Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021021

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021021
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021021
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGATCGCAGAGAAGCAGGTGACAAGTGCGAACCTGAGGCAGGAGGGGC TGCAGTGATGGTTCCGTCCAGGTTCAGGAGGATCTGCGTCTTCTGTGGGA GCAGCATGGGCAAAAAGACCAGCTACCAGGACGCTGCCGTGGAGCTTGGA CAGCAGCTGGTGCGTCGTCCTACTCATACATAGATCTTCTCCCACCTCGA TCGCCCTCGTCCTCGATCGACCGGGCGGCGGGGTTCATATTCATCTCTAC TCCAGCTTGCTTCTCTCTAGCTAGCTACTCCCTCCGTTTTAAAATATAAG ACGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAAGGAATCTAGACTTATTTTAGTACGTAG TTCGTTCCGTTGAATGAACTACGTACTAAAATAAGTCTAGATTCCTTTTC TTCACAAACCTAAAATGTCTTATATTTTGGAACGGAGGGAGTAGTTCATT GCCGTTTGATCTACCTATTTTGCTCTTGGCATATATATATTTATATATAG CAGTTCCTTAATTTCGCTACCTGTTCCATTGTCTTTTCTGCCGTTTGTTT CATTTTCATTCATTTGGGCGTGCGTGCGTGCATGCATTTGCTTGCTACTA TACAGGGAGTCAATTACACATACCACATGCGTTTGCTTGCTTCATTGTAC ATACCAACCAAAAAATACACCTATATCTATACATGTGTAGGTTGCAAGGA ACATTAACCTGGTGTACGGACGAGGGAGCTTGGGGCTCATGGGCGTAGTC TCTCAAGCAGTCCACAGTGGAGGACGGCACGTCCTTGGGTATGCAAACTA CAAGTTAATAATGATGATTCATCTTCAGGCTGCTTCGGCACATGCATATG ATATTCTGGTGCCGGAATATAGGGCATGTTTGGATGGTGGCCAAAACTTA TCCTACCAAAATTTTGGTCATGGCCAAAATTTTATTCTTTGTTTGGATGG TTGCCAATTATTTGGCTTGCCAATGTCTCTATGACCAATCTAGTTCACTT TTCTTGCCAATATTAGCCAACTCATGGGCAACCAAAAGGTTAACCAAAAT TTTGGCTAGCTAAATATTTGGTGGGGCAACCATCACTACAGGAATGGGAA GCTACGCCGACGGCCAAACATCGGGGCCGTCGGCGTAGCCATCGTCTAGG CCAGCTCCGCCAAGCAGCCGTCGGCGTAGAATTGCCCTCGGCATATCCTA TGCTACGCCGACGGCTGCCCTCGGCGTAGCATACGCCGACGGCTGCCCTC GGCGTAGCTGTTTTTTATTTTATCTCATTAAACTTTGAAAAATCATAACT AAATCATTCTAATTCGGAAAAATACAAATAATATATCAAAATTTGCAGAA AAATAAGACCTATCTATCTACACTCAAATATTACACATTTATAAATAAAA ATTAAGTAAAACATAAGAAATTATATATAGTTTAAAATGGGCATAAAAAA TTCAAAAATGATCGAAACAATGCGAAACCTTCGCGTGGTGTTATATTATG TGACATAGTTAGAAGGAAAAATATCAAACTTGGTATATTGATTATGTCTC AAAAAAACCTTCATAAAATGACCTATCTCATTCGAGGTTTCTTGGCTTTC GGGTCAAATGACCAATGTTATGGCTAGAATCAAGACATAGTTTGTGATAA TGTGCCCATATTGTGCATACACATGCATCATGGGATGGCGAACAATGTTG CATGAGAAAGTTTTCCTTTTCGTCGCACCAAAAAGCCATTTCCCATTTTC TGAGCACAAAACACGGACGATTTTGTAAAGCAACCACCAAATGGCTAATT CAAAATGGTACCACCACATTTTACAAAAATACTATACCACCTTATATAGA CAATGTCCCAATAGGGGAATCCGAAACCTTTCCGTCCACCTCTGGTGAAA AAGACAAACTCCTGCCGAATCGGTAGAAAGTGGGTCAGATATGAACTACA GGTACATGATCCGATGCTCATGTTTTTTTACAAAAATCATTTTTAGGTTC ACAATATGCTATTTTATCAAAGATCCAATGCAAGTTTAGCGAGGCTCGGC CCCGAGTTAAGAATCTTCATGCCCGCCGTTCGACAAAGTTTGACGATAAT TTAAAAGGGGCATAAAAAATTCAAAAACGATCGAAACAATGTGAAACCAT CGCGTGGTGTCATATTATGTGACATAGTTATAAGGAAAAATATTAAACTT GATATATTGATTATGTCTCAAAAAAACCTTCACAAAATGACCTATCTCAT TCGAGGTTTCTTGGCTTTCGGGTCAAATGACCAATGTTATGGCTAGAATC AAGGCATAGTTTGTGATAATGTGCCCATATTGTGCATACACATGCATCAT GGGATGGCGAACAATGTTGCAGGAGAAAGTTTTCCTTTTCGTCGCACCAA AAAGCCATTTCCCATTTTCTGAGCACAAAACACGGACGATTTTGTAAAGC AACCACCAAATGGCTAATTCAAAATGCTACCACCATATTTTACTAAAATA ATATACCACCTTATATGGACAATGTCCCAACAGGGGGTTCCGAAACCTTT CCGTCCACCTCTGATAAAAAAGACAAATTCCTGCCGAATCGGTAGAAAGT GGGTCAGATATGAACTACAGGTACATGATCCGATGCTCATGTTTTTTTAC AAAAATCATTTTTAGGTTCACAATATGCTATTTTATCAAAGATCCAATGC AAGTTTAGCGAGGCTCGGCCCCGAGCTAAGAATCTTCATGCCCGCCGTTC GACAAAGTTTGACGATAGTTTAAAACGGGCATAAAAAATTCAAAAACGAT CGAAACAATGCGAAACCTTCGCGTGGTGTCATATTATGTGACATAGTTAT AAGCAAAAATATTAAACTTGATATATTGGTTATGTTTCAAAAAAACCTTC ACAAAATGACCTATCTCATTCGAGGTTTCTTGGCTTTCGGGTCAAATGAC CAATGTTATGGCTAGAATCAAGGCATAGTTTGTGATAATGTTCCCATATT GTGCATACACATGCATCATGAGATGGCGAACAATGTTGCAGGAGGAATGC AAGTTTTCCTTTTCATCGCACCAAAAAGCCATTTTTCATTATCCGAACGC AAAAAGGGAATTTTCTAAAGCAACCACCAAATAGATAATTCAAAAACGGA GGGTTTGTGATTAGTTGATATGGATATCATATTTGGATTCCTCTCATTTT TCTGATCAATTTAGACATATTATTTGTTAAATTCCGATTTATAGATTTAA AGATATTAATTATTCCATATTAAATAGAAAAATACAAAAAAGTAAAATTA TTATATTTTTATTTGAATTCAATAATATTTTTACTTATTCATTAATGTTT ATTTAAATAATTGTTTGTAATTTCAAAAAATACAAACATGTGACATGTTG ATATAAGGGTTAATAGGATTGGTATCATAGTATTGACAACAATGTATGAA TTACTTTGCGGAAACAGATTCTGAAGGAACGAGGAAGTTAAGCGTGCTGG AGCTGGAGTAGTATTAGGATGGGTGACCTTCCGGAAAGTTCGACCAAAAC TGCAATTTAATTAAGTATTAAGTGTAATTAGTGTTAAAAATGTTCAAAGT GAGAGATTAACGAGTCAAACAGTTCAAAGATTCAAAAATTAAGAAAAAAA ATAAAATAAAAAATTTAATTTTTTTTTTAAAAATATTTTGCAACCGGTCG ACAAGCTATGCCGACGGCCGCTACGCCGACGGCATTGCCCTCGGCGTAGC ATACGCCGACGGCATTTTGATACGCCGACGGCCTCTATGTGCTCCGCCGA GGGAGCCCTTCGCCGAGGAGGCTACGCCGAGGGCAGCCGTCGGCGTAGCA TACGCCGAGGGCATTTTAGGCTACGCCGACGGCTTTTTGCCCTCGGCGTA GCGCGCGCGTCCTGTAGTGCATGGGTAAAACCAAACACACCCATAGAAAA CTTTAATTATTTGGGGCATCTTCCAAACTGTAGTATGCTAGCTCGATCAT GCCACATGAGTTTAATCCTAGAAAATAATCCCTACGATTTTATTTAGATC ACATCTTCGGTTTATTCAAAGTTAAACTATATAAAGTTTGACCAATAATA TAGAAAACAAATAAACCTGTATTATACCAAATTCATATGATATGAAAATA ATCTTTACGAAGATTTTATATTGTACATCTTGATATTTGTAGTGAAATAT TTGATCAAACTTTAAAACATTAACATGAAGTACTACCTCCCGTTTCAAAA CATAAGCCTTTCTAGCAGTTCACACTTAAATTTTCGAATGAAGATAGTAA TTGCGAATGGAGGGAGGGATCAGATGGTTTGTTAAGGGTGCGTTTGGCCA CCTAGTATTTTTTATGTTTTCTTCTAATACCTCTGTTTCTAAAAATACCG CGGTTTACAATACTTTTTGGCTCCAAGAAATATTGCAGTTTTAAAAACCA ATATATCTTTAAAACTGTGTTTTTTTTGGAGCATGTTAGAAAGAGGTATC CATTTGGAGTCTTGTTTTTTTCTAACAATAAAGTATTTAAATAAGATGGT ATTTTAGGCTCCGTTTGGCAGCTTAGTATTTTTGGAGTATTCTCTAAATA CTGTGGTTTCTAGAAAAAAATATGGTTTCCAATACTGAGCGGCATTTGGA TGCAGCGATACCACGGTTTAATATACTGAGCTATTTCCCCAAAACGTAGT TTTTTTTGTTGTATTGTAAAATCTGCCTCAGACCTCTTTTTTCTCTAAAA CCGAGAAATGTTCGTTTCCAGGAGTCTATCCATCTCTCTCTTCCCGTCTT CTTATCCACCGGTAGCGACGTCCAGGGCCATGGAGAAACCAAGATCATCA AGCGGAAAAGGCTCGTCAAGCCAAAAAAGTTCCGGCCAGCGGCTGCTGTG GAGAACTGGCAAGCCCCAGATGCCACGTCGATCGATGGATTATTAGTAGT GGGTTCGTTGTCGGTGCATTGATTGAAAGCACAATATAGGTACTTTAGCT CATGCATTCAAAGCCAGCGGCCATGCAACAACATCGTAAGTATCGGTCAA ATTACATCTGCATGCGCCGGAACAATCGGTCAAAATCTTCTAGGAAACAA CACTAGCCAAACGACGCCTTCCTATTTTGCCAAAAATTGAGAAAAAGCTC GGTTTAAGGAAACTGTGGTATTCGGTAGCCGGACATCTAAATACTCTAGT TTAGAATACTAAGGTTTAGGAAAATCTAAGCTGCCAAACGGAGCCTTAGT GTCAGTCAATGCAATACTTCGGTTTCTCCTATTTCTCAGTTTTAGAAAAA AGAGGTCCTGACCCCTTTCTTAAATAATGCCAAAAAACCACAATCTTGAT TATACTATGGTTTACGAAACTGCAGTGTTTGCTGCTGCCAAATAGACCAA AGTATTTAAGACTGCAGTATTTTGAGAAACCATGGTATTCTGCAAATACT TCAAAAATGCGGAGCATCCAAACATAACCCTAACCCACTTTTCTCTAAAA CTGAGAAAGGAGGAAAACTGTAGTATTTTCTTGCCAAGCGTCAGAATACG TTGATTTTGATAATAAAGAGCTATCAAACCGAGCCTAAACTGCTATTGCG ATATAACTTGTTATCTTGCTGTCCTTGTGCAGGGTGATTCCCAAGGCCCT CATGCCCAGAGAGGTAATCACATGGAATTAATGAGTCCAACTTTAATTTA CTACTATTCTTCCATTCTAATTTGAAGCGCTATTAGTTTTATTTTTCTCC AACGTTGCTATATAGTTTCGTATATTGACAGTACCTACTAACCATAGTAA GTATATCTTGTTTTTTCTTCATAATTCTTATCTCTATAGCAATCTTTTTT AAGAAATGTGTCATGTAGTTGGTCTGAAAAATAGATCCTACTAGAAACTT CTTAACTATCACCCCCTTGGTGTCTCCTTTGATGAAATATCACATGCGTG AAAATTTCAAAGAGGCCGTTGATTAGGCAAGTGCCTCTGTTGTTCGGCCC TCTTGGATCTTACTAATGAACATCACCTTTTAAGATGCAGAATACTGTAT AACTTTATCAATTAACAACTCACACACCCGCGCGCACAAACAATATGGTC ATGTAATTATGCTAAGAAGATAGTTAATGTATGATGTTGCATGCATGTGG GTGCAGATAACAGGAGAGACGATTGGAGAGGTGAAGGTAGTGTCAGATAT GCACGAAAGGAAGGCTGAGATGGCCAGGCAATCTGACGCCTTTATAGCGC TCCCTGGTACGTCCTCCCAACAACTATCCGAAAATAATTTTACTTGACGC TGCCCTAGTTTTCTCCTTTTTTTTAGTACTCATTTAGACAAGGTGTGGCA TTGTGGTGGGTTATTCTAATAAACTACTCCATCCGTTTTAAAATAGATGT TTTAGTGTCATAATTTGAATAAACCTATATACTAAATGTGTCTAGATGCA TTCATATTTTGACAAATCCATAACATTTATTTTAAGACGATGGGAGTAGT AGCTTTCTAGGAATTCAGTGTTTGGTTTTCTGTGCGGTGGATTGACATGT TTTATCTGTTTCCCTCCTTTTCCCGGTGGTAGTAGTAAATCTATTTTTCT CGTTCAGGTGGTTATGGAACACTTGAAGAGCTTTTTGAAACAATCACATG GGCCCAGCTGGGTATCCATGACAAGCCGGTAAAAGGAAGCTAATGGCCCT TGTTACACTTTATGTCCAAAGATATATGCCGCTCGCGCGCGGTACCAAAA GGCACAGACATAGGCCTCGTTTGATTCATAGGATCTTAAAACAAAGGAAT AGGAATAGGAATAGGAATTTGGTAGGAATGCATGTGAAAAACTATAGGAA CCGGGAACACGGGAATTCTTTCTTGGTGGTCGTTTGAAATGAAGGAAAGG AAAAACATAGGAATTTAATGGTAATTTAGTTATCTTGATTAATAGACATA GATAACCAAAGGACAGCAGGCGTTAGGTACATATCACAACTGGCATTAAC TTTGATATGCCTCGTTTCACGCAAAGGAATGAAAAAAAGAGCTTAGAGTG GATTCTTTTTTTCCCTTGATTTTCCTAAGAATCTGGTTGCAAAGGAAAAT TTCCTTCAGAATTCCTTTAGTGCATTCCTTTGAATCAAACAGTGCTACAG TGCATATTCCTATAGGAATAGGAATTCTATACGTTTCCTATGAAAATCCT GTGAATCAAACGAGGCCTAACAATTGGGAAATTAATGTTACTGTAGGTCG GGTTGCTTAACGTGGACGGTTACTACAACCTTCTTTTATCCTCCATCGAC AAGGCCGTGGAAGAAGGGTTCATCAAGCCTACTGCTCGTCATATTATCGT GCTGGCTCCGACTCCGACTCCCAAGGAACTGCTCGACGAACTGGAGGTAT TCACCTTATAATGTATTTGAAAAATGTTGAATTAAGAGGATCAGTGGCTA ATTCCAGCTTGGCTCTCCTCTAACTAGCAGAAGTACTCTCGTCAGCATAA GGAAGTTGCGCCCAAGATGAAATGGGAGGTAGAACATAAGGTTCCCAGTT CCGAAATTCCAGGGCAGGAGGAAGGCCAAGAGATCGTCACAGCACAGCGG TAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.