Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027077

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027077
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027077
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTATTATTCCCCCCACCCGATAAAACCGTAACACCCCGAGCCCAGCGCT CCCCCCCTTCCCCAAATCATCTCCCCTCCGCCGTCAGTTGCGTCTCCGCT CCATCGATCGCTCGCTCGCCCCCGCGTGCGTGGCGCCCACGATCGACGCG ACTCCGCGTGGAATTATTTTCCATTCCGGGCGGAAGCGGTAGCGTGGGGG AGTCGCTCGGTTAGCGGCCGAGCCCTCGCAACACCCCGAGGGTTTTTGCC TTTTTCGGGGAGGCGGCGGCGGCGGCCGGTGCTATGGCGATGGCGGCGGC GGAGGCGTCCCTGACGGTGCCGCTCGGCGTGCTGCTGCGGCGGGAGGTGA CGAGCGAGCGGATGGAGCGGCCCGACGTGCTCTGCGGGGAGGCCGCCCGC AGCCGCAAGGGCGAGGACTTCACGCTGCTCCTCGCCGACGCCGGCCACCG CGTCGCCGGCGACCCATCCACCTCCTTCTCCGTCTTCGCGGTACTGCATT GCCCCCCACTGCCCTACGCGTGTCCAGAAGGTTCTAGAATCACATTCCCG GAATCGCGCGTCGGAGACGTGGGGCCCACTCCCGTAGTCCTGCACACGAT TGACACCCTGCACGTTTTTCTCTGTTGCGTTCGGCACAGCTGCTAGTACT ATGTTTTTCCGGCTAATAAATTTTGCGTTCCGCACGTAGGCTGCTAGTTC ATGACTTTATTTTGCTAATAACATGTAACACTGCGACACGTATGAGATAT ATCTTACTAGTCCAAAAGATAATAATTAAGAAAAGCACGCCTTTGATCCA AACCACGATCAAGGCCAGTCTGAGTTCAAACATGCCCTGGATCCTTAATT CTGTCACGTTGACCACTAATGCAATCATTTTTAGATTGACTTATTTAGTG GCTGACTGGTCGTATTTTAATTCGGAGTGGCGCGCTTCTGCTGATTGATC ACTGATCACTCTGTTATGTTGTTCACAGCTGTTTGATGGGCACAACGGAT CTGGGGCGGCCATATACGCAAAGAACAATCTGTTGAACAATGTCCTGCGT GCCACGCCTTCGGGTCTGAGCAGGGATGAGTGGCTTGCGGTGCTTCCACG TTCACTTGTCGCAGCATTTGTCAAGACAGATAAAGAACTGCAAGCAGTGG GTAAATCAGGCCTATCCTTATCCTTGTTTAGCTTGTTGATGATGACAAGC TAGTTTTTATCCTTGAGAAAATAGGCATATATACATTCTAGTCTTTCTTT CGTATGACAAATTGTGCATGCTGTTACTAGTATTTGGTCACTATTTCGAA CTTGGATACTTTTCCTGATACTTACAGGAATAGAGCTATTTCCCGTGAAA TTCATGTATTTGAAGCAAAGCATTTTGTTTGTCTTTAGGGACGAAGTAAA GCTGTATGAACCTTTTGTTGTCATTCCAGCTGGTTAATTAGTAGATGTTA CAGCATCAGATATGTTCTTCAGTTAGTTGTAATGCTAAATGTAGTTGCAT TGCCACAACTGTGCGTTTGCTTGTCTGTTTGGACACCTGTAAAGTTGAGT GATGCCATTATTATTTTCTGAAGCATTCCTTTTGCTCTTTCAGCTGAAAC CTCTGGTACAACTGTGACATTTGTGATAATAGACGAGTGGGTTGTAACAG TAGCATCAGTTGGTGATTCACGCTGCATACTGGAGTCCGCTGACGGCTCA CTATACCATTTGTCAGCTGATCATCGCTTTGACTCCAACCGAGATGAGTA AGTTCTGCCTTTGATGTTACAGTATTATTTACTGAGAATTATGCATTTTA CAACCTGTTCATTTACAGAGTAGAACGCGTCACTGCATGTGGAAGCAAGG TCGGGCAGCTGAATGTTGTTGGTGGTCCAGAGGTTGGTCTCTTTTCATAA TGAATCCGATGTGCTATTGAGTTGGGATATGCAGTTTAGATGTTAACTTC CTATCAAACAATGTCTCAGCTTATGATTTGATTTTTCCAGTTGAACGTAG TTATATTTTTGGGTGCACCACTTAGATTTTTTTATATGGTTATCATTCTC TTTTTTTTTATTTTGCGATGAATCATTCTAGGTATTATTTTGTAGGTCTG ATGAATTAATTTGCTACGTATGTTAAATTCTAGTGTATTTGTAATTCAAT TTTGTTTGATTCAGAGAATGTTCATGTTATATCCATTGTTAAAATTTTAG GGTATCTTCCATTATTGTAAGCTCATTCATCTCTACCCAAATTTTTATTA TGGTTAATTCACTCTGCTATTGGATAATCCGGTATAATCTATTTTTGATT TGCTTTCTACAATATTTCCTGTTCTACAAATTTATATTTCCCTTTTCAGG TTGGTCCTTTAAGATGCTGGCCAGGTGGCTTGTGCCTATCTAGATCTATC GGGGATATAGATGTTGGTGAATGGATCATCCCTGTTCCTCATGTGAAGCA AGTGAAGGTTTACTCATATGAAAATACTTCTCTGCATATGTCTATATTTT CTTTGTTTGAATATTTCTGTGCGGGTGGCTATTCGTCAGCAGATACTACC TTGTTTTTTATATTGTTCAACATGGCCTTCTATAATTAGCATTCACAGTT CAATATGATTTACTTTTACGTCAGACCACTTCGCAGCTCAGTTCACTGTA ACACTATTTTGATTTTATATTTTATTTTGTTACAGCTATCCAATGCTGGA GGCAGAATTATTATTGCAAGTGATGGCGTATGGGATGATTTGACTTTTGA AATGGCTCTTGAATGTTCTCGTGGATACCCATCTGATATAGCTGCCAATC GAATTGTTAATGTAAAGGATTTTACTATCATTTTCATCGGTTAATCGACT GAAACTTCTGCCCCTCATTTCGTTATATATTTTCTTTGTATATGAAGGAA GCGATCCAACCTCGAGGATTAAGGGATGATACTACCTGCATCGTGGTGGA CATACTACCTCCAGAAAAACGAGTTCCTAGTCCTCCAACAAAGTGGCAGG GGAAGATTGTACTCAATAAAATGTTCTGCCGAAAACTTCCAAATGCGTCT TTTAAAATTGATAGAGAATATGCCGAGCCAGATGTGGTGGAAGAACTATT TGAGGATGGATCCGCGATGCTTTCGAGAAGGTATTATTTTAACAAAAATT CTAGGCCTTTTTGTCACTTGGGGCAGCACTGCACTAGCTAGGGGCTCTAT AACATCTTCCAGGGAAAAAGGACTTAAATGTTCTAGTGTACAGTATTACG ATTTCTGTTGTGTTGTACAGGCATGTGTGTTAGTAGATCCATCAACTTGA AACTAACAAAATACTAGCTCGGGATTAGTTAATCATCACTATTGATGTCC TGATGAGTAACATACCACTGTAGGTTTCTAACAGAATAGATGACAATGAA AGGTACATTTTCGGCTAATGTAGGATTATTTGTCTTGGATTTATAGTTCC TTTTGTTACCTAGATCTATATTTGATTGTCTCATATGGGCAACAAACAGA TCTTGCTGTCTGCTAAAGGATAGTAGGAACATAATTATTGGAAGCAGCAG ATGAGTTGGCGTTGCTGATTGATGTTGTCAGCCGTGCAGCCCATTTGTGT TGTCCTTTGCATGATAATGTTTAATGTATCTGTTTGTTCCTTTTCCAATC CCCCTACATTGGATTCTCTTCTTTTCTCTGGTCATTTACATATTGATGGG TTTTCAGGCCTGTTAGACATGGTTGACATATAGTAATTATCTGAGTAGCA TACTGTTGGTCTGTAGCACCAATAACTTTTACCGATTGTTATCGGTAGCA TGTTCTAAAAAATAATAGTATCGGCAGCTCTTCATTTCTGAAATGAACAA CAATATACTTGTAACCAGTAGATAGTTATTAATATTTTAGGAGGCTAGAA GTCCGCATATTTTTTCATGAAGCTTAGCAGACGATTCTAACTATTTCGGT GACCTGATATTTTGTTGTCTACCGTTGAAACGTGGATATGTTTTTATGTG TAACATTCTAGAATTCTTCAAATTCCCACAGGCTTGCAAACCATATAATA TTGATTTATGTTTTTCTTGTTCCTTAACTGCAGGCTTACTACAGGATATG CACTTCAGCACATGTTTGAACCCTCCAGCTGTGCAGTTTGCCAGTTAAGA CTGGCACCTGGCCAGGGGATTTCCATACATGCTAACCCACTGCAACACGA GAAAATGCAAGGTTGGAAAGGTCCTTTCCTCTGCCGAAGCTGTCACGAAA AGAAGGAAGCAATGGAGGGTAAACGACGTCCAAGAGGTATCGCATTGGCT ATCTAAGATGCACACTGTGTTTAACACTACTGGGTACTGATTTCTAGTTT GTAAAAAGCTGCTAATAACTAGTTCTTTGGTGTTTATTTGTCTCTTCAGA TTCATCGACGACCGCAGATGCCTTCAGTCACATGAGGCGGCGGGCCTAAC TGCTGAAACCATTCTTTGATACATATTCCATTTTTCTCTTCATCACCAGG ATCGTTAGTCAGTTGACCACACAATTCTTTTTTTATACCTTGACCATTCT AGTCAAGCAATGCAAAGTATTCTTGACCAGTAGGCTGGAGATTCATTGAT CAGTTGGACCGTCGTAGAAAGGGGCATCTTGCTCAAATGAGAAAGGCATA GTCATTAGAAATAACTTGGTTGTAAAGGATCACTAATATTCTTTTGTAGA GTAGATGAATTCAATAAAACGACGGTTGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.