Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004242

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004242
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004242
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGGAGAGACCCCCCCTCCAAACTTTCCCCAATCCAGTCCTGACCCCCCTT CAATCCAATCTCCTCCCCTCCCCTCTCCCGGAACCCTAGCCTCCTCACAG GTACATGACCCACCCCTCGCCGTCCTCCTCCGCCGCCCCGGCCGCCGCGC CGGACGACCCCACCTCCCTAGCCCCGGGCTTCCGCTTCCACCCCACGGAT GAGGAGCTCGTCTCCTACTACCTCAAGCGCAAGGTGCTCGGCCGCCCGCT CAAGGTCGACGCCATCGCCGAGGTCGACCTCTACAAGCTCGAGCCATGGG ACCTCCCCGCCAGGTCGCGCCTCCGCAGCCGCGACTCGCAGTGGTACTTC TTCAGCCGCCTCGACCGAAAGCACGCAAACCGCGCGCGCACAAACAGGGC AACCGCGGGAGGATACTGGAAGACCACTGGGAAAGACAGGGAGGTGCGCC ATGGGCCCAGGATCGTTGGGATGAAGAAGACGCTGGTCTTCCACGCCGGA CGCGCACCAAAGGGCGAGCGGACCAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCCT CGAGGGCGACGGCGCAGCGGGGATCCCGCAGGTATTCTCCCTGAGGCCGG GCCCAACAATCGACTTGTAGATCAAATTGCTACTAGTACCTGTATTGATT TACTTGCATATACTTATCGATCCCCTTTCCCGGGGATTGTGCTGTTACTA TGTCCGGATTTTAACTGCCTGTTTTACATGTTTTTTTTTTCTGTCACTAG CTTCTGTTTTTAGTGGCTACTAAAATGATGATGCTTAAATACGGATGCTG ATTTCTAAACCTTGCTGAGCAGGATTCATTTGTAGTGTGCCGAATCTTCC AGAAAGCTGGCCCTGGTCCACAAAATGGGGCGCAGTATGGAGCGCCCTTT GTCGAGGAGGAGTGGGAGGCGGACGAGGATGATGATGTTGGTCTGCTGCC AGTGGAAAGGGAACCCGTTGTTGAGCATGAGGCGCCTGGTGCTATGGAGA AAGGATATCTTCAGATGAACGATCTCATTCAGGTATGACGATCATAAGTA GAAAGTTCATACTCTTCAGTCATTCATAAACAGCCTGTCGGACAGTACTC AACACAAAATATACAATACCTGCAACTTCCATGGCTTGTTTCAAACGTGT CTAGTTGAGAACCAAATGCTATATATAATGCATAAAAATCAGTTTCAGCT ATAAATAGACCAATTGTACTTGCCACTCAAACTGTTGGCCTTATGTATCT AATAATAGCTCATGTAGTTTTATTTCCTCACACTTGTCCAACTATGCCCT TGTTTTTGGCTTAACCGATTAGCGTATGGAAATTTCAGCACTTGCTATAC GTCTCTTTTTCTTAGAGTGCCCTTGCATGTACAATATTCTGATAAATCTT CCATATAAATGCTACACAGGTGCTCAAGCGTGTAACTGTCTGGGACACGT TATTATTTATAGCAAGAAGCCTTTGTCATCGAGTGACAACTTCTTTGTTA AAATATGATACCATTCAGTCTTTAAAACACACACGTGAAAATCTAAAATG TGGAAGCATGTAACTGACAACTTATGTCCTTCGGTTCTTGCATACCCGAG TCCATATATTCATATACCTTGGGACAATATGTTCAACATCTTGGTATGCT ATTTGGTTATATGCTGCAGGTGCTGCTTATAGAGAACAACAACTTATTTG GTGAATATAATCTAACACGTTTATTAACGTTTTAGCTTTTGTATGGACTT GTTAAAGCCCTACTTTTTTTTCAGTGGCATGGAACATGCTTGTTGACTAT CTATTATATACCAGTCAGAATAATTGCAAAGAACAGCTACTTGCCATTAG TATTAGCTATTGTCGAAGGGAGATGCTGATGCTTTTTCATAGCCAGAGTT AGGAAAAAATGCACAAACTTGTCAGCAAGTGTGCTCTGTATAACTTCTAC CACATGATCTGTTCTGTTTTTTTACTTCCCAAGTTAAAACAAGAAGTTGT TTGTGAATGAAAATTGTGGATTTGCTTATTTCCCCAATCACTCTGTAGAA TGTTAGTTGAAGGACATGGTTTCGCTATGATCTGTTGTTTGTATGTTTGT CGAGAATAAATGGTTAAAAATAGTACTGAGCATGGATTCTGTGTCACCTT TGCTGTGTATGTCTTCCAGAAGGATGATCCACTTCCGTCAGCATTGGTGT TTAGCTTAATATATAACTTGCATTAATGAAGTTCTATGCTATGCTGTCTA GCAAGAATGCTGACATGCATCGGCTTTTTGACATACATATTCGTATTTCT GCCAGGATTAGGTAGCAAGTCACATGAGATCAGTTGACCCACAAGAGTCA TGATGTCATAGTATTCGTGTCTATGAGTTTGTGTTGTTTTGTCTTTAACT GTATGATATGAACTTCACAAGGCTTAGGTTTCTGAGACGATAAAGATCAG TTGACCCACAAGAGTCATGATGTCATAGTATTCATGTCTATGAGTATTAA AAGGTTGGAATTTATTTGTTGTTTTGTCTTTAACTGTATGGCATGAACTT CACAAGGCTTAGGTGTCTGAGACGATAAAAAATATGTATGCTTTTAGCTA TAATTTCGTTTAACATAATTGTGTTTGATAAAAAAGATTGGTTCTGTCTA AATAGGAGCATACTGTCCATGCAGAACTATATTTTACTTTCTCCAAGTGT AATTATGCTTTGTGGGTGATTTCATTGTTTTGCTCTGTTCATTCTTTACC TAATTATAAACCCCACTGGTATGTCCAGGACCTAACATTCTATTTCCCCC TCTTTTTCAGGACTTGACCGGTCAAAATGAAAATGGTACTTCAAACAATA GCAACCATTCTGAAGAATTGGATGGAAATTCAGGGGACATTTTGAATGAT CCAGATATTGGTTCTAATTTTCTTCAGTATGTTCATCCTGGAGAACAGAA CAGCCTAATGATTAATGGCAGTATGTTCTCTAATGCAAATGGTGGAGATT TTTTGAAAGGGTCTTTCCCCAGTGATGAATTCCTGGAACTGAAGGATTTG GAGTATCCTTTAGGCAATGATTCCACCATCTGGCCTTCTGATGCTTGGGC CTCCTCGCAGGCTGTAAATGGGACCAACAATGAGGTTCTTCCAAACATTG GTGAACAGCCTTTCCAGCCAGATGAGTTGGCGCAGTTGTTGCAGACACTA CAAGATGATGACTCCTCTCCTTTGGGCTCAACCATCACTGATCTCCCAGA ATCTTCTATTACAAATTCCTTTAAGCTAGGAGATGATTCTCTGATGTTCT TTGATGCACCCTTTGACTCCACAATGTTCAGTGACGGGTTTAGACAGACG AATAGATTTCTCGGCTCCCCAGCAACCAATCTATCGGGCATTGACATGGT GGATGATGGTATGCCATACTTTGATGCAGTGGATGATAACTTATTTAATG ATAAGATGTGCTCTGTACATCAGTCAGCTGGGAGCAGTTCCCATGTTTTT AATGGGCCAGTTCTTACTCAAGAGGTATGCTCTCAGTTACATGTAAGAAA TGAACTCTGCAGTTTGTGCAGATCATTGATGTGATAATTGGAGTTCACCT ACAATTTTTCTACTTTTACAGGTCAATAATACCACCTATACATATAGTCC AACTCAAAAGGTTTTAGAACCTAATTTTGTAGTTGGTGCCCCATCAGCTG CTAGGTTACCTGAAGCTGGTAGTCAGTTAAATTGTGTTGTTTTACCAGGT AATTTTACTACGGAAAAATTCAGTAGGCCAGCTATATGCTTACTATGTTT TGCTGTTTCGTATTCATTCATAGTCGGTTCCTCCTTCACCAGTACTTCTA TCTTTGTTACTTGGAGGGAATGTTCTCAGTTGTATTTACTTGCCCTGATT AAGCGAGATTGAAGCATTAGATCATTTCGTGTTGTGAAGAAAATCATGCT TAGTTCCGCTTAATTAGGGCAATTTTACAAATGGCTGGTCTTCAGTTTCC TGCCTGCTAACCTGGATATTGTACATGTAAATGAACGTTATTGATATTAA TTGGTATTGTGTTCCACAGATTCTCAGGCTAAGAATTTTTCTATCGGAGA GCGTTTAGTAAAGATGCTGGATTCAATCTCCGCCCCACCTGCTTTTGCAG CAGAGGAGTTCCCAGCCAACCTTGGCAACACCATCAGTTTCTCTACTGAA GTAATCAGCATATCTAGACAAGACAAGTGGTCCGTCCCGAAGGATGAAGG CATGGAGCTGCTCTTCTCCACACGTTTTCAGCCTGATAACCGCATACACT ATGGCGGCTGCAATACAGTGACCGCGGTGCTGCGTGGTGGCTTCTGCCTC TTTTTCTTCTTGTCAGCAATAATGCTCCTGGTGAGCTACGGAGTGGGCCT GTGCATCTACGGCAAGTAGGCTTGCCTGGCTGCCTGGTATTGGGTATAAA TATTGACATTAGGTAATCGTATGTGTATTGAGGCGAGAACTGGGGACCTC TCCTACTAGCCTAAATGTATTGAATTGCATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.