Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002260

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002260
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002260
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCATCATCAGCTGGAGTGGATCCGTCGTCAGTACAGTACCTCTTCCCAT
GGCGCGTTCCCTGTCGGCCGACTCCGTCCCCTTCCCCAGCCTCTGTAAAC
CCTAATCCCGAACCGCATCGATCGAACGGGATTTCAAATCAAATCGAACG
AGAAAAAACGAACGAAAAGCTCCCGGAATCTAGCAATGGACCGCTCCCGC
TCGAAGCGCGGCTACCACTACAACGACCAGGACTCGCCGCCGTCCCGCTC
CAAGCCCCGCTTCGACCGACGCGGCGGGGGCGGCGGCGGCGGCCCGAATC
CTAACGCCAACAACTACCACCGCCGTGGACCTCCCGGGGGCGGCGGCGGC
CCCGACCGCCGTGGCAACTTCCTCACCCCGGACACCGCGCCGCCCCCTTT
CCCACCCCCGCCGCCTCCCCCTTCCTCCGCCGCGGCGGTGGGGGGCGGGG
GTCCGGGCGGCCCCGGCCCGACCACCTCCTTCCGCATCATCTGCCCGGAG
TCCAAGACCTACGGCTTCCCAGCCAGCTTCATCGTCAACGCCCAGGACGA
CAGCGGCGCGATCATCACTATCCACGACCCCTTCGCCGGGGATCCTGTCC
GTGTCATCGAGACGGCCGATGGCGCGCCGCGCGAGGCGGATGGCCGCCCG
CCGATGTTCTCGCCGGCACAGGAGGCGCTCATTATGGTCCACCGGAGGAT
CCTGGAGACGCAGCCTGATGACGGGGATGACGACGGCGAGTACGGTCCCA
GGGGCAAGGACGCCCGGGACCGCGGTAAAGTTACCACGCGCCTAGTCGTG
CCACGGCAGCATGTAGGATGCCTGCTTGGCAAGGGTGGCAAGATCATCGA
GCAGATGAGGTCCGAGACCAAGACGCACATTCGGATCCTGCCTCGTGACC
AGAATACTCCGCGGTGTGTATCGTTGTCGGAGGAGGTTGTACAGGTATGG
TGCCTGCTACAATGTTGTACTAGATGTTTCAATTCTGGTTTTGATAAAGA
GCATTGCCATTGGTATTTTGAGTTGGAATATAAGATATGTCACCGCTCCA
TTCTAAATTATTAGCTGAACTAAAAAAGGAAATAAATGTGGGTTAACAAA
TTATGTTGTTTGATGGAGAAGACTCGGACTGAAGACAAATCAAACAGATG
AATGTTCAACTACTCCTTTAAATTAGTGAATGAGCACATCATCTTCTGGG
TACCTTGAGATTTGCTTTCCGTGATGACCTTTTGATGTGCCCCTTAGTGC
CACAGCTGCTCCCATTCGAAAGTATTACTTACGTGTAAGGAGACACGGGA
AGTAAGCCAGTGCACAAGTTATGGCATCCATGTTTTGCAATTCTCAAGTA
CTTCAGATTCGAGAGAGAGAGCAATCGAGATTGCCGCACCGGAAGCCAAC
CTCGAAACCAAACCTAATTACTGGACTCCACTGAGATGATCCATATTGGA
TTAGTCTGAGTGCCAGTCTGATCAATAATGCCATAGTTGGTCAGCTGCTA
TTCAGATTGGATATAAGTTGTGTGTGTCTTTGTTCCAGGGGTATTACCAT
GTTGAATTAGTCAGAAGGAAAAAGTGCGTGGGAGAGACAAGACCAGGACA
AATTGTGTGCAATTAAATTGTTCTAGTATGAGTCCTCTGTTTTCTTCCCC
ATGTGTTTATTCCCTCTCCCGAGTGTGTTATGGTATCACAAGTTCGTTTG
CTTCTATGTGAAGTGACAATGTGACATTGTGGTGGTATGATGATAATCAT
TGGTTTAATACAGGAAAAAAGTGAATTTGTTTCCTGAACGAACTGGAATA
TTCTCAGATGCAAACAATAACAAGAAGTATATGAGTGATGCATCACTTGC
TACATACCTCAAAATTGGGTTTTCGTGATGACCTTTAACCTTTTTCTCCT
AGCTCTCACAGTTCTGTTGAATGATCACCCTGATTCCCAGGACATGTCCT
GCACAAGATTGTTGTAGGATGGTAGCTATGCGTTTGCTCTGGATCCTTTT
CTCTTTGTTAAACTTATTTATTGATAGCTTAAATCTGATGCATCATCCAA
CTAACTGTCTTCCAGGTAGTCACTGATGGTTCCAGGTTCATCTTCCTCAA
AATAGGATTGAATTCTCAAACGCCAACTCTAAATATTATAATTTAGAGAA
CTATCTGGACATTGTTTCTTAACACCATATAATTGTGATCTTAGATGCAT
GATAGGACAAATTACTTCTGTTCCCAATTTATTTTTCACTGTAAAGCTTG
TCATTCTGAGGTGTACTCATGATATGTTATTACAGATTGTTGGAGAAGGG
AATTGTGTTAAAAAGGCTGTAGTAATAATCTCTGACCGTCTGAAGGAAAG
CTTACACCGTGATCGTGGTCCCTTCCGCGGGCGGAATTCCCCAGAGCATC
GAATTTCTCAGGCTGATGAGTACATGGGTGGTGCTCAGCCGATGTCTGCA
TTTGAAGAACCTTATGCTCGGTTTGATCAAATAAGAAATAATGGTAGCAT
GGAGCCACCAGGATATGAGTTTGATTCAAATGGTAGCAAGTTCAATGAAC
ATCCAGAGATCCCGTTTGATGAAATCATTTTTCGAATTCTTTGCCCAAAT
GACAAGGCTAACAGTTTACTAGGATCACGTGATGGAATAATAGAGATGTT
ACAGGTTGACGTTGGTGTTGATGTGAGGCTTACTGATCATATTGCTGGAT
CTGATGAAAGGACTCTAATCATCACATCTCGAGAGGTAAATGACATTACG
TGTGTCCCTGTACTTTATCGCCCTACATACTGTTCTAGAATTTGAGTACC
TAATGAGGTTTTTTTTTTCTGTATGCTACACATGGCACTATATAGTAAAT
ATGCCATATAGTGATTATATGTCTCATGCTGGTTTGTAGGTGTCAATACT
TAAACAACACCAAGATAATGTTGTCATCAAGAGTGAAAACTGGAAAGTAG
AAGTTAACATATCACCCAATAATTCACTTGGATCACTCCAACGTGGTGTC
ATGTTTTGAATTCCATACCAGCGTCAATGTTGGTCAGGGTCAGCCTGAGA
TAAGAATTTAGGACTCTGGGATAAGTTAGAAGATAAGTTTGGTCACTTTG
AAGAGTGAGTTTGGATTCTACCTAGCTCAGTCTGTTGGATGATCCCTCTA
TGTAATGGTTGTTATATCAATAAACGGGAAGCAAGAAGTTATCTCCAATT
TTTCTCCTCCCTTGGTCCATCTTAGTCCCACCCTGCCTTTTATCTGAAGC
ATCACCAACCTGCCGCCTATCTCAGGGGACATGATAACCACCTACATACC
ATTCTTACATGTGTTGAAAATCGTGACTTTCCATATGAGCTACTGATTCC
AGGCTGGGAGTGGGAAGTTACAGTTATATTAGCATATGAAATTGGTTTGC
TCACTCTATGAATGCACAAAGTGGCATATTTTTAATCCTGACAAAAAAGA
ATTATGCTTAATAGCGAACTTCTTAATTTGTTGCTACCATGATGATTAAT
GATAAATGTTTTCAAAACTATATTCTATGGTCTGTTGACACTAAAGATGG
CTTGAAAACAACCATGTTCATCCAATCCTTACCCTGCTAGTGGAACTTGT
TATATCGTCTGATATGTGCCAGTGCCAAATGAGGCAACACAAGATTGTGG
AGGAACAGTTGCACTTTACTGCTACTAGTGGACAGCAGAACATGTTGAAG
GAACTGTTTCAGTGTGCTTGCTAGATATCATTCTGTGGGTGTGAAAAGCC
ATAGGATCATTACTCCCTTGCTGTTTGGAAGATCTCAAGATATTATGGAA
TATAAGTTCTGCATTATTTTGGAAACAAAGTTCCATTGGTGATTGGTTTT
GGTTGTTCACAGTAGATACTTATGGCAGAGGCTTTGGCTAGGTGTAAACA
CAAGAGATCCTTGGACCAGCCCACCATGATAATAAACATGTCAACTTCAG
AACTACAAAATAGCGTGGACGCTCCTCTTATGTAAATACAGCACCAACCC
CATCAAATCTAAATCTCATTGACTCCACACAGCGAAATTTGTCCTTTTTA
CCCTACACAGGGAAATTCGTTGGTAGCCTTACTGCCCTTGCATCTAATGA
TATTTTGTTTCGCCTATCTCTACCTGCAAAACAGTTTATATAAGTGCTTG
AATGGAAGGCATGATTATAAACTTGAAGCTTTAGTTTTTCTTGTTATATA
CCTGTGTTTGCTTTAGTTGAAGTGTTATGAACACGCATATTTCAGTTCTG
TTAACTGAAAATTTGAACCGCTTTCCCCCCTCACGGGTTCCATTTTCATA
TTCTTAATGTATCCTTGATTTTGATATAGGGCCCAGACCATGAGCTTTTC
CCAGCTCAGGAAGCATTGCTGCACATTCAAACCCATATTGTAGATCTTGG
CCCTGACAAGGATAACATAATCACAACAAGGTTACTTGTCCCGTCAAGTG
AAATTGCTTGCTTTGAGGGAAGGGATGGATCATTATCTGATATACAGAGA
CAAACTAGCGCAAATATACAGATATTACCAAGGGAAGAACTTCCATCTTG
CGCTCTAGAATCCGATGAGCTCTTACAGGTTGGTTACCTTCACTTCTGCT
ATTTTTTAGGATCTAACCAGGTAGTGGAGATCCATGCGCAAAACGACTAC
ATGACTGTGTACTTATATTTTTTTTGGAAGTTCATATCAATTATTTATGA
GGGCTGAAGATCGGATTTCCGTGTCGATAGGCCAGAGTGATCTTTTTGGA
ATACAGCGGGGTCTTCTTCTCTCTTTGTTTTTGAGCCAAGCTGGGGTTGG
CCTGTTTTTAGTTGCTTCTTGCTCATGAGGAATGAGCTTTAGGTTATACA
TTAAATTATAAAGTTTCATGCTAATATTCTCTGTTGCCTGCACAGATGCA
AAAAAATTATTGTTCGAGTTAGAAGTTCATTGGCCATTTATTTGTGAGGT
TTACCACATTATGTTTTAACAGATTGTAGGAGAGATTAGAGCTGCTCGGA
ATGCTCTCATGCAAGTAACTGCTAAATTACGAAGTTACTTATACCGCGAG
ATGTCTGGTCCTAACCAAATTGGCAGCATTAATGTACATGGACCCATTTC
TCCAGTAAATGATTCACCTCGTGGACTATACCCTGGAAATGACCTTCCAA
TGGCTAACTACCAACAAGCACCACAAATGACAACTTCATGGCACTCAAAG
GTATCTCATGAAACAAAATATACCCTTCCTCAATTTTTTTCACTCCTGAT
GTTCCCTGATATATTCTGTCTGTGCCTTTCAAAATGTGTTTAGTTTTACC
CCCCATACATCAATTTACTGTTAAGCTAACTTCACTGGGCTGTAACCTTG
CATTCTTCATGGCAGAGCAAAACAGTTACGTAAATGGTTCATAATCATGG
TGAAATTTTACTATACAATGTTAATATTCGTACTGTACGCAGTAGTTTTT
TTTTTGCGGTACTGTATGCAGTAGAATTGTGCATGTTACTCTTCTAGTAT
TATTTCATCCGGATCTGATGATTATGTTGGGACTGCACATATGGAATGTT
CAATTGCAGGACAGTGGAGTTAGTGCAAGTGGATCATTTGAGCAAGGGAG
CAACATTAATGATGATATAAGGCAAAGTGCTCCGAAGCGGTAAGTTTGTG
TGATCGCTGTCAATTCTTCTGTATTGATCCATGACCACCTAACTTCTTTT
CTCCATCAGATTTGCTGTCCCCTTAGTGACTAGAAGCACATTAGAAGTTG
TCATACCAAATAGTGCAGTTGCAAGCCTCAGCATGAGGGCTGGAAGCAAG
CTTGCCCAGATAAGCGAGGTGCTGTATATCTTGAATTTTTTTATAGTGAA
CTAAAGGCCGGTACTTCTTCACCACTCTTACTTTCTAAACTCTGTTGGAA
ACAGATGTCTGGTGCATCTGTCACGCTTGCTGAAGATAGACCTGGAGTCA
TGGAAAAAGTTGTTCGAATATCTGGTACCCCTGAGCAGGCAGACAAAGCT
CAGAGCTTGCTCCAGGGGTTTATACTTAGCAGTGAGTCTCTCACGCCCCA
CTCCCAATCTTTTGATTTATTCCCTCAATCGTCTGCACCGAGAAATATAT
AACTCTTATTCCCTTTTTCACTGCCAGTCCAAGATGACATGCCTTCGAGC
TAATGGAGTCGTCACCGTGTCTTACTCATCGCATGTTCAACAGGGCCATT
TATCTTATTCTTTCTAGTAACTGCCTGCGTAGCTTAGGTAGAGTGCAAAG
AGTTCATGCGAGATATTTATCGTCTAGCTGTATAATTTTCCCCCCTGATT
AAGCCTTGTGGCTTTACGTGTAAAAGTGTTCATGTATGTTATTAGCTGTT
ACGTTATGTTAAGTTATGTATCCACCCTTTTCCCATTATAATGAACAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.