Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA010547

[Submit comment/correction]

Sequence	AA010547
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA010547
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCAGCGGCGCAAACCCGCTCTCCCTTCTCCAGCCCCATCCGCCATGGCG CTGCGGGCCGCCTCAGGCATCAAGCTCCCACCCTTCTCCCTCCCGCCTCC CCATCCCCTGGGCGCGAACCTTAGCCGCTGCTACAGTGGGCTCTACGCGG CCAACGCATTCCCGCGACGCCGATGCGGCGCAGTCGTGGCCGTTGTGCGC TGCGCGAAGCGCACGGGCAAGCGGCGGTACCCGTCGGAGAAGAAGCGCCT GGATCGGCGCCACAAGGAGCAGCTCCGACAGACCGCCCCCGAGGAGGGCG GCCTGGCCCGGGAGGCTGGGTTCTGGCGGCTCTCGAAGCTCGGCGTCCCC GCCAGCGACGACCCAGGCAAGGACTTCGTCGGCGTCTCCCCGCCGCTCCT CCAGGCCATTGCCAAAGCCCTCAAATTCCCGGTACGCTGAACTTCTGCAT TTCATGATGTGGTGACACATAATGCCATGAATTCACGGGGTTTTAGCCTC CTAGGTGAGTGAGAGTCGACCGCGTGTTGCTGAAACAGCCTCCGTGCTCT GAAAGTCTGAATGTTAGTGTTGCGAAAAAAACCTTAGTTCCTGATATTAA CTTACGAAATTTGTACCCTTGTTCGTCTTGGCGAATGCCACAACCTTGAT TTGAGCTAGCTGCTGCTAACCTCCTCCTTCAAGGAGGTCGAGTGCAGTTT TCCGTGGTGACATGTTATGGGGATTGAGGTGTAATTCGTTCCTTTTGTTT TGATGGATATGTATGAATTAACTGAATAAACAGCCTTCCTACCTTGCCTG TTCCTATCTATATATTGGGCAAATCCCAATCGTGTCTAACCAGGAATTAG CTGGACGAGTGTTGTACTTGTATGTACTATACGTTGTACACAAACAAACT AGTTAACACATTGTTGTGCAAAATATGCCTCCATTCATGAGGTGTCTGTT ACCTAGGATGCTGAGCCACCAGCGTTCTTATTTCACAGCCTTGGAGCTGA TTGTACCCCTGTGATTTCTGATTAATAAAGTGTGTTTTCTTTAAAAAAAC AAACTAGTTACCTAATGACCGCCTATATGGAGCAATTTCAAATGGTGAGC AGATATCTAATGCTATACCTCTGACATATGTTTGATTGTTCACTATAGTT TACATTTCTTGTTACTCATTTCTCTTCTTGTAATTGCCACTGGCTTGCTG TTATCACAAACTTTTCATATCTGTGTGCTCATGCTTTATGCTGTTAATGT TGCTATTAGACTTTTCCTATAATTATGCGCCTCTAATATGTTCTCCTGTG CAGGTTGCTTCTATGCTCCCCGAAGAGGCCTTCTCTGTTATTCGCAAGTC ATTTGATGCACGGAAGGTTCTTACTGGATTGATACCATCTCTCTCTTATT TAATATTTTTCATCCTCCATAGAGATGGGATGAAATGATGCAGCCAAACT GGGTTAATCTTGATAAAAAAATATTCATGCAGTTGAAAAGAAAATCAATG TAGTAACTATTTACGCAAACTGGGTTAATCTTGATTGTTCATGTGTATTT CTACCGGTGTTGAAAACTATTTAGTATTTACGCAGATTGGTTATCACTTT GTCTGCATCATTTCTTTATGAATGAACAAACCATGTATTACATCTACAGA TTCTGAAAGAAGCTCAATTTGTCTATACTGTTGATGTGGATGCTAAGAAG CTTTTGGACATGGAGCCAAGGACATGGGATTTTATTGCTAGATTGGAACC CAAGCTTGGAGCTGTAGAGTATATGTCTGATGAGAAGGTAGCAACTGATC TGATCAGTATGCTTAATGTTCATAACAAAGGCTCCAATGATGAAAATGGT ATCAGGGATACTGTTAATAATGGCTCGATCCATCCTACACGAATGAAACC AAGGGTGGCCGTTGTAGGAAGTGGACCATCTGGCTTGTTTGCTTCCCTTG TGTTAGCTGAACTTGGTTCAGAAGTTACCTTACTAGAGCGTGGCCAACCT GTTGAGCAAAGAGGGCGTGACATTGGTGCTCTAGCAGTTAGAAGAATTCT CCAGTCAGAAAGCAACTTTTGCTTTGGCGAGGTATACTGTCTGTTCCTGT TTTACTACCAAGGCATCAGTAAACAATCACATAATTGCTTGGAGCAGTAT TCAGATAGGTAGTTGTTGACAATATACGTGAATCATCTAATACACGGCTA TATCTTTTCGTTAAACATAAGCATCAGCAATCATGTCATTTTGGCAATTA CTGGTGCAGGTTCTCTTTTTTCAGGCGATCACATGAAATTGATATAGACT ATTACAAATCCTTGGTGCATGTATCTTTGAAGAAAAAGTGGCTTTAGTAT TTTTTCTCTATACTCTGTACGTGAAATAGTATATGCATTTCCTTTTTGAT ACATGTTCCAATCAGGTATATTAGCTGATGGGTGGATTGGTGCATCCCAA GAAAAGGAATATGGTCTCCTAATTATATGACCTGAAAAGTGTACAGAGAC ATATTTTAGACATTACATGATCTCAAATTATGCAGAAAAATCGTGTAATA ATCTTCACGTTTTTATACTCCAGAAGAATTAATAATAAAATCCTAACTGA TACATGCTACTTCTGAACTCATTTTCTTCATTAAGTGACTTGCGATTTTC CTTACATTAGTGTGAACTTTAAAAAGGTTACTTAATCAGACGATCTTTAT TAGTTAGGTTGATGGCACATATGATAACATCTATATTTTTGGAGTATCAA TTACCCACAATGGAACAGCAAGGATTGACCAAACTACTATTCCCTCATTC CATATTACTTTAAAGATTAAGTCCATCAATTCTTGATCTTCTGTTCTTAA TCATAGCAGGGTGGTGCAGGTACATGGAGCGATGGGAAGCTTGTAACCAG GATAGGGAAAAACACTGATGGTGTTCAGGCTGTGAGAATCTTCCTTCTCC ACCTCAATGAATAGCTTGAGAATTAGAATTACAAACTCTTCTAAAAAACA TTAGATTTTGATGATGTTTTGATTTCGTAGCTATCAAGATATGAAGTGTT TGCATTGCATAACATTATATTCTATACTTCCTAGTTCAAAACGGACTATT TCTATGTGTTTAAGCTATTCTCTATGGGCTCTTGGATTTCAGGTGATGAA GACACTTGTTCACTTCGGAGGCCCTCCAAACATTTTAATTGATGGGAGAC CTCACTTGGGTACAGATAAACTTGTTCCTCTGTTGCGGAATTTCAGGCAC CACTTAAGAGAGTTGGGCGTGAGTTAAACATATCTATCTTCACTAACTCT CTGTTATTGTTTTGTTATGTAAGTTTTATATGTATTGATGTATTATGTTT AATGTTCGGCTTACAGGTTGACATAAAATTCAACACTAGAGTAGATGACC TTATAGTGGAAGGTGGGCAGGTCAAAGGAGTTGTGGTTTCTGATTCAAGA CTACAGCCAGGTTCTGTAGGTCAGAAACTATCATTTGATGCAGTTGTATT AGCAGTTGGCCACTCAGCTCGTGACACATACAGTATGCTTCTGAGGCATA ATGTAGATATAACCCCCAAGAATTTTTCTGTAAGCTCTCTCATGCTGCTT AAGGCTGCTTTTACTTCTCTAGTACTTGTCGATCATTTGATGGTCAGATG ACAGACAAACCACAGCGGAGAATTGAAGGCCATCTTTGGATTGAATGTTA AGAGTTTTTCATAAGAGGCACATTGGTCATGTTATGCTGCTTAAGGCAGA AGGAGATGTTGGCACATGAACAGGAGGAGAACTAGGAAACGGTCCTGGAA ATATAGACAGAATCACAGAACATACAAAATTAGGGAGTTATATCATATTA TAGCATGAAGTCAGGATTCAGGAGAGGCCCAATGGCCTAAACAAGTAAAC ATGATGCCATATGCCTCATAATTAAACTGAAAAGAAGGGAGTGTCTGCCA GCCCCCTTTAGTTCTCTCACGGCTTATCCCAGCCTTTGTTTATCCCTCTC CTCTAGAAACCCGCATCTTATTCAAGCCATGCTGTTTGGTATCCTCTATG ATACTCTATAGAACAAGGATCACAACAAGGTGGTGATAGAATAATGTAGT TAGCATAAACTTCCCATTTAGGTATTTTAACCGGTTATTTTTATTATTAG TCATCCTAATGTAGGACTTGGGCTGTATGATAACTGCAGCGCAGAGTGGC TGGACATTGCCCCCTTGTAGCACTATGTATATTGTTCACGTTATCTTTGA CAATTGCAAGCACTAACTTTTCTTCATGCTATGAAGGAAGTTATTGTAAA CTACTTTCTCTTCAGTCCATGTGACAACATTGGCTACTCTTGCAGGTTGG CTTAAGAATTGAACACCCCCAAGAACTGATAAACAGCATCCAAGTAAGCT ATATTCCATTTGTTCACATCAATCTTTTTCTGAATGATACTCGCGTAATG TGGTTACCTTAATATCAAGGTTGATATTAATTTCTAGTAATTTATCATTC TGCATTTCGTGAACTCATATTTTGTGATTGTTAAAAGTGAAGCTGAAAGT AATAAATCAAGGCATAGGATGTTAATTACTATGTCATCATATGGAGCAAC CCATTTACAAGCTCACAGTTTTGCCAATAACCCCCAACCATCAAATTTTA CTATTGAAATAGCAGCTTGAGCAGAAGCTGACGAAGATTCCTAGCAAATT GTGATAAGTAGCCAGTCAACTATGCAGTGATGAGGCCTCATCTATAAAAA CATGTGACCGAGTCTGTCTTGATGACCTAGGACTTGTGTCCACCAGTTGT CTGGAGCATGGATGCTAATGGAATTACTGTTCATTGCGTGATAACAGCAA TGTTTGTAGTATGTGCACAATCTTTCTTAGAGTCTATGCAGGTTCGGCTA CCAGGCTCATTGGATATATGAACCTATTGTTCTTATAGTAACTATGTCCT AAAAAGAACTCAGCTACACCATCTATCTTTACTCCCGTATACAAGTCAAT TTGTGGTGGCAGTCCGGCCACCTTTGGTTACCGCACATGCTATATTTAGC TCAGACGGTTAAGATGAATGCGAATATGGATATTTTCATTTTGAAAACGG CAGAAAGATCTTAGACTCACAGTATAGTTCTTTTTAATCCGTATCAACGC GCGGGTATTACACTAGTATGAGTAGAAGATTGTATTAATCTTTTAAAAAA TGAGCAGAAGATTTTAGCATCGCATTGTACACTTGTACTTCGCGTTGTAT TGAAGAACATATGGACAATATTTTCACATACCGCTGTATTGAAGAACATA TGCACAATATTTTCACATACTCACACTATGTTCAAAACAACCTATGATGC ATGCTATTGTCATCAATTACAGTATTCTGAATTGGCTGCTGAAGTACATA AAGGGCGTGGGCGGATACCTGTAGCAGATTACAAAATAGTGAAGTCTATT GGTGAAGGAGATGCAAAGAATGATATCGAGCAAGCAAATCAAAATCGCAG TTGTTATTCATTTTGCATGTGTCCTGGAGGACAGGTCAGTCATTTTTTCG TCGCTTAACTCACCACTCTTTCTTGAATGAATTATCTAGTATTGCAATCC TGTTCTTCAAATACCGATACATGCCTGCAGGTTGTTCTAACTAGCACAAA CCCATCGGAATTGTGCGTCAATGGCATGTCATTCTCACGGAGAGCATCTA AGTGGGCAAATTCAGCTCTTGTGGTCACTGTATCATCTCCTGATTTTAAA CCATTTCAATTCCACGGTTCTCTTGCGGGCGTTGAGTTCCAGGTACTTGT TGCAATTCCTTTAGATAACAGTTAAAATACCAATAACTGCATTACCATCA TGATGCACATAAACTGATCCTCTGGATGGTATCAGGAGTTCAAAATTGCC AAGAAGACAACCACTTGAATGCAAGAGTACAAATAATCCACTGGACATGA TTTGATTTCCTGAGTGTTTGATTCTATACTTTTTCCAATGTTAGCTGCTT TGCTGCGCTAACTAGATAAGATGTTCTGTACACAGTTGCCGTTTGACTTT TGGGGAAAATAAGTAATTTATTTACCTTTATCTTATTTTATAGCCCATTC AAGTACTCTTTCTTAGATAAAGAAGCCAAACTGCTGCTGTGTAATGTTCA AGGTTATGACATAACCCGGGCAGAAAAGTCCTTTTGGAACCCAGGCTCCA GGGAGGCTTTTTTTTTAAACAAACCTCATTTTGAAAATTTTAAAAATTAA AAATAAACTTATATGAGTACACATAGTTGCCTATCATGTATGTACTAAGT TCTGTTGACATTTCTTTCTAAACGTGATCTAGAAAAAAAAAAGACAAATG CGAGGAGAAAAAATGAGTATTTTTATTCCTTTTTACAGCCATGATTTTGT CCTTTTTGCGTAGACCAAACCGTAAAGTATTTTTCAACGAAACTTTACAG ATATGTGGAGTACATATATTTGTGTTCACAGAATTGTTTTTAGAACTTTT TGAAACTTATAAATAACAATTTTGAATGTTTCAAAAATAAAGGGCTCCCT GGAGCCCGGGAGCCATATCATCGCACTCAAATTTTATGATTCTGCTGACA TTTATTAGCAAACAAGCAACAATGGCTAGATGGATTGGACATAGGTGGTT ATATGTGGTTCAATAGCAAAGGTTTTGGTGTATTTTGATGTGAGTAAGTT GTGAGGAGTCTGTAGGTTCATACTGAATGTGGAGGTAGGCCCAACTAGAT ATGAACATAAAATGGGAGGATCCTAAAGGTCATGGCAACACTGTGCAAAA TTGGTGATTGTATTTGTAGAGTTGTCCTTGAATCGGTGATCTATCCTAAG TGAAAGATGGTAATGTTAACAAATAACAACTATTGCCGACAGTGTGGGGA GCCGCGGGTTTTTGTTCAAGATCAGTTCAAAAGATGATTATGTAAATTGT TAACTATTTCAAAAGGTTCAGATATGATTTCGTTAGGCTATGTAGTGTTA AATGTGCTCATTTCTGTTATGAAATGCTGTAATGTATTACTAGACTATCA TGTTAAAATTATCATCACAGTACTCAGAAAACTCACAAGATGATGATCTT GTTTTCTCCATCTAATTCAACTGAAAATTGTTTCTCAAAAACATGGCAAT CAGATTGGCTACGCCTATGAGGCACAGTAGATGAGGTACTGTTGGACTAC GACCCACAAATATTGACTCATTATGATATTAAGTAGGCGAATACATGGGG AGAAAAATAATTTGAAGTGACCGGTGAAAATTCAAAGCCGGCATGTGATG TATGCTAAAACCTTACAATGCATGTTTTCTTCCATCTGTACGACATTCTG ATGGCAGTTTCCCCCTTCTGTTAATAATCTGGTTACTCGTAAATGTAGGT TTCCTTTGTATTGGTTGAGCTTAATAACCATTTTTCCATCTATACTACAG TCTGATGACAGTTTCCCCTTCTGTTAGCGTATGACTTATCTGTACACCTT TAAAAACAGAGAGAATATGAAAGAAGGGCAGCTATGATGGGCGGAGGGAA TTTTGTTGTCCCTGCACAGCGTGTCACAGATTTTATCAGTAACAAATTGT CAGGTACTAATGCTGTGCTATGGTCTTCTCAGTTAGTAATGATACATGTT TCTTTTATTTACTTTGTTACCTGTTCCAGTTTCAACTCTCCCACCATCAA GCTACAGGATGGGAGTTCGTCCATCCAAACTCCATGAGCTATTCCCTACT TACATAACTGAAGCTTTACAAGAATCAATAACAATGATTGACAAAGAGGT TTGAATTATGTTTTTCTTCATTTTGCAGTTCTGAATTCCATCTGTCCTGA CCCATTTGCAATGCAATGTTTCCAGATGCCGGGCTTTATTTCTAGTGAGG CCTTACTTCATGGTGTAGAGGTATGCAAATTTTTATGGGACAAGCTGAAT GGTTTTTTTAGTTAATTTATCTGCTTAAAATGGTGGTTCATTTGGTAAAT TCCTGCACAATACATTTAAATATCAGGGAGTCGGGTGTTAGTTCAATGCT GTCAATGCCGTAACCAGAATGGTAGCTGGCTAGTCTAATAGAAACATGCC CTACTAGTAATAGAAACATGCCCATAATCGATATGTTTGCAAATTTGTGC CTCGAATGTTCAAAGGTAGCCTCTTTGATGCTAGCCTGCTAATGTCTAAT GTAGAGTTACTTGGTGATTTAAGTTTTATATTAACCATTTGAAGGAAAAT TTCTTATGAGGCGTGCATTTCAAGCACTACTTTCATTACCAGGCATGCAC TTCGAGCACTATTTTCATTTTCAACAGTGATACAATCTGGTTCACTCTGC ATGTGTTCTGCAATTTTACTATAGTAGTTGTCTTCTATTAGTTGCAGCCT GTGCGAAGTAACAGAATAGTATCCTGCTACTGGCAGGTACGAAACTGGAG CATGTTCTGAATTATTTATATTAGGAAAAGACAGAATTTAGGTCATTAAT GACTGCAGTTCAGTTTAGGAAATGAGGAATCCTAGTTTTAGTTCCTGCAA AATAACCTGCAAAACCAGGTTAGATTTGTAAAATTGTAATTGAGGGGTAT TAGCAAGGTGGTCTGATAGTGCAGCGGTATCCGCAGTTACAATTTTGGCC TGTGATAATGAGATTGGAACCTTGTAATTCTAGCTTTTGCAAAGACAACA GTTGAATCATGTTTTCTAATGCCTCTTGTCTGCTTATTTAAATTTGGGAA AAGCTAAGGTAGAGCTGTAAATCCATTAGAGTAACGTTTATGAAAACAAA AAATGAATACTTGTAATTTCATCAGGCCTGGCGAGCTAGGCTAAAGACCC TGGACGTTCGAAATTTTGTTTACAAGATCGAGAACCCAGATTGTATTTTC CTGGAAGATACCTGAAGAGTGAAGAGCTGTATTTTTTGTTTGTTTTCCTG AATGCTTATTCATATCCCACTTTTCATTGATTCCACTATATAGTCTAGCC TAGATAGTGGAATTCTAACTAGGTTTTAGGATTTTAGCTACTTGATTCGC TGCCCCTAGATTCTCTGTCCTACTTATTGGCAACGTACATTTTCCCTCTG ATTAGGCTGCATCCTTTTCCCTATGGAGAGGAAGGAAGACACAGCGCTCG GCTTTAGCCCCTATGTTTAGTGAAATAGACGAGATGAGCTCCTCTTTTGA GCTCTTTGAGTTTAGTTTTGTGGGCCGTAATGCAAACAAAGTAGCTCATG AGTGTGCACGCTATGCTTGTACACATGTAGAGAGTAGGTCTTGGGATGAA CCCCCAGATTTCTTAGATAACAGTCTTAGGACTGATTGTAATCCAGACCA AAGCAGCAGGTTTTCAGACGCACTCTTTTCCTTCCAGGGTACCGAAGGGG CCTGGAAGGTTTTTAATGAGGCGGGCCTGTTAGCTTAATTTTTAATATAT TGTTTTTCGTCAAAAAAAAAAGGCTGCATCCTTTTCCACTCAACCTTTTC TGGTCACTTTGGTTGTCATATTTGTGTATACCCCTGGTCTTTTTTTCAAT ATTTCGTCTTTATGCTTCATTTCCCTTACCATTTTCGTCTCAAATTTTGT GCTAATCCGGTAGTCCCCATAATGGACAACTCCCATTTCTACCTTGATTC TAAATTTGAGGAGCCCCCCTGCACCAAGACAAATGCAAGTCATTAACATA AAGCATGATGCATCCGTTTTTTCTTAAAAATTTCTGGCACGTGTAAATTA TCTGAAAGTTCTGCGGTGTGAAAAAGATGCAATGTCAACTGTTTTATCCA CTGCATAAATTCATCTGTGTGCACTCTTTTGTCCTTTCTTCCTTTTCTGG TTTGTTTATGTCATGGTGGTAAAGGTATATGTTGCGTTATATCCTCATGC ATGATGCATCCTTTCATTTTATTTATTTTTACTTGATGTCTGTTTGCAGA CTAGAACAAGCTCGCCCTTGCAAATTTCACGACATAAGGAGACATACGAG AGCACGTCACTGCAAGGGCTGTATCCTATTGGGGAAGGTGCTGGCTATGC AGGGGGAATAGTAAGTGCTGCTGTGGATGGTATGTACTGCGGGTTTGCTA TAGCGAAACAACTTTCTCTGTACACTGGTGATATAGAGTCAATTCTTGGC AAAGCACAGAAACAAACAGGTTCTGTAAAATATTGAGTACCGATGGCTAG TAGTTATCTGTTCATGCTTCGTAGGCCCTAGATTGTTCAGAAAAATACCA TGTTAGCAAATAGCACAAGAAAATTTTGTCATGGAGAAACCTGTGATAAT TGTACTCATAAAGAAATTCGAGTCTGATGTAGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.