Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045702

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045702
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045702
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAACAATCACCGCCTCCACCTTCACCTGGACTTGTGCTTCGTCTCGCC
TCCAACCCATCCTCCTCCTTCTCCCACTTTTCCAGATCTACTCCACTGCC
GCCACCCATGGCGTCTCCAGCCGGAAACCCTAATCCGAATCCCAACAATC
CGAATCCCCCATTCGAGATGTCCATGCTCTTCAGACCGCCTCCCAACCCC
GCAGCGCCCATGTTCACCGGCGTCGCCGGCCCGCCGCCGCCTTCCGGCCC
TTACTCCTACCCCCCGGCCACCCCTCCCTTCCACCACGTCCCCTACCCCC
ACTACGCGCAGGACCCACATCCCCCCATGCCCCGCCCAGTGATGTCCTAT
GCCATGCCAAACCCAAACGCAAACCCGAACCCGAGCGCTAACCCCGGTGC
TCGCCTCATGCAGCTGCTCGGCAACGCCGGCTCGGGCCACCTCGAGACTG
CGGTTTCTATGCCCCCACCGTCGTCAGATTTCGCCGCCACGCAGCCGCTC
CAGCTTCCAGTAATGCCATCCGCGCCCCCGGCGAGGATGCTGAGCACTAC
CACTAGCAAGGTGCCGAGGGGGCGGCTTCTGGGTGCCGGGGACAAAGCGG
TGCACAACGTTGACTCGAGGCTGCCTGGGGAGGCGCAGCCGCCACAGCTG
GAGGTGACGCCGATCACCAAGTACACGTCAGACCCAGGCCTCGTGCTGGG
CAGGCAGATCGCCGTGAACAGGACGTACATCGTGTATGGGCTCAAGATGG
GGAACATCCGCGTGCTAAACATCAACACCGCGCTACGATCACTGCTCCGT
GGCCATACACAGGTATATATTATACTTTCAGAGAGATAAATCAACGGTTA
GTTCTGGTGTAGAAATGTTCATTTCAGAAATTGAATCGTTGGGTTCTGGG
TTCTAATGACTCATGTGGTGTTCAGCTAAGGGATAAGGTTTGAAAATTTC
AAAGTGAAGATGTTGCATTACCATTAGTTAGATTGCTAGAATAACATACA
GTTGCCATTTTACCCTTTCTAGTACGGTCATTTGTTGTTCATGGCTCGTT
CTGTTGCATGTTACTTCCAGAACAACTTTGTGTTTTCTTCTTATGATATG
ATACATTATTATTTGCACTCGACCTCATGATGAGGTTGATCAAATAACTA
TGTAGTACTAACAGACATGCTACATTGTACTCCCTCCGTTTAGAAATATA
AGATGTTTTAGGTTTGTGAAGGAGATGTATCTAGACACCTTTTAGTGTGT
AGGTTCAAATGAATCTACCTATACACTAAAAGGTATCTAGATACATCTCC
TTTACAAACCTGAAACATCTTATATTTCCAAACGGAGGGAGTATTTATGT
TCGCTAGATTTTTAGGAAACGCTTGACTGGCTAAATTTGGTGAATCACAC
GTCTTATAGCATGGCAACCACTGAAGTATTACTAGCCATTATTGTGTGGC
GGTTTGTTTGTGTGCTCATTTTCAGCAATTATGTTCGCTCAAGTGAATGA
GGATTTCTTCAATATTTGTTACTTGTTAGTATCTTTATATGGCTACGCAC
GTATATTCACGTGGGTGTGAATTTTGCTCAGTGTATGAAAGTGCATTTGT
TTCTTATGCCTTGTGTTTTGTATTTCTGCAGAGGGTCACAGACATGGCTT
TCTTTGCTGACGACGTCCATCGTTTAGCAAGGTACTGTGCACCGAACAAT
GAAGTAATCTGTATTTGTTCATAATGTCCCTAGTTAGCAGCAGAACAAAG
AGTTCTCTTTACGAGATCACATAACATTGTTGCGTGGTCATGCCTCTTTA
GTATTTACTATGAAAATATCAAATCCTTTTTCTTATTCTTTATTATTTTG
TGGGTCATAATGCTGACTCTGCTTCTTCTGCAGCGCGAGTGTAGATGGGC
GGATTTATGTGTGGAGGATTGATGAGGGAACCGATGAAGAAAATAAACCA
CAAATTTCAGGTAAGATAGAAGTCGCCATACAGATTGTAGGTGATGCAGA
AGCTTACCATCCAAGGATCTGTTGGCACTCCCATAAGCAAGTGAGGAATT
ATTTACTTCGCAGTTTCCACTAAGTTAGATTTGCATGTCAACTTACTAAT
GTAGTTGCACTTTATCCTACAGGAACTTTTGTTTGTTGGAATCAGAAACT
GTGTCTTAAGAATAGACACAACTAAAGTGGGGAAGGGAAGAGACTTTAAT
ACGGAAGAACCTATTAAATGTCATCTTGACGAGCTGATTGATGGTGTACG
CTTAGTTGGTAAGCATGATGGTGACGTGACAGATTTGTCCATATCTCAGT
GGATGACCACCCGACTGGCTTCAGGGTCAAAAGATGGCACGGTTAGTATC
AAATACTCTCCTGTTTATTTGTAAAACTTGGAGTTCCCAGAGAAATGGAG
AAAAATATTTTGTAAAACTGTATTTTCTTAAAATTGTGCTTGCTTGAACT
AATATTGCTTCCCCTTTCATTTCACTGAATAGGTAATACGAACAAACATT
GATATGTAACAGGTTTTTTCAGCAATAGGCTTGCACAGTTAATTATTTTA
ATTTTAGTATGTTAATGCTTTGCTCTCTTGTTGTGGCAAAACACAACTTC
CTCTTGAGGAAGGAAAGAAAACCATTATCTCTTGGTATGTTTCAAGGGTT
ATTCTGGAAATAGTCCATCGAAAATCTGTTGTCTGGGCTGTTACTCCCTT
GATTTCATGGTTTTAACTGCATTTACGCCATTCCTTGTATGTGAAAGAAA
TATTTAGCATATAAAACTGTTAGCAATGTATGGAAAAACCGTGAAGTACA
TATCACCTGTTATTTTTGCGGAACTCTAGATTGGATGATTATCAGCTGTA
GTGCCCTGTGCTGAATAGCCTGATGCTGTCTGGTACTCTGGTTACTGCTA
CTAGTTGGCTGGAACTAACATCAACTGCTTCAGCGCAGATGAGGCTGCCA
GCGGTTTTATGACTTAGTTGGTCTGCCTTTTTCCAGTCGGTTATAAGGCG
ATCTAGAGAAATGATCATCTTTACGAAGCACATTTGTAATGCATATTTTT
TATTTTGCAGGTAAAGATTTGGGATGATCGCAAGTCAGTGCCTTTATCGG
TCCTCAAGCCACATGATGGTCAAGCTGTTTACTCAGTTGCCTTTCTTACG
GCACCTGAGCGCCCACATCATATAAATCTCATCACAGCAGTATGCACTCT
TACACATTATTTTTTGGCCAATATTTGCTCCATTTTACCTCCCTTTTTGA
AGCACACACTTCTCTTGGGGCATCTTGCTCAACTTCTTGTAAAAGACCTA
TCCTGGGCCAAATGCTTTATCCAGGAGTTGGAACCTACTATCGTGCCACA
AAATTAGTGGCTACATATCTTGTGCGTTGGCGTCGAGTCCATACATGTTA
CATCTACAAAACACAATGACAGAATGATATCTATCTCCGCCTCAATTAAA
AATGAACTATGGTGCTTATACTGCTAGAATTTGAATTAAAATCTGAACAG
AGCAGTATTTGCATACAATTGCCAAGGGCTAAATAGGCAAAGACTTGCTA
ACGGTTTGGATAATCTGTGAAATGGTTTATTTTATATGATGTTCAACGAG
AGAAATTTTCTTTGTAGATATTCCAATTCTGTTAAAAACAATCAATATTT
GAATCTGCTCTTTTAATCTTCTGATAAACAGAATTATTGACCGCATCTTG
TATTATGTTAACACCATCTTACATGCTATTCTTGTTCTTCATGCTGCAGG
GTCCTCTAAACCGAGAAATTAAAATTTGGGCTTCTACTAATGAAGAGGGC
TGGCTTTTTCCAAGCGAGACTGAGACTTGGAACTGCACCCAGACCTTGGA
ACTTATCAGTTCTCTGGAACCTAAGGTCGAGGAGGCATTTTTCAACCAAG
TCGCGGTGCTACCTCAAGCAAGCATTATTTTACTTGCGAATGCTAAGAAG
AATGCTATTTACGCCGTGCATGTTGAGTATGGCCCAGATCCTGCTTCTAC
CCGCTTGGATTATATAGCAGATTTTACAGTCGCAATGCCTATTCTAAGTC
TCACTGGCACACATGAAGGCCAACCTGATGGTGAGCAGGTAGTTCAAGTC
TACTGTGTGCAAACAATGGCCATCCAGCAGTATGGGCTGGAGCTATCACT
TTGTTCGCCCCCTACATCTGATACTACTGGACTTGGAAGAGACCCAGCTA
TTTCCCGTGTTCACGATACACCTCTGGAAGTGGTAGGGGCAGATTCATCC
ACAGGAACTAGCTTCACTGATTCTTATACTGTCGGTTCATCAAGTAAACA
ATCAACTTTTGATCAGACTACAGGTAAAACAATTATCATTTCTCATTCAC
AATTGCTTGAATTAACTAAGAGATTTTTCTTGTAATTTATCTGCAGAATT
TGGTGATAAACCATTTCTCATTCAATTGCTTCAGTTAACTAAGAGATTCT
TCTTGTGGTTTATCTGCAGAATTTGATCATAAACCATCAGCTCCACCACT
CGCATACACAGAAGGTGATGGTTCTCCGCATCTTCCGTCCGCCCCTCTTG
CATCAAACACGGATCTTACTGGATCGGGACCATCACCAGGCAATCGCGAC
AAAGACCAATCAGCGTTTGATTATCCGACAAACCGAAGCATGGAGCCAGT
TGCCTTGACTAGGCAAGATACACCAATGCCAAAACCACTTGCCTTGACTA
GGCAAGATACACCCATGCCAAAGGACACTTTTGGAAATGATGAATTGAGA
GACAGTCACAGTGATGTTAAAATGCTTCCAAATCCTCGCATGATGTTTAA
GGTAGGAGGAAATGCTACTCATCTCATAACTCCATCTGAAATTATATCTG
GTGCTCTATCTACTGCTGAAAGCAATCAGGTCTCTAAATCTGATGGCGCA
AAAATCCAGGATGGCTCTGTTGGTAGCCCTCGGATTGCAGAAGTAGAAGC
AAAGCCTGTCGATGAGAGTAAATCTGGTCAGGGTCTGGAACTTGAAGCTA
TCAAGGAAGCTCAAGCTGACTGTGAGAGCTCAGAGAAAGCACAAAATTTG
TTTGAGCAAACTGTTGAAATTGTAAATGAGCGTTCAGTGACGACTGATAA
GTATAGTGTTGAAGAATCACGTTCACCATCGGATAGACTGGTTCCTGACC
ATATTGGTGCTGCTGGAGAAAATGTTTTGAACAAAAGTGTAGAAATGCCT
GCCAGAAGTGATTACTCCTCTGTGTCTAGGGAGCAATCATCTACCAAAGA
GAAGAACCTTCATCTTCAAGCATCTGGTCAATCGTCACCTTCTACAAGTG
CATTTAACTCAACTGAGTCTTCACATGAAATTGTCACAAGTGCATACCCT
CCTATTGATTCCTCTTCAGAAGTTGCTGATATGCAAAACATGCTTCAACA
GGTGATCGATCATCCCATTAAATTACTCTATTATCTGTGCACTCTGAAGT
AACTTTAGTGGAATGGAGATGCTTGTAATATTCTGGAGTTATACTCTGCT
TTTTACGCTGGATATATCTTCAAGATATTTGGTGTAACATTTTCCCTAAT
TCAAGGTTTTGAGCTTTAAAGATTGTAGACTGCACTGTCAATATTGAATG
TTAGTTAGATCTTACTCAAATAATTTCATGTTAGATGGACCACATAAATG
GAGTGGCATGTCTTTTGTAACAAGTTAAATCCTGAATATGGACTTCATTG
TAACATGTGCAGTCTTAGCATTTATAGAACTTGAAAAAAATCACCAAATC
TCGGTATATATGTGTGCTCTATAAGCATTTTGGAGTTATTTGAGACCAGA
TGTTTTGGCTGAACATTCTTTTCCCTGGAAGAACTTGTTAATACATCATT
AAACTCTCTCAGGAGGATCATATCTGTTACTGATTTACTGTAACATGTAG
CATACAAGCTGGAATGGGCCTTTTTTTGCACCAGCTTGGGCTTATTTAGA
GCATACAAGCTTAAGCATGAGCTTAACAGGTCCAAAATAGTCTTACATGT
CATATCCATTTGCATATGAGCTTTAGTTTTAGACGTCCATAATATTTTGG
ATGGAACTCAAGAGTAACAGACAGTTGACTGGTTACTAGACTTGCTGCTG
GGAAATCACAGGGTTGTCTTTTCTTTGTTGACTCTTATGGCTTTCAGATC
AATGTTGGAAGGACATTATATGAGTAAGAGCTTTCAGTTTATTTACCGTG
TGCTCATGTGTCTTGCAGCTAATAACCATGCAGAAGGACATGCAGAAACA
GCTAAGTACTGTCGTTGTTGCTCCCATTGCAAGGGAAGGCAAAAGAATTG
AAACGTCGCTAGGCCGTACCATGGAGAAATCGATCAAGGCTAGCATTGAT
GCATTGTGGGCTCGTTTCCTGGAGGAGAACACCAAACGTGAAAAGGCAGA
AAGGGAACGAATGCAGCAAATGACCACTCTCATCACAAGTTCAATAAGCA
AGGACCTTCCTGCTATGTTGGAGAAGTCACTAAAGAAAGAAGTTGCTTCA
CTTGGACCTGTCGTTGCACGAACAATGACACCTATTATTGAGAAGTCATT
AGCCTCTATAATTGCTGATTCAGTTCAGGTTGTGCCTAACTTCCTGTTGT
ATTTGCTTTTCTTGATTATGTCACCCTTGCTCTTGTTGACTGTTTGCTTT
TAGAAAGCGGTGGGTGACAAGGTGGTCAATCAGCTGGACAAGTCTGTTAC
TGCAAAACTTGAAGCTACAGTTGCTAGGCAAATCCAATTGCAATTTCATA
CATCTGTAAAGCAGATTCTTCAGGTATGTATTGTCTTGTAATTTGTTCTT
ATAGATGGCAGCCTAGCAGCTCTGATGTCGTGTAACATGCTTGTTTTATT
TGTCTGATGTTTGCGTCTAAGACTCTCAGTAGATTATTTAAGTTATACAT
CCATATACAAAGTTTGCTGTTAAGTCAATCTATTCTTAGTCTTGCTACAT
GTACTAATTGTTTAAATGGATGCATGCAGGATGTGTTACGCACCAGCTTT
GAATCATTGCTTGTTCCAGCATTTGAACAATCCTGTAAGACAATGTTTGA
GCAAGTAGATAGTGCATTCCAGAAAGGAATGTCCGAGCACGCTGTTGCTA
TTCAGCAGCAGGTTGAGGCAGCACATACGCCATTGGTGCTCACTTTAAAG
GTATAAGATTGCGAAACTACCTTATTATACTTTTTTGCCACGATCTGTTT
TATACTTTATATTTATTTTTGGAATGGCAGGAAATATTAAGTTAAATTAT
GTTCTTTTTCCCCAGTTGTATAATAATAAAAGGAAACGCTTCATATAATC
ATTTTCAGGAAACTATCACTTCTGCGTCGTCAATCACCCAGAGTCTTACA
TCAGAGTTACTTGATGGCCATCGTAAACTATTGGCACTGGTTACATCTGG
GAACGCCAATGCGCAAAATACGAATGTTTTGCAGCCCAACAATGGCCCTA
TCACTGGTCCCCCAGAGGTGCTGAAACCTTCTGATTTTCCATAATGATTC
TGGGTTCACATGCCTTATTTTCCTGTTATGCTAAATGATATTATGAGCTT
ACTCATAATCTTCATGTGCCTTGCATTTTGTCAGGTTGAGGCTCCACTAG
ACCCGATGAAGGAGCTGGGAAGACTGATATCTGAACACAAATTTGATGAG
GCTTTTACAGTGGCGCTTCAAAGAAGTGATGTGTCAATTGTGTCTTGGTT
ATGCTCTCAGGTATCTTCTTTATCAATCAAGTACTCCCTCCGTTTAGAAA
TATAAGACATTTTAGCTTTGTGAAGTGAATGTATCTAGACGCCTTTTAGT
ATATAGGTTCACTCTGAACCTCTACGAACCTATACACTAAAATACGTCTA
GATACATTCGATTTACAAAGCTAAAACATCTTATATTTCTAAACAGAGAG
AGTGTAATGCAAAACTATAGACCTTTGTTCATTACCTTCCTAATTACTGG
TATAACCTTGGTTCGATTATGATACCTGTACCCTGTTACACAGGTTGATT
TGCGTGCATTATGTACAATGGCCCCAGTCCCTCTAAACCAGGGAGTTCTT
CTAGCCCTACTACAGCAGCTAGCAGTTGATATTTACACCGAGACATCCCG
GAAAATTCAATGGATGACAGATGTTGCTATGGCAATCAATCCCACAGACC
AGGTCATCGCCGCACACGTGAGGCCTATCTTTGAACAAGTCTACGCGAAA
TTGGCTCACCACCGGTCGCTCCCAACCACCAATCCATCAGATAGCAGCAA
TCTCCGCTTGCTCATGCATGTCATTAACTCAGTTCTGCTTAGCTACAAGT
GATTCCAATTGGCTGCAGGAAACTGTGGGGAGTATGGGGAGTATGGCCTA
TTCTTTCTTTGTATAGAGAGAAATTTTGAGAAGCAAGGAAAACCTAGAAG
GACGATGAAACTACCGCCAAGAAAAAGGGTGGATGTGTTCCCACCTGGTG
TAAATTAGGCTTGTATCGGATTTAAACTGGAGTGTTTCCATGTCAACTGT
CGACAAGTCTATTGTTCTTTTAGCGCAGAGTCCTTTGTAGCTCCAAGTTT
TGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.