Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA034076

[Submit comment/correction]

Sequence	AA034076
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA034076
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGACTTTCCCCCCGCCATTGCCGATGCTTCCCCGGCCGCTGCTCCTCGGG TCGCTACCACGCAAACGTTCAAAAGTCCAAAATCAGCACAGCTCAGCGGC CCACGTGTAAAGTGATCGACTTTTTTTTTGAGGGGGTGGTCGACTAGTAT AGCATTTTAGTTTTTCTCTTTTTGAAAAACAAATACCCCAGGCAGACAAG GTGGCCCGTGAGTCACTCGTCCTCTCCTTCCCCGGCGCTTCCAGTCGTTC CAGATGGCGATGGCTATGCGACGCGCGGCGGCGCTCGGCGCCCGCCACAT CCTCGCCGCCTCGGCCTCCGCCTCCTCCCGCGTCATCAGCCGCCGCCACG TACGTCCTCTTTCCCCCCACTCCACTCGCCTATGCTCCTCCTTCATACCC CTCCGCCCTCCCGCCGGCACGGGGAAGATCACTTCCCGACTTCCGTGCTC TTGTGCTCACTCCTTCGAGGATTCTATTTTCGTGGCTGTCTGGGTGCGCA GATGGGCAGCGTGAACGCGGGCGCGGCGATGGAGAAGATCCAGGCGGCGG GGCTGCTCAGGACGCAGGGCCTCATCGGCGGCAAGTGGGTCGACGCCTAC GACGGGAAGACCATCGAGGTAAATACTAATACCCTTCCGCCATCTTACCG TATTGCTGTTTCTACGGAGCTTGTGATTTGGCGCGGTGACTTGGAGGTGA ATTAGCGGTTATTGCTGGGTGGTGCTCCGAGATTCCGTGTGGTATGTGAT GAGTGTGGAGTTTTGGTGCCGAATCCTTAGTTTATTGTGATTCTTCCCGT GCAAGTATTAGTCGTGTGTCCTTGGCTTGTGGACACACTGTTTGCCCGTG TAGGCATTCAGGCGAGCAGGTTATGGGCGGCAGTGTAAGACTCTTTGGTG GAGTGTGCTAAACAGAATTATGTACTCGTTTTCAACATGTTTTGGACGCT AGGGAGTCTGACGAGAGGAACACATAAATTAGGTTGTGGCGCCAAGTATT AACAGGAACCAGTATTAACTATTAAGATGGGGAAGCTCCACCAGTGTCAT TTATTTATGATAAACAACACGCTTACTGATGCATCTATGAGTTCTGAATA TGTTGGTTGGCCTTTTGATCCCATTCCTAGGACGTTAGTGCTACTCCCAC AATCTCGAATTAGATGTCGGAGATTTTCTAGATTCGCATGTATTTAGAAT CTCCGACATCTAATTTGAGACGGGAGTATTAAATTTTCCTCTTGCCTGAT AAGGGTTGGTCCATAGGGGGCTAATCTTAATTCTTTAGCATGGCTGTATC CTGTATTAGCATTGTATGCCTTGATACCGCCGCAGTAGTCATGAAAATAT GCTGCAACTTAGCTGGTCTTGCCCCTTTTCAGTTTGCTGCTTAGGCTATT TCTGTGAAGTACACTGGACAGTGTGAAAAATCAATGAAATGTTGCCACTA GAATACCTCTACTCACTTTTCATATCAATTCTCTAATCCATGTTCTCGTA GGTGCAAAATCCAGCAACTGGCGAGGTCCTTGCAAATGTTGCCTGCATGG GCAACAAAGAAACATCTGACGCAATAGCTTCTGCGAACACTACGTTTTAT TGTATGTCTAACGCACCACTGCATTCAATTTTTATGCTTGCATGCTGATC GAATAATGTTTTGTTAGTGCCATGGTCAAAACTTTTGAACATACTCATAA TCTTAATATATGCAAATTAAATTGCTTCTGCGTCTGGAAAATTATCAATG GAGGGAATGTTATGAATCAATTGAACCTTCGCTCACATGTTACCTTAGTT TCCACAATAAACTAAATATCTTCTGCATATTAGAAAATGCTTTCTACCTT GCCTACGTGTTCTATTGCTATATAATACAGTTAATACTTAATACTAGCAC CTTTGGTAGTTAGAATGAATCTCATAAGAAAATCAATACCACTACACTGC CTCCATATGAGGTGAATATGTGATGGTTGTTTTGAAAATGTTCATTTCAA AATATGTAATACATGCTTTCTTTGATGGACATGCAAACCTTCCTTATCTG AATTAAGTTTAGTTATGGTTTTCAATGCCTGGAAGGACACTTGTCACCAC CTCATATAAAAAAATAGGGGTTACTTTATTTTGTCGTTCTATAAATGTTT GTATGCCTAGGCAATTCTTTTTTTCTTTGTATATTTGATTATAGGTACTG CATTTACTAGTTCTACTTTTCGTTACTCCCTCTCACCCTTTCCTTTTTGT AGCTTGGAGCAAACTCACTGCTAGTGAAAGGAGCAAGGCACTAAGAAAAT GGTATTTTGTATGGATCAATGTTAATAATAGCATGGATATCTTGTTGTAT TACCTCGATCATTCTTCTCACTATGTATATTCAACAAAGGCATGATCTAC TTATTTCACACAAGGAAGAACTTGCACTTCTCATGACACTGGAACAGGGG AAGCCTATGAAAGAAGCTCTTGGGGAGGTACTTACTAAAATCTTGGACTG ATATTAGTTAGCTGGATGTCATCATAAAGGGTTGTGGTAGGCTGATTGTT GCCAATCATTAATTCAGGTGAATTATGGTGCAAGTTTCATAGAATATTTT GCTGAGGAAGCAAAACGTGTATATGGTGATATTATTCCCCCAACCCTACC TGACCGCAGAATATTGGTTCTGAAGCAGGTAATATGCTAATAGCTTTTCA AAACTTATTGTTCCTGTGCCTTGGGTTAATCATTTAACCCTCCATAAATC CATTACTTCTAATCTGTTTAAATTACACCATCAGTTTGTACAGTCCATCT TTCATTTTGTCAAGAAGTTTTTCCTTTTTTAGGTACTAACAATCTTTTGG ACTGCTACAAATTTCTCAATACATTTTCTTGACCTGATGCACTGAATATA TGGTTTTGCGTTTTGATATTTGGCTAATATGGCTATTACATGTGAGGTAA ACATGATTTCATAACGATTATTTTCTACAGCCTATTGGGGTAGTTGGAGC TATTACACCATGGAATTTTCCTTTAGCGATGATAACCAGAAAGGTTTGAA GCAAAACATTACACTTCTCCATTTGTTAAGATGTCCAAACGAAAAGCAAC TATTGTTGTGCATTTTCTTATACATGGTTTGGCACAGGTTGGACCAGCAT TGGCTTGTGGATGCACTGTCGTTGTCAAGCCATCAGAGTTCACACCTCTG ACAGCATTAGCTGCAGCAGACCTTGCTCTTCAGGCTGGAATACCTGCTGT AATTCTCTCAAGTTCTCTACAATTACGACCATCTTTGTGTATGAGTGTAT TTATTCTGTTTTGATATTACTGCACCTGTCGAAGTTCATGTTTCAAAATG AAGTACTCCCTCCAATCCAAATTAAGTGTCGAAGATTTAGTACAAACTTT GTACTAAAACGTTACTAAATCACCGGCACTTATTATGGATCAGAGGGAGT ACTAATTTCTATAATGACTAATGTAAAGTAAGGAGTTAAAACCAATGATG TTCTGCGCTATCAACGTTATGTGCTCAGCTACTTAACAAATTTGATTACT CCCTCCAACCCATATTAGTTGACTCACGTTTGTCTAAATTTGGATGAATC TAGACACTATTTAGTATATAGGTTCATCTAAATTTTGATAAATCTAAGTC AACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACTAGATTTTTGGGCCATCTTACTTGT TTTGAGAAGTTAACTATTATGCCATAAACCCATCATAATTGCAATCTTGC AAAACTCATAAGGGGAAAGACCAGGTTTCAGGTACAGTAGGACAAGTTGC AATTTCCATCTTTTACCTACACCTGCCAAGTTGTTTCTCTATTACTGTTA AACGAAATTCATTGCACATATTTCGATTATGTTCCTTTGTCCAGGGTGCA CTGAACGTCGTGATGGGTAATGCTCCTGAAATAGGTGATGCACTAATGCA GAGCACACAGGTTTTATTTCCTTCTGTTTTTGCAATATTAACTTTTGGCA TGTGTTAGGCAGGAATGATTGTGTTTTACATGATAACATGTTCTATTTTA TAGGTCAGAAAGATTACATTCACGGGATCAACAGCTGTGGGTAAAAAACT CATGGCTGGATCAGCAGATACTGTGAAAAAGGTATGTACTGAGAAACTTC TTGTGGAGAAATTACTGTGTGAGTTCTGGAGTTTGGACACTGTTAAATAC TCTGAAGTTTAAAGTTCGCATCCATGCTTAGATCTTTTTCTCTTTAGGAC GCATCCGATGTTCTTATTCATGCTTAGGTCCTCCTGCTAGGACACATCTG ATTTCCGTATGGTCTGTTTTCTTTTTCCAAGGAAACACAATGCTTGCATT TTAATGGTATGCTACTATCGTGTTGCTTTTCCATTTTGACTTTTTTTTGT TGGAATTTTGGTCATCATATATGTCACATGGTTACTTTATTTCTTAATCA CAATGTTTCTTCAAAGCTGTTATTGCTCCATTTCATTTTACTACCTTTCA TCATTGATGTTCACAAGAATAATTCTCCTGTAGGTTTCTTTGGAACTTGG TGGGAATGCACCTTGCATTGTTTTCGATGATGCAGATATCGAGGTGGCCG TTAAAGGCAGTGTAAGTAAAAGTTCCGTTTCTGCAACTTTTCTGGGGCCA CTCTTAGTATTCCACTAGCATACAGACCAATAAGATTAGTTCTCTAAGTA GATTCATAATAGCTACAATGAGTTTGTACATGATGTCGAAGACTTGTTGG ATCTATTGTTTTCCTAAATTTTGTGGTTTTAACATGATAACTCAGATGCT CTGTTGTCTTAGGTCAATGTACATGTATGTAGGTTTTTTTACTCTCTCTT CGCTGAGCTGCTAGGTAATGCAGCTGCCTTGCCTGGCATATTTGGTAGTG CATATAGTAGTCCCCTTTCTCCCCTCCCACCCCCAAACAGCACATGTGTT CGTTATAGTCACAATTGACCATGACCATCCTTCAACCACATAGGAGAAGG AAATGATAACACTGATCCCTGATCCAAGTGCAAAAATTCAAGCATCCTAT TTTTCCGTAGGGTTTGTCAGCCTAGGAGGCTAGGAATCATTACTACTGCC AGTTCAAACACTGTAATTATCCTTTAGTTCTGTCTACACTTCACTGCATG GAAGGTTTTCTGTTTGCATGCAAGGAGGATACGTCCATTGACCTTCAATT ACTGAAGAAAAAACAGCTATTATAATGATTCAAATTAAACACAAACACAT AATGGCAAAGTGCATAGCCTGTTTGAAACAACAAGAGTGAAGAAAATCTT AAAAAGTCTAAAACATCACAGGGAAAAGACATATCTGCGTTACTGTTCTA GAGGATAACATCGACATTGACAAAAAATAGGAACATTGTTTTCTCGAGAA TGGCTGATTCAAGTTCATTTAATATGTATCACTTTGGAATTACAGTATGA TGAACATTTACCATTTCCATTTGTGTTCAGCTTGCTGCCATTGTTTTCTC GAGAATGGCTGATTCAAGTTCATTTAATATGTATCACTTTGGAATTACTG TATGATGAACATTTCCATTTGTGTTCAGCTTGCTGCCAAGTTTCGTAACA GTGGACAGACATGTGTATGTGCAAACAGGATACTGGTGCAAGAAGGTATA CGGATCACTTATTTCATGTAGGTGTTACTGGGTACTCATTGTTCCATTAT AAAGTGCAGTTTATATATGTAGGTATTTATGAAAAATTTGCAAGTGCGTT CGTCAAGGCTGTTCAGAGTTTGCAGGTTGGCAATGGGCTAGAAGAGAGTA CATCCCAGGTATGTAATCGTGTTAAGTTTTAGCTGGCACATATTGAGCTA CATAATTTAAGCTGGGTGTTTCTTTTGGTAATTGCTTAGATAATATTCTC TCATGTAATGCATGAGTTATAAGGATGCCTAATTTTACAGTAATTAGGTC TCTTTGGATCGAAGAACTTTCACAGGAATTTTGTAAGATTTCAAATTTTC TAGCAAGAGGTTATAGTAGATCACATGGAAAAATCACTCTGTGCCTTGCA TGAGCCTTCTCTCCTCAAATCCCTGTGGAGCATCCAAAGAGCCAGTTTTG CAAATTCGTGTCAGATTCCACAAGCCACAATATCTAAATCCTATGTTCTT CCTATTCCTTTATTTTTAGAATCCTGCGATCCAAAGAGGCCTTTATTATT TGACCTCCCTGCTGCTTCATTATGTATAATGTTTGTGATCTGCTTTGTTC TCTTCTTTTTTTCCGCCTCATCTTAGGTCTTACAGTTCCTTTCATGTGCA GGGTCCTCTAATCAATGAAGCTGCTGTTCAAAAGGTTCATATTTTGTACT TGCAGTTGCAGTAATTTCTTTATATTCTCTAGCATCTTTTTTCCTCTTTG CTCTAAAGCAGCCCTCACATGCTTTATTTGTTTTTTCTGTTCTCCTGTAG GTAGAGAAGTTTGTAGGTGATGCTACTTCAAAGGTAATCTTGGAAGACCA TAACATGTGCATTTTTTATATTGAAATTAGAAGGGTGGTTCCAAGATCTA TAACTACACCAATTCCTACCCCATATGGATTATCTTTTGTGGTTCTTAAA ACCATGAATCAGAAAGTAGAAAGTACTTGGTTGAGAAACTGTTTAACTTT CGCGACTCCAGTTAACCCCACCCTAACTTGCCCCATCCACAGACCCAAAA AAATACAATTCTATACGAAAAGCTTGTCTGTTTTTTAATTTATACCCTAA AGTCTCCACTTTTGTTTTGCAAAATATTGAGTTTTTCATGGCAGCTTCTG GTTAGTTGAAACCCTAGTTGAGCTGGTTTCTAGATTACATTCCTGGAAAA TGATAGCATGGTGCTTGATTGCTGCAGTTGAAGTCAGGACCTTGTTTGCT TTCATGTGTCAGTTGACCAATTCTCTTTGCAACTGCGTGTAAAGTATCTC CTTAATCCTTCCGTAGGGTGCCAACATCATGGTGGGTGGTAAAAGGCACA GCCTTGGAATGTCATTTTATGAGCCAACTGTGGTAGGAAACGTCAGCAGT GATATGCTTCTTTTCAGGTAGAGTCCAAATTTGACATCATAGCCCTCTTG TTTCAATGAATAGATTTTCTTTTCATGTCAATAGATGATAAAATCCTTGG GCCAGTCCTTTGCAGTTTACAATCATGTGTTAATACTACCTTTTGCTTCA GGGAAGAAGTTTTTGGTCCAGTTGCACCACTTATACCATTCAAAACTGAG GAAGAAGCAATTCAGTTAGCAAATGACACGAATGCAGGTTCATTATCTGG CCCAAGAGCACCTTTTGGATCTCCTTATTTTAAACTCCTTTATTAATGAA AATGGCAAATAATTTGCCTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAACTGGCCCAAGT GCACCTTTTGGATCTCCTTATTTTAAACTGACATAAGTACATGTTAAGCC CTTTAACCAAAGACTTGAGTGGAACATACTCTACAGGGTAGGGGGCAGTC ATCAAACGTTTGTATAGGATGATAGAACATGGATATATTTCTAGATACTG GAAACTATATTCTGTGATGTATGAATTCCTCTAATGGTTTAGTATAATCA TCTTAAAAAACTAAGTCTTGGTGTAGGGATATGTTTTTCTTAAAAATGCT GAAAGTTGCATCATTGTTCTTTTTTGCATTAGAGTATGCGTAGCCTCATT ATCCATGAATGTTACAGGCTTAGCCGCATACATGTTTACAAAGAGCATAC CCCGCTCATGGCGTGTCTCCGAAGCTCTTGAATACGGGCTTGTGGGTGTG AACGAGGGATTGATTTCAACAGAGGTAACAGAGCGCCAAATGGAAATTAC TTAATTACCTGCTTTCTGGCCTACAGCGTATTGATATATTTCACATAATT TCCAGGTAGCGCCATTCGGCGGGGTTAAGCAATCTGGCCTTGGACGAGAA GGATCGAAATACGGCATGGATGACTACCTGGAGGTTTGTGTACAAACTTG TAAGCTAGTTTCGACTTTAGTCGGTGCTCATTTGCTCAACCGCGGTTGCA GATCAAGTATGTATGCATGGGGAACCTGAGTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.