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GrainGenes Sequence Report: AA049920

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Sequence
AA049920
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA049920
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTACTTGGAACAGCATTTTCAGTTTTAATAAGACTTGAATTATCTGGACC
TGGTGTTCAGTACATAGCTGACAACCAATTATATAATAGTATAATTACAG
CCCACGCAATATTGATGATTTTCTTTATGGTTATGCCAGCTATGATAGGA
GGTTTTGGAAATTTTTTATTACCTTTGTTAGTAGGAGGACCTGACATGGC
ATTCCCTAGATTAAATAACATAAGTTTCTGATTATTACCTCCTAGTTTAA
TATTGTTCTTATTTGCTGCAACAATAGAAAATGGTGCAGGAAACTGGTTG
AACTTTATACCCTCCCACTATCAGGTATACAAAGCCACAGTGGTCCTAGT
GTAGATTTAGCTATATTCGCTCTTCACCTATCAGGGATAAGTAGTCTATT
AGGAGCAATGAATTTTATAACAACTATCTTAAACATGAGAAGTCCAGGAA
TAAGACTACACAATTGGCTTTATTTGGATGAGCAGTCGTGGTTACAGCAG
TATTATTACTTTTATCTTTACCTGTATTAGCTGGAGCTATTACTATGGTT
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TTTACATATTAATTATACCAGGTTTTGGAATAATTAGTACTACAATTTCA
GCAAGCTCGAACAAATCAATCTTCGGGTACCTTGGAATGGTATACGCCAT
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CACAAGGAACAAGCGGAAATAAAAAACGATTTCTACAGACTAATAGTAGA
TAATCCTTCACATATTCTCCTACTAGCTTTTTTATTTAATGGAAATTTGG
CTATTAATCACAGAATACAACAATTATCTTTATGAGTACAAGCTTTAAAC
AGTAGGTTTGGAGCAAATACTATTATAATTATTAATACTGCTGTTTCTCT
TACATTAAAAGATGGTTGAATATGTGGCTTTACTGATGCAGAAGGGTGTT
TTAATGTATCCATAACATCTAATCTAAGATATTCATTAGGTCAGGTTATA
AAAATGCGTTATTTACTTGATCAGAAGGATAGGGATATCCTTCTGACAAT
ACAAAACCTTTTTGGATTTGGTAAAGTTACTATTAGACCTAAAACTAACG
GTGTTTATCGTTACACTGTTACAGGATTCAAATCAATTAATGGTGTTATA
ATTTACTTTAAAGAATTTCCATTACTTACTAAAAAGGGTCGTTCTTTCAA
TAAGTGATTAGAAATACATGATATCGTTTCGGATAAGTTACATCTTAGCG
AGAAAGGATTAATTAAAGTAAGAGCACTACAAAAACAGATTAATACAGAA
AATAGTTTGACGAAAAAAACAGGATCTGCGCATCCTTAATGTTTATTAAA
AGATGAAGATATAGTCCGATTCTCCTTGTGAAAGGAGCGCTTAGTTATAT
AACTAGGCGGGGCAGATATGAAGAATATCTGCTAACATTTTTGCATCACA
TGTACTCAGTTGGTTTAGATGTAGATACAAGAGCCTACTTTACAGCTGCA
ACTTTAATAATAGCAGTACCTACTGGTATTAAAATATTTAGTTGATTAGC
TACTTGTTATGGTGGATCTCTACACTTAACACCTACAATGCTATTTGCAT
TAGGATTCGTATTTATGTTTACAATTGGAGGATTAAGTGGTGTTGTTTTA
GCTAACGCATCATTAGATATAGCATTCCACGATAAACATTATTTGATGTT
TCCATTTCTTGGTGTATCTCTAGGAAATACACAACAGGAATCTGGAAACA
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GGTGATGGTAGTATACAAGTGAACCAATGACGTATGAAAAACTTACAGTT
TAGGTTAGTTATTAAATTGAAACGCACGGATTTTAATAAATCTATGTTAA
TAGAAATAGCTAAGCGTTTACAAGGTACTGTAAGAGTTATTGGGAAAACT
AATGAGGTATTATGAGTAATGGATGATAAAAGTAAGATAGTCAATTTATT
GAAAATATTTGATACATATCCTCCATTAACTCAAGACTAACATCTCAAAT
AAGGTTTATTAAATTGTGTTTAATAAACGATTCGATAGAATATTACATGA
AAAATAGAAATCTTAAATACGATAGTCAAAGTTGCTTTATAAGTAATTAT
AAAAGTTCTATTATACCTAATTATTTTCCTTTTTGACTAAGTGGTTTTCT
TGAAGCAAAAGGCTGTTTTTCTATACGAAAAAATGGTTATCATTCTTTTT
CTATAGGGCTAAATAATGATAAATATCTATTAGAAATGGGTTGCAAATTA
CTTTACTATAACAAATAAAGTAAGAAATACATACGGTAATTTTTTTATTC
TTGAAGTTTATAAGAAAGTAGTCCTATCTGTATAATATCTCATTTTAATA
ACTATCCATGCTAGGAGACAAATCTCAATCATTAATAAATTCGTCGAACA
GTTTTCAAATATAGTAATGTCGTGTTGTCTTCCCACATGAAGAACTTAGT
ACAGTCTTCGGTAGTAATATTAATTACTGCTAACGGTGAAATCTTATATG
TACCTAAATGCTAGGTACAATTTATTTTTTTACCTCTAAAAAAATATAAG
ACAATACCGTGGAAACCAAAATTAGTTATTTGTACTAAATGAGGGTTCCG
TAGAGGCCAAACGTGGGAGTCGAAAGCTTATTAAGTGATTAGACAAGTTA
TGGTCCGAACCAACGCGTGAGTGTTGCGTACTACATTAACAATGTTTAAT
TCGAACTAAAAAATATTTAGCTATTTTTTTTTTTTACAATACAGATTTAC
TCGGTATTGTTAATGTTACTTACATGTCTAATAATGTTTTTTATTAAAAC
TACGTTATGACCTTATAAATTTTTTTATAGTCCCTTTAAATTACCTGGTA
TGACCCCTCATTATCCTTAATCAGGTTAAAAATTTTTTCGTTTGTACAAC
TACCTACAAATTTACTGTTTACTGTATAAGTTTATTTGTAGCTGGTGTAG
TTGGCTACCATACCCTAGTCCTTGATGACCACGATATTCTTAAATATGCA
TTTATGGTATCTAAGAATAAGGTTATGGTTGCATTAAAGGTTCAGGTGAT
TATTTTAATGTTGGTGCTAAAGAATTATATCTTTTATTAGAAAAATGCAT
TTGCGCAAAATAACGCTTTACAGAGTTAAATTATAAGTTTGAATTCTCAA
ATTGATACTTTAAATTCTCAAATAGAAAGCATGCAACTCCCTAAAACCTC
TTTCAGTTTTTGAATGGGTATAGTTGTTATGATAGCAGCTTTTTTTATCC
TAGTTGCAGGTTACTTTTATTGATTTATGGCATATATTACTCCTATAATA
TTAAAAAAATTATGCCTCAATACTATGGTATTGCTCTTAACTGATATTCA
CATAGTGACAGTGATTTTTCTAAATTATTTAGGGATAATCATGCTATTAT
TTAAACAGTAGGTGTAATTTGTACTTACTGGGGCTCTATCAGGTATGGCA
TCCGGGATCCTAGGAAATGTTTTTAGTTTATGTCTTAGATTTGTACAACA
ATGACTTACTATGTTGTTGCTCATTTCCATTCCATTAGTTAAGTATGGGT
GCAGTTTTCGCATTGTTCAGTGGTTGATACTTTTGAATACCAAAAATGTT
AGGTTTAGATTATAACATAATGCTAAGTAAAGTTCATTTCTGAATATTAT
TTATGGAGTTAATGTTACATTCTTCCCTCAACATTTCTTAGGATTACAAG
GTATGCCTAGAAGAATAAGTGATTATCCTGACGCATTTGCTGGTTGAAAC
TTAATAAGTAGTTTTGGATCTATAATATCTGTTGTAGCGACATGATTATT
CTTATATATCGTATACCTGCAATTGGTAGAAGGTAAGAGTGTTTCTAGAT
ATCCATGATTAACACACAGTTTTTATACAGACTACTTACAAAGTCTATTA
AACAGAGCTTACAGCAGTTTAGAGTGATGTTTAAACAGTCCACCTAAGCC
TCATTCATTTGTAAGTCTACCTTTACAAAGTTAATAAAAATAAAAAAAAA
GAAAAAAAAAACTTATAGCTATTATTCTTTAGGAAAAAAAAAACTTTATA
TTCCTTTAAAGGTTCTGTGTTTGATTGTAGAAGATATGGAATGAAATATG
AGGAGTAGATATGGTGACCTATTGAAAGATGATGAGAGAACTCTTAGAGA
TGTGTTATACGTGCAAGGTAGGGTAGCAAAGCTAATTAATAGAGGCCACG
TTGGATTTGACTATGGTTGAGACCGTTCCTAAATTATAGGACAAGAAAAA
AAAAAATAAAAAAAAAAAACAAGATATGCTAGTTAAACAAAAATTAATAA
AGTGTGAAAACCTTTTAATTATTAGTAAAGGTTTCAAAACTTTAAAAGAT
ATATTATTAATGTAAAAAGTTTGCCTAAAAAGGTTTCTATAAATCCTTTG
CGAATAAAAGGTAAATATCTATAGTTTCAGTATTATATTTAATAGGGCTT
TTTTATTACTATTAGTTCGAATTTATTTTTATGGATCCTGTTTATTTTTT
GAGATGGTTTTACGAATGAGGTACGGTTACAATGAGCATATCGGGAAGTA
CATGTTGCTGATAAAGAAACACCTGCAAATGGGACCGTTATTAATATGGC
GTATTCTTTAATTATACACGGCTATTCTCGGATAGGTTTCGTATATGACA
AAACTACCCTACAGGTAGTAAAATGCGTACACTATTTTTTGGAAAACTTT
ACACAAGTCATACTGAAGACGGTAATAGTGTAGTTCTTATTAATGTATGA
GGGCACGGTAAGTTAACTGAGTTCCCAGGTACTCACCTTAAACCATAGTT
GAAGGTTATTGCTTTAGAGTCAGAAGTTACTAAATGGGAGAACAATAATA
CTCCTATAACTACTAATAATAATGTGATCCATAAAGTGAGTAATAATAAA
GGGAATATTAGTTTATATGTACAACAATCATAAAAGTATGGTATTTATGG
CTTAGATTATTTTTACCTTTCATAAAAAAAAGTTTATAAATCTTTTTACA
TTAGTAATATATTTTTATATATTTTTGTAAGATACTTTTTTAAGGCAAGA
AAAAAAAAAAAACGAAGGCGGATAGGTGTAATAGTAAGATAATTGGCTCA
TGTACAGTAGATAAAGGTGCAATTCCTTTGTCCGTCCATAGCTAGTTTGC
ATTTTTTCATATTACGCGTAGTAATTTATTACTTTTTTTGTTTCTCTAGC
ATATTCTTTTCTATGCTATCATAATGAGAAACCTGAGGTAACGGCTCACC
GATCTGTGAAGAAGTTAAGATGAACGATAAGATAAAAGAAATGTATTATA
AGTAATAGCAACTACTATTAATTTTAATTATACAATAATTAATGGTAAAT
GATTATGGTTTTCAAACGAGCGGAATGTATTTAATATCAATTGTTGGAGC
AGAATCAGCAGTAGGATTATATATTCTTGTGGCGTAAATAGATTAAGAGG
AAGTTTAAATACATATTAATCTGAAATATTTTTCAATAGAAAGAATAAAT
ACAGCGGTTAGAGCTGTTAGGGAAGGTAGTCTAACACAAGAGCACGTAAC
AGTAGAGTTGCGTCAGAATTATCCCGTCATTACTTTGGTAAATTTACGAT
TGTGCCAGAGCAAATACAAATGGCTACTAGAAAAAGACCTGATTTTGTAA
TAGAAAAATGATTCGAAAACCAATCAGTTAATTATTGATTTATACCTCAT
GCTTTAATATAAGTTAAAAGCCTGGTCGAAAAACATATCATATATAGTAG
AGCAGTTACATGATACAGTATTAGTTGTCATGGATCATTGAGTATCTAAC
ACAGGGCATTACTCCGCTTTCATGATAGGTATTAAAGGTACAAAAATAGC
TTTCTACACTTACCATAATTTAGGATCTTGTTAGATGACTACGGTTCTTT
GTTAGATAACTAGGGTTCTTTGTAAGATGACTACGGTTCTTGTTAGATGA
CTACGGTTCTTTTAACTACAAAGGGTTTTTTCTGTTAAACTTTAAGATTC
CTGAACCATTATTATTAAAAATTAATGAAAGTCACCCTTTGAAGGAAGCG
CTGTATCAAAGATATTTAAGAGACCTTAATTTTGATAAAAATCACCATAC
TTTGGCCCAAAAAGGTGTAACCGGTATTACTAATATACCTTTTCCTCATA
TCTTTGATTTACAAAATAATAGCCACAAAAAAGATATTCACAATATGTTT
GTATATATAGCAAATAATACAGCTAATTATATTTCTTAAAACACACGATT
AAAGTTTAAAACTTTAAATGTTTACATTAGTAATATATTATATATAATTG
ATAATATTAGATTTTTTTTATTGAGTTTGATGATGGCTCTGATTGAACGC
TGTCCAAAGGCTTGACACATGCTAATCGAACGTCATTTTCTTGCTATACT
GTATGGTGTGGCTAAGCGCTCACAAAGCGCTAAATCATAACTTAGGCGTA
GCAAGAAAAATGAAGTGGTGTAAAGGTGAGTATATAATATTTTTTTGGCT
ACCTTAAAGTAAGGAAAACAAAATTCCTTATAAAGTATATGATACGGCTC
GCTCGAAAAGCGCTGCACTAAGTTGACTATACATAAAGAAAAAAAAACTT
TTCGCTTTAAGATGTTCAAGATATTTCCGAGTAAGTAGTAGTTAAGGTAA
CTACTTAACTAGCTTTAGCTCGTAGTCGAAACTGAGGTTGATCGACCACA
TTGGGTCTGAAAAAACCCCAATACGTGTAGTACAGCAGTGAGGAATATTG
GTCAATGGCCTAACGGCCGAACCAGCAATTTGGGGGAATGTGATATCTTT
TAGTCGGGATATCAATATAAACGACTATGTCGTATAAAGTTCTAGATAGA
TGATTGATGATGACAGTTTTCTATCTATATGTCTTGACCAAATCTTGTGC
CAGCAGTCGCGGCAATACAAGGAAGACTAGTGTTATTCATCTTAATTAGG
TTTAAAGGGTACCTAGACAGTATTTCTAGCCTCAAAGGGAACAGACTTAC
TAGAGTTTTATGTGAGAGGAAAATATTAGAACCATTGGAGTAGAGATAAA
ATGTTTTGATACTAGTGGGACGGATAGCGGCGAAGGCAAACCTCTATGTA
ATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTGGGGAGCGAATAGGATTAGATAC
CCTAGTAGTCCAAGCAGAGAATTATGAATGTTATAGACTAAAATATTTGG
TGTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATGCGGCAACGC
AGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTA
TTTAATTCGATGACCCTCGAAAAACCTTACCACAATTTGAATGATATTTT
TTTTTTTTATTTATGTACCTATGTTAACCCCCCCGAACATACAACATACA
AAAATAAATTAAGTAAGGTAACTTACTTTAAATATTACAAGTGTTGCACG
GCTGTCTTAAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAAC
GTAAACCCTTGCTTTATTTTACATAATAGAGCACTTCACCCAATTTATTG
GATATGATAATAGGGATTAAGACAAGTCATCATGACCTTAATATTGTGGG
CTATAGACGTGCCACATATATTTGTACAAAAGGAGGCGAAAGTGCGAACT
TTAGCTAATCCTTAAAACAGAATACAAAATGGACTGTAGTCTGTAACTCG
ACTGCATAAATAAGGAATTACTAGTAATCGTGAATCACCACATCACGGTG
AATTTAATCTCAGATAGGTACTAACCACTCGTCAGGCGCTGAAAGGAGTA
TGCGCAATAAGTTTGGCTATTTAATAATTCTTCCTATTAATAATTAGTTA
ATATTTAGAATTTAAAAAATTCTATAAGATACTTTATTGGATAGTTTTCG
TATGCGTGACTTTGATTGGTGTTAAGTCGAAATATGGTTCGTGTAGTGGA
AATTGCACGGGATTAATAAAAATTAACAACAACCCCCTAAATAAAAAAAA
AAATATGTTCAACTAAATTGTTTATATTAGTAATAGAGTAACACATATGT
AGCTTAAAACTATTAAAAGGAATTAGCTTAATTGGTTGAGCTACCGTTTT
TACACACGGAAGGTTAGGAGCTCGAGTCACCTATTCCTTACTATCTTGAA
AATACTTGGTTATGTCTTATAATAAAAAATACAGTGGAATTTAATCCAAG
CAATATTACAATAAACAGTGCGTTAAGTAGCACTATTTCCGTTTTAACTC
TTTTACTTATATTATTATATATATACCAGGAGAATGATTTAATATAGTTA
GTATTCTTAGTCTTATATTATTTAAAGCTTAAATGACAAGTCAAACATTT
TTTCTTATATTTATACCTATATTAGCAATAATATTATTAGCTGTAAATTT
AATCTTTGCCCCACATAACCCATACGAAGAAAAAGACAGTGCTTTCGAGT
GTGGATTTCATTCATTTTTAGGACAAAATAGAAGTGAATTCAGTATATCA
TTTTTCATATTTGCTTTACTATTCTTGTTATTTGATTTAGAAATACTATT
GGTATACCCTTATGTGGTTAGTGCGTACCAAAACGGTATATTTGGTTTAA
TAATAATGCTTTTATTTCTCTTAGTGTTAACTTTAGGTTTTGCCTTTGAG
TTAGGTAAAAATGCACTTTCGATAGAAAGTAGACCAAAGCAACTACAAAT
AAAAAAAAAAAAATATATATAGTTATTTATAAAATAGTAATATTGTTATA
TATCGTACAAGCTGCAAAAAGAATATAATTTTTTATGCTAAAAGAATTAT
ACACTAAATATAATTATACTAATAATTTCATATATTTAATGGAATTTCTC
TTGAATGTTTTAAACTTAAAAAACTTTATGATACAAGCTGCAATAATAGG
AACAGGATTAGCTACTACATGACTTATAGGTCTTTGAGTAGGTATAGGTG
TGGAATTTTGTTTGTAATTTCTTTTTTAATTTTATTTATTTTTATATATT
TAAATTACCCTGCTGTTGGTTTAAGTACATATTTTAATAATAAAATGGTT
GGTTATGTAGCTGCATGTCCCCATGGTTTTGTTCAAGTTGCTCTTTGTGC
GATTTGTGCTAATCTTGGGAAACATTTAGTTACTATAGGGAACTGTTCTC
ACAATTGAAAAAAACTTAATTACGATGACAAATTCGTAGGGTCTGTCACT
TGTGACTTTGCCGGAGATGGTGCTGCAAATAATTTTCATAATGTCGTTAA
TACTTTAGGTGAGATTGCTTATCATTGCGGAAATTGTCATGCTGTGGCAT
GTTTTAGCTGTATTACAGGTTAAATGGTATTTTATCCCACCTTTTTTTTT
ATGCTATTTTAGGCTTTGCATTTTCAGAAGCTACGGGTTTTGTTTGCTCT
GATGATGGCTTTTTTGCTACTTTACGTGGCATAGCTATCAGATGCTATAA
GTCTTTAATGCTTAGTATAATAGTGTTTGTATATCTGTTTTCACGTAATA
AGGTATTATCTTTCTCTTTTTTATTAATTTATTTATCATAATCTTTTTTG
GTGATGATTTAATACATTACACACTTATACTTTTTTTCTTTCTTTCTTTC
TTTTCCCCTATTTATTTTTATTATCTCTAGTAATATTAATTATAGGTATC
CTATATTATGTAAATGTCTTTTCCCTCCTTTAACATTAAATATTATAGTA
TTTTTATTTTTCTTAAAAAATTTATAAAAAAAAACTTTTTTTTTTTCATA
GAAAACGTTTAACTTTATTATTTTTTTTTTTATTTATCTGCTTAATTTTT
ATTATACGCTATTAAATATGTGCTTTAAAGTGTTATCTGGTTTACCAGGT
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ATATGGACCTTCTGGTCCTAGTGGGGGTGAAAGTAATCATATGGTAAGTT
TAGTGGGTAAAGCTAGACACGACGGGATAAAAAAAAAAAATGAGAGAACT
GAGTTTGTGACGAATCTTATTACACATAGTTTTATTTATATTATTACTAA
TATATTCGAATTTACTATATGGACACTGTATATTGCTCACATGGTATTAG
TTCTGAAGAAGGGTTACAGTGGACAGGTAGACAAGTCCAGATTAGCAAGT
TATACCGTCGTAATTCTGAAACTATTTCAGAATTTTCTAAGATTAATGAT
GCTGCTCTTTCTTTAAATTTTGAGAAGGAGTCTAAAAATTTACCAACTTC
TGTACTTTCTAGCCGAAAATCTATAGCAAATCTGGTTAGTTATGTTAATA
AGGATCATGGTTTACCTTACTCACAAGATGATACTTATATTGATACTAAG
ATTTTGCTTTATGGTAGTGTTGAGTATCTTGAACGTGAAAACCTACGATC
CTAATAATTCTTCGAAGAGCGTTGTGCTCGTGTGGACCGAGTTTCCGCGA
GAAGGGATTATATTCATTGGAAGTCTGAGATCTCAGACTTATTAGAACAT
ATGTTTTGGCTTAAAAATTTTTGGGAAAACCATGAACAAGATTTTTACAG
ATACAATCAGTTGAGAACTGCGGGGCAGTACATCGATAGGAATGCGGGCT
AAGAAATGGATAAATTAATAAAGTTTCAAAAAATAAGTATGGTTGTTTAT
TTGGACAGAGTCATTTAAGGAGCGACGTTAAAGTCAGAATAGACAAATAG
AGGAGCTAATATATAAAGGCCCTAATCCTTATATAATTCCTGGTACTAAC
AATTCATAGGTTTAGTTTCAGGTAATTACCATAGATTACCTTTTGCTCCA
TACTTCATATTTAAGGATTTAATAACTAGATTCTTATTTATCGTAGTATT
ATCAGTGTTTGTTTTCTTTATGCCTAATGTTTTAGGTGATAGTAATAATT
ATATATGGTTAGTATATTATTTATACGCAAATACAGCTTCAGCCTTTTTA
TTATTAAGATATGTTTATTTAACTAGTGAAGTATATTTTACCCTAATTTA
TACAACGTTTAAATTGTTAATCTTTAACTTGTATATAAAGGTTTATTTAT
AAAACCTTTTTTAGATCTTGGTTTATTTGGTCGTCTCTTATGATATCTAG
CCTCTTTTTCTTATCCCTTTTTGTTTGATTTTTTTTTTCTTTACTTTATA
TGTGTGTTGTAGGTTGTTCTGATGGGCTTTCAGCTGAAGAGCGGTTGCAG
TGGGCAGCCCGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.