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GrainGenes Sequence Report: AA018818

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Sequence
AA018818
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018818
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGGGCCCATCAGCCCGTCAGACCCGAGCAAAACCCTCGAGTGGCTGCG
TCTACCTCTGCGGCGCGTGCTTCGACCTGACCGCGCAAAATCTCGCATCA
CCCTCCCCCGCCGCCACGAACGCCATGGCCGCAGCGCTTCTGCTCCGCGG
CCTCCGCTCGTCGGCGAGCCGGGCACGCCATGCCTTTCCCTCAACGGCAT
CGACTCCGTCGCTGTTCGCCTCCTCCCTCCCCCACCGCCTATACTCCTCC
GCGGCTGCATCCGCGGCCACCTCGCCCGCGTTTTCACTGGGAGGTGTCAC
AGACCCGACCCGCATCCGCAACGTGGCGGTGATTGCCCACGTCGACCACG
GGAAGACGACGCTGATGGACCGGATCCTCCGGCAGTGCGGTGCCGACATC
CCCCACGAGCGCGCCATGGACAACATCAGCCTCGAGCGCGAGCGCGGCAT
CACTATCTCCTCCAAGGTAACCCTCACTTATTCGCATAGCTCGTGCCTGC
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CCTGAAGGATACCTTGTGTGCATGTCTATGAATTCGAATTAGTGGTTCAA
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CCTATGTATACCCAGTCACTCGCAGCCACACCACACGGCTCTCTTCAGCA
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AGTGTTCCAGTGTACAAATAAACTTTTAAAATACTGGTAATTGCCTACTG
GAAACTATGCTACCATACATATGGTAGATTTTAGGTGTGCCTAGATTTTT
TGTGTAAGTTAGCTCTTGTTCACCTATTCCTATTCTAAGACCAAACACTG
ACTTATATTACCTCTGATCCAAACTGTATATCCTTTTAGAGTTGGGAAAA
CTAAGCATCTATAGCAGAAGCTCTATATTTTTGGCCTCTAAAATCGATTT
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TGGCAACAAATTTCCTTCTCGAGAGCATTTCTTTTGATCTTCTTCATCTT
CAGCCTAGCTGCATCTGCCTTGATTTTGTGTTTGTGGATGCTATCAGCTA
AATGCAGCTCAATTTGCATCTTGTTCAAATCTCTTTTTCCTTCCTCGATC
TTCTACATTGCTTCCTACATATTCTGGGTTGCCTCGTGTGCTAGCTCTAT
TGTGTCTTCAGCCTTATTTTCTTCATCCGATTTCTTCTTCTTGTCGATTA
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TTAAACTCGGCTTTCAAGCCCGCAATACCACATCCACACGTCGATTCCTG
TACTTTCTACAAAACAAATCGAATCGGCAAAATTTCACAAAATTCCCCAT
CGAGCAAACCCTAGAAAATTGTACCTCGTTGGACGTCTGCGGGGTCAGTC
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TGCAGGTCAGATGTGCGGACATGTGCCGGCACTGGATGCATGGATGTGTG
CCAAGAGATGTTCTGGGTTGGGTGGACATAGGTCTTCTAGGGTGGGGGTG
GGGTTGCAGCGGTGTATGTGACATCCTGGCCTAGGGCTTAATAGGATAAA
TATGCTTCTCATCCTAACAAGATGCATCTTCTTTTTCGGAAGTTCATCTC
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GTGACCTCTCGGGAAGTTTGCCAGGGTGCACATGAGTGAGGACAAAGTGT
GCTGGGAAGACCTGTGTTGGTCTATGGGGCCAGTCTAAAGATCCTAGAGA
GGAGTAACTACTGTCTTCCCTGGAGATCCGGGAGTTGCTGGGGTGTTACA
TTGGGGGATGTTGACGAGGCCATGGTGATCCAGCAAATGGCTTGCCGGTC
AGTGGTTGAGTGATCGCAGTATACCATTTTACTGCGGTATGTATACTAGA
TTTTATTTATCTTTTCTTTATACATACTGTTTTCTTGGTCTATGGGTGGA
GTGTTCTACATAGAGGTGATGGAGTATTCTCTTAGTTGTATGACCATGCA
ATAAATTACTCAGATTTTGATAGCTGAATTTGGACTTTTGATTGCCATGT
ATTTTTTAACGCATTTTGATTACCATGCTTGTAGAGCTAAAATCCGTTGA
CATAAGTTTGGATATGTCGTCTGCAACTTTGTTGCAAACTATAGTTAGAA
AGGGCCCTATATAGCCAAAATAGCGTAACAATATTTATCTACCATCTGGT
TATGTAGTCTAGGATTTAATAACTAATAAGCACACCTAGATTGTGGGGGG
CACATAATTTGCTATCTGCAAGTACAAACCATGCATCGATGAGCTTGAGG
AGCTTTATTGGCACTTTAACAATCATAATACTATGCATATAAAAAATCAG
AAAGAATACCTTTTGCAACTTGTAAGGTACCTTTGGTGTAACGTTCCTGT
AAGATTTAACTGAATAAAATTACAATAATAATAATTTTTCTTATAAACTG
TAGCATTAGGCCCATTTATTGTAATTATCAGCGCACATCTTGAGAAACAT
TTTCCCCTATAGATTGTACGGCAACATACGTGACATTGCTTGTTTCCTTT
GGCTATATGTTTAGGTCACTTCTGTCGCCTGGAAGGAGAATGAGCTCAAC
ATGGTCGATACGCCTGGCCACGCTGATTTTGGTGGTGAAGTAAGCACTCT
TGATATAATTTTATGCATATACTGATGAAATCACGATTTTGAGGTGGTGT
TTGAGATGGCTATTGCCTTTTTTATAGGTTGAACGAGTTGTTGGAATGGT
GGAAGGGGCGGTCTTGGTTGTTGATGCTGGGGAGGGACCTTTAGCACAAA
CCAAATTTGTGCTTTCGAAGGCTCTGAAGTATGGTTTGCGCCCAATCCTC
CTCCTCAACAAGGTTGATAGGCCTTCAGGTCTGCTTGTTATCAGAAGTTC
TGTCCATTAAACAGTATTCCTCGACTCGTGAATGCAATGGATGAGTTTGG
ACACAATAACTAAAGTAATCAATTTATTTATAAAGAGCAGAACCATTGGG
TTCTTCAGCATATATGCTGTACTAGTTTGTCCAATTAAACTAGATTACCG
TATGAACATGTCCATAGGTTGAGTTGCTATAATACAGATAAATGCATGTT
AGGTGCATGCGAAGTCAACTTAGAGTGGCTGTAATTTAGTGAAGGCATCT
ACAGAGATATATACAGTAGTTCCCCCTACACTCCACCCCAAAAGTGCTGA
TTACTGGCTAGTTAGTCACCAATCAACTGTAAAATGAGGCTACAAAATCA
TGACTTTTCCTATGTTAACTAACTCCACATCATTGGAACCTAGAAGACCC
AGTCACAACTTTTTCATACAACTAAGAAAGCTGGCATATTTTGTCAATCC
TTTTTTTTGTCAATCCTTTTGTTCTGCTAGCAAAGTATTCTTTCTCCATA
AGGTAAAAATGCCAATTGCAGATGGGATACACATGCATTATTTTTTGTCA
TATATATGTTCATTGTATTTCTCTCTTGTGACTAATTAATGCCACAACAA
CAGTTTCTGAAGAAACCTGCGACGAAGTTCAGAGCTTGGTCTTTGATCTT
TTTGCAAATCTGGGTGCTACAGGTGCATTTCTAGCAATTCAAATTGGTTT
TTCCTAAACCTTATTTTTCTTTGATAGTGACATTGTTTTTTTTGCATGTT
ACAGAAGAACAATTAGATTTCCCAGTTCTTTATGCATCAGCTAAAGAAGG
GTGGGCTTCCTTGGAATTCACCAAGTGCCCTCCTGATAGTGCAAAAAATA
TGTCTGCATTGCTTGATTCCATTGTACAACATGTTCGCTCCCCGAAAGCT
GACCTTGAGGCTCCGTTCCAAATGTTGGTGAGTATACTGAGCAAAATCAG
AACAAGATTTTTGTTTTACACGAGGGAACATTTTATATTTCATTGTTATT
CCTCAATCCATGTTTTTAAGGCATATAATTGAATGACAGACTATTAAGGG
GATTGCATTTATTTTCCATATGAAACATCCATGTGAATTAGCAACTACAA
CATGATTTCTACCTTCATTTTTGGATAATATACAGTTTTGGCTTTGGAAA
ACTAGCATCACTTGGTTTGCCTTGCTAACAAAGCAGAAGTATGAGCCTGT
GTGTGGTTTGTACTTTATTAATTCTGGTTTCATATGACAGCCGCATGACT
TGGTGCCAAATACAAGGCATGACTCGTATGGTTTCTTTTATGAATTTTGG
TTCTTTTAGTTGTACCATGTTGTAAAGTAGTTTTGCATCTTAATTAGACC
TGAGCGAGATCATACTAAGCTAAATTATAGTACATCTTGAAAAGATCCAA
ACTAGATAGCCTCCCACTCAGTTCAAACCAATACACCGGGTTAATCAAGG
CAAGCCTGGATGGATAAGTTAATTATTGTTTGCCAGCTCGTCTGCTACAG
CCTTGAAAAGTGTTGATTTTTCTCGAGTCAGCTCCATGGGGTGATACAGG
TTAGCCTGTATGCTAACCTCGACATGGCTTAGGTAAAATCACTAGGCATG
CTGCAGCAGCCATGATAAGGTTGATGTGCACATTTACCTTCCTCTCAGCA
ACGATGATAATGTTGATGTGCACATTCACCTTCCTTTCAGTAAAATTGCA
AGAGAGATATCTCCTAATATTTCTTGGTTATAGAAATGAATATGCTGAAG
ACGTCAATACAAAAGGTGCTTGATATGTACTTGTTTATTCCTTTTCTGTT
TGGTCCTTGCTTTGTTCAAGTACCAAAAAAAATTTCTTGGATGATACAAC
ATTAACAATGGACTGTTGAGTAGTCAACCTGAGAATGGTGCGGGTTGTGC
TGCGGCTTCAATTTGTTTGGGCTGAAATGGTTTCAACAGCTTAGTGGATC
GGAGAGGTGCGGGCTTCACAGCAAAGTGGATTGGAGCGGTGTGGCTCGGG
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CACACGTTTGGGGGCGACAACTTCATGCCTCGAGCCCTGATCCCCCTCCT
TCCTCCCTTCGTCTCCATGGCCAGCGTGTTGGTGTCCCAGCGACCAGCGT
ACGTCGCTAATGAAGCATGCAATAAAGACCCGGCTGAACCCGGGGGTTCA
GTCCGCATTGGCATGCGGTGCGGTGTGGGTGAGGTTTAAAATTTCTCACG
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GATTAATTACGTACTCCCTCCGACTCATATTAATTGACTTGGATTTGTCA
AAATTTAGATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGTTCATCCAAAATT
TGACAAATCAAAGTCAATTAATATGGGCCGGAGGGAGTATTAATATTTGG
TGTGGACTGGGTTCAGGGTGGATTCTACCCCATTCTCACCTTGATTGAGT
AGTAGTTGAAATGGTGCAGTTAACTTATTGTCCATGCTTCATGTTGATAG
TTTAGTCTCTTAAGATGATTTATGGATTTAGTCATTGTTAAGGAATGTGT
ATCAGTTTGTTTCATTACTTTTTTGCAGTACGATATTGACTCTCAGTCTT
TCACATGTTCATATTTTGGATTTCTACATATCTCGTGATTTCTTGTGCTC
AGTTCATATTTTCATTATTACTTGTAAAGATTCGGTGTTTGTTCCATGAT
CATAATAGCATGGCTCAAGCTGTCATCTATGTGATTTCATCTTTATTTGA
TATACTTGTTTGCCATGGTAGCCATGATAAAACCACACATAATGGTAGAT
GTATGGTAGCTGTGCATGTCGTAGGTGTGTAGGTGTTAGTGACTACTCTG
CTGTTGCCTTGTACATGTATATAACACTATGATAATATGTGATAAGTTCC
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CTGAGACAATAGTAATTGCCAACAATTAAACCATCTGGCACAATTTTCAG
TGAAATCGCATATGCATTGTTCCCCAAGAAGTAGTCAAGTATTTTAATTC
GTAATTGCAGAAATTGTTCTTTTCCTTCCCCATTGGTAAGACATTTCCAC
AATATAAGTCTGTGTGAATCTTTTCTTGTTTTCAATATGCCATTTTACGT
TCTACAGACAGTTCCTTTATATCCTTACATCAGTTATTTTTCTATAGTGC
TCCACTAAGCATGTATCTTGCTTCTTTCGAAACAATGGGATTAAAATAGG
CTGCACCATCTAGCATTTATCTCTGTTTTGAATTTACAAATTCAAATACT
CACCTTTTAGCTTTTTCAAAAATGCATGTATCTAGAAGCGTTTTACGGTG
TAGGTTCACTCATTTTGGTCCGTATCTAGTCCACTTTGAAATATCTAAGA
TGTCTTACATTAGTGAACAGAGGAAGTAACTTTGTAATAGTCACTCTGAA
GCAGAGGTATTCATGGTCTTCTACAGGTTTCCATGATGGAGAAGGATTTT
TACCTAGGAAGAATACTCACTGGGCGTGTAACCTCTGGAGTTATCCGTGT
TGGCGACAAAGTTAATGGTCTGCGCAACTCGGATGAAGGGGTTCAGAAGA
TTGAGGATGGAAAGGTTTGGCCGAACTTACTGCACATTTTCTCTTTGGTG
CCAAACCCATTCTTTATCATTCAATATGTGTTAGCTATTGGATTTGTTCA
AAACCTCAATGACCTTTGTATATTGCAAAATAAATTTAGGTTGTCAAGCT
CATGAAAAAGAAAGGCACAAGCATGGTAGTAATAGAGGCTGCAGGAGCTG
GAGATATAATTTCAATGGCTGGATTGTCTGGTCCAGCAATTGGACACACC
GTGGCAAATCCGGAGGTAGTGATAACTCTATGCTTTCATTGGGCTACTTG
TTGCTGAAGCTGAACACATTTTCATTTTCAATTGTCGGCAATTTCTTAGT
TTTCACATGTGAATGTGATTGTTATTTGTAGGTTTTGACTGCGCTGCCTG
CAGTTGAGTTGGACCCTCCCACAATATCTATGACTTTCGGTGTGAATGAT
TCACCACTGGCTGGCCGTGATGGCACTCATGTAAGTACCAATCAACTGGT
CTTTACATCAGTAAATGAGTTGCTTTTACTTGATCCTCTTTCTTTTTGAG
CGAACCTGAGTGACCCTTCTATTTGACTGACTAAACAAAAAAAGAGGGTA
CAAGATCAGAAATAAACCTACTGGCTCTGTCTACATTACTAAATGAGCTC
CTCTTGGTCTTCTTTCTGAGCAAATCAGAGTGACTCTTTCTATTTGACAT
GTCACAACAGTGGCATTTGGCTGAAAATAAACCAGATTTCAAAATTTTGT
ATAACACATGCACTAATATTATAAAATGGCAACAAGAAATAATAGCTGAA
AGCTGATGGTGTGAAATATATCATGCCCAAACATGTACGGCCATTAGTCC
TCTGAATGAACGTCTAAATTGGTAGGTGTGAGTAGGGGGATAGTACCATT
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TTTTTTTGTTTATAATGTGCACTATAATATATTTGTAAAGTTCCTTGGCA
TTTGTTGATGTCTGGCATAACAAACTTACAGCAACACCCCTTTTATGTCA
TCATGTGTGAAATTTTACGAGGACTTGATGATCTCATTGTTGCCATTAAC
ATCACTTGTGGCAATCTCATTTGTTAAATGACATAGATCCATAGATCCAA
TATTACCTCTATAGATCAGCTTCACATGTTGCTGGTGCAAACTAAAATGA
ACTGGAGGGAGCATAATCTATCAATTTGTAGGGTGACATTTTAATGTATA
ATTTGCAAATTTTGAACCAGGCATATTAATATGTACTGAATGGTTTTGCA
CATCACTAACTTCTCACTTGGCTTGAATTTTAAAACTATGTAGGTAACTG
GAGCAAAAATTGGGAACCGTTTGATGGCAGAGGCAGAAACAAACTTGGCA
ATTAATGTTCTGCCTGGACAATTGTCAGAATCTTTTGAAGTTCAAGGAAG
GGGAGAACTTCAGTTAGGTGTGAAACATTGACAAAATCCCTCATGTTCTT
TTGGAAGATACCGGCTAACTGAAATTTTATTCAACTCACTTGAAACTGCC
CCATGTCAATCTTCTGTCTGATACAATGAGAAATTTAGTCATCAGTATCA
TACAATGATCTGTGTAACTTCCAGGAATCTTAATTGAGAACATGCGGCGT
GAAGGATTTGAACTTTCAGTTTCACCCCCAAGAGTAATGTGAGTTCCATT
TATTCACACATATCTCTTGTTCTGCATGCGAGCACTTTTCTTTCCAAGCT
AACTGTCTCTATCTTTATCTAGATGTCTAGTATCGTATTGGAACATCGAG
CAATTTGACTGCACTGTGTTCACTTTGAGATTGACCAGTTTTCTTCATGA
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TCTTCCTGACCTGTCCATCTAGGTTAGTAGGGACCTCCATTCTCCCAATT
ATTAATCGCATCACTTGTTATCTTGCAAAGCATGAAATACTTGATGGTTG
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ATCTAGATTCGTATGGATCTACACACTAAAACGTGTCTAGATACATCTGA
GTCTAGCCAAATCCAAGTCGGTTATTTCCGTACGGAGGGGGTAGAATATA
ATACGTCTACAGTTATATATTTCACCTCTTAGTTTTATCCTCTAGCAAAT
TGTGTTTGTCTTTGTATGTCAAATATCTCCCACGGTAGGATATACTGTAA
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ATATGCATTTACTAGTTTTGGTCCTGATAATATCAAATGATTTTCTATGG
ACGCAGGGGTTTGGTGGGTCTCAAAGGAATTTTCAACAGCCATACACGTG
GAACTGGATTTATGCATCGTGCTTTCCAGGGTATGATGCTAATTATAATT
CAGTGTCACATAATGGTTTAACTTGTACATGTTATCTGTAGGTGGACATT
AAATTGCATAGTTAGGTTATGGACTTCTAGACTTGAAGTGCATTGATAAT
GTTTAAAACGTGAATTCTTGTCTTGCTAGAGTGGAGAAAAATTATGATGT
GCAGACTTTGCTCGACTTGTAGGTTCCAAATATATGTCAGTGCTGTTAGC
CTCCATGTCCAGTGGATTGCACAAGTTAAAGATCACAGCCAGTTCTGAAA
GTGTTATTACCACTCAGTGCTGTTTACCTTAGCTAGATGTTAATGATCCT
CCTATTTTTAGGCTATGGATTTGCACACGTTTTCCACAGACCATCAAAAT
GTAAATTTTGCAATGACGCTAGAAAAAATTAGTGCGTAGCTGCATTGAAA
TGCAGTTGTTTGTTTGCCTTGCATGCCCTAGCTAGATTTCATGAATATTC
GACATATAATTACCCAATGAATGCAGCATATGATAAATACATGTTACTAG
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ATACAAAGGTCAACTAGGAACTGTTAGAAAAGGAGTTCTGGTAATTCCAA
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TTGAACCGGAGGAATATTTGTAATCATATACTATTACTGAGATCTGTTTC
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TTAAGATTTCTGAACAGTAGCTATGTCATGGTCAACTCTACGAGCAGAAA
TTAATTGTTCCTGTGTTCATATATAGGTATCTGTTGGCAAGGGATCTATC
ACTTCACATGCACTCATGAGTTTAGAAGCTCGTGGTACTCTTTTTGTCTC
TCCTGGGATGGAGGTAGGTACATCACTCCATTTCTTATAGTGCCTTCTAG
GTGTGGAAGATTACCTTAACCCTCTTCCTTTCTTGTTGGCAGACATACGA
AGGAATGATAGTTGGCGAGCATTCGCGCGATAGTGATCTTGAGGTAAGTT
GAGTATTTACTATGCATGAATCAGTTTCTGTCTGTTAATACATGAAATTA
ATGTTGTTGGGCAGATCAATCCTGTGAGAACTAAAGAACTTACAAACATC
CGAGCCCCAGGAAAGGATGAAAATATTCGCCTGTCTCCACCTCGCTTGGT
ATGTCCTTTGCTCATTTATGAAGACATCTGCACATTTTTGTGCATAGGAT
ATAGACACACCATACGGCAAGACCTAATTGACAACCATAGTGGCCGTACT
TTCCCTTGATTTTCAGAGCTGGGGTCTGATACCTTTAGATAGACCCTTAT
GTACAGAAAAAGTGTAGCTTTCCTTCCTTATTTAGGTCCAGTTCTTTTGG
CGGCTTCTCGGACTCTTGAAATGCTCATCTAACCAAACACCGTTGTTGAC
CATGCAGATGACTTTGGAAGAGGCAATTGGATATGTTGCTGCAGATGAAC
TGATTGAGGCAAGTTTTGTCTTCTGCAATTCTTCAAACATTTTTAGTGCA
AAATTTCTACTCCGTACTTGATTCCGTTTTGTGAGGATTGGGGAGTGTGG
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CTCTATGGTCTGACAAACAATGATCCTGCTGGCTGATGGCATGCGATATT
ACTTCTATCAGATAAGAGTAAGGCCATCAGTCATGTTACAGTTAATAGTG
ATAGTATAAACGATACTGAAGGTAAAGAAACAGTCAACAATCACTTACCA
TGCAGTTCGGTATTAGTAAGTTAGGAGCATGCTTTATAAAAAAAATTATC
TGAATGAGGGAAGTGTACTTTGTGTATTTAAAAAAGGTAAGAATACAACC
TACAGGAATATATTTTACTCCCCCGTCTTGAAAAGGATGTCTTAGACTTG
TTAAAATTTGGATGTATCTACACACTAAAATGTGTCTAGATTCATTCAAA
TTTAGAAGAATTTGTGACGTCCTTTTTAGGACTGAAGGAGTATATGCTAT
ACGGTGTTGGTGAGTCAGTGCGCATTCAGATCCAAAATCTCTGTTCTACA
TATTGCTTGCTTTTGTGATGCGTTGGGGTGCAAATTAGTCCAAACAAAAA
ATATGGTAAAGGAGTGCTCGTCTAAGTGGATATACATTTGCCCAAATTCA
TATTCCAGTTTCATTCCGTTAGCAAGTTCTTGTATTATGCTGCTTTTTAT
TGAGTTGCTGACATTTGAATCTGATCAGGTTACTCCCAAGGTCATAAGGC
TTCGGAAGAAATACCTGGATGCCAACAAACGCAAGATGATGAAAAACAAA
ATTGAGAAATGAAGCCCAGTGGCTCCATATTACATCTAGTACTGCTAACA
CCACTAGTATTACGCCGTCGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.