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GrainGenes Sequence Report: AA001622

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Sequence
AA001622
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001622
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGATAGCTTTAGGGCCGGAGGCCGAGGGGAACTCATCGCTTCAGCCACC
AGCGGCCCAGCTAGATCGCAGCTCCACTCCGAGTCTCCGGCCAAATCCGT
CGGCTCGCCACCATGGCCGACGGCGCCGCCTCCGGCTACCGCGGCGAGAA
CCGAATCGACGCCCTCCACGAGGACCTCCTCGGTGAAATCATCACCCGCC
TCCCTGCCACGGACGCCGCCAACACCGCCTCCATCGCCCGCCACTGGCGC
CACCTCTGGCGCTCTACCCCGCTCGTCCTTCGCGATTGCAAGCTTCCCGA
GGCCAGGCGCGCCGCTATCGTTGCCCGAGTCCTCGACGAGCACCCGGGGC
CTTTCCGCACCATCTCCCTCATCAGCAGCAGCTTCGCCTCCCTGGACCTT
GAGCTCGCCGACTGGCCGCGCCTCCTCGCCACCAAGCGCACCCAAAAGCT
TGCCCTCATCAACATGCCCACGGGGGCGCAGCCCATCGTCTCCCGCGTCC
CCACCGACATCCTCCGCTGCGGCTCGCTCCAGGAGCTCTCCCTGGCCTTC
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CCTCCGCGAGCTCTGCTTGGTCAGGACCGCCACGAGCTACCAGGATCTCG
AGTACTTGCTCGCTGCCAGCCCCGTTCTGCAGACCCTTATGTTCATCTGC
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TCTTGGAGCGGCTCTTCTTGTTCCAGCCACCTTGGGGTGGAGCTGATTGT
GTGAGGGTCAAGATTGCTTGCTCACTCAATCTGGGGATGCTCGGCTACCT
GGATCCAAGAATTCACAGGCTGCAGATTGGTGACAACATAATCCAAGTAC
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CACGACCTTTCCTATGATCATTGATCTCCTGGTGTACCTTATTGCAGTCT
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TCCTCAGATGCTTTCCCAATGTTGACACGCTGCACATCCAGGTTCGTGAG
AGATTTAGTCAGTAGTTTAGCAAATTGTATCATCAGTTATTAGCAGTGTG
ATCCATGTGTAACTGAACTATCCACTCACTGGCACGAATTTGCAGTCTGT
CCTTCATGATCCATCTGCCAATGAATCCAGCTGGGAGAACAATGCCAAGT
TCTGGCAGCATGTCAGTCCAGTTAAATGCTTGAGGTCGCACGTGAAGAGC
ATGGTTATCCACAAATTTCGAGGGGATCAAAACGAATTTGAATTCGTCAA
ATTCTTGGCCATGAATGCGCAGGAGCTGCAGTCTTTGGTGGTTGTACGGC
CTGACGTAAATTTTTCTTTGGTGGACAAGGTGAATGAGATTATAGACAAA
TTGGGGTGTCCACGGTTCCGAGCATGGACCTCTAAAGTACTGCTGGTGTC
GCCTAAGGTGGATACTATTTGGGGAATGAACAAAGTTAATGATCTCACCA
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ATGATCCAAGCTCTTGGGTAAGGAATGGCTTTTCTAATGCAAGATCATGC
TGTTTAGTGTTATTTGTCATGTATATTTGTAGCATGTGTTAGGTGTCCTT
TTCTTTTCTTTGCTCCTGTCACCTCTTGTAATTTCGTTCACTTTCATAGG
ATACAGAGGTTGGTTGACCAACATTGCTGGTGTCAGTGTCACCTAAGGTG
TGTAATGGTTGGAGCATTGAGAAAGATTATGGATCGTGGTGACCACGATC
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CGAAGGCTATAGGCAGCCCTACTTGTGATTCCATACTAGATGATATCTCG
GGCAGTTAATGAATTGCCAAGTTGAGATCTTTTGGTCGCCTTTGTGGATC
TCGAGGTATCCGACAAGGTTGTCCTCTTTTGCCATTTTTTTTCAGAATTT
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GCCAATTGTAGTAAATCTGATGTCCTTTTTAGTAAAAAAGCACCACTAAA
TCATCTAGGTCATCCTCTTGTCCTTCCTGGAAAAAATAGACCTGCTGCTT
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AATAAATTATCTCAGACTGGCAGACTTACTTCAGTTAAATCTTTTTTTTT
TTGCTTCTATTCCTGTCTACCACATTTCAAACATCTTATTGAGTAGGAAA
TCATATCCAGGTTAACTTCTAATGTTGGAAAGTTTTGGTGGGCAGGAATT
CAATATAACCAATCTGCTAAACCCAACTTATCTTATAGCTTGGATTGATA
TTTGCAAACTTATGAAATAAGGGCGTTTAGCCATGTGGGTATTAAGAGAT
CTTCATTGCGTGAGAAAAATCTTATAGTTTGTGCTGCTTGCAAAATTATT
AAGGAGGCTTCCTCTTTCCTTTTTGCTGTTTTAAAAGCTAAATACTTCCC
TCATACTACTATTTGGAAGGCTCACTCTTCTGGGTCTAAATGTAATTTTG
GTATTCGGTTCTTAAAGTAATGCCAGATGTGCTTAGCTCTTGTCATTTGC
AAATTGCTAATGGTAACTCTAGTTTGGGGTCTGAACGTTGCTGTCCTGAT
TGGAAGAATATCCCTTGTCATCTTATTACCCAGCCAGGAGACTGATGCCT
TAGTTTCATTAAAGTTCTGTAGTGTGACTCATCAAAGAGCTGGGACATGC
CAACCCAAATACTTCCGATGAATCTCTTTCTAATCAAATCTTGCAGATCC
CTGTTGTTAATGCAGACTTTGATGATAAAATCTGCTGGAAACACACTCCA
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TTTCTTTCTCTTCTTATCATTCTTTCTATGCTTGCAAGTACACAATCTGG
TGTTTCTATTGCAGACTTCGAATGATTTGTCTTCTCAACAAAAATATTGG
TTTGTAATGAAGGTCCTTTATCTGCTGCTATTATCTCTAAACGTGTATCT
CTATCTCCTCTTTGCCTGCAGGTCCATGGGCATCACTGTGATGCAGCTTA
TAACTCTTCGGTGGCAGGAAAAGGTGACTGGGCTTGGGCTTGTCTTTGTT
CAGGCTTACTCTTTCGACACTGATTGTGCTCTCCAGGTGGAAGCACGATG
CTCTGGTTCTTGCATAATGTCTGTTTCTTTACCGATTGCCAAGTGCTAGC
GGAGGTGGCGAAAGTTGTCATTCTTCCTTTCCAATCATGGACATTGGTCC
TCTAGGCCACTGCTTGCTTGCTGTTTTCATGAATGCTACGGCTCCAGAAT
CAGATAGGTCTTCAAGATTCAGAGATCCTCCGACGACAGGAGTCGCTCAT
GCTCTTGCCAAAAGAGCTTGCGTTAAGAGATCAGTCCGACTCATCTTGTA
GTCTCAATACAAGTGCTGCTGATGACATGTTCTCGACATGCTGCTCTGCA
GTTCTGAACTTGTACTAAAGGAACAAGCTTTGCTGTGCAAATGTAGTAAC
CCGGTGCTTGTAATCCTCCTGGGTGTTTGAGCATTCCAGCCACAGTGAAC
AGTTCCTGTAAAAAAAAAGCTAATGTACATGCTTTTTTTTTGAAGCTGAT
GTTGTACTGGCAAATGGGAACGGACCAAATCTAGTTGCTAGTCTTTGATA
AGCATTTTATCTGTGGCTGTGCGCTGTTATGTGCTGTATTGTTTTTGCTA
ATTAAAAGCTGCTGGAAATTTGAGTCTCGTTTCCATAGAGTTGCTAATTA
CTACTAGCATAATCTGACATGTCGAAAGTATCTAATTTTAGCAGAATGTT
ACTGCATCTTTTGCCTTATATGTCAATGTTCAGAAGTTTATTGTTTTTGT
TTTGGAACGGTGTAGGAGCTACAAGTTTTTCGAAAGCTCAAGATGGTCAG
AAATTAGAGCATCTCTTTCGCCTGGACATCATTTGCGGGACGCGGCCGAG
CATAGTTTAAAAAACCGGACCGACGATTGAACCGGTAAGATCCTCCGTTC
GTGGTTCACTGGTTGGACCGCTGGTTTAAACTGATTCGGTGCTGGTTTAT
TAAAGAAAAAATATGAATGAGAAAGTACTGATCTGTAAGAAAAGAGAAAC
ATATTTAGAGTATACATGAAGTACTTTGATACAAACATTGGTTCTTCCAA
TTGTCTAGCCCTGTTGGCGTGAGCTTGGAGGTCACAGGATCAAATCTTGA
TTTGAGCATGGTATTTTCTTCCTAGGTCGGTTTTCAACTCAGTTGACCAC
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CACACCTATTTCCAGTGCCCCAAACGGTTTCCTAAACAACGTACTGAAAC
CTGAACCAGAGGCTTCTCATTGACGATGTCGCTCCCGTTGTTGTCGTCAT
CATCTTTCTTGTCCATACGGTAGTGCCTATGGCCCATCATGGCATCGAAC
ATGTTCACATCAAACATGCCTTCTTCTTCCCATGTGAAGTTTAGGACACC
TCGTGTGCGCGAGCGAACTGCTTTGAGCCATTGTGGAGGTACATGTGGCC
TTGCCCATCGAACATCACCTCCACGCGCCAGAGGGGAGCACCGCCGCCTG
CCCCGCAACATCACTATGGTGGGCTCATGCTCGTCGAGAAGTTGTGCAGA
CTTGTCGGGAAGTTTCTTCTTTCTCAAAGGTTCTTCATAGATGGGTATGA
AGAACTTGAAGTCGGAGCCTTCCTCCTCCATGGGCGATGGCAAGAGGGAA
GACGTCGTTGACAGACCGTGTCCTCGTCGACCACGACCATGACCCCTGCC
TTGATCACGACTGCAGCCGCCCCTAGAACCTGTAGCCGTGGAACACGAGT
GGATCTAGATTGAATCGGTAACGGAGCGGCCGTGGAAAATGCGGCTCACG
TGGCCTTGTTATATAAAGGCCGAGCAGACAAGCAGTCGTTTCCATTGATA
CGGGCGCAGAGGTCGAGCGACTCACATTTAATTGTCGCTAAATTTTTTTC
GTACACCAATGGCGATGCAGACTGCGCTGGCCACACGCCATAGCGGTGAC
GTGACGACTCTTTGCGCCGGCCACACAACACGACAGTGACGGGATAACTT
CCTGCGTCGGTCAGATAAACCACCGCCACCATTAAGTCAGAAGGTTGGTG
ACAACCTATAAACACTATCGTGCCAATGACATGGCTCCCACGCATTGCTT
CCGACGCACCGGAAGCGTCTCCTATGATGCTGGGATGATCTCGGTGCTCT
GGACGTGTGAGACAAAAATGGCTTTTGAGAACATAACTAGACGTTTTTTT
TGGCACGACGTGTCCAGAGCCCTTGGGCGGCCGGTGTAGGCTACCCGAAT
GGAGATGCTCTTAATTCAATGAAATAGCTTAAACAAATAACTGGTATTAA
CAAATGTCAAGCAAACAGTGTCACCCTTCATTTTAACATGTTATTAAGCA
TAGCTCACGGAGAGAAATTATTGTATGCGTTAAACATTACAGACACAAAG
TCTGGACCGCTAGTGGGCCGCCCGCCCCTCCATTTCGAGCAAAACCAAAC
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GCCCGCGGCGGGTACCGCCTCAGCGCCCTCAACGACGACCTCCTCCAAGA
AATCATCACCTGCCTCCCCGTCATGGATGCCGCCCGCACCGTAGTCCTCG
CCAAGCGCTGGCGCTACCTCTGGAACTCCGCCCCGCTCTTCCTCAGGGAT
GGGGACCTCCCCCAGTCCGCGCGCGATGTCGTAGTCCCCCGAGTCCTCTC
CGAGCACCAAGGCCGGTTCCGCCACATCAGCCTCGCCGACTGCAGGCTCG
CCTCCCTAGACCGAGAGCTCCCCGGGTGGCCGCGCCTCCTCGCCGACAAG
CAAACCCAGAGGCTCCATCTCAACAACCGTTTACCCCGGAACCAGATCGA
CACCTTGCCGCACATCCCCGCCGATATCCTCCGCTGCGTCTCGCTACAGG
AGCTCTTGCTGGGATTCTGGACGTTCCCCGTGGACCTCTCCCACGGCGTC
GGCATCTTTCTTCCCAACCTCCGGGAGCTCACCTTGATAATGGTTGTCAT
AAGCGACGAAGACCTCGACCACCTGATCACTGCCTGCACCGCTCTGAAGA
CCCTAAAGCTCACCGGCATAACACCAAAGCGCGTCCATCTCCGCAGCCGA
AGCCTCCGATGCGCGCTCGTTGGGCTGTCCAGGGTGGAAGACTTCGCGGT
GGTGGATGCGCCACTCCTGGAGCGGCTCGTCTTGTATCTGCCAGGTACTG
TTGTGAGGGTCAAGATTGGTCATGCAGCCAACCTGCGGGTGCTCGGCCAC
CTGGATACAAGAGTTCATCGGCTGCAGATCCGGGACATCGTGATCCAGGT
ACGTCCATACTGCTATCTCTCTCTCAACATTGATCCATTCAGCATGTTCT
CCTCCGAGGATCATAAATCAGTCAATCAGTTATGGATAATATTGTTGGGG
GGTTTTGGTGCACCTCATTAATTGCGGTCTCTCAAAATTATTCCATCCAC
ATACATTGATCCATCCATATCATGATATTTTCTATGATCATAGAAGACTT
GATGAGTAATGATGTCTACCTGTCTTGGCAGTCCGGATTGCAGCCTAACA
CAATGGCGAGCGCAAGCGCTGTGATTCCAAGCGTCAAGATATTGGCTGTG
ACGGTGAATTTCGGTGTCCTCAGGGAGGTCAAGATGCTGGCCAGCTTCCT
CAGATGCTTTCCCAACATTGTCACCCTGCACATCGAGGTAGCTGCAGTTT
CCTTCACTCAGTTGATCATCTTTCCCCAACGGCATCACCAATTTTTAGCA
GCATGATCGATAATATGCATGTAACTGAACTGTTCACACTCATTTTTTGC
AGTCTGCTCTGCATGATCCGTCTGTATCTGCCAGTGCTATTGAGCCCAGT
GGGGAGCACCATGCCACGTTCTGGCAGGAGGTCGGTCCGGTTGAATGCTT
GAGATCACACGTTCTCGGGAAGATGGTCATCCACAAATTCCGAGGGGATC
AGAACGAATTCGAATTCCTCAAGTTCGTCGCCACGAATGCCCAGGGGCTG
CAGTCTCTGCATGTTGTGTTGCAAGAAGGAAATACTTCTTCGGGTGACAA
GGTGAATGAGGCAAAAGGTAAATTGCAGGATCTACGGTTTCAAACAGGGA
TCTCTGGGGTGCTGCTGGTGTTGCCTAAAGAGGGCATCCTTTCGACCTTG
CAGAAAGCAACTGATCTTTCTTTCGATGACCCTTTTCGCTTCTGAATGCA
CGGGTTAATTCACCACATGTTCACATGGTTGAGCCACTCCTGTTTGGGAA
CCGCTGACTGTTCTCTGCAAGATGATGTTGTTTAGTTTGTAGGCATGCCT
TCTATTGAGATACGGCTGATTTCAACTAGTACCATGAATGGATATGCAAG
AGTTGAAGCTAGCAGAAGTACCCAAAATACTAGTAATGTTTCTGAATATA
ACCGCCTTGTGTTGTGCAATATCCATGTGTTGGTATTATAACAGCCATGT
GCTTCTGAATATAGTGCTCTGTTTTGTAGCATGCCTGCGGTGTCATTTGC
TTTGCTTCTGTCAATTCAGTTCATTATCATCAGATGTTTAGGGTATGCTG
AGCTTGTTTGACATGTTACCTGCCTCTTCTCTGTGCATTATAGTGACCAG
GAGGACCAGGATTTGTTCCATTTTAATTAATGTACATCAGCTTTCATAGA
CAGGATCAGGACGACAAACGGTTGGCATCCCCCATGCCTAGTTAACTTAC
TATTGTCGATCAGAAGCTGATCTTCCGTAGCTGTAAGTACAACTCTCCAT
TCTCAAAGATGAATCCCTGCGTGAACAATCGACTGGGTATTGTGCTTTCT
TAGGGCGTCTGTTGCAAGTGAGTAACTTTGTGCTCGTAACACTCGTGGGT
GTTTTCAAGCATCCGAGACGCAAGTTTTCTCTTCTTTAAACTAATGAACT
GTTGTATTTTTTTTTGCGGGGGACTAATGAACTGTTGTAGGTTCACTAGT
GTCTGCAAGGAATATTTTTCTGCACAAGTGGCTCCTGACACCCTGCCAAG
TGAAGCTGCACACATACTGGCAAATGGAAAGGAAGCAAATACAGTACTGT
ATATTTTTCTGATGGTGCTGTCTTTCTTCAGGCTAGCTCTTTCCCCACTG
ATTTTGCTCTCCAGGAGGAAACACAATACTCTGGTTCTTGCATAATGTTT
GTTTCTTTACCGATTGCCGAGTGCTCGAGGAGGTGACGAAAGTTGTCAAT
CTTCCTTCTAATCATGGACATTGGTCCTTGTTTTCATGAATGCTACGGCT
GCAGGATCAGATAAGGTCTTTAAGATTCAGAGATCCTCCGACAGAAGTAG
CTCATGCTCTCGCCAAAAGAGATAGTGGTAGAGATCCACCTGGCGATTCA
TGTGATTTTCTGTGTAGAAATGCACATGTCTGCTACATGTCGACCTGTAG
TGTGAACTTGTACTAAAAGGACAAGTTGTGCGGTTCAAATGCAGTATCCT
GGTGGTCGTAAATCCTCCTGTTCTCACCGCCCCTGATTGTGCTCTCCAGG
TGGAAGCACAATACTCTGGTTCTTGCATATTGTCTGCTTCTTTACTGATT
GCCAAGTGCTAGCGGAGGTGGCGAAAGTTGCCAGTCTTTCTTTCTAATCA
TGGACATTGGTCCTCTAGGCCACTGCTTGCTGTTTTCATGAATGCTACGG
CTCCAGAATCAGATAGGTCTTCAAGATTCAGAGATCCTCCGACGACAGGA
GTCGCTCATGCTCTTGCCAAAAGAGCTTGCGTTAAGAGATCAGTCCGACT
CATCTTGTAGTCTCAATACAAGTGCTGCTGATGACATGTTCTCGACACGC
TGCTCTGCAGTTCTGAACTTGTACTAAAGTAACAAGCTTTGCTGTGCAAA
TGTAGGAACTAAAGTACATGCTTTTTTTTTTTGAAGCTGATGTCGTACTG
GCAAATGGGAACGGAGCAAATCTAGTTGCTAATATTTGATAAGCCCTTTT
ATCAGTGGCTGTGCACTGTTATGTGCTGTATTGTTTTTGCTAATTAAAAG
CTGCTGGGAAATTTGAGTCTCGTTCCCAAAGAGTTGCTAATTACTATACC
ATAATCTGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.