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GrainGenes Sequence Report: AA005318

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Sequence
AA005318
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005318
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AATTAAAAGATTAGTTTGTATCTGATGTTGCAAGCACTTATGCTACTTCA
TAGCTGATTGCCTGAATGCTTCTGCTTCGGAATCACTAAGACAGTTTTTC
ACTCTCTTAAACAATGTAGAGCTACGTGATGGATATGGCTAAAGCAGTAA
CGTTCCCTCTGCCACTTCTATCTGTTGCCTATCAACAGTTAATACATGGT
ATGCTGTTAAAGCTTCCGTATATCAACACATTTGCAATTCTCCAGATAGC
CTGAACAGGCAGCCGAAGCTTAAATTTGTTTATGCTTTTTCATTAACGCA
TGGTTTTTGTACTTATCTTCAGGTTCGTCAGCAGTAATTGGAGGTGAATC
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AAGCAGTAAAGAGGGTTGGCTTTATTGGTCTTGGAGCTATGGGCTTTGGA
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AGGAACTACTACTTATTACTCCCTACTTCATAATTTTCCATTTGAATTTC
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TTTAGGTGGATTGACTAAAGATTCTCCTGAGCAAGTATCAAAAGGTACAT
TAGAACCTTGTAGTGTGAACTTCGCAAAAAAAAGAACCTTGTAGTGTGAA
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TTCTCGTGTATTTTGTTCCTCAAAACTGGCATATTTTCTCATTTTAGTGA
GTCAGACTGTCAATTACATGTGGGCCTGGCCTCACCTTGTCATGACACCA
TGCCAACAGAAATACCATGCACTATGTATCGATGATGATAACACCTCTGA
AGTATTAACCAGAAATTTGTTTCAGATGTGGAAATACTTATTATCATGGT
TGCAAATGAAGTTCAAGCTGAAAGTGTTCTGTATGGAAATGCTGGTGCTG
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CATGGTTGTTGGTATCCTTGCCTTTCAGCGTTGTCTGCGGGAACATCCAT
TATTCTGTCTTCTACAGTTTCTCCTGGATTTGTGACTCAACTTAAGAAAA
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CCAACTCACGGAAATCCAAATCTGTTGTCTGTGATTCCGGATGAGAGTTC
AGTCTGTTTCTTCTATCTAAAGTATTAGAAATTAGAAATAAATGTTCATT
TGCTTTGCTCGACTTAAAACAACAGATTCACTTATAATCATTTGCAGAAG
TGACAATTACTGCAAGTGACAACCTGTATGTATTTAGTGTTTGGAGTCTA
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TTGTTTCGGCTATTTTCAAACATAATTTGAAATTTTGTTGTCTCCATATC
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TTTTTGACATGTCGGCAATGTTGTTTACTGTTTTTTTTTTTTGATGATTT
TATTTGGAAACTACTTCTGTACAGCCGAATGTCGAGAGATAAAGTTGGTT
GATGCTCCAGTATCTGGTGGTGTCAAGAGGGCAGCAGATGGGACACTAAC
TGTATGATTAGCAACACATCAGTTTAATAGGAAAGTGAAGATGTAACATT
AATTGATAGATTTGCACTTCTTTTGAAGGTAATGGCTTCGGGAACTGATG
AAGCTCTTCATTGTACCGGTAGAGTTTTGTCAGGTAAAAAAAAGGTTCTC
TGAAGACCATCCTATGCTTTATAGAAAATATGGACACTGGTCCATGAGTG
TGATCTTTTTTTTTAATGACAGCACTAAGTGAGAAGCTATATGTCATTAA
AGGAGGATGTGGAGCTTCGAGGTGATACACACATTTTCTAATCATGTGAC
TTTCCTATATAGATTTACTATTTTTTGTTACTGCTGGGCGGTTTTTTACA
TATATATTAAAGGTAGCTGAATACTTTTGTGTGTGCGTGAATCAACATCT
CTTCTTCTATTGTTCCCAGTTCTGTTAAAATGGTTAACCAACTTCTTGCT
GGGGTCCATATAGCCTCAGCAGCTGAAGCAATGGCATTTGGTGCTCGATT
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ACTCGTGGTATGTTTCCATTGTTTAACCCCCTCGCTCTAATCACTCTTGT
TTCTTGACTCTTCAGTGTTTATACTTCTGAATGTATGTTTCCCGAGTAAT
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TAACTAACTATCAGCTCCCTTTAGGTCAAGCTTTCAGATATCCAGTGGTA
TGTTTTAGAATGAGTGAAGGTTGCTATCTGATAATAGATACATTTAACGT
ATTGCAGGATGTTTGGAAATCGTGTGCCACACATGCTTGATAATGATTAC
ACACCTTATTCTGCAGTGGACATATTCGTCAAGGATCTTGTATGGATAAC
TGATATATGACTTATGCATTATATGAACTACTAATAAAATATCATAATGT
ATGTGTGTCTTGTCTATTTCAGGGTATAGTATCTCGTGAAAGCTCCAACT
TGCGGATCCCATTGCATGTCTCTAGTGTTGCTCATCAACTGTTTGTTTCA
GGTAATTATCTGTAATAAAAGCAAGGAGCAATCATTCTATGCTTTTGTTC
CAAATGTTTTTTAACTGAATTTTGTTCTAAATGTTCAACAAGTTATGCCA
TATTTCTTATTCTACAATGAGAATGACTGAAATTAACGGCACGTTGCATG
GCATTTCACCCCTTTTCTGTAATACTACTATATTGACAGGTCATTTTTTA
TAAGTCTTAAAACAGGATAGCTATTGTTTTATTCGTTTGATGTATTCCCA
ACAGGTTCTTCTTCTGGGTGGGGTCGACGTGATGATGCTGCTGTTGTCAA
GGTGAGAAGCTACCCTATGTTTCAGTAGCCTGCACCTCTCAGTAGACAAA
AGTTGAGATAAAATATGATAAATTCATAACCGTAATGTTATATCTCTTCT
CTAAACTTGCGTGGCGCTTGCATCTAGCACAGGTCTATGAGACATTGACT
GGAGTAAAAGTAGAAGGAATGCCACCCGTGTTAAATAAAGACGATGTCCT
GCGTTCTCTTCCTGCTGAGTGGCCTGAAGTTCCAATGGATGATCTTGTTT
CCTCTGCATCTCATGATAACAAAAAGGTTCTTGTAGTTTTAGATGATGAT
CCAACTGGAACTCAAACAGTTCATGATATAGAGGTCTTAACTGAATGGTA
AACTAAAGCATATTTTTCATCTTAGCTTGCATATGTTTCTGCTAGCATTT
TCATTTACCCCATTATCTATTTATTTTTATGTTTACCCATGTTCTTTGTG
TAAATTCATAAGCCTCGCTTGTAACTCTAAACTGCAGGCCTGTTGAAGCC
CTCACAGAGCAGTTTCTGAAACTGCCAACATGCTTTTTTATTTTGACAAA
CTCTCGTTCAATGGTTGCTGATAAGGTAGGAAAATGTAGTCTAAAACAAT
TCATTTTTATGCTCTCGCAAAAACAATTTTAGCTTCGGTGTCGTTAAATA
TATGTTCAAGCCTGTTCACTTCTGTAGGCCGCACTGTTAGTAAAAGATAT
CTGCAAAAATCTTGAAGCTGCAGCAAAGACTGTCCCTGGTATTAGTTATA
CAGTGGTCTTGAGAGGCGATTCCACTCTACGTGGCCATTTCCCGGAGGTT
AATATATGAAGCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTGTTTCCATTTCATTCTTCT
GACCATACACCACATCCTTCCACTTTTCAGGAAGCTGATGCAGTTGTTTC
AGTATTAGGTGACATGGATGCTTGGATAATCTGCCCATTCTTCCTTCAAG
GTGGGCGGTACACTATTGATGACATTCATTATGTTGCAGAGTCTGACAGG
TAATCTACCGCAGGATCACTATGCAATGTATTTAAATAAAAAATAACACA
TAACACTATTGATGTCCAACAATATCTTACAGATTGGTTCCTGCTGGAGA
GACTGAGTTCGCCAAGGATGCATCTTTTGGCTATACATCTTCCAATCTCA
AACAGGTATTGTTGTAGAATTGTTTGCCTGATAAAGTGAAGAGCAAGATC
TTAGAATTTTCTTTTACTTTATAGTGGGTTGAAGAAAAAACTAGAGGAAG
GATTTCGGCGAACCAAGTTTCAACAATTTCCATAAGTCTTTTGCGGAAAG
AAGGACCAAATGCAGTCTGCCAGCATCTCTGTAGGTTGGAGAAGGTATTT
GATAATCAACATGTAGCGTATGAACAGTTATTTTAAAGTCTCTGCGAACT
TTTTTGGAGGATACAATTATCCTAAATTCTTGATTTTATGGATCTTTCAC
TTTCTCATTTACGTATGCAGTCATGGCAGTATACACGCTAAAATTAAATA
TTAGATAGTAAAATACTACAGGCATTTTAGGAACTTGAGAACCGTATTGA
CCATCACTCGACCATATACTTTCATAAACCCCTTCTCCTTTTTGTTCTGA
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TCTTTTTAGGGCTCTGTTTGTATTGTCAATGCTGCCAGTGAGAGGGACAT
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TACAAGAAGCATTTGTTGATAGTGTGATAATATGTCTTATTCGTAGGATT
TTTTATATTCTATTCTTCTTCTCTTTGTATATTAACTCATCAGGCTGAAT
TGCAAGGAAAGCGATTCCTCTGCCGCACGGCTGCAAGTTTTGTGAGTGCT
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AGACTACGAAGCAGGTTAGCCCTATAACGCTTTAAGATTCTTATTCATAT
TTATCTCATTTGCATGTTCCTTCACATTTGTTAGGTTGATGAGCTTCGGT
CACAATGCGCGCAATCCCTTCGAGTGATAGAGGTAATTTATATCTTCGCC
GGCGTGCCTAAACATGAACTGTTAATCATTATATACATCTACTTGGATAA
GATGTAAAAAGTTCCAGTACTATTTCAAGTTAGATTTATTTGTCTGAGAT
CATTTTGAGTTGCTAGTATCATGTTCTCTTTTTTACTAACTGCAGGTGTC
AGTTGAGATGGTCTCACTGAGATCAACTGAGGACAGAGACCAAGAAATCA
GCAGAGTTGTTGAATTGGGAAATGCTTACATACGATCCAGGAGAGACACT
CTAGTCGTCACCAGCCGCCAACTCATTACAGGAAAAAGTTAGCATCTCTC
TGATTATAATATGGACAATTGTATTGTTTCTTCCATTAGCAATACAGTCT
AAAAAGCTGAGTCAATTTTGATTTCTAGCTTCTTAATGCCATTAATTCCT
CGAGTCACATCTCACCCGATAAATTTAATGAGAAAGTTGTGCTGGTAAAT
GACTGTTCACAAGCGCAGGGTGTGGAGATCCCAAGGGAAGCACACAATTA
TCCCCAAAAATCTACGTTGTACCAGAGGCTCAGAGCTTAATGCTAATTCC
TGAACTCAATTCAGATCCAATCTGTCGCCACCGGTCAACCACCACCATCA
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GCCTAGCTTGGGGGATACTTTATTTTCTTTTGTCAAAATCCAGGCACGCA
CTGAGACTAACTGCATTGGAAGACATGCCAAAACTTGTTAAAAGGGGAGG
ATAGATCAAATGGAATTGCTTATTATCGCCCAAGTCAAGCCCAGAATGTG
CTGCTAGAGCCATGAAGCTCTGCATTTAACCATTCACAATACGAGTAGAT
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GCAAGGACCAAAACTTAACCAAATTTGTTTCAATGTCTGTTCCTGAAAGT
TGTTGTTCTAGAGTCTGTAACTCTATATACTTAACCCAGCTTTAAAAAAT
GTACTTTTAAGAACAACTGATGTTCTCTTCTGGTAAGTATTAGCAGTACG
ATAGAACTGAAGTGTTGCTATTGTTTGCTATGTTTTTATGCCAAACAAGT
ATTTTCTTTCTTGGATATTTGTCTTGAAGTAGTTTTATCACCTAACAGAA
TTGTACCTGTCATGTTGCAGCTCCTGAAGAAAGTTTAGAAATTAATTACA
AAGTGAGCTCAGCACTAGTGGAGATTGTGAGAAGAATTGATACTCGACCC
CGTTACATCCTTGCAAAGGTAATAAATAAACAGCTGTTCTTTTTTCCTTC
TGAAGGAATTGTATGGTTACTTAGTTCACTATATCAAACTTTATGCATAA
GATATATCTTAGTTATATCCTGCAAAATTTGCCAATTTCGGGAACTGTTT
ACTATCCGGTCAAAATGTCTGTTCTGTTCTCTTGGATCTTCGTCACATAC
TTTAAAGATAGTATAATACCTACATCGCTACATGTTCCTTTCAGAAAAAA
ATACAGTGTCTAAACTCAACCATGCTAGCTTTCTCAAACAAAATGACTGA
TTCCACAAGTTGTGCATGAAATAGACTTATAGAGTTGGCCTAATATGATT
TTTTTTATACAGGGAGGAATCACTTCATCTGATCTTGCCACGAAAGCTTT
GGAAGCTCGGCGTGCCAAAGTAATGGGACAAGCTTTAGCTGGTGTACCTC
TGTGGCAGCTTGGCCCTGAGAGTAGACATCCTGGTGTTCCTTACATCGTT
TTTCCTGGTCATAAAGATTTTATCTCATTTCCATACCAGCAGATAGATAA
CATTACCTTTTTACTCAATGAAATGTCTTGTCGCTCCCCTAATGACAGGT
AATGTTGGCGATAACAGTGCTCTGGCAAAAGTGGTCCAGAACTGGGCTTG
CCCTCCTAAAAGTTCAACAAAAGAACTTCTCCTTGTAAGATTTTATCCAC
CATGTTAACTTCTAGTTGAGGACATACATCATTGTTTATTGCTTCAAATA
CCTCATTAATTATTGTTCTTATTGTGAAGAATGCGGAGAAGGGTGGATAT
GCGATTGGTGCTTTCAATGTATATAACCTTGAGGGAATTGAAGCTGTCAT
TGCAGCTGCAGAGGCTGAAGAAAGTCCTGCTATCCTGCAGGTTAGGAATT
CTTTCATAGGATGTTTTCTTGGGCAATTTATGGTACAAATTACATAATTT
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TCCCACGATTTGCCGTCCGTTCAGTTTCCTTGTGTGTGATGATAAAACTG
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ATACATGAGGAACTGGCCATAGATGTTCGCTGCAATACCGGTTTTAATTC
ACGCATGGATCAAGGCTAAACTAGTGCTTCTCTCACATTTTCTATCACCA
ATTAGAAATCACCTAGGTTCCAGAGTTTTGCTTATTTAGCCCAACAATCC
GGTATGGACTGGAATTGCAGCGAACATCTATGGCGGCATCATAGATAGAT
TGCAGCGAGGCCGCATTGTCCGTCTCCTCCACTCTGTTCCCCAGCTCCTG
GTCCCACAGAGAGAGCAATTTGCATGTAACAAGTTTGGACCGCATGAGCT
AGCTGCCTGTACCTTCCGTGGTTTAGTCTGAGTGACCACCAGGCAAAAGT
ATTAGTACATGTCAGCAAAGTTGCCATGCCATGTCGCTCTGTGCAAATGC
TGAAAGGGAGTCTGGTTAGGAACAGTGACAAGTTTTGGGATTATTGCTTC
AGATTAGTACATGTCAGCAAAGTTGCCATGCCATGTCGCTCTGTGCAAAT
GCTGAAAGGGAGTCTGGTTAGAAACAGTGACAAGTTTTGGGATTATTGCT
TCAGATTAAAGATTAAAGTTGAGGGAGCACCATAAATGCAATGTTTTGTA
GATGATATGTACTCCCTCCGTCCTAAAAAGGATGTCGCATATTTGTCTAA
ATAGATACATCCGAATTTCAACAAATGTGTGACATCCTTTTCAGGACGGA
GGGAGTATCTTGATTTCTAACCATTGGTTATTGTGGTTATTTAGGTTCAT
CCCAGTGCCCTGAAGCAAGGTGGAGTTCCATTGGTAGCATGCTGCATTGC
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TTTATATAACTTGTGTTCTCGCATATTAACATTCAGCCATCCTTGATTTA
TTTTCTCTAAAGGTGATCATTCTGTGATTCTCTCACTCAGGTTCCTATCA
CCGTTCATTATGATCACGGGACTTCCAAGCATGATTTGCTTGAAGCTCTT
GAGATGGTATGAGAAAAAGAGTTATTTTCTCAAGCTGTAGAGTACTAAAA
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GATCTCAATCTTGACTTTTCTCCTGACTTCATACTTCGAATCGTAATTTT
CCAGGGATTTGACTCAATCATGGTGGATGGTTCCCACCTACCTTTGGGGG
AGAACATCTTATACACAAAGGACATATCTTCATTGGCTCACGCAAAATGC
ATACTTGTGGAAGCTGAACTTGGGAGACTATCAGGAACTGAAGATGGCCT
GACAGTTGAAGAATATGAAGCAAGATTTACTGATCTTGCTCAGGTGATTT
TCTCTTCTCCAACTAATTTCAACTCCATGGGCTTCTGTTCCTGTATCAGC
CTTAACTTATATGGTACATATTTTCAGGCGGAGCAATTCATTGATGAAAC
TGGTATTGATGCTTTAGCAGTATGCATTGGAAATGTTCACGGAAAATATC
CTCCCAGTGGACCAAACCTCAGACTTGACTTGCTAAAGGTCAGGCAAATG
CAATCAAACTATGAAAATCAATATGTGATCTTAGTGGCAGAATATAAGAT
TTTTAGAACAAAGCATCATAGCACAGAACATTTCACTAGTAAATTGCTGT
TTGTATGGTAACACCCTCTTGTAGTTGTATTGTACCCACATCTTGGAAAA
ATGTCCACTTTTCATCCCTGGATTACTGCAGAATTCACTTTTCAACCTTG
AACTCTGAAACCTGTTGTTTTTTAGCTCAAACCCAAGTGGTTTTGAGCCG
ACTCAGACGACATGTGACATCACATTTCTATGTCATCACTTTGCAATGTA
ATCAGCTTAAGTAAAAAAATCAAGAAAATTGGGATAAAAAAATCTTAATT
TTATTTAAAAGAATTAAACTTTCTAGAAAACCAAAACAAGGAAATTCGAA
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CTTTCTGCTTTTCCTTTTTTTTCTCAGAAGTTTAAGTTTTTCCCAAAAAT
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AAGTGTATAATTGGCGCCACCTGCCTGATATGTGTCGTCTGAGTTCGTTG
TTTAAGGTTAAAAGCAGCTGGGTTTCATAACCAGAGCTTGAAACTGAACT
TCTGTAGTAGTTCAGGGGTGAAAAGTGGGAATATTTCCAACATTTGTGAA
GACCAAGCAAATCTGTGCTGTTGCATGTGACTTCCTAACTCGGTATGTTT
GAAACGATGACAGGATCTTCGTCAGTTAACCATGAAGAAAGGAGTTAGTT
TGGTTCTTCATGGAGCATCTGGCCTCCCTCATGAACTTGTAAAGGTTTGA
TATACTTTTTCCTTCCTTATTAAGATCAGTGAAGTTGTCGCTCGCAATGG
TTATGCTCAAGTTTCCTGCACAGACTTATCTTGAGAACTTCAAAAAATTT
GGGCAATGGTGAGGCTTATCATTGCCAACCGTAAAGCAATTCATTGTTGC
AGACTTGCAGTGCATAAAACTTTCAACCATAAGGTTAAACTGCTTTAGTT
TATAGTTTTTGTGTTCAAGGCTTGTTTTTCTATTTACCGTGGAAAACTAT
GCCCCGGAATACGAGAGTAGTGCATATATTTCCAAACTGCAACCGTAAGT
GATAATAATCTCAAACTACTGCTTTCTAAAATTTCAACTTCTTGAGCAGG
ATTGCATAGATTTGGGGGTGAGGAAATTCAACGTGAACACGGAGGTCCGC
AACAGTTACCTGGAATCCCTCAAGAAGCCAGAGAAAGACCTGATTCAGGT
CATGGCGTCTGCTAAGGAAGCAATGAAAGCTGTTGTAGCAGAGAAAATAC
GCCTCTTCGGATCTGCAGGGAAAGCATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.