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GrainGenes Sequence Report: AA042000

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Sequence
AA042000
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042000
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGACTGGGTGGGTGGGTGGATGCTGTCCGTGAGGAGACGGCAGGAGGATG
CGGGCGGCCCCCTGGGCGGCATGTACGACGACGCCGAGCTGGAGGAGGGG
GAGGCCTGCGGCGACGACACCGCCTTCGTCGACCCCGACGTCGCCCTCTC
TTACATTGTGAGTGCTGGCCGTGCTCGCCCCCGGCTGCTCGCCTCCTTCC
ACTGCACTTCCACATGCTTGTTTTGGTAGATGACTTAGATGTGACTTAGA
TGTAGCATAGCAATTTAGTGCAACCAGTCGCTTGATTGGCCCCCATTCGA
GTCAGCAACGGACGGGAATGCCTCGTTTGCCTGATTCTCCGGCTCTGCAG
GAGTGACTGATTGCCACTCCCGTCGGTGGATCATTTAAACTCTGCACAGT
TTGCGGTTTTAGTTCCATTGGTACGCGAAGCGCATCCGCATTAGTTGGTC
ATTTAAAGTTTACGCAGTTTGTCACTTTGTCGACGGTGATTAATTTTTCT
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GATAGCTTTGTCTAGGTGACGGTTTTACTCTGCTAGTTCACATGGTACCG
GAAGCAGTCGCATTTGGTGGATCATTTAAAGTTTACGCAGTTTGCTGCTT
TGTTGATGATGATGATGATAAGTTTGTCTAGGTAACGGTTTTACTGTGCT
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GTGCAGTTTACCGCTTTGTTGATGATGATGATAAGTTTGTCTAGGTAATG
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TGTCTAGATAACGGTTTTACTGTGCTAGTTCACATGGTACCGGAAGCAGT
CGCATTTGGTAGATCATTTAAAGTTTGTGCAGTTTGCCGCTTTGTTGTTA
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GAAGTACTAATTTGGTTTTGGCCAGTCTCTGTTTGAGATCACCACCGTAC
CTTCATTACGACCCTTGAACATAAATTATCAAAACATGTATTTATTCTGA
GCTTAAGGTCAACAGTTGCTTCCACTTCATATACTCCAATGTTGAACTTC
AAACTTTCAATATGTGCTGTAAAAGATTTGATTGGAAATGAAAAATGGTT
CAAGTCACTGGCTTTTGATTTACTTCAAAAAGGGCTTGTTTGGAATTGTC
AAAGGGATCACTATAGCTTTACTCTCATGTAGCTCATTGTTTGTACGAAA
AACCGGCAACGTGTGTGCGAATAGTGACCAGCAATTTTAATACAATGAAA
AGTCACTAGCAACTTTAGTTTGAAGGTGATATACTGTACCCACAATCATA
TTTGTCGTGGTCACTATTTTTCTTTTGTGTGTTTCTGGTGTGTTTTGTTT
AGGATGATAAAATCAAAGATGTATTAGGCCATTTCCAGAAGGACTTTGAA
GGAGGCGTGTCTGCAGAGAATCTAGGTGAGATGTTGAGCTGTTGCTGCAG
TCAGCGTGATCTGCCTTCATTCATTAAACATTACGCTAATCTTTGACAGG
ATCAAAATTTGGTGGATATGGTTCATTTTTGCCTACACACCAGCGTTCCC
CTCTCCTCCCCCCAACTAGAAGTCCACCTAAGGCGGCAAACCTTGGTCCA
AGATCTCCTTATCACCAGTCTATCGAGGTGCTTACCTTAGCTAGCTCTGG
CTGTAATGTTCTGGAATACTATCGTATGAACATAAATTCATATGGCATTG
ATGGTAATTTATAATGTAGGCTGCGCCTCAGAACCCAACGGCTGTGGCGG
TTCCATCTGTTTCTCAGAACAATGGTTCTGTGGCACCTTCTTCGGGTGAT
TCAATTAAAAAAGAAAGATGTGAAAGCGCAACAGCTAAAAGGAGCACTAG
CACTCAGGATCCTTCATATGGTTCATCTAAGTCTAGTGAACAGAACAGAT
TTAAAGTCAGGATAAAAGTTGGTTCTGACAATGTCTTGGCGAGAAATAAT
GCAGCTATTTACAGTGGTTTGGGCCTTGATATTTCTTCACCTTCATCTGT
GGAGGATAGCCCTGATGGCTACAGGGGCCTCTCTCCGGAATTCGACAATG
TGCAACTTGAATCCCCCCGAACCATTCTTCAGGTAAAGTACTGCATGATA
ACTGTGTTACCCTTTTTTATTTATATTTCAGTATGAACGGTTCAACGGGT
GAATAAACACTTTCATTGTTTAAACACATCCGCACAGATCATGACATGCT
TTTCAGTTCCTGGAGGCTTCTTACTATCCCCACTGCAAGGCAGTATTTTG
CAACTGACAAAAAGGGTTGTGCCTTCATCAAAGAAATGGGAAACAAGCGT
GGACATAGAAAATGCACAGGAAGCATGTGAAGGGCATGTGGTTAAGAAAA
TGAAGCCTGACGGTAAGAAAAAGAAAGCCATAGAGACGAAGAGATCAAAT
AACACAAGTGATGGAAGTGCAGTTAAGAAAAAGGAGATCGATATAGAACT
ACTTACTGGTCAAAAGATCATATCAGAAGCTCTCAACATACCGTTGCTGT
CTAGTTCCAGAGGCATGGAGACAAAGGGCGAGAGTCAATTTGAAGAGGAG
ACATCAGGAAAACCTTTGGAAGGAAATAATGATTCCCGATCGAAAGAATG
GGCTATAAACAGCAACGGCAAGACAATCAAAGCTGAAACTGTCAAAGCAG
AGAGAACGGAATGTTTAGAAAGTGGTGGTTTTGGCAACTCAGAAATGGAA
ATTTCAGCAGTAAAAAGGGAACTGAAACCCATGACAGAAAAGATAGCGTC
AACTTTAGAAGAGATGAATACAACTAATGACACAGATTTGCCGTTGGATA
GGAAGCAGGAAAGAAGAGTAAAACCTGAGAGTAAAAGCAATGGTACTGGA
GTTAACTTTGAAGATAACACGGTTGTAGATGAAAGAGCTCCTGCTGTTTG
CAGGAGCATGGAAAAGGTTCCTAGCAAAGAAACTTCACTTTATGATACAA
ATTCGAAAAATAACACCAAGAGTGAGGCCAAAAGAATCCATAGGGAGCAA
AAGAAGAATGCTCCAACATCTTCTGATCTCCTGGATGCTGACAATGGTGT
TCGTTCTTCTGCTGCAGTTAAAGAGAGGAAACATGATTCTCAGTCCAAAT
CTAGCCACTCTGGAAAGAAACCCAAAGCAAAATCACATAGAGATGTCAGG
GACAGTTTGCCTGAAGGATCTTATGGATGCAAGGAGGAAGATATAGTGGA
GAATGGAGGTGGATTGGGGGAGTTACTGCCAAAGGAGAAGTCAATGAGCA
AAAGGGATTTTGATATGCCTGGGGCATCAAAGAGGGAGATTTCGTCTAGT
GCAAGGCATGATAGACATACAGCTTCTGAGGAGCAGAAGATGCATGTACC
TCCAGCTTCTGTCTCAACTGCAAATGCAGTTCCTGCACTTCAAGTTCCCG
TTGTGATAAAGGAACATTGGGTTCAATGTGACATATGCCAGAAATGGCGT
CTCTTACCATATGAAACGGATACTACTACCCTTCCAAAGGAGTGGAAGTG
TAGCATGCAACTTTGGCTGTAAGTTCAAGTTCATATACAACTGTTTATAC
TTCCTGCTCTCTTTTACTGCTTCTATTCTTCTCTCAACAAGTTTATCACT
AGGTAGCATGTAACCAGCGCGCTTTATTATCAGGAGTTTGTATGATTGGC
TGCTTTTAAACTACTATACTTGTATTACAAGCGGACACATTTTCCTGTTC
AAGCTGAACACAGGAAATAAATGATTGGAATTTGGATAGATCTTTTTGTG
GGTTTCTGCCTTATTATATTACATTCTCAATTAAACTGTTAGGTTGCAGT
TTATACTATTTTCACATTGAAGCGGTATCTTTTAGCACTGTAATGTTTCT
CCATGTTTATAAGTTCATGAACACTTTCTTCTTTTCTGAAGAGATAGAAT
TTGGAAATTTTGCAGACCTGGGATGAATAGGTGCGATGTTGGTGAGGATG
AGACTACGAATGCTCTCAATGCACTATACGTCATACCAGCCCCTGCCAAC
GGCATTCCTCCAGTTGGTCATCCTCACGTTGCTTCTTCAGGACTAACAAC
AGCCAGTTCGTTCAGTGTAAATGGACATGCTGAACTGAGTAGGAAAAGGA
AAAGTCTTCCAGGTGATAGAAGTAGTGTGATTGAAGGTTGTCACTCATCA
CAAGCTTCAGCTTATCCATTGAGCAACCAACATGCTCCTACTAGAATTAA
AAGTACTGCTGATAGTAACCAGTATCCCACTGAGAGAAATTCTGTGAGCA
AATCAGTTGACCCTTTTACTGAAAAGAAGAAGTCCAAGAGTAAGAGCCGT
GGCAGCTATTCTGATGGAGGTTCTGTTACTGTTCCCCCTTCTATTATTTC
AGTTATATTTGATACACTATCTTCCTGCTTGCTTTTACTATGCCTTGTAT
TTACATTTATTTGGCGACAATACAGGAGATCTTGTGGAAAGACCCAAGAA
GCATTCAAAAGGAAAAAGTAAGAGAGAGATGGATCATGGTGAATATAAAG
CTTCTAAGAAAATTAAAAAGGAGGATCGGCATCGTTCTAGCAGAGATCGG
AATGGTAAATATGATTTAGCTAGTGGAGACATTGCTGATGAGGCCGAGGC
TTTGCTTTTAAAGGAAACAACCTTAAACAATTTGGGTGAAAAGAGTGATG
TTCCTTCATTAAAGCAAAAAACTGCTCCGAGGTATGATCACTTGGAGAAG
TCCAAGAGAAACAAGGAAGATGATGTAGTTCTTTCTGAAGACAGGAACAA
GGAAATATTTCACACCTCAGATGCACAAAGATCAGACATTTCTAGCAAGA
AGAGGATAGTGAAGGAATGGGAGGAGAGTCAGCACAACTCAATAGCTCAT
GTGAGCAATGGAATCACAGCGAACCACAGTTCTGCTGCCAAGGAAACCTA
TAAGGATCAGAACTTGAAGGAAACAAAGTCAAAATTAAAGAAGTCCGAAG
AATTGTATTCAACCACGGATTCTAGATCAGTAAAAGGTCAGATTTTATCT
CATAATGGAGGGCATGTTAACAATGAACTCGTCGAGGATAGCACAGATTT
TGCGGGTAAAAGAGCTCCGTCCGACTTATTAGTAAAGCGATCTTCTGAAC
AGGCTTTAGACTTGGTCGGACCTGCTTCTAGTGACATGGCCCACATTCAG
ACTACAGCCGTGACTTCAAGTTCTTCAAAAGCTTCAGACTCACAGAAGAA
GAAACAGAACTCCCATGTTGTGAAGACTTCGCCAATTGAGTCAGTTTCCT
CATCACCAGTGAGAAACTCTAACATTGATAAGCTCCCCCATAACAGAATA
TTGGAGAAAGATGGACCTATCAATGCTAACTCTAGCACCATGCTGAGTTC
AGTAAAGTATCTGAATAATGAAGCTGGTTTAGTGGACAATATTCGGCAGG
TTAAGAAGTCCAAGGATAGTCTGCTTGCAGGTGAAACTGTCTTGCATGGT
TCTTTGCAAGGAATTTCTGAAAAAGATGATGATCTGGTTCAGTTAACTCG
AGGTCACGCACCCGAAAAGATTTCTGTGAGAAAGGGCTTGGATGATGATC
CACATCATGCATCTGGGAGAAAGGATTTTGTGAATGGCTCCAGTGCATCT
AGGGGTCATAACCACTTGCATTCTGGTGATAAAAATAGCTTGCGCACTGA
TGGCTCTTCGGTGCAACCTAGGGCTGCACTCCTGGACGCTAAAGGAGATA
CAGTTGTGAATGGTAATAAGAAAAGTGCAGCTTCCATCCAAGACAGAAAT
GGATCAACTCATTGCCCTCCGGATGGGAATTTCCAACCAGAGTTGCCACC
CGGAAAAGATAAATCATATCCCAAGAGTAATAGGCAAGATACAGAGAAGC
CCAAAGCCCAAATGGTTCCTTCACCTTTGAAAGAAACCCACTCCACTCCA
GTAAAATCTAATGCGTCAAAATTAACACCACAGTCAAGGAGATGCAATGA
TGAAAATGGAGGGCAAAAAGGTGTTTCAAAACAGGGTACTTCAAATCCCG
CAGACACTTCCAGTCCAGCTAGGAAAGATGGTAATTCAACTGCATATGCT
CTCAAAGAAGCTCGGGATTTAAAGCACAAGGCTAACCGTTTAAAGGTTGT
TCACCGTTGTTTTTCTCGTACGAATATGCTACCTTTTGTCGTGTAAGGCC
CTTACAAACTTTCTCTGCAGAAAGAAGGAAAAGATCTTGAAAGCACAAGG
CTTTACTTTGAGGCAGCCTTAAAATTTCTGCATGTCGCATCACTTCTGGA
ACCTCCTAGTATTGATGGTGGGAAACAAGGCGATGCAGCTCAGAGCATGT
ATTCTGATACTGCAAAACTCTGCAAGTAAGCCATTACAAAAGTATATGAT
ATATTGTTCTAATTGCCAAGCTAGTTCATTTTTGTGAACAAACTCCCTAG
TTATAAATTGGGAATTAGTGCCTGGAAGTGCTTGTTCTGCATGACCTGAC
TTTAATGGGCACTATTATCGCTTGGGTAGTCTGATAGTTTTCACAATACA
GTTAAATAGCCTGACGGTGGTTGCAGTACAGTTATATTTATATTACAAAG
CTGATGCAATATTACTAAATTTTGGCAGCTGGATATAGGAAAAAAAATGC
TCCAATAACAGTATAATTCTCCATGCTGTCAAAATTATAATCCGAAGCCG
TTGCTTTGTGTAACAGTACTCACGTTTTTAGGTGAAGAGTGGTCAAATTT
GGTCACTGTACTTAATTGTATTTTTTTTGCCCAGCTTTGTTGCTCACGAA
TATGAAAGGTGCAAGAAGATGGCTGCTGCTGCTTTAGCATATAAATGTGT
CGAAGTAGCTTATCTCAAGGCTGCATACTACAAGTACCCTATTGCAAGCA
AGGATCGACAGGTGTTGCAGGCAGTTGTACAGACTACACCAGGTAGTTGA
TCTAATTAGTGAAATTTAAGTTTATGTATATTGTGAAATGCAACTCACAG
TGTAGGTTTCAAAAGACATTTAACTGGATTAATGCAAAAATTAGACTAGC
ATGCCTTGCCAAACAAATCTGAGTATCATCTGTGAAAAAATAAAACCAGA
GTATCGTATTTTCTTGGTGTATCCTGCTATCATATCATGACTCTTTCTTC
TCTGGATGTTTTTATTTGTTCGACTCAATATTGTTACTTTTGTAGGTGAA
TCACCATCGTCTTCTGCCTCAGACATTGATAACCTAAATAACAATGGATT
ATCTAAGAAGGCCCCTTCAAACAAGGATGCTAATTCACCTCAAGTTGCTG
GGAATCATTTGTTACTGGCTGTTCGCAATCAACCACACTTGACAAGGTTA
CTAGCTTATGTAAGTTCTTGAATAATCCTGACTAGCACTTCAATAAAGTT
CCCCTTTATAGTGATGTTTTAATGGTTTATGACAATTTCATAATATGTCA
ACAATGTAGTAGGAGTAATTAAAAAACCCTCATAGTATGTTATGCCTAAT
CAGCTGTTCTTTATGGTCATTGTGCGTCTAGGCCTTGATGTCTTCTTAAG
TATACGACACCCAATAGGATAATGATCAATGCAATGGAACATATACGGTG
TATTCTACCACTAATTGACTAACTTATAGTGCGTCCTACAACCATGTTTA
TGTTAGAAAGTCGTTAACTAGTGATTTTGTTGCACTCCTGCTAATTATGA
ATTGTTAGTTCTTTTTTCTGGTTGCGGTTAGAGCAGCCAATAATGCTATG
CTGGTTTCATATAGAAATCTGAAATTAGTGCTTTTGAACAAAAACGGCAC
CATTTTTGTCTTTTTTGTTTACCAGAGTACAGAAATTGGTCAGAAATTTT
CGGAGTTGAATTTATTTTGGAGGGAAATGGTAACATTGTGTGTGATAGTT
GCTCTTGCTGCATGGCAGTAGCAGTGGGGATAGTTGTGAGCCTCGTGAGC
ATTGAGTGGATATATATGAATTGAAATCGATGTGAACTTCCAGTATCAGA
TATACCTCCAGTCGAGTTGTATGAAGCAAATTTCTTAAAAGTGGTTAGTA
CTTAGTAGTCTAGAGTTTTGAGCATTGCAACATATAGTTTTGGGAATAAC
TTCCATAAAACAGCAAACTGGATAGATCTTGGCAATCATAAGCAACTGGC
TCGCTTTGTGGTGAACTGTCAACTATGTCCTGGGAAGAACGTGTTGTCTT
GAGCAATGGCCTTATTTCAGGATAAGCTGCACCCACATTGGATGGGATCA
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TTGTGTGGCAATGAACGAACTCAATATGTTACTCAAACAGTCATACCAGA
TTAGAATGTTAAAATGGAATTAGAATCAGATGAGCCTAATCCATTCATGA
AACCAAACACCTGTTGAAATAAGACAACACTACTTTCAAGGCATGCATTA
TGGTTCATTGGTTCTTTAATGAGTCTGGATCTGATGTTATGTTGTTATTT
TGTTAGACGAACGATGTCAATTGTGCCTTCGAGGCAACTCGGAAATCACA
GATGGCAATTGCTTCTGCTGCTGGCAACCATGAAAAGGGAGTAGATGGTG
TTTCTTCAGTGAGAACAGTTCTGGATTTTAACTTCAGAAGTGTGAATGAT
CTACTCAGACTTGTGCGTCTTTCAATGGAGTCTATCAGCTGCTGACATGT
TCAGAATTGAAGAAGATGACATGATGGCAGTATTTAGTGGAGAAGTTCAA
TAGTGCAGAATCCTTAGGTCTTTTCTTTTAGGCATGCTGGTTAATTTGTA
CAGGAAGTGGTTTTGCGATTGTTCTTATTTTTGTTTCCTTAGTGGCATCC
CACTATTATGCATAGTCTCTGGCAGCCTAGCATCTACTTGGATGATCTGA
ACAGTCTAGCAAATGAGGCAGCTGAAGATGAGCTTCGTTGCACTACAGTT
GCAATCCTTTGGACACTCGAGGCATGTAACTCTCAGATTGCGGTTGATAG
GCAATGCAAAATATTACCTGGAAAATGGCTCCTTCTCAAGCACTCTCCTT
GCCTACATGCTGTAAATCATGTGGTCTGTCACTGAGCTGACTTATGGTTG
AAGAGTATGTTAATTCTTCTTTGTACTGTACAAGATGATGTGTTCCCTGC
TTAACAGTTTTGACGGTATGTTCAGTTTTATCACAAATTCGACAACCTAT
TGGCATTCCATAATGTTCACATAATCTTCATTCTTGAGCAGGGGAGAGGT
CAACAGTGTCAATTAAGACTGCAAACCAAGAAAACAGCTAGTGGTGTTTC
TTTTTCTGTATTTTTATGATGGCATGTATCCTGGAGAAAGTTCAAGCAGG
TATGTTTACTAGTATTTAGTTCATTAATTGTTATGTTGACATCCATGTTT
GCTTGCACCTCAAGAAAGTTCAAATGATCGTCTTCTTGAATGAATGTCTC
TTGGTATTTTATAGTGGTGAAAAATGATTATCAGAGCATTCATTAACAGA
ACTAACTTGTCATGATATATAAGGATCCCATTTTTAATTAAACAATTTGA
AGTCCCCATTGTTACTGAGATAGTATTATAACAATGTGTTCTCCTTAGAA
TTATACCAACCAATCCTGTAATTTTGCAAGAGTGGTACGGGCTTTCAGTC
AATCTCCTGTTTGGTATTTTGGGGTTTGTTGTGCATCTTTTTTTTTTGTA
ATTCAGGGATATCATAATCATAAAAAATCGGTACTTAATATTGTCAATTA
CACATTGTTGTTTCGAAGCTTCCTTTACCATGTAACTTGTTTACTACGGC
ATAAGTCTGATACAAGCTAGAACTGGTTTACCACGATTTGTCTATTTAGA
AAGATCCATGGTCATGTGTATATCTTATTGTAGACTTTCAAGGTTCTAAA
ACTATACCTCACCTTGCCACTGCCCCTGTTTGATCACATGGACTAATAAG
CTGAAATAAAAAAGCACACTGCTTGTTTCTTAGTTCTACTTTCACCTGAC
ACAGTGATGGTGCCTTTTCTTTCCAGGTTTCAAAGAAGTAACCACTTGGA
CCATCACCTGTGTATGAACATTGTACAAATATTTTTCATGTGCAATAGCC
TAACCCGTTTTTTCATTATCAATACCACAGACTGTCAGCAGCACATGTAC
ATGTATAACCCTATAAAGGCTCGGACTCTGGTCAAGTTTTAGTCCTCGTT
ACTCATCTTGCAAAGCTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.