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GrainGenes Sequence Report: AA042270

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Sequence
AA042270
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042270
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCGATTTAAGTAGAGCAAAAGCATCCGTGTGCCCTGGTAGGTACGTAG
AATGGCGAACGTCGCCGAGCACCGCGTAGAGATGCCGGCGGCGGATTCTA
CCGCCGGCAAGGCCTTCGCCGCCGCGCTGCCGGAGGAGCGGCTGAACCTC
TTCCTGCACGTGGTCGCGTCTGTGGAGAGGTTTGGAAACGCGCTTGGCAC
GCTGGCCTTCACCTGGGCGACCGTTGTCCTGCTCGGCGGCTACCCCACGG
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GAAGCCTTGAGGTACGTACTACATGCAACTACGTACATACCGCACAATAA
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GAATAATGCGGACATGATCGAGACCCCTCTCGGATCAATAATCAGAAGAG
GGATCTGGAGACCCATACTGACTCCCACACATTCAACGATGACTTTCTTG
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CTCAGGACATATTCCCTTCAAGTCCTACCGATACACATCTACGAGGCCAA
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AACATTATACGAGTTTAGTGGGAGGGGGTACTAATACATCACAACCCTCT
AACAATTCCCATCATTAATTAGTCATTGGATGGCTCACATTGGGATGCTT
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GTGATCGTAGGAGATGTTGGGGTGACGGCGGTTGTCCACGCGATAGCGTT
CAGGAAGGCGCCCTTGCGTCGGGGTGGAGACGTGGTGATCTCCCGCGACA
ACAATCTGATAGTGGTGGTACGTGATCTGGAGGATCTTCAGAAACCCTAG
GTCATGCCATGGCCATTGCCCTTCGATGGCCGCCGAGAGGTCGGGGTGCG
GCCTGTTAGGGGTCTTTTTGGCATGGGACTAGCGTGAGTTGGAGTGGCGA
GGGAGGGCGAGTGGTTTGTCGTTCGCGGCTGTGCTCCGGCGGTGATGGAG
GGAGAGCGGGGCCGCGATTGCTTTCTCCTCCGTTGTTCTGACCGGAGGCG
TGGGGGCCGCTGGTTTTCTTTATAATGGAGGCGGTCCTAGGATTCTCGCA
CCAAGAGAGTGTTCTGTTGGATGACTGCCCTCATTGATCTGGCCACTAAC
GAGTTCCAGAAGGCTCCGATGGAGATCTCCATTGGGCGATTGATGCACGT
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ATGCGGCTTCTAGAGGGTGTGACGCGAAGCTTTGTTGTTTGTTGACATTA
TGGGACATATCGGTATTTCGATTATCATGATGAAGATAGTGGCGCAGAAT
GTCATGTCGGCTGAGGTCTGACGCCTAGCAATGGAGGACCGAGTCTTTAG
GGTGATGATGACTTTGATTAATGATTCATGACTTGTAGCAACGACATCGG
CAAGTGTGGGTGGAAGCATAGGAGGAGTACCGAGTCTTATCTTTCAGGGA
TAAACCCCAAGGTATGACCCTTAATAGGTTGTGCCTGGCAGTGGTCTTCT
TAAAGACATTGGTTTGAGATTGTGGACTCTCTCCAAGGTGAAATCCTAAT
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GTGCAGAATACTTATTTTGCACCCAACATATTTTTACATTGTTAAATTGA
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AAATTATGTCATTTCTAAATTTTCTTATGTTCTTCTCGACTTACGAAGTA
AGACAAAATTTACGTGACGTAAAAATATTCTACACCCTGGGTGTCAAATA
GCGCCACTCTATATATATATATATATATATGAGAAATAACCAGCTAAACA
CAGTCATAGCTGCGCATAGCCTATCCACCGTTGATTCTATCCCCTTTTGA
TATAGGGAGCACATGTATCCAGACCCAGGATGTTGGCTCAATAGTAACGC
CGTTAGTGTTCCTTTGATGCATGCATGAAGCCCTATCAAAAAAAAGCTTA
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CCTAACCCTAATATACTACACGGTAAACCCTAATATACTACATGCATGAA
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CATTTAGGTGAGGCAAACCCTAATATACTACATGCGGTAAACCCTAACCA
AACTAAGTCTTATTTCATTGCCACCGCAATAAACAAAACAACCTTTGTTT
CGTTTTCTTCACATTCTCATGGATGCATGCGGCCACCAAACACATACCAA
AACAACCTTTGTTAGGGCACTCTTTTGCATGGCACATAGTCTAAAGCTTC
TACATGCAAAACCTGTTTTAATCCTTGTTCTCAATCCCTTCTTATTTTAG
ATGCTAAAACTTTTGTAGCCAAAACAGTGTATTAAATTGGAACTCATGCC
AAACCCTAGATTCTTGCATGCATGCACAAAACTAACACCGTTATCTCAGC
CATGTTCCACCCCACTTCCATCTAGAGGTTGCATGCATTTGATCCCTAAA
TCCAACGGTGCTTTGCCTATACGCAGCTACGTCTGTGAGTAGCAAATCCG
CGTCGATATATATATATATATATATATATATATATATAATATATATATAA
TATATGATCGGGTGATGATGGCGCTTGAGCACGGTTTCCTTCATGGAGGT
GTCGCTTTTGGAGAATTTGGACTTCAGATCTTGATGGTGGTTAGAGTTGC
AGCTACAAGGAATCATTGTAGTGGGATCTTTTTGTTTCTTCTTCTTCTTT
GTCTTCTTCTTTTTGTTTTAGGGCTATGAGCATCCATAATGTCTTTAGGA
CATTTCGTTGTTGCAAAGAATGGGTGTAATTGATATCTTCACGGTATTAA
TATATTCCCTTGTCGAAAAAACTGGTTATCATTCATGTGAGGCACAAATC
ATTTAATTGTTATGTTACATCACACACTCCGGTGGTTCTTCCCCAAGGTC
GCCACTAAGGCCTCCAAACACAAACCCTAGTTCCTTCCCATATCCCTCCA
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TCTCACTCTCTTGTTGGTATGTGGCATGGGATTCAGGTGGTCTAGGGATT
ATGTCAACGTGACCTTTGTCGAGCAACTATGTGGCCTAGGTTGGCGAAGG
CACTCTTGAACACAATCAATGATTCTCCACGAGGATTGTTGATGCCTTTC
TTGGTGCACCCTCCCTCTCGTGGTGCTATTGTATTGCCCGTATTGTGTCG
GTTCTAGCTTGTTGAGATCCCATGCGACCTGACAGTATCCGGGTGTAAGG
GTGGCGGCATCAAATTGTGACATGGCATGAGCTGAAATTATGGAGGCTAT
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AAGGTGAGTCGGCATGTGGTGCGACAACTTGATGGCTGAACGGGTGGAAA
CGAGGGTTGCTTCCGTGAACTTCTCTTGTGATCTAACCACGAGTAGAGGC
CGGCCTGTGAAGGATCCAATGGCGCGTGCCAATGGATGTCAAGAGATTTG
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TTAGTGAAAATCCTTGATCAGCCTATTTGATCGGACCAGGTAGCATCGAC
ATACATCAATTTTTCTAATTGTTGAAGGTGTTCAATAAAAGCTCCTCCTT
AGGGGTAATAACCCAGTATGGACCTTTTGCCGAAACCAGCGATATCGCCA
TATGAGTCGTGTTTCATTCAGTCTCGTGTTGTGTTTCACTAGAGGACTAT
GCAAGGCCAATGTTTTGGGTGATGTTTGCTATCTTTCTAGTAAAATTGAG
TTGTGTGTGGATCCGATGACTTTAGATCCCTAAATATCCAAAGATCCCTA
AACATCCAATTTCAAGTACAAAATGGGTGAAGATTGCCCTTTTCAACGTC
TGATCAAATATATCTGAAATATCAAGTCCAACAAAATACTATAAGCAAAA
AAATTCCAGTTGTTCATCTCGGGCACTATTAACAGCCTATAGCTGTATAC
TGTAGTGTAATCTTGCCGGTTAAGTTTCTGTTGGGCCTAATTTTCATTGT
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GTATGTATTTCAGGATGTTCAGCGGCAACAACAGGCTAGATTACCAATTA
TTCTTCCGTACGAGAGGTGCGTTCAGGTCCGTTGGCTCGAATGGGCTGAT
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TCTCCATATGCAAGACTACCCATATGCAGTCCGCTACTTGATGCTATGTC
ATTGTGGAGCCCAATGGTTGCAATTCTATTGCTTTACCCTGCTACACTTT
ATAGGTATAGCGATTTCGAAAACTCAATTGTCAGGAAGACCGCGTACATG
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GGCGTCAAGTCATTCTAAACATGAGCATGCTTGCGACAATTGGGATGTTG
GTGTCCAATTATGATGTCATCCGTAAAATCCGCATTATTATCATATTCGG
CATACTGGTTCAAATTATAGTGTCATTAGGCAACCTTCAGATTCCAGCAG
CAGTGTTGCGCATCGTGCTGGCAGCGTGGGGAATCTTATTAGGTAGTGAT
TATGCTGGCAAGGAGAACACAAACCTTGTGTCATCTCTCTATATCTTTTA
TTCAATGGTGCTTGGTCAAGGGATACTGTACATTATTGCTAGCATCCTTG
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AGAGGTCCCCAAGGAATGGAATGTGTCGATTTGTACTGTGAAGATGCCTT
CGAGAAATGCAAGAAAGGGACTGTGCTTGCTCCACAGAAGACCAGCCTCG
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GCCGGCGCGAATCCCTCCGACTGGCCAGACTGTTGCCGCCGGCGCCAACA
CAGCTTCTTCCGGCCGACGCCACCAGTGCCGACCGCCTCCGCTGCCGACC
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CGGAGTGCTCGCCACCGCATGCATCTACTGCCCTCCTCCACCCTGTTCTT
CCCCTGTCGTGTACGTGGACACCATGAGGTCCAGCATCTGCGACTCTTAG
CTATGCTAGAAATAGGTCAATTAGAATATTTTCTTCAGACATTGCAATTA
CCTTATTTTCTTCAGCACATCATCTGCATTTTCGCATGATTCTTCGGAGA
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AGAGCGTGATCAAGCTCCTGTAGTTGACGCCCGAGTACGCAGATCGAGCA
TGGCTACGAAGATTTTCATCTGTGTGTACGCGAACATGCAGCTGCCCATG
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GGGTTAGCGTCCAAAACCCGATAGATAGGGGGGTTATGTGGACTTCTTTC
TTCCGAGGGAGGAGCCAACTAACATGGGTGAACAAATGCCACGGATACTC
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TCTCCTCCCCGTACTAGGAATGTTAATTCTTGACAAGCTTGCTATCTTTG
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TCAGCTGCTACGACTGATCGCTGGGCAAGCTTTGGCTGTTCTGGCAATTG
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AATTAAAGCTACAAGTGCAACATTAGAGGCAGATATTATAACTTAATATA
TACAGATGTTCTTGCAACATTTTATTTCTTGGTTGCATCATGGATTAGTA
GCTTACCACAGCTACAATGAGGTACACAACACAACTAGATAAATAGATGC
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GATGTTTAAGCATGTCTTACATAGCTTAGCTATTTCCACTATAGGTAATG
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TAGTTCACAAATATGTGAGGTTATTCCTGAAGACTTTACGCGAGAATTAG
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CCTACGAGGGTTGAAAAATACAGGTTCTTCTTGGGTGATGCAGGACTTAT
GGAGCACAACATACCTCTATCCGCTCTTGTGTCCAGAGCAAAACAACTGA
TGAGCCGTGCGTAGTTATGAGGCATCGGCACGGTGATCTGAACATTTATT
GTAATCATATTGTTCTGGATATCTATGCTGGAACTTGTAAACCCACTCAA
GTTACTCACCGTAGTACGTAGTGAGTTATTCCATTGCAATCCAAGAAGAA
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GGTGCTCTATGAAACTTTGTATGGATGGTTGCTTTATTAATAAAGCTGGG
CGAAAGCCTATTTCGAGATTTGTGATCTAATATGAACAGTCATGGTACCA
GGTGACGAGGCTTCGGCCCCTAATCAGTCAAGTTTTGAGCCGCACAACAA
GTGTTCAGTACTAGTAAATGGTAGCTGCAATCCTGCAACTGTTTAGTACT
AAGATAGTAATAGTAATTTGTGTTTTATTCCAACACCACAAACATCCAAG
GTCAAGCAATTAGCCATGAACTGAATAGAAACTACACAGTACCTGTCTAA
TAAGATTCGAGTAGAGTTTTAGCACAATTGTGAGTCCTTTCAGTCCTGGT
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GGCATACCAAAGAATCAGTTGCCACATGTATATTATACCTGGTACTGTCA
GTGGTTGTGCTCCTACTGACAGTCAGCAGGCTGAGGTTACAAGAATCATA
TAGCTGGTAGATACCGCTATCGGCGGTAAAGAGGTATTTTGGTGTCAAGT
TACTCTAAACCTGTGCATGTTTGCTGCATTAGGGGTGCCGGTGATTACTA
CGATCACATCATCAGTCCCATTAGATATTATGTTCAGAACAGAAGAATAT
GCTCGGGTGATAGTGTCATTTGATAACTTACAGATACCAGCAGCAGTTGT
GTGTGTCATACTCGCACTATTGTGCCTTAAGACACAGGATAACTACCATG
ATGATCATCGTGACAAGCACATGAGAAACCTCGCGCTATCTCTGCGTATC
TTCTACAGTATGGAGCTTGGACAAGGAATGCTACATCTTTTGGCTTGCAT
GCTAGAGGTCTTCTATTTCATCCCTCTGAGATCCCTCGTCCTTTCTGGTG
GATTTAGAGATCACTGGGGAGTGGATTCTGTCAACATGTACTCCCTTCGT
TTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTAAAGAAAATGTATCTAGACTTC
TTTTAGTGTGTAGATTCACTCCACACATGAGTGAACCTATATACTAAAAA
AAGTCTAGATACATTTGCTTCACAGAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAA
CGGAGGGAGTACTATGCATATGCCTTGGATAAATGTATGCAACTATCTCC
AGAGAAAATCTGCCTCAGCAACTTTGCCATGGATTCTGTACACTCATACT
CATCCAATTATCAGCTCTGCGGAATTTGGATTATGCACTGCTTTCTGCAA
AGGGGGCCAGCCAAGGCACAACTCGTTTCAAAACTCACTATTTCTAAGAA
ATTGATAGCCAGAATAATCAAAATGTTGATTCAAAAAGTCAAAAAGATAA
AGCTATAAGATTTGCTCTTCTTGACACTGACAGCAAACCAAAAAGAGGAA
TTTCACTTCTGCACACGGATCATGAACATGGAGAAAGACAGGATCCATTT
CTGAGTACAGAAGATAACTAAGAGGAAAACACATGATCCGACAACAGATG
CAGCTGATAACCTATTGCAAAGACTAGAACAACTTCAAGACACCGAAAAC
CTGGTGCAAACTCAAACCGGCTCAACCCAGCAAGTTAGCAACAAACAAAA
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GATGCAGAGGCTGGGGCGCTGCCTCCGTTTCGAAAAAAAACAGACCATGA
ACTTCTACCTGCACTGGCAGTGTCAATTATAGACAGTCTTGCTGATTGTA
ATCAAGACAACTGTGTCGAAATCAGCAAAGCAGCTTATCTCATCTTGAAG
ATCATAGAGTTCACAAGCTAAAGAAGTGACACGGCGATCACAAGGGCGCA
GCATAAGGTCCTGCTGCAGTCATCACTGAAGGTGCTGCAACTGCTCACAA
GAATTGGCCGGGAAATCGGCATAACTCTCCGGTATGAGATATAAAAAAAC
CCTTCATATTGACAAACCTCACCGAGATCTTTGGAGACAGCGTGAGCAGC
CAAGAACTCAAAAAATTGGTGGCAGAAATCCTCAGAAACCTTGTCATTGA
TGGGAACACAAGGCAGGAGATTGGTCGCATCCAACTGACCATTAGCATGT
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GCTCAAGACTATGATCCTCATCCAGGATGGGACGTGCATATATGTTGCGT
AATCTGTGCCTGCACGCTCCATCAGAGTTCATAGAGACGGACCTGAAGGA
ACTATCACATACCTTGCGACAGGTGAGCTCTGCTAATTTTAAGTGACAAG
TGCACTACTAGAGGTGGATAATGAAACTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.