Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA000680

[Submit comment/correction]

Sequence
AA000680
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000680
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCAACAGAAATACAGGTTCGGTGCGTGCAGTTGCGGTTGCATGACAACA
TGCGCGTTGCAACCTTTGTAGTAACACACATCAGGTGCACCAGTCGCTGA
ACCAACCAAGACTCTACTCCGTAACAAAGAAACAGAAAAAACAAAAACAA
AAAACACCAGAGTCGGTTCGGATCCAACCCGAGCCGACCCGACCCGAGCA
GAGCGTCGCCGCAGAGAATCCCGGAACCCTAGCTCGCCGGCGGCGAAGGC
GGCATGAATCCAGCGCCGTCGATGGACTCGGCGGGGTCGGAGATCAGGCT
CTATCGACTATCCGGAGGGGCACCCGTGGAGGTTGCGCGGCTGAGCGCCC
TCGCTCCTCCTCGCGCGGTGGAGGGCGATCTCCGCGCTGCCGAGGGCGAC
GGCGACGGCGCGGACGCGGGCATGTTCGTCGCGCTCGTCCAAGGGGAGAG
CGTCGTAGACGTCGCCCGCTTGGTCTTCCGCGGCGGCGAGCCGAGCGACG
CCGACGGAGGGCAGGATTCATATTCGAGCAACCCCTCCTCAAGCGACGAC
ACTGCTGTGTCCGCTTCAACAACGGACGGGGTGCTCCAGGAGGTCAATTC
GAAGTACACAGATGCGCTACTGGGTAATCTTTCTTTTGGTGGTGGAGGGT
TGCTGGTGAGCTCCCAGGACGACCAGTGGATCAATCAGAGCAATTGGGAG
GGTGAAGGGAAGGAGGAGGAATGGGAGGGGGGATTATGAGGGGTACCTGA
GTGATGAGATGCGAGGATCGTCAGACTTGTTGATCTCAGCATCGGAGCAG
CCTGCTTCAAGCTTTTGGAGCTCAAGGAATAATGATGACTCAACTCAAGT
AGTGATGATGGACAACATGATCAGGATCAGGAGGATCCAAAGAATTGTGA
TGAGCATTGGAGCAACACGAGCCTGAGCCATCTTAGTGCAAGCCTGTTTT
GGTCAGAGAAGGACGATTCAAGCAACAGTGAACAAGATCAGGAGCATGAT
AATGAGACTGACAATAAAGCACACCAGTCTATTCAGATTAGTCTAAGATT
ATGGCCAGCGCAGAAGCATGCAGTGATAAAAATATTTCGTAAGTTTCTCT
AAACCAAACTCTGCACATACCTCTTCTCTTCGTTATAAAAGCAGGGTTAC
TGATTGTGGTGTATCAAACTGGAGTTTGGTGTTGTTTCGCTGGATTTGGT
ACTTGCCGTGGAAGTGGTGTCTTGTTCATTGTCTAACTGCATCTTAGGGA
GTACCTCTTAGGGGCTTAAAACTTGCCACCAGAATCATTTGCGGTCGAAT
TCACAGAGGTGTAGCCATGTAGGTATGCTTCCTGCTTCGGTACTAGCGGA
GACTGATACCTTGCGACTTTATGCAACCTGCTTAGTTACGTTTTGGGTGG
ATATGTGGTGTTCTGAATGATGCCAAGTTGCTGTCAGGTTAAACCATTAA
CTAGTTTAGAGTTGCCTACTTGTCTGCTAGTGCTGATTGCTTAATTTTTG
TAACTGGGTTTTACAATAATGTTGATGTCATTAAGCAATAATAAGGCCAA
CACATTCTTAAAACAATCCATTTCAACGAATATGACACCACCCTTTAAGC
TTTGAACTTCAAAGCAAACTCTATTACATGCAATAAATTCAAACTTGAAA
TTTTGCACATTGTTCTAGTAAATTGAAGTGCATGTAGATTTTTTATTTCT
CCACGGACTGGGTTATATATTGCATCCTAAGGGTGTGTTGCATTTGATGT
GCCTTTGGTCAAAGTCTGCCTGTTTGCACATTCCACACTCAGCTGCAATA
TTTTCTTAAGTCTCCGATTGATCTGCAGCATTTGTGCAAAAATCAATTCA
AGCTTAAAATGTTCTGCAGAATAACCCAAGCTTGCTGTTAGCTTAGGGGA
AGGTAAGTCATCAATATTCCGCCTTCTTTGGGCATCCACATTTCGACGCG
GGTGCTAGAATCAGTATATTTCTGTTTTGTGGGATTAGCTTGTAAGTCGC
GGATTTACCTCGAATCAGTTTGCTAGAGCATATTGGATGGCATGAAGCAC
TTATGTCTTCTCTTACCACAACACTCTTTTCTTGCATGATCATTTTAATC
TCAGTCTGTCTTCATTTTATCATATGTAATGTATTAATAAAAAGCCGAAA
AATGTTTGTTTTTGGCCAGGTGGGGGTAATTGGGTGCTAACAAAGGATTA
TATCCTTAGCTGGATGAAGCCTGAGGATGTGAGGACTGAATACAATCTGC
AAGTGGAATTTGGTGGTTCATTTGCTAATGTATTAGTGAGTGATGAACAC
TAATCTTTGCATTAAATTGTCAAAGCTGTTTTGGTTTAATTAAATTTGCA
TCGCAGGGCTTTAGGAACAATGATTGCACAATGGACTTTGAGGTCAGAAT
GGTATGAGCTAATATCTTCTCTTTATTCGTATGAGGAACTCAAAACAAAA
AATTATTCTTATGAGATGTGGAGTTTTAATACCAGTTTGTTTAAATTGTA
GGATTGTACTCCTATGCTGAAGAATCTGGTGACGCTGCTAAAGCCGTCAA
TCTGTAATTTTCAGATCATTAAAAAAGTCGGTAAGTTTTCTTGATAAAAT
GTTAAAATACAAATATGTATACTACATGAAGACACACATTATTAGTACAA
TATCTTGACGGATGTCCAAATTTTTAAGAGGCATTAATCTGCCTTCATCT
TTGTGTTTAATATGCTAACTTGGATTGATCAGAGTAGATATGTTCAATGC
ACGATACAATAATTCTTTCATCCTTCTCTATCACGCTATACTCTATATAG
AAGTAATATGGGTTTATGTATCAGCGTGCCTGCATGAGTCGGATGCATCA
ATATATTCTTGATAGCTCCCATGTTCACAATTCATAATGCTTCTCGTCCT
ACAATCAATAGAAGCACCAGTCATGATAGTGCAACACCTTTTCTCTCATG
GCTAGCGTTTTTTGACTTGCCATGCCGATAATTTCTCAACAAGCTTAATT
ATTGACTTGTCCGTTGCAGCATTGAAGGATATATCCCATTTCTTATGTTC
TCTGTTCCTAGCTTTCTATATTTTCTAAGAACTGCCTCCAGTTTTGGATC
AAGAGTAGAGTGAGTATAGGGCACTTATTGCTTGAGCCTTTAAGGCTTGA
TCATTTGGTTATACTTTTGTTAATCATTGGGCCTTCTTTATTACTAGATG
TCATCCTATTATCTTTGCTCATCTGTTCCCTTTGCAGTATCTTCTTTGTA
ATTGGTGTTCTCAAGGAATTCCCTACACAGTTTTACTGCCTCATCATAAT
CGTGTCATTTAGCCTTCTCTCTGTTATGTGTGTAACATGCTTCTTAAAAA
GTTCATTCCACCCTCACAATCCTAGTGACCATCATCCATTTCGTTTATAC
ACTTGGCTCTTTTTGTTGGAAAGGTAGCACGCCATGCTTTATTGGTTCAG
CCAGGTTGTCTATCATAATCTCAACTCCACATGCAAGTTTTCCACCCTTC
ATTTGCCACTGGAACCGGGTGTCTCTAAAGACATAACAAGTAGAATGAAA
CCAATAAAGTATGCAAGATGATAATTAAAAACCTAACATACTCACAATTA
GTTACATCATTGAATATAGCTTCTCTATAACAAGTGTCTTTACTCTCTTG
CACTTGGAGATGTGTACATCAGCTAGTAGATCCTGAAGAACAGCTTGTTG
GATGTGATGTCTTCCATGTTGGATTGTCCTTGATCTACCTGAAGTACTCC
TGTGCAATCACCACACATGTGACAAGCTTGTGTCCCTTCTAGGAATGCAC
GTGTTCTCACTGTTGTATCTACCCACTAGCAGCCAATCAGATCTGGTGGT
AATGGAACCATATATGCTGCAAGGGCTGCGAGGGCAACTACAGTTTGCAC
TTACCCTCATCTTCTCATCCTTTAGGAAAATTAAGTGTCATAGGTTGTCA
GTCCATACTTCACCAATGCATTCTTGAACTGTCTACCTTCAGTGAAGGCC
ATGCTAACTAAGTGAGCAATTTTAGAGTTGCTTTTAGAAATTTGATGTAT
TTTGTCTTCTTCCTTCTAATAGCATGCACCTCATCTCCACAACTTGTTTC
ATCGTAAGACAAGTCATCATGAGTGTCAAAATGAGGTGTCACATCCCCAT
CATCAGGATTGCAGTCCTCTCAGACAATAGAAACATCTGGCACACTGACT
CATCTTGTTTCTGAGCTTCTTATAATTCCCTAGCATGCTTTCTCATTTCT
ATAGTTTCTTCATCTTCAGCTGAGCTGTTATCTTCATCATCTGAACCCAC
TTCAAACTAACTGTAGCTGCTTGTATCACAATCTTCAGATAGGATTGTTT
CTCCTCTGCCTCCCTTGATTTTCCTGATATGGAGTTGCTTCCCTTGACAA
TCTTCTGAACACTTGCAATTTACTCCAACTTCTGATGCTGATCAAACACG
TGTGAAACTGCAGCTGCCTCTTCTCTTTCCCCTGCATTTTCTTCTTGCTG
ATCTGCCCCTTCTTCATATTGCTTCTTGTCTCATATACTTCTTCTCCCTG
TTGTTTTGCACCTTGTCCCTCATATGATTCTTCTTGCTGTTCTGCACCTT
GTCCCTCATATGATTCTTCTTTTTGCTGTTCTGCACCTTGTCCCTCTTGA
ACAACTCATCTGGTATCTTAGCATATAAAGGTTAATGACACTTGAGGACT
GCGTCAGAACAACTCACGTGATCTGCAAGGTGCTCCTTGCGCTCAATTTA
ACACGCTCAACTAAAATCAGCAGCATTTTCTGACTAATTAAAAATTGTAG
AGTAACTAAAAGTTGAATCTAGCTACATAAATGAGGGAGTTTCGTAGAGA
GGGACATTCAGAGTTTAGTACCTGCCAGCGGTAAGGGGGGTTGTGGTTTA
CATTCTTTTTTCTTATTTGTATGTTTTTGTACTTGTTGTAGGTGGACAGG
ATGCTTGTAAAGTATTCAAGTGCTTGTTCATGGGGAAGAGGTGTGCATTG
AAATCACTCGCTCAAAAAAATCTCTGCACCTTAGAGTTCCACGGTATTTT
TATTAATGTTATCTTCTAAATTTACTCCTCTTAGATCTATTCCCATATCT
AAAAAAATTCTTACTTATTTAGGGAGGTTGAGATTATATCAAATGTAAAA
GATACGCATGTCATGATATTTTATCAGGTACGTTTCTTCAAGTGATTTCC
TTAGAAATACTTTGTTTTTGAATGATTTTTGAAATAATTTCCTTAGAACA
TACTTTGTTTTTGAATGATTTTATCAGTTTTTTGAATGATTTCTTCAAGT
GATTTCCTTAGAACACCTCAGCTTTTCCTGTTTTAGGCTTGGACAGAGCC
GTGGCATAACGAAGGAAAAGCTGAGCAAGAGTATTTGTTCATCCACTTGG
AGTTTTGCCAAAGGTTTGTTTTTGTTATTCAGATATTCTTTGTGTATATT
TTGAAATGTCAAGCATGTGATGAAGCTATTTTGAACTTTTTTCCCCGAGA
AAACGCAAAGAGGTGTTTGCGTTTCATTTCATTGGAAAGATAGAGTTTGT
TACACGCCTTCTAGGAGGAACACAAAAAAAGAAAAAAAGGGCTCCTCTTT
TGAACTTTTATGAGGTGTCTTTTCTAAGGATAATGCTCTTCTGCTGCATT
ACAGTCGTAAAAATGAGCTGTTATGTGTGAATTGGTTTATAGATGTATCT
TGATTGCGACTTCACCTTTTGGTAATATGACTTAACATGTACTCTCTGCT
AGCACCAGACTTCCAATCAAGTCATGGTCAATGTAATTTAATTGTTCTAA
TCACCGCATTCAATTACACAAATTTAGATGAGCTGAACCTTCTGGTTCTC
TTTATAATATATTTATTAAGATTGAATGTGGTATTGGGGCTGCACATGTT
ACTACCAATTAGCAGTAGATGGCTTAAAACCCGATTCCCCATTTTTCAAC
TAAGAAATTCGATTTGGAAGCAATTTAGAGTTCAGCCAACCAATGTTGAT
GGCTATGATCATATACAGTAAATTGGTCAATTAGATTATGATCTGAAGTT
GTAGCCCAGCCCTGGCATGGTCGTAGGGTTCTCTAAACCTGATTCCGTCC
ACCTCAGGGCTGGCTCCTGTTTTTGGTTGTTGAGGGTCTCCGGTCTTTGG
ATCCTCATCATACCCTATTTACCCTGTTGTAAGTTCATAACACAGATTTA
ATTAAAGTTTTAGAATTCATGACTTGTATGCTTAACAATGAAACACTGGT
GGAAATTAGGCAATATAACATATTTATTTGTTTCATTATATATTTTATAC
TAATACCTATGGTGTAAACTTGTTCTAAGACTTAATTGCGACGAACAATT
CTTGCTCCCTCATTGGAACAGGAAATGTTTAACTTTTCAATATCACCTTT
TGGGTCCATATTCTGTAATAAGCGGCAAGGTTTACTTTTAGATTAATAGA
ATTCCATCCCAGTCTGATTAACAGCCTGTTGGGAGTAGACTATAATGACC
TTCTGTTATCTTGTCTGATTGGTGGCCTAGTTATAAATCAATGGCCAAAT
GTTTAGATGGTATCGCTAGAAAAAAAGAGCCGATTTTGGGAGGTTGACTA
TAGAATGATACTGAGAAGTAAAAGTCCATTTTGAACAGTAGCGCCATAAT
TTTATGATCTGTTGAGCTACCTATTATGGGGACCATCCTTGCGTGCGGAT
CTTGTCTCTACCCATCTCTGTTCGACATTTAAGCGAAGCTCTGTTACTTT
GATGAGTAACTTAATAAACACTAGATTACATTCTTCCCCTTCACAATTTG
ATAGGCCCATGAGGGCACCATACATATTTGTTGGATGATGTTTAACTATT
AAGCAAACTCTAGGTTCTATTCTTTCAAGTCACTGTTTGATAGGGCTATG
ATGATCGGAGCGGTGTTACAGACCCAATGAAACTTGTTGGCCTATTTCCC
TTTTCCCTCAAGATATTTGCTTCACCTGCCTAGAGTTTCTCATCTGTTTA
CAGTTCCAAATTATTTCTTGTTTCAATACTAGTATAGGCCAACAATTTAA
AATTGAAGATGTATAGTGTGTAGTTTATTTGTTATCCTATAATTCATGTG
ATTAGCCTAAGGTTGCATTGTAGATCGAACTCGCCACACCAAACTCACTT
GTATGCTGTAATTATCAGTTCACTTGTCATGTTTTAGCTTCACTTGTTTT
CTGATTGTATCCTTTCCTTCTGTGTAATTTCCACGCAGCACCCTTAAGCA
CGCACTCCTATACGAGAATAGGCACTGATTTACACAAAAATGGCTCCTAT
TTGAAGAGATAGTGAGAATAGTTCACAAACTACACAAAGCTTGTGTTGTT
CATCGGGATCTTAAGCCTGATAACATATTTTTCAATTCGGAATTATCTGT
TCGGATTGGTGACTTTGGTGATGCATGTGTTGGTCGTGATGAGTTTGGCT
TGTATGGAGGAGGGACACCCAAACTAGGGACCCAATATTACTTCGCTGAG
GAGCTTAATAGTGGTGGGAAGGTTACTGAGAAGGTAGGCTCTTGACAAGT
CTGCATATTTCACTTCTGCGTAAAGTGAATGACTACTTGTGTATATTATT
TGCTAGGTGGATGTTTATTCTCTCGGTGTGATACTATTTGAGATTTTTGC
AATGTTCCAAACTGGTCTTGAGAGAAATTTTGTATTTCACAATCTGAGGG
AGCAAGGGCCTCCAGATAATTGGGATGGCGATCGTGAGCTTTATGATATG
ATGACGGCCTTAAAACCTAGTGATCGGCCATCAACTTCTCAAATACTGGT
AAATATCTATGCCCTCACTATAACCATGACCATGAGGAATTGTTGATAAC
TCTATCGTTTTTTTGTGCAGGATTACATCCGTATACATCATTTGGAGTGA
TGCCACTTTGGCAATTTACAGATTGGCTGTCAATGCTACAATGTTGGTAA
CCATTTGTTCATGTGCTCATTACGAACTTGATAATGAGTAAGTTGGTGAT
AAGTTGTGCATATTGGCATATTCTGTGCAGGGCTACGTGATGAATATTCG
TAAATTGACCATGTTCATGAAGTTGAGGAAGAGAGCGCTCTGTTGTATAG
AAGTTGATGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.