Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA034562

[Submit comment/correction]

Sequence	AA034562
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA034562
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GATGGTTCCATCATGGACCGAGGCTGCGGCGCGCTTCATGGTAGCAAGAT TTCTCAACCGATACATATCCATCGGCAGCTTGACGTGAGCTCTTGCATCA GTCGCTATGGCAACATCTAACCATGATTTTCAATTTCTCACCATCATCTG TCGCGTGCAGATTGCTCGAAGATGGAGGCGGCACGTTGAGCTTCGGTGAT TCCAGTGACAATTGCCATGTAAAGTCGGTCATGCGAATTCATGACCCCAT CTTCTACTGGAAGGTATGTGCCTTCACACACATCTAGGATTTATATATGA TGCCTCTTTCTTGCAATCTTATTTGGATGAAATGCGTCTTATCATCTGGC TTGCTTGGGCGAGCGGTCGTCTCCTTGTGGCCGACCTTCACAATCCTCTA CCCGTCTCCGCTGTTTTCCCTCTCTTTCTTTCTCTCCTGGCTCTCTCCGG CAAGCTTTCTGAAGTTCAGCCTAGCGCCACCTCCTCCGACCACACGCCCT CCACACCTAATGGAGGCTTAGAACCTGCTCACCTATTTTGTGTGTTTTGT GAAAACTTAGACAAAATATGGAGGCTTTATGCACGAAAATGAGTAGTGGT ACGAATTGATAAATATAATAACCAACAAAATAGTTGTTTATGCTAACAAC TCGGCATATCTCAGGTTGCAACAGAATCTGACCTTGGTTTGGCAGATGCC TACATCAACGGCTGGTGTTCTTTTCCCAATGACCAAGAAGGCCTTGTGAA TCTTTTGCTGGTAAAACTATCTCATTGTCCAGGTTAGGCTATGTCCTGTT TTTTTTTGTTTCACAGATTGACACATTTCTCTACAGATTTTCATTGCCAA CAGAGATGCTCAGACGAGTAGTAGCGGCATTTTCCGTAAAAGGTATCTAA ACCTTCAATTCTCTACAACACTCGTCTGATTCATTTGATCAAACTGAAGA TCCGTACTAAACTGAGTAAGTAATCGTGTACATATCTATAATATTGTTGG CAGGGGTTGGTGGACACCCATGCTTCTAACAGCTGGTGTGGCATCTGCTA AATATTTCCTCCGCCATGTCTCAAGGAAGAACACAGTAACACAAACTCGT CGAAACATCTCAGAGCACTATGATCTGGTCAGTAACTCCATATGTGTCTC TTTTTCTCAACGCACTCGATTGAACCAGATGCTTAGTCCACATTAGAAAT TTGAGATTACTGCAGATCCTACGGGTAATTTAAACTTAAACTTTTGAGGT GTATATGTAGCCTTTTTATGCCTGTAATTTTGTGATCCATCATGCATTGC AGTATTTAACACACCAGTGAATACACTGAAGTATTTAGTTTTCATATATG TTTCGTGCAGAGTAACGATTTCTTCTCATATTTTCTGGACAAATCGATGA CGTACTCATGTGGAATTTTTAAGGTTTGACAATTTTGTAATTTTATTCTA CAGCTTTAAAATACGCACTGTATGAATAGATGGATTGAAATTAATTTTGT AGATGGATGATGAAAGCTTAGAAGCAGCCCAGTTACGCAAAGTGAGCCTT CTAATTGACAAGGTAATAAATAATCGTACCTACCATGATAATGCCAAGAA ATCATTTATTTTAGTAATATACACTAGTCAGACAGAGGTGTGTACTGTTT ACATGATCTGATGGCGTTTCAATATTGCAACATATGCATTCTACCAAAGG CTAAAGTTGAGAGGGATCATCACGTTCTTGAAATCGGTACTGGCTGGGGC AGCTTAGCAATACAATTGGTCAAGCAAACGGGCTGCAAATACACTGGAGT AACTTTGTCGGAGGAGCAACTTAAATACACTCAGAGAAAAGTGAAAGAAG CTGGCTTAGAGGTTAGCTATGTGCTACTCTTTCCATGCCCAACTTACATA TGGCTCGGTGAAATTTTACCTGACATCTCTACTGTTTAAGGATCACATAA CATTCCTATTGTGCGACTACCGTAAAATACCAGCTCACAAATATGATAGG ATCATATCCATGTAAGTATACTACTGATGTGTACTGGTATATATGGGCAT TCATGTGGTAACAACTTTTATCCCTCTTCTTTAAATCAGCGAGATGATTG AACATGTTGGCCATGAATACATGGAAGCATTTTTTGCCAGCTGCCACTCT CACCTAACTGAAGATGGCTTATTTGTCATTCAGGTTCGATGCTAATCATT GTTGTTTAACAGCTATATATATATATATATATATATATATATATACCATC AGTTGGCTGTGTAGCCTTGTTTCACTTACCTACCTATTCTCATTTTCTCC TAATTCAGAAAACAATTGACTAAGAATATCTACCTACATATATCTTTTAT AAAGCAAAATCCTACTAACAATTGTTATGATAATCTATCTGACCAAGTAA GCTATCCATACCATCCATTATTCTGCCGACCAATTGTCCAGATAATTCCT TTTTAGCAATTCGATTGATGAGATCATACCATCCTGCTATGAAATTACAC ATGTTGAGCACCACGAATCTTTTCAGCCAAACAACCACTTTTCAACAAAT TGTTCTCAATGAGAAAAAAAACATTTGAATGTTATTCATGATTATGTGTT TTTATATACGTAACTACTCAAAACATTTCCAAATAGTTTATATGGCAGTG TAAAGGGCTAATGTTTGTTTAAGTATCCACATCAGTTGTTTGTTCATGCA TTTTATTTCATATTTTTTTAAATTAATTTGCTTGCATCATGAATCATGTA TTTTCACGAACCTTGATGATCTTTAATTCAAATAAACAATCATTCCAAGT CTATTAATTTTTCTGCTCAACTACTTTTGCCAATTGAGTCTTGCATATTC CTTTTTTTTTTTTGGAAAGGAGCATATATTAATATCACGATGATACCAAT TACACCCAGCCTCTGCAATAACGTATTATCCTATTGGCATTACGGATGCA CACAGCCAAAAAAAAGAAGAATTACAAAAAAAATGAAAAGCCCCGCTACA GCGATAAGATCCTTAGTAGCAGCGACACTAATCCCACCAGAACAACACCA GAAGTCCAATATCTCCAATAGCGATGCCTTCAATAAGAAAACAAAACACA AGCACCCTCGTCGCCCGATCAAAGATCATAGGTTTTCATCCTAGAGAAAG TTCCCGCTCACAAAACAATGCCTTCAACAAGGTCATTGCCAGGCACAACC AATTAAGGCCAGACCTTGGATTTTCACCCTGCAAGGTAAGATTGTGAACT CCTCATGTGCTGTCGCCCCACCTTCCGATGCTGCTACAATTCACGTATCA CCAAGACAATTCCTCATCGCCACCAGGACTCGACACATCATAGCTAGTCC ACAAATCTTAGCTTTCATGACATTCTTCGCACACTGACTTCACCATTGAA CTAAAGACATGTTTCACGATGGCAACAGGCTACAGAGCTTCGCCTCGCTC CCTCTGAAACCAAACGGTCAGAAAACACTGGTTGCGCACGACCGAATCCC ATCCGTTTCAGCAATCTCCAGGCATAAATCGCCCATGGGAGTTCGCCGAT GGAGCCTTTCGGAACACGACACTACCACATATCAATGAAAGCAGGATAAA GGTAGATCTTCGTCTTGGCGTGTGAGAAACCCTAGAACTATGCCCCAAGC AGCAGATGCGACCCGCGCCGCCATCCGTCTAGGGAGAACCTCCATCAAAG CCCAAGGCCGTCGCCCCGGCTTCCAGACCCCGCCGCCATCAAATCGCCGT CGAGGCGACAACCTTCGAGCGCCCAAGGGGCTCCCTACGGGGGAGAGGCC ACCACGCGAGGAAGCAGCCCCGCTGCCACCGTCGGCCGGCCGGACTTTGC CCGCCGGCGTCCTCCGGTGGCTGCGGGGGAGAGGTGGGAGGAGGAGTCGG GGGCGGCGGCTTGGGGTTTCGTCTGTGCTGCCTCCCCCAAGAGGCAGCGC GTGCGGCGTACGTCAGATGCGTGTACTTGGTTATAATTTCTTCACCTTGA TTTTCCTATTAGATAATTTCCTGTTTCATGCATCTTATATTATTTTATTT TAAAAGTAGAGTTCTTGGCAAGATTCCCGGTGCAACACGTAGTGCATCCT TCAGTTATAGGGAAACAGCTTGGTCCAGTTCTCAACATACTTTAACTTAG TGGAATAAAGCAACTAACTACCACTTCTATGTGCATATGTACATATGTGA TCCATGCAGGCCATCACAATGCACGATGAACTCTATGAGGAATACATTAG AAGCACAGACTTCATAAAAGAGTTCATCTTCCCTGGGGGTTCACTTCCTT CTTTGTCTAGGATAAAGACCGTTTCCGCTTCAAATGGGTTGTGGTATGTT CAATTAGTCAATGTTTAATTTTATTAATCTTTGTTGATTAAAGCTTCCCT GATATAGCTGCACAATGAGTACAGCATAAAGCACCTCGAGGATATTAGTT GGGACCAGTACTACCGAACTCTGGGATGTTGGAGGGACAACTTGATGGAT AACAAAGAGTAAGTACTACTAAGCATCTAGTACATGCATGAAACTTGAAA CTGTTTAGCATGTACATTTGTGATAGGGTTCATACTCCCTCTACCTTCAT ATAAGGCATATAACTTTGTGTCTGAAGTCGAACAATGTGAGATCTGACCC AGCTTATGGAAAAATATCAACATGTACAATGTTAAATATGTATCATTAGA TACACTATTGAAATTATATTTTTATCTGCATAGAATTATAGTTGTTGATA TGTTTTACTTTAAACTCGGTCAAATTTCATATTATTTGATATTGGAAAAT TTTCATATGCCTTCTACTCGTAAATGGTTGGACTATTCAATATTAGTATT ACAATATTACTCCTAATTTGTTCCTACTTTCTTTGCAGTGAAATTTTGGC ACTTGGCTTTGATGACAAGTTCATACGTACATGGGAGTACTACTTCCTAT ACAGTGCAGCTGGTTTCAAGGGGAAAACAGTTGGAGAATGCCAGGTGTGT GCTTATTATGTTTTGTGTGCACATGAATACTACCTCTATTCCAGTTTATA AGGCAAATACGTATTTTAAGAAAATAATTTAACCGTAAATTCGGTTAATA AAATACAATTTATATTTAACAAAAATTATACCATTAGATTCATATTTAAA ATAAGCTTCTAATGGTATAATTTTTATGACATATAATTCATATGTTGTTG ACCAAATTTATGGTTAAACTAATTTTTTAATATGTATTTACCTTATAAAC CGAAATGGAGGTAGTATATACAATCCATACTCATTAATCCATGTGTTGAC ATTGCCCGTATATATTGCATACAGGTTGTGTTTTCTCGTGCGGGAAATGA TAAGCTGGCAATGGATTGACGACTGATGCATGATCATCTTCCAATTAATC AGCTGCATAAATACATATGTGACTTGTCGCATATACACATGCGGGATTCT AAGTGTGGCCCGACATGTACGCATGCATCTTAATACGTCAGTTATTTTAA GACATGTTTAGCCCTGACTGGGCTCGTGGTGGTGTAGCAAGATATTTTTA TCTAGTATGTTGTTTCTGCGGTATAGTGTTTGTTTGCGCCGGAAGTATGC TGCTATTGGCTCCGCCATCTTGTTTGAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.