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GrainGenes Sequence Report: AA000378

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Sequence
AA000378
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000378
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGACGGCTGGCACGAAGCACGCGCGCGGCACGTGAACCCCACCTCTAAA
CCCTTCTTCAGTTCTTCTCTGTCCGAAGCCCAAGCTCGTAACTCATCCCC
TTTCCTCCGCCGCCACCGCCGCGTCGCCCCCAAACCCTAGCCCCCCTTCA
CTCCCGCCGTCGCCGCTGCCGCTGCCGGTGAGCGGAGACCGGCCATGGAT
GACGTGTGCGAGGGGAAGGACTTCTCCTTCCCGGCGGAGGAGGAGCGCGT
GCTCAAGCTGTGGGCGGAGCTGGACGCCTTCCACGAGCAGCTCCGCCGCA
CGGAGGGCGGCGAGGAGTTCATATTCTACGACGGGCCCCCCTTCGCCACG
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CGAGGCAGGCCTGGACTATAGGGTGAGTAATTCTCTTTGTTCCTGGTTTA
GCTCATAATATGCTGTCGCAGTTTGTGGTAACTGTGTCTTTAATGGTGTC
ATAGACTGTCCCAGACCCAGCAGTGATGGTGTCTTTCCCTATTGTTGGTG
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TGATAGCCGTGTTGTGCAAGGAACATATCTGTACTGAAAACAGATTAAAA
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TCTGAAGTTTGAACCTTGGATGCTCATCTAAACTAAAGGCATAGTGCAAG
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ATAGATTAGCAGTAATTACTTGATCTTACTCTTAAGGTTCTTTGCCTTGT
TCTCTGTCTCTGCAATGCTCTTGCATGTACAATGCATCCGTCCTATCGTT
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GAAAGGAAGCACTGCTGAAGTTGTCCAGGGTGGTTTGGATACTGAATCAT
ATGAATTATTAGAAAAGTTTCCTGGCTCAAGCTTAGTAGGCAAAAAGTGA
GTTATCTTCTACTTCTGTCTCAGCTCATTGGATTTGTTATGGACACTTAT
CTGTACTTGGAGGTGTCCTAAAGGCTTAACTAAGATATTAAAAACTGGAA
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ATTGTTGGTAGCCTTTGATAGCTTTGTTTACCATGTTTTTGTTTTATCAG
ACTTCAGTGCTAATTTCTGACAATCACAATTTTGGACTGTCTAGTGTAAT
CTTTAGAATTTGTTTCATTTGGAGAGATTGTTTTGGTTGCTAGTTCCACT
GATACGATATGTTCCACTTCCATAGTCCACCCATACGATGTGTTCCACTT
CCATAGTTTGCTATAATTTTGTAATTGCCGACTTATCAACATTGGCTACT
CTCTTTTGGTTACTGGAGTTGTTTGAGCAACCGCAGAATTTCATAGCCAA
GACTATGTTGAGTTTTTCTTTGTGTTTTCATTTTTATTTTCTCTGGTTGC
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TAGGGTGATTGCGGATAATTATGTAACTGATGATAGTGGAACCGGTATTG
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GGTGGGATAATTGAGGTTGGAATAATTCTCTCATATTATTGGAATATTGA
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TCCATTGTACTAAAATATGCTACGCCCTCCATTCTGAATTACTTGTCACA
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TTGAACTGGCAAAACTTGTAGAAGACAGAAGTGTTAACCATTGACTATGC
CGGTTAATCTGGAAAATCTCCCGACTAACTTGATTAATACCCTGTATTTG
ACATTGATCCTGGTCTCCAGGAGCAGCGACTAACTGATTAATCGCTGATT
CAGCTGAATTGTTTAACATTGATGCTGAAACTATTTGATAGTGTGAATTA
AGTATTATCTCAATGGCTGTACTTTATATTGAAGAACATGTTGTATGGGG
TTTTGCCAAGCATTTGATGTCACACAATAGCGTCATCTGACTCACTTATT
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TAAGCTCTAACCAGAATTTCAAAGTTATATATGCATCTTTCACATGTATT
ATGCTGCGAGGTGGCTTACTTGAATATCTTTTGTTTTCTGTCTGGTGGTA
TCTGCTTCACGTCCAGGCTAGTGGACTTGTTGTAGCTGTTGATGATGATG
GTTGCTTCATTGAGAAGATATCTGAGTTCAAAGGGCGACATGTTAAAGAG
GCTGACAAGGATATCATCAGTGCTGTTAAAGTAAGTCGTTTTCCAGTCTT
CGATGGGCTCTTAGCTGTAAAGAACACAATCCTGTTTAGTTGCTTGCTCA
GCATTACTAGCAACTAGTACTATTTTGGAGACTTGGAGTTGAGTTCTAAT
CTAGTGCATAAGCATCGTATTTTTGAATTCTAGTACTGAACAACCTTATA
AGCTTGTGCATACATCTTGATGATTATCATATTTCTTATTGGGGTAGTCT
TCAAGGGATACAATACGAGCAGAAAGTAAATGAGGTTTATAGTATGAGCG
ATTTCAGTCTAAGCTGTAGCTGTAGACTGTAGGCATAAGCGTGCTTTACT
TCGTCAACAAACTTTGTCTTGTTATTTTCTGTTTGGCATTTTTGAAGCTG
CTTTAATATAGTTCATTGCATAAATTGGATAGTTATTTCCTACATAAACA
GGATAAAGGAAGACTTGTTAGCAAAGGGAGCATCGAGCACTCTTATCCAT
TTTGTTGGCGCTCGGGTACTCCTCTTATTTACCGGGCTGTTCCAAGCTGG
TAAGCATCTTCTGCTACTACTGTGTAAATTAATTTGTTCATGTGCAGGTG
ACAACTGCTATTAATATGAACTAAATCAGCACAAGAATTACATTTATTTG
GGGAGGGGGCAACCTTTTACTTTGTCTTAGAATTCTGATTATTGGGGAAC
TCACCTCAAATGTGTAAATATATGAGCCTCTTTATGCTACAAATCATCAG
GATTTATCTTAAGTTTCTTCCATGAGATGCAAAGAACTGTGACTGAACCG
ACCAAATTTCTTTTCCTTGATATGTGAAATTCCACAATATGTGCATTCAT
TGTTCTTCCTGCTTTTAAGCTAGCACCAATGCTTTCATCTTCCTAACTCC
TAATTCCAAGGCACCTGATATCTCGGTCCATTTTTATGTGCTCTTCTTTT
GCCACATGGAACAATCCAGTTATGAAGTATGACTCTTGTCATTCTATCTT
TCCATCATAGGATATGTTGAATCTTCTGGTTTCCTTTTGTTAGTTGTGTT
TGTTTGCTTTTATGTCCATTACAGTTTTCCGGTTGCATTACTTATTTTGT
TATTGAAGAATATAGGTCTGAAAGAGCTTTTCTGTAGGTTCATCAAGGTT
GAAAAGATTAGGGACCAGTTACTAGAATGCAACAAGGAGACTTACTGGGT
TCCAGATTATGTCAAGGTATGTTGCGGTTGCTAGCCTGTGACAGTGCTTT
TAGGAAGAAACTTACGGCAACGTAACTCATATGGGTGTGCCCTTAGCCAC
TTGATCTGTTCCAGCAGTTGCAAAAAATATGTTCACCTTTCCACCTTTTT
AAATTTTGTCTTCGTTTTGATAAGTACTTGCAGTTCTCTTGTTTTTCCGT
CAATGCACACATTGTCGTGCCTCGTGCTATATCAATTTCTGTTACCCACC
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TGTTAACAATGAATACATGCAGGAAAAGAGGTTCCACAATTGGTTAGAAG
GTGCTAGGGACTGGGCTGTTAGCAGAAGTAGATTTTGGGGTACTCCACTT
CCAGTATGGATCAGCGAAGATGGCGAAGAAGTTGAGGTTATAGATTCCAT
TGAGAAACTTGAAAAATTATCTGGCGTCAAGGTTAATGCCTCTGCTGTGC
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TGGACATTGATGTTTATTGTTAATGTAAAGCATTCTTAATATTTTGTGCT
CAGGTTAACGATCTTCACCGCCACCATGTTGATGATATTACGATTCCCTC
TCGCAGAGGGGAAAAATTTGGGGTGCTCAAACGTGTTGAGGATGTAAGTT
TGTTTTGACCCACAATTAGGGTGTCTTACCCTCACTTGTCCATTATCCCC
TCCATTTGAAAATATAGTGCATATTAGTTTGGTCAAAGTCAATCTTTAGA
AAAAGTTATCAACATCTTTGATATATTCTTTTTATACTCGGTCAAACTTG
AGGAAGTTTGACTTTAACCAAAACTGATATGCACGACTTTAACAAAAACT
AATATGCACTATAGTTTGAAATGGAGGGACTACATATTCTTTTAGGTTGG
TTCGTACTATATTTTTCCCATTTTCTGGTTGTATACCTCTTCGTTGTACT
TTGTTCTATGTGCTCCAATAGAAACTTTGTCGAACTCTCTCCTTAGTTAT
ATATTTAAGAAAATAGAGAATTAGAAAGAAGTATCATGAAGAGAGGGAGG
TTAGATTTGTATTGAATGGAATGGGGCAAAGGTGGAACTCCGGATAGTAT
ATCTATGGTCATTTAGATGCTAACTAATAGTCCTGTAATCTCTAATATAT
GCAATTATGTTCTGGAAAACATATTAATTGTACCAGTCAAGTAATGGAAT
TACTTGCTTAGGCTTGATGAACTAATACCTTGGGAATTTCTAGGTGCGAA
GCCCTTATACAACCCATTTACACATATTTATCTCATTGTTGCCTAATTTT
TCATGGCATTAGAGGTGACAATGGTTTTGCGTAAGTGATTGGTAGCATTC
AAATTCCTTATAGAAACGAGTCTGCCATAGCCCATGCATCGCTGGAACGA
TAGATGGCTAAATTTCCTAGTTAATTGCATGCCCTAAGGTTGTTTTCTAT
TTATACTTGTGTAGTTCATGTGCTATCCATGCCAAGATTATGGATGTGTT
TGTTTTTTCCCATGGTTACCCACCAAAGATTTGGCTAGACAATATTTTGT
TGAGGTTTGCACCCTTGATTAGCCAGCATTGGCTAGAAAAATGAACTAAA
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GTACACACGGTATGGACTCGACTGTCGTGTATGTGAATGTTTGATTACTG
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TGGCAACTTCGTGGCAGAGGGCTTGGACCAAACACGCGGATGGTTCGTTT
CTCCCTTCAGAATCTTTGGCAGTTATCGACTACCATGTTCTCGCTAATAA
ATAAGAGTCTGTAGGGCCTTCGTTATTTATTTAAGTCCTTTTGTGTGCCA
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GCTCATCAGTTGGCAATGATTAAATTTCAAAGACCAGCCCAAAAAACTAC
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GCACAACAGAAAATGCTGCTAGTTCCTGTAACACTATGTTGACATCTTCT
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TGTTATTTAATGCTGTACTTGTGTGAGTCTGTAACAATGGTTCGGCTTCA
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TCCATTGGTCTAGAATGTGTACAAGTATCGATACTGGAATTCTGTAATAT
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TTCATGAATTTGACTTCATCCTGCAGGTTTTATACTTTGATGGTGCTATC
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TTGTTTTGGCGGAGGATGGTAAGAAAATGAGCAAGAGTAAAAAGAATTAC
CCTTCACCTGTTGACGTCATTAATGAATATGGAGCGGTATGTGTTGTCTC
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ATATCAGTAATTCTATTCTCCAATTATTGTGACCTAACATCTATTGATTT
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TGTCCAAAATGCGAAGAGACTTGAAGTTGAGGGTCTCTCAGCATTTACTC
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ATACATTCTGCAACTGAAAGTCTCGTTAGCTTTGTTCACCAGGAGATGGA
TGCATATCGGCTTTACACGGTAGATTTTCCTGGGTATTTATTGGTCATGT
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TGTGCGGTTCAACCGCAAACGTCTAAAAGGACGTACTGGCGAAGTAGACT
GCAGAATTTCTCTGTCAACTCTCTACCATGTAAGTAAATATCCAGCATTT
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TGCGGGCTTTCTATCCTTAAGTGCTATACTCATACATTGATATTTACAAC
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GTACCTTCACTTCTGGAAGTAGTTCACGAGTGTAACCAGCATTGTGACGA
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TCTCTGGAATTATCTTCTGTTGCTCGATACCATCTACGGAGTATTATATT
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TTGCACTTTCCCTTCCACAACCGGGGAGGTAACTTTTTCTCATTTGATAG
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GATGAGCGTGTTGAGCAAAGTGTAAATAGGATGATGACCATCATTGATCT
TGCACGCAATATTCGTGAACGGCACAGCAAAGCTCTCAAAACACCACTGA
AGTATGTCCGGACTCTATTCGATTTTTTTCATTAACAATGTTTTTTGTAG
GGTCATTTAGGTTAGGTAGGTTACATTGTATTATGTGATCTGTACTTTCC
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GTAGCCTTTTTGGTTGTGGTAGTTCTCATAACATCATTGTACATACAAGT
CATAATAATTGCGGTAGTTGTCATAACATCGGTGCAGTTTTATTGCAACC
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AAAACAGAGGATAACCCTACAGCCATTTTTATTCAAATTGTATGCACGTA
ATCCTTTTGCTTCATGCCTTTTGACATCATACTATAGTTCAAATTACAAG
GCTGCTTAACTAGTTTAAATCCCAGGGAAATGGTGGTTGTTCATCCTGAC
AATGAATTTCTCGAAGACATCACGGGAAAACTAAAAGAGGTTTGTTTATA
AGGCCAAAAGTTGTCTGATATACACCTATAATCTTTTTTATTCTGGAATT
ATGTAACTGCCTTGCTACTTGGTTATCATCATGTGGAGTGGCTGTTTGGT
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CATGGAAGAGATGAATGTTAAGATTGTTACTCCATGTAATGATCCCATGA
TGTATGCTTCTCTGCGGGCAGAACCCAATTTTAGGTATGTGCTCCTAAAC
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GGAGTAAAAAAAATGACCCAAGAACAAATCTTAGCCTTTGAGCAAAGCGG
AGAGATTTCGTTCTTTGGTCATTGCTTGAAGATAGATGACATTAAGGTAA
CATTATATGCTATCATAGGTTGTTAGTTTCAGGAAGGGAATGATTGATAG
TAGATGTGAACTGAATTAAGAAGTTTCAGTTTATTTCAAAAAGATACATC
TGTGATATTATCATAAGCTCATGACCCTTCATCATGAAGTAAAACTTCAG
TTTAGCACAGAACCTACTGTATCACTATGTCTATGAAATTACTTGATGAA
CTTTGTACGTCTAGGTTGTCCGTGAGTTCAAGCGTCCTGCAGATGTGTCA
GAGAAGGAAATTGATGCTGCAGGAGATGGTATTACATAAATTTATGTCAC
TCCATCCTATTAGTTTTGCTCATGCTTAGTTTTGCTACTATGGATAAAAT
CAATGTCTTGTTTTTTATAGGTGACGTGTTGGTAATTTTGGATCTCAGAG
CTGATCAATCATTGATCGAAGCTGGAGTGGCTCGAGAGGTAGTCACTTTT
CTTTATTGATAATGTTTTTTTTGATTTATTGATGTAGAGTTGGTGCTCTT
GTGTTGTTTGTGTTTACCATAGATTGTTTTGATCTTTGGTGTATTGAAAT
AAAATTTATTTTTGATGTTTGCTGGTAACGCACTGGTTCATTTCTTTATG
CCAAAAATTCACGTATTCTGCATGACACACATCACAATATTTTAGTATTC
CCTCCGCCCGGAATTAACTGACTCACATTTGTCTAGATTCACATGTATCT
AGATTGCTGAAACTCTGGTAAGCTAATAATGGAATAGTTTCTCTATTTAG
ATGACTAGCATCTCGTGTCATGAACTTTTCATGTCCGTTTGAGTGCACAA
GTCTTCCTGGTACTCCTTTTGTTTTGATTCAGTAAATAGCGTGGTCTCCT
AATTCAAAAGCAACTCTGTTCAGGTTGTAAACAAAATCCAGAAATTGCGC
AAGACTGCTCAGCTAGAACCTACAGACTTGATCGATGTGTACTACAAATC
AGCGGACGACGGCAGCAGTCGATTTGAGGAGATTTTGCAGTCACAGGTCA
GTCAATTTTTCTGAAATAAAGTTTCTTGTTTCAGAGACTAGAACATCCTT
TCACAAAAGCTATTATTGTTGTGTGCAGGATCAGAAAATTAGGGAAGTGC
TTGGTAATTCACTAGTTCCGATGGCAGTGGCACCATCAGATATGGTGAGC
TTGGATCTTCAACCTTTAACCTTCATAAACCATCAAATAAATTTAAATTG
CACATCCTAGTCAACAACTTTTTTGCATCTTTAATATGCTTGCATTAAAG
AACCTTTATAGCATACTATATAATAATTTAAGCTCAAGTGTCATCATATC
ATAATAAAGCCAAAAGTACACCGGGTTTTGGCAAACTTTGTGAGCATAAA
CAGCTATACGGGGGCTGCTTTTGTGGTGTCAAGTTGAGAGCATTTTCAAG
CATTTACTTTCGTATCTTGGTAATAGAGATGCACAAACTGGGCTTGCAGA
AAATAGTATGTACGGAGGTGTTTAAATGATTTTAAATGGCCATAACACTT
TTCGTTGCAATGTCATTGTATTGTTTGCAGGTAGCTATCTGTGAGGAGTC
TCACGAGGTACATGACATGTCTTTTGTCATCTACATTGCGAGGTGCATGC
CTGTGCTTGCACCAGATCTCGTTTCCCATGCCTCAGGTAAATAAATATCC
CTATTTCTGTTTAGGGGTGCAATAGTTAATCAGTGGTGTTGTGTACTTGC
TATTTTTTTTGGTGTTCATATCATGGTATTGTGTGAGAAATTCTGCGAGT
AATGTCTGTGTACTTCGAACGGAACAGGCAACAGTGACCATGTTGATGCT
CTAAGAGTGTATTTATCATCAAGGTCCATTTCCAGATTGAAGAACGAATT
CCAGACTGGAAATGGCAAGGTAGGGAATCTATAGCGCTGTTAACAATTTC
CATGGTGTGGGTGTATTCTCTGCTCTTACATGTTTTGACTCTTGCAGATT
ACGGTGCGCTGCATTGAAGGCTACCCGCCAATTGACCTGCAGCTAGGAAA
GCATGTTTTTCTGAGTGCCGGCGATTTCTATCAGGCTAATCGTTCTTGAA
TAGTCTTCAAGCATTGTACCAATTTTGAGTAGTTCTTAATTTTTCAACCA
GAGTCATTCTGACCAGGCTGATTATATTTGTGCCTTACAAAAGCAATGTG
TTTACTTGAATGTGCTGCGGGCGATGGAAGGGAGATGAAATTGTGCAGTG
TGTATTCAGACAACAGCTTATACCCGTGCTCATGTTTTTACACATCAGCT
ATATGTCTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.