Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA037825

[Submit comment/correction]

Sequence
AA037825
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037825
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCAAATCCACACGCAAGGCTCTACTAGAAGAAGTGATGCTGGGCACGTG
CACCCACAGGACCGCGCCCCCACTCCTCGCCTGGCACTTCCGCTCCCACT
GCCACTGCCACTCCCACTCCCACTCCCACTCCCATCGGCGTGAGTTACGA
GGCAGGCCGCTACCCTCTCGTCTCCCTCCTCTCAGGTGCGTCTGCTCGAT
CGACTGATCCTTATTCCCGAGCCGATCTGTGTTCTCATGCCGGATCACTC
ATCGCGGGGAGGTCGTTGCTTGCCTTCGCAGGTGTTTCAGCGGGAGCCCG
CCGCCTGAGGCGGTGGCGACGATGGCTGCCGCGGCTGTCGGGGAGATGGT
CTGGGTGCCGATACTGGAGGAGGGCGTGTTCCGGTTCGACGCGTCGGAGG
ACGCGCGCGTCGCGGCAGGGCCCAGCCTGTCATTCGCCGAGCCGGGGCGG
CGGGAGGTGCAGCGTGCCGGAGGGGATTGCCCCTCGGTCTTACCGGCGTG
CGAGGTGGCGGGGAACGTCCAGAAGGTTGTGATCAAGGTACGCGTGGTTC
GCTCCGACGCTATAGTGTTTTGAATGATGTCAGTTGGTGGCATGCGAGTT
TTTTCTTCTCGGGCTGGTGGATGGGAGGTATTACCATTAATAATTTGTAA
ATCCAGTAAGTCGAATTTCAGTCATAATATGTTAAATCTGATTTGAGTTA
ATGGGATATTTCATAGCTTTGGCCTTCAAGGAAGCTACATTGTCTCTTTT
GTTTTTTGGCAGTGGTATACTATCCATATTTTCATTAGTTCGTAATCAAT
TTCAGTCATATATTAAATCTGGATTGAGTTCATGAGATATTTGATAGTTG
TGCCCTTTGAGGTTACCAACAAGTTACAAGTTCTTCCTCGAAGATGATGA
TTTATGCTCTATATTGTTTTATGTTCCGAGACACATTTACAAAAATGCAA
ATTTTAATCACTTCATTTTTCCAAGTCAGCATGCGAGTGATTTATCTACC
AGACATGATAATGTTTTATATTGGTAAAGTGTCAGAGTTGATTGGGGTGT
CTTCGAGTTTACTGTTGATCTTTAAACTTATCCCGTAGTTCAGGAGGGTA
ACGTGCACTTATCTCTCAGTAATATAATCGTTATCTGTCAATGCAACTGT
AATATTGTCTGAACATTGAATCTTGGACTAACTTGAATATATTCTCTTAA
ACAAACAGCTTCCTTCAGGGACGTCTTTATATGGCACGGGAGAAGCAAGT
GGCCCACTTGAACGAACTGGGAAACGAGTATGGGTCTTCCTTAAATGTAT
TATTATTATTATGTCCCCTTGCTGCTTCTTTTAACAAATATTTGCCTGTG
GTGGTCTCTCCTGGTATCTTCCCGTCAGGTTTTCACTTGGAACACAGATG
CATGGGGTTTTGGGCCCGGAACCACATCATTATATCAATCACACCCTTGG
GTGCTGGCTGTACTCCCTGATGGAAGGGCATTCGGTGTCCTTGCTGACAC
CACACGACGTTGTGATGTATGTTCCCTGCATTTCTCTATAGCTTATATGT
GGATCAACTAATCCGTACCTTTTAAGTTAATTATCGTGTACTATATCAGA
TTGACTTAAGACAAGAATGTACCGTGAAGTTTTCTGCCCCATCTGCCTAC
CCTGTCATTACTTTTGGACCATTTAATTCACCAGCTGAAGTCATGACATC
CTTGTCTCATGCAATTGGTACTTCTCATAACCAATCTCTTCCCATACTAA
CATCCATACTGCATACACTTTTTTCATATTCAGTGCTTTCATGCATTTAA
TTTTCATATTGTATATAAACTCAGGTTGTATATCTTATCTCTAATGTGAA
GGCAGGCTATGTTTAATGGAGTATACAATTCCATTTTGATTAGTAGTGTA
TACTAGTATGATGTTATAGTGCTGGTGACAGTTGTATACAACCAATAAGT
GAGCAAAGTATTCAGTTGTAAGCCAACTGATCTAGAATTATCACTGTTAA
ATCTATTCAAAGAGATATTCTTGAGGAATTGAGCCAGTGGAAAAAAATTG
TGTTCTGTGGTGACCATTGCTAGCTGTATTTTTGTCTGCAGTTTGCTCCA
AGACACATGAGCTACCTAGAACAGTTTCCTTGTTTCATTTTGCTTATTAC
CTTAATATCTAATTTGTCATAACAAAATCTAAAGCTTAAATTTATATGTG
CCTATGTTACTCCTCCCAGTTCCATTAAAAAGTCATCAATTTTTTTTTGA
ATGATACAATTAGTCAGAGTTCCAAAAGCTTGACTTTGCCTGTGTCCAGA
AAGGCAAAGTTTAGGGAGCTGGAGGAAATATATTACTTACTCTCCACTTA
AAAGTATAGATATAAAAAAGATACATTACAGGAACTGTGTCCATGCCTCC
AAAATGGTCACTTGGCTATCATCAATGTCGTTGGAGCTATGATTCTTCTG
AGAAAGTACTCAAGGTATATCTTTTCAGAATGTATTTTATTTTCAAATGC
ATTGTTTCTCTGAAGGTAATACTAGGGGCAACAAGTCGTACCCTTTAGTT
ATGAGAAATAGAAGTGTATAGTTATTATTAATAGGTTTCAGTTTGGTATC
TTGCATATCAGTCCATAGTTCAAAGATCAATGTTCAAACCTGATAGCGTG
AACTAAAAAGTGGGGTGGATGGGAATTACCGGAAGAGAGTTCAGTGTGGG
ATCCATATGTGTTAAGCTTCTCACTGTCATTATATATGTATACATGAATA
GAATTTTGCCCGCATGTTCTACCCTTACTATCCTATTTCCATCTCTTGTA
AACCCCATTCACCCATTGATCCTTGATAGTGACCCACACAACCACCAGCC
TGAATGCCATCCAGTTAACCAATCACCTTGACCCTACTCGAGCTGCTCAT
GCTGCTGCATGCCATCACTTATTGGCGATCTCCAGCAGCTGCTGCTCTGC
TTAGTAATAGTAAGTGCACCGCCGTCATAAGAAATGTTCCGCTAACCGTA
TTCCTACCACAATAGTACATATGTCTACACTAACACTTGCAAAAGAAGTT
AGAGTTGTAGAATAAAATAGTGGTGGTGGATGCTGATTATCATTGCGTTT
TCCTTGATCTAGTTGTTTTATCATAGCATTATAAATGTTTAAACAATTGT
TATAATCTTCCCATGCAAACAGAAATGGAATGAATTATTCTTACTGATGA
CTCTTTTCCTCTAGCTGTTTGTATTGTTGGAGAGTAGATCATATTACTGA
AAATTGAAAGAACTATTTTCGAATTTGCTTGGTCTCCATTTCTTTCAAGA
GGTTCATTTGTAGACATAGTGCTTGGACAGTTGGTCCAGCTGCCACTAGC
ATGTATAAATGTCTCGTGATCTTGAGTCACTGTCGGGCTTAAAAATTTCA
TGCTGTCTCTCCACAGGTTGTCAGGACATTTAGGGAGAAAGGCATTCCTT
GTGATGTTGTTTGGATGGATATTGACTATATGGATGGTTTTAGATGCTTC
ACATTTGATAGTGTAAGTATTTTTTGTTGTTATCATAATTACTCCATGAA
AGTAGTAATACCAAACATCTGGATTAGGTTCCTATGCGTAAATGTATATT
TCTTAAAAAATGCCAAATAGCCTGTAATTTTTCTAACTATGGCTGTCAGA
ATGTCTATGGTATAAACTTGTCACAATGTGAACCAGATAGTGTTATTCTG
ACTGCATTTTGACAAGTTAGTTTTATTCTGGTTGCAAGCTTGAAAATTTT
GTTTCATGGCCATTGATTGCTTTTGCGAGACATGACCATCGATTTGTTTG
AGTAATTTGGCATCTGATCATATTTTACAGAACCGTTTTCCTGATCCGAA
ATCTATGGTCAATGATCTCCATTCCATCGGTTGCAAGTCAATCTGGATGC
TTGACCCAGGAATCAAGAAAGAGAATGGTTACTTTGTATATGATAGTGGT
TCTAAAAATGATGTTTGGATTAAAAAGGAAGATGACAGCCCATACATTGG
TATGTTTTGCTGAATTCAGTGAGCTCCTTTGTCTTCTTAATGACTTATTA
GTAAATGATGCCTCATGTACTCTATTCCAGGGGAGGTATGGCCTGGTGAT
TGTGTTTTTCCTGATTTTACCTGTGAAAGAACCCGCACCTGGTGGGCTAG
TTTGGTAAAGGATTTTGTCTCCAATGGCGTCGATGGAATATGGAATGATA
TGAATGAGCCCGCTGTCTTCAAAGTATACGTTCTATCATAATTTATTTAT
TATGTACTATATGTCTAGATTATGTATCACAATTCTTTATTTATACCATA
TTATTTTATTTTCCCCCATATAATAAAATGTAATGGTGTCAACTTGCAGA
CTACTACAAAAACGATGCCTGAAAGCAATATACATAGAGGAGATGAAGAT
ATTGGTGGTGTCCAGAATCATTCTTACTATCATAATGTAAAATTGTGTCC
CTTTGTCAGTAAAAAGTGTTGGAACGCAATCACATAGCTTTGCTATTTTA
CATGCTTGTTTTGATCTTTATAATTTCCAGGCCTATGGAATGCTAATGGC
AAGATCTACATATGAAGGAATGGCGATGGCTAGTACAGACAAACGTCCAT
TTGTTCTTACACGAGCTGGTTTTATAGGAAGCCAGCGCTATGCTGCAACC
TGGACTGGTGATAATCTATCAAATTGGGACCATATGCACATGAGTCTACC
GATGGTTCTTCAGTTGGTAGGTGAAGAATTTTTGCAAGTGAAATACTTCC
GTCTAAAATAAGTACCTGAACACTAGGCCTTTCTAATTTTTGACAATATC
ATCCCAAGTCAACTTAAGGAAAATAGTTTTCCACTTAATTTATAAGCAAA
TGAACAATCCATCAGTGGCCAAATTAACTGACTGTGAGTGCAACCTTGTG
ATCCGAAAGCAACGCATATTGCTTCCTGTATTAGTTTACTGCCTTGGTTG
TTCTGTAAGTTGCAATTTCATTACACGTGTTACGTATAAGCATGTCTTTC
TTAAAATGTTGGATAAGTAATCGCAGTATTTCTAAGAATCTAATGTGTGG
TTATCTGATCAGGGTCTCAGTGGTCAGCCATTGTCAGGTCCTGATATTGG
TGGGTTTGCTGGAAATGCTACTCCAAAACTTTTTGGAAGGTGGATGGGAG
TGGGTGCATTGTTTCCATTTTCACGAGGCCATTCTGAAACTGGAAGTATT
GACCATGAACCATGGTCCTTTGGCGAAGAGGTACCGTTTCATGCCCCCCC
CCCCCCCCCCACCCCCACCCACACCCATGCACACAACCAAGAAGCCTAGA
TCTCTTTGCATGATGCCTGCATTTAAATTTCTCCATATGATTCATTACAT
GTCAGATCTATAAGTGAGCCCTCTTTATTTTGAGATAACTAGCTAAATAC
TCACGCGTTGCCCTAGAAGTTTTCGAGTGCATGAGTTGCTTGAACACTAC
CTCATCGTAGCCCCTTTGTCCAGATAAAAAAGAATCTGAAAATAACAAAT
AATCAGAAGATTGCCACACATCTGTGTACTACATAGAATGTATGATAATT
GCTGTAATTAATTTTCTGGCAACTTCATCAAGAGGTAATTTCTGAGTTGA
ATGGACTGCCACCAACTCAAATCTTTATAAGAATAAAGATAAAGATATAC
ATTTCGTTCAACAAATCAACAAGGTATACCTTTTTTTTTGGAAGCTCATC
TCTAAAGAACTGCGGGGTTAAGCGTGCTTGGCCTGGAACAATTTGAGGAT
GGGTGAAAAGACTAGTGTTGGGTCCGGGGTTAAGCTCATCTCTGAAGTTG
TTCCTGGGTGTGCACAAGTGAGGACAAAATGCGCAGAAAAACTAGTGTTG
ATCTGTTGGGCCAGTCTAGAGATTCTAGAGAGCTGCCAGGGGTAACAGCT
GCCGGCCTGGTGGTGGCCGGGGTGTTGCACGACCCCATCATGTTTTTTGT
TTGTTTTGATAAACAATTTTTGGGCTGGCTTTTTCTTCGTAAGAGTTTAT
TACACATTACTTTAGCAGGGATTTTTGTCTCTCATTGTATACATTACTTA
TAATCATGGGCACTTGGCCGTGTCAATATGCTAGTCTTTACTGGACTTGG
TCCATGCAAAAGCAACATATTTAGACATTGTTTCCAACAACAAGTATTGT
TATAGATCACATACAGTTCTTAATGAGATAATTAAATTACTCATAAGCCC
TATCTTATGTGTTTAACAAATCTCATGCATGCACACACGCACCCTAGTCC
ATCCATTTTCATCATTTACATCCTCCATCAGTGATCCTAAAATTACTCAA
TCTGGTATTTGTAGGGTAACATTTACTTCCAATGATTCTTTCCCTTGGTA
ATAGAAGTACACCCTTTGACCCATATAGCGACAATTAATATGGATCGGAG
GGAGTAACATTTTGATTATTACGAGTTGACGTTTACGTGTTCTAATGCGA
TGCTGTTTGAAGCCCCTTCAAGGCTTTCCAGATTCTTAAATTCTAACAGT
TTATTTATATTTTAGTGTGAGGAAGTTTGTCGCCTTGCGCTGCTAAGACG
GTACCGGCTACTGCCCCACATCTACACGTTATTTTACCTTTCTCACAAGA
AGGGTACCCCAGTTGCCGCTCCACTTTTCTTTGCTGGTAATAATTGTTGT
CTTACTATTCAGTAATGTCCCTCAGTGATGGATACTCATATACTAAGGCT
CAGACTGTGGTTGCTGAACTGCATAATCAGAATCTAGTTAAGAGATCTTT
TTTACTAATTCTAGCAAGTTGATGTTACACCTCAAAACAAGATACTTCTA
ACTAATTGAACACGGAGCTGTCACATGAATTTAGCAGGAAAATAGCATTT
TATAAATGGGAAACTTGTGAAATTCCTTCTGAAGTGGAGCCTAAGATAAT
ACCAGCTACTGATATTTATGATGCAAAACTTCATGCTGAAAATATTTCTT
CCCTTTGTCTCTTCTTTACTGGGATTATCTCATTGGAGGGCTTTTTTTAG
TGTAATACTAAATCATACCCCTTGTTTTCTTGTAGACTCGCAAGATCCAG
AATTGAGGAAAATAGAGACTTCGTTTCTCCTGGGACCACTTTTAATCTGT
GCAAGGTAATAGTTTCACATCATTGCGCTAAACAGAATATCATTTTTTTT
GCTTTTTTTTATCTTGGAAGACCAGATATCTGTTCCTGATCTTCTTCTCT
ATATGAGCAATGTGCTTGTCTGGAATCTGATTTTGCACCGTTGACTGTAA
ATGTTTAACTCTCAGTCATGTGCTTCTTATACATATAAAAATATATAGCG
AACTAATGAAATATGTTATAATTTTGTCTGTGCTTTGGTGTGATTTCAAC
CGTTATGGTATTTTGGCAGCACTGTACCTACTAAAGGAGCTCATGAATGT
GTACATAAGTTGCCAAAAGGTGTTTGGTCACCTTTTGATTTTGGAGATTC
CCACCCTGTAAGTTGGTTGGTATACTATCATTATGATGTCTTGAATGCTA
ATATGGAACTGAAGTGTTTTTTATCTGCAAATGAATGATTGTGCAGGATC
TGCCGGTGATGTATTTACAAGGTGGAGCAATACTTCCTGTAGGCCTTCCT
ATTAAGCATGTTGGTGAAGCAAGTTTAGAGGATGATTTATCTCTACTTGT
CTCGCTGGATGAAAATGGTATGCACTACGCACCTTCTACATTTTGTTCCT
TCACCTTTTGTCTGGGGTAACTTGTGTTTGTGGTCTGTGGTGCATGGTCA
ATTCGTTATGCTTAATACCATTCATAAGCAAACCTCCCTTACATAGCCCC
AGCCTAGTTACTTGCAGTAATCTGCAAGTACTTGTATATATATATATTTT
TTTTTTATAAAAATGACAGAATCTGCAGTCCATCTAATTAATCTGTGTTT
CAATCATCTCATGTTTTACTGCATTAGTTAGCATATTTTCTGCGGTCAAC
AACAGCAACAACAAATCCTTTTTTTCCCAAGCAAGTTGATGTAGGCTAGA
TATGAAACCCAACAGACACTATGGAACCAAAAAGTGAAAGAGGGAAAAAA
AAGTAAACAAAGTATGAGTAAACTAAGGTAAAGCTGGGGTGTCCTATTTG
AATGATAAATTCTGTTTTGCACCACGATGACTTGTTTTACAGGTAAAGCT
GAAGGTGTCCTATTTGAAGATGCTGGGGATGGATACGGGTTTACACAAGG
GAACTATCTCTTGACATATTATGTTGCCGAAGTCCACTCAAATGTGGTTT
CTGTGAAAGTTCTGAAAACTGAAGGATCCTGGAAAAGACCCAAACGTAAC
TTAAACATAAGTATATTACTTGGTGGAGGTGCTATGGTATGTCTATTGGT
TTATTTCTCGTTCACCATACCAGAAAATAAACAACTGTTGGCTCCAGGGT
TTTAATGTTTTTTGTTAACTCAGATAAGTTCAAGTGGTGTTGATGGTGAA
GAACTACATCTTACAATGCCTCCCCAATCTGAAGTATCCAGCTTAGTTGC
AACAAGTGAACTCGAGCTCAAGAGACGTTTGGGTATCGATCCTATAACTT
TTGATGGATCTAATGTTTTATATCTTAAAGAGCTTACTAGTACCGTAGTG
TAAATTCTCTGAAGTTGGTTTGCATTGCTATCTTGTGATGGTTGTACAGA
GATGATTCGGCCAATACCTGATATCGATGAACCATCGGGACAGCAAGGTG
CTGAGCTCTCAAAAATACCTGTTGATTTGAAGAGTGGAGACTGGTTGCTT
AAGGTTGTACCATGGATTGGCGGCCGTATTATCTCGATGACACATCTTCC
TACTGGTATGGTTCACCTGTGTTATATGATTAATGGACTCCTGCCAGTCC
TACAATCTCATTCTACTGATAGGATATTCTATCAAATAGACATTGCCTTG
AATTGTTCTTGATCTGCCAGTGCATCTGCTGCAAAGGGATAATTTTGAGT
TATTCTCGATACTTTAAGTTCAGTCCTTGTAGGCCATTGATTATTGCCTA
TGGATTTCAAATAGAGACAATTTTATTTGTTAACTCGAGTATCGGTTATA
ATTAATCATTGCAGATTCCCAGTGGCTTCATAGCAGGATTGAAATCAATG
GTTATGAAGAATATAGTGGGACTGAATACAGGTCTGCTGGCTGCACAGAA
GAGTACAACGTCGTTAAGTAAGATCACCATTGAGGCTGTTCCCTCTTTCA
TTTGGGTGAATAGTTTGTTGTGTAGTTCCAGTTTTGGCAACAAAATAACA
ACTAAAAAATTTATAGGAGGTATACTGAGCAATCAGGAGAGGAGGAATCT
ATTTGTTTGGAAGGAGATATTGGGGGTGGTCTGGTTCTTCAGCGCCACAT
ATCCATTTTGCAAGACAATGCAAAGATTGTTCAGATTGATTCTAGCATTC
AAGCAAGAAGTGTTGGTGCTGGCTCTGGTGGGTTTTCAAGGTGAGTGTGC
TACATCTAATAAAAAAAATCATGTTTGTAAATCTTTAATCAGGAATTGTG
CAGCTTACGACATAAGTAGTTGCAATAAAAGCAGTCACGTGAATGCTCCC
ATGGACTTGCACTGATGCAATAAAAGTAAATGTTCTCAGATACTGTTATG
TCTTAGATATTGCCCGTTTTGTACTTTTCTCCTAGCAATTTTAAAAGAAG
AAATTGATATTTGTTTCGATCTAATTTCCAATTTTTTTACCATAGTTGGT
GATTATTGATTATACAAAGTTTCATTCATATACATCTTTGATTATTCAAA
GTGAAATAATATCACAGCATATTGAAGTTTGTTTTTCTTTGAAGGTTGGT
ATGTTTGCGAGTGCATCCTACTTTCACTCTTCTCCACCCTACCGAGGTGG
TTGTTGCTTTCACAGCCATCAATGGTTCTAAGCAAGAGATCTCCCCTGAA
TCTGGAGAAGTAACATTTGAGGGAGACCTCCGGCCAAATGGTAAGTTAAT
CTGTTCAACGTTCTGAGATTTTGTTTTTTCCTGATCAGCATTTTTGACAT
AAAACTGTTACTTTTGTGTTGATTTTTTTTGTTTCATTTTTAACTACCAG
GGGAATGGATGCTAGTGGACAAATGTGCAGGGCTCAGTTTGGTAAATCGT
TTTGAGATCAGTCAGGTCAGCAAATGTCTGGTGCACTGGGGAACAGGTGA
TTTGAACATGGAGCTTTGGTCGGAGGAACGGCCAGTTTCTAAGGATACAC
CGTTGAGGATTTGCCACCACTACGAGCTGAAACAAACAAGCTAAGGCATG
TTTGTTGGAGCTGTAGCTGAATGACAATCAGGAGACGTTACCATGTTGCG
TTTTAGGGTTTTTAAACTGCAAGTTTGATGTTTCCATCATGTGAAAGAGT
TGTCGGCAGTGTTGCCTTTTCAAGCGTGTTCACATTACTTGTAGTGATGT
TTAATAATTTGTTTCTACTCCCTCCGTTTGGAAATATAAAACGTTTTAGG
TTTGTGAAGGAGATACATCTCCTATACACCGCTGTATAGGAGAACCTATA
CACTAAAAGGTGACTAGATACATCTCTTTCACAAACCTAAAACGTCTTAT
ATTTTCAAACGGAGGGAGTATTAAGTACTTGTGGTGATGTTTACCATTTT
TTTTCTAGTAATTATTTTTATGTTTTGGTGGTGTGATAACATGGAAGAGA
AGGAGGCTGTTTTTTCATTTGCTTTGCAGGGTTGCACATAGAACTGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.