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GrainGenes Sequence Report: AA051075

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Sequence
AA051075
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA051075
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTATCTGACCCAAGAGCTCAGCTGTATTTACCCGCAAATGCCACTGGA
CTACCCAAAAACAGCCATCCTGAAGCGTTATTTTCTTTCTTCCTGTTTGT
GTTCTCTGCAGATGGAATCCAGACGACTAGGGCAAGCTGCCGCCCCATCT
CTAGCCCGGACTTGGGCACCCAGCCGCCCCAATCTCAGGCGGGATTTCTC
CCCAGCAGCTCCGGCGACCCCTCCCCTTCTGCCACAACGTCCACCCTTCT
CCCCTCCAACCTTGTTCACCCTCCTTTCTCCCTCCGCCCTCCACTCTGTT
CTCCGTCGTGTGCAGTACCAAGAAATGGGAAGAAAAGCCACAGTCTCCTA
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CATTTTTGAGAACTGATATTTCTAAATGCTTCACACAGGTAATGCGTCAT
GCTGCGATGAATTTACCTTTTATTAGCAAGATTACACAAGTATATGATCA
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GTGTGCAAATATATTTTATAGACTTTTGCATATAGTCCAGAATCTGTAGT
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TGTCATGCTTGATAAACTACAGATATGAGAAAAGATGATGTTCATCTTAT
GGAGAGCTTGGCATCATTGAAATGATGCCATTTTGGGGAGACTTGTACGC
CACTTACATAATTATCTAGCTACTGTTCAGGGCCTTACAAATGGACATGT
TACTGTATAATGACGCTCTCATCCGTGCTACTCCCGTGTCTCCTTCTCAA
AGAGTCAAAACCTAGGCGCCTCCGCTTGTCCGTCTCCTCCCACGTCCTCT
CCCCATCGGCCGTCGCTGCTCTGGCTTTCTCCTTCGGGAGGAGTTGAACC
GGAGGAGCAGCGCTGCTCACGAGTCCTCCATCCCCACGTCGTCCTCCTCA
TCCAACATTGTTCTTCTCAAGGAGGACCGGATCTGAGGAGCTCAACCTCC
ACCGGCCGAGCTCAACCTCCACCGGCCTGTTCCTGACTCCATCAGGACCG
GAAACGGCGGCGCTCGCCCGCAGGTACGCCTCCTGCCCTCCCCTATCCCG
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TGTGTGTGGTGCTTACTGCTATGTGGAACTGCTGGTGTGTGTGCTTACTT
GCCAGTGTAGCGATGTGCAAGATCTGCTTGCTGGTTGCTGCTGCCTGCCT
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TATTGCGATATGTGCATTGGCGGTGGTAGAAAGAAGTGTTGGCGTCACCA
TCCTTGAGGTTAGCAAGGCGGGCCCGCTGCCTGGCTATGGTACGCTCTAA
GGATGCGAGGCCTAGGTAGGAGATCTTGAGTTGCTTGCGCAGTTGGTTTT
CCTCCGACGTGAGCAACCTATTCTCTTGGGCTTTGTCGAAGAAAGATATC
AGCTCGCGGGAGATCGCCAGCTTGTGCTTGATGTTACCTATTGAATGGGC
ATTCCAGCTGGTCAGCTTTTTGCTTGATGTTACCTACTACAAAGGGTCCG
CCTCATCTACAAAACCCCAAGCCTCGGCCACGGTCTCATGGAACCCATCC
ATCCTCAACCAGAAATTCTCGAAATGGAACCTCATGTACATCGCTGGCAT
GGGGAGCATTCCAGGAGAAGTGGGCAATGATCGGACACCACCGACACTAG
GCATATGAGGTGGTTCTCACCGTGCGCGTCTTCCCAGTCCGTGGTGCAAA
GCACGCGGTCGAGATGTACCAGGGTAGGGGGTGATTGCTCGGTAGACCAT
GTGTATCTATGACCATTCAAGTAGGCCTCCTTGAGGGCGAGGTCGTTGAT
GATTCTACGGAATCTTCCCATCATGCGGTGATTCAGGTTGTCGTTCTTGA
CTTCTGCACGGTAGATGAGGTTAAAATCCCCATAAAGCATCCATGGGCCG
GGGGAATCGGCCCGGATATCTCTCAACTCCTGGAGAAACACAATTTTCTC
CTCGTCCTCTTGAGTCCCATATACTATCGAGATCCACCAGGGGGGTGCCG
GACTCGTAGGAAACATTGGCAGTGATGGCGTTGGTGGTGAACAGTGGGTC
CATAATCTTGACCCTGCTCTTCCACGCAAGCAAAATGCCGCCTCGCGTGC
CAACAGCTGGCAGGTAGGTGTAATCGTCGAACTCCGGCCCGAGAGTCTTA
AGGACAATGTACGAGCACAACAACTCCACCTTAGTTTCTTGAAAGCATAC
AATGCTAGCACCCATGGTGTCGATCAACGATCTAATGGCTAACCTCCTGG
CTCGAGAATTGAGCCCTCTAACGTTCCAAACTACCATCTTAAGACCCGCG
ATCCATGGGAAAGAGATTGACATGGAGGAGTTAACAGATGGGCTAAGTCT
TGCTCGTGCCGTCAAAAAGGGCCGAATCGACCGGCGGCAGCACGGATATT
TCTTGGTCCACGAGCTTGGCGATGGCTACCAACACAGATTGCGGGATTAG
CATCGCAAACATGCAGTTATAAGCCTTCATCTCCTTCGCAGTAATCTTTT
GATCGAGCTCAATGAGCCCTAGAGTGCGCAAGATCTGGACCTGGGCCATG
TGCTTAGATTTTGGTGGGGCGCAACCCGTCTTCGCTGAGTTTGCCGAACG
ACCGCGCTTGGGCGCGAAGTTTAGCTCCCTGGAGATGGCAAGCAAGCGTC
GATGTGCCTGGTAGCCGCTTGAGAAAGTCGCCCAGCGTCCAGGTGGTTGC
TGTCGAACCGAAGCGAGCACTATCGTGACGGTAGGTTTTCGGTGGCGTAG
CGAACCGACCTGGTGCCGTGCACAATTAGGCGTGGGCATCGCCTGAGCGG
CCTGGCACGACATAGGGAGGGGATCTCGCCTCCTCGGTCTGGCAAAGCGT
CATGGGCAGCTGCTGGACAAGATCCGGTGTTGACTGGGCCGTGGGCGTGA
GGCCCAAATCCGCCTTGAGCGGGCGACTAGAGGGAATAGGAGTTCGCGAC
ACGGGATCTGCTGGCTACTGATGTGCAGTAGTCTCCAAGGGTTGGTCTGC
CCCCATGCCAGCGAAAGAGTCCAAGGGCTGATTTGTCTCCAAGCCAGTGG
GAGCTTCTTTTTGCCCCGACAGTGGATCGACGTTGGAGACTAGGTTGCTG
GCCTTGGAATCCTGGACCACCGTGTTCGAAGATAAAGCTTCGCGGTTTTG
GGGAGGGGGGTTGTCCATATCCACATGGCCCCCGGCTTGGGCATCGTCTG
GCGCCCTAGAATTTGAACTTGACGACTCGGTCGTGCCAGGCTCATCAGAG
GATGTGATCTCTAGCTCGAAGGAAGACGAAGAGGTATGCGACTCGTCCAA
TGGGAGCCCGCCAGCTATGCTTCTAGAGGGATCGGCGCGTCCCGGATCTA
GGGCCACCTAGGTGGTGGCCGCCCCTATGTCAGTCCTGACAAAAGCGACC
GCCAGCTATCGGTCTTTGTGCATCCAGACACATCGTCCCTAGGCACGAGA
GTGGCGGGGCCCACCCTGGAACGGCCATGGGCCCATGCTTTGATCGTGGG
CGGTGCTAGTGGTAGGGGAGGCCTTGGCGGCGGCGACACCGACTGACGAA
TGTCTGACCAACGCACACCCACGACTAGGCTGTGTCGACCTGTTGAGCAC
GGGCGTCTAGCGCGCACGTGAGAGCATTGCGCTCCATGCCATCATCATGG
CCGGATTGGTGGGGGAGGTGCCGTTTTGTTGGCGCTTGCGATTCCTTCGT
CTCTGGCCGCGCCTTGGTTGCTGCTTTGCGGGCCCTCCCTCCATGTTGCT
GCCCTCATCTCCCTGGCTCTTGTCGGCATGGTTGGCCGGTCGTGGGTCTC
CACCGACCGGTGCGCTGCTAACCACCCTGATGGATATGGGATAGGTGAGC
TTAAAAATACGCAGTGACGGTGCCTCGGACTGAGAGTGTGCTAAGACGAG
CTCGACCACCTCGAGGATGGCCTCGCCGTGGATGGTGGTCGGGTTTGGCG
TGCGCGTCGTCAGGCGGAACGTTGCCATGTCCGTGCGCGAGTGCATGTCC
GGGTGCAAGCGCTCCACCCAATAGCTCTTGTGCAACAACGCCTCCACCGT
CGACAGGTTCTAGGAATTCGCGGGAATGCCACGGAGCTCGAGCTTGGCGC
TGTAGTCCAGCATGCCCACACTGGCGTGAGCCAACTTGCACCAGGGCCTG
AGCGAGAGGGTGAAGCCAGTGTTCTCGTTTTGCCGATAAAGTGGTCGTTG
GCGATCCGGTCCTTGATGGGATTGCATGTTGCAGATGATAAATGCTACAT
CTACGGACAGATTCTACAGAATAGTCTTACGGACTAACAACCTAGGCGTA
ACAGTTTGAGAACGTGGTCCGCACTTTCAGGAAGAAAAAAATTAGCACCA
AATCGTGTGGCTCCACGTAATCCCGTAAGCCCAGTCCGTAGGCAAATTTC
CGTACATACAGCATTACTGGGAAATCCTCTGGGTGATGGAGATGGATGGA
AAAGTCGCCTGCTTGCAGGTCAAATTCTTGACGAAGCAGCGCGGCCACGA
CGTCGGAGGCGACCGTCGGCCTAGTTCCTGTGACAGTGGCCACCATCGCG
CGGCCTCCACCATCTCAGCGTAGCGCGACACGATGACGCGGGCCGGACCT
AGAGGGTCGATAACTGGCGTCAACGTCGCAGCTGCAGCTGTCGCTTGCAG
AGACGGGGATGGCGCCTGCATCGGCGGCGCACGTGGCAAGGTCGGGCGAG
CTGGGGCGGCGGAGGTGGTGGGGGCAGTGACAGGCGCGCCTTGCCTCTGG
GACGGACGTTGGGCTGCCGCAGGGGCCGCCACCAGGAGCCGCGGAGGCGC
ACGACGCTCGGGCGGCACGCGGGAGCGGTCGAATTCCCTCTACTCCGTCA
TGCACTGCCTGGAGTTATGCGTAGAGTACTGGCAACGACGACAGTGCACC
TCGTTGATGCAGTCCTGCACCGGGTGGCCGAGCTCAAGGCAGCGGAAGCA
GAGGCCCTCCTCCTCCTCGGGCGTAGGGTCCGGCGACGAGGCGGCCGGTG
GTTGCCTCCTGCGTGCTGGGGACGCCGTTGTTGGTGATGACCACGCCTTG
GCTGCTATCAGCCTTCGGCATCTGCGCTGTGGGTACCACATCGGCAACGC
GATGGACCTCCGAATGGGGCCGAGGCGGGTGGACAGGGTTTGTGGCGGCG
ACCAAGGGCTGTAGGGGTGGAGACAGGGAGGGAGGGAGGGGAAGGGGGTG
GGGGGGGAGCGGGGCTAGAGAGGGAGTAGGCTACCGGCGAGGAGTTCGAC
GGCGGCGGCTAGGTCACTGGGGTGGAAGGAGAGGGAGCATGCATCTAGAA
TCGTGCATGTCCATCTCCGATCCTCAAGTCCTATCTCTGCACTTCAGAAT
TTGGTATAAAAGAGTGAATGTGATGTTAGTCCATAGAGCTCTAATTTATG
TTAATTTTTTCGCAAGTTACTTATTCTTGTACCTGTTTACATTATGTTCA
GATTCATAATGGAATTATGGCTTTCCCTTGATGAAATTAAACAAAGACGG
TGAGTGATCAGGTTTTTTATGATGTTCCCTTGCTTGGAGAATAGTACATC
TTAGTAAATCATATAGAAGCATCTCATGCATTGCTAGCTAGCGCTGCACT
TCTTTTTCCATGTTTTTTTATTCGGTTTTAATTCTGTGAGCACTCTGCTT
TTCTTTTTGATCATTATTTTCTCTTATTGTCTCGTGTATGCTGACACTGA
ATTTCTCGAGACAATGAAGATAGTCAGCTAGAACTCCTGGATATCCTTCA
GCAAGGACTAAGGATCTCTGTCTCGTTTTCGAACTTTGATCTGTTAAAAG
AGTCATCAAGCAGTGCTCCTATTTTAGCATTACTCCATTGAATAACTAAA
ATGACTATAAGCTGCCTAGAATCGTATATGTTAGTTGACCTACGTACCTT
TTTTTATGTATGCCTGATCACATGCTTTTGAGATGGTTGGATCTATATCG
AATTATTCCTAGAAGTTTAAATATTGTTTACCTTACTGCAGAAATCTTTT
ATTTTCTTAAAACTTATTTGATTTTATTCTGGTTGTTTACCGTTTGATTT
TTTTGCTTGACTTATCTAGGTGTTCAAATGCTTCAGATTTCAGTGGCCAT
TACACTGGATCTTATTCCATATGATTTTGCTAGAGCAGATACAAAGAGAA
GTAGTTGAAGGTAAATTAAAACTCAAAAGATTACTCCGTTGTTGCCTATT
TGTAGAATCTTTATTTCTTTTTTCCCCTAGAAATAGTACATCGAGCAGTA
TTTAACATTCCAAGATAATCATGTGTAGGCTGATGACTTTTGAAATGATG
TGACCTTGCCATATTTTTTTTGTGGTGAGCTTTCATATTAGATAAATGAT
CACGCTGCATCATTTATATATATATACCTATTACATAACTGAAGTTTTTC
ACCTGTTTAAGTGGAAATAAATATTGCACACGTTGAAATCTGATAATGCT
ACCAGAGTTGGCTAACCCGCTACCTTATGGTTATGATTTACCAGGTGTAA
ATCCCATAGTGATGCCAGTTCTGGTTAATCCATTACATAATGATTATGTT
CCAGTTAATGAATATCAGATGGTAGAGCCAATGGTTTTCAATCCTCTGCC
TGCTGGGATATGATTGCGGTGGAAGCTGTTTAACTAACCGCTTCCCGACC
GTGATCTGCTGTCTGAAAACCCTGTCACGATGACCGTGAAAGTACCGGTT
ACCCCATTTACTCATAAAAAATATGCACCAGCTACTGTAAATCAGACTGC
AGCCAGTGATGTTTACCTTGCTGCCTGATTATGTTTTCCAATTAAAAATC
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AAATACCTACTTCATTACACAATCACATATACTAAATATTATATCTTGTT
TTAGTTTATGTAGAACCAGATAAAATTGTATCTTATTCTTCTGTATGTGC
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TCAGGGACATGGACAATGTAAGCCTTTTGTATTTGTCAACAGTCCAAGTA
TCTTTTTCTATGTGGTACGTTTGTGTGTCAGTTAACAGTCAGTATGTGAG
TACAAGAAATCTGGATTGAATAATTGCTGCTCAAACTACCTAATAACTCC
AAATAAAAATTTCATGGTATCCATTTCCTCATAATAAGTACACCAGTATT
TGTTGGACATGCTAACAATTGTGAAGTTGTCTGCATGGTACCAAGAAGTC
TCCGTTCAATTCTGTTTACTAGTGGTAACTTCTCCCGTTTTTTACTACTG
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AAAAATATTGCTCCATAAACATGGGATAAATCTGTTAGCAATCTAATTAT
TTTGTTACTGAAGTATGAGCTATAAGATGTCTAATTGGGCATTCCTTTTG
TCTTAACAGATTGGTATGGCTCCTTTCAAAATTGGGGAAGTTGAAATGGG
GTGATAGTGTAACTGAGCTAAACTAGATATTTCCTGGTTGCTGTGATGAA
AGACTAATAGTTTGTACTATCTTGGCGCTTCTCTTTCATGGTAGCGCCCT
GCCACGCCAAGCGTGTCCGGTGGCTCCCATCAAGTAAATTTTTGTTGTCT
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GTTAAATGTTCCATGTAAAATCTAGCCTTACCACCTTATGTTTAAGCCAA
CAATTGTGTATTAAACTATTAGTAACTCTAAACATTGGTTAATGGCAAAC
TAAAATTGTTGGGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.