Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA023477

[Submit comment/correction]

Sequence
AA023477
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023477
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAGCCGTCCCTCTCTCTTTCTCTCCACAGTGACTGCCAGTGCCAGAGCC
TCGGCGCCGCCGCAAACCGACCCCCTCTCCGCAGTGCGTCCCAGCGCCGC
TTCCTCCTCTCTACCCAGCGCCGCCGCAAACTCACCTTCTCCACCTGCTG
CGAGTGCCGAAGCCGCCGCCTCAACCTATCCACGTTCCGCGCCAACGTCA
ACGTCAACGCCAGCCTATCCAGCGCTGCGCCTGCCCAGCGCCTACCAAGC
ACTTAACCATGTCGTCGTCTCTGGCGTCCTCGTCGTACCGCCGCAGGATC
CTCGACTCCAAGGTGGCGGCCACCCACGCGCTCTACTCTTGTCGGCTCCC
CTCCCGCTCCAGGCAGCTTGCGCACACCAGGATTGGCGCCGCCACCAGAG
GTAAAACCTTCTCAAGGAATCCGATTAATTCCTGTGCTTGCACAGCCCAG
TGAACCTGGTTAGTGGTGGAACGCACTGAACCTGCTTGTGGAAATGCCTG
TTAGCAGAGTTGGTGCGCTTATTGTTTTCTTTTTGCACGGTGAATCACCG
GGGGAGATAGCATGTGAAAGAAATCCAATGTCATTCTTGTATCTATTGCT
AGGAACATGTAAATAAGTAGCAATAAAGGAAAAATAAATAATCTGTTATG
CAGAAATGTTATTTCTTGGTATGATTTAAAATTCCCAGTTCTAGCCATTG
AAGCCATGCAGCTTTCCTATACCCCACTGTACTGATTTAATTTCGAATTT
GCATTTACTCCCTCACATATTGGTTGTAATAACATCTTATATTATTGGGA
CCAAGGGAGTAGCAAATTAGCTACATTGCATAAGTGCTACCAGCCCCGGC
CTACAGCTTTCTAGTATCTCAATACATATTTGTTAGCTCTAGCTATTTTT
TTACTCCTATATTTAACTTGTTTGACTGTTATTGCTTGCTTCCCATATGC
AATACTAGTATACTTGGTATCTGACACCGCTGTAGTTTTGGCCCTTCTGA
TATCGCATCATTATTTTCTATTGATTCGGTTATCTGTTTTAGCTCACGGT
GTGGAGAGTAGCATCATCATTGTCCTAACTATGCATCACTGGGAGACCTT
GAATCACATGGCGTACAAATTTGGGAAGCTTGACAAGTGTCATGGAAAAC
TGGCCTTGAAGATACTGGGTTCTATTGTGCAACAATCAGGTTTGGAGCGA
ATTACCCATATTTACTGCATGGCTGCTCATATCCTCATCCAAGCTCAAAT
GCATTCACAAGCAATGACAGTGTTAAAGCATCTTGCTGTGGAAGGCTTCT
CTTGCAGTGCTATATTTAGCTCTCTTTTGCGAACCATCTCACGTTGCGAT
TCCAGCCCCATGGTTTTTGACCTTCTTATTAATGCATATCTGAAGGAAAG
AAAAGTTGTTGATGCAAGTAAGGCAATTTTGTTGATGGATGCCTGTGGAT
TTAGGGCTTCAGCTCATTCTTGCAACAATGTCCTTAATGCTCTTGTGGAT
ATTGGCGAATCAAAACATGTTTGGTTCTTCTTAAAAGAAAGTCTGGCCCG
GAAGTTTCCTTTGGATGTCGTCACTTGCAATATTGTGCTGAATTCTTTTT
GCATTGAGGGTAACCTTAAAAAGGCTAATCTTATGCTGCAAAAGATGAAG
AGTCGCTCCCTAACAAATGTTGTTACTTATAATACAATACTTTATTGGTA
TGTTAAGAAGGGAAGGTTCAAGGCTGCCAAGTGTGTCTTAGAAGATATGG
AGAAGAATTGTGTAGAGGCAGATGTGTATACTTACAACATCATGATTGAT
AAGTTATGTAGAATGAAGAGGAGTACACGTGCCTACCTTTTGCTTAAAAG
AATGAGGGAGGACAACTTAGCACCCGATGAATGTACATATAATACTTTGA
TCAAAGGATTCTTTGATGAAGGTAAGATGAAACTTGCTGTCTATATCTTC
AATGAAATGCTGAAACAGAGCCTGAAACCAAGTCTAGCTACTTACACTAC
CTTGATTGATGGGTACTGCCGAAATGGGACAACTGATGAAGCTTTAAGAG
TTCTATATGAAATGCAAGTTGCTGGTGTGGAACCAAGTGAATTAACTTAT
AGTGCAATGCTGAATGGTTATTGCAAAGCTTCCATGCTGGGACATGCAAT
GAATCTTATTGAAGTTCTGAAAGCAAGAGGCACAACAATCAATAGGAATA
TGTATACTGTTCTGATTGATGGTTTCTGTCAGCTAGGACTGGTTTCTAAG
GCCAAACATATTTTAAAGAGCATGCTTGTGGATGGGATTAATCCAGATGT
TATCACGTACTCAGCATTGATAAATGGTATGTGCAAGATGGGTAAGCTGG
ACGAAACAAAAGAGATTTTGGCAAGGATGCAGAAAACTGGAGTTTTGCCT
AATGAGGTGCTTTATACAACTCTAGTCTGTTATTGTTGTAAGGCTGGATA
TGTCAGAGAAGCACTGAAATATTTCGTGGACATGTATCGAAGAGGCCTAA
CTGCCAACACTTTCATCCATAACACGCTGTTATGTGCATTGTATGGAAAG
GGAATGATTGCACAGGCTGAGCAATTCAAACAATACATGTCTAGGATGCA
GATATCATTTGATGTCACCTCTTTCAACTGTATAATAGACTACTATTGCA
CTACGGGTAACATGCATGAGGCATTCTCAGTGTATGATAATATGGGTAGA
TATGGTTGTTCTCCAAATGATTACACATATAGGAATTTGCTTAGAGGATT
GTGCAAGGGAAGCCACTTGGCACAAGCAAAGGAGTTCATGGCCTGCCTTG
TTGATATATCTTCTGCCATTGATCAGAAAACCTTCAATGCATTACTTCTA
GGGATTTGCAAAGATGGAACACTAGATGAAGCTCTGGATTTGTGTGAGAA
AATGGTTACAAGCAACTTTCTACCTGACACCCATACTTACACTATTCTTC
TTAGTGGTTTTTGCAGAAAAGGTAAAATTGTTCCTGCAGTCATCTTGTTG
CAGATGATGTTGGAGAAAGGGTTTGTCCCGGATATTGTTACATATACCTG
TTTGTTGAATGGTTTGATCAAGGAAGGCCAACTTAAGGTTGCTTCTTACC
TGTTCCAGGAGATCATATGCAAGGAAGGCATGTACGCTGATTGTATTGCC
TACAACTCAATGATAAATGGGTACCTAAAGGCAGGAATGATACATAAAGT
AGATATGGTGATTTGCGATATGCATCGTAATGAGGTTTATCCAAACCCGG
CTAGTTATAACATTCTTATGCATGGGCACATCAAGAAGGGACATTTCTCA
AGATCTATTTATCTCTACAAAGATATGGTAAGGAAAGGAATTAGGCCAGA
CAATGTGACATATCGTTTGCTTATGCTTGGACTTTCCAAGCATGGTATGG
TTGAAATTGCGATTAAGCTCTTGGACAAGATGGTCTTAGAAGGCATTTAT
CCTGATAAGTTAACATTTGATGTACTCATAACTGCATTTAGTGAGAAATC
TAGGATGTCTAGTGCTTTACAGCTTTTCAACTGTATGAAGCGGTTATACA
TGTCACCTAGCAGCAGAACATACAGTGCCATGATAAATGGATTAATCAGG
AAAAACTGGTTGCAGCAGAGTTGTGATGTTTTACGTGACATGGTTGAAAG
TGGGCTTGAACCAAAGCATACACACTACATCGCATTAATCAATGCAAAAT
GCAGGATTGGGGACATCAATGGAGCATTCAGGATTAAAGAGGAAATGGCA
GCTCTTGGTGTTGTGCCAGCTGAAGTTGCTGACAGCTCAATTGTTAGAGG
TCTTAGTAAATGTGGAAAGGTTGAAGAGGGTATTATAGTTTTCTGTAGCA
TAATACGGGCAGGAATGGTGCCAACCATTGCTACTTTCACTACCCTAATG
CATGGTCTGTGTAAAGAAGGCAAGATTGTGGATGCTCTGGACCTCAAAAG
GTCAATGGAGTTGCATGGATTGAAGATTGATGTTGTCACTTATAATGTTC
TAATCACAGGTCTGTGCAATAATCATTGTGTTTCTGATGCGCTAGATCTG
TATGAAGAGATGAAGTCTAACCAACTTCGACCAAACCTTACAACATACAC
CACAATAGCTGGAGCTATTTATGCATCAGGCAGAATGCTAGAGGGAGAGA
AACTACTCAATGATATAGAAGATAGGGGATTTGTTCCCTCATATAAGGAT
CAAAGTCCTGAATGGAGGATGGGGAATGCATTGAGAAGGTTAAACGTGAT
AAGAAATTGCAGAAAAGCAATAACTTCTGAAAATGAGGTCGAGCGACTGC
ATGCAGATCATGAATCCATGCCTGCTGAAGACTGAAATCCTCTTGAAATT
AAACTTTTCCAGGAAGTAGTTCTGATCCTTCTCCGAATCGTCATTTTAGC
TCTTGGAGCTTCTTTGCAAAGGAAGGTGTCTCCTCTCCCTTACGTCCTAC
TAGCCGCAAGGAAAGTAGAGGATCAGGTGCATCTTTTCGCTTCAATGCTA
CAATCTAAGTTCCTGGATATCAGCATAATAAACCCTCATTACGTGCTTTG
ATTTGTTCCACCATTTACTGGGCAGTGTTGCTATTTTCACACTATTTCTT
CCTTGCTGCAGAAACATAGTGTAGGGTAGCAAAGATTGCAGTTTCATTGT
GCTATATGTACAGTTTTCAGTAGAAAGATTCTGTTGCGTATTTTTCTTCA
AAGGTAGAAGAAAAAAGAACACAACCACTAGAAAATGTGTGAAGAGTGAA
ACATATTATAGTTACAACTCGCATAACAAGAAATCAATATCTACTCTTTG
AAGGAGATAGATTACCCTTGTGCTAATGTTTAAAGTTGCTTTATTAAATG
TGCAACTTACATCACATGACCGGACTAGCATCCTAGATGAAGAAATCTTC
TTATTGTTGCAAAAGATATGTGGGCCATTTGAATGAAATGTTGAAGTGTT
TCCATAGGCACATGGCAGCTGAGTGTCTCAAGTGTACAGGATTTGTTGGA
TTTGTTATTCTTACTAGTTGGATGGACTTGATTGTAGCTCGTTTGGTGTA
ACAAACATAGCGAAGTGAATAGATTCGGAACATCACTGCTAGAAAAACCT
GCAATTAAACTCTTGGGTTGCAAACGAGCAGCTAATTCTGTATGTCTGAA
AAATTGTAGCAAACGAACTTCAAAGCTAAGGATGATGATTAACATTTTTT
GTTCTAATTTCTAGGTCTTAGGATTCTGTATAGGAGAAGACACTGAGGGC
ATAAAGACAGCTATAAAATACCCATCCCAGGATTCAGGTTACATTTTGAT
TCTCTCTGCATTAACATTACTTTCTGAATTATATGTTTTCTATTAGAATT
TATTATTGATGTTTTCACCATTAAGATTATGTACAGGGCAAGAGTGAGGA
CAATAATTTCTGAAAGCAAATCACCTTTTGAGCTAGATGGTCGTCAGACA
CCTTCCTGGCATTGGTTATGTCTTATCTCAGGCAAGTATTTCTGGCTACC
ATGAAGCTGAGCTATGTCACCTGGAGTACAGGAGGAGAAAGTAGATACGC
TTCTCCAGGATGTTCGAGCTGAAACTCCTGTATTTGTGGCTATCATGAAG
CTAAGCTATGTCAAGTCACGAAATGCTTCTCATGTAAGTTTTGCTGTTCT
TTCTCTTCGAATTTATCGCTCATTTTTAGTGCTTAATATTTATAGTTATA
TATGAACTTTTATTCCATTAAATATTTGGTATAGTCATGCTTTTAGATTG
ATTGCATGAATATAACAGGGTTCATTAGAGGCACAGGTTTTCCTTGAGAG
GCTAGATTAGAAATACCCACATTCAGAGGAGGTAAAAGAAAAATATGAAT
CAGTAGTTATTTGAGTTAGTAAAATTATGACAGTTCTGTTTTCAGATATT
AACATATATATGATGTACACTGTAACATCTATCCGTGCATTTTAATGTTA
GTTTGTACACGAAATACACTTGAAGTTTTCTGTAAGATAGCTGTTGAAGT
TATTGCGTACCATTAAACATTGTGCTAAATTCTGTACAAAAATCTGTTGC
ATCAGAAACCACAAATTATGCTGGTTCACTCGCATAGATTGTCTTGTAGT
GTGGACACTTTGCTACTTGCATCACATTTTCCTGAGTAGCATATGTGTGC
TAGGATCTGCATGTCAGTTTGCACAGGTCGTGTATTCTCCGTCGATAAAA
AAGTTCTGTACAACCCAAGATATTATTTTCTTAAAAGAATTTTACATTAG
TCCGGAATTACTCTGAATGAATTGATCCCAACATAGTCATATTTATTGAT
CTGTCAGACTGTCACTGATATTGCGCCACCTGGAATTAGGTAATTTCTAA
AGGTTATGCACCCAGGCAAGGAAAAAAACTGGTCTCCCAGATTTTACATC
AGGAAAGATCAGCATTGGTGCAACCTTTCTGGGCCTGGTTGGTTAGACTT
TCTCCGCAAAAATTGAGTAAATGTAGTATCTTTGAAAGAATGAAGGGCAT
TGGGAAAAGTTCTCATCAGTAATCTGTTATGACCGGTCTGAGTTACGTGA
GGAGGGGGCCCAACCATGGGCCCAACTAGGGGCTTAGCCCATTATCAGTT
TAGGGTTTTAGCTCTTTATATACTGGTTGTAAACGAAGCAAACATCAAGC
AATAATAATATTCATTATTGCCGACTCCCCGAGGAGTCGGTCTCCTAACC
CTAGCCGCCGCCCTTGCTCTCCAGCCCGCGCACGACGGCGTCCGCCGCCT
CGTCCGCACGTCTCCCCCTCCTTCCCCTACAAACTACGCCCTAGGGCGGG
TAGACCAGTTGGTTCTACCATAATCCATCTACTTCGCAAATCAATGCTGT
ATTCTGTCGGTGGAAGTGAAATTGGTCCTAAAAAAGTAACTCAACTCACG
ACAAAGCAAGGGTGAATTTGGCTACCCTAAAAGAGTAAGCACAGCTGATG
GTAGAACAAGGGCAAAGTTGACTCAACAATCCGAGTTAAGAAAGAAGCAT
ATAATGGTATATCAAGACACCCGTGGTAGACTGAAACAACTTGGTGCATT
TTAAGTTTCGTCTTCTTCTCGTTAAAAGTTTCAGGAGGAAAATGCTCCTT
ATTTGGGACACAACCAGTCATAAAGCACTTCATGGACCTCTTTAGTTTGA
TGAATCCGAAGGTTCTTCAAAGCCTCTGTAAATATTATCACCAGCTGCAT
GTATGACTAGGGAGCAGTAGAAGAATGTCGACAAGAGGGTTCACCCTCCT
CAGTCCGAAGTTTCCATTTACGTGTCAATAAGAGCAGTGTTCATGTCAAC
AACGTCTATGCTGTAGTAATCTTTTTCTGGACACATGTCTCAGCTATCAA
TAGGATGTAGTCCTTGCTCAATATATCTTGAACCTGGTAAGGTTTTAGCT
AACCAGTTGTTTTCATGCAACATTTTGTGTCTTGAAACAGACCATTTGCA
AGAAGTATGCTGTTGAGTATCTCTCAGCCGGAAATCAGGCCGTGACAGTC
ATGAGGGTAGAGAGGAGCAAGATGTGTGAAGTCGAGATGCATCCAAAGAT
TGGTGATGCGCGAATGCTAACGGCAGGTCGGTGCAAGTTTGTCGACGACA
ACCGTCTGGAAGATACCTGCTTGTTCTAGCTAATGTCTAACCAGAGGAGG
CATGCCGTGATGGTGCACATCACTAATCACAATGTCAAGCGGTAGCTTCT
AGTTTCCAGCACAAGGGAGTTATAGTCTCGGAGAGTTAACTAATGTTTTG
ATGGGATGGTGAATCAAATGCAAGATCGATTCTAGTACTGGTTCTACAAG
CTATGGCTATTAGTTACTGGCAATTTCCTAAAGGGGGGCATAGTTTCTAG
AACTGGTTTTATAAGGGGTAGTTTCCTCCCCTTGTGTTTCTGCTATACAG
ACGTCCATAGTTAGATAATGAAATTATACGTAGTTTAATTCACCGAGAGT
TCTCTAACCTGGTAGGGTGAATGCAACTTCAACTGGGAGGAAGCCTGAAC
CAACTGGGAACTATCTTGCTGAACTGAAGGTACCAACGCAAACGCCACCG
CACGTTCCTGCAGTCCTGCTACTACTGATCCTCCCTGTGGCCACGGTAAT
CTAGTGTATTTTCTGGATCTACAACGGGATATGAGGCTCTGATGTTCTAA
TTTGGGCTTTCTCTAGTAGGGCTACCATGACAGCTGAACGTCACCTCTTT
GTCTTTCACGAGAAGCTGCCTATATTAGCTTGGCAAGGTAACATACCAGC
ACATGTTTCTTTTCCGATGTCTCTTATCCCTACGTGCTCTTGACCGGTCA
CATGATTGGGCATTTCACAGCATGGAAGTGTCAAAGGAAAGAGTTGGGAC
ATGAGCTCGGTGTGAGTGAATGCAAAACGATAGAGCTTTGCTGGCTGATA
TAGGTGAAGATTGTGTAGTATATATAGTACACTCCCTCCGATCCATATTA
ATTGTCGCTAAATATGATGTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.