Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA014410

[Submit comment/correction]

Sequence	AA014410
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA014410
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGACCTCAATTATTCCAGTGTTTGCCATTCATAGGGAAAATGATAGGTA CTGAAGAGTGGAGAAATGGTAAATTAAACTTTTTAGACGCCTTTTTTGAT GAGTAGAATAATTTTCTTTCAATTGGTGTTTTTTGTTCTCATCCTGGAGA TCTTGTGTGACAAGTTCCTGTTTGGGTTGAGTCTAAAACTAACTTTGGGT TTCTGCGAGCATTTGTCTTTGTTCCTAGAGCTTTAGAATTTGGGCACTAT TGATGTATTGCCTCCGAGCTAACTTTTACTTTTATTTTGTTCTTCTATGC TTCTATTGTGTAGTAATCCCACAAGACATGTTAGTATTTATATATAAGCA AAACCACTTGGCCTTTCCTCTAAAAAATTAGCCCAAATCTTTGTCTAGCA ACTATGTTCCATATTTGTACATGCATCAACATGGTATTCTCTTTTTATTA GTAACTACTTTTTCTAGCCCATAGTTCCAGAAGATCAATAGGCCTGAGTT GTGAGGAAAAAAATACAAATGGGTAGATATTAGCTTTGTTTTCTAATCCT ATAGTTTTATGTGGAGAAGAGAACACGTGCTTATTTCTTATGGTTGGATC AAAGGACGATCATGCTATGACTCAAATAAATGTGAAGTGTTCGAAAATAA GACACAATCTTCTCAAAAATGCTTTTATCTCGGGGAGGGAGGAGGTGGGA GCGGGAGAAACATTTCAATTTTCTTTATCTATGTTTATGAATAATATCAT GTAGATAAACTTGGATTGAACTACATTTTGTTGGCCATTAACACTAAAAT CCACACTAGGTGTGATGTTTCCTTTCACTTACTCAACACATTTTTTTTGG CATCAGAAGTACTAGCATGGAAGAGAAGGCACATGCGAGTCCAAATAAGC CGCCATACAAATTGTTAAAACATATTACAAATAATTTTCATGATGAGCGA TTCCTTGGGAGTGGTACATTCGGAAAAGTTTACAAGGTATGGGCAATATC ATATTTGCCTTTAATCTAAGTTTCATACATGGATTTTGCACATCACACAT ATTTCATATAAAAAATTAGGACACAATATCGCCACTTCATATGTTTATTA AAATTTGATTAGAGAACACTTTGAAATGCATAAAAAGGAAGATCTATATT GAAGGCGGCCATAGAGTGCAAATAATCTTGTAGTTTGAACATTTATACAT CATGATCATTGCTACATAAAAAGAAGAGGATCAGAGTACTAACATGAGAT GCTAGACAGGGTGTGCATGAAAATGGTGAAGTGATTGCCGTGAAGGTGCT ACATAAGATTTCAGGACCAGATGATAAGGAATTTTACAAAGAGTTCGAGA ATCTCAGGGGGCTCAAGCATCCAAATATTGTGGATTTAGTGGGATTTTGC AATGAATCAGAGGAAGAACTCGTGGTGTTTGAAGGGAGACAAGTTACTGC TGAACGTTTGCATATGGCCCTCTGCTTTGAGTATGTACACAACGGCAGCC TTCAAAAGCGCATTTCTGGTAATTAAGTCAATACACTCCTCCACTCGTAC ATTAATATTTAGCATGTGAACAATTATTATTTACATTACATTTTTGAGTG TTCTCGTTTACTTTACCTTTGTTGTAGATGCAAGTATGGGACTTAATTGG CACACATGTTACACTATAATCAAAGGGATATGCGAGGGCTTAAAGTATCT CTGTGAGGGGCTCGAGTATCCCTTAATGCATTTTGACTTAAAACCTGATA ATATATTGCTTGGTAAAAATATGGTACCAAAAATCGCAGATTTTGGTTTA GCAAAGCTATTCGGAGAAGAAAACACATCAAGGACGATGAATTCTGTAGG TACATGGTAAGTATTCTATCTAGCACATGGGTGTAGGTAAATTTGGAAGG TTTTCCATAAGGTTTATTTTTGTATTTTGATTCTTTAATTTGCAGAAGGA TTTCATTACCACAAGGAAAATATTGAAATTCACCTATGGTTACTGAACTA GGACGTATCACTATCTTGTATCATTTAAAAAAAACACACAAACCATGATA AAACCCTAGGGTGAAAACGATGAGTTCAATATTCTATAGGGTGTATCCCT ATTAGCTGGTAAAAGTTGAATTTATTTTATACCCTTGGTACAATGGTATA ATAAGTATCATGAAGGAGAACCCCAATTAAGATACATTGAAATCCTCAAT TTTAGTTGCTTTATATATATATATATATTCTTTGAAATGTATTTTATTTC TAAACGTGATTAGTGAGAAGTAAAGGTTTATTAAATGTTGCACTTATTTA TTCAGGCTTTCTCTTCGAGAACTAGTTTCTTTTTTTGGCAAAACTTAATA ATGTTTATAATGTGTTAGATGCATCTACTAGATGTAAAATCCTTTTATAA TGATATTGTTTGTATATTTTGTTGTGTTGCTTGAGTGCACTATGTAACAA CTTGTACCATACATGATGACATGCAGTGGATATTAGGCCACCGGAATACG TAAAGCATCAGATAATATCAAAAGAGTTTGACATATTTAGTCTGGGTGTT ATCATTGTAAAGATAATTACCGGACATGATGGCTACAATCGTGTTGCTGA CATTCCTACCCACAAATTTGTTAAGCAAGTAAGAAAATATTTGTCTATGT ATGGATATCAACCATCCCTATTCAGTAATTGTAGTGAACTTTCTGTAATC TACCATTCTAATTTTTGTACCGATATTGGAGGTATGTGAAAATTGGAGGA AAAGGCTACGTCGAACATGGAGTCACTCGTCACTAGAAGTATTATGCAAG CAAGTAAAGAGATGCATTGAGTTAGCACTAGAGTGCTTGAAGTCAAACAG GCAAGAAAGACCTACTATACAAGGTATTATTTATAGTTTGAAGGAAACAG AAACAATGATAGGTGACAGAGGACTGCAGATAGAACAGGTACCATGATTT GACACATATGTCTATATTAGAAATTATGGTATATGCTATTACAATTAAAT TTGTGATATGCACTGGTCCATGAGGAGGGTCTATAAAAACCACAAATTAC TTTGCAAAGCTAACTAGTCAGATCGACAAGTGCACCTCAATGATTTGAAT GTGTTTTATTTTTTGTTCCCACTCAGCTTTTGTGAATTTCTCATACCAAT TCTAATAATTCCCTCTCACAAATAATTGATCAGTTTGTCCTTAAATCATT ATATTTGGACATCTAATATAATCAACCATAATTAACTTGTCTTGGATCGA GTCTCTTCGTTAAGTTAGTGTTGAAGTAATCGTATAACTTTAATATTTTA TTGGTAAACTATCGTTGTCCAGATATGTAGTGTGTTTTACTTTCAGTCTC CTATGCACAATCTAAACGTCAATTTTTTTCTATCTTGTTACACTTAAAAA GTACTCCCTCCATTCATACAATTTCATTCCAACCTACTAACTGCTATTGT TGTAAGAACACATTATCTTACGGGAGGGGGGAATTAGCAAAAGAAGTGAG TCTAGCTCACTTGGTTAACGGGATTCCAGTCCTCACTGATGTTTTTTTTA TCATCTCTTCCACTTTCCTTGTCCACATGATTTTTATGGATGCTATAGGC CAAAGTTACAAAATTTTGACTACACGCATATACAATTTTCATAGTAGTGG TCAAAGTTTTAGAGGGTTCACTACACGCCATATATTTCTGAACAGATAGA GTATATAATAATTGCAACAAGAGCACCAGCTCAGATATCTTTGTTATTTA TATCCTTGTTTTTTATATTTTATATAGTTCTATAAAGAAAATGATGGAGA ACTCACCATTTTCTCCGAGAGTAGCAGGAACAACTCCAGGCCTACTTCTT CAGGTTAGCACTACTTTTAGCAAATATTTGCAACAAAAAAGATACTGTGG TACTTAATCTGACTTCGTACTTCCACTTCATAATTAGCTCTTCTAATTTT GCATGCCATGGTTCCGGGATGAAAAGGCTGTAATATGATGTCTTAATGGA AAAATAGAGATGGCCATAGATATAATTGAGGGGAATTACCTACACTCTTA ACTCTTGTTCTGAACTCTAAAATCTACATAGGTAAGAACCTATAGAAGTT CAGTAAAAAATGTGATCAGATGTGCCATTTACAAAAAAAAAAGACAAGAT GGTTCGTTTACCTCTCCTGTATTTTTGTACATGACACAAACAATAATTAT TTTTTATCAATGGTTGCAGGTTCTTGTTTGGTATTTTTCCTTGCACCCAT GAATATTTTCAGTGTTCAAACCACCGTGAAAAATAGAATTGGGGTTTAAA GCGAACTTTTTTAAGTTAGCTCTCATTTAAACTGTTTATAGGTCATGGCT TAATTCTGACCCGAACCCGATGATATAGTTCGCGCACTACAGGAGAGCAG TTCTTTGCCGTGTGGGGCAAAGGCTTTGTCGTGTGTAAACACAAGGCAAA AGCCACACAATAACGATAGCCATTGCCTTGTGTCTTTGCGTCCGGAACAC GGCAAAGGCTTTGCCGTATGTTTTCGGCGTAGACACGATAAAATAAAGTA GTTCACGGTTCCGTCCGTCTGACGGAGCCAACAGATCTTTTCCGTAAACT ATCTTTGCCGTGTGCTTTGCTAGAAAAACCCTTGCTAGAAAAAGGTGAAA AAAATGCTTTGCCGTGTATACAGGAGAGTACACACGGCAAAGTCGAGTAC CTAACGGCGAGGGCACACAGCAAAGATTCTGCCGGCGGGTGACCCTACGA GACCGCGGGGCCCACATCTTTGCCGTGTATCTTCAGTGCTTTTGCCGTGT TGATTTTCTTTGTCATGTGCCTTCATTTTTCGATTGCCGTGTTCTTTATC TGTAGTCTTCCGTGAACATTTTCTTTGCCATGTGCTTCTTTGCCGTGTTC CGGGCGTTTTGGCACACGGCAAAGGGCGGGGACGATGGTAGCGAACATTT TTCCGGTAGTGGTGGTGCACAAAGTAGTTCTATGTATTCTAGCATCTTGA CTACTTATTTTGTGGAATTGCCAGTTCAGTATGGAACTAGCATATCATAT CGTGTGGAGCCAGGGGTTATGCCATTGATATTACTAGAGGAGATCACTGA TAATTTCTCCAAAGATAGACTACTTCTCTCATGGGCTGGGTATGGAGAGG TTTACAAGGTACACAATTTTATGGACATGCCTTCTCTCATCAGAGCATCC ATGCATGTATATTATTCCTAACAAGTCCGGATATCAAATCAATTTGTAGG GAATCTATGAGCATGGAAAAGTTCTCTTTGCTGTGAGGAAACTCGGCACA GAAAAATCTAATATAGAGTGGCACCGTCTGGTTTCCCGTCTTCTGAGAGT CCGTCACAGAAATATCGTGCAATTTGTTGGATACTGCATGGGTACACAAG AAACAGAGTGGGTCAAATACTTAGGAAGATTTGTATTAGCTAAGATTGTA ACTAGGATCTTATGCTTTGAATATTTGCCAAATGCATCCGTTGACAAGCA TATTTCAGGTACATGAGGCACTGCAACATGCGTGACAAATATTAGTAATA TCTATCTGTTCTTCCTCCATCCATACATTTTTATGTTCTCTGTTGAACTT TATAGACATAAGCTCTGGTATCAACTGGCGCGCACGCTACAGAATAATTA AGGGCACTTGTGAGGGTCTAGGATATCTCCACATGAAACACGTTGTGCAT TTGGATGTAAGACCTAGCAACATATTGCTGGATGAGAGTATGATGCCAAA AATAAAAAAATTTGGTATGAGAAAAGATTTTGAACTTGAAGAGAATGGGT TGCCTAAAATGGGATCGATGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.