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GrainGenes Sequence Report: AA003771

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Sequence
AA003771
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003771
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCGCCCTGGAGGACCACGTCGCCGAAAGCCATCCGCGCCAATTCGTGTC
CCTTTACTCGCCGCGCCCGAATCCAAATTCGACCCACCCCATTTGGCCTT
CTTCCCTCATGCCGCTCCCTTTTCTTCTTCTTCCCCTCTCCACCGCTCAT
CCGCCCCGTGCTCACCATCGCCATGGCAGCCGCCTCGAGGCGACGCGGCC
TTGCGGTAGGCGCGGGATCCTGCGGGTCAGGGCGTCGAGGGAGGCCGTGC
CGCCGCCTTCCAGAACCCAGGTAAGCGAGCAACCCCGACCCGACCCCTCC
CCGCCGTCGGGCCTGTACAGGTTTTTCTGTTCCCGCCGCGAAGCGATAAT
CGTATGAAGATTTTAGTAGCCTCGCTACGGCATTGCGCGAGGGTTGTCCG
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TGGTTGTTTGAGACCTGTTTAGTTTATTTCATTTCATTCTCTAGTGTTAC
AACCTTCTGACTGAACTATGTGCGCATGCAGACTCCAATGTCCCTGAAAT
TGTTACTCGCGTCCAAGGGCCATCGGTGGATTATGATCTTGGTTCTGACT
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GCTACTGCTCTCAGTTATAGAGGCCTTCGGGTTGGAATTATCGAAAGAAA
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GAGGGAACAAGAGTGGAATATCTCGAGAAAGGAGCTTATGGAAATTGTGG
AAGTTGGCATCCTTTCAGAAGCGGAAGTTGAACAGATAATCACAAGTGAT
TTCAATCCCGTAAGGTCTTCCAGATAAAGTTGACATACCCACAGGGAAGT
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TTTTAACTTTGCAGAATAGATGTGCATTTGAGAATAAGGGTGAAATTTGG
ATGGAGAACATTCTTCACCTTGGAATATCGTAAGTTGTCACCTGATTAGC
TTTGGTTAGTTTATGTCCTGACAGCAAACAAGGGGACATACATCCTCCGA
TTATTTATGATCTGGGTAGTACTGTACAAGCTAAATACAATGTACTTGGT
GTCTAAATTGGTAGAGAGGATGCAAAGGAGTAGTAACCTATACTAGTTTC
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ATGACATGTGCTCAAAGAAAAACAAGCACACAGATACATAAAACCAAGTA
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TTCATGATGATCTTGCAGTAAGCAACATGTTTGTCTCCTTGGCTGTAATA
ACATCGTCTCAAAGTGAAATATTAAACTGTACAAAGTACTCAAAGGAATC
AAGGATATGTAAATGTAGTGCTGTATTCTTTTCTCCCACAACAATTTGCA
TACTGATTTGGCCTGTTATATCTTTATCAGATCTAACATCATAAATCCAA
CACTTAACTTCAAAAAAATTCAAGATTACAATATATATAGTTTAATTTGG
TCTCAACATCATAATAATTCCAACAAACAGGTTGAAAATAGGCCTTGGGC
AGTTAGACAACTGCACTAAGGTATAAATACTAAATGTTATTCAGATCTAG
TTGTCCATGGAGGGAGGTGTTAATATGCCGATTTTGTTCCACAGGTACTA
AAATTGAGCGATGGTGATTGTTTGCCTTGTCGACTTGTTGTTGATGCTAT
GGGTAATTTTTCCCCAATTGTGCGACAGGTACTCTTTTATCTTTAATGAA
TGCATCTACATGTTTTCTAGTGTAAGTTGTTACACAGTCTGACAAATAGA
ACCATATATTCGACATGTGTATCCAAGCTTTGTTTAAGTCAAGTGGCAGA
ATAAATTTGCAATTTCCTTGCACTGCACTTTTTTTTTCCGAAATGGGGTT
GTACCGCACTGCACTATTTTACCAGCTCAAATCCTAGTACCAACCGGGAA
AAGGACTAAAACCACTACTCAGAAGTTGCCTCTACCAACAGAACTGGCTT
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TAAGCCATTACAAGTTTAAACTGAATACCCATGGCAAGGGAACACCCCGA
TTGAAGTTAGGCGCTTATTACAACAGACCACAACAAACACTGGCCTAGAG
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GTTATCATATCCATCTTATCGTTATAGCCACATCCTAACTCTACATTATC
AGTTAGTTACAAGTTTCAACTCTTCTGTCCTTGTGCAAGATCCGATCCGG
TAGAAAACCAGATGGACTGTGCCTTGTTGTTGGTTCTTGTGCTCGTGGGT
TTGAAAAAAATACAACAAGTGATGTTATTTTCAGTAGCTCATCAGTAAAG
AGAGCTGGAAATTTTGGAGTACAACTCTTTTGGGAGGTAACTACTATTTC
TTTCAGTACTTTTGACACAAAATTGATGCTGAGAAATGGAACTAAGATAT
CTAAACTACAAAGGCATTTCTTCGCATACCACAACACAATTTTGTTAAAT
AGAAACACCTCCACCTTAGCCAGCCTCTGTTATAAATAATATGTCTAAAC
CACCATCTTGTGAAATGTTAGTTTTCCCTCCACCTAAGTTGCCAATAATC
ATTTGAAGTTGTATCTAACCTACGTTATCATATTACAATTTATTTTTGCT
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CTGATCGTACTACTTACATGTTCACATATGTTGATCCACAATTTGGGTGC
CCAAAGCTTGAAGAACTTTTGGAGATTTACTGGAATCTTATGCCTGGTTA
CCAGGTGAAGAGTGCTGTATTTATTTATACATCGTAGAGTCATTATAATA
TTTCCAAGTTTATTCAATGATATTTCTTGGTTGCTATCCATAAAAGTACT
CCCTCCGTTTCAAAAAAAGTCTAGATACATTTTCTTCACAAACCTAAAAC
ATCTTATATTTTGAAAGAGATGGAGTACATGATTTGTCTTATCTTTGGAA
AAAATGTATTCACTTGTTAACCGAAGGTGATTTATGTGACGCCGTCATGC
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TGTTCTACCGATGTACATAAAATATAATCAACTCATGGGTCTATGGATTA
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GCTGTAAAATTAACATTTCAAATCTTTACGCCATTGAATTAAAAGCCAGA
AGTGACATATGCTTGATACTAGGCATGCAGGCGGACGCCCGCCAACGCGT
GCATGCATGTCCGCCTAATTTGATTCCAGCTTATTAACTAAACCAATTCG
TTTCCTAAACTAACTGTTTCCTAGCTTTGCATGCACTCCGGCGGACTGTC
CGCCTTGTCCGCTGGACTGCCCACTTGCATGCCTACTTGATACATGCCAT
CTTTTTATGTTTTATACCTATGTAATTATACTTTATTCTCAATTTACTCT
AACTCTGTGTTCATTTAGGATGTGGTTCTTGAAAATTTGGATATAAGGAG
AGTCATATTTGGGATTTTCCCAACTTACCGGGACAGGTAACAGAAGTGAA
CAATAGCCTATATGCTTCTCTTCCGTTATTTGATGATAGGTAACTGTAAA
ATGCCAACACAACATGAATAAGCAATCTGCTGCACTATCACATAATGATA
TATGTGCGGTGGCTAAATTACATCACTACACTACATTAAACAATATTTTT
AGCTGCTCATTTTATACTTAAAGAGGAATCATTTATGTGTAATTCTCAAT
AGTCACACGTGGACATATGAAAGATGTTAAACCCCCATATTTAATAATTT
TCTGATGATTGACTGGATTGTGTCTATTTAGTGCTTGCATCATTTTGGAT
ATGCAGTTCTTCCATAAACTTATCCTTTTCATATGCCAACTCTTGACACA
ATTAATTCTACCATTTCAGCCCACTGCCAGCTGCATTTGACCGTATCTTA
CAGGCATGGGATTTCTCTCAATGGAAGCCTGATTGCTTGTGCCCTTTTGT
TTATTAATTACTAATGCCCTTCGCACCTCAGGTTGGTGATGCTAGTGGGA
TCCAGTCACCTGTTTCTTTTGGAGGGTTTGGAAGCTTGACAAGGCATCTT
GGCCGCTTGTCAAATGGTTTGTCCACTGTTCTTAAACTGTAGGTTGCATG
ATCATCAAACAGAAATATGCTTACTCCAGTATAAACAAAACTTAGTTAAA
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AAGGGAGAGTAAATTACGTATCTCACTTTCTTGTGAGATAGCAGCTCATG
AAAAATTCCCAGAGAACCCTAACAGGATGTTAGCACAAAATATGCTAAGA
CAGCTTTTAAGGTTGAAAAGGGAATGCCAAGGTCCAACTCGCCATAGTCA
AACATGTTATTCCCTGGTTAGACTAAGCACAAGAACAGAATCCACAATCA
CCTCAAGGCTCAAGAGCCAGCCAATTCAAAAGAGATGCTTGTGCCTAGCG
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GCTCAAAAATAAGAAGGTGAAATCTAAGTTACTTTGGGTTTCGTGCCTAA
GCCTCTCCAACGAAATTTAGTTTTTCGATGTGACAATAGACCTCAATCTT
TCAAAGCACTTGGAACTCTTTAGAAACAACGAAAAAAAAATTAGATGCAA
GATGTACTCCATGCTATGACATGTGAACCTGTAAAATCTCATACGAAAAT
ATAAACAAATGTGGCCTGCAAAAAAAGAAGTGAATAGTTTGCAGTCTCAT
GTGTTTAACTCTTGTTTACTCAATATTTAAAATACAGACTATGCTTATTT
AATATTTAAAAGACAAATAAGAAAGCTACCACATTTTTTGTATGCTAATC
AGATTTAATCGTTTTAATATAGGTAAGTATTATTATGCTTTAACTAATAT
ACATATCCATGAAGATTATATATAAAATTGTCACAAAGAAGAATCTATGA
TTTAGTTTTTTTTGTTTCATTACTGTATATGGAATCTTTGTGGGAAAATA
CACTATCTCTGTGTCCACTCTGTATGATATAACAACAACAACAACAACAA
CAACAACAACAACAACAACAACAACAATATCAAAGCATTTTGTCCCAAGC
AATGTTGGGGTAGGCTAGATATGAAAACAACAGAAAAATAAGGAAACCAA
AACGTGGAACAGAGAGAAAAAAGTAGGAAAGTACGAAAAAGAACTGTTAT
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GTCCAGACCACCTTAATCGGTGTTGTACTAGCTTCACTTTGGTGCCACCC
CTACCCTATCACGTATTACCTCATTCCTAGTTCGGTCTTCTTTTGTATGG
CCACACATTCACTGTAGCATGCACATCTGTGTGACAATCATTTGTTGGAT
GTGTTGTCTTCTAGTGGGCCAACAGTCTGCTCCATATAGCATTGGATGTC
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ATAGGATGCCAGGTGTGTTTCCCGCAACACCTCGTGGCATATATCCTCAT
CGATATCACCATTTCTGTGCAACATTGACCCCAAGCATCGGAAGGTGTCC
CTCTTAAGCACTATTTGTCCTTCTAAACTAATTCCCTCTTCGCTCCCAAT
GCAACTGAAGTCACCCCTCGTATTGTCGGTTTTGGTCCTACTAAGAGCAT
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CCCCTTGCACCCAACGGCGTCCCCCAAATTATGTCTATCCCAAACTTTCA
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TAAACAATAATTATACAAGTAGTGCCAAACTAGATACATTTTAAACTAGA
ATTAAACTTAAACTAGATCTAGCCTAGTCTATGAAGATGTAGTCGGCTTC
GGTGCCAATGGCTTTGGGGGCGCAACGGGATGCCCACCGGCAAACGGTCG
TACAGCTCCTCGTATGACTTCGCGGCATCCTCAATGTTGGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGGGGGATTGCTCGTGCATGAAGACACGATTCCACTTTGAGCCG
TTCCAGCCGTAGTGGGGATCGCCGAGAAGATCTGGTGGCAGGAGCCTGTG
GTGCTCGGCGACTTTGAGCGTGCGCGCGTGGCTGGACGGCGGCGGTGGCA
CCGGAACCCTGTTTGGGTTCAAGTGCCATCCCTCCGACATCTTGACGTCG
CGGGGCGCTGGCTCGTACGCCTTCGTGAGCCGCTGTTGTCGTTGCGGCGG
GAAGAGGAGGCGTCAAACCAGTTCGGCATCGCGTGGGAAGCGTGGATCTA
TCGAATGGCCATGGTGGCTCTGGCCTCGGAGGTCGAAGATGGATGGGAGA
GCTAGCGGAGCGGATGTGCGGTGGGCTAGGGCTTGGAGGGGCGGTGCGAG
CAGTGTGCAGCCGACGCGAGTCTTTAAAACTAAAGGGCAAGGGACGATAT
GGGTGGCCGACATGGGTGGACCGCAGACAGTGTCCATCTGCCCCCAAACT
GCCCCCAAGTTTGGGGCCAAATGGCCATCTGCAGGACCGTGGACATGATT
TGGGGGCACCGTCGGGTTCACGTTTTGGCCCGTCTGTGTCTGTTCGGACA
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AAAATTATCGTACATATCTCCGATGAGGATAATTTACTTTGTTGGGACTT
TATGTTTCTCTAGGGCCCACCAAATGAATGTCATTGGTATCTTGTCATGA
GCCTTCTCCAAGTTGATGAAAACCACATGTAGGTCCTTCTACTCTCTCTA
TCTCTTCAAAAGTTGGCGAAGAAAAAAAGTCGCCTTTGTGGTCGATCTCC
TAGGCATAAAACCAAATTGGTTTTTATTGACATTTGCCAATCTTCTCAAG
TGATGCTCAATCAATCTCCTAAAGTTTCGTAGTATGGCACCTAAGCTTAA
TTCCTCGTTAATTAGTAAAACTTTGGATATCTCCTTTATTCATGAAAATA
AGTACTACGTAATATATATTTCTTCCACTCTTCGGGCATCTTGTTTGACC
AAAAAATATGGTTGAATAACTTAGTTAACAATACTATTGCCATGTTTCCA
GGGCATCTTGAGAACCAAGCGCTGGCTTGGTGGCAAGGCTAGTGAGTGCG
CAACTAGCCCACCCGGGTTCGAGTCCCCATGGGGACCGAATTAAACGGGA
TGTTATCCGAGCACGTATAATCCGCTGCTGGAGAGGTCTCAGGGCCTCCT
TAACCTCATGCTCTTGGATCCTTCGCACGAACCGCCTGTTGGTGTAATCA
AAGGAGTCATCTAGCTCGGGCATAGTTCTCCCGTTCCCATCATTGAACAA
CCCGTCAAAGTAATCTCTCCACCTGATTTTAATCTCTTCATCATTCACTA
GAAGTCGATTAGCCTCGTCCTTGGTGCATTTAACATTTTAACTTGGTTGA
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CCTCATTCCACCACCACGTGAATTTAGCTTCATGTTTCTTGCGTATTGTC
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AAGGTCTGCTCAGCTTCCACCACTTTGCTCTTGCGATTTTGGCACCTTTG
TCCTAGAAAACACGTGTATGAAAGCGGAAGCCGGCCACCACAAGCTTATG
CTGTGTATTTCATATCCATGGGAATGGCGGGTTTTTATGTTGGCTCATCA
TGCCTATCACAACTAAGGATGGCAGGGGTATCCTAAAGGGTACCCTTACC
CTCTTTAGTACAAAAAAATGAACGTTTTGACAAATCATCACTTTTTGATA
AAACTAGTACATTTTTTTGAGCTAGACTAAAATTGAGGGTACCCTAAAGG
TACCAAACTGCCATCCCTAATCACAACCCTCCTTTACCGGGCTTAGGACC
GGCCATTCCTAAAAAGGCACGAGCAGAGTTCCTCTCTGTATCATACTATA
TGCCAGTATTCATGTCCATAGCCACATCCAAGCTTTGCATTTGTGGGTAA
AAACACAGAAACAGTACAGCCTATTTTCATATGTCTACGTTCCATCAACT
CTACTTTTCAGTCTGCAAAGACATTAAATATTGTCCAACTCCATAAGTGG
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AAGCAAGTTCTCCATGCTACTAGCAAAATGGCGAACTCTTTCGCTGTAGG
CCTAATCATCCTAGTTTCCCCATGCCGAGGTGCTTGCACAATGATACAAC
ACATCCAAGACAATTTACTCTGTACGAACATGATGCGAGATCTGTACAGA
AACAATATTTCTCCTTGCCTTTCAGTCTTTCACATACTTCACCCTCTAGA
TTGTTTTGGAACTGCAGGTGTATATGAGGCAGTTTCAGGAGATTTCCTGG
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GGTTGTTCCAAAGAGCAATGTCAACAAGGCCGCAGACAAATATTTCACCA
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TTATTTCGTAAGATACAATATTTTCAGATCACTTATCTTATTAAAATATT
ATTTTCTACAATGCCAGAAACTTGGGAATCCAGTACTTCGGCCATTTCTC
CAGGTTGGTACTTCGACATTGTGATACCTGGCAAATAAGAAACATCACGC
ATTTATATTTACTGTGCATCTGTAGGATGTAATACAATTTGGACCTCTGG
TGAAAACACTGGGCCTAGTAATGCTCAGTCGGCCACAAATTTTGCCTTCC
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TATGATTTTCACGTCAGGCTTCGAGCTCTAGGCGAGCCTGTGTTGGCTTT
GCAATCCATTCCTGGTCATTAGAGTCTATTTTTCATCCATCTTTGTATTT
TTTCACACCTCCCTTGCTTTCTTGTAGGTTGGACTTGGAGTCATCCTTAA
CTGGTCAAGCCATTTTGGGATGCTTGGTTACTACACATTCCTTTCTAGCT
TTATCGATCCAGCTATTAGGTACAACCGAGTTGTTTATTCTCTAATGGTC
GCAAATTCACATTCCAATACCATATGTGCAACCTGCCTGCATTTTGAGAT
GATTTCTATTTTCTCGATTTGTAAAGGACTTGGGTTGAATCTTTGCCGCC
AAGGAACAGATATCAGTGGAAACGGTATCTTGAAGCATGGCAATATGGAG
CTGGCTTAGACTATCGTCAAGAGGAATAAAGCTTCTGTAAATTGGAATTC
TATACGTCCCTCAGCATAAAAAGAAAAACAAGTATGTCAATACAGATGAA
ACATTGTAAAGTAGATACAACAAGTCAATGCAACACTTGTATTTTTTTAT
TTTTTAGAGAAAAGGAGGGCCACCTCTCGATTTCACTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.