Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA004680

[Submit comment/correction]

Sequence
AA004680
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004680
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGGAAGAAAAAATTGGATGGAAAAGATCTCACTCTGCGCGTACGCCACG
ACACGAACCAGCACGAGCCGTGCACTTCTCCCTGCGCTGCGCTGCCCCTG
CCCGCCCCGCCCCTACTACTACAACTACACCACCCAACTCGTTCTTTCCC
TGGCGGTCGTGGGCGTCGATAGAACCAAAGGATTTTGAGGTTCGGCGATA
TGGGGATCTCGAGGCGGTTCCTCCTCGCGGTGGCGCTGCTGATCGCCGCC
GTCGTGGCCGGGGCGGCGGCCGAGGAGCAGGCGGCGGTGGACACGGCGGT
GCCCGGGGAGATCGCGGGGGGCGTCAAGGAGGCCGCGGAGGCGGACGCGC
TCAGGGCGGAGCTGGCGCAGCTCAGGGAGAAGATCTCCGCCTTAGGTCAG
TTCTTTCAGTGCCCGTCTCGCCGCAGTCGCGGTTCGAAATCAGAGGGCGT
GTTAATTCTCCCCTGTTGTATTCTATTTTGTGGGGGTGAGGACCGAGTAG
GGGATTAGGTTGGGCCGTTGGGGCCGGTGCTGTGATTGGATTCAGGCTCT
GGAGCCAGGTTAATCCGCCATGTTTCGCCTGGATTGATTGATGGATGGCG
TTGCGCTGGAGAGCCAAGGGGGTTAAGTTCTGGGTCCAAATTTGACGCCC
CGACCTGTGCCGGATCCGTCTCGTAGGGGTTTAGTGTTGACGTGATGACT
AATTCTCTCGTTTTGCGTGGCTCGGGTGTTATACACTGCTCAATTCATCA
ACTGGCCTGCTGTTCTGACAATTTCCCCTCTTGTTCTGTGCCGATTGTGG
TCCTTACGTATCTTACATAGTAGTTGCATAGTTTTTGGTTCAGCAAAAGA
CTGTATTTCTGAATTTTATGTCTCCTGTACAAAAGTCACCTTTTGGGAGC
CTTGTCTCTGTAGTGGTTGGATATGAAAAGAATCCATATTTGTTGACCTG
GAATTTGCTTTAGAATCGGCCAACTTTGGTTCAAATAAGATTTTTTTTAA
CACTACGAGTTCAATTCTGTATGTCACAGTCAATATCTGTTATAGTAAAA
TGTTTCCACCGTCAGCAACACTACTTGTGTATGTTTGGCATGCCAGATTA
GCTGATTTCACCAAAAGCCCTGCCACCTTGGCAGCTACTAATTACGCTAC
TCACTCCGATCCAAATTAATCGTCGCAGATTTAGGCAAAATGTTTCCTAA
ATCTGTCTAGGTTCAGTGAACCTGTGGCAACTAATTTGGATCAGAGGTGT
AGTTGAATTTGCTCGTCAAGATCCTTTTGGAGACCCTCATCTAAGTAAGA
TAAGTCTGATTGTTTTCGTTCTACAGAGTCAGGCATTGCAGAGAGATCCC
AGGACCTGAAGAGCAAGGATGATGGCATCGCAAAGCTGGAGAAATACATT
GAGGAAAAGTCGCAGAAAATTACTACTCTGCAGAGCGAGATCACATCCCT
CCAGGTACTTTTTTATGATAGATAGATACCTCTCAACTCTGAAGCATTAT
TTTTTACAGTGTCTAAAACATAAATTTGTGGCCTTACTAATACTTTTTGC
TTCTTTCGAATCAATGTACAGAAAAAGGGGTCTGTGGCTGCTGAGGAGCA
GGCTGGCAAAGCCGTTGCCCGGGCTGTTGAGCTTGAGAAGCAGGTATGGG
AAATGGAAGTTAAAGAACTGTTGAAATTATCGGTTACGAGCTCGTGGTTT
CTCATCTTTGTTGTTCTAGATTGACATTCTCAATAAGGAGATCGAAGCAC
TAAGTAGCCAGAGAACAACACTTGAGGCTAGAGCTACCAAGGCAGAGAAG
AAGGTGCAAGATTTGAACTTGAAGCTTGAGTCTGTAAGTGTACTCCTTGG
CTTCTCTACTATTTGTAAAAATCTTTTTTGTTGTTTCTGGACAGAAGGTA
ATTGATATTGCTGTTGGGGTCATGGACACATTGCAATGCAATAATTACTT
CTGTACTTAACACTTCATTCGGAGTGGTATCTGTATTTTCTTATTCTCTT
TGATAGTCATGGACACGTTGCAATGCAATAATTACTTGATGAATTCTATT
GAATGGGCTATTTTCGTATAAGTTCACCCAAAGTGAAATATAGTCTCTTA
TGATGCTTAGCAGCTTAAATTAATCAAGTGGTTACTTGTTCATATATTGA
ACGTTATATACCTCAAAGTCAGAAGTCAATAATCAGTTTGAAAAGCTATT
GAAGGCCGAGTCTGCATTCAGTTTCTTAAGCTATTGAAGGCCTGCGTGAT
GAGTACAGTTGAACTGAACGAGGATGCTAGATGTTGATCAAATTGTTCTT
ATTTCTCAATTTTATTCTTGCTAGCTCCAAAAGGCAAGTGGCGAGCAAAA
GCGGACGATCCAGAAGACGGAACGTGCTCTTAAAGTTGCTGAGGTTTGCA
ATTTGTTCTGTAACTGTTACTGCACTTTCCTAGGTGGTTCTAAGGTTCAT
TTGATTCCATATGTATTCTTTCTCATCTGTAGGAGGAATTGATGAGGCTG
CAAAATGAAGCAACAACTAAGTCAAAACTGCTGACAGAGGTAACCATATA
GCTAGTAACATTTTTCACCAGTGTGTGCCTGCGAGGTCAAGTACATTTGG
AAACCTATTTGTGACAACAAAATCATTCCATCTCTTAGACTTATCTTCTG
TTATAAAGAACTCACAAATTAGGGCTGGAGAAAGAGTTTTTTCTTGTAAA
TATGCTTCTTTTGGTTGCCCAGAATGATAATGATAATTTCTGCTGATCTA
CAAACATATTTCTCTCTGGGAAATTGGTGGTTGTATTGTTAGTTTGAATA
AAGAGAACTTTCAACAGATATTAACTTGCACACTAGCTACATAGCTTTAG
AATGCACTTGGGCATTATTTGTTGTGTGTCGTCAGTAGTCTGTTGGCATA
TCTGATTGTTAGCTTGTACTTGCAATTTGTTCTACACTTAAGTAAAAAAT
GTGTACAACAAGAACCCATGTTCAACTTGTTTCCAGAGTTAGAAGATATA
TATCTTTTCTGATTGTCCGTTACGAAAACAATTGCATGATTTTGTTTTTG
TTCTTTTTCCAAGGTACATGGAGCATGGTTGCCACCATGGTTAGTGACAT
ATTCTGCTCGCTATGCGGTAAGATGGAACCACAGAAAATGCACCTCTGTC
ATTTTTGTACTCACACTCATCAGTGTGATCACCATCTTGTGTAGGAGGTG
GTCTCAGGGCACTGGAATGAACATGGAAAACCTGTCTTGGAGAGCTTTTT
GCAGAAGGTACCTCTTAATGAAACAGTTCCTTATATACTTCAGTTACATG
ATGCAATGCTTAAATAAAGTTGTCATTTATACTTGTCTGCCATGTCAAAT
TGCCGCAGGCATCAGAAAAATCAGCACGAGCAAAGAAATGGGCTGAACCA
CATATTGAGACTGCTCAGATGGTACTGTCATTAGATCCATGCATTCTACT
CCTTTATTACTAATCTTGCTCTGATAATATTAATTTTGTGCTTGAAGAAA
TTGGCTCCTGTCAAGGAAAAATTGGCCGTGCTCAAGAAAGATGCAAAACC
CTACCTGGAGAAGGTGTCGACAAAATCAGTGGAGGTTTATGAGGCATCGA
GGGATGCTGTTACACCTCACATTGTAAAACTTAAAGCAGTTTCTGATCCC
TACTTCCAGGTACTGTTTGTTGGTTATGCTAATTGTTGTTATTATGGTTG
TAGTTTGCAATCATTGATGTCTAGTTATGACTGTTGATTTAGGAAGCTAA
GAAGCTCTCCAAACCTTACATTGATCAAGTTGCTGAGATCACGAAGCCAC
ATGTTGAGAAAATTAGAACTACTCTTAAGCCTTACACTAAAAGAGCAGTT
CATGCGTATGGAACATTTCTTGAGTCTGCAACCACATACCATCGTCAGGT
TTGTGACTATATTTTCCTCATTCATGCTAAGTCATAGTATATATGCTAGC
TTCTGTCTATGTCAATATTTTATCAAGTCTCCGTTGTCTCACCATTGAAG
TTTTCAGTTGGCCACTTGGCCCCTCTCCCTTCTGTGCTTCTACTGGTAGC
TGCTAGCCTTACCTTAATCAGCCCATGGACCTCAAGGTTACATGCTTTCA
TTGGATCTACTAAGCGTCAGAACCTCGTACAAAAATACAGAAACAAAACT
CAACCCTTGTGCTACTGCTGCTATGTGCAGTGTTGCCTCTAGTTTCTAGC
TGTAGCATGCTGGAGTAGCAGCATGTGGGCACCACTGGATGCGCCCTGAG
TCACCATTCGTAAAGGCGTAAAGCATAGTTCTGTTGTTTCTTGTCTAACT
TCTTCAGCACAATGGCCTTGAGAGGTTGACCCGCTAGTGTGACTTTGTTG
GTTAAAGGGCCTCCAGTGGTGGCAGCATGCCTGGGAGATGCCAAGGCTAT
CTTTAGTGCTAAATCATGTCATCTATGGGTTCCAGCTAGCAATGGAGCAG
TCTGCAAGTTAAAGCAGTGCAGACAACAAATACTCCCTCCGTTTAGAAAT
ATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGGAGATGTATCTAGACACCTTTTAGTG
TATAGGTTCAAATGAATCTAGACACTAAAAGGTGTCTAGATACATCTTAT
TCACAAATCACAAACCTAAAACATCTTATATTTCCAAACGGAGGGAGTAT
AACTTAAGATCTTGGTTTGAACCAGGCCTCTATCTCAAATATTTGAAAGG
CCAATAGGGTATTGTAGCCTAATGGAATCTCCAGGGGAATAGACATGGAA
ACCATTTTTTCTTCCAGATTGATTACTGTGTCAAATGGTAGTCCAGCATG
TACATTGTATGCTAAGGCAAATACCGAAATCTGATTCAACGGTGAATAAA
CCTCCTGGACCTGATCTAGAGTTGTTACTTGTATATGTGCTCTCCCGTAG
CAAAATTTTCAAATATAGTATTCATTTGAAGTCCTATCAGATGGTTAATA
TCTGCAGCCTGATAAATCAACACTAGACAAGAAGCTATAACAAAACACTA
TGACCCTTGCCAATGTTCACTCCTAAATGCATTTATATGGGAAAAAATCT
CAAATTTTTCTCTTTTCTTAGGCTCAAGCAAGCATCTCAGATTACTTGCA
CCAACATGAGATAACAAAATCACTTGTGACGAAGGAGTTGGTTTGGTTTC
TGGTAAGCACTCCTGGAAAATAGTCAGAAGTAGCAACCTTGATGGCCACC
TATCTAACCGTCACTCCCATATTTTTTTACAGGCTTCCGCTTTGCTGGCT
CTGCCTGTGTTTGTTATATACAGGCTTCTAGTAGATACCTTCTGGTAGTT
TGCTTTATTTTTGTATCTGGTATTTTAATTATTATGTTGCAACCTCGCCT
GAGCTGATATGTTCATAATTGCTGTGAATTCTCTTGTTGACTTGACACAG
TACCAAGAAGAAGAGACCCTCTCATAATGGTAATGGAAACAATGGCAATA
GGAGACACAAGCGCCGACATGCTGAGAAGTGAACTGTTTTTGACTGCCAT
GTAGGGTTGCAGGTACTGTTTGTCTCTTCATCAGTGGTAGACTGGAACTA
GGCTGAGCCTCTGTATTCTCTCGCTGACATCAAGAACCGTTTATATTAGG
CAAAGTCAAAAAGTTTGTTAATTATCGATGCGTTAATTGATTCATGTTTG
ATATTCTGATATTGGTGTGCAGAAATCAGATCAAAGTTCTTCCCTGAGGC
TGTTCTCATGAGCCATGGTAGAAGGATGGAACGCTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.