Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043952

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043952
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043952
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCGCCGCGCCGGAGGAGCGTCTCGACGTGCTCACCGCCGCCGGCGA
CAAGACTGGCGTCTCCAAGCCCAGGCACGCCCCGATTCCCAACCACCCAC
CTCCACTGGATCGCCAATCCTTTTCAATTCGACCGGGCCGCCGTCAGCTT
AACGCCGCTTGTTCTCTGCAGGTCGGAGGTGCACAGGGACGGCGACTACC
ACCGGGCGGTGCACGTGTGGATCTACAGCGAGAGCACCGGGGAGCTGCTG
CTGCAGCGCCGCGCCGACTGCAAGGACTTGTGGCCCGGCCAGTGGGACAT
CTCCAGCGCCGGCCACATCTCCGCGGGGGACTCCTCCCTCTCCTCCGCGC
AGTGAGCTCGCTAACCTCGCCGTTGCTTCTGCTGCTGCAGTCTCCGAATA
CCATAACTCGATTACTGCACGGAAAATTATTGTTAAAAATAGTCAACTTA
TGGGATTCGACATTGTCACACAGTGTTTGAGCTGTTGCCCTGTAAAATTA
CTTTTATTATTACTCCATGTGGCCACTGAATTGCCTGCCAATTACTCCAT
AGTGTGATTCTATGCTAGGCTAAAGTAACTCTTGTATTGAGATGAACGGC
TCTAATCTGTATACTGACATGGATCACCAGGAAGGAGCTTCATGAAGAAC
TAGGCATCAAGCTTCCGGTTGATGCTTTTGAGCTGATATTTGTTTTTCTT
CAGGAATGGTTAGTATGTCTACATTGCTGTTCGTTACCTTCCTGCAACTT
AAGACACAACTTGCTCATCAATTTAAGATGGTAGAGCACATTCTGATTCT
GATCATAACCGCACTGGATCTTTTATGAGTTCAAATAGGCATGAATATCC
TAAGAAGATGCTAATTAGTATTTCATCATGTTGGAGTCTAGGTTAGCATA
GTAGTATTGTCCTAGGAGAGTCTAGAGTATTCCAGTGAGTGTTGGAGTCT
GAGTTAGTGTAGGTAGTACTACTCTTGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGGGA
GTGTTAGTATAGTAGTAGTGTCCTACTAGAGTCTAGATCATTCCAGTGTA
CAAGTGAAGATGTAAGGCTAGATTGTGCTATATATAAAAGAGGGTGTGGA
GGTCCAAGGGACCAACCAAGCCCATCCAGAAAATTGTCCCAAAAAAACCA
ACATGGTATCAGAGCTAGGCTCCTCCTCCTAACCCTAGCTACCACCATTC
CACTACTGCAGCACCCACTCCGGCTCTTGTTGTCAACAACACCAGGCACA
TTGTAGTCACCTAAGCGGCGGGAGGCCGCATCCCGTTGCTCTCTACAGGC
AGTAACCAGCTTATGTGTTGCTCTCATCACGATGTGTTGTGTGAGGCTTG
GTTGCTGCTCTGTACGGAGGTTGCTTAGTGAGCTAGTTAGAATGGTGCAA
TTGAGATGTTGATAGGAGGAAAATAAGTTAGCTGGATTTGGGGACCAAGA
GAAACTGGAGGTGGAGGAGGACCTCTGATCTGGTTGGAGATGGGCAGATG
CAGAGGTGATGGTGATGGTGATGGCTGGAGCTGTGTGGTGCTGGGCTGTG
GTCGTGGAAGGAGACAACTGGGTGAGGTCTCCAGTTTGGTCGTTCTTGGC
TCCGGGAAGAGGCGAGCTGCAGAGCTGCAAGGTGTGGACGCCTGAGGTAT
GAAGCGGAGCTGAGAAGAGGAGTCCAGGAGGGAGTAGCTGCTGGAGTTGA
TTTGGGCGTCTGTGAGGAGCAAAGTGAACAAAGCTTGGTGCTAGGAGAAG
AGGAGAGAATGGAATGGATCTGAGAGAGAGGTAGAGGATGTGGTGACCGA
GGCAAAGATGGTTGAGGCAAGATGGCCGGAGGGTTGATGGAGAGGTGGTA
GAGGTCAAGGTTGTCACCGCGTTGGATAGGTGGAAGTCATGTGGAGGTCA
GGAGAGTGTGGAACTGTAGATAGCTGACCGGTGAGGTGAGACGGTTGTGG
CTCTGTAGGAGCGGTTGTTGAGGTTAAGCAGCTGTGGTTCTGTGGGAACC
AAAGTTAATGAAGAGACAATGATGATGCTCAAGCTGATGAGGGAAGGCGT
GTGGTGCCACCGTTGTACGCACCGGTGTGAGAAGGTGCATGGTTGGAGAG
GCAACGGTGGACCAACACAAGAAGGATGGGAGGAGGCTAGCTTGATGCAG
AGTAGGTGTCCGGTGATGGTGATGGCTCCCATGAGCGGAGCTGGATGGTC
GGAGTTGATTGGTTGCTTGACGACCACTAGAGCAAGAGCTAGAGTAAAAC
GCTCTCATGTAGATTTTTATGCTTGCAAGCTAGAGGTGTAGTGGTCCTAG
TAAGTGTCATGGAGTTGTAGCAAGATGGTCATGGTGACTGACCCATGCTC
ATCTTGAGGGGGAGTGTTGGAGTCTAGGTTAGCATAGTAGTATTGTCCTA
GGAGAGTCTAGAGTATTCCAGTGAGTGTTGGAGTCTGAGTTAGTGTAGGT
AGTACTACTCTTGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTTAGTATAGTA
GTAGTGTCCTACTAGAGTCTAGATCATTCCAGTGTACAAGTGAAGATGTA
AGGCTAGATTGTGCTATATATAAAAGAGGGTGTGGAGGTCCAAGGGACCA
ACCAAGCCCATCCAGAAAATTGTCCCCAAAAAAACCAACATATCATATTG
GTTTTGTTCGCTCAAATCTCAGAGCATCTTGGAGATCTCAGAAAATGATA
CTATCTGATTCTTTGACTATTTGTTGCAGCGTTATCAACAATGGGACTTA
CACCAACAATGAGTACAATGATGTTTACCTCGTGACTACTTTAAATCCAA
TTCCGCTTGAGGCCTTCACTCTCCAAGTGAGGATTCAGTAATACTCTATG
TTAGTGGCATTTTCACTTTTTTTATGCTCATTGAACAACCTTACGCAATA
GAAGGAAGTATGCACTTATGTGTCACTTGTCAGCAAAGTCTGTAAGAAGG
TAATGACACTATCATATAAAAAAGTTTCTTAAAAATCAAAATAAAAAATC
TAGGTATTCCCAATTTTGTTATTCTTTGTCTTCGTTCCACTGCTTGTACA
TGTTGCTTTTATTTGTGAATATGACTGAAATATTTAACATGCAGGAAAGT
GAAGTATCTGCAGTTAGGTATATGCACCGTGATGAGTACAAGAGCTGCCT
TGCAATAGAAAGCAGAGAATTTGTGCCTTATGGTGTGAATGGGCAATACG
GCCAACTATTCAGCATTATTGAAGAAAGGTTAGCACACTAAAGCAGTCAA
CATGTAGGCCTCTATCGTTTTTAATGGGATAATCCTATTCGTTTTTGAGA
AAGCTAAAATGCAATTTGTGTGTGGTCGGTATGAAGTTTACTATTATCCT
AATAATCAGTTTGGTGTTTATGATACTTAAATCGAGTTCAGAACCCTTTT
TTCTTCCTGGTTTAGTTTTTAACACCAAGCTGGAATAGTGGATTTGGAGT
CTTGGGATTGTCATGAAGTCAATCCTAGGTTCTTAAAATCTATGGTCTGC
ATTTTTACCTCACCAGGTGGCGCCTTAAGTTGAAGATGTGATGTAATATT
GTTTACATCATAGGGAAAGCTATTGTTCTTAACTTCAAGAGAAAATTGAG
GATTTCATCACCTAAATGGCACTCTAACATCTCCTGAGCGGGGCCTTTCT
CAAAGAAGTCAAGTGATGGGGCTACCTTTTCGACCACTCTAACCAAGATC
TCCCACTCGACCAAACAAGCTCAACTGACTAGATGTTTCAAGCAGTATGT
GCTCCTTGTTAACTAATCACCAGACTCGGAACTTGAAAGAATGACTTAGT
CTTTCCTGTCTTGCCAATTGCCATTTTGAAGTAATTCAGTAAATCCTAAT
ACTTTGGTGATCCTTATTGCACTGTGCTTTTATTAAAAAAAAATTAACCT
TTCATGCCATGTTAATAGGTACAAAGACAATGTCGATTCCCGCAGCTTAA
CCTTACAAAAGCAAATTAGTCGTTATGCTCCCATCAATTTGGAAACAGAG
GCAAGTTTATATATCAGCTATCTTTGGCCATTTATTCCATTAGCATTTGA
CCTTTTTTGTTTCAGAATCTTCCTCGCCTTTTCTAGTACTTCAGTACTTC
AAAGAGTTTTGGTTAATAGGATTTCAGATGATAAGTACACTCTTATTTCA
TATACAATGATAGCAAGTTGTCTGTGGCAATTTATCTTTCCTCCTATAAA
AGTTCCAGTCGGTGGCGGTGGTTCTGTCACCACCTCACCCCATCTGATGC
AAGCCGTTAAATTTAGTGCATTTGCAAGTTCTGAGGTGGTGGTATAATTA
CTAGCAAGGGCCAGCAAAATATTATAATGGTTTTTTCTAGTATAATTTAT
CTATAGCAACACATTGGGTAGTCCAATTTGTGTTATCTGTAGCAACAAAA
TGGTATTTAGCTAGTAGTATGCAATGGCATAATTTTCGAATATTGTTTGA
AGCACATTAACATACTCCCATGTATTAGTCCTTGTGTTCATGCAATACGT
AAAACATCACTTGATATATAATGCATATGGATATTTTCTTGATTTGTAAA
CTTTCCATTATATTCCCATGCATCGAGACCATACTATTTAGTTGAAAAAG
CAGGAAGGAAATGGATGATGTATTGACTCATCACTTCCAAACATGCTTCG
CTTATGTATACTTAACCTTTTGATACTTTTGTTTTCACAGTTGACTAATC
TATCTGAAGGTGACAGGGAAGCCTTGGGCTATATTTTTAAAGCATCAACA
GTTATTGATGACATATTTCATGAGCAAGTTAGTTCTTTTATTTATCATAA
GATAATGTCCAGATATTGGTTCTGTTTCTTATAGATGTTTCAAGTATAAT
TAGTTATGATAGTTTATCTTCATAATATGTTCATCATTATTGCACTGCAT
AGTTCTTAATTAATCTTATTTTCATTTGATTCTGCAATTTCTTACTACTC
TAGTTCTCAAGTAGGTATGGAATAGCAACCGGATGCTAAGAGACTGGCTA
AAAGCACGTGCTGATTCCTCCTCCTTTGATAATTTGAAGTGGAAATATTA
TTCTATTAATAAAAGTCCATGGTAATTCCGTATTCTTCAGTTAAGATTCT
CATGATTGAAAATTTGTTCATTTCATTTTTTTCTTTGTTATCATTGCTAT
TCTGATCAGTGGCATGCCTCATCTTGCTTAAGAGTTAGGCCTGTGACTTT
CTTCTGTCCGTGGTGTGTATCCCACCATGTTGATGTACATATTTTAGCAT
GTAATATGAATGAGATACAGTTACTTTTCTATTGGTTATCCACCTTCTTA
CCTAACAGAGTTAAAAGTCAGTCTGGAGGACACATACTTTCTCACTCCTT
AGTTTTTATTTGCTGATCTTTACTATTACTGTGCATACATTTTTGTTTTC
TTCATACTACTTCATCAACTAGGCAACTATATATGTTTTTATTCACTGTT
CTCATTCCTTCCTCGTCATAAATTAGACTGTGAGATAGGTGCATTGCATA
GCTAAATGGGATATATACATTGCGAGACCTGCTCTCAGGGAGCTTGTGTT
TATCTGTCATCAATCATTGAATGTTTGTTAGTACCAGTGCCATTACCTTT
TCGAGAAGTTCACACTCTGGGATTAAAGCATGCTACTCCGCTTTGTTAAA
GTATATGTGGATTGTCCACCTTCTCTCCACCAGTTTGGACTTCTGTTTCT
ATTGGTTGGTGCATGAGACGTAAAATCAAAAGTACAAACTGATGGAGTGA
AGGTGGGCAATCCACGTACACTTATGAGATGAATTTTCCACTAGCCTTTT
GCAATGTGGACATGCACTACTGGAACGCCAAGTGGATAGCAGATTTCTTC
AAGCACAATGGTGTTAGTAAATGGCAGTTTTATGCTGACACGCTTTTTGC
TTGACTTTTTTTTCAGCTGTGCATATAACTGAGAAAATGAATCCTAAGAT
ACATTATTACCAACGTTGGTCCGTTTCCTTGTTTATTTTCTTTTCATATC
AGACTCTCTTAGTAAACAGGCATATGATTTCATGCACCGCTTATTCATAC
CTAGTATGTTTGTTTGAAACTTATCATTTCTGATTAAGTTTATGTATAAT
GATTATATATTTCTTAGCGTGCTCATAGTTATCGTTTTGATATTTCCAAT
AACAGGTCCTGCCTTGATGAAAACAAGGCTTTTCTGTCCACCGCAGATTC
GGCTGTAAAATTGCTCAGAGATGCCACAAAACCAATTTCAGGATGGAAGG
GGATTGAGTATCGTGCAGCATTTCCTCTAGATAAACCTAGCGGTGCAAAT
TTTTATCCTCCTGATATGAACAAAATGGTACATCCAAGTCACTTCTCCAC
TTCACAGTGCTTAAAATACCCAGTAGAGGATTTTTTTCCTGGGTATAATT
GCAAACTTCAGTGTACTATCTGATTGTAGTAACTGTACATTTGATGTGTA
CTTGATTATGTACTGAGATTGGATCAATCTGCATATCTTTTGCCTGGCTG
TAGGAGTTTGAATTATGGAAAAGTGGAATAACTGATAAGGAACAAAAAGA
TGCGACTGGATTCTTTACTGTCATTAAACGACCTGACGCCTTAGTGCCGT
CATCACAAGCACAATCAGAAGTATCAAATCAAACCAATACTTCAGATGAT
CTTTTCATTGTTCCGTACTCCAAGGAGTATAAATCATCCCTTGAGAAAGC
TGCTGGGCTTCTTTGTAAAGCATCAGAGTGTTCTGATTCTCCTAGGTAAG
CTAGTAATTTAACATCTTCCAGTTTTTGTAGCTTTACTTAATTAGTTTCA
AGATTTATTTTGCTTTATCTTGTTGTAGCCTGAAGAATTTGCTTAGAACC
AAGGCAAATGCTTTCCTTTCAAACGATTACTATGAATCTGACATAGCTTG
GATGGAGTTGGTTGGTATCCTAATTCTCAGTTTTGTTAGTTCATTAATTT
CTCTTTATGTTGATATAGCTACCCCCTCCGTTACAAATTACTTGTCGCAG
TTTTAGGAAAAATATTGCCTAAAATATGTCTAGATTCAACGAACCTGCGA
CAAGTAATTTGGATTGGAGGTAGTATTAACTTTGTTGGAGAAGAATAGGT
TATATCTGGTAGTAAGATTTGGTTTTTAATTTTCTTTATATTCATATTAG
CTGATATTACCTCTACCTCTATATTTATTGTTCCTGTCATTTTCCCAGGA
CTCCAACATAGACGTCACAATTGGCCCATATGAGACATACGAAGATCGTC
TTTTTAGTCATAAGGTATTTTCCTTAGGGCCCTTGTTCCACCTGTTCTTG
GCATCTCTTTGTCTATTGGTTGAGTTGAGCATTGAAGGTGCACTACTAAA
CACCAAATGTAATTTCGAAGTGCTTGTTTCTGCCATATGTCACTTTGAGA
TACTCTTGAAGTTTGTGTAACCGATGCTAGCAGATGAACACTGGTTACTA
CACCGAAATCAGCTTCAGACATGCGTATTGCCAACATTTCTCTGTATTAA
CTTTTATCCTTGGCTACCTTTTAGGCAACTTTAGTAAGCATGTTCTTCAT
TAATGCATTTTAGTCAGTTAAGTACCAGCTGTGCCCACAAGGCAATATTA
GCATTTGTATGGCACGTTGTCATATTGTTCAATTAAGGACATCTGTTTAA
AAGGAGTAGACTATATTTCTCCAGGGGCATTGCCCACTGGGGCCGTATAA
TAATTAACAGTACAAGTCACTGCATAATACAGGAATGTTCACATGCAAAA
AAAAAGGGAATTCTTGAATTGAGTTTATTTACATACTTTGTATTGAGTTA
ATACAGTTTACCGTTTGTGTTTACTAGTAACAACTTCCTACTATTTCAAA
GGCAACCTTTGAAGCTTTTGTTGGGATATGGGATGACGTTGCAACTTCTC
AAGTTAAACTCTTTGGTGGTCAGCTTGAGGTAATTCTGATTGTATTTGAA
AGAAGAATATTGAGCTTTTATTTATTTTAAATTTTCCCTGATTTTAGGAT
TTGGAGAAAAATCTTCCACTGGACAATATTTACAAATCAGACCATGTATC
TGCTGCTCCAATTCGCGTGATGAATCTTCTTTACAACTCTGGGGTATGCT
TCTATTTTGATGTTACTTTTGATATTCTTTTGCTTCCTGCCTAGAGGTCC
TAGTTCGATCAATGTTTAATAGTAATTTTTTTTCATGACTGTCCCAGTTT
CTTATACATTTCACCTAAAAATATTGTGCATGTGTAGACAAAGAAATTAA
AAAAAAAAATCTGTTCTGCTTGGTGATAGACGTAAAACTGACAAGATCCC
TATGTCCTTGAATTCCTGAGAGCAGTGTTTCTATCTAAGTGGCAAAACAC
TAGGTTTTCATGAAAAGAATGCTTTTCTGTAGCTGGAATGCTTTTCTAGC
TACTCTCTCAGTGGCATGGTTGTCATCCGAGTGTTTAATGCCAGAGAAGA
TTTATAATTAGCTTTATAATTATTTTTGTGTTGAAGTTACTTGAAGGTTT
AGTATTTCCATCCCCTGCGGTATAGTAATTATAGTTATTGTCATCTGGGC
TTCTGGAAGCAATTGGTAAGCTCTGGAGAGACTAAAAATTGTCTATGTAT
TGCTAATGACTATGTCAATTGCATACCCTTGGACAACAGCTTCATGAACT
AAACAAGGACTGGTCTTGCAGGATGTGAAAGGTCCTCAAACTATCGCTTT
CAATTTGCCAAATGATGTGCGGATTTTGAATGAGCGAGGAACTTCAATGG
TTATGCTCAAGAACATTTCAGAAGCCAAGTATGCATTCTACTGTTTTTTG
TTTATAAATTTTAGCTGACAATTTGGCTTTTCACACTTCATTATGGCATG
CAAAGTAAGGGAGTTAATGCTCACATTGGCAATTCAAAATTTCTGTATTA
TTCAGGTTCAAGCACGTCTTGAAACCTATAGCCGATGCCTGCATCAGAGA
GGAGCAGAAGGATTATGTTAATTTTGATTCCTATTATACGCATATTGTTT
GCCATGAATGCTGCCATGGAATCGGACCCCATTCCATTATCCTCCCAAGT
GGTAAAAAGTCTACAGTTAGATTGGTATGTACCAGCAAGTAGCATTAAGA
AGTAGAAATACTTCCACGGGTTGGTGTTTTGACATAAACAAAAAAAAATT
TGAACGGTGCCTCCTATCTGGTGCCACTAGTTGACTGTCCTGGCCTTCTT
GATGAATTTACAGGAATTTCAAGAATTTTATTCAGCATTGGAGGAGGCAA
AAGCTGATATAGTTGGTCTGTGGGCACTGAACTTTCTTATTAATAAGGTC
AGTTACTTCCTTAATTATCAGATTATCAGGGCACTTGGGTTGGCCAGAGC
TCTGGAGCCCAGACAAACAAATTCAAACTGTGTTACTTCTGTTGCGAATA
ATGGGGATGTTTATGTCTATTATTGCTTTTTTATATCCTTTTTATGCAAT
CATTTCTACTTAAAATGGACCACAGAATGCCTTATTTATTTCTGTTTTAT
CAGGGGCTGCTTCCTAAGAGCCTATCAAAATCCATGTATGTCTCTTTCCT
GGCTGGGTGCTTCCGGTCCATCCGCTTCGGACTGGGAGAAGCTCATGGGT
AAGTCTGTATCTTCCCTGCTATCATATATCATATATAGTACGCCTAAAAG
ACTGAACATGGATACTCCTCATAGTTTGTTGGAGTAATTTCGTGGTTTGT
TGTGCTCTCGAGGATAAATTTAACGGCTGTAATTGGCTGCAGGAAAGGGC
AAGCATTGCAATTTAACTGGATGTATGAGAAAGGAGCTTTTATCATGCAC
TCTGATGGGAAATTCTCAATTGAGTTTACAAAGGTAATATCTCGCGAGAC
ATGATATACTTGTCGCTCTTTTATTATTGCTGCTCACTATAATCTCTTCT
GAAAAAGGTTGAGGAGGCTGTCGAAAGCCTTAGCAGAGAGATCCTGACAA
TACAGGCAAAGGGTGACAAGCCCGCTGCCCAGTCTCTCCTTGAGTCCCGT
GCAACCTTGACGCAGCCTTTGCGTGTGGCTTTGGAGAAAATAGAACACAT
GCAGGTATTGTTCAAGTTTTACTGTATTCCGCAACATGTAGGCCCAGTGA
GGCAAATTGTATATATATTTTTTCATGGACTGATTCCCTTATGTCTCTTC
ATTTCCAGGTGCCTGTCGATATCACCCCTATATTTGACACGGCCAATAAG
CTTCTTGCAAATTATTAATCACCAGAAGACAGCAATCCAGCAAGTTTTGT
GCCTCACCACTATTCCTGAGAAACCAGATTGTTGAAACATGATAAAGCTC
CACACCGAGTGATGTTAATGAAAAGAACGTTGAACACATGAGTAACTTGT
ATAAAGGATCATGGTTGGCGTCACTTTCTGTTTACCAAGGCGTTCTTAGT
AAGATGTTTACGGTATAATCATCAACCGTATTCCCTAAGAAGAAGAGAAG
AGAAGGAAACCCATGTGCCCTCTCCTCTAAACTGTGCCAGAACTGCTGCT
CTGAACTTTCGTGGTTTTTGCCATGCCGAAGGTCTACGCATGGTTTGTTT
GTTTTGGTGAATTTTTGCAAACCGCATGAAATCATTCACTAGTGATGGTT
TGGTATAACAGGATAGAGCATAGATGTCATCGTCTTATGGCCTGCACATG
TGGTAGGAGGACTAACTCTTGTGATGGAAGGCTTGCACATGCCAGGATAA
GCTTTGGTTCTGCAACGGTCTGGGATGTGTTGGTACCTTTACAGAGAGGT
TGGGCTTGACAAAACATTGAAAAGACCTGAGTTGCAAAATATGGATAATA
TTTTCCTACCACTTACAGAGAGATCAAAGGTTTTGATCCATTTGGAGATT
TTTCTTTGCGGGAAGATATATTTGGAGTTTGTGCTATCAGATAAAACTGA
ATAAGTATATCATGTGTGAACAAGAAAGCGTAAACATCCAGCTACATGTG
TGCATAGTGTAAACATCCAGCTACACGTGTGCATAGTATATCATGTGTGC
AATGATGCCTTTGGCTGTATTCTTTGACTTTGACTAATACTAGTTGTTAG
GCTGGTTATAGTGGTACTAGTGTATGATACTATCTTCACAGTGCATGATA
TCATATGATAGTATCATATTAGTATTATATTTAATGATTTGTAGAATCTC
AATATAAAATTGTGTACAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.