Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA011082

[Submit comment/correction]

Sequence
AA011082
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA011082
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAAATTGTACACGCACCGCCCCTCCCCTTCTCCCCATCCCTTCCGCCG
GTCGCACTCGTGCTGCTGCTCCCCGCATCCTGCTATCTCCCGTCTCCCGT
CTCCGCCGCGACGCCTCGACGCGGGTGGATCCGCGCGCGAGGCCTCGCCG
CCGTCACTCCCTCAGGTTCGTCTATCCCTCTCTAGAGCCTGATGCTAGTA
TAACCTTCTCTATCCCCCGCCCCTCGTGCGTAGGACGACGAGTGCTAGCT
TGCTTCTGGATCCGTGGCATTCGGTCTCGCGGTCCGCTGTAGGTTTCATT
GTGGGTGGTGTGGTCTTCGGATTCCACTCGCCTTGGGTTTAGATTCGATT
TTGGCGGTGGCGCTTTTTGTAGATTGCAAGTGGCGCTGATTAGGTGTTGG
GACGAACCTGCGTGAATTGGGGCCTGGGGAATAGGATAGTGTACGACGGT
GCTAGGATATACTTTCGATTGCTTTGATTCGCAGTAAGTAGGTTTTCTTA
GCTGTTTTGGGGCGGCAACTGTGATGTGTAGCTTTGAGCTTGACTTCAGC
TCGAGCGTAGCACATGAGCTTGGGCAAGCTAGGTATGCATTGTCCTGTTC
CCGTTGCCGTCACAGTTCTTCTATTCTGGACCTTTTGTCGGTCAGAGCAT
CATACTCCCACTGTTGTCTTCTGCCCCGAAGCACATAGCTAGAAAACATG
TGTGAGAATAACTTGCCAACGTTTCTGCTGTCAATGTATAATCTAACTGT
TCACCAGCATTTTGTTGTCTGTTTTTGCATTACTGTAACGATGAGTATAG
CAGAGTTAGGTTCAGAGTTTAAGACACGATTCAATACAGTGCTCCTATAG
GGCTAGCTTCAACTTTCCGATAATTGTGCAGAAATATTTTCAACTTGTGC
AAGGAGATAAGATTGATAACAAACAAACTAGAAAAATCATTTGATGCTCC
TATTTTTACTAAGATTTTAATCCTTATCTATTTCAAATGTTGCATTGCTG
TATCTTATCGTTGAAATATGCCACATCTAGACAAATATGCACACGCTTCT
TATTCTCTAAAAATGTCTTTGTTTTAAAATGTTTTTTACTTCTCTAAAAA
CCCTTATAGCCTTATCAAACTTGGAACATATATTTGGAATTTAATATAAG
AATATATTTTATATTGTTTCCTTTGTATTTCCTGATTATTATGGCATTAT
ATATCTTGTATGTTGTCAATTAGGATAATTTTTAGGTTAGTAAACAAGCA
TGAAGCATACATGCAAATATTTTCAGTTACAATTAACCCTACTCAAAATG
GATTCTTGTGGAAGATGGAACTGGGCCAACTGGCAGTGAACTAATCAATA
TAGAAAGCATTTTCCTCACTGTTCTTTATGCAGCTCAATCAGTTGAAACA
TAGGATAACCATAGTGATTTGAGATTGCATATGCCTTGACAAAATTGTGA
CCTGATAGAATATTGGCATGGCTTCATTTCTAATAACATACATAGTTTGG
GTAATCTGTCTAATGATGATCAGAGGGAAGGAAGACGAGCGTTTCAACAT
GATGTGTTGTGATTGTACAGGCAGGCCCCACCATTGGAAGTTCAGAATAA
TGTGGAAATTCTTAGGTCCTTTCCATTTTTCTTGTTTGATACTGTGAAAT
TTACCACCTCTATGATTAATATGAGTCCTCCAATCACATCTAACCTTGTC
AAATACAAGAACCAAACCCTTGATTGAAGAGGCCTGCATGCTAGCCTGTT
GAGGTTCCCTAGAAAAGTTTCCTTGTTTTGTTCCCGGAAATCTATTTTAG
GAAATAGAAGGCCACCAGAAGCCCACATCTAATGCTAAACCAAAATATTG
ATATTGTTTCAAGGTTTTTGGCTTGCCAAGTTGAGTCGAGACGTCATGCA
ACCATCTAGGGATTAGCCAGGACTATTCCGGCAACTAGTTATGACTAATC
GTGCCCAGTCACACTCAGGGAAGATTTATGGAGAGGGTGAGAGGATATTA
AGGGCAGAGTCGCAGTTTTGAAAGAGCTTGAATAAGAAGTCAATGTGACG
TGAAGCTCCTGGGAAAGGTCCGGGTGGCTGAAGCGGGGCGACACTAGACT
AGAAGGGCCGAGTTGCTTCAGTGGAGGAGGACGGAAAGTCTAAGTTGGTA
ATGGCAGGGGCATATCTGGCCCATGAAGGCCCATTTGAAAACCCTAGCTT
TTTAGATATATCCAGACCGTCCATACTTATCCAAGCCATCCATACCATCC
ATCAAGATGGTAACTGATAAGTAGCATGATGCGAGGACTTTTGTGCTTTA
CATAGCAGCCGCCTGGGAAGCTTCCTTCCCCCTTCCCACACCTTCTCTCT
CCTACCACACACCAGCTGCAGGGTAGATCTATGGCTGGTGGCGTCAAGAA
GATTGATTCCTCACGGAAGACCTTGTCGGCCGCCTAAAACAGCACACGGG
ACCTAAATCTCCCCCCAAAATTTTCCTGCCAGTGGATCGTACCAAAACGA
GCTGCGACGGCTGGGTGTTTCTAGTCGCTGTCTAGTCAGAGCAAGCCGTC
TGCTGGCCGGCATGTCGCAGGACTTGCTCTGCTAGTCGGGTCTCTGCTCT
GGCTCAGTGATTATCCGGTGACTAATTGGTGATTAATCAGCGACTCAAAC
CCTTGTTGATTTAGTAACTACTCGTTGTTTTCATGACTAGATTTATTATA
AAGGCTCATAGATATAAATATGGGGACCATCTGAAGCAGGGAACACCAAA
AAGTATAAGTTTGTGCTCTTCTGGACTGTTAGTCATGGCCTTCTTTTTGT
TCAGTATTGGTGGTCTGTTCCTTCCATTCAGTTTTTTGTCTAAATATCTT
TTGTAATTTTGTAGAACTTTATGTTTCCATTTGGATCTTAGCTAGTAGTT
TTCTTGTAGGTGTAAACTTGGAAGTAAATCATGATTTATCTTGTATATCA
ACCTGCCTACTTTTTTGCTTGTCAGTTCAGGTCTTAGAATGCCAGTCCTA
TGTTCTAAATATACCAAGCTGGTCCTGGAAGTTACACACACCTTCATTTG
TTTTTTAGATTGGTTCTCATGTTTTCCCTACCCTCTTGTGCCATCTTGCT
GACTTGCTCACAGTATTTTCTAAAGTTTTGCTATTTGATAGTTTGTCATG
CATGACTTCCTTTTCAGAATGTAACATATATAGAATTCTAATGTCTTCTA
ACTAGTTAGTGTTTTAATCTAGCAATTCAACTTTTGGTCCTGCCTTGCGT
GTAGCCATGCATTTCTTTCCATTTTTTTTCTATAAGTATCCTGCATTTGT
GGAAGGACCTGGGGTATAAATTACTTACACATATATATTATCTCTTCTTG
GACTCCAGATTGGATTCATTATCACTCAGTTGGTGGAATACTGGAATAGT
ATTTTGACTTCCTCTTGCATTGCCGCTCTTTCGGCATCATCACAATGTCA
GGATCACTGAATGTATGCTTTTATCCTTCTTTACTTAATATATGGTTATG
CATTTTCTCCTTTGCGTTCAGTAAATATGGCAACTTATTTAACTTGTCCT
TTTTAGTCATGGTATTGTTCTTATGTTATTTTACTCCCTGCCTAGTTCCT
CTACCTCAAAGCATGGGCAGACTGACTTTTTGTTGTGATCAAGGTTCATT
GTCCACTTCTATGTACTGATGACAATGGCTAGCTATGTTTTTGAAAAGGT
CTTTGGTTTATTGTTATAACTTTTTTCAGTCGAATATGAGTGGGGATTCA
ACAGGAAGGCCATTCACATCAACCTTTTCTGGTCAGTCTGGATCATTTCC
TGGTTTCCATCATTCTGGTTAGTAAATCTTACAGATTGGTTAGTCCAATA
ATTCATTTTGCAGAGTACTGTTTTTTCTCATAAAGCTAACTTATTTGAAC
TTCTTGGAAGGCTTGCATAATATCCATGGAAATCTCAATCTTGCATCACT
AGCACCAAGGAATGCTTCATTGTCCGGTATTCCATCCCCAGGTGTTCAAC
AACCTGGCGGTAGTATTTCTGGTAACCGGTTTCCCTCAAATAACCTTCCA
GCGTCCATGTCTCAGGTTTGTTCTTCTTTCAAAGTCCACACTGTTTCTAT
CCATTCTGAGTGATCAATCATTGACTTATTTGTTTGCCCCTTTTGTAGAT
TCCTCATGGGCATTCTGGGATCAGCAACAGAGGAGGTATGAATGTTGGGG
GGAATCCTGTATTCAGTAGTAGCATGAATGCTATTGGTGGTTCAGGACAA
GGTTTATCCTCAAGCTTGGCTAATGTTGGTAACCGAAATTCTGCTCCTGG
GTTGACAGCTTCTTCAGTTTTGGGGAATTTAGGCCCACGGATAACAAATT
CTGTGGGCAATATAGTGGGTGGCAGCAGTATTGGCAGAAGCATAAGCTCC
GCAGGACTGTCTATGCCTGGTATTACATCCCGTATCAGTTCAAGTGGCAA
CTCTGGAAGTGGGGCTCTTAATATCCCAGGATCCAACCGAATGAGTAGTA
TGCATCAAGGTACATGGTTAAGTGAATCTTTATTTGTTCTTTTGCACTTC
TCATGCTTCTTTGGTGAACAGCTATCTTCAATTTATCTTTCTTGCTGGCT
GAATAGTGGAGTGGTGTGGGTGTACTGTATGTCTTGTCTTTGGCCGTGGT
CCTGCCTTGAGTGGTTGGATGTTTCAGTCTAGTCATAGGCCTGTAATTGT
TTTCTTTCTAGCAATGCATGGAGCTGCAAGCTTTGCATGTTCTTGACAAA
AATATGGAAGTAGTTTGTAAGGGTGGTTAAAAGGGTGGAAATAGGAAAAT
GTGTAACTCTTTAAAGTTCTATGGATTGAACTTCAACGTGGCTCGATTTG
ATTGGAAATTGACATGGGGAACTGAAAACTTCACACATTGTATTATAAAG
CAGTGGCACTACCTTTAGGGCTGTCTGCCTCGGTTGCCCACACATGAAAA
TTGGAAGCAACTAAACTGTATATAGAATTACTGGGTTTATGAATAGCTTG
GAATTTCTTCTTTCTTTTTGTAAGGGCTGTGGGTGAAAAATGACCTAGTG
GATTTCTATTGTTCTAATTCTTTTTGAGTCTTTTTTTCCTTAACCAGCAT
CACCACAGTTCATGAACATTCTTGGGAGCTCTTATCCAACACCTGGAGGG
ATGCTATCTCAGAACCAAGTGCAGGCGGGAAACACTTCTTTTGGTTCTTC
AGGAATGCTACATGATGGAAACCCCGGTGAAAATTCTCCGTTTGATATAA
ATGATTTCCCCCAGTTAACCGGCCGTCCTAATTCTGCTGGAGGTGGTCAA
GGGCAATATGGTAATGCTAAAACACAAACAAAATCTTCAATCCTCAGTGC
TTAGATAATGTTAGTTTAACTAACTTTTCTTAATTTGTAATTTGAAGGGT
CACTGCGAAAGCAAGGAGTGAGTGTAAATGCCATTGTGCAACAAAACCAG
GAGTTCAGCATTCAGAATGAAGATTTTCCAGCTTTACCAGGATATAAAGG
TGTGTCTCGGCCATTGCTAGTCTCATTATGCATGCAGTGGACAACTCTAT
AAATCTTGATGAGATCAACCATCTGTTTCTTGTTAGTTTTTAGCTTTTTC
CCTTGCATTTTTCCTTGTTGATTTTTTTATCTGGACAAGATAAGTTCATG
TTTTATCACTCCTTCACTGTTTTCTTTTCTATTGACCACATATCATGGTT
CTAATCCTTCCTCAATTTTTCATCTGGCATATGTTTATCCTTTTCTTGCA
AGTTGGGATATTTAACTTTAAGATTTATAACCAACTCATGTGTTACAATT
TGATCTGTCGAAATTATTCGGCTAAATTCTGAGCATGGGAGTTATTCCTA
CGATGTTTCTTTCTGCTGATTATTTCTGGGCAACCTCCTTTCTTTCCTTT
CTCGATATTACATTATGATATGTTTCTTTGGGATATAAGGTAGTTCGTCA
GATTACGGTATGGATTTGCATCACAAGGACCAGCTTCATGAGAATGCAAA
TATTATGCAAGGACAACATTATCCCGTGAGTTCATATTGTTTTATCATTT
CATCCCAGATTAGCTATACCTTCTTACTCTTAAATTTCTACATATGATTC
TGCAGATGGGTAGATCATCTGGCTTTAATTTGGGGGGTAGCTATCCACCC
CGCCAACAACATCAGCAGAGCACTACTCAGGTAAGCATTCTAGCAATCTT
TGTTGCATCAACACCAAATATTTGAGGCTGAGCACACCAGTCTTATAATT
AGTATAAACACCTCATAATTTTAACCTCTTTTATGTGCAGCTGTATATGT
AGAACCTGTTATTGAAATTTTAATATTTAGTATCTGCTAAACCTTTTGAA
TCTAGATTGTTAACTACTCTCTCTTGTTGTGCTAATTAGGCTCAAAACGG
CCTTGATAGTATCGGGCTAAGGCCGATAAATTCTCCAAATCCGTCTTCTA
ATTCAGGGTCTTATGAGCAACTTATCCAACAATACCATCAACCACAGACT
CAGAATTCACTTAGGTCGCAGACGTCTTCGGGCCCACAGTCATATAAGGA
TCAGAGTCTAAAGTCTGTTCAGGGAACACAGACTGCTCCAGACCCATATA
GTTTACTTGCATTGTTGCATCTAATAAGAGCGAAAGAGCCTGGACCAACA
TCTCTTGCCTTAGGGCTTGATTTGACATCCCTAGGGTTGAATTTGAACTC
TCAAGATAGTCTTTACAAGACGTTTGGGTCTCCATGGTCAAATGAGCCAG
CTAAAGGAGAACCTGATTTTCAGATTCCTGCTTGTTACTCTGCCGAGCAA
CCTCCAGCACTGCAAGTAAGCTGTTTCCTATTTGGTTTGCAGTAGCCTCT
TGAACTCTGACGTTTCAATTTTTTTCTCCATTTTCTCCATCTGCAGCCAT
TCATTTTTCCAAAGTTTCAAACCATGACACTATTCTACATCTTCTACAGG
TATATTTAATATAATGAACTGTGTGTTTGGTTTTACTAGCCTATGCATTA
TTTCACTTTGCTCTTTTGTGCAGTATGCCGAAGGATGTTGCTCAGTTGTA
TGCTGCGAATGAATTGTAAGTACAAACATGTAGCGTTTGTGGTATCTCAG
CAGAATATACTATTTTAGCGACCTGCATTCGGTGCTGTTCACACACACAC
ACACCCTATACGATTGTTATCTGTTTTCATGTGTATGCTCTTCTATTTAT
AGTCTAATATTAACAGTCTTATATGCATAAATATTATTTGTCTACATCAT
TTTCTACTATGAGTTGTTTTCTCAATTATCCATTACTTTTAGTCCAAATG
ACAATGTCAGATGACTCAGATTTCTGATTCTCCTTTTCCAGATATAACAA
AGGGTGGCTTTACCACAGAGAGTATCGTGTGTGGCTCACAAGAAATCCAA
ATGTGGCACCTCTTGTGAAAAATTCACTTTATGAACGAGGGTCCTACCTT
TTCTTTGATCCAAGCGTTTGGGAGACAATTCAAAAGGTTCCATCATTAAA
AACTGTGAAACTTTATAGCCTGATGGCACATCAGGGAAAGTAATCTGAGC
ATTTGTTCATCGCAGGACAACTTTGTTCTCCAGTATGATTCTGTAGAGAA
GAGACCTGCCCTCCCTTCGGCCAGCCAAAATGTTAGATTATAAGGTCAGC
AGCTGGATTCTATCATTCCATTCGAGTGTGTTCCTGTCCTCCAGTGTCAT
AATTCCCTCCATATGTATGTAGTGGCTTTTCTGACATACAAATTTGCACT
TGCAGCAGCTATTGGACTTTCCTTCAGCATTTAGAGGATGTCGATTTTCT
TCAGTCAGACCACCTTTTATTATCATCATAGGATATAGGGTGGCGTACAT
TTGTGCAAAATGATTCTGTAAGCACATCCAACAAAACTGTATTTACTTTT
GTTGAGATTAATTTACTACTATGCCGTGCTAAATTTCATTTCCTCTGAAC
AGGACATGTAAGCTGTTCCGAACGGAGCTTCTGTATTGGCTGACAGCCCT
GATGGTAGCTTTAGAGATGTAGCTGAGGAAAGTGCGCATCGTAATTCGTT
GGCTGTATCCAGTAGGGTCGATTCGATGTCTTCTTGCTGTAAATGACTTG
GATTTCTAGCTTCTGTAAACTTCAGACATGTACTATCCTGTGCTCTTTAA
CTAGAAATTTGTTTTCCGGCACTTACGTTTTAGAATATGCCCCCTGTTTT
TTTTGAAATATATATAAATAATCAGACAGCAGGACGTTTCATTAAAAACA
TTTCAGTCCCCTTACGTATCCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.