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GrainGenes Sequence Report: AA032898

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Sequence
AA032898
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032898
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCCTGTCCCCCGAGCTCACTCCCCGCCCTCATCCCCGTCGTGCCGCCCT
GCCGTGCTCGTCCGAAGCTCCGCATCGCCGCCATGGACGCAGGTGCAGGA
CGAGGACCTCCGGCGCATCTGTAACAGTCCCACTCGCGCCGGACGTGGAC
TCGGACCACCGCCCGCCCCTCCGTACAAGCCGCCGCCTCGCCGGTGGAGG
ACGGTCATCGACTGCCGTTTCCCAGCTGCTACTGGTCGAGTCCGACCCGA
TCTGCACCGCCACCGGCTCTCCGGCCTCGTGTACACCGGCAGCAACAAAA
TTCGACCAACAGTGAGCTTGAGGTAGCAAATTTTCTGCCTCTCCCCAAAT
AATATCCACGCTGCTCTCATGCTCTGCCCTACCCAACAGCCAACCTAACC
CTAAATTGTCTCCCGTAGTCCACCACCGCTGTGCCCTGGAGCTGCGTCCC
TGCCGTAGCTCAGCGCCACCGACGGCGCCTCTACATATCTAACCCCTCCA
CCTCGTACGCTGTCGCTGCCATCGCCTTTCCCCTTGTACCACCTCGTCGC
GCCCCTCGTCCGCACTCTCGGACATCGATTTCTAGGTATGGCCGTATGAG
CTTTTGTCATCCGGTGATTGCTTAATTTCGAACTAACTTCCACATTTTTC
CAGTCTAGATCCTCCACTGGACCTTGAGTCGCCGCGGAGATGGATCCGAT
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TCTCTGGCTTGGATTGTCCGATATATCTCATGTATTGTTCCTTTTTGGTG
CCAAAAAGTTTGGTGCTGTCGTCCCTGCATAGGATGTGGTCCTGTTAACC
CTAACCCTAATCAATATAGCTATGGGGCAGTCATTTGCGTAGGCAATATG
CATATTATACTAGCTAAATGCGCGTGCGTTGCTACGGCATAAAATTTTAG
ATTATACAACATGTCATATTTGTCCTTTTACATGTGCAGTCATTAGAATA
CCTTATTTGGACACGGAGTACTCCACTCCAGAGTATACCAGAACAAGAAG
GATACGAGTATTTTTGCAATTGTGTTTATCGTAAACACACATGGTGATGG
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TTTTTCTCGTTGTATGTTTTTTCCTACTCACTGCGAAAACTAGACAAATA
TGTCCGTCTCTTTCTAGTCTCTACCTTGGGCTAGTCTCTCATCTTTGCCT
TCTCAGAACCAGTGTAACTCTCTAGTTTATTTTTTGAATGGAATATCTCT
CTCCAGTTTTCCATCTTTCATGTCACCCTCCTATGTACTTCCTCCGTTCC
ATCAAATTTGACTCAGATTTGTCTAAATTTGTATGGATCTACTAAAACAA
CATGTCTAGATACCTACGAATCTAGACAAATGTGAGCCAAAAGTCTTATG
GAATGGAGGGAGTAACATAATCACCTTATGTAGAAAGTAACTTTTGTCTT
GGATGCAAGAATAACACAAGTGTATATATGTCTGACTAATTCACATGTGT
ATAAAAATGTTCCATACTATTTGGCAACCCTAGAATGAAGAATGTAGCTT
GCAAAATTTCAATTTATTCTCAATATCCATATAGGTTTACTCTTTCACAT
GTACCTGTTATTTTCTCGTATTCCAACGTTGCAATAATAATGAATATTGG
AAAGTCATATCTGCACTAGAATTAAGCGCAGAGTACTATGCATTCAAAAA
AGCCTCATGCACCGGAGTACACACTACATGCATACCTGGGCATGGGAAAC
CCGGCCCGATAAAAGCCCGACTGGCTGGGCTTTTCTGGCCCACGGGCCAG
GCCTGGGTGGCGGATCTGGGGCCGTGTGCAATCTGGGCCGGGCTCAGGCC
TTGAAAACGCAGAAAGTAGGGAAGGTCTGGCCCGACGGCCTGATGGTTTC
CTGCAGGTTCGAGCCGGGCCTGGGCTTTGATCTGCGGCCCGATAGCCGGG
CCGGGCCAGGCTTGGGTTTTGCCCAGCAGGCTTTTTTTGGCCCGACCCGA
AAAATGCCCAGCTATACTACATGTGGACCAAGGCTGGGCAGCACGACCAG
CTGCTAGCGGCGTTCAGGTTCTGTGCTGCTCGGGCTGGCACGGCGGGATA
AAAGTCCAAAGCGACATGCTGCTTTGATTCCACGTGGAGGGGGAAAAGAA
AATGAGGCCGCCTCACGGGAAGAAATTTGCTAAAACGAGCGCAGCAACCG
AGATAGGGTGGTGCGTTGCAGTGGGCGACTGGCTAGCGACGCGACTGGCA
ACAGGATGCAAGCAAGTGTGGGGCGGCGGCGTGTGTTAACTCACGCGGGA
ATAGAACGGCGGAAGATCGAAGGCTGTAGGTGGAGCTGGCGCGGCGACAA
GGCAGGATGGAGGCGCGTGTTGACTCACGCGGCTGGATCGAGGCAATCAG
CGGGTGGCCAGCAGGCTGCTTGCGGCTGGAAATCAAGATAGAGTTGGAGA
GGCGTCCGGTGGCGTGGGGTGGCCGGGGACAGCCGCTGGAGTCGAGGGGC
GTCAGCGGCGACGGGGTTCCCGTGCGTGAGGAGACCTAGAATAAGCAGAG
GAGATGATGGTCTCCAGAGGGAGAAAAGGAAAAAAAAACATTTCGTGATA
GCTTGCGGTGGCACTTTGTTCGTAAATATGCACCATACCATCATCACGTG
TTCCAATTTAATAGTAAAGAAATTTGTACGTCGTGTATGTGTTTCTAGAT
CATGTGATTCTCCTATGTGAACTGGCTTGGAATTTGATGTAGTTTTGTCT
TTTGACTGGTTACAGGATCCTAGTGGTAAGAATTTAGTAATTCTGCTAGT
GATTTATGGTTAATTAATGAATTTGCGCTGGCGGTACTAGCAGAGATGTG
ATTCCTGTGCCAGCTTTTAAAAGGATTTTTTTGGTGTGTAGGAGGATATG
TATTCTGTCCGACTTGTTTTAAGGTGTATATTCTGTTTCTGTCATGTCTA
TAAATATCCAGATGTAGTTGTGTTTTGTGTCATCTGAGTATCTTGGTTGA
AGTTGAAGGTTGTGCTACTTTTGTTGGTTTAGAGTGGGTGAAAAATGGTT
CCATCTGTGTTTCTCTATTCTAGATGATCCGTGGAAGGGAACTCATAGTG
TACAAACTTACCCTGTTTGTGTCCCTTGCCTTTCTTTTCTTATAAGAACT
CATAAAAGTGTATATTTTATAATTTTGATACACTTTTCTTCGAAACCTCA
CGATACATGTTGTTTATGTCATGGATATTTCTACCTTTTTGCGGTGTTAC
CAAACCTACCTAATTACTACACTGTCGCAACTTTTGGGGGGGGGGGGGGT
GTAATCAAGTAGAATTGTCAGATATAAATGGTTTCCTTGTTTCCTGAATG
AAATCACTTTCCTCCTGTCTATGAGCCTGTTTAGAATCATAACTGGTTGA
ACATTCTGCTTTTCGTTTCAGCAACAATGTTTAAGATTATTAAGGAGATG
CTGCCACCTGATGTTCGAGTGGCAAGAGATACACAAGATCTTCTTGTTGA
ATGCTGTGTAGGTAAGAACTATATTATGACAATCATTTAGGTATATGGTA
CAACTTGTGTGTTCAATCGTGCAATGTTTTCTTTCAGTAGCAGAGTTTGG
TTGGGCTCTACCATCTTGCATAAATATTGTAGATTCGGTGAGGTTTCATC
TACACACCCTCCACCAGTCCGAGTAGGGTACGCAGTCCATCCGAGTCCGA
GTTGTAGTAGTATATGAGTAGTTAGCCGTCTTGGTTTCCTAAGTCCTAGC
TTTTATGTGTAACCAGCTTGTAATCAACACCAACACATGACCATGGGTCA
ATATTCAGAAAGGCATATACAGGCAATCAGCGAAGTCTTCACGGGCGTGT
GCGAGGGCGTGTGTTGCCGACTTGCCGCTAGGAATTGTTCTAGCTAGCTT
CATTTTGTACGTGAGCGTCCAATACTTCTATGTGTAAAACTGAATGCTAT
TGTGATCAATATAGAATGGCGATTGTTCCGCGGCAAGGCGCGGACAGTTA
GCTAGTTGTTCTAAGGAGATTAAGAGGGTTAAGATGCAAAACCTACTGTA
TGTGCCATTAATTATATGGTAGGGTCAAACTTGTCTGTTCGTGTATAATG
TAGTTATTTCACCTGTCACAATTTATAGTCCAGGTATTTGTGTCACTAAT
TTCACTAAGGATGATGGGTTAACATTTTGCATGTGTATTGTATCATTTTT
TCCTATCATCAAGCAGAAGATGCAAGAATGTATCTGATCTAATGCTTGTA
TGAATACTTCTTTACATTTCAGAGTTCATCAATCTTCTTTCTTCTGAATC
CAATGACGTGTGCAGCCGGGAGGAGAAGAAAACTATTGCTCCTGAGCATG
TTATTAGGGCTTTACAGGTTTGCCTTCCCATTCCTTTTATTTACGGTGCA
TGATTATATGAAATCCTTTTATTATGCACATGGTTACATGAACAATCTTT
TCGTATAATTGATGAAATTTTGAGTGTTCACCACTGAAGAACATGATTGC
ATGAACATCTCCTTCAACCGTCATGTTTTTTTTGTAGTTGAATAATAGCA
TCATTCCAGTATGTTAGTTCTTCAAGATAATGACTACTTATTTCTTTGTG
TGGATTGCCAATAATATAATCTTCGAATTTTTGAATTTTTGATACTCTAC
AACTTGAAGATAATGATAATTGAATGGCTGGGTATGGTGTGAAAGGTGAA
CATATACATTACATTTACATTTACTGCTGTCATTACAGATCAAAACAGCA
GGTGATGCTTTTGCCTGTATTTATTGCAGTTTTAGCCACCATGAAATAAG
CTGTGGAAAACCTGCTGAAAGCGCCCATACTGTTTCTATAAAGGGCAAAC
TCAAGGGGTTAAATGACACCTGTGTCATCCTTGTCCTTGCTGAATAGATG
TGTTGACTTCATAGACATGCTCTAAGCACGAGTTATTGAAAAGCTTAAAT
TGGAAATCTTTAAAAACAGCTAAACGGGACCTGCCTGCGCTACAGGGCAA
CACCTTGCGTCCCGGGTTGCACACGCGGGCGACCCCAGACGGACAAACCC
TAGCGCAAGAGCACCCCCTGCCGCGGGCTCCGCTGCTGCCGCCGGCGCTG
GTGGAGGTTGCGGCGCCTGGCCGTCGAAGGCGGCGGGCAGGGCAAGGTGA
GCCCCGTCAGGCCTTCCTCGCGAGGGGATGGACGGCATCCGTGCGTGCGC
ACGGTGGCGTAGTCGAGTGGCGGCGAACGGCGACGAGGAGCGGACGACCT
GGCCGGAGTTTGGCGGGGAGGACGGCGTGCGGAGCGAGGAGTGGAGGCGT
CTGCGTGCTGGAGGCGCCGACGCGTTTCCTGGGCTGCAGCGCGGGCCTTC
CCCGGCCCTGGAGGCGAGGATGGTGGAACTGCGTCGGTGCCCCCGGCGTT
GGGGCTCCTGGAGGCCGCGGAGGAGCCTACGCAGACGGTCCTGGCTTTTG
GCGGCACGGGCCAGATCTGGCCTGATCTGGGCCTAAGGGCTAAGGGCTGT
GGCTGCAGCAGAACTGTCAGGGAGGTGACAGCTGCGATGCAGCGAGCCTT
CGACTGCTCAGGAGATGGAAGAAGCGTGGGGCTGCAGGAAGACATAGTGC
TCTTGTTCGTGGTCGTGGGAGGTCCACGAGAGTTCAGCAAAGACAGAGCG
GTGCTGCGACGGCGGCGGTGTGATCAACATGGATGTCTGCCCCTTTCCGG
CGAGTAGGCAATGAGGTGTGCGGCAAAACGGACGAAAGTCTTGCCTGGCT
TCAGTCGGTGCCGGCGACGAAGGCGCCCATGGGTGTTGTTCTCCTCCTTG
GAGGCGTCGCCGAGGTGTGCCGACACTTCTCTCGCACTTGTTCCGGCATG
GTAGAAGTCTCTAGGCAAAAACCTAGGTCTAGATTGGATCTCCGCGATGG
CGATGTCCTTGACGTCGTCACTCTCTTGGGAGCATCGTGTTTGGAGACAT
GGCTTTGAGGTCCATGTTGCACTCCTCCGGTGCTTGCCGCGATTCGAGGC
TGATTGTCAGGGGCACGCTGTCGCTGGCAAGTCCAAGACGATGCTTTCTT
GGGACCGACCGAGTTCCTCCATCTTTCTCTTTAGATGGTGCGTCGACAAG
GAGGGTCTTCTTTGGAGCGGCTGTTCTTTGGAGGCGTCTGGTGTCGGTCG
AGATGCGGATTTGTTGCTTAGCTTAGGATAGGCTCTTTCTTCTTCTTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTTCTTCTTCTTTCTTCT
TCTTCCTGTGGTGGCTATCTTCGGACATGCCGGTGTGGAGTTTGTGCTGT
GCTTGTTGCTCGCAGCGAGTGGTAGCTTTCTTGTACTCAAACCTCCGCCT
TCTGTAAAATTATGGTATACTCTCAAAAAAAAAAAAGAAATCTTTAAAAA
CACAAACCACCAGAGAACAGGTCAAAGACAAGTCTACAAAACCGGAGCAG
ATGTCGGTCAGACTAGAGAAATCGGAAACAGCGGCCTTCTCTGGTACAGT
TTGCTTAAAAGACTATCCTGGAAAAAAAGGTGCAATAGCTAGAAATCCAA
ACCATAACCTTGACCCAACGAGTGTGCTAGATCTTTACCAACTGGGTTGG
ACTCATTTTGTATCTAATTCATCTAGTAAATGCTATATTACTTCCTAAAG
CATAGGAAGTCATATTTTCTTAAAAGTAGCATAAATATTTATTGAACTAG
ATGATACCCTGTGCATATCCGCCGGGTTGGAGATTTAATTTCTAAATATT
TGCCTACAATATAAATTCATTCCATAAAATTTATGCAAGAAAAATATTAT
ATAAAAAATTAAACATGTCACAATTAAATGTGAGGGGATTAAACCCACTT
AGAATGCACTGATGCATGCTACATGGTGGAGAAGTTCTCTATACCCAGAT
CAGATGGCTATTGGTGGACCAAGCTAGCAAATCAATGGCTAGAACAAATT
TCACGATGTGGCTTATTGTGAGAGTAGATAAATAACTATTAGTGATTGCT
AGTCGGTTTGTCTATATAAGGTATACATGTATAATATTGTTGACCCACAT
TGAACTCACTAAGCTGGCGGTCCGACCAGCAAACTCGTGAGCCAGTTGAT
TGACCCGTCCACTCACTGGTCTGTTTTTTTAAACAATGGTAAAAAGCCAC
TGGTTTGCTAGGTAACCAGGTTTTCTTAGGGATAATGGAATCCTGAACAC
AGGATTTTGATTGTAAACTTATTGGTGCATGATCTCCCTTGAGAGTAAGT
GTTGCTGCTTCTAGTTGTCAATATTGTTGCATTACTCGTCCGATCTCACT
CTTTAATTCAGCTCTCAAACTTCTCACTAAACTTCTAGCCAACCGTCTCC
AAGCCATCATTCTTGAGTTGGTGCATAAAAACCAATACGGTTTCATCAAA
ACACGCACAATTCAAGACTGCCTTGCATGGTCATTTGAATACCTTTATCA
TTGTACCATAATCCTTAAATAGGATTTCGAGAAAGCGTTCGACTTGATTG
AGCACCAGGCCATTTTGCAAATGCTAAAGAGAAAAGGTTTTGATGATGGA
TGGTTGGCATGGATGGACAATATTCTCTCCTCGGCAACTTCAGCTGTACT
TCTTAATGGAGTTCCTGGTAAATTTTTTTTCTGCAAAAGGGGTGTACGTC
GAGGGGATCCGCTCTCCCTGCTGTTATTTGTAGAAGGGGCTGAACTTCTC
CAAGATATGGTGAATGACCTTAGTCATCAAAGGAAATTAGTGCCACCTGT
CCTTTTCGAAGGACAAGATTATATAGTGCAGTGTGCCGATGATACACTTT
TGTTCATGGAAGCTAGTTTCGAGCATTTGCAAGTACTTAAAGCAACTCTC
CTAGCTTTCCAACAAGCCACGGGATTGAAAGTGGATTTTCAAAAATCGTG
CTTGGTGCCAATTAACATTGACAGCTGCTATGCTACTTGCTTGGCTGAAT
TTTTTGACTGCTCAGTTGGCAAGATGCCATTTACTTACTTGGGATTACCA
TTGGGGACAACTAGACCGACAGTCATGGACTTAGCGCCTCTTGCCGACAG
TGTTGAAAGAAGGCTGAATGCATGTTCTCGTTTCCTGAATTATGGTGGCA
GGCTCACGTTTGTTAACTCTGTACTCCTCGCTACGAACTTTCTACATGTG
TATGCTCAAGCTTAATAAGACTATGGTGAAAGTGGTGAATCGTGCCAGAC
AACATTGCGTATGGGAAAAAAAAGACAGAACATCACAATTCCTTGGCAGC
TTGGGAGCTAGTGTGCAAGCCAAAAGACAAAGGTTGTTTAGGTGTCATTA
ACTTAGAGATACAAAATGATGCACTTTTAATGAAGCATTTGTTTAACTTC
TTCAATCACCGTGACACTCCATGGGTCAGTATGGTTTGGCAGGCTTATTA
TCAAAATGCTGTTCCTCACGCAGTTGGTCCTGTTGGCTCATTCTGGTGGC
GGGATGTGTGTAAATTGTTCACAACATTCCGTAGTATATACTCTCTAGTA
CCTGGTAAAGGAAATTAAATTTTATTCTGGAAAGATGCTTGGCATGGTGA
CTTACTAGCTTCAGAATTTCCAAGGCTATACTCTTTTGTCGTAGATTCAG
ACATATCTCTGAAGAAAATGTTGTGCTGTACATCCACACACCTGATGGCC
GAGCACTTGGCAATCCCTATTTCACCGCAAGCTTTTGATGAGTTAGAGCA
GGTCATACAGGTTTTGCAACCACTGAGTATCAACTCACAGACAAGACAAC
AAAAAGATGCCTGGCCTTTCTTTAGGCAAAATGGAACGTAGTCTTCAAGG
GGCTTTTACAAATTCATGTTTTCCGGATTACAAGTATCACCAATTTTCAA
GAAATTATGGAAGAGCAGATGCCTTAACAAACAGAAAGTTTTTTTCTGGC
ATTTACTAGTCGACCGTCTAAACACTAGAGATATAATGGGCAGGAGAAAT
TGACACTGGACTCAATTGTGCTATTTGTGGCAATCTGGAAAGAGAAACCA
GAGATCATTTATTTTTCAATTGTCGCTTTGCCGATAGAGTTTGGATAAGT
ATGGGTATTGATTGGATTTCAGCGACAAGCATTTCAGAGATGTTCGAACA
TGCTAGACATACTTTTCAAGGCCCGAAATTCATGGAGGTAGTGACCTGTG
CTTTATGGGGCATTTGGAAGTGCAGAAACAGTCTAATCTTCGAAGGAAAA
CAAATTTCTTTCAGCGCTTGGAAGGCTGTGTTTAAATATGATCTAGAGCT
GCTCATGCACAGGGTTAATCCCGTGCACAAAGCCACACTATCTTCTTGGC
TTGAATCCTTTTAAACTTGTGGCTGCCTGTTTGTAAATATGTAACTCTAT
TAGCTTTAATCTAGTCTAGTTTAGATTAGCCCATGTAATTATATCCTCCA
GACTTTTGGCCTGAGGCCTTTTTCTCCTTTATTAATATAAAATTATACCG
TAGGGGTCTCCCCAACGCTTTCACGGTCACAATATTGTTGCATCACTATA
TTACTCACCTTCCCTAAAAAATATAAGCTTCCGGGTCAACAGGTTGGGGT
TTAAGCTGGTGCGAAATTCTGATGTTTTTCTCAATCTTCTTCCTCTTTTC
AGGATCTTGGCTTCAAGGAGTACATTGAAGAGGTTTATGCAGCCTACGAA
CAGCACAAGCTTGATACTCTGGTTTATACAGATCTGCACCCTAACACTAT
GAATATTATGCCCTTTATAACTAACGTTGTAGAATATGCTGACTCTGGCA
TAATTATCTTGCGCAGGACTCTCCAAAAGCAAGCAAATTCACCGGCGTGG
AGATGTCAGAAGAAGAAGCTGTTGCAGAACAACAGAGGATGTTTGCTGAA
GCCCGTGCACGGATGAACAATGGGGCCACCAAACCGAAGGAGTCTGAACT
AGAGCCACAGAAGCAATCACACCAGTCTCTACAACCTCAAGTGCAGCTGT
ATCCGCAAGCGCAACAGCCTCCACAACCTCAAGTGCAGCTGCATCTTCAA
GCACAAGAACCTCCACAACTTCAAGTGCAGCTGCATTCTCAACCACAGCA
CCCCTTGCAACCTCAAGCGCAGCAGCTCCTGCAACCTCAAATGCAGCTGC
ATTCTCAGTCTCAACAACAGCAACCTCTGCAACCGCAACTGTTGCCACAG
CAGCCCATGCAACCACTCCAGCTGCGTCCTCAGACTCAACAACAGCAACT
ACTGGAGCCTCAGCTGCAGGTCCATCCGCAGCCCATGCAGCCTCACCTGC
AGTTGCATCCTCAGTCTCAACCGCAGCAGTCCTTGCATACTCAACTGCAG
CTCCATGTGCAAACACAACAGCCTGCACCACTGCCACTGCAACCCCCACA
ATCTCAACCCCAGCTCCATCCAGATTTGCCAACGCAAGTGCTGGTGCAAT
CTCGACCGCAGGAACCTCAACCCCAGCCGGAGATGCAATGACACCCACAG
ATGGAACATGGCTTGGACAGTTCGTGACTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.