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GrainGenes Sequence Report: AA043213

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Sequence
AA043213
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043213
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCATCGGTACAGCCGGTGCATGAGTTGGGCCGTTTATACAGGATCCGTTC
TCCATCCCCAAGGCCCCAACTCAAGTCTGAACTCTCGAAATCCCTGAACT
CCACTGACCACTGCTGCCTTTCCCGATACCACCAGCTGCGTCCCCTCCGC
TACCGGATCTCTGCCGCCGCACGCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCTTCC
CGTCTCCACTCGTCACCGTCTCAGCAGCAATCCCTCAGCTCCCTCTGGAT
CTCCACCGCCGGCGAGTCCCCCACACTTCCGCCGAAGCCTTTCGGTCAGT
ACGCACCTCTTCTTTCTCCATTATGCTGGTTTGTTTAAACATCAAAATCT
AGAGCAAGTGGATGGCTAGCTTTCGTTTTCTGCTTCTCTGGACAGGGATA
ATGCACCAACTGTAGGAGCAGATTTGCAGTTCACTCAATTCTTATGTAAA
CACTCGTGCTAACCATTTTCATCCTTATGTTACGCCACGTAATTAACATT
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GTAAACTAAGTTCACTATGTTTCAACTTCAACAGAGAAAATGCTGTCGAG
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GGAATATTTCATATTCAGATATATGCTTACTTCATATGTTTTGCACACCA
TGTTCAGAGCCATTAAAATTCATTGCATATTGAGTTATGGCATTCATATT
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CTAACACAGGAGCTGTGGAAGAGTTCTATTTACTTACAAAACCCGAATAT
TCTGGATCAGCACCAGCAAGAGAACCACCCCCTGTTCCTGCCACTGTACC
ATCACCAGTTGTGATACCACCAGTTGTTGAACAACCGCAAATTCCTGTGC
CATTACCAGTTTCAAACCTGCCGAAATCACTATCATTGGACTCTCCCACT
GAGAAGGAATTGACCATAGATGACATTGAAGACTTTGAGGATGAGGAAGA
TGAATTCGATAGCCGAAGGGCTTCTAGAAGGCATCAAACCGATGCCAACG
ATCTTTCATTGCGGTTACCATTATTCGAAACAGGTAATAGTTATTAATTA
ACAGCTATCAGTGTTGCAGGTCTAATAATAGATTGAAGTTAACTAGACAT
GTCTTATGTCCCTTAAAATAATCGTCATGCTATTGCTACTAGAGATGTTT
CGATGATCTTCCATCTGTTCCTTTTACCTTGAAGTGCATTTTGTTGGTTG
TCTCCTCATAGCTTGCTTGTGATGCACTAATGCTTTCTTTAGTTTCCTTA
ATCACCTGAAGGTGTTCCCTTTAGTTTTGGAATAACTGGATTGTCATTGT
GCGTTTGAGTTACTTCAACCTGTTCATTCGTAAGTCTGAACTATTGGATA
AAAAAAGAAAACAAAAGTATTTTTTTCTCGAACACGCATCTAAATGAGTG
TCCTTTGTATTAGAAGGAGAGCACCAAGATGGTGCAAAAACATTTTCTGT
AGTTATTGGATAATCCTCGTTTCAAAAAAAAAGGTCCTTGTTGTTCTCTT
CTTAAGATTTTTTTTTCGAGAAAACGCAAAGGAGCCTTTTGTGTTTCATT
TCATTGGATAGAGAGAAGTTTGATTACAAGCTTCCTAGGAGGCAGTGGCC
GAGAAGCAAAAAAAAAAAAAAAGACATCAGTGCACAGCCCAGTTGGATGG
CTGCACAACCCTAAGGCCGGAAGTGTTCTCTTCTTAAGCTTGACTGACTC
TAAATTCTGAATTATCTGGCAAAGAAAGTTATTGAAAAGCGATAACTATT
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CCTTGTTGCTGCTGCTGGTGCTTCAGGGTAGGCCCGCACAGTTGAATGTG
ATAAGCTATTATTTTAATTAGAAGATCAGGAGTATCATAGTACTAATCTA
TTTCAACTGCTTATAGGGGACTTATAGTTCCAAAGAAAGAAAAGAAGAAG
GAGAAGAGACACAGATTAATGAGGAAACTTGGCCGTAGTAAGAGTGAAAG
TGCTGAATCTCAAACTCAGCGGCAACCAGGTTTAGTTGGTTTACTTGAAA
TCTTGAGAGCGCAACTTGAGGTGGGTTGTCTTAGCTATCTGTTCCTGATA
AATAATTTAATAAACAAAATTCCACCTTCGTGTTTTCTCTTCTTTTGTAC
TATATATTTATTTCACTCGGTCGAGCCTATATTTGTACATTTGAACACTA
GTAGCTTACATTTATAGTACAATTTCTCAAAAAAAACCATATATAAAACA
ACTTATTGAGTTTAAGGTTATTGTTCTGTTTCTTTATATGTTTTTGTGCA
ACCAGATTTCTTCATACTCAGCATGCTAATGTGCTTACCTCTTTCACCCC
TCTGCTTTTGAATAGATAACAGAGTCCATGGATATTAGGACTAGACAAGG
ACTACTCAATGCTATGGTGGGTAAAGTCGGAAAACGGATGGACAATCTAT
TGATTCCACTGGAACTATTGTGCTGTATATCTAGAGCTGAATTTTCTGAC
ATGAAGGCATATCTTCGTTGGCAAAAAAGACAGGTTAGCCATCCACTTGT
GCTTTAATGATTTTGGACTATAGTTACATGACTTAACAGTATATATTCCT
TTTGTGTCTTTGGTTAGCTAAACATGCTGGAGGAGGGCCTAATAAACCAT
CCTGTTGTTGGATTTGGAGAGTTAGGTCGAAAAGTCAACGAGCTAAGAAA
CCTTTTCAGGAAGATTGAAGAATCTGAGGTCTTATGCATACCCCAGTCAG
TTCTTATGGTTGAATTATTAAACTAAATAAGTGCTGTATATAATAGACAC
TAAATGGAGGTTATTATGGTGTATTATTTGCTAGTCCCTGCCACCATCTG
CTGCAGAGGTTCAGCGTACAGAATGCCTACGATCACTGAGAGAAGTTGCC
ACATCTTTCTCTGAAAGGCCTGCTCGAGGTGATCTTACTGGTGAAGTTTG
TCATTGGGCTGATGGCTACCATCTGAATGCTGCCTTGTATGAAAAAATGC
TCGGCAGTGTTTTTGACATCTTAGATGAGGGAAAACTTACAGAGGCAAGT
ACTTCAAATCCTTGTCTGTCATTTTCCCCTTTACATCCTGCCGGTTACAA
CATTTGTCTTACATTTTTGGTTTAATATGCCAGGAGGTGGAAGAAATCCT
TGAGCTCCTAAAGTCAACTTGGCGGATACTAGGAATCACAGAGACAATTC
ATGATACATGCTATGCATGGGTGTTATTTCGACAGGTAAATCACTAATCA
AGAAGTAAGATACTATTGTTAGAGTATTTTGTGCTCGTGCTGTTGTTGGC
CTTAAATATCTCTACAATGGCAATCAGATGTGTTTCTGGATTCTGGCATC
TTGTGTTTTTTCTTCATAACTCCAAATGTGCCAAAAGCAAGGGAGGAGCT
AACCATCCTTATCCATTTTTGAATGATGCCAGTTCTAGCCTTTTCTCTTC
GTAGTGTCAGAAACAATTATCACCGCAACAACAAAGCCTTTTGTCCCAAG
CAAGTTGGGGTAGGCTAGAAATGAAACCCAACAAATACCTGTCGCAATCA
AAGGAGGAGGGTGTGATAGGCTTGTCGAGCCAACATAAAAACCAGCCATT
CCTATGGATATGAAACCCAATAGTGTCAGAGACAATTATCTGGAATAAAA
ACCTGAGTTCAAACTCCTGTTTTGCCTTCACAATATTGTGGGAATGATTC
TTTTACCTAATAGTGTAGTTAAGTTTAAGTCTGTCACGATGTACGATTAT
CGTTAAAGTGGTGATCATATCTAAAACCAGTAACCACTTGGACTGGATCA
TTATTTATTATTTTATCAAAAGATGATCTTGCATACTGCACTAAATCTAG
TCCTGTTCAGTAGAGTACTACTGATTTATTAGCTCATGAATTAAGTCACC
ATCACAATAGTATGACAATTAATGTAGGTTCCACACCACAGTTTGTTTTT
ACAGGTGAGCAAGGACTCCTGAAAGTTGTGATTGCGCATTTGAGGAAAAT
ACCCTTGAAGGAACAGCGTGGTCCACAAGAACGATTACACTTGAAAAGTC
TACGTAGTTCTGTTGATGCTGATGATAGTTGTCAGGACTTCACGTTTTTT
CAGTCTTTCCTGTCTCCAGTTCAGAAATGGGTGGACAAGAAATTGAATGA
TTATCACCTGCAATTTTCAGAGGTTTGTTTTTCTCTGCCCTGGTTTGCTC
ATGTGCTCCCTACATGCATGCCTATTAAATTTGTCCTTACATCTGCAGGG
TCCCAATATGTTGGCTGATATCGTAACAGTAGCAATGCTCACTAGGCGGA
TCCTTGGTGAAGAAAATGACAAGGTGCTGAAACCTTAAATCCTTCATTCT
TCATCCCAAATACCTTTTTAGTCTAAAATTGGACCGTCTGCGTGCGGCTT
GTGTGCATATAAACACCAACGCATCCAGGAATTTCTCGAGCAAAAAGCGC
TTGACAACAAACCGATCCAGTGGAGTTCCTCACAAAATGGTCTCTAATCC
CCGCAGTCCTCGCCTTCTAACTTGTAGCAGTATACAGTAGCAACCTTATG
TTATCAATATCAAGCACGGCAAAATATGGAAAACAGAACTTACGTTACTG
TTTGCACTATAGAAAATCTTATTTAGCCACATATTTGTTTTTGTTCATCA
GGCAATGGAGTCACCTGATCGAGACCAGATTGAACGTTACATCACATCTT
CTGTCAAAAGTGCTTTCGTAAAGGTGACCTTATTTGCAGCTTCAGTTATT
CTTTTGGTAGTATAGCTTAATATTGCTGATTTTATTTATTTGCTCATTTT
TTTGCTTATTTTACCCATGGGGTGGATATAAAAATATCACTTACGCACCC
ATGTCTGTTTATGGTGTTTATGTGGGACCTTGAATGTTGTTGGATCATAG
TGTATATGTATATGTATATTGGATTTGTTGTGTTGTATTTGATCACCTTG
ACTCAGTCATAGGAATTGTAATACCAAATGTTGGCAAGATTCTTTGCACT
TAGATGTGTTCGGTCATCAATGTCTTCTTTGTATATGCAAAAATGCGGTA
TGACCTTAGTTATGTTTATTAGGAAGAAGAGATACCAAAGCTTAAACATC
CGAGAATCTGTAGGATTGTATTTTGTTTTTCCCCAAAATTTTTTGTATAC
CTTTTGGCATTTTAGTATAGAAGATTTATTTGGTCTTCCTGGTCACTATA
TTCCTCACAAGTCAGTATGACATGAGGCCTTCTAGGCAACATTCATATTA
GAAGATACTATGTAAGAGTGTAAGCACGTGATAAATGACAGGGCTGGCTT
TCGTCTGCATATTAGAAGATATACTGTATAAATTCTAGACTCTAAATCTT
CATGTTCATACTAATAATTTAAATTATTTGTTCTGCTGAGACCATTAGCT
TTTTAGTGCGATGTGTATTTGTATATTATGTTTGATATGTAAACATTAGG
ATAAAATTTTGTTTTGTTTCAGATTGCACATTCTGTAGAGGTTAAAGCAG
ACACGACGCATGAGCATGTTTTAGCATCTCTGGCTGAGGAGACAAAGAAG
CTTCTGAAGAAAGATACAAACATTTTTGTGCCAGTTTTGTCAAGATGGCA
TCCACAGGCAGCTGTTCTTTCTGCTTCCCTTCTCCATAAACTTTATGGGA
ACAAATTGGTAAGTTATAGTTGACTGCTAAGTCCATCATAACCTTCTGAT
ACTGCATGCTCACGTTAGGTTGTTGTGCCAGAGACCTTTTCTTGAGCATG
CTGAGCATCTTACAGAGGACGTAGTTTCTGTATTCCCGGTAGCTGATTCT
CTCGAGCAATACATAATGTCTGTGATGGCTTCTGTTGTGGGCGAAGATGG
TTTGGACAGTATATGTAGACAAAAGCTAGCTCCGTACCAGGTTAGATACC
TCGATCTTATCTTCCTCAACTACAAACATCCACAGAATTTTAAATTGCTT
TGATGTCACCTTTGACATGCTATGTTCATGCCATTTTTTTGTATCATCAA
TTATTATGTGCTGGGATTTCTTGTTGTGTTGTTCACCCTAATTCTCTGCT
TTTGTTTATCTCAGATTGAAAGTAAATCTGGCACGGTTGTTCTACGCTGG
GTGAATGGGCAACTGGAGAGAATTGAAACTTGGGTTAAAAGGGCTGCTGA
ACAAGAGGTTAACACATTAATTGCCAAAAATATATTTTATATATGACTGT
TTGCGAGTTTGTATAGGCATCTCACTGTGTATGATAGTTTTTTTTTTGTT
TTACTGCTTACAATATATTCTCTTCTGATGTGACCTATCTTTGCATTCGA
ACATTACTTTGGTACTCATCGAGTGTTGTTATGAATTTTCTGCATTTTCT
CCATGCTAAATTTGTGCTCGACAGGCTTGGGATCCTATATCCCCTCAACA
ACGCCATGGGGGTTCTATAGTAGAAGTCTACAGAATCATAGAAGAGGTGT
TCCTCTTGTCCTTCATCATCTCTTTAAAATTGTGTTAATTAATTTCTCTT
TATTAGGTTAAATTTAAATGCTATTTCTCTTCTATGGCACAATATCTCGA
AGGTATTTAGCCTTGATGGTTTCAGATATGATTTGTGCCTGATAATCAAG
CTGCCTGTGTGAAAGTAATTTTTGTTACTTGCGAGCTATTGCAGACTGCA
GATCATTTTTTTGCATTCAAGGTTCCCATGCGAATTGGCGAGCTAAATAG
CCTCTGTCGTGGTATCGACAAGGCATTTCAAATTTATACACAACTTGCTA
TTGGACCCATAGGTTTGCATCGTCACCTTTATATTTCTCCTAAAGTATCT
TTCTATTAATCCTCTTGCTGCATGTTATTTATTTGTTCCTTCATCTTTAT
TTCCTATTATTGATTTGAAAGGAAAATATTCTCTTGCGGTAGAATACAAA
GTACAAACTCATGCTTTAGATAGATGGTCCATGCTAAATAGTATATTTGA
GGTAGTATATAGGGAGAATGTATCCTATGAAACGAGACAACTCGTGCACC
AGCTGCACCTACGTGTTATGGACCATTGGATGAAGAAATAAGGGACAGGA
TGCGGCTAGGACATGGACTGGTAGGCATCTTACAAAAGAACGCCCCAATG
CTACTGCTGCTTGCACAGAACCCCTCCTAAACTCTCAAATCATCTTCGCG
TCTATTTGACTGCAGGATACTACTAGTAGTCTAGTAGATAAACACAGAGC
ATTTTCGGTGTGTATGAACTGTGAAGACGAGGACACCGCAAGGAAAATCT
TTAGAGACGACGAATTAGTACAAGCGCACGACAATGATGAGACAAATAGC
ATGGAGATTTCTGTTTCAACAAGTCTATTGTAGACCAAATTTTGAACCAT
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AAATATCAAGAACACCGAACAAGGACCAATATCAGAATCTCAACATCTTA
GATCGACACATAGCTTCATAGAACCCTTCAAGAAAACATGAAAAATTGGA
GCTATACACACAGTACAAGGCAGCCGTGGCTCCATGAGTGCAGAATTCAG
ATCTGAGGAAATCGGGAGAAGAAATCTGGGAATAACTTTTGAGCACCAAA
ACTAGAGGAGGACGACACTAACATCCAGATCCGGCGGTGGCGGAGATTCA
AGCCGCAGGAAAGTCGAAGGAGGCTAGATTGGCAAGAAGGAATTTCCTTC
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ACTATTTGCACAGTTCACCTGCACTCCAAGGTTTATTTTGTAAATGGGCC
ACCAGTCCATGTCTAAGTTGGATCCTGTCCATTCGTTTCACATCTAATGG
CCCATAATAGGTCGGTGCAGCTGGTGCACAAGTTTGATCGTTTCACAGGA
TACATTCTCAGTATATAGGATGGACCAAAGATACTTATGTCCTGTTTGTT
TTTAACACTTATGCTTTGGTTAAATGCTATTTATTTTCTTTAGGTTTTAA
GAGAAAATGGTTTTCTGTGCTTGCAGTTGATAAAGAAGATTTAGTTCCAC
CTGTTCCTGTTCTTACTCGATATAAAAAGGAGCTTGGAATCAAAGCTTTT
GTAAAGAAGGAAATCCCGGAAGTTAGAACAGTTGATGAGAGGAAAGCAAG
TGAAATAGTTCAACTTACGATGTCAAAGCTCTGTGTACGGCTTAACAGCC
TATATGTGAGTTTCTTATTACAACTCATGCTGCTACGTTGTTTTTATCTA
GAATGACTTATCAAGATCCCGAGCAATTTCCAGTAGAAGAAGATGTAAAT
TAGAAGAAAAGGCATAGCAATTTTCATAGAAGATTTATTTTGGAATGATT
GACATTGACGTTGAAGCAGCATTTCCTTAAATTTTATAAAATTCACACAT
GGAGTTCATAATTATGCTACCAGCCTGCTACATCATACAGCCCATTAAAT
ATATCTTTGTAACTAGCTGTATCTTTCACTATTCTTGGTTTGATGCTGTT
CCCTTTTGAAAGTAGCTATTGTTAAGTTGGTGCATTAATAGTGATTTATC
AGCAATCATAATTTTTCAGCAAATGCAGAAATTTGCTATTGATTATACTG
ATAGTTCTGGACTTGAAACAGTATTCTAGTATGGAGGCAATAGCTGTTAC
TAGCTGTTGCCATGATTTACATCAACAGGACCATGATGTTCTTTTGATAT
TTGTCATTCTTCCTATTTTATTGTTCATTTTTATTACTGTCACCAGTTTC
TGAACTTGAAGTTTTTTTATGAATATGAAAATAGTATGGTATAAGCCAGC
TAGGCAAGTTGGAGGACAGCATAAGTGAACGGTGGGCTAGAAGGAAAATT
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TGTTGGATACTCTGATAAGATTGCCAATTACTCTGTTTGGCATATTCCAT
GTAGATCAATCTAAATTCTATTTTTAATATTTAATAACTGTGTTAGGACG
ATCAACGAGCGGAAAATCAAAGAGCGTTGTCTCCAATCAGAAGAATCAAT
TTGATGGAAGTAGAAAAGAAATCAATGCTGCTATTGATCGGGTATGTGAA
TTTACAGGTAAGAAAATATGCATAGACCAACCACTTGAACCGGGAAGCTG
ATGGCTCGTCAATGTTAAAGTTTGCATCTTTTCTTTCGTAGGGTTAAAGG
TCATATTCTGGGATCTGCAACAGCCATTCATCGATAACTTATACAAAAAC
AGTGTAGCCCAAGCTCGACTGGACACTATTGTGGAAGTGCTTGATTTGGT
ACGTTCAGAAGTTTGCATCATTTGATCTGACAGCTGGCATGTCAACTTGG
TTTTGTATCCATTAGCTATATGCCTATATCTGGCTAACCTTATACAGAAC
TCTGCCAGTTAATTCTTTTGGACCGTAAGCACGCAAACCAATGTTTAACT
GCAAATAGTTCATCTTGTATGTGTTAATTTTATGAGCACTCCTACATGTG
AATGCAACTCCAGGCACGTGTTAATCCATGCCATGCATCTTTTTGTAGGA
TATTCTGTTTTTACGAGAAAATATATTGATAGTTTTTATGTCAGAAATTT
GGTGTGGCAAAATGCTAAGTATATGCTGTTACCTCAAACTTTGGACAAGC
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GTCGTCCGGTCAGTAAGCTTCTGTTGAACTTATTGGCCTATATTTGATGC
CAATGCTCAATCTTTTAGGTACTTAATCAACTTTGTGTTGTCATTGTGGA
GCAACTGCGGGATCGCGTGGTTACAGGGCTTCTGCAAGCATCCCTGGTGA
TAATTTTGGCTATTAAAATTAGTGAGATGCTGTAACAAGTTTTTGATTAT
AATTTTAGCATAATTTCTTTTCTCTCAGGACGGCTTACTTCGCGTAATAC
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GCTGCTTTTGTTTTATATACGAGGGAAATCATGCATGTGGTGGCGGTAGT
ATTATTCTATAACTGACATGCTTATCATATGTCTGGAATATATGTTAATC
TCACCCTGTATTTATTGTCTGACCAAATAGACTGTTTTCTTAACTCGTGC
TGACTATTTGTTTGCTTACCTAAAAGGAATCTTTTTGTGTGATGTAGGAA
TTTTTCATATCTGGTGGAGATGGGCTCCCTCGTGGAACTGTTGAGAATTT
GGTCTCACGTGTTCGTCCTGTAATAAATCTGATCAAGCAAGAGGTAAACT
TTGGATTAAATTTCCCATGGCTTTGGATCTGTTGAACTCTAGATTCTAGA
TTCTGGCAGTGCACCATACATAATTACCGCACCTAATCTCCAATTATTAG
GTATAGTCTGTACCTGCACCCAATGCTGTAGTATAGGAAATCGCTTAATC
TTTGCTGTAATCGTATTTGTGAATGACTAGATGGCGTTTCTTATGTGCTC
TCTTTCCCCAGACCCGTGTGCTTATTGATGATCTGCGAGAAGTTACTCAA
GGGGGCAAAAGCAAATTGGGAGGTGACTCCAAAACCCTGCTCAGGGTCCT
TTGCCACAGAAATGATTCAGAGGCATCACATTATGTAAAGAAGCATTTCA
AGATACCCAGTTCGGCCCCTCCGAGCTCGTGATCAAATGCAAATGAAAAA
TCTGAAAATGTGTCGAAGGTATATAGCGGATGGAACAATGGCTGGTATCT
TGCTCTTGTAATATTTGTGCATTATTAGCTGTAGGAGCTAGGGAAGCATA
CACTAGTTCTGATACATGGGCATTGTATGATTGTTTCTGCCCAGTAAGGA
CTTGGCTGTTTTTTTTGTGTGTTTTCTTTGGAGAACTTGTAGGTGGATTT
TGATGGTCTTATTTTAGGTGGATTTTGATGGCATTTCGGTCTGATGGGAT
TGCTGGGGACAGAACTGATGCTTGACAATTGGTTAGGTGATTTTTCCTTG
TGATATTAGCATGGGTACACGTGATTTTGACCAATTTGTTGTAGTGTCTA
ATGTCAGCGTGAGGGTTGTAAATAATTGGAAGGTACAAATTTGTTTTCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.