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GrainGenes Sequence Report: AA002630

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Sequence
AA002630
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002630
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAACCACATACCTCACTCACGACCCTTTACCCGCCTATATATAATACC
TTCATTCACCGAACTGAAGCGCGCAGTCGTATAGGTATCCCGCGCTCGGC
ACATCACAGACTGAGAAACCCAGCAGCTGACTGATGGAGGCTCTAATGGC
GACATTCCCAGCAGCTGGCGTGGCCGCCGTGGTTGCCGTGGCGGCCGCTG
TCGTAATGGTCGCGATCACCATCGTCTGGATGGACTCCAAAAAACGCCCC
AACGCTCCACCAAGTGAGTATGATCGATAGTGTAATGCCGTTGTCGCCGT
GATTGCGCTAGCTGCAGATCTTGCCCGAGAGTGAAAATCTGGGTACTCTG
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GTACCTCTATATAGCACCCAATTATTTTTCACCTAACATATTTTACGTTG
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GTTGTTAAATTTAAAAAATTAAGGTTTGTATTCAAATAATTATGTTAAGA
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TACTCGTGTTATGAAGTAAAACAAAATGTACGTGACATAAAATCATGTGC
GCTTGAAAAAATAGAGGATAAATGTAGAATAACTATTTTAGACCCTAGGG
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AAAAAAATTCTGAACGAAAAAGTAGCACCTGCTCCATACCTATCCAACGA
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TGGAATTTCTCTATCTTTCCAACGTTATATCATTTATGTAATTCTGATAA
GAGGTTTAGAAATTGCGTGCAAAACACGATTTGTATGGGTTCATGATGAT
TTCCGATTTTTTAAATTAAATTTAAATGGTCTGGAATCTGAAAAAGTTAT
AACATGAAAAAGTTGCGGATTTTCATTATCTTTCCAACGATATATCATTT
ATGTAATTCCTAGTAGCGGTTGAGAAAAACGAAGAAAAACAAAGAAGTAG
TGCAACAACGTGGATAACGATAGTATAGACATCAAACCGAGGGAAGTACG
GATCATGTATAGAATATTATTCTATCATCAATGAAAGAAACGCATATTAA
CATTAATGTTTGGGAAGTACCATTGATGGTATTTTGGCAGTACGATTGCT
CGTATTTGGGAAGTACATTCATTTGGGAAACATATTTATTTAAAAATAAG
TAAGTATGAATGATAAAAACAATGAAAGTATAAAAGGAAAGTATACGAGA
AGTATTGATTAAAGCAGTTCAAAGCAAAACGTCCCTAACTTTTAGTTTTA
ATTGTTTCAATATCATTTATGTTCGGAAGTAAGATCATAAAAAACAAAGA
AGTATAGACTTAAAAATATAGAAGTATAAACTTACTGAAAGGAAAGTAGA
CATTTTAGATACGGGAGTATAGAAAATTCAATAATATGTAAGTATGAAAC
CGCATCGAGAAGTAAGAACACATAGAAAGAGAAGTACGAGATACAAATAA
AAGTAGTAAGAAAATATAAAAAATTAGAACAATTTAATTAAATATTTTTG
TGGGAAATATGCAATCTTCATCGTGGAAGTATAAAAGGGAAGTATATACT
ATATATACAAGAAGTTTGATATAAAATATTAAAGGTGCAAGTCATGAAGG
GAAGTACAAGTTTGATATCTTCACAATGTTCATAGCAATAAGATCATAGA
CAAATTTTGCTGTTTGTTCAGACTTACTTGTAGACTAAACCAACCATATA
AAGTTTATATGAACAAGTATTTTTTTCAAATTACCTATGGGGCAATGTCA
TCGACCTTAATGCATCAAAAGTGGTGAGTTTTTGGACAGTGTTGTTAACT
TTGCCCGAATTGTGGTATTTCTTCTAAATTTAGTCCTTCTATGTATTAAT
GTGCAATCTTACATATTCTCTAATAGATGAGAATTTAAAAATAAATCTTG
ACACAAGAGTTCATTTTTCTAATCTAGAATATGAAATTTTACGAATGATA
ATGATGTTATTTTTATCAAGAACAGTGCTATAGAGCGGCGTCGTATATTT
TTGACTCCGTGTGGCGGCTACCAACCGCTGTCAAAACAAACGCGAGCGAC
CTAAAAACTAAAAGACAGTTCACATGCCAACGACAAGTGGCAGGCACATA
AGATTGCAAGACGATATACTAGTATAAAATATGCAGTTAATTGTTAGTAA
TTACCATATTAATTAGTACTATATTGCCAGATTAATTATGCATATATTCC
ATGAGTATTACTAATTGAGGGATCAATCCACCAAATCGCCTGATTAATTA
AACATGATTGCCAGGTTCAAATTACCTGATTAATTAAAAATGATTGCCAG
ATTTAAATTGCCTGATTAATTAAACATGATTGCCAGGTTCAAATTGCCTT
ATTAATTAAACATGACTGTCAAGTTCAAATTGCCCGATTAATCAAACATG
ATCGCCAGATTCAAAGCACATAATTGCTGGGTTTGTAGTGCTTGTCGCAA
TAAACAATCTGGTATCCATCTTCCGCTTAAGCGTGCTTGCTAATTATCAG
ATTAATTACTCCTAATTGCCAGGCTTAAGCCACCTAATTTCCTGATTAAT
TAAACGTGATGGCCAGATTATTTCTGCTTGTTGCGATGAACAAACTAAGC
TATCATCTGCGTGCTTGCCATTGCCAAAGTTCAAAATAGTTGTAAAAGAG
ATGCATCTCTTGTCCTCCCAAATATAATCGAGTCCAACTTAAATATCATT
GAGAGGATAAAAATGTCACGAATAAAATTGCAAACAAATCGAGAAGAGAT
AATCGCATGGTTGGTCGTACTACTAACCAGCGATGAGCAGTTTGGTCACA
GAACTCCAGTTCAGGAGTGCGCTGGTCACTTAGGTCTGTTTTATGAGCAG
CGTAGTCACTCCCGTCACTCCGCCTGTTGGTCAAGCTGATGTGGCACGTC
ATGCCGTTTGCATTTACCCCCTCTGTTGGTTTTGCATTGTCTGTTTGGAT
CATTTTGATTTTGAATTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTGGATT
TGTCAAATTTTGGATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGTTCATCTA
AATTTAGACAAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGAAGGGAGTATTTGAT
TTAGAATTTGAGAGAGTTTTAATCAATGTTCTCGACAAACTCTCGATTTT
TCTCAAGTATCTTCGAGTGTTAGTCAAGGATTGCACATCAGAAGTAAAAG
TCACAGGAGATACACAAACAGAACAAAAGTAGGGCTACTTAGGTTTTCAC
ACATTCAGGACATGATCAGTCAAGTTAGTGCACAAACAGAACAAAAGGTG
GTGCCATCTCTGTTTGGCCACTAACTCAATCATATGCAACTTCATGTGGT
CAAGTTTGAGAATTGATCAATGGTGGTGCTTGGGATGCATCAACATCAAC
AGCAGCAGCTTGTTCTTCTACAGGACCAGTCTGTCCTTCTCCCCACAACA
GCCATTGTGTCCTTCCTCTGCCTCTAGCAGGTATGTCAGTCAAAGGTTGC
TCTACAGGGCCAGCCTCTTCTACTCTTGCTCTTCTGCCAGTTGTGCCTAA
CATGGTTCCCCTTGTGCCACGATTCCTTGCCCTGGTGCCACTTGATCCAA
ATCCCGCTCCTCTTCCTCTTGCAGCAACTGTGTCAACAGACACTCCCCCT
CTCCTTCCTCTTCCTTTTGATCTACCTCTTCCTCCTCTCAAAATTGCTCT
GCCATTAGAAGTGGCAGTAGTAACTCTAGCTCTGCTGCCAGGGATGTTAT
CTCTATATGATGCCACAAAATATGACTCCTCGGAAAAAGGATCATCATCA
TCAGTCAAAACGATATCGGGACTCTGCAAATGTATACTATCACTATGAAA
ATCTATCTTTATTTGGGACAGATAAGAAGGTAACAAACAAGTGGATAATT
TGTACCTCATGGTTCAATGAATTAACCATGGAATCATCTAGGTTTGATGG
ATCAAGTTCTGGATCAAGTTCCACTTGGTCAACATGCTACATAACAATCA
GGAGATACAATTGGTAAACATGGTACATAACAATCATGAAACTAACTAAG
TTGTCTGCTAAAAAATAAATGATCAGTATGTGATAATGTACCTCCAACAT
GTCAGGGATATCTGCATCACCATATTCATCAATATGAGTTGGACGTCTGG
TGCTATTAGGAATGCTGACCTGCTCATAAATTGTCCTTCTCTTCTTCCTT
TTAGGTCTAGGTTTCGGCATAGCTTCATCAGTAGCCTCATTGTGCTCAAT
ATCATTATGTCTTGCTTCATTTTCTGCAACTACGGCCCTTGCTTGCTCAG
CTGCTTCAGCATCTCTTATTACCTGCAATCTAGGACATCCACTCCTATTG
TGGCTAGCATCTCTACAATATCCACAGTGGATAACTACACCAGCCCTACT
CAACCTTGTTCCTCCTTCTATTTCTTCTGGATTTTTTCTCCTGCTTTTCT
TTGGTCTACCAACTTTCTTCTCATACATAGGTGGCTGCACCTCTGGTCCA
TTTGTCTTCGCCCATTCTGATTGGTCCCTCAATGGCCTAATGCTTGTACC
ATAAGCTTGCATGTAAGTATGAATGTTGTAGCATTTACAAACCATTTGCT
CAGGTTTCACCCCTTCATGTCTGAGGCAAGCACAAACATGTGTGCATGGG
ATGCCAGTTAGCCGCCACCTTCTACAAGAACAACTCCTCAAGTTCAGCTC
AACTATATATGAAATTTCATTTCTGACTACCTGGAAGACCCCTTTCCCAC
TAGGCTTTGCTTCATAATCAGCAGACCAATCAACAATTTTATTCAGTTTG
CTCTTTATTTTGGGACAGATTTGCCCAGTCCAATCTTGCAATGCCTCCTT
AGGTTTGTTGTAAAACCTACTCATTAGTTGACCAAACATATCTTCTAGCA
TGCTCAACACTGGATATTCTCTAGCTTCTAGGATCATCCTGCAATCAATG
AAGAATTGTTCAGTACAAGGTCAAGTGTCCAAGTATCATCCTAGAGATGC
AACAACCAAAGCTAGTGTCCATTACCTATTGAAAACCTCACAAGAATTAT
TTAGTAGAAGGTCACACTTAGGAAAATCTGAGAAGAAAGCTCTAGCCCAA
GTGTTTGGTGCCATTTCCTCTAGCCAAGCATGTGCCTCGGGGCATTCTGT
CTTGAAGGCCTCCATATTCTTCTCCCATCTGGCCACATTGCTTGCCCTTG
CACAAGCCCACAAGTGTTTCTTCACTGTTTCTCCTTTGTGAAGCTGGTTC
ATGTTGCTGTACAGGTGCCTAACACAGAACCTGTGCTCAGAGTCAGGAAA
CAGCTCCATAACAGCTTTGATTAGTCCCTTCTGTTTATCAGACATAATGG
TGAAGGGAGAGGTGTTGATGATGTTCAGATCCTGTTTTAGTGTGGTCAAA
AACCACATCCAGCTGCTGTAGCATTCCACTTCAACAATGGCATAGGCTAT
AGGATAGATTTTGCATGTCTGTGAGCTTGTTGAACATCTTCCACTTGTAA
GTAATACCTGATTTATGCTCTTCAGGTAGCTCTAGCTCTTCTTCTTCTGC
AATATCTTGCTTAGGTTCTCTCTGAATATTTGATTTGGATTGTGTCTTCT
CAATCAAATCATCTTTTACACCTTCATCAACATTCTTCTTGAACTGCTCA
TCATCTTCTTCAAAATCATAATCAGAGTCCACAAAATCACTGTCCAAATC
TGAAGAATTGGCACTGCAACAAGATATCATAGTATTTGTGTCATCATCTG
AGCTCAATTCTGCTTCATACTGTCCTTCTGCATCATCTACTTCTGATCTC
TTCTTCTCAGGTTGTTTAGATGGAATCAAAACAGGAGGCAACTGAGCTTG
CTGCACACTAACAGCATCCCACCTCTGCTTCTCTAGTAAGTTAACATGAT
CAATATATACCATTAGCTGCTTCTCTTCAACTACACACTTCTTCATCAGT
TCTGCATCTTTCTCCCACTTAATTGCCACAAGACCATCTCCAATTTTATG
CCCAGGCTTGCACCAGTACACCCTTATGTTTCGATCAGCTGGACTATACC
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CCCTAATCCACAGAAGAAACCTCCATGGAATACTTCAATACTAAAGATAT
CATCATTTGGACCTATATTGCATCAAAATACATGACATTTAATTAATACC
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AGCAATTTAAGCCAACTACAAGAGACGCCATCCACAGAACAAGAGCCAAA
ATCAAGCCCTCAATCATCCCAGGTAAAAACCCTAGCTAAAATCCCCAAAT
TGGGTCATAGATGGAATACATACCGTATTTGGGCGGCTCCATCCATGGAT
CTCGAAGCCGCGACAGTCCTAAAGATTCCTCCGTGCGTCGATGAGAGCCG
CCGCGGCTACCGCCGCCGCCCGTGTCATCGCCGGCGACCTCGCCGGTCGC
CTGCATGTCGCGGGAGATGAACCGAGCTGATAAGGTGAGGATGAATGCTT
CCAGGAGACTTGTATAGTCGGGGGCGTTTTTGCAAAAAAACTACCGATTA
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TACTCCTGACCTGGAGTTCTGTGACCAAACTGCTCATCGCTGGTTAGTAG
TATGACCAACCATGCGATTATCTCAATCGAGAAACATGAGGAGAGAGAAA
AGTCAAGAAAACATCATGGCGGCCGCTGGAATATCACGGAAACGGAGATG
GACGCGTCCTCCTAGTGCAGCTCCAGGCGCTTGTCGACTTGCACCTCCCT
GATGCACGCGAGGAGGTGCCGCCTCGGTGCTTCCCAATTCAGCCGTTCCT
CCTCCCGACGGGGCGCTCGATGCATGCTCGGCGGCGGCAGCCCAGCGCGG
CGTTCCTCCACCTCCGACACGCAACGGCCCCCTGATGTGTGCTCGGTGCA
CTCCGTCCGTGATGTGTGCTCGGGGTGCGGCGGTCTCCTCCTCTCACGCC
AGAGCTCTCTGGCGCGCGACGTCCTCCTCCGCTGATGCCTCCCGGCGCAG
CGCACCTCCACCTCGCATCCTCCCCGCGCAACCTTCCCATGCTCGTCGGC
TGAATCCTCCCTCAACACATGACCGGCGGCGCACGGCCTCCCCCGAGGTG
TGCTCGTCGGCGGTAGAAAAGGCCTCCTCCTCACGCTCGTTGGCTAGGCG
GTGGCGGTCTCCTCACGTGGGTCTCTGTCACAGCGCTCTTCCTCCGCGTG
GTCGTCCGTGAGAGAGAGAAAACGGAGGAAATTGTGTGGACGGACATGTG
ATGAGAGGATAAGGTGAGAGGGAATAGTTGGGAAGGCCACGGTCGATGCA
ATTTCATGAATCGTGTCACAGCCGCACGAGCGAGTGATCTATGCGGCGCC
TTCCAATAAATTTCCTCTTTTATCAATTGTTTTCTGATCTAAAAATTTCT
GTGGTGCAAAAACAGTTCAATGGCCACTTTTCGTGTAGTACTCAAATAAG
ACTAAACTAAAAATTACCATGGACTAATCACGAAACATGGAAATAGTTTT
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GGTAAAAACATCTTGTATTTCATCAAATAATTTCAAGATTATATATTATT
TTGTCTTTTTGCAGGCAATGGTTGACAAATACTCATCCATATCTACTAAA
GCTATCTAAAGCATTCTCAGTGCTTAGTCATGATAAAACAATGGTTTCTA
TGAGTGACTATGGTGACTTTCACAAAATGACAAAGCGTTTTGTTATGACG
TCCTTGTTGGGTCCTTCTGCTCAGGTATAAGTCTCGGCATTTTCAAATCA
TACCGTTAAGTTAGCACGTCTTTGATACATTTATGTTTTTAATTAAATAA
GAGCTAACCATCATATTCTTTTAAATATTTAGAAACAATTTCAAGACACA
AGAAAATACATGATGGATAACATGGTAAAAAAATTTCGTACATCGATGAT
TGATGACCCACATGCTACTCAAAACTTCAGGAAAGTTTACAGGGCCGAGA
TATTCCGTTTAAACATGATCCAGGTTAGTGTGCAAATACCATGATTTAGT
GTTCTTATACGATATTGCCATGATGTTGTTAATTTGAATCGTCGTGGTAT
GAGCATGCTCCATTTTCAGTGTTTCGGTGAGGATGTAAGTTCAATTTATG
TGGCGGAGTTTGGGCGGGAGGTGTCGGATGAGGAACTCTGTGATATCATG
GTGGTAGACACGCTGACGTCCCTAGCTGAGGTTGATTGGAGAGACTTTTT
CCCATACCTTGGTTGGATTCCAAACAAGAGGTTTGATGCAAATGTTCTAC
CAAGTGAAGCTAGGCGCACCGCTGTGACACGAGCCCTAATCAATTATCGA
AAGGAGAGAATTAAGGGCGGTGAGGTGAGGCGGAACCAACCTATCCACAT
GGAATCTTTTAATGATTGTATGTTTCTTTTAATCCGATTCTTATATGATA
TGTAGCGACGGGTAAGCTATGTGGACTTCTTGCTGGCAGAGAGCACACTC
ACGGATGAAGAATTAATAGTGCTAGCTTGGGAGAATATCTTAGGTGGTAC
AGATACCACAACGATGAAGACCGAGTGGGCTATGTTCGAGCTTGCCAAAA
ACCCTGAAATACAGGCAAGCTCACCTAGTGTTGTTGCTTTTTTCCCAATA
AAGAGATATTAATTGTTGTTGCTATATATTTGTCGATGTTCTCATGAATA
GTATTATCATATATGTAGCCATATGCATTTCTTAACACACCAGATTTCTT
GTGCCAGGGCCGTCTCTACAGTGAGATGCAGGAGGTGTGCGGCGATGATA
TTGTCACCGAGGATCATCTTCCTCGGCTGTCGTATTTGAAAGCTGTTTTC
TTCGAGACGTTGCGGCTCCACCCCCCTGGCCCGGTTCTGCCTCCTAGGTT
TGTCCACGAGACCACCACACTAGGTGGCTACCAAGTCCCAGCTGGAACAG
AGGTAATCGTATTTGCGTGAACACTTGGCATCTTAATGGAAATTCATACG
TCTCCTACCCGAATGTATGTACTACATGCTCACAAGAGTGGCTATTTATT
TTCAGTTGATCATCAACGTGTACGGATGCAACATGGACAAGAAGGACTGG
GAGGAGCCTGAGATGTGGAGGCCGGAGAGGTTCATGGACGGCAGGTTTGA
CGCCACATACAAGCCCATAACATTTGGCGCTGGGAAGAGGATCTGCGCCG
GAATGGCACAGGCGACGAGCATCGCGTGTACCTCCATCGCGAGGTTCGTT
CAGGAATTCATCTGGAGTCTCAAGCAGGGCGACGAGGACAAGGTGGACAC
CGAGCAATACGTCGGCTCAAGGCTCCACCCCCTCTACATGCATCTCTCAC
CAAGAGGAGGGAGGTAACTGGTAAGCACATCTTCGCAACTTGTCCAAGCA
AGAGGAGATATAGTGGTAATGAATAATGTGTATTGCATGAGCAGTGTGTT
GGGATTCATGCATGAATCCCTTTCTTTTTTTACATGATGAAATGTATCCC
TATTTGTGGCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.