Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA017371

[Submit comment/correction]

Sequence	AA017371
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA017371
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCAGATGTATTCTGGACTTCGAACTTCTACATGCAAGATGCTCCTTC CGATGAAACATTTATTGGGGAACGAATGGACAAAGATCTCATTTGTTATT TTGACATTATTGGTCTCATTGAAAAACAGGGATACACTTCGATGGATTAC ATCTACTGCAAAAGAAATGGCCATGGCCGTCATCGATCTGAAGTGGTTGA AATTATCAGTGACCTTGATGTGAGTCGGATGGTGTGTGAACATGAAGTTG ATCAGAAGCTAAGCTTTTATGTCGCAAAGCAAACTGATGGTTTAAATACT GGAATTCTTCGATCTGGACAAGTCCCCATTGGAGCAAGTGCAGATGCAGA GTGGCATAAAGCTTTGTCAGATGAGAGAGTCACTGGGAGTGATTACGATA CAGAATCATCACATGAAACTGACCATGAAGCACAGGGAGTTGAGCACCAT GCTGGGTTGGAAGACATAAAGAGGCGTAGGGTTGTCCCTAATGTCAGGGG GGTAAGTGGAAAGTGGGTATCATATCACGGTTTTGTACATGGTCTATTTC TGTACATAGGTTGCATGTAGTTCATAATTTATTTCCATATTATTATCCTC ACAACCCACATCTACGTTAACACTTAGAAATGCAAACCATGAGGAATAAT GAGTTAATCTATGACTCTATTGGTTTACCATGTAACTGTTTTAACATGAA ATGCAGGAGAGAGCAGATCGACAGACTGTGTTGGATGCCCTGAAGAGGCG TAGAGCTAATCCTAATGTGGGTGTGGTAAGTGGGCCTTGGTATCATATCT TAACTCTTGATATGGTTCATTTTTGTACATAGGTTGCCTCTAGTTGATAA TTTATTTCTAGATTGTTCTGCGCACAACTAGCATCTACACAAACACTTAC AATTTACAAATACAAACCATGAGAAACAAAGATTTAATGTACATGCACAC AAGCACATAGTCCTAAAAAAGAAACTGTAACTAACTGTAAGTTACAGAAG GAATTTTTGTTAATATTTCCTCTTGCTGAAAAAGAATAGCATGTCCTCTA ATATTAACATTTGCATCATAAAGTAACTTTTGTTCTAGACTATGACTAAA TAAATAGTGGTAGTTAACAAGCATTACACTACTCTTAGGTCTTGAGAAGG AATGGAGAAATTCCAGTACATCACAACAATTAAACTCTTTTCTCAAAAAG TAAAAAAATAAAATCTAGAATTGTACCTTTGGAGTCTAAAACTTGTCATG TATCATAGACCAGACGATAGCAAGGAGATCAGCCTCTGTATAGCAATAAT ATCTGCCTCTGTTTGGCAACTAGGTTCATCTGGCTTAGCAATATATATTG TTTAATTAGAGAACATGAAAACCATGAATCTATATTTGTTTCCTATGTAA TTGTGTTAACGTGAAATGCAGAAGAGGAATAAACGACTAAGGAACTCAAG ATTTCAATCGGAAGATGATGAACATGAGGAGGAAGACGTGGGTGATTTAG ATGATCCTTTGGAACCAAGAGAAGATGGGGAGGAAGATGACGATGTTTCG CAGGACTCCCCAATACATTCAGAAAATGAAGATCAAGATCTTGGAAAACC TGACACTACAATTTCTGGGGTTTCTCCAGAATCTGGATCCATTAAAATTA TCTGTAGGTTCCATTATTCCACGGACCTTTCCAATTATTTTGCCAGTTGG TGCTTATGTTGTACTCTTTGACATGAAGGGCCCAATGGAGTTGTGCAAGA GTATAGGGGGCGTTTCACAATATCCAATGTGATGAACATTAAATCTGGTG GAAAGGTACTTGTTGAAACAGATGGAAATGGCATTCCAAACCAAAGGTCA GCTGGTCTTCTTGGTTCATTTCTACGTGATCTGGCAAAGAGTTCTTCCCA TGTGCCATTGCATATCCCAAGATGGGACAACAAGTTAATGAAAAAGCCAA AGCAGGATCTCATCACTTATGTTGAGGTAGAGTTTATCAGAAGGATTTCC TTAAATATAATAGTGCTTTTGCACTAACTATATCTCTTTTATATTTAGAC AAAATTCATGTACCCCGAGAAGACAAAGTACACTACAGAAGGATGGATGT TGAAGATTGTCAACAAAGGATGGAGAGCTCACAAGTCTTTCTTGAAGAGC GAGTACTACAAGCCAAATAAGTTGTCACTAGATCGAATTAAGAGACGGGT TCCTAGTGGTGTTAATAAACATCAATGGATAACACTACTTGGGACTTGGT GCCAAGAGCAACATGCAGTTATGTATATGTTACCTGTTTTACATGTGAAT TAAATAGAGGCTTGGTTCTTTTTTACTGATTGAACTTGCTTTGTATAGAA AACATGCCAGAGAAACTCTGAAGCTGGAAAGCAACAACGCCATCCACACA CCATCGGAAGGAAAATCCATGCAAGACTAAAAAAGGAGATGGTACTATCT TTTTCTTTACACGTACTACTATTTTCATCTCTATATAGTGGTAAGCTTTA CTTGTTGTACAGGAAGTCAAGAATAAAGGTCCTGTCAGCAAAATTGATCT ATGGGATGAAGATTATAAGAAGAAGGATGGCAAATATACAAATAAAAATG TCCAACAATTGATGGTATCGTTTTTGTTCTTATAGTCTATTGTAGTCCTC TAATTTATGTTGCTTTCTGATTTCCCTTTTATTTGGAAGCATAAAGCTCG TAAGGAGTTAGCAATTCTTCAGAGGAAGAAAAATGGGGAGCTGTCACCAG AAGATTATGACAAAGTGTTTGATGATGTTATAGCAAAAGAGTCAACCATA GGTGGATACTATGACGAGAAGTACTGGGACGATGCAAAGTTATGTCAAGG TTCAACATCTGTTCAAGGGTCATCAAGTGAAGTCAGGGTTCAAAAAGAAC TTCAAGAAATGAAAGCTGATTTGAAAATAGTTACCGGATGCATGGAGAGA ATGTATGCTTTTATGGCACGAAACCATCCATATGAAGATTGGTTGAATGA AGTGATGGCTTCTGGAAATGAAGTTAGTACCTTGTTATGCTGACATTCAT GTCTATGTACTTTTCTTGTTTCGTCATTTACAGAACTTGTTCTAATTATA TTTGATAGATCAAGACTGGTGGCCAACCAGAGGAGGACCCAGCTCCTAGG CTCCAGTACAACAATGTATCAGTAAAATTCCTAGCTTTTACTTTTTCTCT TGAACTCCTAATATATAATATTAAATTACCATCCTCCATGGACCCCCTTC CACTCATAATTTAAGAAACCGGACGGTCATAAAACCGGCGAGGCTATCGG TTCAGGTTTTCACCGGTTGAACCACTGGTTCATTGTCCGGTTTTTTGAGA TGTAAAATAATAATTTTCCCAGTTTGAAATGTTATAATAGATAGATAAAT ACATGGAAAAATATTACATACTTTGCAATTTGGTATGTTCATTTTCATAA CAAAGCAATAGGCAAGAAACCAACATAGCTCACACCTCCCAGTCGTAAGA TTTCACAAGCATCAACTAATCAACATGCTCTGAATCTCTGATGCTCCCAG GTCTATAAGTATCTAGCAGTTTGATTCTAATCTCCAATAGTCTAAATCAT ACACCGAAACATTGAACGCTAGCACCTAATTGCAGTAGTAGACTTGAGTA ACATATACGTGCAGACTGCAGAGCATATGAGAAATTGAGATTGGAGATTT CAGAAAAAATGCAGTACCTAATGAGTGATGACTTGATCTATGTCTGCTGC CGGCCAGCGTTGTGGAAGAACAGCAGCAGACTACATGAGCTGACTGCGGT GGTCACGCGGGGCAACTATGCGGGAGCGGGCGTTGGAGGTTGGGGACTTG GGGAGGGGTCGTCCTAGCTGAGAGTTAAATTACTTGATGCACGAGGAGAA GATGTCCTAATGCTTTTACCTGCTGAATTCTATACTGAAATTCTTTAACT TGCTATACTTTTGCATACCAAACAATTAAGATCCCACATAGTTTTCTTAG ACATTGTTGGTGGTTACTGTGTTTGTAGTAATGTTGAATGGCTATCCATG TTTGGAAAATTATAGGGATTGTGGTCTTATATAAGCGTGATGTGCTTATA GCCCTCAATATTTCGAAGATTTAACTATTTGAACATATTTATTTTGAATT GACATGATTTAGTATTAGAGATAGAAAGGAAGCAAGCTTTTCATTTTTGT TTAGTTCACCGACTATCATTCCAAAAAATATGTTCTTATTATTCTTTGAT AGGTGAATGTCATCTCTGATAAAGTTGGTGGTGGTCATGAGGTTGATTGT GTTGAAGAACCCATGGATAATGTTCATACTACAGAAAGTGATCCAAAGGT TGCATTGTGGACCATGCTACTACTTCTATCATCATAGATGGGTATCATAA CACATTAATGTTTGGCTTTACCTATCTACAGAGTTAAATTACTTCATGTG CTTGCTATAAGGAATATTCTTAAAATACAAATTAGTCAAGTTCATTTAGG CCTCGTTCAGTTGTCGTTGGAACGAAACCATGCACTGGAGCTGAGGAACA CATGGATTTAGACATGGTTGATTCCAAGCTCCACCCAATCCCCTGACTTA ATCTCAGGGTTCCATTATCCCCGAAAACAAAACGACATGGCATCACATGG AAACAATCCACACGTCAAGTGGCGCGTATTTTTTTCCAGGCACGGGGTGA GGAAATTGGGTAAAATGGGTTGGTACAAAATTCTAACCAAGGATTAAACA AGGACTACGTATGTATGGGGTTGGAAAAGTTGCATGATCAGGCTGGCCAG CCAGAGTCGGACGGAAATCCAAGTCCACCCCGCTAAGTTTGGTGTAAACG AACGAGGCCTTAGTGTGTTTGACCAAATTGTGGTTCATTAGACATTGGAA ATATATTTGAAAACTTTGACTAATTGCAGGAAGCACAATTTGGAAACAAT CCTACATCTAAGGATCCCGTAAATAGAACTGGGAAGGCATCCACAATGAA GGAATCACCAGAACAGACTTCACATCAGGTATTTGTATCTTTTTTCTTTG CTGATTCTACATGTTGTATCATATAAAATATCTATGCTTCTTTCACTAAA ATAAATAAGTGTTTCTTTTAAGTGTTTTTTCATGTTTCTCTCATAGGTGA ACGTTTCAAAAAGAGCCAATAATGTTGTTATCCATCAGAAAGTTACTGAG ACTGCTAAATCCAATGAGGTTGTTCAAACTTTAAGCAAGAATACAGAGGT TCTATTGTTCGATGTCCTTTTGTATTTGGATTCTAGTTAAATGCACGTCT AATGAGTTATTCTTCCTCACTGAACATGTATCATGCATGGGAGATTAGGT TTCATTACATTGTATCTTAGGAGTCCACTTGTACTAACCATGCTTGGTTG ATAATGCAGTTTACACGCGCTATAGAAGATAAGATACATAGTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.