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GrainGenes Sequence Report: AA029702

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Sequence
AA029702
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029702
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGGAGCCACTCCTTCACGCCCCGTGATCAATGTGCAGTCCATTTCGTTC
AATCATTCACGCACGCCACCGGTCTCTTTACCTTCCGCGTAAAAAAGGTC
CCAAACTCCCACCCCCAAAAGCCCTCTAGCATCTTCTCCGCAGAAGCAAA
AGATTTCTGCGCAGTAGTATTTCCCTTTCACATTGATCACTCTCGCCTCT
CTCCCACACAGCACAGCCGCAGCAGCCGACTCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
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GCGGCTAGGGCGCGGGACGAGGCGGCGATAGCCCCGGCGCGCGACATGGG
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ACCAAGGTGCCAGAACTAGCTGCGTGCTGTTTGTGAGTTCAAGCAATTAT
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GAATCATATCGTGCGCCCCTGATTGAAGAAACAAGGTCAGATCTATGCTC
ATGCCTTGAACTCATCAACGAAGCACCCTCGTCCAAAATACTCTCCATGG
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AGAAGACTTGAGTAAACTCAGACATGCAATATTTCTGAATAATATTATGA
CAAACAAAAGGATATGGCAAGCACTTTCCTTTGATACGGAAATGGACAGC
AATTTCAGAGTAATCAAGTCGCTTTTAGCCCCCACAAATTTGGTAATATA
ACCTTGATAGCTGCATTTTAGTTTAAATTGCTCTTTTCATTAACATTATT
ATAAATTGGTCTCTTAACTTTTTGAGCCCTCTTTGTTGGGTCTGTTACAG
GGTGAGGATGTATGTGGCATCTGTGTTAAACAGGATGAGGGCTGTCTTCC
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AAAGTGATCCTGTGAGTTTTCTGGACTTCGTAAAGAAGCAGTTTGATGTG
ACTGCAGTAGCTCTTGAGAGATGCATAGTGAATTTGTGTGTTCACCTTCC
TCGAAGTAAATTTTCTCATGATAGTGTCACAAATATATCTACATTGTTTA
ATATGCTGAAAAAATTTGGCACCCTTCTGTGTGACGTCAACTTGACAGAT
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TCCACAGTCTTCTATTGAGAAGGAACTGGATGAAGCAAGGTCTGTATGCC
TTAAATTGCTTAAAGATCTGCAGCACTCGCTCAATTTACCCACTGGAGTA
GACAATAACTGGGTCCAGCGCTACTGCATGCGTAATGCTACACTTCTTTT
CTGTACTACCTCTAGCTCTTATCGCTTGCATCACATGGAGATTGCACCCC
TCGACGTCTTAATTGTCGATGAGGCTGCTCAAGTGCGGGAGTGTGAGTTG
GTGATCCCACTACGTCTGCATTGGTTGAAGCATGTTGTTTTGGTTGGAGA
TGACTGTCAGCTGAGTGCAATGGTCAAAAGTCAAGTAAGTTTCACCCAAC
CCTCTTTATACGTGTCATACTGTCATTCCATAGCTATAGGTGCATTTTTC
TACAACATCAACTTCTGATAGCAAAATGCTGCAACAAATTTTCAGTTATT
TGTGCATTTGTCTACAGCATTGGTAACTATCCACATGCAACGAATTATTG
AAATATATGTCCCACCCATCTCCATCAGTCCTGATGCGTGTGATTCAATA
TTGTTTCAAATGCACTTCCATATGCATGTCTTGTCTAACATATCTTTTTT
AAATACAATTTTACCATACAACTGCACAATTTTTTTCTGGAGTTGATGCA
GAAAACAGTAAAAGTAGCAAACATCAAAATTATCCAAACGTCAAAATGTC
AGCACATGATGATTTTCTTGAAGTCCGATGGAAAACCTGACCCATTCAAC
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GTCCAATACAAGAATAAGAATCATACAAGGGCCGGATGTCCGTTCGGCAC
GGGGGAGTATTTGTTTAAACGTATTGAGTTCTCAACGTTTGAGCTATCGT
GGTTTGATTGTGATTTGTTGGATCTACCAAACTGTTGCATTTTTCATATT
AGTAGAGATGAAGTTCTGATACTGAAGTGCCTCAACAAATTTTGCATGAA
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ATGATAATCTTAGTTACCATTCGTTTGTTTATTTTCAGGTATGCAAAGAA
GCTGGATTTGGTACAAGCCTTTTTGGGAGATTGGTCATGCTCAAATTCGA
AAAACATCTGCTGAATATACAGTATCGCATGAATCCTTGGATCAGCTTGT
TTCCAAATGCTCAGTTTTATGAGAGAAAGATCTTAGATGGCTCAAATGTG
CTGTCTCCTAGCTACAATAAGGATTACACATGCCTCCCATTTGGCAGCTA
CACTTTTATAAATGTCACGGATGGAAGGGAAGACAGAGAGGGCGCAGGAA
ACAGCCGGAGAAACATGGTTGAGGTTGCTGTTGTTCTTCATCTGATCCAA
ACCATTTTTAGATGTATGTCTAAGCTGAACCCTATCCTTTGTTGCAACCC
TAGTATCCTGCCTTGATATTTATTACTTTGTTTCTATATGAAGCTACTTG
TCTGATATAACATGGCATCTTTAGAAGCTTATAGGGTCGTCCTTTCTTGT
TTTACATGTTGTAACCTCCACTGATAGGAAGGTATATGAAGCTACTTGGC
AGATATAACATGACATCTTTAGAAGCTTATCGGGTCTTTGTTTCTTGTTT
TGCATGTTGCATAACCTTCACTAATAGAAAAGTGTTCTCTGCAATAGTTT
ATGTTCAACAATACAGCTTCTTATTTGTATCTTGTGATGTGTTACCTCCA
TCAATCTGGGTTTATGAAATTCAATTCCCTACGTATGTCTGACAGCTAGT
CCTTTGTCATCTACTATCCTGTTTAGTAGATAACGTTACATTTTTTATTT
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CTGTTAGAGTTGTCCATCACTACATGGAACCCACTTACTGTATTTTTTCT
TCAGAATAGATAAGTAATACTATGTCAATTGCAAGCTGGTACAGATTCAA
TTTTGCATTACTAGTTTTTTCTCTCGCTAGCCTTGTGCAAAAATCGACCC
CAAAAGATCAGTAAAATTACAAGTTTAGTGTATTCTGCAGGTTGGAAAAG
TACAGGCCAAAGGCTCAGCGTCGGTGTGGTCTCTCCATATAGTTCTCAAG
TTGATACAATTAAAGGTAGACTTGGCAAAAAATACGACACATGTGATGGC
TTCCATGTGCGTGTCAAGAGCGTAGATGGTTTCCAAGGAGAAGAAGATGA
CATAATAATACTATCAACGGTTAGATCCAACGGCAGAGGAATTGTTGGAT
TTCTTGCTGATAACCAAAGAACAAATGTCGCTCTTACCAGAGCAAAGTGA
GCATTGATTCTTTTTTTTCTGCGAGCCTTTGTTTTATTACTGTTCAAAGC
ATGTCAGACTAATATTATAAATCATCTGATGGATACTTTATTTGATGCAG
GCACTGTCTTTGGATTGTTGGGAATTCTCATACTCTGTACAAAAGTGGGA
CTGTCTGGACAGACCTTGTTGCTGATGCTCAAAGACGTAAATGTGTTTTC
AATGCAACGAATGACGCGACCATATGTAAGTTGGTTTTGCAAGTAAAGCA
AGAGCTTGATCAACTTGACGATCTTCTTAATGCCGATTCAGCGGTTTTCA
GCAATACCAGGTGGAAGGTAAGTAACATAGTGATCTTTAATCAGTTTGAC
TTTGACCATCATGTGCTCCCTCCAATTGTGCCTTTATTTTCCTCCTGTTC
TTTTTGCTAGTGGTTAGTTTTGTGGCAATTTCCCCAGTTGGTTGGGTTCG
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AATCAAAATACACATGTTTGGACGCTTGATCCAGATTTTTTTAAAGTTGG
TTCGGTTATGTGCATTTAGTCTACTGGAATGCACCCTACGTGCACACACG
TGTGGGATGAGACTCATGCTTATTGTACTCAGTTATTATTGAATATAAAA
TTCCTTTAGCATGTGATTTTTTTCGTGTTTATAAACAAATGTGTCCATTT
TCTGGAATTACCATTGTGGTTCTTTTGTCTCTGTTATGCTGTTTCTAATT
GGATAAATTTGTTACGATTTAAAGGGACATGTGCTACTTTGCACACGCTA
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TAATCTTTAATAAAACATACATGTCCTTGTTATTCTTTTGAATTCGTTCT
TTCTCAGGCTCTATTTTCTGTGTTGCTAATTCAACAGGTCATTGTTAGTG
ATGAGTTTAGGAAGTCCTTCACCAAACTAAAATCATCACAGCTCAGGAGG
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GAGGAACTTAGATATACCTGGTGTTTCCAATCTTGCAAAAGTATACAAGA
TCAGGGACCTTTATCTAATTTGGAGTACTGACGTGGAGAAAAGTGAAAGC
AGGTATTTTCAGATGATAAGAATTTGGGACCTGCTGTCACAACAACATGT
TGAAAGAACCGTACGCCGTCTCGGGTACCTTTTTTCCATGTACACAGATG
ATTACCTGGATCACTGCAGAAGAGTGCAGACACTCGGGTATGTATTGTTC
ATTGTTACTGGTTATTAACAGGTTCCTTGGATCCTTTCACCTTTCATGCT
CGAAAATGGACTGTTTGTAAATACACATGCTTACTAATGGGCTGCTTGTA
GACATTCTTCTTATTTTTGCCTCCTTTTTTGTTGGTTAACAGGAAGCTGG
AGGTTCCTATTGTTTGGGATGTTGATCATGAAATTATTCGCTATAAGAAG
GATAGCAAAGTTGATGCTCAGGAAGAGCATGATCTCGTGGATACATCATA
TGCTATGGAAAATTCAAAAGTTAGTGAGAGCTTCTTGCTGATGAAATTCT
ACTCATTATCTTCTGGAGTGGCACAGCATTTGCTGACAGCTTCTGATGGT
TCTGAAATTGATATCCCCTTTGAACTAACTGATGAAGAGAAGGAGATAAT
CCAGTTCCCGCTCACTAGCTTTATACTTGGGAGGTCAGGCACCGGAAAAA
CCACTGTATTGACAATGAAACTGATTCAAAAAGAGCAGCAGTCATTGATT
GCCTCCCATGGTCTGCATTTGGATGAAGATGATTTTTCTAGGTTGGATGA
CAAAAGTATTATGCCACTGAATGATGTAAAAGAAAGTTCTATGAAACAAG
TATTTATCACTGTAAGCCCAAAGTTGTGTTCAGCCATAAAGAATCACATT
TCCGGCCTTAAAAGGTATGTCGGACTAGAGCCACGTTTAGAAGTTTACAC
ATGTTTACCATTTTCGGAATTTATTATTTTTACATATATTTAAAATGAAC
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TTTTATCCCTCTGAAGAATCATTTTCTCCCTAATATACTTTATAATTGTT
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AGGGTATGTAGGGATAACTCTAGGATTAGGAATGTTCTAGAGTAAGACAT
TTAGGAGTAGTATGGAATATCTAGAGTTTGTAGAGTATTCTAGAAGTATG
GTGTAGGGTTTGGATTGTGGCATGTACAAGTATAAATAGGGGTGCCACCC
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TTCCTACTAGCAGTGTGAGTGAAGCACATCCCTTTAGAGAGAGAGAGAGA
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ATCATGTAATGAGGACTTAGCCCTTGTGGCTTTGTAATGAAGGATACACT
TCGTAGGCGAGTCCTTTAATGTGGGTGGGCTTGCTCTCTCGTGACTAGCT
CTCAGCGAGTTTTATTTTTGAAATTTACACTCTTCAAATGATATTTACTT
TTGTTATTTAATGAGTTATATCAACCATGTTCATCGTTCTGTCAAAAAAA
ACATGTTCATCATATTAGTTATAAGTTATTTCAACCCTTTGTAGGTTCGG
CTCTGGTGATGTCTCTGATCAGCCTAGCATTCTTCACATGCACGACATCA
TTGATGACCAGGAAGAGTTCACAGAAATACCTGACATTTTTAGCAATCTA
CCTCATGAGCACTATCCTCTTACTATAACATATCGGAAGTTCTTGATGAT
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GCCTCGGTTTAATGCAGACCTGACCAAGAATGTTGATGCATCCATTGTCT
TTACTGAAATAATTTCTCATATAAAGGGTAGATATCAAGCAAGCAGGCCT
TATACCAGCAAGCTTGGAAGACAGGATTATGTGATGCTCTCAGATAAAAG
ATTTTCATCTCTGAACAGTGAGAAGAGAGATAAGGTTTACAGTATTTTTG
TTGCTTATGAGAGTATGAAATCAACTGCCAGAGAATTTGATTTGTCAGAT
TTGGTCAATAGTCTTCACATCAGTTTCGTATCTGAGGGCTACAATGGAGA
TCTGGTGGATTTTGTGTACATAGATGAGGTGCAGGATCTAACAATGACAC
AAATAGCACTTCTTAAGTATGTCTGCAGGAACTTCAAGGAAGGCTTCCTT
TTTGCTGGTGACACTGCACAGACAATAGCAAGGGGTATTGATTTCAGGTT
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CTTACTCAAAATTTCCGCACGCATTGTGGCATCCTTCATATGGCACAAAG
TATCATGAGCCTTTTGTACTTCTTTTTCCCGTCAAGTGTTGACAAGCTTA
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ATGATGCTACCAAAAAACAAATTGTTGATCTTGTTGGTAAACAGGCTCTC
ATTTTGACTATTGTTGAATGTAAGGGCCTCGAGTTCCAGGTATCAGCATA
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TAGGGATGCATGAGAAAGCTGCTGCCTGCTATATCAAATTACGTGACTTC
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TCTGTCTGACTAAACATTGTTTTCCCTGCTTTATCATAGGTATGGTCTAT
ATGCAAAAATGTGGTGCTTCCAGGCTTGAGGATGCTGGTGACTGTTTTGC
CAGGGCCGAGTGCTGGTCAGAAGCAGCTGAAGTTTACTTCAGAGCTGAAC
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TGAAAAAATATTCAGAGAAGGAACGGTTGCTTGCAAAAGCGAAAGAAATG
GCGACAAATGTTTCTGAGTGCTTCTGCTTCTTTGCTAGCCTGGAAGCTGA
TGCACTGTCAGATGTGCCCAAGACCCTTCCCAGATTAAACTGTGTATTGT
TTGACGGCAGAAAATGCGGAAACTTGTTTGTTGAATTTGTTGCTTCCCGT
TTGATTCTTGATGTTCATCTTCAGTCTCGTGCCTCTGAATACAGTTTGGA
ATCAAGGCCAGGTTTTGAAGATGGAAGTAGCTGTAATGATATGGTGGCTT
GTAACCAGATATCACCCCATTCTCTAGCGAATGCCTGGAATCACTGGAAG
TCAATCATAGTCAAGGTACTATCTCATCTTCGACACACTGATGCTCCAGA
GATAAACGATTATGAAGTTACGTATGAAGATCTTTGTGCTAAGTACTTTG
GGTTGAGGAAGGATGGTGAAGATGATGGATATGTTGTGCTTAACATGAAC
TCAAGTTGGCTCTCTAACGCAGGCAGAAGTTCTTTGCAGCAAGATGGCAA
CATATGTTGTCTGGATGTCAAACACTTTCATTCGTGTGCTCAGTCTTTCT
TGATGAATGAGCTGTCTTCTGTTGGTCTGAGTGTACTTAAGAAGTTGGAG
TCCATTGTTCAAATTCCTCCGAAGTCGGCATCTTCATATGCCCTGCTGAG
AACTATCCTCGTTATAAATGAGATAGCCAAGTTCTTGGAAGAACCAGAAT
TCAGCCTGCAGAAAAGTACCATGAAGTTAAGAAGCTTCTCTGCTCTCTGC
GTGGGTCGCTTCTTTGATTTAGCTTTTCTTCTCTGGAGAGATGGAACAAC
GAGGAGCCTCTTGCCTGCTATACTTGACTCACCAGCTGCATATGGTCTGC
TTGCTGATTCCCTTAGTTCAAATCTTCGCCCAAAATATAAAGATTTGACT
TATGGGCATCTTGGGAAGACGACCATGCTACTGCTCCATGCAGGGCGATT
GGACAATGCATTACTTTCAAGGCTACTACAGTTCCTGGACAATGATTCTG
GGTGGGCAGATTTTTTTAGATGTTTGAATAGATTTCTTGACAGTGGTCTC
GATAGATCCTCCTTGATCCTCAACTTTAAGGTTGCTCTGGACTTTACCTT
TAACGGTGTGAGGTGGAGGGACGAACTGGATTACATATCCCCAGTGTGCT
ATGTGGGTCTTATGGAGTGCCTTGGTTTCTTGGCTTCGTCATACCTTCTA
CAGAAAGGTCGTATATACTGCACAGAATCTCTGTTGGTCAATATGCTGGA
GTGCCGTACCAGCAAGCTTTACCTTGACACCTGTTTGGTATCTAATTCAA
GCTCAGATTCCGATCTTGATGATATGGCATTCTTATCTGGGCGTTTCATA
TTTCAGACAATTATGGATATCTTGACAGACAAGAATATGCTGTGGGAGTG
GGCACGGAAGACTTCAACTCCTAGTAGTTCACCCACTGCAGTCCTCCTGA
GACTGGTGGTCACACTTTATCCACTGATCCTAACTCACAATCTGGGGAGT
TGCTATGAGGTCACAAGTACTCTTTTGAAGTGTGGAGTCTTTAAGGATCT
ACCTAAGGAGTTCTCCCAGAGGATTGTACCGACTTTGCAATTGAGGTATC
GCACATCGAACAACTTCACAAGGGCGCTTGCTGATGCACTTGCCGCAATC
GGAGATCCCATGGTAATTATAGGTTCTTCACAGAAAGGCGGCCCAGCAGT
CTGTCGAAGCATAGTTCATATGATTAGCACAGAGGATTTGCGTGATGTTC
CAAAGGTAATGGCTCTTCTTTGTCCTGAAGAGCCAAGTCCTGTAAAGCAA
GAGACTGCAGGGCCAGAAAATCCTAAGGTGGTTCAAGATAGTAAGATGGA
CAGTACAAGTAAAATGGATTTAAGGGATCAAACTGCATCCTTCTGGGCAA
ATAAGCTTGAGGATTTTTATGTCAGCCAGAGAGTCCTGGTGAGTCTCATA
CATTCTAATGCTTGTTTGGTTATCTTCCTGTTTGTCCCAGTGCTTTGCCA
TCACCGAATTGTTCTAAAAGCTTATCTTTGCAGAAAGATGCAACCGCCAT
AATTCAGTTCATCAGAGATGCCGCTTTATGGCTGGAGCAAAGAGTCCCTC
CAGAAAATATTAGTGCGCAATTAGTGGAAGAGGTCAGGCAAGTCTGCAGT
GTGTTTGAAGAACGTTCTGGAAGGTAAGCTAATCTTAATTTCCCAAAGAC
TCTTGAGTTTTAATGGCTGTATAAATCCAGTATTGCAATCTGTTGACAAG
TACCAGTTCAATCCAGTATTACCATTTCCATGTGAAAATGATTTGTGATC
ACAGGTTGGAGAAGGGAGCTTGTCTGCCTATGGAGGATCTATACATGGCG
TGGCAAGATGGCGAGAGCAAAATGCAGACTATCTTGGACCATCTGTGTTC
CGAAATGACATCCTTGGTAGAACCACCCCCCAGAAGGAATAAAGCCACAG
CCATTGTCCAGTCACAGACTGGATGTTCAAACAACGAGCTTGGCGCAGGA
GGAAGTAATGAGGTGGAACCAGTCACGGAAGAAGCAGACGAGGCCGCCGC
CTCGGCCTCAACAAAGCTGGCGCCCAAGCAGAAGAACAACAAGAAGAAAT
CCAAGAAATCTAAGGGCCGCGGCAGGAAGTGAGCTGCTGTGGCTGTAAGC
TGTAGCCCGTGGTTGCCTTCATTGGAAGAAACTAACTCATAGCGCAGGCT
GGTTTTGCTCGTACCTCTTAACTTCATGCTCATGTGTTGCCTTGACGCTT
CTACCTGATCGTACTCAACAAGATTTTATTTTAAATAGCCTGGTTCCCTT
CTGTTGCTGTGCATTTTGTTTCTTGGAAAGATCGATTTGATTTTGTGGAC
CGTTGTGAAGTATGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.