Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA045602

[Submit comment/correction]

Sequence	AA045602
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA045602
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGTGCCCAGCTTTGTCCCTTTGATCCGTGTCACGCCGAACATCTGACCT GCATTTTCCGTGCACACCAAGAACCCCGCGCCCCACTCTGCACCGTCCGA TCCCCTCTCCGACCTCTCCCCAGCCGTCCATCGACCAACCGACCATCTCC CCCGCGGCGGACCTGGGCCCGGCCGCACACGGGACACGCGCCTCCCGAAC CAGCAGCGGCAGCACACACGGCACACATCGCAGCACGGTCACATAGGCGG CTCCGGCTCCGACTCCGACTCCGGCTCGCTCGTAACTGCCAGGGTCCTCG CCCCATTCCCCGCACGCGGCGAGCGGCCCGGCGGTTAGACGGATGGACGC GCGGCGGATCGGCGGACGCATCGCGGCGGCGCGGCGGGCCCTTACCGCGC CCCTCCCGATGCGGATCACCAACGGCCTCGCAATGGTCTCGCTCGTACTC TCCTCTTGCGACCTCCTCCGCCTCTGCAGCGACCGGGACCGGCACCTCAG GTTCCCCCTCGGCGGCCGCGAGTTCGCCACCGTCGTCTGCCAGCTCGGCT CCGTCCTTTACCTCCTTAGCCTCTTCGGCGTGTCCTTCGCGCAGTCCGAG CCCCCTGCCAGCGGCGACGGAGACGGCGACTCCCGCCGCTCGCCGGCGGC GGTCGCGCCCGCGCCAATGCCTGACGGGCCGGATGATGGGGACGAGGAGA TCGTCGCGGCCGTGGTGTCCGGGGCGCTCCCGTCGCACCGCCTCGAGTCG CGGCTCGGGGACTGCCGCCGCGCCGCCAGGCTGAGGAGGGAGGCGCTGCG GCGGATCACTGGGCGGGGCGTGGAGGGGCTCCCGTTCGAGGGGATGGACT ACCAGGCAATCCTGGGGCAATGCTGCGAGATGCCCGTCGGATACGTGCAG CTGCCAGTCGGGGTCGCCGGCCCGCTGCTCCTGGACGGGCGCCAGTACCA TGTCCCCATGGCCACCACCGAGGGATGCCTCGTCGCCAGCGTCAACCGCG GATGCAGGGCTATTGCAGCGTCCGGGGGTGCCGTCAGCGTGCTGCTCCGG GACGCCATGTCCCGGGCACCCGCCCTCAAGTTGCCTAGTGCCAAGCGGGC AGCAGAGCTCAAGATGTTTGTTGAGGCACCTTCCAATTTTGAGGCGCTGG CTGCCGTCTTCAATAAGTAGGTCTCTCACTCTCAGTCAATCTTGACAATG GATTAGTATAGTGTGACTGATGATAAAAAATTGCATTCTTTGGTTGTCAT GTGATGTTCTCAGTACCCTGCTTGTGTGATGCTGGTAGCTACAAGTAGAA CTGCATGTATATATTTAAAAGGTCAGGTGATTGCGCACCGGAGCAAGTCC CTTTCTCATTTGGTTGATGATGGGGCAGATGTCACAACGTATTATTGCCT TACTGCACATGCATTTGGTTAAAGCAAGGATAACAGCCTTACCTGCCTAC TAATTTATCAGTAGCATATATTGCCCGATTCATCCTTTTGGTAGTAGCTA TCTGGGATAAATGCCAGTTTATACCTTTTCGATAGTATCTACCCCGAATT GTCGCTTTGCGTTTCCTCAAACCTTGGGAAACAGCAAAAAAGTCTTGGTT TCCGCTTCTCAAACTCCAGAGCATGTGAAATTGATGTCTCTTGTGCATTT TGAACCTTTAGTGGGCGCACATGGAGTATCCTCTTTTAAAGGCTTATTGT GTCCTGACGATTTATTGTGTCTAGAAAAATCGATCATCTCACTTGGTTCA TGATGGTGGGCTTAGTGCACATGCACTTGTTAAGGCAACTAAAACAGCTT TACTGGCCTATTGAGGTATCAGTAGCATACATTTCCCGATCCATCCTTTT AGTAGTAGCTATCTGTGATAAATGCCAGTTTGTACCTTTTCGACAGTATC GACCCCAAATTGTAGCTTTGCATTTCCTTGAACCTGGGAACAGCAACAAA GTGTTGGTTTGCGCTTCTCAAACTTTAGAGCATGTGAAATTGAGTCATAT TGTGCACTTTGAACCTTTAGCAACTGCACGTGTATCCTCTTTCAAAGGTT CAGGGTGCATATGTCTAGTCGATTTATGGTGTGTAGAATAATCTATCATC TTATTTGGTTGATGATGGGCTTATTGCAAGTGCATTTGGTTAAGGCAACT ACGACAGGTTTACCTGCCTATTGAGGTATCAATAGCATATATTCCCGATC CATCCTTAAGGTAGTAGCTATCTGCGATAAATGCCAGTATATACCTTTTT GACAGTATCGACCCTGAGTTGTTTTGTGTTTCCTCAAACCTCGGAGAACA GCAAGAAATTCTTGGTTTGCGCTTCTCAAAACTTCAGAGCATGTGAAATT GATGTCATCTTGTGCACTTTTAACCTTTAGCGGGTGGATGTGTATCCTCT TTCAAAGGTTCAGGATGCATATGTCCTGTCGATTTATTGTGTGTAGAAAA ATCGATCATCTCATTTGGTTGTTGACGGGCTTATTGCACATGCAGTTGTT CAGGCAACTAAAACAGCTTTACCGGCCTATTGAGCTATCAATAGCATTAT ATTGCCTGATCCATCCTTCTGGTACTAGGGAGCCGCGATAAATGCCGGTT TATACCTTTTCTGCCGTATTATTAACCCCAAATTGTCGCTTTGCATTTCA TAAAACCTCGGCACCTTCCAATTTTGAGGCGCTGGCTGCCGTATTCAATA AGTAGGTCTCTCACTCTCAGTCAATCTTGACAATGGATTAGTATAGTGTG AGTGATCATAAATGCATTCTTTGGTTGTGATGTGATGTTCTCAGTATTGG TGTGATGCTGATATCTCGAAGTAGAACTGCGCACCGAAGCAAGTCCCTTT CTCATTTGGTTGATGATGGGGTAGATGCCACAACATATTATTGCCTTATT GCACATGCATTTGGTTAACGCAACGAGAACAGATTTATCGGCCTATTGAG GTAGCAGTAGCATATATTGCCTGATCCATCCTTTTGGTAGTAGCTATCTG CAATAAATGCCAGTTTATACCTTTTCGACAGTATCGACCCCAAATTGTAG CTTTGTGTTTCCTCAAACCTCGGGGAACAGCAACAAAGTGTCGGTTTGCG CTTCTCAAACTTCAGAGCATGATGTCATCTTGTGCACTTTGAACCTTTAG CGGGTGCATGCATATTCCTCCTTCAGAGGTGACGTGTATTCCTCCTTCAG AGGTTCAGGATGCATATGTTTTGTCGACTTATGGTGTGTAGAATAATTGA TCATCTCATATGGTTGATGATGGGCGTATTGCACATGCACTTGTTACGGC TTTACTGGCCTATTGAGGCATCAGTAGCATTATATTGCCCGATCTATCCC TTTCTTACTAGCTAGCCCCAATAAATGCCAGTTTATACCTTTTCTGCAGT ATTATTGACCCCAAATTGTCGCTTTGCGTTTCCTAATACCTCGGGGAACG GCAACAAAGTGTCGTTTTGCGCTTCTCGAACTTCAGAGCATGTGAAATTG ATGTCATCTTGTGCACTTTGAAATTTAAGCGGGTGCACGTGTATTCTTAC CTCAGGACTTGTTCGGTTTGGGGGAATTTGAAGGGTATTGAGGTCGATTA AATCCTTTGCAAGTCAAAATCCACTCCAGTCCACTCTAATCCACCTGGGT GGATTAACCGAACAAAGCCTCAGAGATTCAGGACATGGGCGGAGCCAGCT ATATACATGGGTGTACATGTGTACGTCCATTATTTTGGGGAGGAAAAACT TTACCTCTATACAGTACGTATATACTAGACAACATACCTATTAAAAATCG GAATGTATTACTTTTTTTTGGATCCATGTACAACCATTTTCCGAAATCTG GCTCAGCTACTGGTTCAGGATGCATATGTTCTGTCGATTTATGGTGCATA GAATAATCGATCATACTACAACGGCCTTACCAGCCTATTAAAGCATCATT AGGATTATATTGCCTGATTCATTCCTTTGGTACTAGCTAACCGTGATAAA TGCCACTTTATACCTTTTCTGCAGTATTATTGCCCCCAAACTGTCGCTTT GTGTTTCCTAAAACTTCAGGGGGCAACAAAGTGTCGTTTTGCGCTTCTCA AACTTTGGAGCATCTGTGCACTTTTAACCTTTAGCTAGTGCACTGTATCC TCTTTCAGGATGCACATTACATATGTTTTCCCCGTCTGGGGTGTGTAGGA TATTCAGCTTAGTATTACTTGCTGTTTGGGTCTTATTGTTGGCCTAGTAA GTGTAGCTATGTTCCAGTTTATGTTGTGTAGAAGCTTAGACTGTTATTCT CTCCCTTGTTTGGAACCTCTAGATAACTGCCGGTCCATGTGCAGAAGTTT TAAGTGTTGTCATTTAGTACTCTACAGAATTAGGGTATTGTTAGTTCACA CTGTTTCATAAAGCGTTCTTTATGTTACTATTTTCTGTCATTTCAAAGTC TTGAGAAATCATGGAAATATTTGTTGCCATCAGTAGATGTTAGCTTAGGC CACTCCTTACCAACTGTTGCATTTGTGAGCATCCATGGGAACTTCCTTAG CTTGTGTTTTAGCATTTGGTACTACTAATAAGTTTGACAAATGGCCTCTT TATTAGCTTGTGTTTTAGCATTTGGTTCTTGCATTTCAGATTAATGGTCC AGTGTATATTTTCCTAATTCTGTATTTACTCTGATTTCTCAAACACATAT TAGTTCACTATACCATATATAACCCCTATGAACCTATCTAAGCTTTCCCC CACTTTCCTCCTTTGGGTTTTTATCTGTCAAGTCATTCACAGTTAAGAGA TATGGGCTGTTGTTTGTACCAAAAATATGGCACTTTGGTTCTTACACAGT GTTTTCTGCTTTGATGCAAATGTTTGAACACTGGTTGCAGTTTTGCCAGC GTCTCATACTCTTTGTGTGATTTCTGTCATCAAGTGCCGAAGCTGCTTAT CCTATTACATACTCCCTCCGTTCCAAATTAATTGAGGCAGATTTAGGCAA AATGTTGCCTAAATCCAGTGAACCTGTGTCAAATAATTTGGAACGGAGGG AGTACCAGAAAATTAATCATGAATCAGGCATATGTATACTATACATCCTC CAATATTTTGAAAGTTTCATTGATCTTCTTTCTCAGCTGAATTAATAATT CTGTGCATGTAATGATAAACTTCTGTAGAAGTTTAACAACCAAGTTCAAT TTCTCTGTATCCGCAGATCAAGCAGATTTGGTAGGCTTCAAGGCATTAAG TGTGCACTAGCTGGAAGAAACCTTTACATGAGGTTTACATGCAGTACTGG AGATGCTATGGGGATGAATATGGTATCCAAAGGTGTCGAGAATGTCTTGG GATATCTGCTGAACAACTTCCCCGACATGGATGTCATCAGCATATCTGGT TTCAACTCTTTCCTCTGTTATGGCAAACTGCAGCCAATTTTGCATTCTTT CTCAGAAAACCAATGCATCCTTTTAGGAGATAACTAAAACATTGTTGTTC TGGAATTCGTAGTAAAATGCTGGGTAACAGGCATGGCGTACTGAAAGAAC TATTTGATCAATGCACCCAAGACATTTTATCCTCATCTGGTGAAGCTGTA ATGTTAGAAAATTGTTCCAGTAGTATATGTTATTAGGTGGACTCTAATAT ATCTATGTACTCATTTCCTGTTAGCTTCAATACCTCAAGTGTAAAATAGA AGCTGCAGTGATGAAAGGAAACAATGAATCTGCTAAATTTTGTTTGTCTT GGAGCAAACTTATCATAGTCTTATTTATGACATTGTATTTATAGTGGATG GACTAGTGTAGGATGTATCGTGCCTATTATCACCATTGTTCTCTGCCCAG CATTTGCAAAATGAATTAACTTTGGGTATATCAGGTAACTACTGTTCAGA CAAGAAACCTACTGCTGTAAATTGGATAGAAGGTCGCGGGAAATCTGTTG TTTGTGAGGCTACAATTAAAGGGAGAGTCGTACAGAGTGTTCTAAAGACC ACTGTGGAAAAACTTGTTGAGCTTAACATTATCAAAAATCTTGCTGGATC AGCTGTAGCTGGAGCTCTTGGAGGTTTCAATGCCCATGCAAGCAATATTG TCACTGCCCTATTCATTGCTACTGGCCAGGACCCTGCGCAAAATGTTGAA AGCTCACAGTGCATCACCATGTTGGAGGCAGTGAATGACGGGAAGGATCT CCACATCTCTGTGACCATGCCGTCCATTGAGGTGATCCCTTTTTCCCTCC AGTTCGTGGTAACTGGAATCATGTTCCCACTCTTTGTAGATTGCAGCGCA GTTTGCCATCACCAGTTGTCATTGAAATGATGAATTTTATAGTCAAGATG TCTTATTGGATCATTCGGTTTTTTTTTTTGCTTTATGCTTTATAATTCAT AACTCAATCATGAGGGCACTGCAATCCTGCATATTAATTTGTTCATGTTA AATGGGTTCAATGTTTGTTTTTTCAGGTGGGCACAATCGGTGGTGGCACT TGTCTTGCCTCACAGGCCGCCTGTTTGAATCTCCTTGGTGTGAAAGGTTC CAACCATGGCTCACCTGGCGCAAATGCTAGACTTTTGGCCACCATTGTAG CCGGCAGTGTACTTGCCGGCGAGCTCTCTCTCCTGGCTGCCCTAGCCGCT GGACAGCTTGTGAAGAGCCACATGAAGTACAACCGATCTAGTAAAGATGT TGCCAAGGCCGCTTCTTGAGCAGCCCCCCTAGGATCCATCAAGTGCTGAC CATATTTAGACAGAAAAATCACCAGACAGCGAGCTTGTCGACAAGCAAGC AAATCAGCAGAGTAGAGAGGCTTGTCTGCACATACTGCTGATTAAGATAG CGAGTCTTGTTTAGATTCCCTTCAGCTTTGCAGGTGTCAGATACAACCTG TGTTTATCGTATAAATTTGTGAAGAAAACACCTATCTTATTGTGCAGCTT CTGATCGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.