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GrainGenes Sequence Report: AA031486

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Sequence
AA031486
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031486
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCAAACCGACGCAGACACCCGAACCCCTTACTCGGCACGCCTTCTTACC
GGAGTTTCGTCGAGGCCTAGGAGCGCGCTCACCCCCTGCCGACGATCATC
GATGGCGAAGGGCTCTCGGAAGCAGGCCGGCGGGAGCAGCGCCCCGCTGC
GGAGGAGCAGCCGGGCGGCGGTGACGTCACAGGTCGTGTCGTCCGCCATT
GAGGAGCTTTCAGCGGCGACGACGTCCTTCCGCACTCTCGTCTACCGGAT
CGGATCGCCCAGGGATACGCCCGATCTGCGCGCCAAAATGTGTGTACCTA
TTTTTTGCCCTACCTCCCCTCCCCCCCCCTGATTCGTGTGCCTAGATGAG
TTTTGCGATCCCTGGATGCTGCAAGGTAGGATGCGTGCGTCGAATTGCTG
AAAATCTGCGATCCCGCTCTGTGGGTATTTCTGACGCGTATGGGAAATAT
TGCGATTCTGGGATAGGTACGGATGCGCGCGTGCAGTTGTCAGAAAATTT
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TGGGGCACTAATTCTGCGCTAGATTATGGTGTCAGTTATGTTACTGCTTG
TTTGGTTAATGGGAATCAGGACAACTCAGCTTATATAATCGAAGTTCGAT
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GCTAGTGTATGTTACTATACTTTTGGATTCTGCTTATAACTGAACGTATT
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GACAGTATGTGCAACTTCACTCTTACTCAAAACCACTGAGTCATGATACT
TTCTAGAATGGTGGTATACCCTGTAGTTTCAACCAACTCTTCAAATCATG
AACATAAGATCAATTGTGGCACTCAGGTTTTATATATATGGTGATAATGT
TTGCCCATGTTCATGTTTCAGTGGACCTATTATTTGGATTATTTTCATTC
CTTTGTGTGCTACTAGTCTATTTTCTTCACAATAGTGTGTGACCATGCAT
TAAACTACAGCCTGCTAGGGAGGTTTCTGATGGCGAACTCGCAAAATTTT
TTGGGGAAGTCATTGGAGAGTTTCAGGAAGTAAAATTACAGTTAAAAAGG
GAAGCTCCAGTTTTCTCCTTTATTACTCAAGCGGATAAAGCAGGTGTGCC
AGAAAGGTAAGATTCAACTGAACTGTTCTGCCACTTTGCTATAGACATCA
TTTTATTTTCACCCTTCTCTATTTCCAAATGAGTAATCTTCTGTAGTTCT
TGACAAGTTACATACTATCATATAGTACTATTTTCTTGGTAGTGCGCTTA
CTGCTGAATAGTCAGTTTGCATAGCATATTTTGTTGTATATGTATCTCTT
GGGAAACAAAAAACCCCAATAAATGATGATGTCATCAACTACAATTGATG
CACCTGCAAGACTTTATCATTTTATTTTCAGATTTTAACATACTGTGAAA
TGACATTACACTCACTCTGTTCTTTTGATCCTTGCATATCTCTATGGTAT
GTTTTTTGTTCACAATGGTCTTTATTGAAAAATGGTGCAAAGATAGGACT
ATTTGAGACCAATGTAACCTTGGTATGAACTGAATACCCAGATTTTATTG
TTGTTTGTGCACTTTTATCAGGTCAACATTCACTAAATCTTATTTGCATA
TTTTTTCTGTTGATGTGTTGATCTACTCTAGCATAGAAGCTCCTTTGCGT
TTTGCACTGTATTTATTCTGACCTACTGTTGCACAAAAGTTAATTTTGCA
CTTACCATTCCATATCAGGTCTCTTTCTGGCCTGGCTCATGCGTCAATGG
GGCATCAACTTCGAGCCCAGCCACCACCATCCCTTGCTAGTACAAGCTAC
AGAGCTGACCCCCCTGTGAGTCGCTCAGTGCGGTCCTCCTCGACTTCCTT
GAGCTCGACCCACCACCATTCTGGTGCACCTAAGGTAATTTCGATTAAAT
GTGGTCTCCTAATTTTTTATGTTTAACTTGTCTGTTATTTTGGTTGTGCT
TTTCATTTTTTTTGAGTGAATGCTGCATGGAAGGTCTATTTCCTTAGCTC
TGAAAATGATGTTCTTCTATTTTATTTTTCTGTATTTCTAGTTGTCCGCA
AAAGGAGTTGATGCATCGATCATGATACAAGATTTGAAAGCAATGATGAA
AAACAAACATAATATCCGTAATGTCTGCATGATAGCAGATTTAGACGAAG
GTATCTTCTTCTTTTTTTGACCGGTTTCTGCAATGATGTGCTTGTGGTTT
GATTCTTACAATAATCATGCCCGAGTTTCAGGGAAGTCCATGGTTGCGGA
TATGTTGATAGCAGATGCTGGTACTGAATGTCTGCTTGATTATGATGAGT
TGGAGCTTGGAGTTACAACGGAATCCACGGTTATTTCTCTTTTCCATGAG
CTAAGTTCTTCTGCATTACCGGGCATTGATGGCTGTTTTCTTATAAACTT
GTTCGAGTCGAACTTCCAATGCGACTCTGAACCTGTTCGTATGAGCGATG
GCGCACTCTTGGTCATTGATTGCACTGGTGATGTCTCAAGAAGAACAGAA
AATGTTCTCGGACAAGCTCTCTATGAGGGGCTGATCCCAGTTCTTGTACT
TGATAAGGTTGACCAAGTTTTTAGTGTTGCTAAAGATGGTGAGATAGCTT
ATGAAGTGATCTCTGTCTTTATAAGTGGCATTAATAATATTTTGGCCGAG
ATGTCTGGTGAATCCCATTTCAACCCAGCAAGAGGGACTGTTGCTTTCTC
CGCTGCCTCGCAAAGGTGGGCATTTACATTAGCAGACTTCGCTGAGCAGC
AGGCTTCTGAGTATGGATTTCATAAGGAGAGTATGATGGAGCTTCTTTGG
GGAGATAATTTCTATGATACAAACACAAGAAAGTGGACAACAAAGAGGAC
TAGCTCTCCAACCTGTAAGAGAGGGTTTGTTCATTTCTGCTATGACCCCA
TCATGCAAAATTTGAAGCACCGCAGCGGTCTGAAGAAAATGCAGAACTGG
TTACCAGGTAGCCCTTGCCTACTTACCATGATGATCTCTCATCTCCCATC
TCCAGCAAAATCTCAGAATGATCGCTTGGAGAACCTCTATGAGGGACCAC
AGGAGGACCGTTTTGCATCTTCTATCAGAAACTGTGATCCCACTGGTCCT
GTTCTTGTATACATACCGAAGATGATTCAAGCATCCGCCAAGAGACAATC
CTTTGCTTTTGGCCGTGTCTTTTCAGGCACAGTGCAAAATGGTATGAAGG
TCCGTGTAATGGGTCCAAACTATCCCACTCGGAGGAATGATCTCTTTGAG
TCTAAAGTTACTGAAGTAAGTACGGTGATCGGAAAGAAGATACTGTCCTG
TGAGGGTGTTCCTTGTGGGAACACTGTAGCTGTCAGGTTTGATTATAATC
TTGATGCCACAAATGCAACTATCACAGATGAAGGTGCAGCTGATGCTTAT
CCAGTAGGTGCACTGAGGAATGGATACTACCGATTGATGCCGCAAGGCAC
AATCGACTCATTCTTTGAAATTCCCAGCAGTGTTTCCCGAGAGCTAGCCC
ATCATCAGGATATTGCATTAAGATGGTTATGGAATCTTTACTGCAAAGGG
AAGGGTGGCATCCTTGGGGATGACATGGGGATGGGAAAGACTAGACAGGT
AAAGATGCATTGTAAACTTGGGCTACTTAACATGTTATATTTTACAAATA
TTTACAGAACTGTTTTGCAGGTTGCCACCTTTTTGCTAGGTCTATTTCAT
AGCCAAGTTGTCACATCAGTGATAGTGGTTGTTCCCCTGACTATTCTGAA
GCAATGGGTAGAAGAACTGGATCATATGGGGCTCGCAAAAAGATTAAAAA
TGTGAGTTCATCGTTAGTGAACCCAGCATAATGATTATTTTTTCTTATAT
TACTTTTCCATTTGATGCAGATTTTCAGATTCTAACGTGAAATCTCAGAG
TAAGCAACTGAAAGATGCTGTTAAGGTTAACTTCTAATTTCAGTACAAGA
AAATTTGTTAAGAGAAAATAATTTTTGCATAGGCTATAATGATTCATTTC
ATCTTTATACAGCATGGCGGTATACTTCTGACGACTTATGGTCTATTCAC
AAACCATAAGACCAGCATAATGGGTAAAGAAAATGAGAATTGCTGGGATT
ACATAATTCTTGATGAGGGGCATAAGATAAAGAATATGGAGGCTAAAGTT
TCAATTGCTCTAAATAATGTCAAGTGCACCAAGAGGATCGTGATGACTGG
TACACCTTACCAGAATAACATGAAGGTAAATACCTGATAAGCTTTCCTTG
TTCCTCCACCTCTAATGGTAACTAGCTGAGTTTTCCCCCCTTATTTGATT
GTAGGAATTCTATGCTCTCATGAACTTTGCATGCCCAAGTCTATTAGGGG
ATGAAGATTATTTTGTTCAGCAGTTTGATAATCCGATTGATAAAGGGAAA
CATAAGGATGCACAGACTGATTTGATAGGACAAGCCATCAGAGCTTTTAA
GGTAACAGTTTAAGATGTATTCTTTAAGACATTGATTCACCGATAGTAAG
CTCGATCTAAGAACTTCTATTCTTCTCATCTACGAAATTTAATTATGTTC
TTCTTTGTACAGAAGCTGGAAGAACATATCGGTCCTCACATGTTACGGCG
GACAAAAGAGGTATTGCTGAAACAGGGAATACTGAAAAAGAAGCAAGAGC
TTGCTGTGTGGCTGAAACTGGCGCCACATCAGGTTTACATCTTTTTCGTT
TCACCCACAATCCTGGATTCTCTTTTTTTTTATTTATTTTCTTTTTTTCT
ACGCAGGCTGCACTATACAGGAGGCTGATAAACGTACCACGTGTCAACAC
TCTAGGAGCCTTCCCTGAGTGTCAGGTTAGTTCCTTTTCCCAGTCAAGTT
CTCTGTAGTTTCTGCTCACATGGTTTATTCTTTTTCTTATCACAAAAACA
GGTCGCAGAAAATATTTGTAACCATCCTAGAATCTTAACAATGGGCAGTG
ACAACGACCGTCCAGTCAATCAGTATTCTAACCACATTCTAAAGTCAGAC
CCCAATGATGATGATCTGGTTGAGTCCTCCTGTAAAGTGTCATTCACACT
ATATCTAGTGGTCAGTCCTTATATGTTTATTGTCTTAGTATTCATCCATA
TATTCGAAGAACTGACATAAATTTGTTCTAATATTGCAGAAAAGGTTACT
GACAGAAGGGCACAAGATTTTAATATTTTCACAGTCGATTCCCATGCTCA
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TTTCCTTACGTTTTACCTCAAATTCACACAAAGTGGCTAGGATGCCACTT
TTGGAATTTTGTGAGGACTGCTTCTCACGCTAATCTTGATCTTCTGACTT
TGTAAAAGCAGATGGCTTTAGGAAGTGTTGTAGATGAAGAAAGAATACTG
TATATGGATGGTGATACCCCAGCAAAGAAAAGAGAGAGATTAGTGGAGGT
ACTGTTTCTTCAGTTCAGTTTATTTCATTGCATAAATAAAAAATAGCACA
TCCGATCACAAGTGAGCAGCGTAAGGCACTCTACCACTTTAGCACTCTAC
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CAACAGAGCGTCTCAACCATAGTGTAATATAATGTTCTGAAATGTAGGAC
TTTAAGGAATTGGAAAAATCTTCAGGAGATGAGAAGGACTTGAAGAATTC
CGATGATAAAAAAGAACCATTAATATTCGTCATGAGCACACTAGTTGGTG
GCCTGGGATTGAATCTTGTTTCTGCCTCCCGTGTAATTTTAGTTGATCCA
TCGAAAAATCCAAGGTAACTAACATTCCTTTCCTAGTACAGATTAGTTCT
TGGTAGGCTTTGTTAAGTTGTATTTGTTTAATTTTATTTGCAGTACGGAT
GATCAAACAGTAGATCGTGTCTACCGAATGGGGCAGGAAAAGGTCGCTGT
GGTTTACAGACTTATCACTTGTGAGACAGTTGAAGAGCACATATACAGGA
TGCAGGTAAGCCATATCTATTATTCCGGAAGATCTTAGCGATGGGATATA
AGTTATTACTTGGAGGCTACAAAGAAAGAAGTGTGGCCTTCCTAGAATAA
AACAAGGGAATCAGCAAATTTGAATTTTGACAAGATGGTAATATTTACTC
TTTCCAGGTGTTGAAAGGTGAGACAGGGCGTTCCTTAACTGAACGAAAAC
AAACCCGCCGGGCAGTTCCCAGAAGGGTATGTCTTGACTGTACAAGAATA
TAACTGCAGGAATACTTCATGTAAAGTACTTAAGTTTTTTATCCATTTTT
ACAGAACCGCAGAGTCCTGGCGCTTCCAGAAAACAATTTCTCTGTTTCAG
ACACTCACAATGAACTTGGTGATGAGTATAAAAATATCTTTGATGAGTGA
GGCCATTTAATACTTACCTGTTATATTCGTTTACCCTTTTGAGAGTTACT
TATTACATATGCTATGTTCTTCTAAATTACTCTAGTGATATGATTGAAGA
AGTGAGGCTGGTCCGAGAACACGATCTAGTCATGTCTGTTACAAATCACA
GTGATTTGTTCACACTGGACGAGAAGTTTCATCATTTTCCCCTGTATGAT
GATGATGAGATTGATGAGAAGTATGTTTTGTCTGACTAACTGATTTTATT
CTAATCAATGTACAATTGCTGTATGTAACCTATTCTTTCTTTTTATTTTC
AGGATGGATGTTCAAAAGGTTTCCTCGGGGCCTTGCAGAAGGAGAAACAT
TGTTATAGGAGGGTAATGAACATACACTCTTTCTCATCAAACTTGACCCC
CGGTCAATAAGATTGTGCCGCATCAGAACTTTGTTGCCAAAAAATAAAAA
GTATACACATATTACGTGAGACACCTTGCTGGAATCCCAAATATGTCTGG
TTCTACCGCTTATTATTTTTGTCAACTTATTTTCTGTGTAGCTTGTCTTG
CTATGTGTCAATGCACATCTTAGTTTAGCATAATTGTTTTAGTTTGGTTA
AAAAGACAAGTGTTTTGCAGGTCCAAAGATGCTATCCACCCCTGCAAGCC
TGCTTCGGAAAATGTAGTGCAACCCACTCGTTGGAATCAACGGGGTAATG
ATCATTCTAAATATGGATTACACTGAGGTAATTAAGCTCAGCTTGATGTT
TGATGTGAATTAGTGATGTTTTTTTACAATTTTATAAATTCTCTTTTACA
ACGTTAAAATTTCTGTGAACAGTCATAAGAATGGAAAAGAATGCATGGAT
CCTTTCATAACATTTGACTGCATCCTATGGCGTTGTACACTGAAATTGGT
GTTCGCATCTTGCAGAGCGCCTTCTACCCTGTCTCTGCACAACTGAAGGA
GTTGAATGTGAAGCTTTTAGGACTCTGTAACGAAGTATGTTTTTTTTTCT
TTACTCTTTCTATACACGTGTTCATGCAAAACTGTCATGGTATAGTAGGG
ACTGAACCTACATAAACTGATAGAAATGCGTGATTTTGGGGCCAGCTCCT
TAGGTTAGGGCCACGTCAAAATGATCCGTAACTCAGCACTCCGAACACAC
CTTGTTTCGTACTCCTTGTTTCTCTCAGGCTGGGTGTCATGTGATGAATG
AGCTTGTTCACCTTGTTTGCTGTACACGAAACGTAACTTTGGAGTGACTC
TTTCAAGTGCCGAAGCCAATTTTATCAGCATAATCTCACCCACACACACG
TACTCCGGTATAAAAATCCAATTCCGACTTCTTATACTGCTGTGAAAAAT
AAAGGTTCTTTCTTGGCTCCCACCCTTAAAAACACACTATCTTTAATTTC
TTTGCCATGTACACGGCATTGTGTAGGTAATGGGGTATCTTTAATTTCTT
CGCCATGTACACACTATCATCTCTCCGTCGATGATTACTTGATTAGCACT
TATGGGGACACCGAGTAGGAATATGACCGTTAGCCAGGTGAGCTCCCGCG
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CCCGTCCGACCTTGCGCGCGTTGTTGCGTCATTTTTTGCTGTTATCGTTT
TCTACTGACGTGTGTGTGCACTGGGCTTCATCTGGGGTCTTCGCTGAGTG
CTACTATCGGGGCTTTTCTTTTCATGAATCATGCAGAGTTGCTGACTCAT
ATGAAGCATCAATCCGGAACTGATTCTTTATGTTTTTGGTTAGTCAATCA
CCATGTGCTTTGCATAATTCTATAGCCCGGCTCATTTCCTACCAAGACAT
CTTCAATCATTGTCATTTCTAGAACTTTTTAATCAACATCGAAAAGGATC
AAAACTGGAACTCTTACCTTCTCTATTTCTTATTTTCTTTCACCTTTCGC
CTATCCTCGTCGAAAGCAGTCAGCATCAACTTGCAACGACGTGAACCTGA
ACACAACATCTAGCCCTGTGGTCAGATGAGCATCTGCATAAATGATGCCA
AATCTCTTGAGTTTTTGTCACTCAGTCCATTGACTATCATATCCCAGAGA
ATACTGAATCTGTTTCCACAGTCCAGAACCAGCATAGTGAATTAATGTCC
ATCATCACGTATTCCATTTATACTGTTCAAGTGACACGTATTGGCCAAAC
TGAACTTCTGCAACTAAAGACTCTAACTAAGGTGCAATGACCATGTTGCT
ACACTGTGCACTAATTTTGTGAATAACTTAGCCTGAACAAATTTAACCAA
ACCACTCGAACAAATTCATGTGCTTACCTACATGAAACTATAATCTCAGA
AGATAAACAAAAGATGGATGGCAAGTAATAGCACACACATACCTTTCACT
TAACTTACACTCACAACACGACATGGCTATGAACACAGGCAATTCACATG
ATGTGACGACATGAAGGCCATGTTATGCGTCTTTTTCAGGACAGCATATA
AATCAGTGTATTACATCTAAAAAGACCAAGAAAATTTTATTTGATGAAAA
ACTGGAGCAAATTCTTGCTTGTATGACTTTGTGTATGTTATAATTTGTCT
GCACAATCAAACATAGTACAGAGTGAATACACTTGTATGTATAGTGTATC
TCACATGCAGACTAAAAATCTGAACCAGGACTCGAAAAATTAATGTTGCC
TGCCTCACTATGCACACTAATATACCGAAGAAAAAAAATGTACTGAAAGG
GACAACTATGTGATACGAGCTACACATGGTTGAACTCAAAGAGATGGAAT
TTGCTCGCTCGCGGTACCTGCTCCTCTCACTTCATCGGACATATCTGGTT
TAGACTTGTCCATGTACGTTGCAACTTCTTCATATATATAAGAGGGCTGT
TAAGACAAAAGAGATCCTCTTAGCACCGTCTCTCTTTGCCCCACAGTTTG
ATTCAGAAGTATCGTAAATGGGGTTTGCATGTAGGTATTAACTAAAATAT
GTTAATTGGTCATTTTCATACATGAACAGTATACATAATTTAGCAAGACA
TGAAATCCATCATCTATAAACAAATAATAACCAAAAGCTAAAGATTGACT
AATTCTAGATCCTACCTTCTTAAATCCTAATGGTAAATAATCACATCTAA
CCGACGTCTGTAGTAAAAAAATAAACGCCTACAGCCGACCTGCATAAAAT
GAGATATGACAGGAAAACAATCAAAGAGGTAGAGAGTATAAATTTGAGTC
ACATCTACACACCCCGCTCGGTCAAGACAGGAACAACAACAGTATGAGGC
TTCGACGTAGGAAACAAAATCTCACTCTCAAGAAAGTAATGAACCGAAAA
GATACCAACCATCTTTTAATTAAAGAAGTAACGACCATCTTAATAATTGG
TTGGTAAACACGATCCAAGGTACATTGCTGTTAAGAAAATAATGTAACTT
AAGCTAACCCAATAATCAATCTATTTATCGAGAATAATCAGGAAAATGAT
AAAAGAAGTCAACTGCATATAGGAGAATCCATGATACTAACTAAAATATT
ATAAACTGGCAACCATTACTTAAAGCAGATATATTGTATTGCATTCTATA
TAGCACTATAGCAGATTTACTATCATGCATGATCTCAAGTTGATGCACTA
ACTGCTGTTAGAAAAATTAGGCAATAAATCCTGAGTGCCCTAGAAGAAGC
TAGGTCCGTCTTGTTACAACATGTCTATATAAACCAATAGAATTCAAATG
TGGGGAAGCACGAGAACATCTGATGTCGGACCAGCACCATCAAATAAGTA
CCACTACCACATGATGTTTCACTTTAAAGCGAATGCAATCTTGAAATATT
AGTGGTACATGTTATAATATGCACTATAGTCATGCTAAGAGTTTCAGTTT
AAAAACTGCATCCTCAAACCTAAACTTTTTATTACAAATGTTACATGATA
GAAATAGTAAACAAATGGGAAAATGATGTAAGCCTAAAAGCTAGATGAGA
ATTTTCATGTAATCAACAACTCAATTGAGAGAAGTGATGAACCAGGATGT
CTTCAACACTATACAGTAGAAAAATAAATCAAACCTGTGTTGCCACTGAA
CGACAGTAAAAAAACCAAACCTACAATTGCACAAGAACCAAACCTCTATA
GGAGGAACAACAACTGGATTTACATGGGGAAGCAACAGTTGCTGGCAATA
TCAATGCTTTATTTTGTGCAATCTTTCTCATCAGCCATTTGTTCGAACAA
TTTGTGTGCAAACCCGAAACCTGTAATATGAAAGCTAAAACAGAGATGCA
ATGAGAACAAAACACTCATGCAGTTGCATATTCGGCAGTGATTCTGCAGT
GGAACCAAACTGGGGATAAACATGAGGAGACGGCGGCGGCGACGGCTATC
ACCCTCCCCAATTATTCAAACATTAGGGGAAGAGCAGACCAGAAACAACA
GAATTACCATGATCTGGAGCAGGTAGTGGAGCCGAGCGGCATGGGCATGC
TGTCCTGGATGGCGACCACCAGCAGCGACTCGAGCTTGCAGTCGAGTGGC
GACATTAGCTTAGTCTCCTCCAAGATGCGTGTGTACTACTTTGATCTGTC
TATACTTGAAAGTTGGAGGTCATATAAATCAGAGAAAATTCAGAATTCTA
AC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.