Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA020163

[Submit comment/correction]

Sequence
AA020163
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020163
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGACATGGTGAGAAGGGTTTTGCTCCTAGTGTGGCAATCAAGATAGT
GCATGATACACTATTGGAATTGGAGCTTCCACCGAAGGATGCGGAACCTC
TCAATAACATTGGGAAAAAGTGTACCTCGCAGAGACCGAGCAATGGGGTG
ATTAAGCTAAATATTGATGGTGCTATCAACGCTCAGGACATTGTCGCTGG
AAGTGGGGACGTCGCAAGGGATGCTGTAGGTGCTTTCTTAGGAGCATGGT
GTAATGCTTACCCTGGCATCGTGGATCCCCTTACATCAGAAGCACTGGCA
CTCCATGATGCTATGCTGTTTGCTCGGGCTCACAATCTTAGTCAGGTCAA
AATTGAGACTGATTGCTCGGAGCTAGTTCAACACTAGAAAGGAAGGAGGA
GGAACCGTCCTTTAATCGTCCCTCTTCTTGATGAAGTTAGTGTGTTAAGC
TTAGATTTCCAAGTTTTTTCTATTCATTTTGCTCGACGCTCTTCCAATAA
CTATGCACACGAATGCGCACGATATGCGTGTCTGCATAATCGGTCATAGG
AATGGACTGAGGCCAGCCTAGTTTTCCTTCGAAACAGCCTTAGAGCTGGT
TGTAATGGCAGTGTGATGTCTTAATAAAGTTAAAGTGTTTTATGCAAAAA
AAAAAGATAGCCGCATCATATGAATCCATAATACCTCAAATTTTGCTATT
AAAATTAGTAGCCAATGCTATGAAATACATACCTAGAAAAACACAATCCA
CATTTTTAGTCCAATCTTATGCTTCTTGGGTATTGGAATATTGACTTTTT
CTAAACGACCCAAGTTCGTAAATAAGAGAGTTTTAGACTTTTCTTCTCCT
AACGGAGTCATGGTTTTATACTTTATGGCAACACATTTTAGGACATGACA
CATAGTCATAAGCGCCTCCCTCACCATTCCTTGGAAAAACTCGATGTATG
TAACATGGTGTTAACCAAATCAGTTAGAGTATGTTTCTTTCTTTCGTCCA
CTCCGCTTGGCTGAGGTGAGTAGAGAGGCATCCTCTCATGGATAATACCA
TGTCCCGCTAAGAATAAATAAAATTCATTTGAGAATTACTCTCTGCCCCA
ATCCGACCTTAGCCGCTTGGGTTTAAGATCAAGTTGGTTTTCTACTTCAG
CTTTATAAATGTTGAAGTAGTTCAAAGCTTCATCTTTAGATTTTGGAAGA
TAAACATAACAATATTTAGTAGAGTTATCAATCAACATCACAAAATATCT
TTTCCACCTTTTATCAAACATCATTCATCTCACAAAGATCCGAATATATA
GGTTCTAATGGTGCTAAGTTTGTTGGTTCCGCAACTGTATGAGACTTGCG
GGTTGCTTTGCTCACAAACTTGGCACTTAGAATCTTTAACAGTGGTGAAT
TTTTGAATTAAACTTGTATTGGATAGCAGCGTCATGCAACTAAAGCTAAA
ATGACAAAAATATGAATGCCAAATAATGGACTCATTATCATTTCAAACAT
GATTAAGAACTTTAGTACATAAGTCTGATAAAGATAGGTGGAACAAGCCT
CCACACTCATAAATTTTTTCAACAAATTGTCCATACTTATATATTAAAAT
TTATTGGACTTGAAAGCCAACTTAAAAATATCTCACATAAAAGAGATCCG
CTAATGATATTCTTATTGATGAAGGAAACATGTTTCACATTATTTAGCTG
TACGATCTTCCCCGAAGTAAATTTTGGATTTACCATACAAACAACATGAA
CAGAACCATGTGAGCCATTTTCCATCAGCATGGAAGAAGTCCCTATGACC
TAATAAGAAGAAACCATGAAAATATCAGAACATGGATGTATATTGGCACC
CGTGTATATCCATAATTCAGGAGAATGATATACTGAAAGGATAGTAGGGA
AATATTGTACCTAACTTCGTTCATCACAGTATCACCAATAACAACATTAG
TGGTCTTGGCGCTGTTTTCATGCTGACGCTTGTCAAAGCGATTAGGAAAG
CTAGGAGCCAAATTATTAGGGTCACCACAAACATGGTAAGAGCCTTTCTT
CTTATCATTCTTCTTCTTGAAGTTGGTTGAGTGTGTGGCTGTTTTCCTTT
ATATTTGTTCTTATTCTTGAACTTCTAGGATGGTAAGTTTATCTTTTGTA
CGAAGTTGGCAGTAGAACCTTTCTCAAATCCTCGAGCATGTGTGTCCTTT
TCTCTCGCATTTTCTTCCACATAAAAAGACCCAATGAAATCCATAACGGT
AAACCATTGTCTCTTATGTTTTTGAGTGGTAGCAAAAATTTTACACTAGG
GAGGAACTTGGAAATGATGCCTCCAACAACAAACTTTTCCAATAATACAC
AACCAAACTACTAAAGTTCTTTGGCAAATGATTGTATCTCATGAGCATGC
TTAACGATGGAGAGCTCATTAGCTATCTTGTAGTTATAGAATTGCTCCAT
GACATACAACTCGATGCATGCGTCCGAGACCCCAAACTTGTGTTTAAGTG
CACCCCACGCGTCCTTGCCATTATGAAATGACATATACGGGACAACAATA
TTGTCCCCAAGAACACTGAAGAGAGCCTCCTTAAACAAGGTATCGACTTT
CTGAAAAGCTTCCTCTTGTTCAATAGAAGTATCTCCCCCAGGTTTGCCAA
GATTGGAGGTATAGTAGTTCGGGTTTGGAAACCAAAGAACTGCTCTTGTG
CGTCATCTCTTATAATGCATACCATCAAATAGAGGCGGACTAGTAACCGT
GACAATGCCACTTGAATTGGGTTACCTATAATCTGTTATTTGGACTGCTT
AACATATAAGAAAATATTCACATGATTTAATCCAAATAAATATCTGACAA
AGCATGACCATGGAAATAACAATTAATTGAGTCATGCATACTAACAAACT
AGATGAACATATTGCATCTAAACATGGTAATACTATCACATCTACTATAA
ACGCTAGAGAAACTCTAGCAAAATCTAAAAGAGGAAGGTTAAAATCATGT
ACGATGCATCTTGAGCAGTGGCGTTCGTGTTGACATCGGCATTGACATTG
TCGCTCATGTTAAGGTTGCCGAAGAGGTTGTCTACATACGGGAAGAAGTA
TTTTTTCAAAAAATCATCGTCCGATGACGTCGTGTTGTTAGTAATCACGC
TAGAGCGGTCCCTAAAAACAAAATCGCCCCTCACCCGTACATGTCTTCAA
GAGGTGGGGTTCTAGAGGCCTACTGTCCCGGCCAACGATGCATTGCCGCA
TAACGGGATAGGGAAGACGGTGGCGGTGGTGCAAGCTTTTGGAAGAGGTA
GTCGCATGTAGCGCGTTCAACTAGGGTACGTATCTGTGTTTATGTAGTGC
AGGCCGAAGAGGTCATGGGACACAGCCATGTCAAAATATAAACATCATGC
AAAACATGAGCTCGACTCGGCTCATTCCTGTAACCCGAGCACGCGCATCG
TAACGAGACGTGGTGAGATGGACGGCGTTGGAGGAGGAGCGCGAGAGATA
ATTTTTTCTCACATCTTAATGAGTGGTAAAACAACCAATATATAAGGAGC
TGCAACTATCATTCAACTTGCAATATAAGACTAAACTTTATCTCCACTAA
CACAGTCATGTGTTGTTATGCACGAATGGACCAAAAAGAATTTTAAAATT
TGTATTGGTTATGGACCAACATCCTAGTCACCAAAAGTCCTAGTGCTATA
ACGCTAATAACTTCTAGCATCCGTACATCAGCCCCGTGCAGCTTTAAGTG
GGCGTGGCGTGAAGCTCTGCGTTTTGTCGATACCATGGGATATGTCTACT
TCTAGATTTCCATGGTACTGAGATCGATAGAGAATTTTATGACGACTGCG
ATTGGTGGATCATAAGAAATGTTGGAAAGGTGTCTTGGATGCGATTAATA
CTGAGCTTGGTGTTTAGTGACTTGAAGTAGAGGCCTTGGCAAGCGGGGGT
GACAATACTGGAGGGCTTCAGTCTTGGTGGTGCTTCTCAAGTACCGAGTT
TAGAGATAAGATTACTCCATGGTTGTATCTGATAATAACCTTGTTGAAGA
TGTTGTACCTGGTAATAACCTTGTTGAAAACGTTGTTTTCAGAACCCGGA
CTTTTCTAGGTTGAAAACCTAAGATCATTGATCATACGTTGAGTGCTCTG
TTCTTTTCTTGGAGACGTCGTCTTTGGACGACCTCTTTTGCACCTCAGGT
GCTGTCTTCGGTGGTGGTTAGTGTGCTACCACTGCGAGTAACTGATCACC
ATGACAAGACTTTTTTTCCTCTTAGATAGGCTACCTCATGAGTCCCAGAC
TTGTACTAGACTATACAGCTCACGTACGTTCACAATTTTTTACATGCAAA
CTAACCAAACTAGGAAACCTACTTAGTCTTAAACACTAACCGGTATTAGA
AGTAAGATTACTCGAGCAATCAACATGCCTCAAAATGTATTTTGAGAGTT
TTATGGTTCTACTAAAGTGACCTCAACTAATGCAGGTCATTCATGCACAT
GACGTTGAAAATGTGGCGCGAAGTGTAATGTTTTGTCTGGAGGATAACAG
TAGTGCTGCACATAATATCATCTATTTTGATGGATGGCTTGGTTTGGCTG
CTTCTGTGGTGCTTAGAGCCATAGCCCAACACCCTCAGCCATCTCTACGG
GAGAAATTCAATAAGATCATCCATGTCGATTGCTCGAGGTGGATGAGCAG
AAGAACTCTCCAGAGAGCAATTGCGCATGAACTAAATCTTCCTCAATGGG
TAATGGCTATTTTTGATAGGCAAGATGATGCAGATGATTTTAATGGGATA
GATGGAAGTTCTAGAGCTGAGATTGGATATGTTAGCCGAGAGATCCATCA
AGAACTGCAGAAACACAACTGCTTAATTGTATTCCACAATGGCAGCAATG
ACACAATTGACTTGAATGATTTTGGTATTCCACGACCTGAATGGTTTGGT
ACTACAATATTGTGGACCTTTAGGGGGAGGTTGCGACTCAATCCGGCAAT
AAAAGAAAAGCTGGATAGTTCACATCTTTTCCTTGAAAATGATTGCGATG
TTTATCCTCCTGACTGGGATTCTTATCTACTGGAAGAAGCTAAGGAAATT
GCTCAATGCACATGTAATCTTGGTGTTACCGAAGAAATAGCTCAAGAGTG
TTTCTCTTATCTGTTATCATTAAATTCTCAGGGCGGTAACATCATGGACT
ACAACTGGGCCACACATGCCTCTAACTATTGGGTATGTGATGGGATTATA
CAGGGAGGCCAGGCTGACAAAGCATGGGAGGTTGGTGCTGCTCTGCATCA
ACATATATGTATAGAGGATTATTCATCTAATGCACTGCCATATTTTGGTA
ATGAACTTAAGACTCCTCCAAAGCGGTGGATGTTGGCCAACGACAAATCT
GTTGTGCAAGGAAGGACACATATAAATAGAGTGACTGTTCATCCAGATTC
AACGTCCTTTTTTCTTGCAGGGGTCACAGTCGGATCTGATCCTCCATTAA
GGTTGTTACATAATGACATGTTTCTTCAAGCCGACAAACTTCATGTGCTC
AAATTATGCCACTGCATATTCCAGTTTACTTCGCCTCCTTTCCGTTGCTG
TCGTAACTTAAGGTTCCTTGGACTAGAGGGTTGCAAGGATCAGCCGGTTG
AAGAAGATGAGGAGCAAGATAGATCAGTAATGGAATTTTTTCAAAGCCTA
TGGGTACTAGACATTTCTCACACGGATTGGGAATTGGATTTATCACCGGA
AATAATAGAGAAAATGGCAGAAAACATTAGAGAGGTACACATAAGCAAGG
GAAGGATTTGGCGCCACAATTTTGCATGGCGAGAACTGCAGAACCTTCGC
AAGCTTCGAGTAACTCAGCCTACTTCCCCCTGGGAGTCGGGTGCAATGGA
TGAATTCACAGGTATGGTGAAGTTGGAGTTCCTCGACCTGTCTGGGAATA
GTACAATACAAGTTTTGCCAAGTCTGTCAGGGGCAACAAGCCTCAAGACA
ATTGTTCTAGTTGGCTGTGTTGGGTTGGAGCATGTTGGGCCTGATGAACT
CCCTCCATCACTTGAATCATTCAGCTTAGATGTAGGTCCGACAGAAGATC
ATTGCAAGAAATCCAAAATAACCCGCATCTCCCTGGCTGGTATTGTAAGA
CTATCTGACTTCACGCTACGTGGATCATTTCTAAAGCTCGAGGATCTCAA
TTTGTCAAGCACATCAGTAAAAAAACTTGATCTCAAAGCTCAGGTGGTGC
AGGTCCCATGTCTCCAAAAAATCATGTTGTTGAGATGTGAGGAACTACAT
GCTATACTTTGGCCAGAGAAGGGGATGCCTCAATTAAGTCTGCTATGCAT
TGACACTCGAGGAGAAGAGATTGGAAGAATACCATCAGATAATTATGAGT
TAAAGAAGGGACACTGTGAAGCACATGTTGCTATGATGGATATGAGATTC
ATTCAGCTACTAGTGCTAAGTAGCTGGAACACCTATAGATTTAGTCTGAA
CCTCTGCATATCTACCACTAACACATATGGTAGACATAGCTACAACGAGG
GCCCTATTAGCAGCGAGAAAATAATTGGGCCGAAAATCCCGGATACTTCT
TACAACACCTATACTGATGTTGCTATTGACAGTATAACTGATGCTGACCA
TGAAAATAGCAGGGCGTCAGGATTTGAGCTGTTAGGCCGCCATGTGGAGA
TTGGTGAGGGAATTAGCAACACTAATGTGGACAGCGTGGAAGGAATCAAG
GCTATTATATTTGTGATGAACAAAGTTGAGTCGTTGCATGTTCATGACAA
TTCTTCCATCACCACTGTTATCCCGAGACCCATGGTGGCCATAGATGGGG
ATATACTTGTTTGGCTTAATCTGAAACGATGTCATGTGGTGAGATGTCCT
AAAATGCACACGGTATTCAATACTAGTTACGATAGCTTTGTTTTTCAGGA
GTTAGAGCAGTTTTGGGCTGCTGATCTCCTGATGGCTCGTTGCATTTGGA
GCAAAGGAAACATAGTCGCTGGCATGCCCGAGTATTCCTTTGCGAAACTG
CGGAGCATACACCTATACTCCTGCCCAAGCCTCACGTTTGTCCTCCCACT
AACGTGGTTCAGCTTGAGCAGTTTGGAGACCCTCCACATCGTCGACTGTG
GTGATATCGACAAGGTATTCCCCGTGGAAGCAGATTTTCTTATGAAAATA
GCAACCGACCACAGAAAAGGTGTATTGGGATTCCCAAAGCTGAAGCACAT
CTACCTGCATGAGCTATACAAGCTGCAGAGTATATGTGAAGCCAAGATGT
TTGCTCCCAAACTTGAGTGTGTCAGGCTCAGAGGCTGCTGGGGTCTCAGA
CGCCTCCCATCTGTCGTGCAAGACAGCCGCACCATCGTGGACTGCGAGAA
GGGTTGGTGGGAGAGGCTGGAGTGGGACGGGCTAGAGGCTGGCCATGCCC
CTTCCCTCTTCGAGCCGCGCCACTCGTCATATTACAAGAAGCCCCTGCCT
AGATTCTCGGTGCTCCGATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.