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GrainGenes Sequence Report: AA046139

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Sequence
AA046139
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046139
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTTTGCAGCGCCTCCAAAACCCGCTTCCCCGTTCCTAAAGATTCCCCAA
AAGCCCAACGCCGAGCTGAAATTCACGATTCGACACCCATTTCGAACTGC
TCCACTCGCCGGAGGCGGGGGATGCCGTCGAGGAGCAAGTGTGGCCGCCG
CCGCGGCGATACTGAAGACGACGACGAGGAGGTCGTCACCGTCTCCTCCG
ACCCCGACGAGTCGGAATCCGAGGCGGAGCGCGGGGCAGAGGCGGACGAC
GACGACGAGTACGTGGCAGAGAGCAGCGATGCGGGCGGCGTCGAGGACGA
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TAATCGACTGTAGCTTGACAAATGCATCCTCTTGTTTGAAGATATTTATG
TTTTTCTTCTGGTTTCTGTCAGGGGAAATCTGGTTGTAAGAAGGCAGCCA
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TAATTTTGTGGCAACCTGATGGATGTGACAAGGAGAATAACAATTTTACT
GCTATAGAAGTTGATCATTTGCTTGTACGTTACCTTCGTCCTCATCAAAG
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GAACGGAGCACATGCTCTCTGTAAGTCGTAGGCACATAGATGTTACAAAT
TGTGCTGTAGCTGTACTTATAGGCAAATAAGTTGTATGTCCCTGATGTTA
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ATATGACTAAAAGACCAAATTACCTAGAATATAGTAGAAGCGTGTAGAAA
CTACTACTCGATTTTATTACTGTTTTATTCCCACTACTGTCCCTCATCAG
TAAGAATGCTTATGTTCTGAATCTTCGAGTAGAAATATTTAGTTCTAGTA
GCATGCAATGTATCACATGCTTGCGTTGTAATGCAGGGAAGGAGTTCAAT
TTATGTTCGATTGTGTTTCTGGGTTGCTAAGTGATGATGGTATCGCTGGA
TGCATTTTAGCTGATGACATGGGGTAATAAGCTGGGGAAAAATCCCTCTC
CTCCCTCTTGTCCATTTTATATTTTGATGATGTAAATATGTAATGCTTTT
GTCTTTCAACCTTTTTACTTAGTCATTGTTACATAAAGCTACTTCTGACG
CCAAGTAAACCTTTCCAGATTGGGGAAAACTTTACAGTCGATAACTTTAC
TGTATACCCTTCTGGCTCAAGGCTTTGATGGTAAGCCAATGGTTAAAAGG
GCTGTCATTGTAACCCCCACAAGCCTAGTTAGCAACTGGGAAGCCGAGAT
AAGTAAATGGTTAAAAGGCAAAGTGCACCTGCTTGCCCTTTGTGAAAGCA
CACGTGCTGATGTTCTTTCTGGAATAGGGAGTTTCTTAAAGCCCTTGAGC
CGTCTTCAGGTGTAGCCTTTTTGCAGTTTTCGTACTTACAATCATACCAT
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TTTTGAATTGTCTTCAGGTTCTTATCATATCTTACGAGACTTTCCGCATG
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CGAGGCTCACAGGCTGAAAAATGACCAGACACTAACAAACAAGGTATACC
AGTTTGCCAATTCAGGTTCTCAAGTTTTTTTGCCAATCCGGTTGCATTTC
ATCCACAAGTGAGGTGTTTGCACTTGGGTTCCTCCTGATTTTGTTCTGCC
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ACACGGCGTATCCTGTTGTCAGGTACCCCAATGCAGGTAGTTCCTTGCTT
TCCCATTTCTTTTCATTTTGTAGATGGAACCATTGTTTTGGATTTCGATT
TATTCATTTTAGTTTTCTGCAGAATGATTTGGAAGAGTTCTTTTCAATGG
TGAATTTCACAAATCCAGGAGTTCTAGGGGATGCTGCATATTTTCGTCGA
TATTATGAAGTATGTACCTTTTTATGAACCACAAGTAATACTGCCAAGTT
TTTAATTACCACTGTTTATTAACACATAGAAGTGTTTTCAGACATAATTA
GATCTGTTATTCAATTTTTGTGTGTGTCCTGCACCTAAAATTATGTGTCA
ATGTTATTCCCATTAATTGCATTCTATCTTCCTTTGTGATGTACTTAACT
CTAGCATTATCCACCCCTAACTGAAGGCACCAATAATTCGTGGAAGAGAA
CCCACAGCAACTGCAGAAGAAAAGAAGTTGGGATCTGAGAGATCTGGAGA
GCTTAGTGGAAAAGTAAATCAGGCAAGTCTTTTCCTTCTGAAGAAGGTTG
TCTGCAATACATAATTTCGTGCAACTGTATTGTTCACACGTTATGCTATC
ATCTCCTTTAGAATTTTTCGGATACATTTCCTTCTGCAATTTTTTTAAGC
TAGCTGCAGACTAATTACCTTCTGAATTCTGATGGCTTCTCAATGATATT
CAGTTTATATTGAGACGAACGAATGCCCTGTTGTCCAATCACTTGCCACC
AAAGGTATATTTGGCCTAATATGGTCATCGCACAATCAAAAACTTAAAAC
AATTGTGTACCTACTAGGCTGCTGTCCATATTTTAACTTATAGTGATTCT
CTCTTCTTTCTTTCTTCTTATGTATAGATTGTTGAAGTAGTGTGCTGCAA
GCTGACTCCTTTGCAGATGACCTTGTACAACCACTTCATACACTCCAAAA
ATGTAAGGGAACTTTATTTGTTCTGAGTTCTGTTCATTAGGCACATGTAA
GGCAGTGAGTGTTATATTTACAATATTCTATTGTTGACCCTGTCAGGTTA
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AATGTTTTGTCTGCGATGCATTCATCATGCCCTTTTAGTGAAAGTAGTTT
CAACTGTAGGTTCAGAGTTTATTGACAGTCTGTTAGTTTTTACTGCATAC
GTAATTTGCTAAGTGTCAACATGTCGAGCCGCAGCTGTCTGTCTTGACCC
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AGCGTCGCTGCCACGCCGAGCCGAGCTTTGTCTTGATTCTTGTCATGATT
TGTGTTGAAGTATTTGTTTTTTCCTTTTCAGTTCAAAAAAGTATTTGTTT
TGTGCTAATATGATTTGATAGGTTATGAGAAAATTCTGGGCTGTTGTTGC
TTGTGTTACTGTTCTTTATAGCCATTCAGCATCGGTTTCACCTTTTGGGA
ACTATATGTAGAATCCTATTCATTGGCTGGTTATATTGGTATTGCAGCTG
ATCTATGACACCATAAAAAGTAGCAAGTCGGGAGGCTCCGATTTTGATGA
CTGCCTACGCTTTTTCCCTCCAGAATTGTTTCAAGGAAGGTATGCCTCAC
TTTTCTCACTAGCTTCTTAAGCTAATCCAACTTATCTGTATCGTTTATTT
ATGCAAGATCGGGATCTTGGACTGGTGGAGGAGGAATGTGGGTAGAACTA
TCTGGAAAAATGCATGTGTTGGCTAGATTGCTGGGGCACCTCCGACTAAA
AACCGATGACCGTATTGTCCTTGTATCAAATTATACTCAGGTCAGGTGTT
TCTAATGTATTATCTTGATATGACATTGTATCATTGTGTTAAGGTTCTGT
TGGTATTGGTAGGTTCATTGGGAATGGATGTTGTAATATTTAAACTATCT
CCTCTCGTTAATGAACTGGCAAAGCTCCTGCTTTATGTTTCAAAAATAAA
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TGTGGGGGGGGGGGGGGGTGGTCGAGGGAATGGGCTAGGGAGCCATTTGG
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GCAAACATTTTTTTTCAAATGAAATTATAAATACACCTGAAAAACGAAGG
GTTGCTCGTAAGCCATCATTAATCCTAAAATCTTCATTGGTTACTGTCAT
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AAAATATTGCAACCTACTGTTTTCTCAGGGTCTCCCTACAGTTTTCCGCT
TCAAAGTAAAAAAAAAACTCACAACCAGCAGCCATACAGCACAAAGTCTA
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TCCATATCATATACTCCCTCTGTCACAGAAATAAGTGACTTGGGTTTGTC
TAGATTCGCATGTATCTAGATGTGTTTTAGTGTCCAGATACATACAAAGA
GACAAATCTGTCAGGTCTCCAGCAGTAATGATCTAGCGATCCTTAATGAT
TCTATCTAGTGGTCTCTCTATTTATGTTAAACTCCATTAAGGGTTGAACC
ATGTTGTAATAAACTTAAGCTTGAGCCTGCCTTGTGTTATAAAGAGCAGG
TGGGGTGGATGGGTGGATCAAGCAATAGAAACCCTAAATTTACTTTTCCT
GTTGTTTTCTTCTCCTGCAAGTAGTATTAGCTCCGAGCCCCGCGTGCTCC
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AAGATGCTAGTTAAAGTTTATTTGCTATTTGGATACCTGCACAGCTGGAA
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GCAAGGCAGGTGGTTGTGGGCTTAATTTGGTGGGTGGAAATCGATTGGTT
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TGTATGAGCTGAACCTTTTAATCTATTGACATTTGCAAAGGCTGCTGCTA
GAGTATGGAGAGATGGACAAAAGAAGAGAGTGTACATATACAGGTTCTTG
AGCACTGGAACCATTGAGGAGAAGGTTGCCAACTCAGAATCTTGTACTTT
TTATATTTTCACCACTTTCATTTAATTATCCAGTGAAGGAATACTGAGTT
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TATATCAGCGCCAAATGTCAAAAGAAGGTCTCCAAAAAGTTATTCAGCAG
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TGCTTTCTTTTCCATCCTTGAAAGTGCCAATACTGATTTCTCACAACTTT
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TTGACATGGTTTGGATAAACTATGAGGGAACTGGGTGGGAGAAAGACATT
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TCATGCAGTTAATTCCAATTGGTTGATACCTGCCAGTCATGCACATAGGT
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TAATATGATGTCAACTACCAGGGGATGCGAACAAAATGTAAATGTTCAAA
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GGGCCATCATTCTGATCCATCAACTGTACCTGATACTATACTCCAGTGTT
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TGCTTTACAAACTACCCTCTTAACATTTAACCGGGTTTTCATCGGGTTTG
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GCTGATTACTTGCAGATCATTTCAAGACGAAGGGCTGCACTGTAAATCTA
ATCCTTGTACAATACTACCATTAAAGGTTCACTTCTGTTTTTGCTTTTCA
CATGTTACAGTCGTGCAGTGTGATGCTGGTTGCTACAGAATTTTCTTGGC
AGCTGTGTGTTTATCTATGGACCCACTTTTCACTTCATTTGATGCTGTGT
TAAAATCTTGAGTCCGTTTTAGAAGTGTACAATTTCCACAACTGGCATAA
TGTAGTTCTCTTAAATTCTTATGCCAGCAATTCTCTCCCTGCTTGTTATA
CATGCGATTCTCAGTTAGAATTTGGTTGTAGCTGTTACGGTAATAGAGGT
TGAGGAAATTGTGAGATCTGCAGTATGCAAAGGAGACCAACTGGGCGATT
TCAGCATGTTGTTCTGATAGACAACTAGATCAGGCACTGGGCTGTTTGCT
TTCACCACCAGCTGTTTGTTATTTAGGCCTTAGCATGTGGGTGACAGCCA
TACCTTTCAGTTAGTCTATTAAAAGCTTGGCATTTGTACTGTTGCACTCA
CCCCCTTAGCATAGTCAAATCAAAGTAGTCATAGATCCAGCCCAGCGACT
ATTTAGTATCATCTTGGATAAGTATAAACTGAAAAATTGGAAATTCCTGC
TTATGCAGTAGCTCACGCTTCTTAACTCTAATCAAAATAGAACTTTGGTG
CAATAAGCTAGACGTTTCCCCCTAAATCATCCTTAATATGATTTATTGTA
GTATTTGGGTTTAGAATTTGGACACTGTCGCTGATAAGTGACAAATTTCT
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CAGTTATAACCATAAGAAAATATGTCCCACTCTTTCGTTTTTCCTTGAGA
TCTGTAGAATTAAAGGTGGCTGAGTTGAGTCACAATAAGGCTGGTCTTCA
TTCCCACCCATCACATGTGCAGTCACAAAAGTTAATACATTGCTGGAAGA
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AAAAATGCATTTTGAAATTTTGATTCCATGTTCTTAAAGAACTCGTATGC
TCGTTGTATGTTGGAAACCTCTGCAAAACGTCAGATTTTCGTGGTATGGA
TGGAGTATCCAGTTGTTAGTAATTTTGCCACTGAAGCATGTTAACTCCAT
CTATTAGCATGCTACTGTGAGATGACCTGAAACTACATGATTATTTATAA
TGGTCCTATTTCCAGTAGGAACACTATAGTTGTGATTTAATGCAAATAGG
ACAGGCATTATTAAGGAACAAGAACTCTTTGACTGGTCCGCTATTAGGTG
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ATGGAACCAGTGCGAGGAGGATCCTTTGGGATCACATGGTCCTATTCTGA
GAGGTCGACGTCGCCAGCTCACTCTGGCTAATAACAAACCAGTCAAGTAT
CGGTCAAATGATTTTGTTACCTACTTTCTCCCTCCTGCTGGTGCCGAGCT
GATTCCACTTCCGGACATCTTTACGCCAGTTAGCATTTCTTTTGTTAATC
CTGCATGTGTATGTACACATCTCCAAATCTGCCAGATTAGAAGTTTTAGT
TTATCTTTCTATAGAAAATTAAGAGCTTCAGTTCATAGAAGGTCCCAATC
ATGATTGAAAATTCAAATTTTGAAGAAATTAGAATTTCAATTCTTATTGG
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GCATGCATCATTTTTACTACTCCAGTAGTGGATTTATTGAGTACACCTCA
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GCAGATCTTACCATCATGTAGTAGTCAGCGTTCTCCCTGAACAGCACATC
TGTTCATTTGTTAAGAAGATCGCTGTCTGGGCTCATCTGGTCTTGTTCTT
CAGGTCCTATACGCCAGGTCTTCGCAGGGCCGCTGGTCCCTAATCCACGG
GAAGAAAGCTACCACCGAACCTACACTCCCGCACCGCACCGTAGGCCGTC
AGACTCAAGACCGTACGGCTTTCTTGTTCCTTGGTATGCGGGTTCATGAA
CAAAGCCTTCGATTCTGTTGTCTCGCATGATTTCCAACAGTTGCCCGGTC
TGTATGATTCTGTGTGGTGTGGTGTTCAGATGAGGAAAGGGACTGTTGTC
TGCGCCTTGCTAATTCCCCTGCAATAATGGACGGGTCTTCGTTGTACTAC
TACTCTACACACCTGAGAATGCACGGAAGGCTGGTATTCTTGCACCATAC
TCCTCAGAAACCCCACTATTAATTATGCCCTTGGCGCATTCGAACAATAA
TCATGCCCTTGAGCTCAATTATTACATGTTTCTTGATGGCACTAATGTTT
TGCCGCTCAATTATTACATGTTTCTTGTGTAGCACTTGCAAACAAAATCT
AGATAAGCCACCAATGTTAGATAAGCCACCAATGTCGATTTCGATGCGTG
CCCGTTCTGAAAACTTTCTCTAGTCCTTTGCTTCCACCAAATACTACCAA
GCTCCTTCCTGTAAAAGCTTGTTATCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.