Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA012697

[Submit comment/correction]

Sequence	AA012697
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA012697
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGCCGACGGGGCGACGTCGCCGGCAGGACAGGAGCGAGTCCAGGGC CAAGAAGAGGAAAGGGGACGGGCGGAGGACCTCCGTCCGCGACCTCCCGG AGCACGTCTTCGAGGAGATCCTCTTCCGCCTCGGCCCCTACTCCCCTGAC CTCGTCCGCGCCGCCGCCACGTGCCGCCGGTGGTTCCGCGTCGTCGCGGA CGCCGGCTTCCTCGCCCGGCTCGCCACGACGCCGCACGCCGGCGACTACC GCACCGTCGACGGATGCACCCTCTTCGTCCCGTCCTCGCCGCTCGACGCC GATGGCCACCGCCGCTTTTCCCTCGATTTCCTGCCAGACAGCGAGTCCTG GGAGCTGTGTGACAGCCGCGGCAGCCTCCTCCTCCTCTCCAAGAAAGAGT CTGACACCTGCGAAAGTATGTGGCGTCATGACAACCGTTGCTGTTGCTTT GATCTCATGGTCTGCGATCCGTTCAGGGCGCGCTACCAGGAGATCCCAGG GCCGCCGAGTGAGGACAGATCCGATCGCATCGGCATGTTCTTGGCCGACT GCAACGGTGACGCCGCCGGCGGCAGCTGTAGTATGTCCAACTTCAGAATC ATTGTGGTCTTCCAGCAAACCGTAGTATATGCAGTCACCAGAGGGAGGGA CGGCGGCTGGCACGATATGAAGGACGAGTTCCCCGATGATCCGGAAACAA TCACACCTGTATTCTTTGCCGGGCGTGCCAATGGATCTTTGTACTGGGGA ATTGAAGAAGACAGCACTATGGTACTTGTTCTGGACGAGGCCGCCGAGGT GCTCTCCTTGGTCCGGCTTCCACATAACGTCTGGGGGTTGTCTAACGATA GTGAAGCTCGGCGGTTCTTCGATGCCGAGGACGGTGTGCTGCGTGTTGTG CGTCTGATAGGTAAGAATCTCTATGTCTTCGGGCAAAGACATTTTGGTTG CAGCGACTACAAAGGCGAGTGGGTGCTGGAGAAGCGGCTGAACTTGTTAG AAGCCACGGTTGGATTGCCAGGGCGCGATGGGAGCTTCTTGCAACGAAAA ATTGTTATTATTATGGCAAACTCCGAGTGCATCCTCCTCTCACTAAGCGA TGAGTCGTGGGTGTTCTCGGTTGAGCTAGACACAATGCGAGTGGAGTGCG AACACCCAAGGAACAAGTACACCGGAAAAGTGTACCCGTATGTGCTGCCA TGGCCACCGGTGTTGTCTGATCTCAGCAAAGAGCAATATGTTGTAGTGCG TAGGCCTAAGTGTGATAGAAAAGAGCTCAACAATATATTATGAAGGACAT GGAAATCCTAGCTTCTTTTAAAGGTAATTCGTTTGCTTTGCTTAGTCCCG AGATTTTGGGATCCATGCCGGAAGATGAGGAGGTTGTGGTTCCCTGTCAG GTCAGAGGTGGAAGATGGTCATGGCTCTCAGCCGTGCATGGTGTCGGAGG ACACAACTTTGAAACAAGACGACAAGGAGTTGCGGGGCAGTGCGAGGCTA CATGGACTGCTGACCTGATCCTTGGAGATGGGGAGATGAGTGACGATATG AATGAAATTCTTGCTCGTCTTGTCGGGCAGGCATCGACAACGCCCACGAG TGTCGTTCCTCTCCGTGGAGGCATCGTCGGGGTGTGTCATAATCTCCCTC ACACTTTCTTGGTGTGGGTATTTGTTGCTGGGCGAAATCCTAGATTTGTC GGATCGGTGTGATGGGGCGTCGTCGTTGTCGTTCCTCTATTGGGAGTATC GTGTATGGAGACACGGCTTTAAGGTCCTAGGTTTCCCTTCTCTGGTAATC GTCGTTGTCCAAGTTTGATCTTCAGAGGCGCAACATTATGTCGTTGCCGG TGTGTAAGCGCATCTGCAGCGATACGACCGATCGGGTCCGACCCGGTATG TACCCGTCCACTCGGGTGTCTGACGGCTGACGGGATTGCTACAATCCTCC ACCACAATTGCTACAAACCCCCTCCAGAGTTGCTACAGGTGGCATCACCG GAGCTGGGAGCATGCTGTTGGCACCATTGTTCCTGTAAGTTGTCCGGCAA CGGCAACTTATGGCTAGGCTAGTCGCCGATCATATCTCCTTTTGTGCGAG GAGATTATTCATGATGTTTTCTATTTTCGCAAAAAATATTGCTATGGGAA ACGCTATCGCTGGGCGAGCCAACTCTGCTAGGAAAGCGCCGCGCGTAGCC GCTGCGCGGAACGTCTCTATCGCTCCATGTGGGATGGGCTCCCGTAGGCG CTTGGAGCCTCATGTGCTTGCGGTTGGACTGATGGAGGAGAAAGGCAAGA GGCAATAGTAAGGCATAGGAAGAAAAAAGACCTTGCGGTTGGAGACTAGA CTGATGGCGGAGAAAGGAAGGAAGAATAGGCATCGGGAGAGACACAGACG CTTTGACCATCGTGTGGTGGAGCAGCCTCAAATTGGACGGCTTTGGACAC GGAGGATCGAGTATCTAATCTTTCTCCTACTGGTTAAACAATAGTTCTAT TCATGGTCGTGCTCAAATAATATATATCCATCATTTTCCTGGAAGTTAAC TTTTGGGTCAATGCCTGTTATTTTTTCTAGCTGGCGCACGTGCCATGTAT ATGTCTTCCACAACAGCAATCTTCTAATTTTCTGTATGCAGTGGGAGGCA ACCGAAAAACATGTCCTCCTACTTGTATGCAGTGGGAGGCATCAGAAGAA CACAAGGATGAATCATATGGGTCCGTTCCTACGGGGCACACACATGGACT AGACACATAGGTGGATAATCGTGGTGATTGCATGCTTGACAGAACAATGG GCGATATTGTCCAAGACAATAAACAGAAGGCGTCTCGGCCTAGTTGAGAA GGTATCCAAGTAGGTTTGCGGAGCAACAACCCGCTCACATTTGATAGCCT AGTTAACACGTAGTGAACGGGGCACCTTTGAGGATCCGCATCATTCGAAT GCGAGATCCAATGGACTCGTTGTGAGGGCAGCTAGGTTGCTCTATTTTAC CATATCTTCATTATTTTGTCCACATGTCATTTTCGTGAATTTATTTAGGG GTGGGTAGGGGGGCATATGGGTTGATACATCCTAATAGATACAAACTATT TTTAAGGTGCCATTCTTAGTTTACAATACACCCATGATACGATAATTTTC TTCAGGCTGATATTGCCACCGCTAGAATTAAGCGTAGATATATACTAGAG ATTGATCAGGGGGATTAATTTTGCCAAGATTATGCAATGAAGTGTGGATT TGATTTTATACAATTAAGGATATATATTCAGTGTCTCACATTATAGTTGT TCAATACGCATTTCACAATATGCCGAGACTCGATATATTTGCAACCAAAA TCAAAATTTCCATGTAAAGGAATCTAACAACATTTTCTGGAATTAATGTA TGTTTTTTTTACTAGTACCCATAAGTCTTAAATTATAATTCTGTAAATTT CCTGTCTTGTGTTGCAAAAAGGGTATAAATAATGCAAATATTTGTTTTGG TCCATAACTTACGGAAATGGGAAAAGGAAAATCTGTAATAATATAAATAT AGATATGCAAGTAGTAATATTCTAGAACTAAAATATATGATATTAATGAG GGGGAAATCTGGTCCATAACTCACACAAATGGGCAAAGGAATATCTGTAA TAATATAAATATAGATATGCAAGTAGTAATGTTCTAGAACTAAAATATAT GATATTAATGAGGGGGAAATCTGGCATTTAGAATGAAATTAACACCGGTC TACTATTTTGTAGATGTGGTCTTTGTTGAAGATTGGTGAATTATAGTTCC CTAACAAAAATAGTGATGCATGAGTCCTCACTATGACGTAGCATTTGGCA TTTCAATAGACTAGAAGCTATATTTTGGGATGAAACACTCATCACTTAAA TATTATTAGGTAAAGATTTAACACGGGTCTACAATTTTGTCGCTATGGTC TTTGTTAAAAGAGTGATGCATGAGTCCTCCTCACTATGAGGCAGCGTTTA GCATTTCAATCGATTATTATGAAAGTTATATTTTCTAACCAAAATTTGCT TTGTCTTACTGTTTGTCTTTTTTTTTTTAGAAAAATGCCTTACTGTTTGT CTAACAGGCATGATAATATTATCACGGTACTTTTTGCATGATATTAGACT ATAAAGTGAGATCAGAACAACACTGCTCGACAAACTGAAATTAGACAATG AAATCGTAAAGAAATCGATATGTGAACAACATGTACAGTACCTTTTATTG TGTCACGTGTAGCACATGTAATCTGTACCTAGCCCTACTCGGATACCTCG CTCAGACTGACCACGTTTCCCGTTCCAGAGTTGATACGCCGCCACACTGG ATCCTAGATCTACACAGCAGTATTTCTCGGTTTTTCCCGTCCATGCCTAT GGTGCTGGCGGGGCGACGTCGCCGGCGGGACAGGAGCGAGTCCAGGCTCA AGAAGAGGAAAGGGGCCGGGCGGAGGACGACCGTGCGCGACCTCCCGGAG CACGTCTTCGAGGAGATCCTCTTCCGCCTCGGCCCCTACTCCCCAGATCT CGTCCGCGCCGCGGCTACATGCCGGCGATGGTTCCGCGTCGTCGCGGACG CCGGCTTCCTCGCCCGGCTCGCCACGACGCCGCACGCCGGCGACTACCGC ACCGTCGATGGACGCACCCTCTTCATCCCGTCCTCGCCGCTCGAAGCCGA CGGCCGCAGCCGTTTCTCCCTCGACTTCCTGCCAGACAGCGAGTCCTGGG AGCTCGCTGACAGCCGTGGCAGCCTCCTCCTCCTCTCCAAGAAAGAGTTC AGCTGCGAGAATACATGTGAGCACGTGTATAACAGCTGTTGTTGCTTCAA CCTCATTGTTTGCGATCCGCTCAGGACGCGCTACAAGGTAATCCCATGTC CGTACCTAGACAGATCGGATCTCATTGGCCTTTTCCTGGCCGACGGCAAA GATGGCGTCGGTCGCCGCTGTAGCATGTCCAACTTCAGAATCATCGCGGT GGTCCAGCAAACCGTAGTTTGGGCATTCACCACTGACGGCGACGGCAGAT GGCGTCTTATGGATGACGAGTTCCCTGATGACGACCCAGAAACAGTTACA ACCGTGTTCTTTGCCGGCCGTGCCAATGGCTCTTTGTACTGGGGACTTGA AGAAGACAACACAATGGTGATTGTTCTTGACGAGGCCACTGAAGTGCTCT CCTTGGCCCGCCTCCCAGATAATGTCTGGGGGCAGTCCAACGATAGGACA GACCGGCGGCTCATCGGTGGCAAGGACGGCGTGCTGCGTGTTGTGCGCCT GATAGGCAAGAATCTCTATGTCTTCGGACGGAGGCATCTCGGTCGCAGCG ACTACAAAGGAAAGTGGGTGATGGAGAGGCGACTGAATTTGTTAGAGGCC ACAGTCGGATTGCCGGGGCGAGATGATAGCTTCTTGCAACAAAAAATTGT TATTATCACGGCAAACACCGAGTACATCCTCATCTCACTAAGTGATAAGA CATGGGTGTTCTCGGTTGAGCTTGACACAATGCAGGTGGAGTGCGAACAC CAGAGAAATAAGTATACCGAACAAGTGTACCCGTATGTGTTGCCATGGCC GCCGGTGTTGTCTGATCTCAGCAAAGAACAATATGCTGTGGTGTGTAGGC GTAATTGTGATAAAAAGGATCACAACAATATATTGTGAAGGACATGGAAA TCCTTCCTTCTTTTAAAGGTAACTCATTTCTTTGCTTAGTCCTGAGATTT TGGGATCCATGTCTCACAATGTCCTGATATTACTATGCCTATTGTGCAGT TTGATGGCATTGGTATTCATGCTTTATATAGTTCCTCAACTTATTTCGGT AATTATAATTCTGAAAATGATTCTAAAAATGGTAATGAAGAAGGAAAATC CAAGTTCAATGAGGGATCACATTGAGGTTATTGATAACCAACAAAGGTCA GATCCAAGAAAATCCCCTAGACCTAAGAAAATGAAGAAAAAACAACATGG TGGGCTTTATCTGGAAATTAGGGAGTCTCGGTAGATCTGATAGAATTATT GTTTTTTTAAATAACATAAAAATGTGGATTTTGTGGGTTTACAAAAAACT AGAAAAGTTCTATTGTGCTCTTAATATGGTTTCTCACTATATTACGTTTA ATATGCATTGTATGCCATATCAAGGATCTGTTGTGGGGATCTTGTTGGCT TTAAAGCTTCCTCTTTTGTGGGTTTACAAAAAACTAGAGAAGTTCTATTG TGCTCTTAATATGGTGTCTAACTATATTCTGTTTAATATGCATTGTATGC CATATCAAGGCTCTTCCGTGGGGATCTTGTTGGCTTTAGAGCTTCCTCTT TTGAGGTTATTGGCCATATTAATAGATAGAATAGTGTGAAGAAATAACTC TAACCAAAAAGTCTAGTAAATGATAACTGGTTATTGGACCGGCACAAACA AAATTTTATAATTGAGTTTCATAATCTGGTTGCAAACTCTTCCTACCATG TGCTCATAGGGGGTGATTTGAACTTTCTTAGGGATCAAACTAAGAAACAA AAGACAATATTTTATTTGACACCTTTATGTAGGGCGATGCAAGGACATCT TTGTTGATGGGCTTTACCGAGTCAATGTTGGAAAAGAGGGTCTACACTTG CGGCAACAATAGAGATAACTTTATTTTAGCTTACTTTGATAAAGTGTCAG TATCAACATTTTGTGATAGTTAAAACGCGGGGAGCAGGGCGTGGTACAGC CGTACAGGTGAGCTGATGGCGATCAATTCTGGGAGGGATCAATTCTTGGC CGTACTACTCCACTACGGCCGACGATCGGTCATCCCTTTCACCTCTTAGT CCCAAGATTTTGGGATCCATGTCTGACAATGTTTAGAAGTGTTAATAAAT CTAATCTTATCAATGAGATGATACACCGAGTTAGAGAAATATCTAGATTT TGCTACTTCCAACAGTGAGATTGTCCTACCTAAAACTCTAGATGATATTA CTATGCTTATTGTGCAATTTGATGGTATTGATATTCATGCTTTACATAGT TCTGAACTTATCCTGATAATTATAATTCTGAAAATGATTCTAGAAATAGT AATGAAGAAGGAAAATCTGAGTTCAATGAGGGATCACATTGAGGTTATTG ATAATGAACAAAGCTCAGGTCCAATAAAATATCCAAAGACCTAAGAAAAT GGAAAACAACAACATGGTGGGCTTTATCTGGAAATTAGGGGGTCTTGGTA GATCTGGTAGAATTCTTGCTTTTTAAAATCACATAAAAATGAGGATTTTG TGGGTTTACAAAAAACCATAAAAGTTCTATAGTGCTCTTGATATGGTTTC TAACTATATTCTGTTTAATATGCATTGTATGCCAAATCAAGGCTCTATTG TGGGGATCTTGTTGGCTTTAGAGCTTCCTCTTTTGAGGTTATTGGCCATA TTAATAGACAGAATACTGTGAAGAAATAACTCTAACCAAAAATTCCAGCA AATGATAACTGGTTATTGGACTAGCACAAACAAGATTTTATAGTTAAGTT GCATAACCTGGTTGCAAACTCTTCCTACCATGTGCTCATAGGGGGTGATT TGAACTTTCTTAGGGATCAAACTAAGAAACAAAAGACAATATTTTCTTTG ACACCTTTATGTAGGGGAAACCCCTACGGTGTAAAACAAATGACAATATA ATCGATGCAAGGACATCTTTGTAGATGGGCATTACTGAGTCAATGTTGGA AAAGAGGATCTTCACTTGCGGCAATAATAGAGATAACTTGATTTTAGCTT ACTTTGATAAAATGTTAGTCTCAACATTTTGTGATAGTTTTTTCCCTCTA AAGTATGTTAAGGCTCTTCACGTGTCATAAGTGATCATACTCCTCTTTAG GTTGACACAAGATCAAATGGGATTGTTTCTATTATATTTTCTATTTGAAA ATGTGTGGTTAAGTCATGTGAATCTAGCCTCCTTGTGGAAAATGTTGGCA GACTAATTGCCCTCGCTCTAATCTTATATATATTGTTTGGTAGTTTAAAC TGTAGATGCTTGGTAAAAAAACTAAGAGGATGAAATAGTAATGAGGAATT TTCTTTAAAACGAAAGAGGAATTTGTTTGAAGACTTGTATATTTTAGGTA TATTTTTAAAATAGTCACCTCATGTTGAGAGAGAAATGTCGACAACTATT TCCTAAGAGCTAATACAATATTTGGACAAAAGAAGAAACACAAATTTGGC AAAATCAAGAGATAGGGAAATTCTAGAAAGGTGAGATAAATAATGCCTAT TGCCATGCCAAAGTAAACAACAAAGTATAAAACTAGATTTGTTGTACTTA AAGACCCTTCTGGGTTGGTGGAAAATAATAAGGATATGCTAGTTTACTCT GAATTTTACAAAACAATCATTTGAAACCAAACATGATGTTCCAGTAGCGG TGGTATTTTGGGGTTGATCTGAGTTTAGTTATACATCAGGAATACTATAT TTTGGAAAAAAACATTCGTGGAGGAGGAAATTAAACAAGCCATTGATGGT TTTTATGATATAGAGTACTTGGCCCTGATGGTTTTTCTTTCCTTTTTATT AGAAAACTTTTTATTTTATTAAAAGTGATTGTATGACTCTTTGTACAATT ACTTTGTAGATTCATTTTAAATGTTCGTAGGATGATTTGTGCAATTGTTA ACATTTTCCCCAAAGAAGTAGATGCAAGAAAAAGGACAATTTATTTTGGC CTATCACGCTTGGCCATTATACTTTTAAATACTACAAATCCAAGACAAAT ATGGTGTCTCCAATTGTTGATATGTTGATTTCCTCTAATCAAACTGCTTT TCTTAAGGGTCATTTTATTATCTAAACAAGTGTTGTTGCTTCACATGAGG TTCATAGAAGTGCTTAGCATGTTCCAGTTCTTAAGCTAGATTATGAGAAT ACATACAACTACATTTGGGGTTTCTTCATGAGATGATTTTATCCATGTAC TTTGGGACCACATGGAGAAATTGGATTGATAATATTAGAGTGATGGCTCA CTCTGTGTAAGATTGAAAGATAGAAATAGTAATGATGCCACTGTTGGCAA GGGACTCGAACAAGGGGGATCCTTTCTCCCCTTTCTTTTCAACCTGGTGT GCGGTGCGTTCTCCGAATGTTTACTAAAGCTGCTAGGAATAGTATTTATT AATAGTGTATTGCCTAATGTTTTTAAGATGTTATTGTTAGTTTATAATAC ACCAATGGGTATCATATTTTTTGGAGTTTATATTGCTATTGCTAGTATTC TCGAATTAATACTGAGATGTTTTTAGAACTTATCTAGTCTAAGAACTATT TATAATAAGAGTGACCTTATGACCATTGATTAAAAGGAACAACAAGCCAA TGTTTTTTCTTAAAAATTACGCTACACAAAGGATTTTTTACCTTTAAATA TCTTATGGTTCCTCTTCATTTTTATAAATTGACTAAAGATGATCTCCAAC CTATTAAGTTTAGAGAATAATGAAGAAAGTTTAAGGATGGAAGGGTAGTT TGTTGCCTTATGGTAGTAAGATGACCAGTATCAAAAGTTATATCTATAGC ATACCAACTCATCTTCCTTCTATATTATTAAATTTCCTAAGTGGGCAACT CAACAATTACATATAAGATGTTCCATTTTCCTAGGGTAATGTTGCTGAGA ACCAAAGGCACCAATTAGCCAACTGGGACTTGGTTTCAATGAGCAGAATA TGGTGGTTTATTTCATTATTAAAGAATTTTGTGATTTAGGTGTTCACAAT TTGTGAGGGTTTAATCACTATTTGTTGGCATCTTGGATCAAAAGGTAAAA CCTGAATAATAGTAAAATTTGGAAAACAATTATAGACTACAAATATAATA ATTCTACTAATATTATTTGGATCAATGACAACATCATCTCTCCTATTTTA TTTGGAAAGGAGTGGCATTTGCTGATCATGTTGCCAGGATGACATACAAG TGAAAGTATAATGGGTGGAAATTGGATTTTTTAAGGATATTTGATTTGGC AACTATTGCCTACCCAACCTATATTTGGTTCTATTTGGTATTGTTAAAGG AAAAACATTGCCATTGATTATGTTTTGGATGGTCATGAATTGCAAATATC TTTTTATAGATGTGTGGATGTTGGCCTTATTGCAAAGTTGTATGAGCTTA TGGAACTTGTTAGGTGCTTGCACTAATTCGTCTATGGAAGTTGATTGTAT ACATGAAAATACGGTGCTAATGGCACCTACTATCTAAATTATTTTTTATA CAGTTGATAATAACAGAGGGATAGTGCATATACACAAAGATTCATGTTTT CTTGTGTATTTCCCAAATAACAAACATTTAACTACAAAGAAAATGAATAA AGATAGGCATGTAGAAGACAATATTTTTTGGCGGTGGAATATGAGTGGAA TGTGAAATATCCATCAAATATTATTTTTTAATGCATTGTTGCATCCCATA TCCAGGATTTTGTTTTAACAATTTCTGAATGCAAGTACTAGTACTGACTT TGAATATGAGGATCACTAAAGGCTTAGTGAGAAGAAACATATAACTTTGA GTATGGTCATTGCTGCTACCTTATGGTGTTTATGAATTCTAATAAATTAA CTCTTCTTTCAGGGAACACCTTGGACATGTATGCCATATGTTTGGAGCAA GCTGATACTCATCCTTCATCGGTGGAAAAATCATTGCAGTCGATATGAGT TGGAATTGTTGGATCTCTGCATTTTCATGTTGGAAAGAATAAGAGGGAGT TGGTCTCCATCACCTAGACCAAATGCAAGGGCGAAACTCTATAATACTAA AACATTGCCTTTGTCTTGTTATGACTTACAGTCTGCAACATTGTCCTGGA AGATTTAGTTTAATTTGATGTGCTACCTGACTATTTTTGTATGGATGATG TGGTGTCGTGTTTAATGACAGTGGGTGGACCTCCTTTTCTCTAAAGAAGT ATGATGTTTGATGTAACGGCCCTCTCTGGCACATCTCGCTAGAGAGGCCA TCACCGCACATGCCACCCAAAGAAATGGGGTTGCATGCTTTCATACCAAG ACATAGTGGTAATCGTCAAAGCATGGGAACACTTCATTATGAAAAAGAAT GCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.