Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027684

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027684
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027684
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGATGGTGCAGATTTTCATGGAGATGCAAATTGTTACTGCTGCCGG CTGCCCTGCTAACGATGGAGGCAGCGATCTTCAGGCCCATATTTTGATCG ATTCTCAGATAGAAGGAAAGATGGAAAAGGTAAGAGGGGAGAGGAATCTA CGTGCCTTGTTTTTACGTATATGTTGACTCCCATGTGAGTCGTGTTGGAC TCGTGACATGTTGGGGACGGGCTACTAATCCACCAATTAAATCATGGCCT TAGGTTGTAGATCCAATAGTTAATATAATTTAGGTGATGTGGATTAATGT GGTGTCTCGAAACACACCCTTATATCCGAGGACATCATATTTAATGGGTT GAAGGGATCTGGAAAATAGATTTATGGTTTCATGGTTGTCACATTTTATG ATAAGAAATAATATGGATCCAGGCTTATAAAAAGGTTGTGGTTAAAATAT TATGATATATGAGTAAGAGATTTAACAAACTTAAATTTCTAGTCTGAATA TTGTTATGTCATCTGTCAAAAGATATATGTAAGGAGTGTGTTGGTTCTAT GTAATATTAGCTCAATGGTAAAACTATGTGTGAGTTAGATCAGTATGTGA GCTTGATTAACATGGATAAATTTTCTTGATGAACTTAAAAGAAAATAATT CATCAAATAGTTCGGTCCAATTAAACAATTAGAATTGTTACCTCGGTCTG ATTTTCTTCCTCACAACTACTTATGAAGTTTGAAAACACGAAACCTCTTT TTTGTGAATGAGAGCTTGTATTTAAAAAGCATCAACATTACGATCATACT TATAGAGATTATATATAAAGGGTCATATCACAACCAAACAAAATGTTTGG CTTCTAAACCGCCTATACTTGCAAGAGTGTGGCTCACAAAGTTCCGCTCA TGCCTAATATGCTCAAACTTAAACTTTATAGTGTCATGGAGTTGACCTTT ATTTATTTCATGAGATAGGTGAAAACTGGCCTATCTTCATATTTGTTCTT GATGATGGCTATTGCTCGATAATGTACGACAATGTACTCCATTGTTGTGG TAAGGCAAATCCCTCCATGCATGCACCCGCCTCCGCCTCAAAACGTGAAA CCTTATAGATTTAAAGAAGTTCCAAGGTGAATTGTTACATTATTTTTTTA TATTAATATGATCCTATAAAAATATATATACAAAATTAGTATTATATTAG TAAAAAAAATATTTCCAGCAGATCCATGAAGATGTTTTTTAGGTTATTGG TTAAAGAGAGAAGTATGGCGATAAGTTTTATAATGTAATCTATTTTGATT CATTATTTTTATCTATGTATTAAAACAATTACATGTTATCTTCATCCTTA ATTCTTGTTTATACACACTCGACTGGTATTTATGGTTCCATATAACACAA ATGCACATCTTCAGTAATATAGTTCTAGTCTCTTAATCATCGTTTGATTT TATTGAGTGAATGAAAGATCCATGCTCTTATTTTGACTTCACTGTATCAT AGAAAAGACATGCATGGAAAATATTCTAAGGTTGTGAAATCATCATACCA AACAGTATCCATGAAAACTATTTCTAATAATTAAAAAGTCCATATTGTAG GTCCTCTGAAGAAAGATGAAGTAAATCAATTTAATTCACACGGCAATCAC ACAAAGTCCTAAAATAACTTGTTTAATCTCTTGGTATTTTCCCTATTTTC GTATACCCAACGATACCCATATATAAATTTGTACACTTATTACGCACCGC CCAGTTATAATTCACTTTATTATAAGTTTAAGGCTCCATTTGGCACCCGA GTGTTTCCATTACCCAAATATTGTACAATTCTAGTATTTACATGGCTAGC CAAAAAATACTATAATTTTGGAAAAAAGAAGTCTGGTCCACTTATTTCTG TACTAAAAAATCACTGCAATATCACAAATATAATAGTGCATTGTTAACTA AACCAAACCTTAAAGTACTTTAAACCATGGTATTCAAACATTGCAGTATT TTTAATATATTTCAAAAAAACACATTGCTGCAAACACAACCAAGGACATA ACAAAATATTTCGGACATGGTTGCAATTGGGATGATGGACGTTGACGTGG TACATAGACCAAATGTTGAGTGAAAAACCGAAAGTGTTTAGATTGTCAGA GTAATAAGATATGAAAAATATCCATTGTACTGTACATTTTTTCCACAAAT TGACTTGGCTAGCTGATCTCCTCTATTATATTCAAACGGACTCGAGTAGA ATATTTTCCGTACCAATGGACTCGGTTAGTCTGCTCCTTTATTTTCAAAC GGACTCAGCTAGCTAACTCGATCGTGTACCCTTTTTTTTTAAACGGTCTC GAACCAGCTATTTCTAGGGATGCATTGCCTACAAAGAAAGAAATGCTTGT ATATTTTTTCTGCATGGACGTCTAGTTAATCACAGAGTCCATGTTTCAAA GGAGTGGACACGTAAAGAAAGTACATAATGTTGTTTGATACGGTAGTTAA TTTGGATCCGGCAGTTCGGAAACTGATCTATGCTAAAGGGTATCTCCAGA GGACTCTAACGGTAGCCAATGTCACGATTTTATCTGGTATACAACCATAG AGCGTGTCAAACAGTTTCAAATTGGACTATGTATGTAGTTACGTGACTAT TAGCCTTTGATAAATCCTAGCCCCATATTATAGATCCAACTATTACAATA AATTTGGATGATGTGGGTTAACGTGGTGTCTCGAAAAACACCCTTATATT GCTTTTAATATATAATAGATAATAGATATTTAAGTATTACATCTGGGGTC TGGCTACACCGAGGTCGACCTAGATCTAACTTATAGCGAGGTCAGTTCCG ACCAGGTTGTTCCTGCCCCGATTTCGCTGTCGTTTATCGTCGAGCCTTTC CGGAAAGGGTCTGGCTACCATCGCGCGCTGCCAGCTTACACCTGATCCCC CCTCCCTCAAAATCGATCTGATCCCCCCTTCCAGCTTACACCTGATCCCT CCTCCCCCCCCCCCCCACCCCAAATCGATCTGATCCTCCCCTTCCAGCTT ACATCTGGATCTCCTTCATACATCCTCTCGTTCCACCACCAGGCTCCATG AAAAGCTAGAGAAACATCCTCTCAACCACCCCCTCCCCCCATCCCCCCTC TACCACCACCAGCTTACATCTTTCATGTGTGAACTTACACCTTTTAATGT TCTTCTTCCCCCAGCTTAGACCTAGATCCTCATCTCTCCTAGCTTACGCT CCAGGGGGCAGCTTACATCGTACCTGCTGAAGTAACATCCAGGGAAAAAA GAAGGCCTGCTCCCTCTGTAAGTTACATATTTGTTCTCTTCACTACTACT ACCCCTAATCCCTCTTCAAATCTATGATTCATGAAACTTCCTGGAAGCTT TTACAGGAAAAATATAACATCCTGTAACATCTGGCAAGTTTCTTTTTGTT TCTGACAAAATCTATATGCCTAACATCTTTGCCATATAGTCCATATATGA TAACATCCTAGCAATATGTAAAACTTCATGTCAGGGCAATAAAAGTAGCA AAAAAAAGCAGTGATCCATGGTAACATCCTAGCATATTAAAACTAACCTG GGAGTAGTTGTAACATCCAATCAGTTAAACACAAAAGCAGTAGTTGTAGC ATTCAGTGAAAAAGGTAGAAAATAGTAGTTAAGCAAGCAGTTTGCATGCT GGAAACACGAACCAAATGCAAAAACAATGAACATCCTGGAAACAGAAACA ATAAAGGATAGCTGGAAAAATCCTTAAAAAAGTTGGGAACTTGTTGCAGT TTAGGTACTCCTTTGGTGCAGTGTCATTCTTCCTTCTTTTTGCCATGAAA AACTTCCCACTTTTTTTGCGATGTAACATGAATCTGCAGTTACACAGGTA GATAGAAAAGTTAGTAGTTTTTTTTGAGATGTAACATGAATCTGCAGTTA GTAGCTTTTTTTGACATGTAACATGAATCCGCAGTTACACAGGTAGATAA AAAAGTTAGTACCTTTTTTCGAGACGTAAGAAGTAGCTTTTGTTTTCTGT AATTTTAAGTGTGTTGTTAGCAAAAAATGTACTTATCTGATAAAAAAACA TTTATGTTCTGAAATTTTCAGGAGTTAATAAAATGCCAAGAGGTTTTGAG TGGTGGTTTGGAGGGATTGATCTGAATCAGCCATTACATTCAGACGAAGA AACTGATGTTAGGGGTGATGGTGCTAGGACATCGACTGCCCGTGATGTTC AGGGTGATGGTGCTGGAACATCAGCTGGTCCTACTGATACAGATGTGCCA GATGTGCAACCAGGGCCTGATGTTACTTCTCGTGCATAAACAGGGGTGAC GCTTTCTAGTGAGGACAGTGATGGTGAGGATGAGGTTCAGTCTACTCCAG AAGCTTTTGTTCCAAAAACCCCATTCATCGGGATGTTGTTTGCGTCGCTT GATGAAGCATTGGTTCATTACAACAGATATGCTAAGCATGTTGAATTCTC AGTGAAGATAAAGTCATCAAGGAAATCTGCAAAAGATGGTGAGAAGGACA AGAGTGTTTTTGTGTGCAACAAATCAGGGAAAAATCCAGAGGTAGAAGAA GTGCCATTGAAGCAAAGAAAACGTACTATCACCAAGCTATGTGATTGCAA AGCAAAGATGAGGGTGAAGCGCACCGGTGCTAGATGGCAAGTGACGCAAT TTGTTGAGGAGCACACTCATGATGTTATCCAGAAGTTCGCTTTGAAAAAA TATTTGAGATCGCACAAGAAAATACCAAAAGAGGAGAGAAAACTTATAGA CTTGTTGCATGAGGTGAACGTCAGTTCTGGTAGGATTATGCAGATTATGG CTGAGCTTTATGGAAACAAGCAGAATGTACCATATGACAGCAAGACTGTG AGTAACTACATGGCAAAAAGTGGCGAAAAAGACAAATTCCAAGATATACC TGAGTTGTTGGAATATTTTGAAGAGTTGAAGAAACAGGATCCGCGTTTTT ACTACAAGTTCTACCTTGACGAGTTGTCTCGAGTTAAGAGAATCTTCTAG GTAGATGGTGCTGCGCGAGATGTTTACAAGCTGTACTATGATTGCATTTC ATTTGACACGACGTACATGACAAACATGTATAAGATGCCATGTGCGCCGA TCATAGGTATCAACAGATATGGGCAATCCATTCAACTTGGGTGTGGTTTT GTACGGAATGAGAGAATAGCAGATTTTGTATGGCTGTTTGATATGTTTCT AGATGCAATGGATGGGTTGCATCCGAATAACATCATAACTGACCAAGATG GTGCTATGAGGAGTGCAATCCTTGTTTTGTTGGTGCACTATGCATAGGAA TTGCAGATGGCATATAATGCAGAAAGTGCAAGAAAAGCTTGGTCCTTTCA TAGCAGAAAGAGAAGAATTGAGGAAGGATTTCAATGCAATCATTGATTAC AGTTTGAGTATAGAGGAGTTTGAGACCAAGTGGTACGGGATGTTAATCAA GCATGATATTGTTGAGAATGCTCATTTTCTTGATATCTATGATCTAAGGC AGAACTTTGTTCCAGTTTACTTCCAGCATCGCTTTTTCCCGTTCCTGCAG ACTACAGCAAGAAGTGAAGGGTTCAACGCGGTACTTACGAAGTACGTTAG TCCCTATGATAGCCTTTTTCGCTTCTTCAAACAGTACATGAAGTTGCAGG AGCAGATTGATGTAGCTGAAGATTCACATGAGTTTGTTGGCGAAGATAAA AAATGTTAGACTTTGGTCAGATTTCCCTATGGAGCAGCAGATTTTAGATA CATACACTCTCCCGATATACAACCGTTTTCAGGTTGAGTTGCGTAAGATA ACTTCCTACAATGCTCTTGATCGTGGAGGTGGAGTATTTGAAATTGTTCC AATTCAGGGGGCTGTCTATGGTTATGGCATAAGAAGTTACATGGTTGATG TTGATTTAGAGAATGAAATATACAACTGCCAATGTTGTAAGATCAAGAAG GATGGTATTCTATGCTGCCATGTAATGAAGGTCATGTCCCATTTGGGTGC GGTGCATAGAATACCAGACCACTACATCCTTGCTAGGTGGTCCAAACCTC CTCCGGATATAGTTGTGCAAACCATTGAGCCAAAAGAAGTTGTTCATCCA ACTAAGAATTTGTCAAGGAAAGATATGAGGATGTTGCGTTATGGGAACCT ATGCAATGATTTTTCTAAGCTTGCAGTTGGTTTGGCGTCCTCAGAAAAAA CAAAAGAGATTGCTGAGAAACACATGAAAGCAATGGAGAAAGAAATGGCC GATCTCAAAAAGGCTACTGCAGATGCGCTGAAAAGGAAGAAGGGGAAAGC TCCAGTAGTTCCTGCTACCATTGAAATGACAGATGGAGCCCCTATGGAAG AAGATCCCATCCTTGCTACCAACAGAAGAGCGCAAGACCCTCTTCTCACG GCCACTAAGGGGAGACCAGCTCATAAAAGGAGGAAAAGTGGGTTACAACT TCAGAAGCCTCATCCGACTAAATGCACTCTCTGCAAAGAGATAGATCATG CTAGCCAGAACTGTCCATTGAGGCTTGCTGATCCAGGAAAGCACACTACG TTTTCGCTTTTCAAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.