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GrainGenes Sequence Report: AA032765

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Sequence
AA032765
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032765
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGACATTTCGCTCAAGTGGGATCCCATTGAAGTCAGGACTAAAGGAGG
ACAGGAGATGGAAGGAGTTCACCTTAGGCCTAATGGTTGGAGTAGCATGA
CGTGGGTCAACGGATGACATGGTGATTGCCATATGATGGGCTGCATCAAA
CCATGTAGGTGGACTTAGATAGGTTTGGTACTGTTTTCTTGTTTGAGGAA
TTTAAGTGCTTGAATACAGAGAACCTAATAGGTTGGGTGACTGAATTGTA
GGTGACACAACAACACACAGTGAACTAAAGAAGCTCCTAGGCATCAAATG
TCTGATTCAGGGAAGCTTTCGAATTTAAGTGCTTGAATACAGAGAACCTA
TTATAGGTTGGGTGACTGAATTGTAGGTGACACAATAACACGCAGTGAAC
TAAAGAAGCTCCTAGGCATCAAATGTCTGATTCAGGGAAGCTTTCGATTC
CCCGATAGCCATTGAATTTGACTACTTCCGCACCTTTGGATCTCCCCTCA
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CGCCATACGGTGTCACCCACAACCCGTCCACACACCAGTGCTGCCCTGCC
CAACATCCACTCAGTGGCTTAGACCATCAATCTTCTCCTTTCTAGAAATT
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GCATTTCATGGGGTACATTCCATGTTCTTTTAGTTTTTGTGGATTTTTTT
GCGAACTTCCCATCACTAAAAGCTTGAGATTTGAGTTTTGAATAGAACAG
TTTGAAATTTTCAGTTACTTTTGTTACTCTAATATGAACATTTACTAAGC
ATAACAAAATGGTTTTGACATTTGGAGTACCCCTGATTTTTGTTCAGTTG
GTGATTAATTGTCATGAACATAGCACCTTCTATGCTATTAACATAGCCTG
TTAAATGTTGACATTCGACTTAAATGCTGGTCACACCAATGGTCAAATTT
GTATAGATACTATGTCTGAAGAAAGTATGTTCTATCAAATTGTTACTTAC
AGTTTCCTCCAGGTAATGAAATGTGCCTTAAGGCTTTTTCTTGTGGTCAC
TGTTAAATATCATGAGTTGTTAATAAAGTAAACTGCAGCTTTCTTTGTAT
TGTAAATTATAAAGTAATGCTTATATTCCATCTTTGTACTTCTAACTAGA
CTTCTCATTTGGTTTTAGGCTGCAACTGCAGTTGTTAAGGAATCTGTTGA
ACCACTGCTAGATGATTATCGACCTCCAGGAATAAAATCTCTGAAGTTCA
ACAAATTCTCTCTTGGAAATGTGTCACCAAAGATTGAAGGTCTCATTTTA
TAATTTCTGGGCTCTCTAGTATCTATTGCGTGCTTGCTCTGTGTATGCCT
ATTTCTTAGTTCTAAGTGAGAGAGATCTCCAGTTAATGTAAAATCTTCAT
ATCCTGCATACATAGACCAAGCAATATGTCTAGTGATAGCAGCCATGGCA
GGTCTTAGGGCCTCTTTGTTTGGGATTTTTTTTGGCTTTCCACAAAATAA
GCAGGAGAAATGAAATAAAGAGCTCAGCTGTGCGTTAGGCTTTTCCAAAG
CCACCACCGGAAATACACTGTCCAGAGAAAGCCCGATTCGAGGTGCTTCC
TGCGGCTCCCTGCAACTTTTAACTTAAAGCTGAAGCGTTATCTTTATTTG
CCCATTTCATTTGTAGTAATTCCGTCTAGACTGCCACCAAGCCCCTTCTC
TCCTCAACATGGGCTGAGCCGTTTTTTTTCCGTCTCCCACCCTGTACGAG
AAGAGAGGATAGGGTTTATCTGTTCCTGATCCCATCGAGCACCAGCAGGA
TGGTCGTCCTGCCCACGGCGATCGGCCTGTCTCTCGTGGTCTGCTGCCCG
CTTGTTCCGCTGCTTGTGTGCTGCTCCTGCCGACTAGTACTGCTCTTTGT
TCGCTGATGCTGCTGCAGACTAGTAGTGCTAGTACTGTTGCCGACTAGTA
GCACTTTTGCATATATGAACTAATGCAAATAGCTCACGTAGTACTAGTGC
ATAGATCTGCTAGTGTGTATTACAATGTATATAGTGAATAATTTGGATAA
AGCAATTTGATGAATATGTATTTTGGACTATGAAAGTTATTTGATGAATT
ATTCGGTGTGTATATTCTTTTATAGTGATCCATTTTTTAATTGTAGTGAT
CTATATGTTATTTATTACACACAAGCCAGCCAAGTTGCCAAAGACTAAAA
CTCAGAACAGGATTGGCCCTTTTCTTTTCTGAATGTTTGTGACATCCATA
TGAAGGCTTTATTTCTGGTCTAAACTTTCTCTCCTTGATATCAATTGCGA
CTCCCTTTCCTATGGCACATTCATCGAGTGAAACTACTATCAGATAGCTT
AATGCATGCGTGTTGCTATGGAGTTAGCAAATATGACGTTTTCAGTAATT
CTCAGCCAAAACATTTTTTTGTTGTAAAAAATACATTTTTGTGATGCGGT
ATGCATTTTTACACTATCAATATAATTCTATTAAAGACATGTTAAATTGT
TTCTTCACTTTTATTTTTTATTTTTATTAGGTAAGTACAATGTAACAATT
TTGTCATGTTTGAAGCATAGTTAAAGCTATGCCTCCTCTTTTTAGTTTAT
TTTTTATTTTAGATTTTCGCCAGTCACATGAGGTTGCTGAGCCTATAGAT
AGTACCTTAGGTAGATTGACAAGACATAACTGAAAGTACAGATTTACAAG
GATATATCATCCCTCTACTAACCGATGTGTAGGAAACTGAAACCGAAGCA
GGAAGGCAATATGCCTGAGCTTTCCCTTCTTCCGCTGCCTCTCGTCTCTT
GGAGCGTTGAAGTTATCCCTAATGTCAGGGTCTCTCCTGTCTCTTTCTTT
TGCAGCACTTCTCGTCTCTCTGGGTACGGCTCATGAAGTATCCAGCAAAA
CCGCTTGCTTTAGATATACGTTTTTTTATTTCACCATGTCCAGCTGTGTG
ACCACTTGGTTACGATCTGCAGCCTTAGTTGTCAGGTTTGCTGTTCGAAT
CCTGGCAGCTGCAGATTTCTTTTATCTTGTCACTGAAGCACATAAGGTGG
GAGAGGCAGATGAACCATCGTCTCCAACTCGTATTTTAAAGGAGTAAAGA
TAAAACCAGTTGGATATACTTATTTCAAAAGTGAGACATGTTAGATAGTC
CATCCACAGCTTTTTCTCGAGAGAGGAGTTTTTCAAAATGACAAGTATCT
TGTTAGTGGAATAAGTTAGGGAGACTGTAAAAGTAAGGGACACAACAACT
CTGCACATAGGAGAGAGATGCAAGGAAAATATGGCAAATCAGGAATATAA
ACGTATTGGCACTAGGCCCAGAACCGAGAATGCTGTTTCATCCCTCTTTA
CTCATGGCGAGCAAAGAACAATGTTATCTTTGTATAATAGTGCAAATTTG
GGATGTGATTTATTTATTAGCACTTAGTTGTGCCTGTGTCGATATTCTTA
CTCTGATTTGGCTCTTTGTGATGCTAATGAACTTTTGTCCCTTCATGAGT
TCGATATGAGTTCATGTTCCACATTTACTAATGCCTGGCTAAGCTAAATT
TTAATTATGTTGCTGCTGTACTGAATACATATGACTTGAAAGACATCATG
TCATCTTTTGTGAAGGCATCCGTATCCAAAATCTTCAGCCAGGCCAGATC
ATAATGGATATAGATTTCCGCTGGGGCGGTGATCCAAGCATAATCCTTGC
TGTTGATGCTCGGGTTGCATCACTGCCTATTCAGGTTTTTACTGTTTCTT
TGTCATTACTGTGGTTAACCTTGCAAATTAAGCTTGATAAATTATATTTT
CTGTGAACCATCTTTCAGCTCAAGGATCTCCAGGTCTTTACCGTTGTCCG
TGTTGTATTTCAACTATCAGAAGAGATTCCCTGCATCTCTGCTGTTGTTG
TTGCTCTCCTCGCAGAGGCATGTATCTACTAAGCAAATTGTATTTTTTTT
TTGAGAAAACTGCCAATTTCTATTTCATTATATTTCTAGTTTGCGCAAGA
GAATCATGTGTTTTTGAAACAAAGATAGGAGGAAAAAGAGTACACGGTAG
CTGTGGACTGGTTTGTAATTAAGACGGCATAGAGTTTTTGTTTTGTTTTG
TTTTGTTCCTTACATTTATTGATTGTAGTTTGTTTCGCATATAGTACAAC
AATAGACCAGAGCTGACCTCAGAATGGGTTGAAAACATAGAATATCATGT
CAGTCAAACCTGGGAAGGCCTTAAAATTAAACCCACAAAGAATACATACT
TCCTACTTGTAAAATGACGCTAATTTGTGGCTTTTCATAATGATGGTGGC
AGTTTGACACTGCCAGTATTTTTTATGGGTACTTTGATACCACCTATCTT
ACGCGTTGATCCTGCTGGCATTTCCACGAGACAGTTTGTTGATGCAAGTT
TGTGCTGCAAAGCTCCAACTAGATTTTATAGTTGAAAGGTTTTTAGTTGT
AATATTTCTGTCGACAACATATCACAAGAAGAATGAGGCAATATTCTATA
AATGTCATTTATGATGCTTGGAACCTCTTGCTTTTTCAAAGATGTGCATT
TCCTGTATAATCCTTTATTAGGGTTTCTTTGTGCTTCAGCCAGAGCCAAA
AATACAGTACACGTTGAAGGCTGTTGGAGGAAGCCTGACTGCTATTCCAG
GACTTTCTGATATGATTGATGTAATGACTTGAGAAATTTTGAACTTCAAT
TCTGCTAACAAACTGTTAAGAACTGACATGATTCTTCTTCCTTCAATTAG
GATACTGTCAATTCAATTGTCAATGACATGCTCCAGTGGCCACACAGGCT
TGTTGTTCCACTTGGTGTCAATGTTGATATAAGGTGAGTTTTCTTCAATT
TACTGCTGCAATGGCCAACGGATCCCGCTCTCCTGCTTGTGTGTGTTATG
CCAACTCGTGTGGATTAAATTTTAACTGCAAGGTCGTGTAGAACTAGAGT
ATTAACATAAAACTATCACTTTAGAGACGAAATTTACCATTTGGTACCAC
TTTATGTTTTTGGAACAGAAATCTACCGGTTCAGACTAAGTTTTTTTGCA
GAAAACACACATTGCCTAGTTCTTTTTTTCGAAATGGAGGTGATACCCCC
AGCCTCTGCGTAAAAAAGATGCACACGACCTTCTTTCATTATTCAACAAA
ACCTTACAAAGACAATACATAGATTAACCAGAAGTCACCTCTGTAACGAC
AGTAGTCGCAACTCGTACAACCTAGATAAAGGGGATGACCATGTCGGAGC
CAGCACTCTGACCGCACACCTACGTACATCATCACAAATCCGTAGGCCCC
ATCTGACCTCCCAACAGCTAGTCGGGGGCACAAACCGGTCTAACAAAACC
TTAGCGCACCATCGCACGCACTCCAGAAGTCGTCGCCACCACCATCTGCC
ACAAACTATCTTCGAGACAAGGATCTAGGCACCGACCTTGCTAGGTCTTC
CATCGACGCCACCATGGCGCCAGAAAGCACCTCCGCCCTGCTCTGAGTCC
ATCATGTCATGTCTGTCGCCGAGTCTCCGTTGTACCATGTGGTCATCAAC
ATGGTTGATGCGCACTAGTTCACCGGTTGCTACCACCATCAAACCGTTAC
TCCAAAAATGATGCCCCAAGAGGTAAAACGACGCCAAGAGCATCACCATC
GTCCGATCCAGTATACCAAATTTGGGGTTTCCCCCGGAGCAACACTGAGA
AGGCGCGGGCTGCAATGGCGATGCCTTCAATAAAGTAACGGCACGGGAAA
GCTGCCATCGCCTTCCATGACCGGAGTCGAGACTCGGTTTTATTGGCATC
TGCGCCTCCCAAACTCGCCGTCAAGACCAACCAGCCGACCCCCTCTAGTG
GAGGAGGCAGCCACCACCACTATGCTGGGGCAGAACCCCCAACAGAAAAC
TGTGTGGTGAAGGCCAAGAGCGCCATCGACGTCGGAGAAGGGAAAAGAGC
AGCACGCGAACCGCAGCCCGACCAAGCCCATCTGGGACGAGATCGGACCC
GGCTGCCAACCACGTCGGATCAGGCCGTCGCCAAGGAGAAAGACCGCTGC
CACCGCACCTCCCGAGCTTCGTTGGGAAGCGCCCTCGGCGGCGGCATGGG
AGGTATTGAAGGGGTTCGCAACAGAAAACAAATTTTTTCTAGCTAGCTGC
TTCGTCCCCAAGATCTATCTAGGTGTAATGCTGTAACGGAGGAGGTTTCG
ACAACATACCCTTGTAGACCGAAAGCGATTAACGTTCGTGATGAACGTGG
ATGAAGCAGTCGTGCTCGTAGCCGACCTCAAGGTCGCGAAGCTCCTCGCA
AGTCACCCCTGGTTTAGCCATGACAACTCCTGGTTCCACAATTGGTAGCA
CCCCCAAGGTCTCGCACACGTCCGGTGCTCGATGACGACTCCCGGTCTCC
CTGATCTAGCAGGGATGTGGAAGTAGATCTTCAGGCTGAAATCCCCGCAG
CACAACGACGTGTTGCAGAGAAGCGGTCTCTTGCGCTCGTAGTCCTTACT
TGGAACCGCGGTTGCAAGAGACGAGAGAGAGGCATTTTCCTAGGAATCGT
GTGTCCTTTTTTCCTCCCATATAGACCTCTCTATATAGGGGAAAATAGGC
AACCCCAATCTTTAAAGTCCCGAGGTGGGATTAAACCAAGAAGGAGGTGG
GAGGTGGCGTGCCCCAGGGGAGGAGAGCCAGCCGGCTGGCTGTGGTGGGC
CCCAAGCGCGCACGCGTCCCAAGGCAGGCCGGGCCAGTAGGCGAGCCCCA
CCCCGCGCCTGTCCCAAGGCAGCGGCGGGGGCGAGCCTACCCCACGCACG
TGGCCCGAGGCGGTAGTGTTGTCAGGTGGCCCCATGGCGCTTGCCCTTTT
AGCCCAAAAATTTAAAATTTAATATTAATTTGAATAATTAATATAAAATA
TATATTATTAAATTCCTCTATGATCTTCAATTCACTCCGAACTTCTTTTG
GAACCTCCTGGAACGATTGTAGTTTTCTTTCTTGCGGAACGCTTCCAACA
TTCTCATTTCTTTCTTCTACTCCGGTAAATCCAAAACGATCTCAAAACGT
CATCGAACCATTAAGCGTGTTACCGTACGGTTCGGGAACATCACAGACAT
GATCGAGACACCTCTCATATCAATGATCATTAGCGGGACCGGGATGCCCA
TAATGACCCCTGTGCATTCCATAATTTCAATATCGTTTGAACCATAAACG
TCGAGTCCAATTCCCTTTGTTCTTTGATAGACTTGTCCAAGATCTGATCA
TTGGTATCACCATATCCTGTTCAATCTTGTTACCGACAAGTGCTCTTTTA
CTCATTCCATGATATTATATCCTTGTGACCTAGTCACATGTTGCGCAACA
TTCATGGATATAATCTCACCGAGTGGGCCCTGTTTATCTTCCCGTCACAC
CTCTACATGTCCCTTTGGAATACCCAACATACATCTTTATGATCACCCTT
TTACGGGGTGACGGTTGATGCAGTCTAAGCAGCCGTAGGTGACAGTGATT
AAACATGATCTCACGGTCAAAAAAGAAGGATAATGCGTTTCTAACTATTG
CAACGATGAACTTTGTGACTTAATCATGTTTCAACAATTATATTGGGTAA
TGTCTATCATGACATTCATCAATTTCATAGCTTCATTGTCAACTGGCATA
AATGCTCCATGATTAGGCAACCTTGATCATCAGTTGCCCAATGAACTAGT
ATAGATAGAGGCTACTAGGGACTTGGTTTATTTACATACCAAACATGTAT
CACCGTTTCCGCTTGATACAGTTATAGCATAGTACAAAACTATCATGAAC
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GTTACTAATTACAACATCATATCATATATGATTTTATGGTCATGCTTGCT
CATGGAAAACGTCTTGTCATTGATCTGTTGACCTAGGGTGCCTCTAGTAG
CTACAATCAATGAAGGTGGCCTAGGGAACAGTGTGATTCTAGGTCCGCCA
GTGCGAGGAATGGCCCATCGCTGGTGGTTCGGATCGAGCTGAAAGGGGGT
GGTATAGCCGGCCAACTGGAAGGGGGAGGCCGACCTTCTCGCTAGAGCTT
GATGGTGAGAAAGAGGGGGGATAAGATAGGGGAAAACAAGACATGATTTG
ACAGGTGGGTCCCACGTCTTCCTAAGCGAATTATCATTGGTATGCCCTGC
ACATCCACTTAACGGTTCAGTCAAAATGTAGAAGATTTGGTGCCACGTCA
TCACTAACGGGTGGGCCCCACTGTTAGTTTTTGTGTCAATTCACGTTCAA
TCACTTTTAGCGCTTTCTGCAAAAAAGTTAGTCTAAAACGGTAGAATTCG
GTCCCCAAAATGTGAAGTGGTACCAAATGGTAAATTTCACCTCTAAAGTG
GTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTCCACTTTGTCAAGATACAGTT
GCATCTAGACTAGATACTTAACTAGATACATATGAATCTAGACATAGTAG
AGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTAGTTTTATGCTATTCGGTCTATA
GAACTAACTTCTTTGGCATTGGCATACTTATGTTGGGTAATTTTGCGGCA
TGTGTTATGAAACTTAGTTGTGTTATGAACCAAGGCTGGATAAAGACAGG
ATAGAGTCGAGACAGATAGACAAAGATGAGAGCGTAGCCTGGGATGTTTT
TTTCCCGAGAAAACGCAAAAGACTTTTGGGTTTCATTTCATTGAAAAGAG
AGTTTAGGTTACATTCCTCCTAGGAGCTGGTTACAGTTGTAAGAGCATCT
CCAACAGATGCGCTAAATTTTGGCACTGTAAAACCACTTTCTAACGCGTT
GTATCTACTTTTACCACGCGCGGCCTTGTCAAGGTTTACCGGATGCTGTA
AAATAGGGCGTGACAAACATGTTTCTCTCTACATATGTGCGTCGAACTAG
ATCAAACACAACGGAATAAATTTAAAATAGATAAAACATATTACATGAGC
AACCCATATGCTAGCTCCGTTGGAACTGCTCAAATTCACGCACGCGAGCA
CCACGGCTGCCTCCATCTGCCCATGTAGAGCCGCAACAGCGCATGGGTGA
AACTGAAATCAACCGATCCTGCACATATGCACATGGCTGAAATCAATCAA
TCCTGCGCGTGTTCAACAAGCCCGATTGGGGCAGCTTCCCAGCGGAGGCC
AAATCGATTTATCCCAAAATCGATTCCCGCCAGGCAGACGGGGCAAGGCG
GATGGCGACCTCGTAAGGGCGCCGGTGGGAGTGGGAGCGCGACGGCCGGC
GAACGGGGCCAAGGCCGGAGGAAGGGGTCGCCCCTACGAGAGGCGTGCTG
TGACGCGTGTGTCGTCTGGGAGCGCGACGGCAACGGCGCCCTCGCAGGGG
CGACTACGACCTTGCAGGGGCGTCGCGGCTGAAGGTATCGGATGGTAGTT
GGGACTGCGCGTGCACGGTGGAGTTTTGCAGAGTGCGGTAGCGAACGCGG
TATATTTGGTGCGCCGGATACAGATTTTGCCGTGTGCTGGTTATTTTTTG
GGGTGTGCTATTTTACGGCGTCTGCTGGAGCGCCGATTTTAGCCTCATGT
GCGCTAAATTGACGATTTTTATATCGCGGGCACGATTTAGTGCGTGTGCT
GGAGATGCTCTAAGAGGAAAAAACATCCGTGAAGTCCCATGTTGTTGGCA
GGATAACCCTCAATCCTTTTGCGCCAGCCCTGGCCGAGAGCACAGCCTCA
TCCTTGATTGCTGCACTAATGCAGGTGCAGAAGGTTGGATTCTATCGAAC
ACACAGGCATTCTGATGTTTCCAGATCATCCATGGTGTGAGCATAGCCTG
GGATGTGAACTGTAGAACATTTGATATGCTAGCTTCCAATTATTACCCAA
AGTAAAAGGACTACATTAAAAAGGAGAAGCAAGTTGTATGAATTTATTTA
TAGGAAGTGGTCGATTTTTTTAATCGGACAATCCGGTGTGCGTGTGTGGC
AATCAATATTTTAGCATGCTACCACCCAGAAAGTTCGATTGGGCAACACT
GTCATGGAGCTCTTCAAAATTCTATTTTGCAGCATCTTTCATCTCTCATG
CCAGTCCAACCCTCTCTAGTAGACGCCAAGTCCTGCACGTCATCTCTCGA
GAATCTTTGGGCAATCAAGCATATATTTTACATGGTAAAACGTTCTATGC
ATACACAAATCGACACAAACACTTAATTTCTTGGTTTAATTCTGCTAACT
AGCTTATAAGGACTTATGACTATTCTCCTTCCTTCATATTCCATTTGGAG
CTTTCCTTATGTAATATAGTGCAAGATCCCAGGGGCATCTACTAACATTT
AACTCTTTGATTTCACCCCTGCTATGTTTACTTTCTATGCAGTGAGCTGG
AGCTTAAACCTGAGGGGAAACTTTCTGTTACTGTAGTAAAAGCAACGTCT
CTGAAGAACAAGGAGTTGATTGGTAAATCTGATCCCTATGTGACCCTGTA
TGTGCGTCCGATGTTCAAGGTCAAAACAAAAGTCGTTGATGACAACCTAA
ATCCTGAATGGAATGAAACATTTGAGCTGATTGTTGAAGACAAGGAAACC
CAATCTGTCATTCTCGAGGTAATTCTATGTTGTTTCCCTCCTTTCTTTCT
TGAAGATGGACTGAGCTGAGGTAAAATGTTACTTCCTTTGTTCCTAAATA
TACGACATTTTTGCAGTTTATTTTCAACTGCCAAAACATCTTAGATTTAG
GGGGGGGGGGGGGGGGCAATCAATTAAATCAAATTTATTTATTTACATAA
AGTGAATATATCTAGAACAACTAAATTAATCTCCACTCATGTACCTCCAA
AAAGGAAATCTTTGAAGCTCACTGAAACATTATCTGTGGTAGATTATAAT
CCTAATAGATGTCGATCCCCAGGCGGACTCCACGAGCCAAAGCTTGCTAC
CTGTCACCTCAGCGGCTGGCCCCTGTTGTGTTGGCGTGGGCCCCATCTCC
GAAGGAGGTGGCAGGCTCCCCTAGGCACTGTGAAGAAGGTGGAGGTCGGC
CC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.