Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA015083

[Submit comment/correction]

Sequence	AA015083
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA015083
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCCGCCGTTGTGCCGCATGAGGTGGCCTAGCCTTCACCATCCTCCGC CCTCCTGGACCTCAGTTTGTTTCATTTACCATGAGTGATTTCAGAATGGT CCTATAGTATGTAAGAAGATCTTGTTCAATATGTTCTATTCTATAGTGTT AGATTGAGTCACATATACACGATATACAATTCTGGTGGTGCTAATTTTTT GCCTAATTGTTTTTACTGTGTAGATTATTCGACAACTACATATTTCCTGA ATTAGGTTCAGGTAATTCCTAGCATTATTTTATTTTATGCAACTTTACTC AATTCCAACCTTTTATGTATGTAAAAACCTATTTTTGTTTTGATTCATGT GTGCTCTTACATCTCCTCCTCTGCTTGAGGGCAGCCATTGCTGGAGCGCA CAATAGCTGAGATCATCACCACAAGAAGTAGAGTTTGACACCCTGAAGCA TACTAGGTAAAAGTTCTGTGAATACAAGTGTTAACCTACTTGTTTGTGTG TTGTGTGATGTATGGGTAAGACAAATAGAGCATATTTTGAACGGACAAGG AAAATTATATGTCCATGTTCTGTATTTATTGGTTATCTAAGGATCTGTTC ATTTTCTCTCAGATTTTCTAATGTGTATGCCCAGACAAACACAATCTTCA TTCTTCAGTTCACTGCTATCACACGGAAAGAAGGTTATTCTTATAAATTG GCACAAAGAAATCAAGGCCTCCCTTTTCTTCTTAGTACTATACCAATTGC TAATTTTGAGTGGACAAAGTGAGGAAATTGTAGGCGATTACTACCAAGGA TTGTTATACTATTTATCTTACAGAAGTTGTTGTCTGCTTGCTCTTCCCTT CCATTGTTATATTTCTTTTTTGACCTGGATTGGATCTGTGTCATCAAAGT TCACATATTTCCCACGCTACCTTTTGAGATGCATGATGTGGCTCCTTCTA ATTAGATTTTCTTTATCGTTTTCTCCATTGTTTTAAGGCTATTTTTTTGG GTTATCATGAAATAGCTTTCACATATGGTTATAATTGTTTGTAGGTTGAG CTCGCTTTGTCCAATTGTTTGCACCTCTCCCAACAAAGAATGCTGAAAAC CAAACGTTGCATATAATGAAAATTATCCGATCAAGAAAATAATAATTATT CTTTCCTGCGAGTTATACTTAGAGGTCGTTATGTCGCTATGATCATTCAA GATTCAGTATAATTCTGAATATACTAAGGAATCAAAATTATTAACTACAG AATGTGCTACTCCGCCATGTCAGGATGCCCTCCATGTCATGGGCGCGACT TCACAGGAGGTTCTGTATGTGCTACTCTGCCAGACCCCACCAATTGATGA AATGACAAAGGCAACACATCCAGCACACGTGGATTCAGGCTCCCAGGTCA TCAAGGGTTGCACAATAGCTTCAACAATGCTGCCAAACCCCACATGTTGA TGAAACGCAATGGCCACCTCCAACATGATTGCCATTGTTTACTGTTTCAA TGTTTGTACCTGCAACACCTGTGCCTTTGTTCTACTGACAAGAGGTTTCT TCCATTGCCACCACACGGCCTTATTGATGTTTTGAGTTCCTTTGTTATTC CTAACCTGATTTAACCACGTTCCTTCTTTTTCCTCTCCACTCCAGGTGCA GATCACGACCACTGAAGGCCTCGTCTAATTCTCTGGCAAAAAAGAACTAA ATTGTGAGGCGGAAATCGTATTCTTAAGGTAAATATAGCATGAGATGGTG CTCATGGGGTTCCCACGTTTTGGTCATCCGAGGCACATGTTTAGGACATC TCCTAGCTCGGTGCATCTAGACAGCTCTACTACTATCACAAATACTTTAT CATGGATCTATCTACTCGCTAGTGATGTATGCAAGTTTGCAGAATTTTTG TTTGCAAGCCTGGTATGTTGATTCCTTGATGACATGACCATGAGGTGAGC AAATATATTATATTTACTTTGTATCTACCAATTCAACTATTTTCTAAATA ATCAGTGGTATAATCAAAATCTTGAAACCGTTATGTGAGAAGAAATTGTT CACGAGCATGTAGGCCATACAGGTGGCACTAATAGTGTCCTCTTGTATTG GGACTATTCTGGCTTACAGTCTGTTGTGGGGTATTTTCTCCCAGTACTTT ACATTGTCAAGTAGTAATATGTAGAACTTAGAACAAAGATATGTTACTTG ATTCATATGCATCTTACTTCAGAATTGATCTTACCCAAGTAGTAGTGAAT GGGACATAATCGTGGATTCGTGGGTTTAACTTTCAGACTCTTGTGATGCC ATCTGCCTCAATTTCAACTGGCATGTGAAGGCTATTACAGATATTTGTCC CTCCCAAAGTTTGTCATGAAAAAAAATCTCTGTTTGTACACGGTTCTAAC TTATCCGAGTGCACTTTATGTATTAGGCTTAAGAAACTTAATAAATTAAA GAAGCGAAAATTTTAAGAGATTTTACATAATTAGATTAGAATGGTGCCAT TGAGGTGGTATACATGTTTGATGTAACTGATCTTTAAGAAAATGCCAGCA TGTCTGTTTGTTGCATTTAGTAAGTTTTTACTAAATGCTTTCCGTGTGTT GCTTCAAGATGCAAAGATATTACACTCAACTTTTTATATCCTGTAGATAA ATGCCTTATAAAAATTATACCCCGTGTATACTAACTACCTCTCCATAAAG TGCCGCATGGAGATCAATTATCCTGCTCTGGAACTGGCTGAAATCGAAAA GAAGTCTTGCGTGTCTGCTGGTTCATGTTGTCCTTAGAGGAACTGGTTCA TGTTGTCCTTATAGAGGAACTGTGGTGCAAGAAGACTTCAGTTACGAGGG AATGGCAGCTGATAGGGAGCTAGCACGGTGACAGTTGGGTTCAAGTTGTT TTTAATGTATATACCCTGCTGTTTTTTTCTTGCTTCCATCCGTCAACTAT TAGTTCTCATATCTATTTGGTAATATTAAGTGGGATCCCTATTTATGCTT TACAACAAGATTGGTAGCTCTGGATCCCATTGTATATTGTTTTCCCTGTT CTGTTGAGATCAAAACTCTGCTAATTTCACCATTGCAGATTTGTGTTCTG TTGAGATCAAAACTTCTTTAATTCCACCATTGCAGGTTGTGCTCATTGGT GCATTATTCAGCCGAATGGGGGTCAAATGGGTTTGAATTGGTTTTTCTAT GAAGCATGAACTCATGTGAAATTTTACTATGAAACTATACCTGTCCTAAA ACTGCAGTAGAATGTTTTCTTGTGAGGTTGTACTCAAATGTTCGTTATCT TTGCAGTTTTCTGTGAAGCATGCACGCTAATAGAAAATCGGATGTCACAT TGTCTGCAAGATCATGAGGTACGTCTCTTCCTACTTCACCTATGATTGTT AGGCTGCATTCCCTACTCCTTATTTTCTCCTTTGTTATTGAGTTAATTTC TGAACCTTCTCTGTTGATATTGAGGCCGTATGATAGGGTGGAATAGCAGT GCATGCCACTTCTTGCACACAAGTTGGTCATATATTTCCAAAAAAATTGG GTAAGCCATGTTTGCACACATTGAACCTAATGAATCAAATGAGAGTAGTC TGCATAGCTCTATGAGAATCTAAATAGCTCAAAAGAACTGAAGATTATGT CATTTTGATGAGAACTGAAACGTTCCATAGTTCCAGAGTATATGATTAAC TTGAATTTCCAACATTAAGAAATATCAGGCCTTCTGAACAGAAAGCAGCT CATGTATCAGTCAGATGAGGAACTAAGTAAGCAATAGATTGGTGTAGAGA TGAAAAATATTGTCATCCTTTTAAGATGGTATCACGAATAAGTTAAGTCA GAGGGCATCGTACACATTGGAGTGGCTCACGCGGCAAGCCCTCCGTCCAT GGCTTACATCCGTCGAAAGACCTAGGTCATTTGTTCCTCCTTCATTTGTT CATCTCCAGTTCTGGAATCAAGTTATCACTCTGCCCTGCTTCTTGAAGGG ACATAGCATGCAAGGATGCCCTTGTGGCCAAATATTTATTTCAGAAATAA CGCCATGGGCTTTGTTTGCGTCACTACGGTTGTTCATTGTAGACCAAATC TAGATTTTTCATGCTGTGCAATGACCTCTCTGATTCAGTCTAACAATTCA GTCTTTGAATTATTTACCGTTAGTCTTGAGCACATGTGTTTATACAGGAG AAAAGCAAATGATTATCTATGTGGAAGAGATCCGCAAGATCAATCTGGAG CTGGGATATAAGGAGGGCACGAAATATCACAAGCAGCTGCGTACTATCGC GGCAAACCTGGTGTTAAGTATCGATGAGAAATCACACCTGGTGTTTACCA TCACACCTGGCGTTCACCCAGGATGGTAATGAAATTGTGGTGACATAGAA GGTATCCCTCTCAGACATCCTGACGGGGTACATGATGTACTGATGATACT AGACACGTGCATACTTGTGTCAAATGAAATCTTTTTTTACTAAGTTATCT CTCACATGCATACAGATGAAGCGAAAGTTCTAGATATGCTTATGTTCTGT CCGTTTTCACTCGCAAGAAAACTGTCAGACTTGACCTATGTCCGAGAAAC AAGTAATTGTGTTAGTATCTCTCGGTGAACTATGCATTAGTATATAATTC TCTGTGAACTATGCATGCTTTTTATTTGCATTTCACAAAAGTAAAGCAGT GTGGCAGCCAGGGAAACGTTCTTAAGAAGTTTAAATTCGTTTAAGTAAAC AAAATTGCAACTTTCACTTTAACCATTTCGTAGTCTGTCATTGGCAAATT CAGCTCTTAGGCTCCCAAATGTAAACCTCTACTGTCGACTCATCGTTTTG AATTTGTTCATATCGCTATTAAATTATAATCTCATTTGAAAATGCATATT AAATTTCAGTCTGATGGTATGACTATCCGAACATATTACGTATTATTTTT CTTTACCTATAATTATTAAATTGATTTGAATTCAGCGGGAACGTGCGCCG AGGCGCACACCTAAATCTAGTGAGATATTGAGCTCATCTCGCAACTATTT TGTGTGAAGACATGTCTTTAGGTTGTGTGTTATATGTGTGCTTACATTTT GAGCACGTTTGACTGAATCGGTATAAGGTTAAACATAAATGAGATTTAAA ATAGACATTTTTGTTATACAGACGTGCGTTGCACGTACACGCTTACTTGT CTTCAACTTGTCATATTTATGTACTTGTCTTCAACTTGTAGGATCTCACG ATGGAGCATGAGCTTGTGGAGCACTCGGAGTTGATGATCTTGTAATATTT GTCTAGTTTAGGTCGTTGGTTATGCACTTGGTAGTATTTGACACTTGTGG CAAGAATAAACACTACCATTTGACACTTGTAATATTTGTGAAATCTCTTA CTTTCGTGGTGATGATGTTTGCTAGTGTTGTTGATGCATTTTGGTGTTGG TGATGATTATATTGTTGTTGTTGATGAGTATATTATTGTTGTTTATGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.