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GrainGenes Sequence Report: AA017136

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Sequence
AA017136
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017136
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAACAAACAGACGGGTAGAGCGGATGGTAGGGTCTGAGGTGACGATTGG
GGTTCACCCATTGCCTGCAGGGATTAGATCCGCGTGTGGATTTAATCCTG
TGAAACCGAACAAAGCCTAACTCTCCTGAAAAGTGAAAACCCTATCCACC
CCCGATTCGCCCTCACAAACCCTAACCCTAATCCGCTCGATGTTGTGATC
CCGGCGCGCTTGCCATGGCTCTAGAGGGACCCGCGGAGCGGCAGGACGAA
GGTCAGCAGGCAGGGATGGTCAACGGGAACTGCGCGGCTCCGCCGTCGTC
GCGGATGGCCGGCCGGCTGTCGGGGACAGCTGCGCACTCTGACAGGCGGC
TGCGGTTCAACCCGAACGCGGAGCACAAGTCGCAGGACTACACCGACGTG
CGCGGCGAGTACGCGCCGGCCATCTACAGCGCCCTGGAGCGCCACCTCCC
GCCTAGTCTTCTTGAGGCAGACCGTGACGTCAAGCTGCACTTCATGCGTG
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TTTTGTTTTGCAAAATACTAGGCTTGTTTTTGAGCTTTGTGACCAATCCG
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GTAGTTTGAATATACACAATTTGGAATAGGAACATTTGAATAGCATATTC
GTGTCATACTATATTTCTACTCATAGTTTTATGCAAGTTCGGATATTTGA
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ACCATATTTTTATTTTAATCAAAGAGGTAGTTGGATATTATTACATATTA
CTGGTATTTTCTATCTGATTGACATCCCTAGGAGTCTGTATTAACGTGGA
AGCAGTCCAGTGGTTAATCTGTTGAAAGGTTACATGTAGTCCAGACAATC
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ATCATGTCACTGGAAGTGAGCTTTTTCTTCGTACTTGGTGCTGATTTGAT
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TCAACCTTGCTTCTTTTAGGTAGAGTTGGCATTTATTCCTTCCATCTTCT
TAAGTTAGCTTACTCATTCATGTATTATATTTGCCACAGGTTCAAAGGCA
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TCTGAGTCCATTAATTTGGATCGGAGGGAGTACCATTTTTTGCAAGTTTT
TTTTGAGGGTGTGAAAAAGATTCATATGTTGCAATCGTCATGTATGACCT
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GAAGTGTGTGCTGGATTGGTAGAAGGCTCTTGAGTGCATAGGTGTTTGAA
GCTGCATAGATCAATAGTTGATAATCCATCATACCGTGTGAGTTTCATAG
TTAAGAGTGTTTTGATCCAGCAATTCCATATATGTGGGTGTAACTGTGTG
GTCTCCAATATTGTTGACCTGAGTACACAGATTATTAGGATCGAGCTATA
TATAAATGGGTGCAAACATTATTAGGATCGAGCTATATATAAATGGGTGC
AAACATTATTTCTGACCGGAGTACAAAGATCTCAATCTGTTAATTAAGTA
GAACAGAATTGCTCAGTTAATTCGAGGAAAACCGGCTGAAAACTGATGCA
AACGCCCAAAGACAGGGCACCCTTGGCCGTTCTGGCCACCAAAGCAGAGC
TGACACACACCACTTAGAAACCGACCATCGAGGCCGTCCAGCAGCATCGT
CAACATCACCTATCATAGGGATGAAAAAAATGGAGCTGAAGTTTCCCATT
TTTTCCGCGGAAAAAGGGAAACAGAATGGAAATACGGAAATAGAAACAGA
ATTTTGCGGAGCGTAAACGAAAATGGATATTTTTATGCGTAAACGGAACA
GCGATTTCCAGCGGAATCGGCATGAAAACGGAAATTCCTTTTCCGGCTAA
TGTGGAACTTTCCGTTTCAGGGTTGTTGTGCATGGTCCAATCCAGCAGCA
GGCCCAATATTAAACCCTGTCAAGCCAAACTAGCTAAGGAGCCCATCCCA
AAACTGGCGACCACCGTAATCCCTTGGTGCGTTCGAGGAGGCCTCTACTG
TTTGACCCTTCCCTGTTCCCCAGTACATCGATCTGTTTCCTACAGTATCT
GTTTCCGTTTTTTTTTGTATTCGTTTCCGCTTCCGCAGAAAAATATGGAA
ACAGATGTGGCACCACTCAGTTCCATACATTTCTGCTTCGTTTTCATCCC
TAACCTATCGCCACTATCTGGTGACTACGACTTCTTTTCGGACAACCATT
AACACACCAATCATCGCAGAGGTCACCAAATCCACGACGGCCCTGCCAAA
CAGTCAACTAACACATTGGATCGACGCCTTGAGGACAAGGCTGCTCCAGT
TTTTCTGATGGAACTTGCAGGTGAAAATTTACAAGCCTTATACCTAGGCC
TGTGCATTTGGTTCATTTGGTTTGGTAAATACGGTATTAGTTCTTCGGTA
AATTTGGTGCAGAATCAAAATATGGTTCAGTTTCAGTATATGCCAAAGTA
TTTCGGTATGGTCTCAGTACGTAAACTAACCAAAGTTGACGCTAACTAAG
AAATAAACCAACAACATTTTACTTTCTTGTATATCTAAATACTTTGGAAA
ATAATTCAACATGTATAAGTGAACTGACTTGCAAGTCATGAGTTGTGAAT
AGCACACTTGTAGACTGTGGTACAACCCTATTTTTTTTGTTGAGGGAGTA
GTACTTACCTAGTAATTACTACTAATTAGTAAAATCATATGTGCGTGCAT
CAGTGCACTACCGAGTTGTTGCCCAGACTTCCCTGTGAGGGATTAGCCCA
GGACAGACCCTTACCCAGCGTGTCTTGTCTAGCCAGCCAGGATACTAGGG
GCTAGCTTTGGGCTGGGTCACAATAGGAGATTCCAGCCCAGTATGCAGCT
AAACTCCGAATATTTTTGTGCATACCGAACTACTTGATGCTAGAATTGTT
ATAAAACATTCATACCATACGAAAAACAAAACCATAATAACCAGAATTCT
GGTTCTGTTTGGTTTATTTCGGGTAATTTTTTGGTTTGGTTTTAATATTC
TCAGGCGTACTTGCACCGACTTTACCCATGCAGCAACTGGAGAGCTACCT
GCTGAGCCACCCTTCGCGAGCAACTGTTGCCGGACTGCATGACTTTCTGC
AACACACTGAGGAACAACAACCAGAGACACCCAACTAGCACACAGAACTG
CCATAGAAGGCCATGTGGCGAAGCAGCTGTGCTCGCCACCATCGTTGTCG
CCGCACGAATCGCAACACCACGACGTGGACAAGCCACCACCTGGAGCTCC
CATCCAATCGGTGTCAACTGCAGAAACGATGGCCCATTGAGATAGGTTAT
GCTTGTGAATGACCCAAGTACCCTGATACATGGGCTGGCAGTGTTGCCTG
CCAACATATTGTGGGATTCTTTCTCGATAACGTCTCAAAGTCATGAGAGC
TTGGGCTGTAATGCATATATTGCATGGTCACCGGCAGATTGAACTCTTGG
CTGAAGATCTGGTGCTCGAGCCTGTAAGACAATGCCAAAGTCTTGTCTTG
CCAATTTTGTAATTTGATCAATTAAATAATTTGGCCGACCAAGATGCTAT
GTTTTCTTGCTTGAATCCGAGGACATTCTTTTAATGCTTAGTGGGCTAAA
AGAATGTCACTGTTCACAAAGGTGTATGAGTATGATTGTGTAGTTGATAC
TGGGTACTATGTGCAACAGAGCTCAACATAACCTTTTGTTGGATCTCATA
AAATCTTTTCAAATGCGTATAGTAATTTTGACCATGGCTTTTATTGTCCA
GAGGACTGTTTCTTCCCTATTTGCTTGTTTGTAATTCACTTCTTTTGCTA
CCTTGCAGCCACTTCATGAAGATTTATACAGCATGCATCCTTCGGCTTTC
TTCTTACCAACATTCCTTGAAGCAGTAAGAACCAATACAGAAGAAAGCCT
TGCAAGTATAATGACCGAGCCAACTCCTGGTGTTTTTTCATTTGCTATGT
TACAGCCCAACTTCTGTGACATGCTGTTGGAGGAGGTATGGTAAAGTAAC
TAATACCCACTTCAGCTCTTATGGCAGGTTTGTTAGCTTGTCAAAGCAAT
TATTTAAACCTTTGTAGGTAGAGAACTTTGAAAAGTGGGTCCATGCTATG
AAATTTAAGATAATGAGGCCAAATACAATGAACAAGTATGGTGCTGTACT
TGATGATTTTGGCCTGGAAGCTATGCTGAACCAGTTCATGGAGGGGTTCA
TAGCTCCAATTTCTAAAGGTTATTTGATTTACTGCTGTGTTGTTGTAGAT
TGGAAGAAACGGTCTTGGGTTCATTGTTTTTACATATCCATCCACATTAA
TATTATGTTCTTTGTGTCAACCATCAGTTTTTTACCCTGAGGTTGGTGGG
GGAACATTGGACACTCATCATGCTTTTGTTGTTGAATACGGGAAAGACAG
AGATGTTGAACTTGGTACGTTACCATTATCATATCCAAGGGTGCTGACAT
AATCTTTTGACGTTCTCCATTCTTTAACTGTGCATATTAATTTCGTGCGA
AGGTTAAAGAAGTGGAGATACTATTTGTATCAGCTTCAGAGCCAACTTCT
TGGGCGTTTTAAGTGTCTGCTCAAATGAAGTAGAGGCTAGATAAGAGATC
ATTTTGACCATTTCCGAAACTTATATTAGCCCTCGCTGTCAAATGTGAAT
GTCAAACTTATCTGGCTAATATGCACTGATACAATCTTCCTGTGTATATA
CTATTTATAATGGTTACCATCACAGTGATCATGCTCTGCAAGAACTGTAT
ATATCCAGTATAAAAGTTGGTGCCCTCAAACTCTCTCAGAGCTGTTTTAT
GATTTTGGTGTTTCCTGCCTAGTGTATCAGTGAAAAAATATGCCCTATAT
TTTCAAACTGAGATGTGTGAGCTGTACCAGAACTTCCATTCCTTTATTTT
TTCTCCATTTAAGAATATTGTTTCCTCTTTATGTTACCACACTATTGTAG
TTCCTAAAGATGTTTGTGATTGTAATGACACTTCCAGTAAGACTACTCCC
ATCTGTTTTGCCACCTCTGCCTAGAGGTACCTTCAAAGCATGTCAAATGC
CTTTTTGATGTTCTAAACTGTTATACTTGCTCTTGCAGGTTTCCATGTCG
ATGATTCTGAGGTTACGTTAAATGTTTGTCTTGGCAAGCAATTCTCTGGC
GGTGAATTATACTTTCGTGGCATCCGTTGTGAGAATCATGTGAACTCGGA
AACACAACATGAGGTAGTGTTTTGTGAATATTGTGACCTTCCACAGTTAT
TGTATTTCTTAATTTAAGGTTTTTGGCTCTTTTGTTTGGCCATGCCCATG
CATGATGAATATTTTCTGTTGTTGCTGATACTGATTAATCTGATTGCACT
ACTAAAATTTTCTCACATGGAATTTGGCATTAGCTGTTGACAAGCTAGAG
AGTATTGTTATAATGTACATAAAAATCAATATATAGAGTACTTAAAAATC
AATATATAGGCTATGCTTTACTTTTTCTTCAAGAAAAATTAGTGTATGCG
AGGAAGCAATATCTAGTGTTTCAATCAAGTGTCCTGTTCCTGATTTTTAC
GGCAGGAAATGTATGATTACTCTCATGTTCCTGGACGAGCTGTACTTCAT
CGTGGCCGTCATAGACATGGTGCTAGACCAACTACATCAGGGCTCAGAAT
GAATCTGCTTTTGTGGTGCAGAAGGTATTCAGATCTCTCCTTACAATTTC
AATTTGTCCAAGATCTCTGAGTGACTTCTTTTGGATGTTGGATGTGATAA
GCACTTGCATTTAGAGAGAGATATATGTATTGTATAAGTCTTTTTGTATT
TTTGGATTATAGGTTATCTCCCATACTTGTGTATATATATATGCGCTCTA
CAGTCTTTGCTTCTCTCATAACATGGTATCAATAGCAAATTAGGTTTTTG
AAAAAACAAAGTTTGCTACCAACTCACACTTCATCGCTATGTCCGACCAC
CGGCCGGCTCCTCCTTATGCTGCCCGCCAGCTTCTAGTTGCTGCAGTTGA
TCGAGTACTCTTGTTCTGCTCTCCCCCCTCCGATCCTATAAATTGAGTTT
GTCAAATCCGATTAGCTCCATGCCTCCCTTGTTGCCATGCATCTGTCCTG
AGCTGCTCCTGCCGTAGACTCTCATGAGTAACCGCGTTGTCGCCGCCTTC
TAGCTGACTGCGGCCACTCGCTGGAGCTCCTCCGTCTGCCGGCCAACCTG
GAGCCTCTGCTCCTTGCTGCAATTCCATGACTAGGGGGAGCTTTCGGCCT
TGCTGCGTGCTGCTTGAGTGTTGTGACCGGTACTGGTAGAGAAGGGTACC
GGGGATTATTGAGGAGAAGGGTATTAGAGACTCCAGAATTATTGATTGAT
TGCTTGACTTCCCAGTACACGCTACTTCTCCTTAATGGGAGATGGCCCAC
ACTATTACAATGACACAATCCTGCACGGGTACAACTTGGCTCTAAGCTGT
ACCTATGTAGACTCTTGGCTGAGACCTAAGCTTGTTGAGAATAACCCACG
TTAACATCTCTCCCCTGCTCGATAAGCAGCTCGTCCTCGAGCTTGAAAGT
TGGATATTGCTGAACGAAATCATCAAAGGGCTCCTAGGATGCTTCCGTTT
CAGATGAACCAAGGCTGATGAGGTCAAACTGTTGAGGCTGTAGGGATGGG
CGCCAGGGGGGGAAGTACTAGAAAGGATGGGCGGGCTGAAGCAGGCATGC
AGGACGTTGTAGATGCATCATTGGCCGGAAGGTTGTGTACGCCAGTTATG
GGCCGCTTCGTGGGCCTGTTCCCATGCTGGCTGAGGTATTGATGGAGTCA
TGTCGGTGCTGGCGTTTTGATCTGAAGCAGTCTTAAAACCACCCATAGTG
GAACCTAACACCAAATTGGTAGCATGTTTGCTCCTTATTGCAACCCCATG
TGCAAGGGAAGCTTTTGGCCCTACTGTCTGCTGCTTGGGCACCGTGGCTG
TCACTGGTAAAGAAGGATATCGGGGATTAGGGTTTCCAGAATTATTTATT
GATTGCTTGAGTTCCTGGTACATGCTACTGCTCCTTATTGATTGCTCCTT
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GGGCACCGTGGCTGTCACTTGTAAAGAGGGATATTGGGGATTAGGGAGAA
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CGCTACTGCTCCTTATAAAGGAGACGGGCTCACACTGTTACAAAGGAAGC
AAAGACTGAATTGGACACAACTACTAGATGTATCCCACTAGGACACAATC
CTGCACGAATTGGCCCTAAGTTGAACCTAGTAATAAGATAGATCACTTGC
ATATATCCTAGCACTTTGGTTGGCATCAATGTAGAATTGGCTAAAGTTGT
ACTCCCTCCACGTGGATATGTAAGTGTTTGGCTAAGACAAAATACATGAC
ATAAAATTATAAGAACATCACATTTAACATGGCAATTTTCAAACATATTA
TTGATAATTCATATCACATAAACCAAACATGAAAAGAGTAATTTTTGGTC
AAAGCTTTGTCTTAATCAGACAAATCATGCCTTGCATTTCCAGGCGGATG
GAGGGAGTACTTTGGTTACTAGTTTATTTGTTGCTTGTGATGTACATCAT
GCCCAAAAATAGAAACAAAAATTATTCCCTATGGTTCAAAAGTCTTGTTT
ATAGTGTCATTGAGAAGTTAGGAGATCGTGTGCCCAACACTTCAATGTTT
CCTAGGCATTTCAGAAAGTAAGTTCCTTGAAATTTATATAGCATTGCTGC
TCATAATTTTTGATAAAATACTTGCAATATTTTAAAATGGAATAGCAACT
TAATATATCGCATGAGCTCTAGAGCGACATATGTGCATGCACATGAGAGG
AGGCAAGGTAAGGTAGGTATCCTAATTCAAAAGGAAATACATCATGAGAG
CATACTACAGTACATCTATCTCTCTTGACACCTTTCGCTCAAACTCATGG
TGAAGGTGGCTTGACAAAAATAGAAGCTGCCGCATGGAAACCACTGCTCG
AACTAGCGAACAGAAAGGCTGGTGTACCGGGCTGCACTAGGGACAAAAGA
ACAGAGCGCAGTGCTGCGGACGACCTTGCCCCACCTGCCCCACCACCATT
CTCCTTCCATTTGAAGTCCAATTTCTCCACTTCATTATTCCTCAAGTGCC
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GCGAGATGCTACAAGCATGTAGCACACAGCCAAAAAGGTGAAGATGAGTA
AACGGATGTGCTGCCATGAAGTCGCTCAACTGGAGGGCAGAAAATGGCTG
AATATTAGTCAAATATGTGGCGCATGGTTTTAAAGCGTTAAGACGTCTTA
GAGCGGTTTGGGGGCGCTTTGATGCCTAAGCGACGCCTAGGCGGGCGCTT
CGGAGGGGTGCGCCTCGATGCCTAAGCGACGCCTAAAGCGGTCGATTTTC
CAAGGCGGAGGGGTGCGCCTTGACGGCTTCAAAACCATGATGTGACGGTG
GAAGCAGTACCAGCCCGAGAAATGAGCTGAAGAGCAGAAGCAAGTTTTGG
AGCACATGCATTCAAGAAGATGACAGTGCGTATGCTCAACCACTGCATTC
TAAGCATGAGCACCAGGACAAGAAAAATGAGGGTGTCCTGCATAGAATGA
AAGCTACACAGTGCTCTACAAAATAATCTCCTCAGAATTATCATTAATAG
GAGTGTCAAATCCCTAAAAAAAAGGAGTGTCAAATCCCTAAAAAAAGGAG
TGTCAAACTGTAAGGATCATTGTAGCAAAACTCCTGTGGCCGGATAAAGT
TTCAGTAGGGAAGACATAATCTATCGGGTTGTGACGATAGAAGTCATCTA
TAAAAAGTACATCCTCTGTTCTGAATTATAAGTTCTGGCATTTTTGAATC
TCTTGTTATATAGAGACGTGTTAGTGTGTCTGTTCACTCATTTCAGTCCG
TTTCTAGTCCACATTGAAATATCCAAAACATCTTATAATCGGAACAGAGA
GTGCATAGAAAACAAAAGAAGGTTTGTGAAGTAGCACCTAATTTAGATGA
CATGCGGACGTTCTTAGGTTTGTGAAGTACTCCCTCTGTCCCGTAATATA
AGATGTTATAAGTACTCTGGCCTGTAAACATTATGGGACGGAGGAAGTTC
CCAAGATATTACCATATTTATTCTTTTTGATCATGTGGCACTCCAATGCT
GACAGTCATATAACTGTTGCATGTCTACTGCATGCCCAGGTGGTGGTTCA
AATGAGAACCCAAAATGCATGCATGCCATCTCTTAACATTGTACTGTATT
ACTTTTAGTTCCAGTTTGTTGGTATTAACGTTGGCCTGCCATGCATAGTT
TAATTAGTGCTTCCTGTGTTCAGCTCTGTGTTTAGAGAGATGAAGAGATA
CCAGAAAGATTTTTCTAGCTGGTGCGGTGAGTGCCAGCGTGAAAAGAGAG
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ACACCAGCTCGTATGGTGTCCATTTAGCAGCTAAGATCCTGTTATTTAAC
TTGCACTTTTCTGCTTTTCTTTCTTTCGAGCAGGCATTTCTTAGGGGTGG
TGGAGGTGGAATGATTTAAGTCATCTCTACCGCATGTATTTTTATAGTCG
TATTTAAATATTGTCTGATCATTTGAATACATGTGGTTGCCGTTCGGTTT
CCTGCATGTATGTTTGTCAATGTCATTGCATCTTTTGTGTAAATCTAAAT
ATCCTGCCACAAACCGGGTTATTTACATTTTTTCTGTTTATGATCTTGAG
CGAAAAATAAGAAGCACAACCTGTTGTGGTTTAAGCCATGGGTTGGCTTG
ATCTTTCCTGGTTCTCGAGGGAAGTCGGGGGATTCACGAGGTAAAGGGGG
AAAGGAGATGGAATTGAACTCACGCAAAGCAAGAACATGACGAACACAAG
CAATACCCAACACAATACAAGCTGACGGCTCACTCCGGTGGCTACTAGGC
CAATACAATCCCAATACATGCGTGGGGATCGGTATTGAAAAAAGATCTCT
CTCAATCCCAATCGGAGAGGTTAAGAGCTTTGGTGAGAATCTCTTCTTGA
AGAGAATAACTTGTACAACTTGGATGACATGTGCAAAGTCTAAAGAGGTG
ATGATATAGCTTTCGTAGAAGGAAGATGAGACCAAAATTAACAAGGTTGG
ATCTAGTGCTCTAGTTGGCGGTGCTAGAGCTGGCGCCGGATTGAAAAGTG
CGTTGTGACGGTTCAGTTGGTGTGCTAGTCTACGAAAAGATTGTGTATTT
ACAACTACAACGGAATAGTATATAAAGTCAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.