Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA019188

[Submit comment/correction]

Sequence	AA019188
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA019188
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTTGTATTTTGAAAATGAAAAAAGCCACACCGGACATGTTGACTCTTTCT ATCGGGATCGTTGCACGTTTGGTTCCTGATCGCCCCACCGAGTCGACTAG CACGGTGACCTCTCTGTACGTCATCACAGACCAAAGGAGCGGGGCCGTTA CAGGTATACTTTTCAGAAAAGCCCTCGCATTACGTCGTATTCTAGACTAC CCATATAGTGGTACCCCGCTCCAGCTTGGGCCCTCAACCCTAACCCCCTG CACCCCTCTAACTCCGGCGAGATGCCCATCGAGGCTTCGGCGTGACGCAA CCTATCGTCGGCGGAGGAGTGAGGGGGTGAAGGCGGGGGTGGCGCGAGAT GGAGGCGAGGCCGCCTCGGGCGTCCGGCGCGCGGAGGGTGACCGCGAAGA AGCGGCCGAGGCCGGGGGATGTGTCCTCCAACAGCGCGCGGAAGCTGCAG CGGCGGGAGATTGCCGCGTTCTCCGTACGCAACTTCGCCGCGAGCACCAC GCGGGAGCGCTTCCGCAACATCCAGCTCCAGGTAGGTCCGCCACGCGCTC CCCTCCCCCCGCGTGTCTCGTCGTCAATTGTGGCCTTGTGGGTGGGTGTC ATTGGCGGTGGTTCGCATCGTTTCGTGATGATTTTGGGTTTAGGAGAGAG AATTCCTTCAAGATCTTAAATTGTGGGAACATTTGGAACCAGAGGGCACA GGTGATGCGGGGTACTATTATAAGGGGGTGCCGTGCGAGGAGGAAAGTTT TGATTAAAAAATCTTTCTTTTTTTAGAATTCTCGTGAATCAGTTTCACTT TCGTTAAGTAAGTGGGCTGTTCAGGGTGCATCGTGGAATTGCAGCAGTGA CACTGTATTGGGTGATACTAAGGGTAGAAAAGATTTGATCTTTATCGTGT TGATGCTTTAGATGGTCATCTCTAGGATAATTTTGTTTTTTAAAGGAAAG AACCTCTGAAAAATAACTTAATGATTGGTTGAGAAAAATATGCACTTGGT GAGGCCCCCTTTTCATAATTTAATCTCCCAGCCTTGAAGCATGATATCTT GGTCACCTCTGACTCTCAGTACCTGAAGTTATGAACCATGAGTAGATTTT ACAAGCTACATTTCAGTGGTTGATTCAGTTAGTCCATTCACTTACTCTGT TTAGGGATTCAGCCATGGCCAGTTAAGTTTGCTAATTGCTACCATTCACT CGTTCTGTTTTCAGCACTTAATGCTAGACAACGACTCTTGAGTTGCTTGA TTTTGTGAATAGTGTTCCTTATCAGGACTTCCCTTTCCCCTCTTAGATTC CCACATGCATTTGTTTTCTTTCAATCTGCTAGTGGCATACACAGAACGTA TATATTTGCGATTCTTAATAACATATGTTTTTATCTTATTTTTTTAGGAA GAGTTTGATACATATGATCCTAAGGAGAATAGGTCGCTACTACCTTTCTT GAGTAAACGGTCTGAAATTATCGAGATAGTTGGAGCCTGTGATATTATAT TTGCTTTATCACAGTTGGGAGTCTGTGCTGCGTTCAGTAGAGGTACACCC ATTTTAAACTTATGATAATGACTGGTCCTCGTTCGAACAACCATTCTAAT TTTCTCTTTGTTTCCAGTGACAAACCAGCGGATTTGCTTTCTGAATGGAA GTCCAGATGAAGTCATCCGCAGTTTGTTCTATAACAAGAACAATGACTCC CTTATAACCGTATCAGTTTATGGTTCTGAAAATTTCAGTGCCTTAAGATG CAGGACAACTCGAATTGAGTGAGTTTGGTTTTCTGTGTTCCTTTTACAGT ACCAGGCTTCTAATTTTGTAATATTATATCTAAATGATATTTTACTCTTC AGGTATATACGCCGTGGAAAGCCAGATGGTGGTTTCCCTCTTTTTGAGAC AGAATCATTGAAGTGGCCAGGTTTCGTGGAGTTTGATGATGTAAATGGAA AGGTGTTGACTTACTCTGCACAAGACAGGTGACTGAACTCCTTACATTTC TTAGGGAAAGAAAACAAAACTTTGTTCAAGTTATGACACTTCGTTCTCAT TTTAAACAGTACTTATAAGGTGTTTGATTTGAAGAACTACACGCTGCTGT ATACGATATCTGATAAAGATGTTCAAGAGATAAAAATCAGGTAAGGGCAT GAATCTCTCTTGATATGTTTTCCTCAACATTGACATTGTACAGCAATCGT GGTTTTAGTTTCTGTGTCGTTTGCTGTTCTCGTGCAATACTGACAGAATA TTTTTGTTTGAATTTTTTTAATCATAATTAAAAGTACGAACCACCCCTTT AAGCTCAGTCTGCGGTTGTGTTTGCTGAACTGATTTTTTGATCTGCTGGG AGAAAGTAGGTGTTGAGATAGACAGAAGTTGATTAGCCAAACAACAAATA GGAAATGTCTGGTTAGGAAACATGATTATCATAATTCAACATGATGGAAA ACATGATTATCATAATTCAACGTGATGGCAAACACAACTTATTTCACATA GTTACTACATGGTAGAATGGTCAGAATTCTATTTTATCGTGGAGATCATT TTGACATCAATTCTGTATTCCATTGTTTCTCCTTCAACCATTCATCTCAT ATGCTCTAGTAGAACGCAAAATCGTTAGCAACTAATTAAGAAAAATATGG GGGAAGCAGGTAAGCTGACCCTTTTTAGTATCTCTACATGATAAGTGAGG GTTGAAGAAAAATATTAGTTGTTGGCTGGTTGCAATAGTGCACTTGTGCA CCTTCTAGAGCTTTTTCATGATCCGGCAAACAGTGCATGCTAACTGAGAT CTAAGAAAAATATCAGTGGTTGCAATAGTGCACTTGTGCACTTTTTAGAG CTTTTTCATGCTCTTGCAAGCAATTCTACTGAGTTAGTTTTGAAGGAAAA TAGTTTGTTACTACGGGGCACGTTCGGAATCCCACGTAGCATTTTCTGTG CACTGTTCTCTGCAGCAACACAGGGTTACCGTTCACTTGAACTGTGCCAA ACAGAACTGTATCATGCTGGATCTAGTGAATAACTCAGATGCATGACTAG TCTACTGTCTTCTAATTTAAGACAAATTTGGTTGTTATTCGTATTTGCAT CCATACATCTGTTAGCTATCCATTGTTTGAGAGAAACAACAAAGAATAAA CAAGTTGTTCTTTCTAGTCTGCTGTCTTACCTAAAAAAGTTGTGCTGCCA GACTGTCCTCATGGTGGCATTAGCAATGTAATGATCTAAGCAACATTGCG TGCACCTTATGTTTGTTTGATGGAGAAGCTAATGATGAGGATTTGGGAAT AAGAGAATTATGTTTACAAATACACTTCAAAAAATACTTCCAGGCTCTCC TATAATAAGTTAATAGCACAAATGTTACAGTAAACCATAGGCCAGGAAAT ACACTGATTTAATATTGTGTAATTTATTTTGGAGTGAGCTGAAATACTAT AACAAGTGTGTGAGCACATATTTTATTCTTTGCCACTTCCGAGATGAAAT TAGCTTATTGTTTTTCTTTCAAGAGAATATGGGTGGATTTGATTGATTTT TATTTATTTTGCACAAGTTCCATTCATGAGGATTTTTAGCTCACATAACT AATTGTGTCTTATTGCTTCTTGTTGCCCTCTCGTAGCCCTGGTATAATGC TATTGATCTACTCTAGAAAAAGGGGCTATATTCCTCTTGAGATTCTTTCT ATTGAGGATGGGAAACGCTTGAAGTCGTTCAGACATCTTCTTCACCGCAA TAAGAAAGTTGATTTCATCGAACAATTCAATGAGAAACTTCTAGTAAAAC AGGACGGGGAGAACCTTCAAATTCTTGATGTAAGCATTTTTCCTTTAGTA TAGATGGCAGGAAATAAATGGAATATAATTTTCTGTTTCTTGTTTGTAAT GGACTTCTTTACACTACTGCAGGTAAGAAACTTCAAGACAACAGAAGTAA GCAGCAGTGAGTTTGTGACTCCATCAGCTTTTATCTTTCTGTACGAGATG CAGCTGTTCCTGACATTCCGGAATCGGTCAGTGTCAGTTTGGAATTTCCG TGGTGAACTGGTGACATCCTTTGAGGATCATTTGTTGTGGCATCCTGATT GCAACACAAACAGTATTTACATAACAAGCAACCAAGACCTTATTATTTCT TACTGCAAAGCTGACCCGGATGATCCATCTTCACAGGACAATGGTAGCAT TTAAACTTTCTTATGCTTCAGCATGTACAACTGATGTGTTTAATTGGTAT AATGAAGTTGTAGTCTCCTTGTTGCATTTGACGAATTGACTTGTTATGAT TGTCGATCCTTCATGTCCCCTTGTTAGATTTAGTTTGTGGCACTATCAAT TCTCTCTTCGATATAAGGCATTCCTCCCAGCTTTTAGTTGTAGGTCAGTC AGATGATTGATGCATGCAATTTTCAGTACTGCTTGAGTGTGTGCCACTAA TGTTTTGTTCTGTTGTTATTTAGAGTAGCTAGTATGTCAAATTAAATGTG CCCACTGCCAATCACTTTTAGTGCACACGTGAAAAATAACTATCCTTTTA ACTTGCTGCAGTAGATACATGAGAATCATACAAATGCCAGAATAGGAATG CTCTGTTGTTCATTTCGAGTAGCTAGTGACCATTGAATTTGTGTGTGATT TTTCCAAATTCTCTACCTATAGCAAGTAAAATTAAACAAAACATGCATGA GAAAGTATGCCAAGTTGCATTTGTGCTCATCGCCGATCACTTCTTAAATG TACACAAAAAAAACGCCTCTTACTTGCTGCAGTAGATACATGAGGAGGAT GCCACTATTTTATCCCTGCATAAATCTATCTAATCTGTACTTTGATCCAT ATGCAGCTTGTTCCATAAACATCAGCGAGATACTGACTGGAAAATGCGTG GCCAAGATAAAGGCAGGGGACCTCTGCAAACAAAAGAGGTCATCGGACTT CCATTGCACACCTTCAGAGGCCCTTGCGGACATCACGTCGCTGTACTACG ACGAAGAGCGTGAAGAGATCTACACCGGCAACCAACATGGCTTTGTCCAC GTGTGGTCAAATTGACAGCTGCTGGGCAGGTTACATCAGGCACCAGGGGA AATCGATCCTCGTGTTATTAGCTAGCGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.