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GrainGenes Sequence Report: AA039910

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Sequence
AA039910
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039910
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTGACACAGCAGAGCACAAATATGAATGAAGAACAACATCAGCAATG
CGGAGCTAAGGAGAAGGGCAAGCAAGTTGGGGATTATTGCATGAAGGAAG
ATGAAGATTGCAGGGAGGAGGACCATGATGTAACTGAATCAGATGATGAT
GAGCTGAACCAGACCCTGGATGATTTCAAGAAGAGGAAGAGGTGGGAGTG
GGATTCAGTTTTTGATGCACAACAAGAGGCGGGTGATATTTTCCATGTGT
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TTTGAACTAGATCCAACTTCTGGGAAGAAGAAAGAACCAGTTAGGAAGGG
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CTTGGGGATGGTAGGGATTTGATGAGTTCTATCATGTAATCGAAGAAGAT
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GTGTTCACGGAGTGTTAATGCTTTGCTTCGGTGCTCTATTAAAAGGAGCA
CCTTAATTGCCAGTAGTTACCTAGAGGCCTCGCTGCCACGGGTTGGCTGG
AAAAAAGATGTTGTGCAAGTTCTCATTGCGAGCACGTATGACTATATTTG
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CCCGTCCATCCATCCCTATGCCTACCGCACTCGAATCCCACTGTTACCGT
TACTGTTACTATTGCTCCTGTTTTGCTGTTGTTGTTGCTTTGCCGTTGCT
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AGGTGCAGCTGAACTGACAACTCGGTTGTTAAGGCTTGCAAGTATTCTTT
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ACATGCTACACACACTGCTACTACTGCTGAGTCTGAAACTGCTTTTGATA
CTCATGATGTTACTTCTAATGTGCTTGATGTGAATGTTTCATTAGTTCCT
TTTCTAAATGCTACTATGGCCAGTCTAGGAAATACCGAAACTCCTAGTGA
AGACATTGTTACACCTGTTAGATCACCTGAGTCTAGAGAGAGTTATGATA
TTAATGATGGCTACATTGAGTTCACTGATGATTTTGTTGAAGAGTGCCAA
AACACACATGGTACTAGCGCTATTAAGAGCCTCCTTGCTAGACGTACTAT
TATGCCTAAGTTGTCCTCTGATCCTAAGTTTGCCACTTCTCCCATAGATA
TTAAAGATAAAGATTATGATTTCTCTCTTGATTTATCTTATTTAGATATT
TTTGAGAAAGAACCTTTTTGTGGGACTGAAAATGAGAGTGTTGTGGCTCA
TATGAATGAGCTTTCTACTATGTGTGATTTATTCTCTGATGATTTTAAGA
TGCGCAAGTACTTTGTTGCTAAGATCTTCCCTTTTTCACTAAAAGGAGAA
GCTAGGGCTTGGTTTAATAGATTACCTCCTGGTTCCATTGATAGCCCTGA
TTGTTTGATTGCTTCTTTCTTTCAGAAATATTTTTCTCCCAGTGCTAGAC
ATGCTGCTTTGCAAAGACTTTTTGATTTTGAACAGGGAGAAGAAGAGAAA
TTACCTGAGTCATGGACAAGGTTCTGTGCCTTTATTCATGCACATCCTGG
ATGTCCATTACCTAAGAATGAACTTCTTGATATTTATTATAATGGACTAA
TTTATGATTCTAGGACCTACCTAGATAGCTTTGTTGATTGTGTTTTCAGG
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AAGAATTATGTAAGCCAATTCCCCCTCTCATCCACTGTTGAGGTACACTC
TCTCCAACACTCTGATGAAGGTGATATTCCTTATGGTAAGCCTCCTGATC
AATGTTTAGAGGAACTTGACATTTTTATTGTTAAACAAGGTCATTTTAAT
AAACAAGTTCAGAATCATTTATTGGAAAACTCTAGAGATATCAATGAGTT
AAAAGACATTGTGGAAAGGACTTCTAATGATATTAAAATGCTTTGTAAAC
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ATATGCTAGTTAATGCTTCAGGAGATAAACATGCTTATGGAATTAAAACT
AGGAGTGGTATAGCTACTCAAGATCCTTTATACCCTGAAGGACACCCTAA
AAGAATTGAGTAGGAATCCCAACAAGGTGAGAGTAGTGGTAGTCCTCGTA
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GTAGATCCTAATAGTATATCTGTTTCTGATGCTGAAACTGAGAGTGGTAA
TGATAAAAATGAGTCTCCTGATAAGGAGGAAGGTGGGGAAGAACCTGATA
AGCACACTAAGAACACTAGGTACACCAAGGAAGATTTTATAGCTAATAAA
CATGGTAAAGAGACAGAACCTTGGGTGCAGAAACCCATGCCTTTTCCAGG
TAAGAAACACAAGTCAAAGGAGGAAGAACACTACAACAAGTTTGGTGAGT
GGATGAAACCTTTATTTTTGCAAATTCCTTTGACTGATGCTATTAAATTG
CCTCCTTATTCAAAGTATATGAAGGATATTTTATCTAATAAAAGGTGATT
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TTAAGAATAATTATGTTAGAACTGCTTTATGTGATTTGGGAGCTGGAGTT
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ACCAACTGATATATCTTTGCAAATGGCTGATAAGTCAACTACTATTCCTG
TTGGTATATGTGAGTATGTTCATGTTCAAGTAGCTCATAATTGCATGGTT
TTAACTAATTTTGTTGTGCTTGAAATGCCTGAAGATGATAATATGTCTAT
TATTCTTGGGAGACTTTTCTTAATACTGCAGGTGCTGTCATCAATTGTAA
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TCCCCAAGAAGGTTGTTAAGAGCTATTGCCTGAATTCCATTGAAAATATT
GAGAGCATCAAGGTTGGAGAAATATATTGTCCCATTCCACAAGAAAATTT
TGAAACTATTATGATTGGGACCATTGCTATCAAGTATGAGGTAACATAAT
CACCTTGTGTATTGCAAAGTTTTATTTCATATAAGATTGTTTTGGTAAAA
AGACTTGATCAACCTTGTTAACAAAAGGATTTTTAATGAACAAAATAATG
TTTTCACGGTGGTTATACTTTCTTTCTTTTACTTTTCTCCTTCCTAGTCT
TTGCCTTTCTTTTGATAGCTTTGGTTTTGTTAGTTGTTTGTTTGTTAGAG
TCTCTTAGAACTCCTATAGTTTGGCTTTTGGTTTGCTTTTGCTTCTTCTG
AAAAAACTGTTTCTGCGAGAAAATCAATTTTCATACCCTGAAAATTGGCC
AAAATAAAGTTTCCCGAAAAATCCCATAAAATTCAAAATAAATTTTTCCT
CGAAAAAAGGGGTAGAGGGACATCTGGAGTGAACCAGGGGCCACCCCAGG
CCACCACACCCATGGTAGGCGCGGCCTACCTGTGGGTGGCTCCTGGGGGC
TCTGGCCCACCTGGGCCCCTCCAGGCTGCCTCCTCAAAGCCACCTTCTTT
CTCTCTCCCAAAAAACACCCGAAAACTTGCTCAATCTCGAGTTCTTGCTG
TTCTTGCTCGCGATTTTTCGATATCCTTGTTCATCCCATCTTAAGTGCTG
ATTTTTGGAGGGATTGCTCCTTGGTATGTGCCTCCTCCACTTGTCCAATT
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ATGTATGTGTAGCCCTCTAGCAAGTTCCTATAGTAGTTGCTCACCGTTTA
TCAACTTAGAAATCACTTGGTTTGATGCTTATCTAAAAATTTCAGAAAAG
GGAAGTCATGGACCACCACATATTTGGTGAAATATTTGAGGGTGATGCAC
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TGCGCACCCCTCCACCTTTCCTTGCCAAACTTTCTTGCGGGCTGCTGGGA
TTCTTGATGATTTTATGACCTTGGTTCGGAGGGCTGGACTAACGAGCCTT
ACGCAGGATGAGAGCGCGCAATATGCTACGCTCACCAAAACATTTGTGGA
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TTTATGGCAGGTCTTACCATATGACATTGAAGAAATTTTGTGGGTCTCTT
GGACTTGGTACAGCTGGGTCAGCAAAGAAGATTCCAGCTCAACCCGCTGA
TTTGTTGGAGCTTTACCGAGGAATAACCAATGATGATAGCCGTAGAGCTC
AACGGGGAAAGATAAGAAACATTCAGCTTCCAGCCATCAGGTACTTCGCT
TACTATCTTGCCACTAGTGTTCTTGGTAGGGAGAACACTAGTAATATTTC
CAGCTATCTTTTGGCTTTCTTAGCTGTTGCGCTCAACAATGAAACCAAGT
ACAATCTTGGTTCTCTCATTGCTCGTCGCTTAACTGCTAAGGGACCCATT
TATGGGGGAATTATTGCTACGCGTGTTGCTGCTGCCTTGGACATTGTTGT
TGATCCAAATGATACAATCTTGGCTCCTGAGAGGCTTGATCTTGCTGCCA
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TATAGAATGTTGTTTACTGACGGGGAAGAGAGAGAGAGAGATCCCTCTCC
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GGAGGAATCGCCCTCATATGACCCTGTTGTACACTACACAGGGGAGTCCT
CGAGCTCGTACTAGGACGAGGGATCCTCCTCGTAATACTATGGAGGTGCA
TCTACTTGGGCACCATGGGATTGAGCCCCACTTAGGCCAAAAGCCTAAGC
TTGGGGGGAGGTATATCGACATCGCGCTCATCTTTATATCATGTTCGGAC
GATTCTTTGTATATCCATTGTTTCGCTTTCTTTTTGGTTTTTGTTGCTTC
TTTCTCAAAAACACAAAAATACCGAAAATATTTTCGTTGTTTCTCTTGGT
TTGTTTCTTTGCTTTTTGGTTTTGGTTTTCCTTAACAGAAAATTCCAAAA
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TTCTTCTTTGGTTTTGTGAGTTCTTTGCAGGGTTCAGCCATCCTCAGTGC
ATGTTGGTTTCATGTTATTATTCAAGTCACACAAGTGAAGGGCAATAATG
AAGATTAAGACAACTTGAGGTGTGGTAAGAGGCTGGTAACGAACTCTATT
TGTTTCATTTTTGTACATATACTCATCATTGTGAGCATGCTTAGTCTGTT
CATGTAAGGTGTATGTCATTATGGATGCTTAGTAGTTCTTGTTTGCTTGT
GATTAGCTCCAGCTTGCTAATAGTTTGTAGCATGTCTTATGAATATTTGC
TTGCATTTTATTCATATTTTGGTATGATATTGTGGTATCCTCCTCTGACT
GTTCATATGAATCGACTTGGCACATGCTCACACATGCATATGACTAATCA
ATAGTCAGTAAGCCTCGATGATTTATTTTGCATCAGAGTTCTTGTAACAC
TTTCATGCCATAATTAGTCCTGTTTTGTTGCAAGCATGATTATGACAATT
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GAGTATGAGCTCTACCCGTGCTTCCAACTCCCCAAAACCAATATTGCCAA
CAGTGTCCATCATACCTACCTATTAGCATCATGTGCTATTTCAGTGCATA
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GTTAGTTAGTAAAGCTCTCACGAACTTGATGGCACACTTTATTCCTTGCG
CTTAATAATCCTGAACCATCATGACCTGTCCATGAAAGTTATATGCTTGC
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GGATGTCGACGGTGTGAAATAAAAGGGGAGCTTGTGAGTTCATGGAGTCT
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ACAAGAACTTACAGATAACCAAAGTTGAGTAGCATGCGGTGCGGCCCCCG
TACTCAAGGGACTTGGGATTTCCATTTTATGGTCTGTCAAGCATATGATT
CGTAGTGGACCTTACTTTCACCTTAACCACATGAAGATGCCTATGATAGG
GGCAATGAGAGCTCAAAGCTAATGAATACCTTCCTTTCAGCATTTGGAAG
CCTTTCAAATGTTACAAAACCGTTTTCACAACCTTGTTGAGTCACCACTT
ATTCTATGAGCACCTTCTTGAGAGCATAGTTGTCATTCTTGTGTTTGTTC
CAAAACTTGGTTAATTATGTCATGACTTTGATGCTTGTATCTCTGATATC
TTTACTTCTAGTCTTCACATGAACTTCAAAGGTGCCTTGGCATTTATATT
GTGCTCTACAAACAAAGGCAAGCAAGATACCACTCTATCATACCTTACTA
TGAATATTGCAATGTTGCTTATGTTTATGTTTGATGCTACTTATTATTAT
TGAGTTGGTTTCTCTTCATAGCTTGCAATGACTGTTGAGTAGACTTAGTT
GCATACTCTTTATTATGAATTGTCTAAGCATCTACTCCTGTGCTGAGAAT
ATTTATATCATATGAAGAAAATGTGTTCGTGAAAGTTCTTTTATCGCACT
CAATTTTCAACTAAATTGCTTGAGGACAAGCAATAAGCTAAACTTGGGGG
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TTCTCCTCTAAACTTGTATGATTTGGATACAACTAACACGGAATGACGCT
GTTTTTAACAGAATTACCTTGGTGTCTAGTTTTAGTGCAGAAAATGAACT
ATCAGGAAAAATCCCGGAAAATATGCCAAAAATTATATTTCACCAGAAGA
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GTTGTAGGCTTGGGGATGGAAGGGATTGGATGAGTTCTATCATGTAATCG
AATAAGATTGTTAGGGCATAGTGCCTAGTATCTCTATTAGTGCTATTTGA
CTTTGTTGCAACTTGTTGTGCTTAATGCTTGTCACTAGGGCCCGAGTGCC
ATGATCTCAGATCTAAACTTATTATTGAATCATTATGATAGTATTGTTTG
TGATCTTATCTGCAAGTTGTGTACACATATCATTGTCTAGATCCAAAGGC
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GATCACATGTGTTCACGGAGTGTTAATGCTTTGATCCGGTGCTCTATTAA
AAGGAGCACCTTAATTGCCAGTAGTTCCCTAGAGGCCCCGCTGCCACGGG
CTGGCTGGACAAAAGATGTTGTGCAAGTTTTCATTGCGAGCACGTATGAC
TATATTTGAAGCACATGCCTAGGAATGTTTAGTAATTGGATGCTTGTTAT
TATTTATTTGCAATGCCCTAGATCTTGAAGTTACATGTTTAGACTCGTTC
ATTCAACGCCCGTCCATCCATCCCTATGCCTACCACACTCAAATCCCATT
GTTACCGTTACTGTTACTATTGCTCCTGTTTTGCTGTTGCTATTGCTTTG
CCGTTGCTACTACAAACTGTTGCTATTGATAAACTTATGTGAGCAAGAAC
TATTTCCAGGCGCAGTTGAACTGACAACTGAGTTGTTAAGGCTTGCAAGT
ATTCTTTGCCTCCCCTTGTGTCGAATCAATAAATTGGGTAATACTACCCG
CGAAGACTGTTGTGATCCCCTATACTTGTGGGTCATTAGAGCCTAGTGTG
AGAGTAGATCCAAGGACATGCATTGAGGCGGTGATAGAGACAACTAAGGA
TAAATATGGTGTAGATGTGCACAAGATGGCATATAGGGCAAATAAGAAAG
CATTACAGGCAGTGCTTGGTGATCAGGTTGGACAGTATAGGAGGCTCAGA
GACTACTTGAAGACAGTTATTTACACCAACCCTAGCTCAAGATGCATTGT
TACTACCAAATTTGTTGTAGCGCATCCCAGCACCAACCCTAGATTCCATG
GGATGTTCTACTATCTAGGTGGATACATACAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.