Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA038566

[Submit comment/correction]

Sequence	AA038566
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA038566
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGGCAGAGCCCGACGTGCGGTGATTGGGTGAAAACCCTAGCTAGTCACGA TTGGCCTAGCCAGATGATGTCCTCCTCCCCCAATCCACCGTGCCGCCACT CTCTCGCCTCCCTCGTTCCTGGCCCCGCCTGTTGCCGCCGCCACTCGTCT CTCTTCCTAGCCCCCACCTGGTCCACGCATCTACTGGCCGAGCCGCTGCC GGTGAGATGCATGGACGAGCAAGCAGCAGCAGCGCAGGTCTTTTCCTCTT CTAGGTCGCTCGTCCTCGTCGGCGGGAGGTGCACGGGCCACTGCCGAGTC CGCACCACGCGGCTGGTTCTGTGGTGGTCGGCGTCGCTTCCGGTAACCCA TGAATATGAGAATTCCTTCCCCTGGACCACTCTCTTCCCGAGTAGAAGGA GTAGACGGAGAGCACACTTGGTGAGAGCTGGGAGGAAGAGGAGGAGGCAG AGAGAGAGAGGAGTGCCTCTCTCCTCTCTTTCTCTCTTGGCATGTCCATC CTCACTAGAGGATGCCAGATTAGGTGCTCCTGACTTCTCCCTTTCTCTCC CCCTCTCATCCCCGTCTAATCGTCGGTGCTTGATATGTTGGGCAACTGCA AAGGGATGTCGCTTTGGGCTAATTAGTGAGGCTGGTTGATCTGATTTACT TTGGATGTGTATTCTCTGACTTTATAATATTTATGCTTGCCAGGTGTTCG ACGAATTGTCTACATGGGCTAATATGTTTTTTCTGGTTATGATGCAGGCT GTGAGTTTTCGCCGATACCAGCGGGAGATTACTCTTAATCGAGATGTCGG GTGGGCTATGGCATGCTCGAAGTTGGTTCCTAATGGTCTTGTTCGATTAT TTATATACCATTTCTTCTTCTATGAAACCTGCAACTTATTTCCGCTCCAT TGGCTCACTAAGGTAAAAACTAGGTTATGCTGCACGAGGCATTCAATGGT AATATATAATACGAATTGTTTTTATAGGCATGGAGAGCAACCCGGCCATG ACTCCGGTGCTGGCCTAAGCTCTTGCGCTGCCATCGGTGATCGGTGGTGC CAGCAGTGGTAGCGGCAACGCGGGGAGCCAACAGAGCTATGCGGCCCGCT ATCACCGTCGCCGTCCAACTCGTTGGAGCGCATCTGCCATCAGTTGCGGC AGACATGCAGTATGGAGGTTAAGGCGGTGGAGCAGGTGCAGATGCGAGGT GGAGGTGACTGAATGGGTCATCCAGGACGAGCCTGGCCTGAGCGTCACTG TCCGTGAGCTCCGTCGCATCCGCTTTAGGTCGATCCGAATCTCCTCTGAA ACCAGCCATAATTTTCAGACGGTCTCCTCCACTTAGACTACTGAGTACCA TATGATCTCTTGCTGACATATATTATTTTGTGCATGATGTGATGATCTGG TACTGACAAACCTTTACTTTCTTGAATTTTGGTTTTGATTTTGTTCACCC GTTTTTGCGGAGCTGAACACCAAGTTGTGGTGGGAGAGGAATAAGGAGAG GATATACGTGAAGTACTTCTAATCTAAATTATGCATCGGTAAACCTGAGC TATGATTTCACTTTAGAAAATGATTCAGTATCTGTGCAACTGTAGGGGCG AGGAGATTAATAACTAATAGTATTAGATATGTGTGCTGTCCTTTTATTGC GATAACAAGATTCTCAGTTTTCTCAGGTGTTTTCTTCTCTTGCTGCACCA GAAAAGTGAGAAGGTGGTTAATAAGAGGTTGTTTATTTATTTCTGTCCAA GTTGTGTCCAAGTTCAACTGGTTGTTGTTGGTCTCTTCGGACTATAGGTT GAACCTTTTGTTCTTTCTTCTGAATTGTTGATGTTCTCTCCTTCACAAAC TCTATTTATTTTTTAGTTATTACTCTCTACGGAAGGATAACCTACATGAT TTAGAGTCCAGCATTAGTGATTCCTATCTTGTCTCGGAGTCGTACAATTT GTTTTATGAATACCAATTTCTGGGTGCACATGTAAATCCCATCTTTTACA CCGTCTAGCATGGCAAGATAACAAGCTATTAAAGCTTGTCATCTGTGTGT ATATTATTGATTTTGTGCATGCACTTTAGTCCATCATCCACAATATTCAC TTCATGATCTGATGTATACATTCAGTTGATAACATGTCTTCTGATGGAAG TGATAAAGCGAACGAGGAGGAAGGTTGTCAGGCTTGGAACCAGTTCTTGA CCATAAAACGCATGTAAAGATTGCCCTTTCTTTATTTAGTGTGAGCATGC TCAACTTGAAAAGAGAGGTCGCCACCAAAGGCCTCTTTGGTTTTGGGATG TGTCAATATTTTTTCATCACAGATTTCATTAGTACAATCTTCTACTAATT AAACATTATACATTGATTCAAGAAGAACATGCTTCTCATTTCAGAGGAAG AACAAAAAGTTCTTCAGATACATCTGATTTTACCCTCTCTATTTTTGTTT AGGTGTATTTTGGGAGAATAAGATGGAGTTCTTATTGTTTGGTATCCAAT GTATTTTGGTCCAGGTGTGCCTCTCTGGCTGTCTAATGAATTTACCAATT ACATGCTACAATTGCTAGGTGCAGTATTTCTGGATCCTATTATTAAATCC TTAGATCTGCTGGTTGCTTAATTGTGAAAAGTTTTACATTCTTCTTATAT TTCACAAATTACAGCTGCGTGTTTCACTCTAGGATTTATTTTTAGTGCAC TATTGTTCATGTGTAGCTATGCTTTATCCATACTTGCATGATCGTTAAAT TGGGCTTATTTCACAGGTTCCATTGGATATTGCTTAGCCTTAGAAATCTT AAACCAAAGCTCAAGGAGATGATCAATTCTTTGAAGGTAATTAAAAGATT GCACCCATCCTTTTAATGAAATGTTCAGTGTATGATTTATGATTTCCCTT GCTGTTGGAAGATAGCATTCAACTAAGGGACACATTGGAGCGTAAAGAGC TGGAATTTGAACAAGAGAAGAGGCTTGGTCTGCTCGCAGATATCGAGGTA GCTTATACTTTGACCAGATTGGCTTGGTTCCTAATATGGAATCACTAAAT GAGATAAGGTCTGGACGTGTCTGTATGTACTGATGAGTTGGTTCTGCACT ACAGGGAGTGTAGGATGGCTATCTTTGAGTGTCTACATTATCACTACGAC CAGCATCGACCGCCACCACGGAAGCAGACAGTGGCGGTTAGAATAGAGCA CGAGAAGAGCACATGCGGTTCCGCTGGAAGGAAGACATGTCTTTGCGACA GAATCAGGTGAAGTGATTACAACGGCATTGTCGTTTCTTGGTTCAGTTGT AATTACTTCTATTTTTGTTGAGGGGGTATGCTTTAATCTGAGACAAAATT TGGGGGATACTTACTGTATTATGTGTGGCGAAATTTTGAGATGGTCTAAT TGATAAGTGATGGTTCAGTTTCTTCTCATCCTCTCTCTGCTTGTTGCTTT TATGAAATTATATACTCATCTGCACGGTAGGTTCGGTTTATTCTTCTGTT TGTTTGGTCTTGTGCAAGGTGCATCTTAGATTATTATCACAAGGCTTCTC TATAATCGTTCTAGCTCTATTCTGTTTTTAGGTCATGGGATTGAAAGATT TCCTAAATGATGTATCTTCACTAAGCTCGAACGTGTTAGTGGCCACCCTG CGGCAAGCCATGTTAGTTCTTTATGGCCTGGTTAGGTTTAACTTGAATGT TCTTTGGACTTGCAGTTATTGTCAGAAGCATGAAATTGAGTCGAAAATCG CATATTTGGCATTCTGCAACATCGTGAGGTGCTTCTCTTCCTACTTCACG GATGATGGTTAGGTTGCATTCCCTGGTCCTTATTTGCTCCTTCGTTTGAT TCAGTTATCTCTTGAACCTTCTTTGTCAGTAACCAGGCAATGGGGCTGAA GTGTCATAGGAGTGCTTTCCACTTCTTTTCATTGGTTGGTCACATTGTTC CAGAGTTTTGGACTAACATACATTCCCAAACATCTAGCCTCTCTTGACAA AGTTCATATCACACTTCATGGCCAAATAATTTAACGAGTACCATTTGTAA TGTGTACAAAATTTATTTTGTGCTCCGGTCGATCCAACACCATATTGCCT GTCTGGGTTTAGTTCCCTAAATTACTTTTTTTTGTCAGAACAAATAGAGT GATATTTGTCAGCATTCTCGCTTGCTTTGCATAGTATATATATTTTTGTG ATGCTCCTCATTTGTTTGCCTAGCGCGCTTCTGCTGCCTAACTATTAAAT CACTCAATTGTTTTTTATCTTCTCCTTTCAGGATTATATTATACCTAGAA TTAAAGATGAATGCATTTAGACCCGGGAAGATTCAGTTGTTTTTATAGCT AATAGAAGTTGTATTTGTTAACCACTTAGTTGAGGACAAGTAGACTATTT GGAAGGTACACTATGCTTTATCGATGTGTAACAGCGCAGAATTTTAAAGA ATTTCAGTGACAACCATGACAGACCGCACACTATAAGATCGTGCGCAGAC TGCGTTTTTTATAGTTACTTGCAACAATGTTTAAACTTTCCCCTGTCGTA TTACCTTCAATTCATCTGTTGGTTAAATGATCTTTTCCTTTATTCTGCTG CATGAATCACCCTGTGTTCTTTCTGTACTTCCTTCTGAAACAACTTAAGT CATGTGTGTTCTTCACTTAACATTTACTCAGAATGATTTTTTTAGCATGG TTAGTATGGTTGCTTAACCATTTACCAGTGTGAGAGCCACAGGGTCTTGT GCCAAGGTCCATAACCCTAAGGCTATTCGGATGTCAGCTTTGCTAATGGA GTTTCTTCCTGAGGCTCAGCTTGGGAGTTAATTATTGTTATTTTAGCTTG AAAAATCTTCGCCTGTATTTTTAGCTTATTGAAAAGTGTTCCCTCTCTTC AGTACATATCATTGTCCAGTTTTGCTGATATATATCCAGGATGTTTATGC TTACCTATTGTATCCTGTTATACATTTCAGTCCACGTATCTATTTTGCAT AAGATTGTACTCTTCTTAAGTTGAACCTGAACCTGGTTCATTTATGTACA CTGCAATGGCGTCGTGTTGTGATCTTCTTTAGAGCGTGTGATTGGTTGCG ACTATGCTTGTATGTGCTACGATATAGTTTGAGCAACAAAAACATTCTGT TTGCTGACTTTTTGGAATTGGCTATTCATTTGTTTGATTATACTCCCTTC GATCCGAATTAACGACCGCGCTGTTATTTTGCAAAAAGAACCCTGTTCTT TTCCGACAAACAACTCGCTACACCGACTCGTCTCTATCACTGACTTGTCC GCCGCTCCCCCGCCGGCCACCTTGCTCTCACCCGCGCCGCTTGCTCCACT GCTCCCTCGCTGGCCGCCTTCCTTCCTCCGGCATCCACCAACTAGAACCC AAGGAGGAGGGAGATCGAAGATGAAAGGGATTCCCTTTTCCCCAAAGTGT TTGACTTTGCCAGCTTTGGCGGCGGTGCTCGTGGCCTAGATGCGGTGGTG CTCGTGGATCCGGCGGTGGCGGTGCTCCTAATCTGCTCGACGCACCTCCC GCTGAACTCTGTGCCGCCGAGGTGTACGGGGAGGATTTTGAGCAGGGGCG TGGTGGAGTGGCCGCCGAGGCGTCGCTGGGGGAGATGGATGGGGTCAACG GGGGATGGGAAGCTGGAGAGGAGGCTGCGACGGAGGGAGACTATGAGGAG GGAAAGAAGGAGAGTGAGCCCTTTGCCGTGCCGACGGCGAGCGCGTTCTA CATGCACGACGACCGCTTCCAGGAGGCCCGCGGCCGTGGACACGGCAGGT TCTGGCTTTTCATTGTCAAATTAATTGGTCAATTTCGCTATTACCTCCAT AGCCAGTTTGGTGCTAGTCCCATTGAAATTGCATGTTAGGTTACTTACAC TCGGTTTCCAGTTGTTGAATTGTGTTGTAGAAAAATAGTCAATGAAGGAG TAGAAAGATGTTTAAACAAACAGTGAAGTAACCAACCGCTGGTTTAGACA AACAGGGTTATCATAGTCTACGACAATGCTAAACAGAGTCTTAATTGCAT CTAATTTCAGCCGGGGGTATTTCATATTTGGCTAGTTTCACCTAGGTTGC CATAAAAACCTTATCATGTTAACTAGTGTTGTAAATAACTTAGAAAAGAC CATTTTTTGTGTAATTTATCCACTGCTTGTAGTGTAGGTTATCTTAGCAC TGGCCTTCAAGCCTATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.