Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA042135

[Submit comment/correction]

Sequence
AA042135
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042135
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCATTGAGCACCGGAGAGGAACCTCCTAGCTTGCCCATTGCGGCAGC
AGGTGCTCCGCTGGTGACCATGGAAGCCAAGATGATGGTGGCCACGGGCC
GTGGCGATTGCAAGCAACTGAAGGACCTGCTGAGCCAGGAAGATTCTTCC
ACCGTGGTGGTGGTGATGGCCTCAAGCAACCCGACTTCCACCCCGAAGCT
TGATCGCTCGCCATCGCCGGTCATGAATTCGCGACTGCTGGCATCGGTGT
GCTCTGGATCTTGGAAGGATTTGGAAGCACTTATCAACGGGGAGCACTGC
CAAGCCTCCAGCAGCAACAGCCGCGACGGAAGATCGGCGTCCCAGCAGCA
AGGATCAGAAGACATAGAAGCATTTCTCAAGGAGCCTCTCCTCGCCGGGG
TTACAGTCGGAGGGGACACTGCCCTCCATGCTGTGGCCACCTATGGTAAC
TTCTCTATGTGCCCTGACATCATCTTCAGCAGAGCGAACAAGGGAGACAC
AGGCGATGGTGGGGAGGGCAACTTCTTGAAGATTGCTTCTATCATCTGTG
CCAAGGCGAGGCACCTGCTCCTCGTGCAAAACAAGAAGGGTGACACGCCA
TTGCACTGCGCTGCTCGAGCAGGGAAGCTCAAAATGGTGTCTCATCTCCT
TAGTCTCGCTAAAGTCAAGGTTGATGGAGTTGACATAGTGAAGGCATTGC
TGAAAACACAAAACAATGCTAAGGAGACGGCCTTGCACGACGCTGTCCGC
GTTGGCAACAACAACATAGTCGAGCTACTGATGGAAGAGGAGCCTGAATT
GGCGTGTTTTCCTAAAGACGGCACTTCGCCATTGTTCTTGGCCATCTTGC
TGGAAAATAAAATCATTGCAGAGACGCTGCATAGCAAAAGTGCCGGGATT
CTTTCATACTCCGGACCAAATGGACAAAACGCATTACATGCTGCTGTTCT
CCGAGGCAAAGGTACCCATAACCCATCCTTTTCCTTCCTTTGCAACATTT
TGCTGTATATACCCGAGTCTTGTGCCTGTTATTTTTATTTATCACGTAGA
GAGATGAACTTATATCTGCTGTGACATCTGCGGGTCATGAATACTATGAA
GTGTTTTAAATTGAGGACATAATATTTAGTTCTCTGTTATCTTTTTCCGA
AAAGGAAGAAGACTCTTGGCCACTGGATTGTTTTATTTAAGTGGCAACAA
AAGATTTGCTTCTATCCATTAATTATTAAGAGAGAGTTTTGAAAGGAAAA
CGTAAAAGAAGGTTTACAAAAGGACTTCTCTCCCAATATTACATAAATAA
AATGCTTTGCACCCGGGTATACCCATAGCTTTGCCTCTCTTTTAATAGCC
TCAAGAGTCAAGAAGAATAGTTGGTGGGGCGGATTTGTTGTGGCTTGTGT
TTCTCTCATTCCAAAGTGTCCAACTAGTCAGCATGGTGAGAGACATCTTG
CCTTGCGATTTGGGACATGTGAGCTCGACATGTTGGTCCACCAAGCATTG
ATGGAGAGGTCCTCTGGCCACTAGGAGATGGAGACAGAGGAAAGTTGAAG
CCAATCTTTTATCATCCCCAAAAGCCTTTTGGACCTGTCAAAAAAAGCCT
TTTGGAGAAGCAACATTGGAATAAAAGATGTGCCGCCCTCTCTTGGGTTC
GCTTACGAAGGGGGAAAAGGCCACAATTATTCCATCCTCTTTTCTCAAGA
CGATCTGCCATTCAAAGTCTATTTTGAATGGCCAACTAAGTGGAAAAAAA
TGATTTTTTGTGCCGCCCGATTCTTCCAAACCGCCTTCTTCATATTAGTG
CTAGTGGCCCCAAAGAGTTGGGCTTGTAGGCCAGTGTCGTTGTATATTCC
CCGTTAGCCGTGAGATTCCAAATTATTGAATCATCAACCACTTCACGAAG
GTACACATTACTTATCTCAAACCAAATACAAACAAATAATGAAGGTGAGG
CAAATTCAAGATGGCATCCATGCATCTTTATCTTTGAAACCCAAGCGTTG
TCATGCATTGCCGCCTCAACCTTCCATTTCTTTCTTGTGGATGTCTAAAA
CATGAGAGGATCAATATATTTGGGCATCCTACCATTGAGCCAAGGGGGAT
CACAGAAAAGGTGTGATCTTCCTGTTGCCGATGGTGATGGTGGGATAGAC
ATAAAAAAAGACTCATCACACAATCATATACTTATCAATTGACTTATATC
TACCTAACATATTGTTGTCCATACCAAGATTATTTCACCACATTGTGCCT
TTTTTTATTTCGTGTATCAACTTATATGTGCCGTGTCAATTGGGTGTCAT
GAATTACATTCACTATTTTAATAGGTTTAGGGGAAAATATTTATGCATGT
TAACTCCTCTAAAAGAGGCATGAATTTTTCATTAAAAAGGGCCTAACAAC
CAGTAATATGCGAACTAAGTTATTTTTTTGAAAATAGGACTAGTCAATGG
GCCTTTGCATAAATCAATGCATACACCTATTTTTATTGCAGTGTCTCATA
CTAGAGTATTGCAATTTATGGGTCACAAAGAGTGGATACAAAAAATCAAT
CGACATAAAATAAGAAACATAAAGCGCTCATGCATCATCAGTAATTCAAT
TATTTCACCACCATCCATACTTTTTGAATAAATCATGTGCTACCATTTTC
AAACGATTGCTCCCAGATCCCATGGATGCCATGTCTTTCACTATCTAGAG
ATATGACCATCTGCTGATCCAATGGGTTGCCATAAGGATAAATTGAAAGA
AAAGAGTAGCTCTAGTATTATTAAAAAAATGATTGTGAGTAATCCATATT
AAAAATAATAATTAAAGTGCAAACCCACATAGTGTTATATAAGAACCAGA
TAAAAACCCTTATTTTGTACTAGAAATTCTAGTTTCCAAATATATTTTCC
GATGAATCTAGTATGACCACTAGTCATAAGGTCCTCATATATAAAGTATT
AGGGATGGGTATCACCTACCTAAGGGGACCCGTCAAGAAGAATAGACACA
TCTATGGAAGAAAGGAAATATATTTCTTACCTAAGTGGACTCCCAAATCT
ACTAGGCACCTCCATGGACAAAAAGCAAACAAAGTCAAGTCAAGACTAGT
CAATGGAAGTTCATGATCATGGCATGATCAACAAGTCAAAGATCAAGAGA
AGAGACACAAGTCAGGGTACCCTAAAGGGTTGGAAGCCCGTTCATTCATC
ATTTAATAAACGAGGTGTGAGAGCTAGTGTTCCAATTCAAGGACAAGGTG
TTCGAATTTCGGACTTGAGGAGTCACGTTTGAATCAAGCCGACATAGTAC
GGGACCTTGACTTCGGCCCTGGGAAGCCTCATTTGGCCCGAGGTCCATGC
TCAAACTCTTTGATGCTCTCCTAACAAAAAAATTAAGCCGTGCTCCAACA
AGGCATCCCAACCTACTCAAAAAACACCTTTTCAATTCTCGTAGAGTGTA
CACAGAACTTTGTTAGCACGTGGGCATACACACCTTACTAACCGCTTACT
CCCACTAATCACAGGTTGTTTAGTTTAATAACACATAGATTTAGTTGTGA
AGGACCCTGAAGTAATCAAACTCCATTTGAAAGTATTTGGCTCGATAGAT
AAATCAATTCCCATCGACCGTTGAACGAAGTGTAAACAAGATGTCCACTT
GTCTCTGGTTAAGTCTGTCTAAGACCTATGTTTATCAGTACTTCGGACAT
AGCACTTGCTACGTAAACGCCTTCCTATTGTACAATGTTATATGGGGATG
TATATTGTTGAGAAAAAAACATGTCACACAACCATGTATCTTCTAAAAAA
TGAGTACTCGAGCCATTCCTGACCATAAAAAAACCTCTACCAAAAACATC
ATATTTAAGTCACAGTTATTCCCCCAAAAAAGGAATGTGTGGGTTTTTCT
TTTGCTTGAGATAAAGTCTTGGATTGGAGTTACTTATTTTGTAGCATCTC
TTTCCACACATCCTTTTTATCCATAAATAACAATTTGTTGAGTAATCATT
TATTTTTTTATTTCCAAATATCTACCCCTTGGTCTTTTGATCAGAAAATA
ATTCTCCATTTAGTTACATGATATTTGAACATTATGTCAGTCACTCTACT
AGAAAATTTTAGATCAGAAGAATTCTAGTCTTTCATGGACCCTTTTGGTA
TTTCTAGAAAAAACAACATAAACATCGGTAAGCTAGTAAGAAGAGGGTTT
GTAAGAACAAGTCTATGTCTGTATGAGAGATCTCTTTAACATATGCCATA
TAAGGAATTCGATATCACCAAATGAGAAATCTAGGGATCAAATGCTCTGT
CTTAGAGAGCGAAGACCCGACCATCTATCAAATTCTAGGGCAGGTGATGT
CTATTAACTACGCAGAAGAGTGGGATATGTGTGTTGTGGGGGAGGAGGGG
TTGTATCTTGATGCCAAAAAATGATGAGCGGAGAACAATGCAACTACTGT
TGGCTAACCAATAACAACATTGAGTACTTATCTTCAACCGAGGTTTTAAT
GAGAGCATCACCGAGGAATAGATAGTGGCGTCACAAATAGAAACCACCAG
CAGTGACTGAACAATCAGATCTGGTGTCGAGGCGGCGCAGCAGCAGGAGG
CGTGGTTCAAACACTGCATTCTTTTTTTTTCCTTTGTGTGATTTATAACT
TAACCCCTTGAATGCCCTCAGAATAAAAATTTGTCGAGCTCATCGGAAGA
TGTCTAGGCTAGGAGGATGTCTTACAAAAATTATATTTGTTATTTTATTG
AAACAGTGACTTAGATTTTTCAAATATTAAATGTTAGGCAAAAATCGAGG
TTCCTTTCGGAACAGAGTAGTTTTACTCTAGGGAACATCTTACCCCATGA
GCACCTCTGATAGGCTAAGCCGGGAGATCTTGAAGTTCAATGAAATCACC
ATGGACGCTTCCCTACCTACCACTGAAAGAATATTGCCCATTAATTCCTG
GAATAAATCCAGATAAATGCGATCACTCGTGCTAAATCTAGGATTTGAAC
CTGAGTGGACCACTGGACTGACTCTGGCACAAGGAATGTAACCAACTAAT
GTACGCACATTTGGGATTGACATTTGATAACATAGTGGAAGACATTTTTC
ACATGATTGAATCCAATGACAAGTGGGATGGTACTTGTTCCTGTTAACAA
AAATATTTGGAGACAAGCTGGTGTGTACTTATTCTCGTGATGGATTCTAA
ATTCGGTGCTTTCTAAATTTGAATTAAAAATCATGTTTTATTTTCATAGT
TGTTGAAAGTTGCTCGCATATATTATTCCTAAAGAAATCCCATATTTACA
GAGCTTACGGACATAATGTTGAAATGGAACAAGTATCTTACCACACAAAA
GGATGAAAAGGGGAGTACACCTCTTCACTTTGCCATAGGCCAACCAAGTG
AATGTTGGCAAGTATTGGAAGCAAACCCGGATGCACTATATGAGTCGGAT
AACGATGGAATGTTTCCTATACATATCGCAGCCTCCGTAGGCGCAAAGTG
GGCCATCATTAGTTTTTTGGAGAAATCACCTAGTTGTGCCGGTTTGCGTG
ATTCTAAGGGAAGGACATTCCTTCATGTTGCTGTTGAGAAAAGGATACTG
GACATTGTCAGTTATGCTTGCAAAAACCTATCGATATCATGGATTCTCAA
TATGCCAGACAATGATGGGAACACTGCACTGCACCTTGTTGTCCAGTCAG
GGAGTCTTCGGATGTTTTGTTCTCTATTCGGAAATCGGGAAGTTAATTTG
AATTTAACAAATGAGGAAGGGAAGACACCTCGAGATATATCACGGTATAA
CATTCCCCCAGGAATGTACTATAATCAGGTAATCGACAAGTACTCGCTTT
ATTGTTATTCAGCGTCTCTTAAAGTTGAGATTCCAATGGTTTGACCTCTT
ATATTTGTTATTGACAGAATAGCGAGCCAATAATATTCCGCGCACTCGCC
TTCGCTGGTGCTAGATATGGTTGTTATCGCTTGGATCACTTTGATGAAAA
CTATTTTCACCAAACAGAATATGATGAAAGTGAAGAAATAGCCAAGGTGA
AAGACTCGTCACAAACCCTATGTATTGGCTCGGTTTTAATAGCAAGCATG
ACATTTGGTGCCACTTTTGCTATTCCTGGAGGTTATATAGCTGATGATCA
TACTAATGGAGGCACACCAACATTAGCCAGGAGGTATGCTTTTGAGGCAT
TCATAATGTCGAATACGTTGGCCTTCATTTTCTCCTCCATGGCTACCATC
GGTCTCATGTTTTCTGGATCTCCAATGTTTAACTCGCGGAGCCGTAAAAA
GCACTTAACTGCTGCCTTCTATCTTGTGTCGGTTTCGATTACAAGCTTGG
TAGCTGGCTTTGCTAATGGTGCATATATGGTGCTAGCTCCAGTTGCTCAT
AAGACTGCCGTTGCAGTGTGTTCCCTATGTTCTCTTGTGGTGCTCTACAG
AAATCTAGAGTTTATGATGAGATATGCTGTTTTTATCGGACCATTGTGTA
GAAGAAATGGGCTAATTTGGGCATTAAGGGAGCCAGTATGTATTATCATG
GGTAATCTGCTGGTTGAGAATTGGACACTGCTAGTCATCTTTGGTTGGGC
TGCATATGCAAGGGACCACTCCATTCCAAAAGTTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.