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GrainGenes Sequence Report: AA013705

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Sequence
AA013705
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013705
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAAACTGGAACGCGAGCCGCGAGGAGATGAGAAACCCCCTATCGCCG
GTGTCGGCGGCGCCGCTGGAGAACGACGACCTCCTCACGGAGATCCTCCT
ACGCCTCCCTCCACAGCCTTCTTCCCTCCCTCGGGCCTCCTCCGTCTGCA
AGCGATGGCGCCGCCTTGTCTCCGACCCCGGCTTCGTCCGCCACTTCCGC
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CCTTGCAGCTCGACCGCTGGCGCGGAGACGACCAGTGGTTCAACACCCTC
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TGTATCGTTATTTTGAGCTCCCTTAGTTGAAGCGGGTGGTGTGCCTCCTC
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AATATGCACTGATACTACATCAAGAAAAAGTGAAAAACTAGCTTGAACCA
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AGATGTCGTCACTAAGTATTTTGAGATTGAAAACATAAAGGACATTAAAT
CCTCCTAGTCCAATTTTGAAATTGCATTGAACTTATAATATTCACAGTAC
AGTTTGTCACACTCAATTTTTAACTGAATTTTACATATGGGCTATATATA
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TTCCATTACCTGTCTTGGTCTCCCTATGAGCCTGTTGTGCCATCGCACTT
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ATCCTGCAGCTTCCTCTCTTAAGGAGGAAATCATGCTCACAATGAGGACA
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CTCTTCCGTTTCGTGTGCACGGGGAGATTGACCCTCTCTGTTGCATGCGC
CGGAACTGCGGAGTGGAATAATCAAACGCTTAATTTGCTGATTAACCCGC
TTCTATGTATTATCTGGTGATGCTGAACATTTAACTGCACCAGCCTTTCC
TAGTGCCACTTTCTTTTTTGCTTGCTCTGTCTTTGAGATTCGATGACTGA
AGGATTCCTTGGGTTAGCTGGCCCCTGATATATTTCGTATGAGTTACTGT
GATCATCCTGACAGGGATAGGCAAATCTTGGCATGGATTTATTTTGCTTA
GAGATTCACAAACTTCTGCTAAACAAGTTATGTGATGGAGAAATACAAAA
TATGCAGTTGGTGCTTATAGCTTTCTAATCCCATGGTGACAACTCTGAAA
GAGGTGCATATGCAGGAGTTTGACATCTAATCACTGTAATCTTCGAAGTA
CGGTGGTGCCCTTGGTCATTTGAAGGTTCAGCTCCTTCATCTGCTCCGCC
CTACGTCTCCCTCCTGGCTGCTCGAAGCTCACCTTCAGAATGTCTGCCTT
GCCGAATCCGCTGACGAAGCGCCAGAAGAGCTGACACGCCTCGGCTTTCT
TCTGCCGGCCGCCAGCGCTGCAGGCGGGGAAGAAGTCCAGTTCGAAGTGC
AGGTCTGCCGTACCATGCTCGTCGACGCCGGCGGAGACACGAGCGTGAAC
GGCTGGAGGGACTCCCTGTAGGCGAAGTGCCGTAGCGACGTCGCTTCGAG
CTCCAGCTCGCACCACAAGCCGCCGAGGTTGGCGAGCGAGAGGGTGGTGA
CATGCGGGCAGCGGAGCCCTTGTCCGCCTGACGAGAGGCTGACGTCGTCG
AGCTCCATTGTGGCCAGAAGCGGCGAGGCGTCCACGATGGTCTGGAGGTC
CGTCAGCCGCATGTCGCACCGGCGCAGCCGCAGCGTCTCCAGCCGCGTGA
AGGACGGACTGTGTGCGTGCGGAAAAGGCTTGAGTTCCAAGCCGTCGAGG
TGCAACACACGGAGGGCGGCGGAGGGAAGGGCGGCGACGCCGAGACTGTA
GTCGTCCGCCGGGGAGACGTGGACGCGGAGCTCCTCGACGCCGCGCGCCG
CCGGGGCGCCGGTGAGTAGGGCGTCGAGCCCGTCATCGATGTGGCGCCGA
GACCAGTAGGCGTCCTCGTCGTTGTCGGGCGCGAGGTAAGTAAAAGTGAG
CTTCTTGAGTTTGATGCCCTCCTCATCCGTGGCGTCGGCGATGGCGCGGA
GAGCGGCGTTGGCGTCGCGGATGAAGACGAGGCTGCGGCTGTAGCGCATC
TTGCCGGGCCCATAGGAGCGGGAGTCGAGGTTGAGGACGCCCGACGAGAG
CCACAGCGAGCGCCATGACCGGGCCAGCGCGCCGGTGCACACGGCCTCCT
TGGCCGGCGCGTGGGAGAGGACTTGCCAGAGCACGGGGTCCGGCAACCTG
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GGCAAAGGCGATCGCTTCTCTGTGGAATTTTTCTTGCAACGTTGGGACAG
CGCGCGGCTGGTGTTGAATTCATGAACCTAACCTGGACAGCAAACGGAGA
GCCGGACACCCAATCGAGTTGTGATCGAACTACACCAACATTGGTGTGCG
CGATGACACGCGGTTACGCGTAGATCCTACCATCTATAGGAATTCCAAAA
ATAGCAGAATTTTTACCAGCAAGACAGACACAAGGTCAATATGGTAGGTC
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GAACAGAAAAAACGAAATAAAAATACATAGCTTCTAAGCTATGCCTTTCA
AGAAAAGAAACGTGTGCGGCGATAGTGACTGAGTCCAATCATAGGTCGAT
CTAGAGATTTTCATCCTGAAAGCCGAGCTTCGGTCCACCACCATCAACAA
GAACATGACACATTGCGTGTCGATATAGTTTGATTGTGTTAGAAACTATT
AGAATTAGGCTAACTATATGCAGTTAGGATTTTGTCCAACCGTCTTATAA
CCGAGGCGTCGCCTCACTTGTAAACCGCCTCAAAGGTCATTGTTCACAGG
GTATATATATACCCGGACATCTATCAATAAAAATCACTTGATTCATTCTC
AAACACGCTATCGGCACATCTCTCTACCGAGAGCGAATTGGCTAAACTCG
TCGGAGAAGAACAGGCAAAAGGTAAGAAAAATTGCCTGAGACACCTTCGA
CTACTTCACGGGGAGAAGAAGGAAAGCGTCGACGGCGTTCCGCGCATCGA
CGACGTCCGGTCAACCGCGCCCTCCGTGGCTCCTCTTGCGTGGCATGGCG
GTGGCCATCACTCCACCGAAGTACGGACACTTGTCGATGAAGCCACATCT
ACTATCATCTCTTGCCTGGCTGTCGTCATCTCGAAAACCGGATTCCATCT
GAGAAGATGCCAAAAGGAGAAGACGTTCCACCGCCTCGCCTCCACTGTCG
CACCAATTTGACGTCTCCCTAATTGCTACCGTGCACTTGCCAGCAACATT
CATGACTTGGCCACTCCAATGAGACGCCCTGCGTAGCACCCCTTCGGTGG
ACAAACAAGACTTGTCGCGTCCAAGATTCGCCGCCTATTGCCAAACTCCC
TCATTGCCATTGACGACCGTGAGGCGATACGGCCAGACATAAGTAGTTTT
ATATGTAACTTAGCTTCTTTTTTCTGAATGAACAGTACAAATTTGTTTCT
CATTATGTTACTCCCACCAGGTATCCGGAGTTGCGTTCCGGTGGCTGAGA
CGAACAAATGGCTTGTTGGGTATAGATTCTTCTATTTAATCTAGTCCATA
AGAAAATCAACCCTCGTTGAAGTTTGACATGTAGGAATCAATCGCCTAAT
TTGCTGAAGCACCCTGTTAGCTTAAACTCTTATCTGATTCTTCCTGATGG
GATGAAATCATTCGCCGAGTTATGTGCAAACAACATTAGGATGAATTTAT
GAGTTATTTCCTATGTTCACTAATACTCCATATGTTTCACAATATAAGTC
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GGGAGTATAAAAAGTTTTAGCAAATTGAACTGAGAAAGTACTAGCCCTCC
CTGATGATGCCACTTTTAAAACATCTTGTAAAGTGACATCTTTGGCATTG
CTTTTTGTACTGATTATACATAGAGCATGTGGACAAGACTCAAATTAACC
CCAAACACAAGTTGTAGTTCAATCACGCAACATCGGTGGCACCATAGTTA
CACCTGTTATCATTTTCATATCTTCCGCTTCCACGTCTAGTGGCCGAGCT
CGGTGGTGCTTGATGACACTGTCCATCCACCAACGACGCTAGGCATTGCT
GTCTTTTCTGTTTCTCTTCTATTCCTTCTTTTGTTTCTTGTACTTTTCAT
GTATTTCTTGCAGTTGCTTGATGGGAGTACTCTCTTCGTCTTTGAACACA
AGGTTACTTCATATTTTCTGTTTTAAGTTTGACCATTAATTTTACCAACA
AAATTTAACTTACACTCCACAGAAATTGTGTCATAGGATGTACATTCCAG
AGAGCTTTCCGATGATATATTTTTGATGACATATTACTTATATTTTTTGT
TAGTCAAAGCTTGACACAAGTGACATTGTATTTTAAATACGGAGGGAGTA
CCTTTGTTCGAAGAAAAAGTAAGGAAAGGAGCATATCCATCCTTGTTTGT
GTAACATATAAAAATGGAAGTAGCATGAACATTGTCCTCATACATGATTA
TTTTATTTGTCATACATGATCCTTTTATTTGAATGTATGAACACTTTTCA
TGTCACACATAACATGTTTCATGAAATTTATTTCACAATTGTTGAAACAA
ATTTAAAGTTGCATGCAGCTAAAAAAGGAATTGTGGAGTACATGGATTTT
TTATTTAAATAATACATCAAACCTTTATAATAGTGGAACTATTTAAAAGG
AATTGTTGCTCTACCCTCTTTTATGGTAACTTGTATATTTATTGTGTAAA
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ATGCATAGTTTTCTTCACGTTAAGCTTGGAGAAAAGTCAGGTGCTAAGAT
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TAGTTTCTGCACATTATTTATTATTTAGTTGGATTATCCTCTCAAAATAA
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TTTTTTTTGGACAGTGCTAGGCGTCCACCGGGCATAACTCCCCAAAATCT
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CATATAGTAGAAAATGGTTTGGTTTAGAAAAAAATAAACAGACTAGGCCT
CGCCGGTGACCGTGTAGCAAAATTATGCTAATGTAGCATATTTGATCTCG
CCGGAGGCTTTCGCTGGTAGACCTCACCAAAGACCGTGTAGCAAAAATTG
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GTTGTAGCAAATCTGATCTTGCCGGAGATCTTGTAGCAAACCATACATAC
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TGGAACGGGCATGGGGCCGGCCAGCACGAGGTGGGACGGGCGCGGATGGG
GCAGATGAGGTTGCGGCAGCGGCGACCAGAACGAGATGGGTGAGCACCGG
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ATATACGTGAAACATACGGGCATACGGCTGCGCAGTGGGCTTTCTCTTGC
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AAGCCTCTGCCGCCGCCGCCGCACCTCGCCGATGGACGTCGACGACCTCC
TCTCCGAGATCCTCCTCCGCCTCCCCCCGCAGCCGTCCTCCCTCCCCCGT
GCCTCCCTCGTCTGCAGCCGCTGGCGCCGCCTCATCTCCGACCGCGGCTT
CCTCCGCCGCTTCCGCCTCCACCACCGCCGCAGCCCTCCCCTCCTGGGCT
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CCTCTCCCTCGGATGCCGCCATGGCCTCGTGCTGATCTACTACTGGAAGC
AGCGCCAGGTCATGGTGTGCGACCCCGTCAATGGCGCCCAGCACCACATT
GCCCTTCCCCCTGGGTTTGACATGTTGGATGTCCCGATCCACATCCAAGG
GGCGGTTCTTCGCGCTGCCACAGACGTCCAGCACTTCCAGGTGGTCTTAG
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GTCAATTTTTTATAAAAGCAAGCCCAGTATGCTGGTTGGGGATTCCCTTT
ACTGGCTGATCACTGGGGATTTTGTTCGAATTATTAAGTTTGATCTGGAG
AGGCAGAGCTTAGCTGTGATAGCGGTACCCATGGATATGCATGTCCGGGA
ATATTTCCAGTGCTCTATCATGCGGGCAGACGATGGTGGCCTCGCATTCC
TCTTTCTGTCAGACTTCAGCGCCCAATTATGGAACAGGAAGACCGATTCT
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CATTTCCTTGAATTTACATGAAGAGAAGGCGCCCCTAAAGATTATAGCAT
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ATGATCCAGCTCGAGCCATTGCAGTCCAAGAAGATCTTGGAAACCAACGA
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TTGCTGCTTGATGAACTCTCCAACATATAGCGATGTTGCTCTGTAGTTTG
ATCTTTTGATACATGTGTGCTAGCGTTCTATGTGATGTTTATGACCTGAA
AAAAATCTATTAATTCTAGGTATTGCCCCTGCTTGGCATTTAATGTGTTC
TTCTTCGTTAAAAGTTATATAGTAATTTTGATATTGCTTTATTAAGTTGT
CGGGTGTGCCTCTGCTGTCAAAAATCAAAATTATGAAAGCTATGGTGTTG
TGTAAGGTAGCAAACCGACATCCATAGGATAAAACAATACAAACAAGCAA
TGTAGATATTTTTAGTCATTTTTTGTATAACTAAATTTGTTGCCTGCTTG
TTGGAATATTTACTAGTTGTATAACAATGGTAGTACTAGTGTATTGCTGC
AGCGGGGATGTTTCCCGAGATGAGATACATAACAGTGGGAAATCGAAGGT
AACAGGGGGATGTTTTTGCCGGGCCAGATCTGGGCCAGGCGGGCCTGGAT
CTGGCAACAACCTCGCCTAGGTGCCATGTTTGTCCCTCAGCACCCTTGCG
GGCCCAGGTGGTGATCCTCGGACCGGCGGCGGTCCGGTGTTCCCGGGTGA
GCGCGGTGATAGTGGTGCTGCTAGTTGGCGACAGGGATCGACGGTGGTGG
TTGATCCCCTGGTGGACGGAGAAGTAGGGGATAGTGTGAGGGTTGGCTTG
GACGACGGTTCCCCTGCTGCAATGCGGCGGCGGGGCTTCACGAGCCCCTG
TGGGCTCGGCCGGTCCAGGTGGGCCTGGTTTGCCTCCGCGGCCGTATCCG
GTTGGCTACCGCCTTCCGGTGGTGGAGGTTGTTCCCTTCCGCGCGCTGTT
GTTCGGTCAACCCCGATGTTTCTGTCCTCTCTTTCTTACTGGCCCTGCTG
CGTGTGTCACGGTGAGACGGTGGTGTTGGCTGTGAGATCGTGTTTTGGCG
TGTGTTGGTGGGTGGCGAGCATGGTGGAGCATGGCAAAGCGTCGGGGAGT
ATGGGATTTTTGAGGGGTCAGGAGAAATCCTTGTCACCTTGACACCGACG
CGGTGACGCCGGTGGGTTTCATCGTCCTTCCTGAAGGGCGTCAGGAGTAC
CTCTTCCCCACCTCCCAAAGCGTACTGGGGGAAACCCTAGGACCTGTCCG
GGCACCAGCGTCGTCATCGTCGCCTTCCTTCTTAGAGGTGTTGCTTGGTG
CGTGGCGCTTCAGAGTGCTAGGCATGTGGTGGAACGTAGCTGGAGGGCGC
CATGGTCATGAGTCATCTTTGTTTTCGTTAAGCCACTATTGTCGGCTTTG
TTTTCTCTTCTTTTTCTTTTTCGTTTTCTTTTTTGTTTCTTTTGGGCGTT
GTGTTGTCTGGCCCAACAGCGGTCTCACCGTGGTTGCTATATTTATATAG
CTTGGCGTATGCCTGTTTCGAGAAACTAAATGAACAAAAAGTCAAAAACT
AGCTTGAACCAAATGAAAGCCCAAATAGATAGCTTAATTGGTTGGTTATG
TTTCTTTCAGTTTATATTGTTAAGTTTGTTGATCTTGCTAATAATCTTAA
GTTCATAACAATGCTGGTCTGATACTTACAAAATACTTGTTCATATTTAC
CTTTTATTACTTCTAGAAGAGTCCTGCTGCAAGTGGCAAAGTTCAATTGT
GCCAGAGAAAATTAGTAATTGAGTTCTCTTCGTATTTTTCAAGCAAGTTT
ATTCAAATATAATCTAAATATGAATAGTCGTGATCAGATTGATCGCTAGA
ATTTATTGGTATGAGTATATTTTAGTTTGTACTACCATATGGCATGGAAC
AAGCCTTAAGAATAATTTTGGATAACTTCTCCCGTCCATTCGGCTAATAA
TCTGAGTGTACGTGTTCTCCATTTTTACGATACTATTGAGCAAATACTGT
TGTAAGGATATTCTGTTTATTCGGTAGTAGAATGGGCTTTATTTATCTAA
TCCCAATGCTATCAAATCTGAGCTATTTTTTTATTATCACATACAGATAT
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CTGAAATGATAGTGATTCTTTGACTTATGTTTGTAGATACTAGCATTGGT
GGTGGTCGTGATGGGGCTGAAATTTTGCACAGTACATAAGATGATGGATT
GAATAAATATGATATCATGATGTACTGGATTCAAAAGGTAAGCTTATCTT
TAAATAGTAGCAAAATGAATTATTTTCCATTTACTTTGCTTTGTGGATAT
TTTTCTGTTTTACTTATTCTAGTTGCTATATTGCACTAAATATTTTGTTG
CTATCAATCGATCAATTCAGATTGCGATTTTTATGTTGTTCACTCTATGC
AAGTAATCGATAACTCAACTACTATGCATTAAATAAGGAAGTAGAAATAG
CATGGTATATTTCAATAAAAGCGTGACCGCAATATCTAATAAAATGTGAA
AATCTTCTGAAGGAAATCGATGATAGTAATCTTTATATATCTAATAAATT
TCAGGATGTCTAATTTATTTTGGCTGCCCTTACTGTATATGAGATTGAAA
ACATGCAAAGCAGTAAATCTTACAAATACAATTTCGAAATTATTTTGAGA
TTCTGATTACCATGGTATTCCCTAAGACCATTGTTAAAAGAAAACTTCTT
TCAGGAGTCACCTCAGATACATGATACATCCCTTATGTTCTGTTCATTCA
GACCAAAGTCCCTTAAGCAAATATCTTCTGCTTTGAGAACTTTTGACTTG
ACCACCCAGGCTTCTTAGATGTGTTTGAACAATCTTCTTAGATGTGTTTC
AACAAGCTTGAAGTTTTTCTATTTGTAGTAAAAATAAAGACGGTGGCAGC
ACTTTGTACTAATTTCAAAAGCATCAGAAGAGTCTTTGAAATCCGAAGGA
GAAATCTTCCCTGCCTCTTGTTGCTGGTTGCAATTTGGGTAGTGTCGACC
TTATAAATGGACTTGAAGAACAAACCCTACGTCCGTTGTAGAAGGGAACT
TCGGAGGAATCATTCACATTAACGGACTCCTCCCGTACAAGCAGCTCTAC
TGGAAAAATAGATGCACTATCAGATTAGTCTATTTCAGAGATGAAACCCC
GAAATTCTTTCATGTGGCAGCCAGAAGAAATTTCATTCCATCTCTTGCCG
ACTGACAGGGATCCTCAACTAATGATCATGAAGTTAAAGCTTCTACCATC
TGGATAACGTTCAGTAACAGAGTGACTGTCGTCTCGGCCGAATCCCACAT
GTTAATTAGTAGACTTTTCTTAATTTTAGTCTTAAAAATTAGTACATGTT
GGTTGTAGTTTAGCTACTCGGCCGGTGCTACAGCACCTGTAGCACCAGGC
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CCAGCCCGCCGTACCAGCCGCCGAGGTTCCCGAGCGAGAGGGCGGTGACC
CGCGGGCAGCGGAGAGACGAAACCAAAGAGAGGTGGACGCGGTCGAGCTC
CAGGGCGGCGAGCAGCGGTGCGGCGTCCACGATGGCCTGGAGGTCTGTTG
GCCACACTGCGCACCGGCAGGGACGTATCCAGGATTTGAGCTTTGGGTGT
ACAAATTTTTAACTAACACAAAAAGGTCAAGTGATAACATAGGTAAAAAT
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ATATCTTAAAAGGTGACAGAGATTACATAAAGTAAGAAGAAAAATAAAGT
TTTATTGATTCCACCACTTCAATGCCACCTGTCCCGTGTGGTTTTGTCAG
TCCAATGTTTGGGTCATCTTTTCCTTGAATAAAAAATGTGATGATTGAGC
CTATAAGAATTTTTATTTTAAACAGACAAGGAATAAATATCACAAGATCA
TCACATAAATTTGTTAATGGTAGAAATGTTTCTTAAAAAAGATATACAAG
GGTTACTGCATAATTGGCCGCTTACAACTTAGGCTGCACTTTTCTCGTTC
CGAAATAAGCGTCACAAATTTATTTAGATACACATATAGAGATGCACACT
AAAACATGGCAAAATGCATGTGTATCTAGACAAAACTACAACATTTATCT
CCGAGCGACGGGAGGAGTAAACTATAGGATTTTCACTTAGTTTGTGGTTG
GGGAAATACTATATACGTTAGAGAAAATATGCTACTACTGTTGTATATAT
CCACCATACAACTATATAAGAGTTTTTTCGTAAAAAACTACTTTCTCCAT
CCAGAAATAACTGACTTGGTTTTGTCTAGATTCCAATGTATCTAAACGCA
TTTTAGTATATAGATACATTCGAATCTAGACAAACTCAAGTCAGTTATTT
CAAAACGGGGGGTATATAAGAGTTTTTTCCTAGAAAAAATTGGGTGTACA
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CAGCGTGTAAGCCGGCGGCGCTGGCAAGTAGCGTAGCGGTGACGGTGGCG
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ATGGCGATGCGGAGTTTGTAGCAGTCCCACGGGGAGACATGGACGCGGTG
CAGCATGTTTTGTTAATTATTTTTTTATTCTTTTGTTTATTATCTGCAAA
TATTATTATAATAAGAATAACTTATTTTTTATATTCAATGTTTTTATAGG
AAGCACCTATTGAGGTGTTCCCAACTATATTTCAAATCCCACACGGAGAC
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TTATAAATTTAAAAGCAAATGATCTTATGTATGTAATTTTTGATGTAAAA
GAAGGATACGTCATACTTGATGTAAACAAGAGCGAACGAGATTAGAACAC
CATTTAGTACGGGTGAAGAAAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.