Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA018112

[Submit comment/correction]

Sequence
AA018112
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018112
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGAGCCCCGCCCCCGCTGGGCAGCGCGAGCGAACTGCAAAGCCAGCTCA
CTGCATCGTGTCCCACTTCGTGCCCCGTTCGATACAAACGAAGCAAGCTG
CTGCATCAGCTTAAACCCAAACCCATCCTGCCTCCAGCCCCCACTGCACA
CGACAAGGCACACGACTTGCACGCCTCACCACACCACCTCATCTCCAATT
CCGAATCCAGATGGCGCAAATGGTAGCGGCGGCGGCGAGCGGGGCAGGAG
CCGCCAGGCCGCTCGGCGCATCTGGGACTGACTCGCTCCGGTCGGCGGCG
AGGCTGCCCTTCGGGCCGCGTGACGCCAGGGAGAGGTGGAGCGTGGCCTC
GAGGGGCCGACGTGACTCCCCGGTTGTCTCGGTGATTAGCCGGGCGCCGC
GCGCCGACGCCGAGGTGCTGCCGGTGTCGCCCGACGATGATGCGGTCCTT
AAGGTAGAGCTTGCTCCAACTTAGACTGGTACCTCAGCTGGCCGCTAGTC
GGGGAACCGCGGTGGATTTGGGGTCGGGGTGCGCTTTTGTGGTCTTCGGT
TGCTTTCGGGCACGAAATTGGCTTTCCGTGACGGTGAAATCGGGTCTGTC
ACGCCTCGGCCTCATTTTCACGCGTGCAACAGGAGTTCAGACTTTAGAGC
CCGGGGCTATTAGAGATGTCTTTTTCTCAAAAAATTCCCCCATGCGTAGT
TACTTGAATTTTCGTGTCTGTTTGTACTCTTGTCCTTCTACGCATCCATG
CGAGCTGCTTGTTTGGTACCACTATCTCTCCGTTCGTTTTGATTATAGAA
TGTTGTTAGATGCATATTTTCGATGTGAAGGTGACATGTTCCCCTTCCAT
ATTTAGGCACATTCTTCATTTAACTCACTGGTTTTTTATATTGAGTGGAT
AGCGATTTAATTATGACACCGTTTGGAAAATTGACGTTGGAACCATTGAC
TGTAGTCAAGGAATGCTTCCTTGGATGCAAAACTTATAAACAATTGGTAA
TAGTTCATTTCACCGAAAATTTACTTGCAGGAATAATTCTCAGCAGAATC
AGCAGTCAGCACTGCTTAGCTTATTTCCTGCCACCGAAAAATATAGAACC
CCTTGATCTTATTGAGAATATCTCAACTTTTTTCTTCTTCAACCGGGCTT
CAACCCTATTTAAGCAAACGTAAATACACGCACGATTCGTCTTTAGGATA
TCTCAACATGGATGGCCGGGTAATCTCAAATAAGGATGTGCTACTTTCTG
ATCACTTTGGTTAAATCTTATTTCTGGGTCTTCTTAAGCTACTTATCCAG
TAAGCTATGAAAGCTCAGGATCAACGTGAAGGTTTGGATTTGTTTGTTTG
TACTCTGCTCTGGCTATGATAAGCAGTTATTCATCATAACATGTTCTTCT
GCATTGCGTGTTACAGTTACTCACAATATAACAGGGTGACATCTTGGAAG
GAACCCTATGATTGATCAATTGAAACTAATTGTCAATAATACATCTTCTT
GACAGGAAGAAGAAAACTTCCAGCATCTTAAGGCTATTCAAAAACTAGCA
ACAGCCGCCAATGGTGTGTGGTCTAAACCAAATGTTAGGCGCAAGACGAA
GATTGTGTGCACCATTGGCCCCTCAACTAACACAAGGGGGATGATCTGGA
GCCTTGCTGAGGCTGGCATGAATGTGGCTCGCCTTAATATGTCACATGGA
GACCATGCATCACACCAGAAAGTTATTGACTTAGTGAAGGAGTATAATGC
TCAAACAAAGGACAATGTGATCGCGCTTATGGTTGACACCAAGGTTTGTA
TTGCTTTTTTCCAGCGCTTTTACACTCTGGTGGATTAACATCCACGCCCT
CAGAGATGCTCTATTTGCAGTAGCCTTATTATAACTCTGCCATGCTCGTG
CTACGCTAGTACATGATTTTCTCTACTAATAGATACTGTAATTGAACCTT
TTGATTCCGTCCTTCTGTCATTATATCATAACTTGATTTGTCTGAATTAA
GCTAGATTTTTATCTCAGGGTCCAGAAGTTAGGAGTGGAGATTTGCCTCA
GCCTATATTCTTGGAAACTGGCCAGGAGTTCACTTTCACAATTAAGCGGG
GGGTTGGGACCGAGACATGTGTTAGTGTTAACTATGATGACTTTGTTAAC
GATGTAGAAGCCGGTGACATGCTCCTTGTGGATGGTATGTAAATGCCTTT
TCTCTCGTTCTGATTTCTGACTATTTGCTCTTTGTTCGGTTACACATGAT
TGTGTACACTTTGTGCAGGTGCAGCAACTCAATTTATCTGAAATACTAAA
ATTTAGGTAGCGATTAAGTAAATTTGTGTAGTGGCAGGTAACCACTGAAG
TGTATAGGTTCTTAATAAGCTGGTCTTGGTTAAAATGGCTAAACATAAGT
TGTCAATTGTTTAAAATCTTCTGGTTATGTCTAGCGTAATGATATTCTGC
ATTTTATGCACTAAAACTTTGCTTCACTGAACACATTTTGGGCCTACTGG
ATGGATTCATTTAAATTAGAACATCAGATACATGTGTAACATCCTTCTAC
CTTTCTTATCTGTATTTTTATGCTTGTAAAGATGATTGTATTTTTCAGTT
ATGTAACTTCAACAATTGTATGATTTTATATTCTGTTTAGTGATCACTGT
GTTCCTTATTTAGGAGGAATGATGTCATTTTTGGTCAAGTCAAAAACTGA
AGATTCTGTAAAATGTGAAGTTATTGATGGGGGTGAATTAAAATCCAGGC
GTCACCTGAACGTCCGTGGAAAGAGCGCAACCTTGCCATCAATCACGGGT
AATAGTCAACATATACTTCATTGAGTAAAATAGTGCCATGACATGCTCAT
TTCCAAACTTGCAGATAAGGATTGGGATGATATAAAGTTTGGAGTGGAAA
ATCAGGTTGACTACTATGCTGTTTCTTTCGTCAAAGATGCTCAAGTTGTG
CATGAATTGAAGGATTATCTCAGAAGTAACATTTTTCCCTGCTTTATAAA
CAATATGTGGACTTTGTTTTGAGTGTGTCGTGATATGTATATTTTTTAAT
TTTGACTCTCAGGCTCAAATGCGGATATCCACGTAATTGTGAAAATCGAA
AGTGCAGATTCTATTCCAAACTTACATTCAATCATTACAGCATCTGATGG
GGTAAGGGGTTGATATTGATTGTTTCTTCAGTTTAGTAAAATGCATTCAA
AACATACATCTTAATATGAGAGAGGTCTTAAGTTGTATGGGCATCATGAA
ATCATGCTTCATGGCTCTTTTCTGTTTTGTAGTATAACTGTACAAGTATG
TCTCACTTTTTGTTTAATTTTTGAAGTTTTGATGTATGGAATATTGAGTC
TGTAGGCTATGGTTGCTAGGGGTGATTTGGGAGCTGAACTTCCTATTGAG
GAGGTACCATTGCTGCAGGTATGTTGTAATTGGTCATATTGATCAGTCTA
AATGCCACTTCTCTGCTTAGCTATTTTTTTAAGCTACAACCTACGAAATT
GAGTGTGCAGTATAATAATAACCAACACCCAATGTTATATATGTCGTTTA
CAAATCACTTGGAAAAAAAATTACTAACAGCGGGCCGTTTTGCACTCGCT
TGTATATACATGTCGTCTAGGTAGTTTTCCAGTTTGAAACCTATAACTGA
ACTTTCTGTGCTTCCTTTAGTTAATCCTATACAAGATATATAAAGTTTCA
CGTGTCTTGATGCAGGAAGAAATTATTAGAATGTGCAGGAGCATGGGAAA
AGCTGTTATTGTCGCCACTAATATGCTGGAAAGCATGATCGTTCATCCAA
CTCCAACCAGAGCAGAAGTTTCAGATATTGCTATAGCTGTTCGGGAAGGT
GCTGACGCAGTTATGCTTTCTGGGGAAACTGCACATGGAAAGTACGTGTT
TTCATTTTCTTATGCATAGCAAAATATTTTAAACTTTTTATCGGCGAACT
ATATGAGCACACACACATAGTCCATTGGTAATAATTTAACTAACTGAAGC
CAGCTGACTTTGTTACTAAGTCATATTTCAACACCGATATGCTGGTATTT
TTAAGTTTTGGTGCTTTAGCTCTCTTCTTATTTCAACTGATAAATTATGC
AATTTAACTTTACTTTACTTTTAACATTTCAACTCTGAACTTTTAGTGCC
ATGTTGTTCAGGTTTCCATCTAAGTTAGCTTCTTCAAATAGTTTTACAAC
GTTCATGAACTGCCACATGAATTCGTTAATTTTGCTGTAAACCATGAATA
GAGTTGTTCTGCTTTTGTTAGTTGCACCTTTTTCCCCTCATTGGTTAAAA
GATGTTTGCTAGTCTTGTGACATGTATTTGAGATAGATACATTACTAAGC
TTATCTGATCTCTTTTGCAGATTTCCCTTGAAAGCTGTCAAGGTCATGCA
TACTGTTGCACTGAGAACTGAAGCAACTATTACTGGTGGGGAAACACCGT
CTAACATCGGTCAGATATTCAAGGTCTGAACTGCAATATCCCAACTGACA
CCATATGTATTTTTCCTCACTTAACCCGGAATCTTCCTAATCTAATTACC
CTTTTCCCCTGTAGAACCACATGAGCGAAATGTTTGCCTACCATTCAACA
ATGATGTCCAATACACTTGGCACATCAATTGTGGTTTTCACCAGGACTGG
ATATATGTCCATCCTACTTAGTCATTACCGCCCGTCTGGCACCATATTTG
CCTTCACAGATCAGTAAGATTCCTCTTCTTATGCTCCAACGTGAATGGCA
TCAATAAGATGAAACTCCCATATTTTTTTATAAAAGTAAATCAACAAATA
AATTGTCATATCTGAACAACATCTATTCATTGACTAAGTAGAAGTTAACA
TGTTTTAAAAAATAAAGCTTATGCTGCTAAGGCATTCAATGTTAGTCATT
AGCGACACCAAATTACCAATGCATTTTCTTGCCTCTTATTGTGTGCCCAT
GTACCAAGTTTAGTGATAAGCCTTTGTATTTCATACATTCATGTACAAAA
TGTTAGGTCTCTAGTCTAGTAGGAGAATGGGCTGTTGTAATCCATCCACA
TGTATGGGCTGGAAACCAGCTGTGCTAAGTTCCCTTTCTTCTTGATGAAC
ACCATTTCCCTAACATACGTACGAAGACGTTCCTAGACCCTCCATCAGGA
TAATTTGCCCATGCAAGCTTATTTTAGAGGTGAATCACAATCACTACTCC
CTTCGATCCAAATTAATGTTCTCAGATTACATCCCAATCTAGATAAATCT
GAGAACATTAATTTGGATTGCAGGGAGTAGTACTATCATAGAAGAGGTTA
TCAATGATGAAACTAAATTTGAATAATGTTATGGTGGTATATACTTTTTA
TTATACTGTTGAGAGAGAACTGATCTAAAGATGATCCTAGATTTTTTATT
TCTGTAAGTATGATATTGTTGCTATTTTTTCACATTTTGCTTCATAAATC
TGGTATCTGCGTGCAATTTATGTTGCTTCTTACTCTTTACAGGGAGATAG
TTCGACAACGATTGGCTTTGTACCAAGGTGTATGTCCAGTTCATATGGAA
TTTTCTGATTGTGCTGAGAAGACTTTTGGCGATGCTTGTTCTTACTTGCT
GGTAATCACTGATATATGCTATCCCTTTTGTGTTTTTGCTGGCATCAGCT
TGGCTACCATTTGGTCCTTCACGACGAAATCGTTAAAATTACCCTAACAC
AGCCTGCACTGAATTGAAGTTAGATAGGCTATTCCCATTTTGGAGTGCTG
GTCCTGGTACAGATGATGTACTGTATGGTCCTGTTCTGGGGTGCGTTAGC
ATAAAAATTGTAGCACACGACCATGCCTGAGGCATGATCTATCAAAAATG
AATTAAATCTGTTTATTATAAATAAGGTGAGGCTAAATATATTTCTTTTG
AAAAACATCGAGTACAACATAGACGCCTGCCCACACACCTGGAGTTGCAG
AGCTTGAAGATTGATGAAGGTGATGCTAAAATATGTCAGCCAGGAAGTGT
GACTCCTTTCACGCCAAAATAAGTGTAGGACCAGAAAGCAAAATGACGTC
ATTGAGAATAAAATGTGCTTTAGGACTATAATAGCAACAATAATAATGGC
CTTACTGAAAATGAGAAACAATTGACTATGGTCACAAACGGCAAAGTTCT
CCCTTTTTTTTTTTTGGCGAGTTTCCCGTGCTATGTAGTATCTCACATAT
CTGCCCTATGTTGCAGTCTACTAAAGCATTGTTCTTCAGTTATGAAATTC
AGAGAAACATATACTTGTTCACATAACTTCATCATGATAAAACTATCAAC
CAATCATGCTCCGAACATTGATCTATATTGAAGCTAAGTGCAAAACATTC
ACTCTCTCTCTCTCCTCCACAGGCTTATTTCAGATCAAACAGACACAAAT
ACATGTAGGAAATATGGAGTACTCAACGGAATATTAAATCTCGAGCACTA
AGTTTATAAATTTCGAAGGAATGCTAAAACTAAACAAGCACGCAAATATG
ACCTTGATCTGTGTGTGCTTATTTAGGGTGGGTAGAACTAGATGGATAAG
TTACAGATTTGCTCAGCAGTGTGCATGTTCAATTCTAGTATTCACTATTC
CACATACGTTTTTGTACTATTATAACATGAGAATATGTAGTCTAACATGA
TGTGCTACATTTCACAGAAGCATGGTATGGTGAAGGAAGGTGAGGAGGTT
GCACTTGTTCAAAGTGGCAGACAGCCCATCTGGAGGTCGCAATCCACCCA
CAATATTCAGGTTAGGAAGGTCTGACGAGGAATGCCCTGCAGTATTTGGA
TCTCCCATGGCCGACAACCTAGGTATTGTTGTGCTTCTGGCAAATTCGTA
GGCATGAGCTTGGTAGCATATGTGCTAGATATTATTTAGTGCTGAGTGTT
GTGATTCTATTCTCTCTTGCTGTTTACTTTTCTTCTGTGTAAAATGGTTT
GACCGATTGTTTCCCCTCCTCCATCAGTTTTTAGCTGTAGTTTGGGGGTA
CTGTAGGATTTCTTTTTTGTGGAACAATTTATGTACTTATTATTAATACA
TGGCAAGGACCAACAATCTATGTACTTATTATTTCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.