Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA041328

[Submit comment/correction]

Sequence
AA041328
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041328
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTTAATAAAATCCCATCCAGGAAGCGCTCCATACATGGGAGATCCCATC
TTAATTAGGGCAGGAGGAAGCGAAAGGCGTCTGCGGCTGCGCTGAGGAAA
CCTAGGAGGGGGAGCGGAGATCTGCTCGTGCGTCTGTTCTCTGGTGCCCG
GGTATGGATTTTCCAGCTTTGATCTGTTTCTGTTCTTGCATTTGAGTTTT
TTTTGCATATATTTTTCTCTATTTGCATGTATTTGCTATAGATCTGTTTT
GATTTGGATCATATTTCTATAAAAATTTAGTATATTCGAAGTAGATCTGT
TAAGTTTATAATCACCTTGTTAGGCTTTAAGATTGAAGATACATCAAAAG
TCAGATCTGATGGAAAAGATTGGACAATCCACATACACTTCAACATTCTC
TTATGTGTGTCTTGATAAGGCCTAAACGTATAGAAAGAAGGAGGGAAAGC
ATTTTTTTAATTATTAAACAACCAAAACCAAGAGTTTAATCTTACCATAT
TGAGTTCCATACATTAGCCGTAGAACCGAAAGTTTGAACTGATAGAAAAG
AATAGAGTCCACATGTACTTTAATGACTACAAATTGAGATTTTGCTCTAG
ATTTCATAATAATACCAACACGTTTAGTCTAAACCTTATCTACTTCCTTT
GTTTCATATTAGTTCCCGCTGATTTATTACAAAGCTGTACTAAATCAGCG
ACAACTAATATGGATCAAAGTGAGTACAATTTTCCACATTTAGACATTAT
GGACCCACTCGGAAGGCTGATATGGCGCATTCACAAGTTTATCGGGATGC
CACATCACGTGAAAGGTGGCCCATCCCTCCCACATCGCGCATATTATTAT
GAGTTACTATGCGAAGCTGCCCCTAGAACCATCTTATTATTTTTGCGTGG
TAGTTGTTTGCAATTGGAAAAAAGAACTAATTCTACATATGCTTAAGACA
ATCTTATGCCTGCCCTACCCTAGATCTAGAACAATTATTAGCAAATGCTA
CTGTTAGGTTCTTGAAAGTTTCCTCTTGACTTTCAAAACACCTATAGAAG
GAACAATTTTACACTAGTGATTGACAACCCATTCTGGTACTCGAAGGTGT
ATGAAAAGAAGCTTTAGCAAGATTGCCATCCCAAACTCTAGCTTTCGTTA
TTTCAACACACAAGTTGGCTCTGGTTGAGGAAAAGAAGACCGCTCAATGG
AAATCAGAGGAAGGAGGACAAGCAACCCTCTTATCGTGTATTTCGGGATT
TGTTAATGATAAATTGATTTTTCCTATGAGCAACTATGGATATTGCATAC
ATGATGACTTGAGGAGGAATCACACACTCGATTTCAATCCTTAGATGATG
CGCAATCAACTTATGAGTGACCATGGTTTTTCTCTTCGGCGCTAATGCAC
ACTTTGTCAAGTTGAGCTCAAGTGATGTTAAGCTAACTATATCTTTTATA
AGTGCACATTCTTGTGTGTCATCAAACTTTATCAATCCGAGCTCAAGCTT
ACTCTAGCTTTGTTTGAAAGCTTGAGCCTAACAACAAGCTCAAAGGAAAA
CCTATCTCTCAAGCTTCTATGTTGAATTAACAAAGTGGATGCCCATGCCT
GTGTATCTATCTCTAAGTTGAGTAATCTTATACAACATCGCGAAAGGCTT
GAGCTATCTAAGGATGACATGGATCTTGCCTTGATTCCTTTCACATGTTG
GCATTAGGGCATGTTCACATATGTGACCAATTGTTAGTAAGAACTCTGGT
GAAGGAATTGGATATGCAAAAGCAGCAAATGGGTACACTGAGGAACATGC
TAGACCGACTCAACACTAACGAATCTACTCCGGGACTCTTCTCTTCATGG
TTGGCTATAGAAAGAAGTCTCTTTAGTCCCCAACTCTATGGATTTGGCTT
GTGGGCTCAATGCCCTGTTATCGACGTTTGCTCTGGACATGAGGCTTTGA
AATGGTTGAAAGTAGATCCAACATTAAAGAAAGTAATCCAGTAGCCTCAA
GTCTAATAGTAACTCAGTGGTAAGAGGGTGGTACCGAGAGAAAAGTTGCT
AGAAGGGAAAGACTAAACCCATTTGTTCAAGTAAAGGATATCTCCAAGTG
TAGAAGCACCGAAAGGAGGGGATGAAAAACTCTTGAGGGATTTGTATACA
AGTACAAGTAATCATTTGTATACAAGTTCAAGTAATCATTTGTTTCCTAG
TACTAGCCAAAGACAATTTTCAAGTGGTATGAGGGATTTCAAGCATTATG
TGTGGTTTGCAAATTGATTACATTGGCTGCCAGGAGTAATCTTGTCAATG
TAGTTGACTAGTAGAAGGAGCTATCTTAGTCATGAAGTATCTAGGGTATG
TAGGAGAACTCTAGAATTTGGAATGTTCTAGAGTAAGATATTTAGGAGTA
TGAAATATCTAGAGTTTGTAGAGTATTCTAGAAGTATGGTGTAAAATTCA
AAAAAAGAAGTATGGTGTAGGGTTTTGATTGTGCCACATGGCAACAATAA
GGGTCATGTATAAGTATAAATAGGGGTACCACCCCTCCCATGTAACCTAG
CTTGGTACACTTGAGATATCTAATAAAGCTTCCTACTAGTAGCGTCTGTG
TGTGAAGCACATCAAGACAAAGAGCTGTGAGTGTGAAGCTCATATCTTTA
GAAGGGGGAGATTCCTGGGTGGGAGATAGTAGCATAGATCCAACATTTGG
TACCAGAGCCAGGTTGTGTTAGGTAGAGTGAGACATCGAGAAGGCCGGTG
CTCAGAAAGAGCAACTGCTTTGGCACCCCTGCGAGAGGAGTGGTGAAAGT
GCACACTCAATGGTGTGATATTTTTGGAGTGTGCACATGCGGTGGTGTCA
TACCATTGTCGTAGAGGGTGTTGGTGTGAGGCCAACCACTATGGTGTGAT
TCCATTGTCATTGCAAAAGGTTGGCGTTAAGCCAATGCCGTTGGTGTGAT
GCCGTGTCAAGTGGAAGAGTCGTTTTGAAGTCGACGACTGTGGTGTGATG
CCACTGACACATGGAAGGTCGGTGTGAAACCGAATCAGTGGTGTGATGCC
ATCTTATATGGAGTCAGTGTGAGGCTAAGAAGGGTGTGATGTCGTTGCTC
GATGTGAGGCGGTGCGAGGCCGTCACAAGATGAAGTGCATGGTCCAGGTG
ATCTGGATTAGCGGATATAGTTGATATGACAATATTCATGGGGAGATTGT
TAGGAGTAATCTTGTCAATGTAGTTGGCTGGTAGAAGCAGCTAGCTTAGT
CATGAAGTATCTAGTGTATGTAGGAGAACTCTAGAATTCGGAATGTTCTA
GAGTAAGATATTTAGGAGTAGTATGAAATATCCAGAATTTATAGAGTATT
CTAGAAGTATGGTGTAGGTTTGGATTGTGCCACATGGAAACAATCTAAAG
GGTCATGTACAAGTATAAATAGGGGTACCACCCCTCCTATGTAACCAAGC
TTGGTACACTTGATATATCTAAGTAAGCTTCCTATTAGTGAAAGCCCTGT
TTAGTGTGTGTGTGAAGCACATCAAAAACGTTGACCCCCGGGAAATGATC
CCTCGCGGGATATACGTTGTTAGGTAGATGAGACCTCTCCAGCAGCGAAT
TATATGCGCTCGAATAAAACTCCGTTTAATTCAGTCCCCATGGGGACCTG
AACCCGGGTGGGCTGGCTGCGCACTCGCTAGCCTTGATGTGTGAAGCTCA
TATCTTTTGAAGAGGGAGATTCCTCGGTGAGAGCTAGTAGCATAGATCCA
ACATTGGCGCACTGTGACAAGAGGCACTTCAATTGTTCGGCTAAGTTGCA
CATGAACAAGTAGCAGTAAGCGACCTCCTACGATGTCTCCTAGTTTGGGC
GATGAAATATTTGATTTGCGCAAGTACACCATATTTAGTGCCCTTCAGTC
ATTTAGTTTTGGATATGCCATGAGTTAACATTAAGTTTCCATGGGAGCAC
ATCCACTATCTCCATGTACCTCACTCCAAGAGAAGAGATCTCATACCTAT
ACTCGAACGTGATCGCACTTGAGATGCGCCATCTTCTAGACCACTCATTG
TCTCATCGCTAATCCTTACTATGTTTATACTATCATTTGCAGTACCAAAG
TCGTTGAGAATGTCAAGAGACTCTAACAAGAAAAATGTATTTGGAGTTGA
TCCCTTGGAGCACTACAAACATATTATCTCCGAGTTGTTACTCGGGAAAG
AAGATAGTTTCTCTACAAGAGTTGCGAAACCAGTTGAAGGGGTTGTGGCC
CAAAATGTTGTTAAAGCTGGTCAAGAATCTCTTCCATTATTCACAGAAGA
AATTAGGGGCCTTTCCAATTGTGACATGGAGAGATTAAAGCATGTTCTTC
ATGACGTATTTACAATCCTCAATGACGATGTTGATGAGGTACAGTCTTAA
ATGACTCCTATTCATTATGTACCTATAAATTCTTAGCCTAGATACCATAT
TGGTTCAACAAGTTCACCCAAAATTAGATGTAATCTATCTTTATCCTACT
AGAATGGTATACAAAGAGATGGAGTTGGGAAAGGATAGAGTTTTCACACT
TTTGGTGTAGAGACCTTCCTTTTGGAACCTGTTTAGGGCATATTTGATTC
AAAGGATTTCCAAAGGAATTTTGTAGGATTCTTCTTACCCATAGGTTTTT
TCTTATAGAGGCCATTTGATTCAAAGGATTGAACCCTCCAAAATTCCTAT
GAATTGCTTTCCTATACTACAGTCCCAAAGGATTTCTAGTAAGAGGTCAG
ACCTCTTGGAAAATTTCCTATGTGTTTTTGCCACTATGACATGTACTCAA
ATCTCTATAGAAATTTCCTATGTTTTTCTTGTGGTGCAACCAAACGTCTT
CTGCAACTAATTCCTGCGTCTTTTCTTCCCGTAGGATTTCACGTGTTCCT
GCGTTTTCCTATTCTTGTGCTTTTAAAATCTTTTGAATCAAACATGCCCT
TACTAGGTTATAAGCTAAACTAAAGGAAGTGTTAAAAATATACTATTTTG
CCTAGATTATGAGGTTTCTTATCCATTTGATTCATTTAGGGTGAAAATGT
GATTGTTCTCATAAAGTTATTATCGTAAGATCTAACAAGAAATTAGGTTA
TGATACTCTTCCATGTGTCATCCTGTTACAAAACGACATGGGGAAATGGA
ATGTCAAGTGTTTCTCCCTCTTGGTGTATGCCTCCCTTGAGAGTCTCACA
CAACTTGCAATTAGCAAAGCACATCGTGTCCTTGGTAATTGCATTGTCAT
TTATGCGGAGGCTCTCGACCACTAGATGCTCTTGGTGCACGAAACAAACA
AACTCTTTTGAGTAGTGTTACATGCGATTGGTGGTTTTGGCATTATGGTG
CATTATAATACCCTTATCTTTCTAACCATTTTTTGCATAATTTATTTTTT
CTTACCACAACTTGCCTACTTTTGCACTTACTTTCACAACTTTTCAGATA
GTAAGTCCAGGATAACATAGTTCCATCAACCACAAACTGATCCTTAATTA
TATTAAAGAATTAATAAACTATTACCTCGCATTTTAGGGTCTCTTTGGCT
CAAACAAGATTTTGGAGGATTCCATTTGTTACGATTTTCCTATAGAATTC
GTTTGTTTTGTGGGATTTGAAAGTATTGGATTTTTTTCCTATGGTCCACT
TTGCATGCAATTTGAAATGGAAATTTCTGTTAAGTCCACTGATAGTGTTT
TTCATCTGTTTCAGTGACAACTATATCATACACCCAATCCGTCCAAAACA
CATAGGTTTTCTTTTGTGCAACCAATATACATCTGACATGCCATGACATC
GCGTTTTAGACATCCCACGAGCCAAAGAGGTCCTTAGCTTTTATATGGTG
AACAACCATACAAAAGGCTACTATCTGAATTAAGATAAGTATATAATATG
TATCCATGTTTGCAGCAAAAAAATAAGCATCCTATTTAACTTTCTCCACT
GCGGTGACACATGAAAAACACTTTGATAATATACTACACTTACCAAATGC
TCTCATCGTTTCAAAATAAGGCACACTGGACTTTCATATTCTCCAATGCA
TGTTTTGACTTTGATTTTCACTTATAATATACCTACAAAATTAGTAAAAG
GACATATTACAGACAAATACAACTGTATTATTCTTACATGCCCACTGCAT
ATAACAGTGGTCTGCATGTGTGTACTTATGTGCCTTATACTTGGAATTGA
GTAAGTACTTCATATGAGATGTGCCATTTTCATCTTACTTTTGTTTGACG
TGAATACATTAGGAATCATAATTGATTAAGGAAAGACTTGAACTTATCAT
CTATGCAGTAATTTTCCATAATTCCATGTCATTTGGCAACCTTGTAACTT
TACGAAGATGCTAAAGTTTACCGATAGAGCTATACTGCTATATAATAGTA
TTAAGTGTGTGCTGGATTAAAAAAAAGTGGGAACGTGTGCACCTAGAAAG
GTCAGTGATTTAGTATCTTGTCTCTGAACCCCTATGCCCCAAACCAGCTT
CTATAAGCTCTAATAGCTGTAGTAATTAAGCATGTACACCTGGTTGTATG
AGCTGTGAGGTGAGCAGTAACATGTCAACTCAAGACCAAGCTAGTCAAGA
CTCGAGGAATCTTGGAGATGCAGGCTCGTGCCTTCTTGCACTCCCTAGGA
AGGACTTGGTCTTTTTCTGTTAGTATGGATGTTGTGAACGCCTCTGTTGC
GTAGATTATAGGGATGGTTCACCGGCGGGCGAGAGCGTCGCCTGCGGTTT
GGTGCCGTGACCGGCGTGTTGAGAAGATAACAGGGGTAGATGAGAGAAAC
TAGAGAGGTAGGGATTAGCAATAGGAAGATTAGGGTTTATTACTGCTTGA
CCAAAAACACACGGGATACACATCCTCTTATAGGAGGACCAATGCCAGGA
GTCCTGATGCAAACCTACTAGGACTAGTAGTAGTATTCAACTAGGACTCT
CATATTACCGTATTCAATCCTGCTAGACTACTAGTAATTGACCTGAACTC
TAATTAACCTATACTACTAACGCCACAACACTACTCCCCCCATGCAGACA
CAGCTCGTCCTCGAGCTGTAATTCATGGTGGATCTTCCTCCTCGAAGTCA
TCAATCACTTCAAGGTAGAAAAGGCGCTGACAACGATGGCCTCTCGAGAA
TTTTTCGTCGCAGTTGAAGCACAATCCCTTTTCCCTTCTCTCTGCCATCT
CTGCGGCTGTCAATCTTCGGAGCGTCCGTTCTTCACCAACTGGAACAGTG
CGATTCAAGGACACACCTTGCTGCAGTCCGATGGCCGTGGATGACTTCTC
GTTAGAGGCTGCTGCTATGATAGCAGCCCGCTGTTCATATGAGCGTGCCA
GACTCATGGCGACTTGAAGGTCCAGTGGCTTTTGCATCTCAACATCCACT
CGGAGCAAGTCAATGAGACCTGACGTAAACAGTTGAACCTGCTGCTTTGT
CGACAGGGGGTCATTGTGAGAAAGCAGGGACAGAAATTTCTCCACGTATT
CTGTCACTGTGCCGGATTGCCGCATCCTTGCAATCTCGCCAAGAGGATTG
CTGCGGATTGGTGGCCCAAAGCGTAGGTTACAACATTCTTTAAACCTAGG
CCATGATGGCATACCCTCATCGCGCTCCAGATGCATATACCACTCTTGAG
CTACGCCCACCATATGATAGGCTGCCAGCCAAACTTTGAATGCTTCATCC
GTGCGTTGTCCCCAAAAAATTGCTCACAACGATTCAGCCAGGTAAGCGGG
TCTTCCTTGCCCTCAAACTTAGGAAAATCCAATTTATGGTAGCGGGGGGC
CCCTGTCATCTCTGTGATATTGGGGGTGGGAGGGGCGGGCCAGATATTTG
GAAATCTGGGTTGTTGCTGTTGTGGTTCGAACGACGGAAACCCTGTCGGA
TGCGGCTGTGGTGCATAGGGCCTTGTTGAGGTTGACGCCCCTACAGCAAA
CTGCGGCGCTATTGGCAGCTGTTGTGACAGCAAAGGAAGCTGCTGCGAGT
ATTGCGGCAGATTCGTCGAGGGTAGCCCCACCGAGGTGGTGAGTGTGTCT
GCAAGGTGCGCGGCTGTGAGAGTCGCTGAAACACCAGAGGAAGCGAGCGG
CTGGAGGTTTGCCGGTTTTATTACGAGGCCGTTGCCGATCGCCTTCTCCT
CCAGGGCTTTGATGCGTATGTCCAAGGCTGCAAAGCCGTCCTCCATCTTC
TTGAGGATAGCCTCCTGCATGGTAGCCATGGCTGTAGCCAAGTCGCCATC
AGTTGCTTTCTTGTCGCCATCGGAAGCCATGGTGGTCGGCTCTGATACCA
AGATGTTGTGAACGCCTCTGTTGCGTAGATTATAGGGATGGTTCACCGGC
GGGCGAGAGCGTCGCCTGCGGTTTGGTGCCGTGACCGGCGTGTTGAGAAG
ATAACAGGGGTAGATGAGAGAAACTAGAGAGGTAGGGATTAGCAATAGGA
AGATTAGGGTTTATTACTGCTTGACCAAAAACACACGGGATACACATCCT
CTTATAGGAGGACCAATGCCAGGAGTCCTGATGCAAACCTACTAGGACTA
GTAGTAGTATTCAACTAGGACTCTCATATTACCGTATTCAATCCTGCTAG
ACTACTAGTAATTGACCTGAACTCTAATTAACCTATACTACTAACGCCAC
AACAATGGAGCACATAATAAAACAGATGTACTAATCGTGAACAGCCCTGG
CTATGTTCCAGGCATGTAGAACCTAGTAGTTTGTTATTTTTGCTTCTCCA
ATTCTTAAGAGTGCTCAATCTAGCCGTCTACATAAGCTGCTGAAGTTACA
ATGCCATTGTCACTAATTTAAGACTCTTTGATATTGCTTAGGCATAACTG
CTAATATTAGTGATTTTTCTAATATCTAAATTTGACTGCAGATATTTGGT
TACATTTTAGCAATATCTGAATTTAGATCTGAGAAGTTGCTATCAAGCCA
TGCAAGTGGATCATGTGAAGACGAGATCACCCCACCGAGTGCTAAAAAAC
AGAAAACACTGACGGTTTCTACACCGGATGCTTGTGAAGAATTACATGGC
CATATTAGTTCAGATATCTTTGAACAGGTGAAGAAACTTTATTGTATACC
TAACCGCCATGCTTGATTTACTACTTTTCCCCTTGCATGTAACCCATTTT
GTTCAGCCAATCCAACAATAAATCTGCAAAAAGAATGGAAGATTGTTGAA
AATACCCTCATCCCATCTACCTTTTCAACAACCGGACGCCCTGCTATTGC
AAAGAATTGGAAAAACTTTGTTGCCTTTTTTTGTGAGGGAAACTGTTTTA
CTTTTATGGCACACACATGCAATTGCCAATCATAATTCTGACAAAAGAAC
GAACAATTTGGTGGCCTGTTTTATTTTGGCAGTCTTCCATGTCGTATCAT
GTGAGAATGATGTCAAGTTAGGCTATATGCCAAACCAACGGTTCCACTAT
AAGAACATTTTCTGAAATTGCCAAGGCATTGACTGTTAACGTTTTGCTTC
TGGCAGCTCACAAGAGATATCCGGTTGATAGAAGAAAGTGGCGAAACACG
TCAAGATGCTGTGAAAAAGTTTTCTAATGGATTGCTGCGGAAGGTATTTA
ACGTGGCATTAGGTTATGGAATCTCCTTCGACAAATAATATCATGAGTTC
TACTTCCAAGTATTCAAGTGAGACATTTTTTGCAGCTTAGTAATATGGCG
CAAGGCGTTGATGATTTACTGGACACAGTGGCATCCAAGTGCAGGTGGCG
TATGCCATTATCTCAATTGAGTGATATGCTGACCTATGTTGACTGTCAAG
ATTGTCTACATTCTAGCATATTCAGAAATTTATTGAATTGTTGCATATTA
GCAGATCTATGACCACTGCTGAGAAGATTGAACTCGGTAAGCGCATCCGC
AAGCTCCCAGAGAAGGCACTTGATCACATGGTGGAGGTAGTTAAAATGAG
GAAACCTGAAATCTCGGGTTCTGATAAAATATCATTCAACTTGGGAAGAC
TGGTATGCTCCTTATATACACTCCCACTAGTTAATTTACCATGCGAACTG
TTCATGTGGTTTGGGTTTGCTGTTATGCCAATCATGATGCTGCCGTTTTG
ATACTCCTATTAATCTACACAAGGCGACAGTCTGTCATGAAAAAATGGTG
CTATGCTGGATGCGTATTTCAAACAATGAGCACGTTTTGCATTAACTTTG
CATATACCTTTACTTATTCGCAAAAGCTTTACGTCTCACGTGTCTCCATT
TGATTAACTCTGTTACATCACTATATTTGGCTTGGTCTCACTTACTTTCA
TTTGGTTAGGATGATGCAACTTTGTGGAGACTATACTACTATGTAGAAAC
AGCGCTTGAAGCAAAACAAGATCTGGCCATCACCCCTCCTCAGGTGATCA
ATGGACGTCGTCCAGGTTTTACTACATGTAGTTTTTAGCAGAATTCAGTG
TAGGTGGTAGTGCTTGGAGAAACACATTAGCTTCAGTTTGTCGCCAATGT
AAACCTCTACGAGCACGTATGAGGGGATAGTCCTTACGTTGATAGATGTA
GAGGTATCTCCAGAAACAGCACCATGAATGGTGTCTAGAGCTAGAGGAGA
TAGTGCACTGACCACTAACTCGCTAGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.