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GrainGenes Sequence Report: AA018819

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Sequence
AA018819
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018819
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAAACACAGCATATAGCAACCCCTTTGCTTGCCTCTCCCCTGTTTCCCA
TCCCGCCGTCGCCGCTCTCCTCCGCTGTGTGTGATGCTGTCACGATGGAT
GCCTGCCGCCGGGCGCCAGCTAGGGATGCTGGCCAGGCTGCGCTCACGCG
CTTATTCCCACGGGAGGGTGTTCGACGCAGCGGCCCGGGACGGCGAGCTT
CGGCTGTTCGTTGTCGCCGGTGAGGTCTCCGGCGATTCGCTTGCTTCGCG
CCTCATGGCGTCCCTCAGGGATCTCTCCCCCGTACCCGTCCGTTTCGCTG
GCGTTGGCGGGTCTGGTTTAACTCCTGTTCCTACATTTTTTTCGATTCAC
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ATGCCAATGGGTTGATGTTTGCATCCATCTCTTTCTTTGTGTTATATCTG
TACAGACGCGAAGTGAGTTAATTTTTTGTGTGTCAACATATCTGTGCGTT
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GCAAGGAAGGCTTGCGATCACTTTTTCCAATGGAAGAGATTGCCATAATG
GGTTTGTGGGAACTGCTGCCACACATATATAAGATCAAGGTGCATCTCTG
GTGTGTCTTGTGCTTTGCTTCCTGTTTGTATGTACTTAAATGTTGGTTAT
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TTACCATACCATAATTTCATTCAAACAATCAAATTTACATTTTTTTATGA
GAAAACATGGTAAAGTATCTCTGTTGTCCAGGTAGATACAATCAAAACGT
TGACAGCCCTCTGCATGTCCATTATGTTGCACCGTCATTCTGGGCCTGGA
AAGGTGGTGAAAGCAGGCTCTCGAAGTTGCGTAATTTTGTGGACCATATG
TTGTGTATCCTTCCATTTGAGGAGGAAATTTGCAGATTAAATGGATTGCC
TGCCACATATGTTGGTCATCCCTTATTGGACGATGCTGCTGGCTTAAATG
TGGTAGGTACTGTACTTAAAGGAAAAATATTGTTGGAATTGTGTGGCTTT
GCTTTAACATCAATGCCATCAAACTGATACTGAACTGAAGATTTTTCTGT
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CTTTCTGTTTGTCTTCTCGCCAGATGTCTCATTAACATCTGTTGCATAAT
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TGTAGTACCACTTCATAGGAGTAATGTCAAGGCAAGATCTTGTCAAATTT
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TAGTAACCCTGCTCAGGAATCATACTCACTTTAAAAGGGGACAGGTGGGA
GACCACAAACCTTAGCGTGGACATAGAAATCCAACAAGCCAAAATCTCAT
CCAAGCATTATAGTAATTAGGGGCACACAAGAGGGATAGAGGCTAGATCA
TGCTTAGCCCTAGATTTTTGCATAAGAAAAAGGTTCGAGAGGGTTGTGAG
AGAGTGGTGTTCCCTTGCATTCTTTTGAGATTTTGCATCAAAATTTTCTA
TGCTGAGATGCTGCTGACATGGAGTAACTACTAAAGGTTGTCTTGACTTC
TACAACTGACTAAAATGTTCCATTTATCAAACTAAGCATTTGCATTTTGA
TCCGATCTACTGAAATCTCTGATATCATGTAAATGAATCACTAAGACTAG
TCATTTCAATTGTTTATACCTTATGTCTACCAAATTTCCTAGGACCCGGA
GTTATCTTCTGACAAGTCCACGCATCAACGAAGTGCTGAAGCTTTTCGAC
TGGAGTATGGACTGTCGCCAGGTAATTAAATGTGTCACTCGTTATGAACA
CAATTCTAGATTGTCAATGCAAACAATCATTTTCATTTTTCTGGTTTTTT
TCGTGTATTTATCAGATTTGTGTACTGTATGTGTTGATTATTGTAATTGT
TTAATCACACGGTATTAAATATGTTGATCGATGCATTCCTATGAATTATC
ATCAAGGAAACATACAACATGGAAATTATTACAGTTCAGTTTCCCATAAC
TTTTGGGAAGGCATGCTCTTTCATATGGATCTGGGAATAACAAAGAACCG
TGTACTATTTTCCAAATACTAACACCAAGGTCCATGTTTACCAGTAGAGC
AACTTCAAATGTGCAGACCACTCTGGCATTTATTAACTTATACAATTATA
CAATGGAATGTGGGCACACTTGCACAATATCAATCCTTAAGTACCAACTG
CCACTGCCAGCTAAGTTATTATATAGTCTGATCTGTTTAGCATGAGATGC
AAAGCAAATGGATGGCCAAATGTCTTAGCAGCTATCCTTATCTTGTGATG
GCATTTATAATTTTGACCTACAATTTGCGACCTGGTGAAAGAAGGAACAT
ATAAGTAATGTAAAAGGGAAACTACATAGAACTAGGAGATGATGATATGG
CCAACTCTTCTATCCTTTTATGATTGATACAATCCACATTTTATTTGTTT
TTCACGTAATGAAGACCATCATTTGATGCACCTCTCTGTAACTGTCCCAA
GATTTCTCAATAGGGTAATTTTATATGCATGTGATTATTGTGCTATTAAT
GCATGTGTCTATTTCCTAACGAGAAATACTCTTTTGATAGATTCCACAAT
CTTAACCATGCTGCCTGGAAGCAGGATGCAGGAAGTAGCTCGTATGCTTC
CAATCTTCTTGCGAACTGTGCAACATCTAAGTCATACATTGAATGAACTG
TCACTAGTCATCCCAGTTGCTCCACATCGGGACGTGAAGACCTATGTTGA
AAATGTAGCTCAGTCAGTGCCATTTCCGGTGGTACTGATACCCGGAGGGT
CCCTGGAAAAAAGATATGGTGCATTCAATGTAAGCTCACTTCTCTTTTTA
AGTTACACGACTCTAATTCGCATGCATCAAATTTCCTTTGGATATCACCA
TTTTGGAGTGCAGATATTTTCACTTATTTAGCGTATGTGAAGATTGAATA
CCTTTCAAAGCACCATACCGTGCTAACATGTAAATCATGCATTGCAATTT
GTTCCAAATTGATTCATATTTTGTGTGTGGGGAAAAAGGATTCGCATTAG
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TTAAGTTATCATTAGCATTTTCATCTTGCCGTTGGGCTATATAGGATCAA
AATCTCTATTACTTTATGCAGTGGTGGTCCCTGTAACACTACAGCCTGAA
AAGATTGAGCTTATGTGCACTATGCCAATCCCTGGATCGGTTCATTGGCG
CACATAGAATAGATGAATAACAAAGTAATATCCGTGCATCATAAATAAAA
CCTAATGATCTAGAATATTCAATTATTACAAAGTTGCTTAGCTCGGAGGC
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CTTCAAATTGTGCCACAGACGAACAAGTCTGGACTGGAGTATTGCGTCCT
AAACGATCACTCAGAATCGGAATAACCTGCAACATGAAACGTCCTGCAAC
ATGAAACGTTGCAGCCACGAATGGTCAATACATTGAATGTATGCCAAGTA
GGGCTAAGTAAAGAGACATAAAACCTAGCAACTACATGCTTATTTGGCTA
AGTGGAGCTTTGGCTAATTTGCAAGCATTACAAATACTTTTAACAAATAG
TTTTGCTCTTTACAAACCCAATTAAGTTAACCTATCAAATTTTAAGAAAT
TATGAAGTTGGTATGAGAGAGAAATATGTCATAACCTCTAAATCTAGTAA
CTCAATTTGTCCATAACCGGGGACACGGCTAAGTACTTAGATTAGACACC
CTGTGGTTGTAGTTGTTGTCTCTGTGACCATCATGGCGATGTCCATTCCC
CCTGTGATGCTGGTGATCATTACCACCACGCTAGTTATGTCCGTTGCCTC
CATGCCTGGGATGCCCAAAATGTCCATCATAAGAAGTACAAACCCTGTGG
TGTGATCCTGACTGGTGGCTGTTGCTATACTTCCTTTTAAGGTTCTCCAC
TTGCTTCTGCTTGCCTTCAAGAATCCTGGCCTTGTCCATCAGATCCTGGA
ATTAGGACAGTAGACCACTTACGGCTGAAGAGAGCTCATCACTCAGGCCA
TCCAAGAACCTCTCCCTCCTATTGGTATAAGTATCCACATCTTCAGGAGC
ATAGCGAGATAGGTTGTTGGATTCTTTGATGTATTCCGACACCGTCCGAT
TTATTGGACACCGGTTGCGGAATTCCTTCCACTTCAGGCTCAGAACACCA
GATGAGACATTATTGGTCCTGAAGCCTTCCTGAAACATAGTCTAAGTGAC
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GTCCTTCTAGCAAATGAGCAGCAAACCTCACTTTCTTAGCATCACCACAA
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TGGTTGGCCATTAACTACGTCATCACTTGTGCCAACTGTGCTTGTGTTAC
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AACACACAAGCCAAAATAATTTTGTTTATAAGTTCCAGAAGTTTTGTTTT
AGTGGTATACCTTCCACAAAATAGTTTGCAATTGATAGAAAAAACTTTTG
GGTGTGAACCTACAATGTTTAATGTAATAGACATAATCTGTCTCAAAACT
ATATCAGTGTTCACGAATTTTATTAGGCATCTTAAACTTGTCGGAAAGCT
TTGCTGATTTTTGTGCATGTAGATTATTAAGTTGCGAACCAGATCCTAAA
ATATGAGCTCAATCCGAGTTACCAAATAAATATGAAAAATCGCGCGGTGA
AACGTGACAAGCAGAAAACTACAGCTAAAAAATTCACGAATTTTAATCCA
AACCTTTATTAATGTATTATAAAATCTCAACGAAAATTCCTGGAACTTTA
GGGTATCAAATAGTGCAACCTAAATTTTATAAACCAACTATTACACAAGT
TTTGCTATGATCGAAAGCTAGATCTAAACGAGGTCCTATCAAAGACTATA
TGGTAGATAATACTATGTATTTGAATCGTTAGAGGTAGTTCGATGCCTCC
TTGTACCTGCGCTTCCTCTTATTTCTGCTAGTACTTTTGCTCATTGATGT
GTACTCCTCCCCTAAATCCTCGTCACTTGTGGCGTCGAAGAACCTTTCCT
GGGTTCCTTCTCTTCTCCTTCCTGCATGCGACCTTCGGCTTCGTCTCCAC
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GCTCTCCCGCCATCTTGTGCAGCGACTCCTCCATTTGGACAACTTGAATA
TCCAAGTCATCAACTTACTTCTGGAAGAACCTCATGTCATTCCTATCATC
AAGAGTGACTATTGGCTCTCCCGGTCCATTGCGCTTTCCAAACTCATGGA
AGATGGAGTCTTAATGCAACTTTTGCTGGTGAAGTTGCACATGCGAGACC
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AACGGGAGAGCCAATAGTTACTTTTGGTGATACGAATGACATGAGGTTCT
TCCAGAAGCAAGTTGAGGACTTGGAGATTAAAGCTGTCCAAATGGAGGAG
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GGCAAAACTCGCATGCAGGAAGGAGAAGAGGAGGAACCCTAGGAAAGGGT
CTTCGACGCCACAAGTGATGAGGATTCAGGGGAGGAGTACCCAATTAGCA
AGAGTACTAACGGAAATAAGAGGAAGCAAGTACAAGGATGCGTCGAACTA
CCTCCAATGATTCAAGTAGATAGTATTGGCAACCATATAGTCTTTTGATA
GGACCTCGTTTAGATCTAGCTTTCGATCAACAAAAACTTGTGTAATAGTT
GGTTTATTATGTTTATGTTGCACTATTAGATACCCTAAAGTTCTAGAAAT
TTTCGTTGAGATTTTATAATACATTAATAAAGGTTTTGGATTAAAATTTG
TGAATTGTTTAGCTGCAGTTTTCCGCCTATCGCGTTTCACCGCCTGAATT
TTCATTTTTTTGGTAACTCAGATTGATCTCATATTTTAGGATCTAGTTCG
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CTTTCTATCTATAACTCGTCTATGCTATCCTGACAGATGTCGCCCCGTCG
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AAAAGAGCTAAGCAACTTTGTAATAATTGAATATTCTGGATCATTACGCT
TTATTTATGATGCACGGATATTACTTTGTTATTCATCTATTTTATGTGCC
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CAGGCTATAGTGTTATAGTCCCGCATTATATTCCGCCCAATGTTTATTTT
TTTTAATGAAGTTCAGATGATTCTGCCTGATCTATTGACAATTAGATTTG
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CTGTGAGCTAAACTAAGAAAGTGTTGCTTCTTTTCTGGCAGGCTAGTAAA
GCAGCACTATGTACTTCGGGAACAGCTGTCATGGAACTAATGCTAGCAAA
GCTACCATGTGTAGTGGCCTACCAAGCTCATTTCATCACTGAGTGCTTCA
TCCACCTGAGGAAAAAGATAAACTTTATTTCTCTGCCCAACATTCTTTTG
AACTCTCCCATTGTACCTGAGATCCTTTTTCGAGCTTGTACAGATAAAAA
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ATTATTATTTTTTAGCTACTGAACTTGCCTAGAACGTTCTAACTGGTCTA
CATATGCAATAGTGACTAGACATATTTTACTGAGTAAAGAAGTTCTGACA
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GTATTAGTTGTACACGTAGACAGATGCACATTTGATAGTAGCCAGTACTG
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CCATTTCCTATTTGTGTGTCTATGGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAG
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GATTCACTCCAAACATGAGTGTACATACTAAAACAAGTCTAGATACATTC
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GTCCGCTTTGCCTGGTTGAGGCTTTGCTTCACAAATGTTCACAGTTTTCC
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ATCAAACTATCAATAGACTGTAGGCGCAGCAACAGTATAAATTCATGTGG
CTTGGCTTCCCTGCTAGTTTATTGCTACTAAAATGGTTTCTCTTGCTTTT
CGGCTTTTCCGGAGGATGTGCTACATGTATTTTGATTTTTTAAGCAATTT
TACATTGTGTATTGGACCTCATCATATGTTATCTCCTTTTGACCGGTCCA
GCGAGGTCATTTTTAACGAGGAAGTCCGTCAGCTGCAAGTTGGATCAGCT
GAACGGGTGCTCCAGGTTCTCTACGAACCAATCAAGCAACGCGGCAATTT
ATTTGCGGAGGAGGTGGGCGACTCGAGCTTACCAACAAATGTCTACTCCC
CCAGCACAATTGCAGCGCTAACAGTGCTTTATACGGAGAAAAATCGGCGG
TTGGTGCAGAACTGAGTGGGCTTTTTCTCGGTGGCGGAGAAGTGATTCGG
CTTTGGGCGGACTTTCTCAGTGTCAGATAAATGTTTTCATCTGATGAAAG
GGGGTGGTCGCTGTCGCCTGCATTTTCTTCTTCTCCATCTATTGTCTACA
TTGAAAAGTAGTTTTTTGGCAGATTGTATTGGCTGCGATTTATGATTGAT
TGATCCATTGGCGGAGCAAAGCAAATGTTTAGGTAAAACTTGGAGTGCTG
AGCTGCTCCAGTGGTCTGGTCTGGTCAGCATCGCACTATCACTGTAGAAA
CTGGAAACACATGTGCCCCGGTGGGTCTTAGTCGTCGGTTTGAATATTTT
GGTACTACTAGGAGGGACTCTTCCATGCAGAGAACACAGGGAACAAGTAA
ACACAATATATCTGGTAGTATGTGTTTCTTCAGGTTCTGCAACTCTATAT
CTTGCCATTTTGATCATTTCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.