Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027347

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027347
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027347
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGTTGTCACCCAATACGTCGTCTGCCTTCGTCGAACAATTCCATTGTCA GTGCCACCACCACACACATTCTCCCATCCCGTAAACCCCGCTCCGCTTAA TCAGAGGCAACGCATCCCCGCTTTCTCCGCCCCCTCCCTTCTCCTCCAAA CCAAAATTCTCAATCCCTCCCGACCCCACGCCTACATCCCCTGGATAGGG AACCGGAGTTGCCCTCCCAACGCGTCCACCGGCAGCGCCCTCCCATTCCC TGCTTCGAGATCACCTAGCGGTGCCCTGGCCTGCATCGAGTTCAGCAGAG AAGCCTTCCCACTCCTGCTTTGATTTCCAAAGGAGACACCCTCCCCTCCC ACCTCGCACGTCTCCTCCATCCCCTGCATCGAATTCAACGGCGACGCCAT CTCACTCCTGCCTCGATCTCCACGCGCCCAACCCTCCTGTCTCGTGCATC CCCTCTGTCCTATGGCGCGGCCTCCCTCCATGGCATGCCACAACCGTGGA TTGCCTCTTGGTCATGGAGGAAGCATGGCCTTAGACGCCGCATTGGGTGC GTAGGCTCCGATCCACCACCACCTCCTAGGACTGGACATCTCCGTGTAGT TGTCTGAACTTCCACTGGAGAGGGAACTCCGTCACACTGATGGCTGAGGA GTGCCGCCGCTGATTCTCGGTAGCCGCCCAAAGATGGATTTGGCTCTCCC TGATCAGTGGTAGGTTTGACTATTGCTACTGCTGTGTTTGCTGATATGCC AAGACTAAACATGTATTCTGGGCCTGCTGATTTTGGTTCTTGCTCCTTCA TTATGTTATTCTGACTGTAATTCATTTTCAGAGATTTGAGCTTTTCTCTG CAACTAAAGACTGGAAGATAACGATTCTGCAACTAAAGACTTGAAGATAA TGATGTACAAAATATCAGTTTGATCTGTACTGTTGGAGCTTTCAACGGAT GTTTAGATGCTAAGTTTGCAATATGCACATATTCTTCAAGGTAATTGACA CTCTGTTTGATATTATTATCTCAATTTTTCAGACATGACAAGGATGAAAT TACTGCAAATGAACTGTTGCACCATTGAAGTAGGTGATCTAAGCTTGTAT ATGTTATTATTGCCGCCAATGTCGCTCAATGATGTCTAAAGCTTGTATTC ATTCTTTATTCTAGCCCAAGACTTCAGTTACTGGCATTCTCTTTACTTGA TACTAACAGCACACCCTATGTTTGCTAACATTTTCTATTTACCTCAGTCT GATAAAATCCACAACAGAAAATGTCAGGCACCAAAGATGCAGGCTAACAC GGGTGATAGGAGCATGTTTCAGCCGAAGCATGCAGGTAGATGTTGTCCTA CTTAGTTTTGCTTAAGACTTCATATCAAGCTTTACTCGTGAGTTTCCAGT TAATCTCCATGTCTTTTAGACTTGGTTAATTCCGTGAAAATTTTAATTTT CCAGGAATGATTAGTTATCCTCTATTATGTATTAGATCGTGCAACTAGGA ATGGATTATCCTCTGACATATATTATCTTGTGCAGCTAGGAATAGATTAT TTTCCTCTGTCATGTATTATCTTGTGCAACTAGGATGGATTTCGACTTAG CGCCATGATTGTTTATGTTGTTTCTCATTCCCATCTGATGCTATGAGCTT TTTCAATTACGTGTTTGTACGCATCGGCATTGCTAAACTGAACCCATGCT GCTTGCAGAGATGGACTTCTCTGATCCGAAGCGCATGTAGAGATACCTCA ACCTCATCAAGATAATCATGGTCACCCTCTTCATAGCCATGTGCTTTTCA CCCAGCCACTCTGCCATGGTAGGGTCTCCAGTGAGGTAAACCTTTTTCTA TCTTTTTGGATGTGCATATTTGGAGATGTCCATTTGTATATCAGTCGATT GTAGATTTCCTGTTTCACCGGTCAGGAAGATAACTTGGCACTACTAAGCA ATGGAGTAGAAATGAATGTGATTTTAGCAACTGAATATCTGTCATTCCTT CAAGTCTCTCATGTCTAAATCACTGATATGCAAATGTATCTAATCTTCTC ATTTTTGTTTACTTCATATGCAGCAATATTATTTTTTCCAATTATGCGGG TCAGCTATACTACAAGATATTCTTGTAAGGTATAACACTAAAAAACTCAC CTGGAGCTAGCATCTCATGCACTATCATTATGTATTTTCTTCCCGGCACT CTTATATCCAGCACTGTAATAATCTTGTGATGTACCAAGATGAGTCTTTC TTTTGCATGTTGATAGTGCTCTTTTTTGCATTGTATTTTATCTTGGTTGT AAAACGAATATATCTTAGAGAAGAGGCAAATTGACTCAAAGTTGTAGTAA TGCTGGGTACCCATATTCCTAAGGTTGAATAACTGTATAGACTTATGTGT GCTTCTTTTCCTCTATGCACTGGATACAATATATTAACCTTCACTTTGTT TCTTAAGGTGAGCTGTAAGAATTCAATTAAACAATATGAAGCCTATCGGT TTTGAGTGCACTTGTCACAATATATTTCTATTTAATTGTTATAAAATATC TACTACCTCTTAATATTGAACCTCACTGATCACCTGCGTTGTAGATCATT CTTGCCATGTGCTTAGTTGTAGTTACTCCATATATTGCTTTTGCTATCTA GCTGTAAACAATTTTTCGGTTGGTGGCTTTATTTGAGGTTATTGTCTTCT CTGCTTCTGGCTTAGTCTTTTTTATCTCCTGAAATGAAATGCATATTTCC AAATAAACTGGAAAGCTTCATTGGCTACCAATATTCCTGTATGCAGAGAA GACCTCCTCGATTAACCTATATGTAGATATACATGGTAGAAACCTTTCCA GTTCAAATATTTTTGTTTTTTAGATTTTGGATCTTGTCCCTATCCTCACA CATGAGTACTTTCCAGAGAATCTTTACATGGCGTCCAAGCTTCAATTTTG TTCTGTATGGGTCTGCAGGACAAGGACATGAGCGCTACAAAGGTTAGCTC AAGTTGATTCCAGGCAAACACATATTTTTCTAAACTTTTTGTCACACCGG TTGGTAATTCTTTTGTTTTCTCTGTTGACAGGAAGAGCTTGGCATAGAAA GGGAACAAGTCTTCTCTAACATCATCAAGACAATGAAGAAGTTATAAGGT TACCTTCACAACACTACATGAAAAGAAATCGAAGCAACCTTACCATGACT TAAGGAGGTAAGCAAAAAAATCTTTTTCTCTTGCCAGTTTAATGTGTGTG CATGTAATATCTCCGCCAAAAAAAGTTGTGTTGGATGTCTATCTTGCTCG TATACAGATCTGACGTTTTTCTATTGTTGATTAATTCTAAGATCATTCAT GTGTCCTTCTTGTCAGATCTGATTAATTCTAAGATCTTTCTTCACGTAAC ATGCATTGATCTTCATAGCATCCCATTGAAGAGAGAAAGAAGCTATTGTG GTACCAACTTTGTTTAACCTTCACTGATTCTTTATTAGAAGAATACCTAT ATGATGGCATCAATTGTGGTGGTAAGAACAAATAACTGATAATGTTTTTA AATTCTAAATAATTTATTGCACATGGCAAATCCGGAGCTGGCTACGCGTG CACATTGGTAAGACGGCGAGAGTGGCGACATGGATGCGGTGGTCGTCATG TACTATGCTATTTGCTGCTCTGCCTGTTGGAGATATGCCCTAGAGGCAAT AATAAATATGGTTATTATTATACCTTTGTGTTTATGATAAATGTTTACAT TCATGCTATAATAGTATTAACAAGGAAATATTAATACTTGTGTGATTTGT AAACCTAATTTGAAGTCCCTAGTAAAGCCTCTATATAATACTAGCTTGTT GGTTAATAGATGATTGTGGTTTCCCTATCATGAACATTGAGATGTTATTA ACAACAAGATCATATCATTAGGAGAATGATATGGTGGACATACTCCTATA GATAAACGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTCAATAGTTCAATTGCTATAT GCTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATA TCACCTTTACCGGATGGATGCTTTGATGACATCAAACACCACACCGTAAC TGGGTGGCTATAAATGTGGCATTGAGTGTTCGGAAAGTATTGATTGAGAC ACATGGATCAAGAGTGAGATTTGTCCATCCATATGACGGATAGATATACT CTGGGCCCTCTCGGTGGAATGTCATCCAATTAACTTGCAAGCATGTGACT GGCTCACAAGGGATCACATATCACGGGAACGAGAAAAGAGTACTTATCGG TAACGAGGTTGAACTAGGTATACAGAGATACCGACGATCATAACCTCAGA TAAGTAAACTATCGTGAGACAAAGGGAAATTGGTATCGTATGTAAGTGGT TCATTCGATCGCAAAGTAATCGTAGAAATATGTGGGAGCCATATGAATTT CCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCG CATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGACGTTGTTTG AGTAGTTATGGTATGATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGG ATGGGATCCGGGATATCACGAGGAGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGA TTCATATAAGGAAAGTCCCGTTTCGGAGTTCAGGAATGATTCCGGTGTTT TCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAATGTCCGGCACTCCGGAGGGG AAGGGGTACATGAATGTGTTATTGCAAGTTGGAATGATTGCATCATGTAC TAAGTGTCATCGCTGTTCCAAATAAAGGATTAATTCAAATCCTAGTTTGA AAAGTAAAATAGCTAAATTGAAAAGTCAAACGGCTAAATTTGGAAAGAGG AAAAGAGGAGGAAGGTGAAACCGAGTTGGGGAGGGAGTCCCTCCTCCCCA AGCCGGCGCACCACCCAAGTCGAGTTGGGGAGGGACTCCTCTCCCTCCCC TTGGCCGCCGGCCCCTCCACCTATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCTCCTA GCACACACAAGTACCTCTCCTCAAAACCCTAGCTTGGCGCCACCACCATA GCCGCCGCCCCCCTAGGGTTTTGCCCTAGCCGCCGACTTTGGGTGCCCCA AACCCTAGCCGCCGGCTCTAGCATCCCCTCCTTGGTGTGTCTAAACCCTA GAACACCGAGGACTCTCTCATACTCCACCATACTCGCTCCGGCTTGAGGC GAAGCCCTGCGAGATCTCCCCTCTACTTCCGGTACCATGCTGTCGTGCTG CCGGAATCGCGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCTACTGGAACAAGG GAGAGGAAGGTGTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCG CTGCCAGAACGCAGCGATCGTCTACGCGATCTTGAGATCGGGAAGAGTAC GACTACATCACCCACGAGAATCCGCTCTCGTTAAACACTTTGGAATCTTC GAGGGTAAGTTATTCCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATCT TGGCTTGTTTGTTTGTATGTGATAGAATTTTTTTGTTTTCCATGCTACGA AACCCAACACTGCCAGTGACCATGTAGATCAATAGTAGGTGTAGGTGAAT TCTATTATAGGGTTATTGGTACCGGTGGTTTGATATGGTAGTTTCTCATC GAGTTGCTTGGAAAGCGATAGCAGCCTACGCTTTATCTAGATTTTATGGT TCAGCGCCTCTCATTCGGCTATGGTGTTTAACTATATAGGTTGCTTTGTT GTTTCAGAGATGCTGGCACTTCCAATTGGAGAAAAGTGGAGCAGAAATTG ACCGATAAAGAAACTGTAATACTTCAAACATCTAACAAGAAGGGAGTTGT ATTGCTTGATCAAGTTTCACTCATTCCTTCAGTCAAGTTCAAGGTATATA ATACTTGTTTGTATGACTATCCTGGCCGTCTTGAATTTCATGTTGTAATT CACATATTAATGTGCACCTGAATATCCTTACAATGTCGACTATGGGCGGA TTGAGTTGGTCTTATGGTCGAGCGAGTTTTATGCCAAAAAGAAAAAATAT CAGTCTCCCATAGCTGCAGTTAGAACATGCTGGCCATCGAGATACTTGAG TTTACTTTTGTTTAAAGAAACAAAATCCATCCCTATGCTTGCCACATGTT GTTCCCCAGTTCTATGTTTCTGACATTAAATCATATGTTGTGGATCTTCA ATTCTAGAAGCTATAGGCAATGTGTTTTGATTCAGGTTGTTTTGCTTGAT AGGACTAGAAGCAATATTTCCGTGGGCTATGTTCCTAGGATGAATTTTCT GGATATCTTGGCATGTATCAACATTAAAATTAGGCAAAAAAAATTCAATT ATTGTTTTGGCAAGGCATGACATTCCCCAGATTGTATCAATTATTCATGG TACAATATGGCTATACTTAGATACTTGAATTTTATTGTAGCCAATTTCAG TCTGCTAGACAATGTGTATCTGGTTTATATTGTAGGTTAACCAAATTTAG TCTGTAACCGTAAGCAATGAGGCCGTGTGAATGTTAAAGTGTGCTGGCTG GCCAGTCACTATCATGTGTTCATATACTTCTTTCCTTCCTTTCTTATCCG AAATATTCAATTACCATCTCTTTGCTTCAGTGGTAAAACCGAGAATGCGT TACTTGCTGATTTGGCGGTTGGATTATCTACAATATGTTTTCAAATTCTT ATTAGAACGAGGTCATCAGTGCGACTTAAGTTTCATGGTGAAGTTAATGC AACAATATTTTGTTGTATTCCTATTCAAAGTGGGTCGAACACATCATTTT GTTTTAATTAACTGGAAATACCACGACATTTTTTACTACAATACCAGGTT TCGTAGTGGAGATCGTCTTTAATTTGTGGCTATCACAAGGTCAAGAACAT GTTGCCGAATTAGACTTAGCTATTTATTGTATATGGTATTTCAGAGCACC CTCTGGTGAAAAGTTCGTACGATGGTACTTTCTTGCCATAGAAAATCAGA GCACTAAATATACAGGGATGGAGGGAGAGCTTACCATGGTTCTTAGAAGC AAAGTCTGTGTGTCACCAAAACACAAGGTTATGTGATAGGAACATTGCTC GGGATAATGAAATATCAAAATGAGTGTAATGGGTCAATCTTGGATTGGAG AGAGGGGATGAGCAGTAGACATGGTGAGGTACAGAGTTTTCAGGAAAAAT AATGAAGAAGACAACACTTGAGGAATAGAGGAGATGGCATGTCAATGACA AACGAGTTGGTGAGTTTTTTTCACGAGCTCAATATATCACACTTTGGAAT TAAAAATAAATATGAATTGGTTTTCATGGATAATTTCTGAGAATGTTAGT TGCTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.