Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039842

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039842
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039842
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCCACCCCGCCCAGCCGCCCTTCGCTTCCCGCTCTTTTCCCCTTCCTCC GCCTACGCCTAGAGCCTTCTCGAACCTTCCATTCCATCCGGAGCCGTGGA GGCGAGCCCCCATCTCCATGGCCTCCTCCTCCTCCCGGCGTTTGCCCGTC CTCCGGGAGATCCTCCTTCTGTCCTTCAAGCCGCGGCTCTTCCCTGACAC TCTGTTCGGGGTCGACACGGAGAGCACGCTGCGTGACCAGGCCGGGCTGA TCTTCCGAGCGGCGTTTGACGGTGACACCACTCGCATGAAGAGTAAGAGA CCCCGCGACTCCTCGTGGATAGGTTTTGGTGATCGTGGATCCGACGCGAT TTCTGGTTGCTGATTTGTGCGTGCAGCGCTGGCGAAGCAGAGGAAAAGGG ATGGGAAAAGCATGGACGTGGTGGAGGAGATCAGGGACAATCAGAACAGG AGCCTCGGGGCGCTCCATCTGGCGGCCTTCGCGGGGAAGCTGGAGATGTG CAGGTACCTGATCAGGAAGCTCGAACTCGACGTCAACGCGGCTGCTGAGC AAGGTAATTAACCCTATTGAACTATATGATTCGCGGGGGCTGTTGCTCCA GTTTAGTTGTGCGGAACTTGTATCACGCGATTTGGGCTGCAATCCCTCCT TCTCAGCTTTTGTTTACTTCTGCAATCCTGCAACTGCCATTACAGTGCTG CTTGAGTTACGTTACGCCATTGTGTTTTCCGAGGCTGAAGGTCACCATCA CCTGCCAATTGTACCCAGTTAATTGCAAATAGAAAGTAGTGATGCTGAAG CGGTGCCGTATTTGGGGTTATGGCATGCGACCATTAGTTCTTTCTGTGCT GGTTGGGACGTAATCTATTGTGTTTCTACTGTTTTGTTTTAAGCAGGGAT GTACTTGTGTTTAAATCACAAAATTTCTGCGGATAGTTAGTTTCTTGAAA ATGGTTGTTGTGAAATAGGAACATTCAAGGTACATGAAATTAGAGACCAA CTAATGATGTCAATGTTCTTGCGCTTCCTTTTATTTTTATGTGTGACTCA CTTGTGGTGCCTGCTTGTGCCATTTTCTAGTATGTATTTTGCAGGTTCAA TCGCTCTTGGTTACATATCCTTTTTTTTTTTGGTTGGAAGAAACAGCAGT TGTTCGTTCTGACAAAGTGTTTATCGTATCTTGTGCTCTTGCTAGGTTCA TCACCTCTACTATGTGCAATATATGGTTGTGCACCTATACCAATTGTGAA CCTTCTACTGAATCGTGGTGCTGATCCAAACAAAGCAAGCAGCGAAGGGT TTACTGTGCTCCATGTTCTTGCAACAATTCAAGGTTCTCTCTGCCTATAT ATTTGTTTCAGACTTTTGTATTTGTAGCTTTAATTAGGATTATGTTGCCA AATCATATTTAATCCAAAATTGGTTGCAGTGTCTCTGCCCAGATATACTT TTTTCGAGAATACTATGAAATGTATTTTTTACCTATTGTGTCCTTGATGT CAATGTCACGCAGATCCAGATCTCTTTGTAATAGCGGAGATATTGTTATC CAGAGGGGCCAAGGTTGACTCTATGAGCACAGAAGGAACACCACTACATT TTGCTGCTCAGTGTGGGAATGCAGTAATGATGGAAGCACTGTTGAAGTAT AATGCAAATGTATTAATTTCCTTCTTTCCATCTTTTGTATGCTCTTTCTG GTCAATATTCGGTCTGTTTTGTACAGTCTTGTATCCGTGATAAAGAGAAG TCGTGGCCAAAAGGTATTCACTTGGCCCATAAATGTTACTATCTTCCTTT TCCCTCAGGGAACTATCCTAGTCCTGCCTACTTGGCGGAATGAATGCTAT TTTTGTCTCCTTGACCAAACTTGAGCTAGGGCTTCTCTTTTATTTGCTGG CTCTAGTCTCGTGTCTCTTTACGTTCTTTTCTTGTTTTAGCAATCATCAT TTGTTCATGGGTCTTTTGTTCTTCCCTTGCTTAAAATGCATTAGATTCTT GATGACTGCCAGATCGTGGTCAGACCAAGTTCCAGTTTAATCCACTGTGC ATGTGTGACGAGGCTCACTTCTCCCCACCAGGCCCAAAGAACTGCTTAAT TGATATTTTTTTTTCTGGGTACTCCTGGGTAGTTTGCAACTTCGCATGCA ACTTTACTCGCATGCTAGCAAATATCAAGCGTTGGTGATAACTGATAGCG GCAACATATGACCTTAAATTACCTTGATTTTTTGTGGTGCTCTTAGATCC TTCATATGATGCATGTAGTGGTAATAATTGCATAAGGGCCTTTGCTACTG AACACTGGATGATAAAGCATATGGTTTCTGTTCGCATCTATAGCTTGTCT GAAAAAATAATCAAATCGGTGTTTTTAGTAATTTTTGTATTTGGTATGCT AATAATTGCGTAAAAAAAGCTGATAGTTTATTGTTGTTCATTGACTACTG TGTTATTGTTTCTCTGCAAGTAATGTGATGTTTGCCTTTTCTCCAGCCTG ACAGAGTTGTGCAATCATTCTATGCACCACTCACATTGGCTCTCTTTGCT TCTTCAACTAAGTGTGTGGAACTACTTATTGAGGTGCAGTTACTTGTCCC TTTAGAGCATCCATAGTAGCGATATTTGCCAAAGGGACCTGAATTTTTTC TTTGTCATGTCATTCCTATTGTGAGACAAGTTGCAGCAGATTACAAAACA CTATATTCACAATTATGTGGTAAATACTTATTGTTTCAGGCTGGTGCTGA TGTCAATGCTGGTAGCCCTGCAACTCCATTAACAATAGCTGCAATGGATG GCTTAGCTGACTGCATCAAGTGCTTGTTGGAAGCTGGTGCTGATCCCAAT ATTCCTGATGAAGTGAGTTTTTTGTGCTGCTACTTAGTGTATTAGTTGTA ACTTGTTGGACGCTGGTGCTGATCCCAATATTCCTGATGAAGTGAGTTTT TTGTGCTGCTACTTAGTGTATTAGTTGTAACTCTAAGTGAGCTTCTGAGC TGGCTCTGTGTTCTACTTGCAAAACACTTCGTGGTGTGTTTGTGATTAGT AGCTTATCGTATCATCCGATTATCTCTGCATTTTGTAGATTATATTATCT ATGGTACTATCTAATAACATGAGTAAATGTAAACTATTTGATAAACATGC GTAGCTGATGCCATCTCTTGCTATTTGGGGTTTGTTAGGGTTGAAATATC ATTGTTTGTGATTAGCATGTTTTATGCAGAGTTTCCTTTCTGTTTATCTG AAAATTTTGTACCTGTATTACTTCAATCTTGTTTATTACAAAAAAATGTC AAAGGTTATTTCTTTGAAAGAGATATTTGTTAGCCTATTTAAGTGTTCAG TGCTACTCTGCTATGAACCACTACTCCCTCCAATCCAAACCGACACTTTT TATCGATCGGACGGAGTATTTCTTTTCGACTGTAGCAGAAACAGTGTGCG TTACTGTATGTTGAGGCTGTTATGGATATGATAGATAATAGGCTAGAAGA TGGATCAGTGCTCATTTAGTTCCCCTAGTTCAACAGTATAGTGAAATGTT AAATTCACAAGCTAAAGTATAGTGGAACTCAGTCGTAGTAAGTGCAGTTC TTTCTATCTCAGATCATTTTCTGGTTAAATATGCCACTCTGAAGTCCTGT CTCCGCTCTCTTCTAATAATGATCGATCATGCTGCATTGAAGTTCACATC ATCTGTGCTTCCGCATATGAGAAGAGCAAAGGAACTAAAACATTCATGCA TCTGTTTAATTATTCTGCCTGTACACATGTCCAGGATATGTTGGGAACAT AGGAACAGATATATTGTAGACCGCTTCATATTCTACTATGATTTAGTACA CTCGCTGCACAATCGCCCATAATTTCTCATATTTCGGATGTTATGGATAT GCCTGTATGCAATGACTTTGTCACATTCTCTATTTTGTGTCATTCCCTAA ACTCTCCCTTGCTTATTCTAAAATTGATCCCTCATATGATTGTTAACAGA TTGGTAGAACGCCATTGGAAATAGCTGCAATCCATGGATGGAAGGAATGT GTTCAGATTCTTTTTCCTCACACATTCCCTGTAGCTAGATTTGCAGACTG GAGCACTGATGGAATAATGCAACATGTGAAATATGGGAGTTCAGAAGTAT GAATAAAGTATTTTGTATTCTACTTATTGTTCCAGTTTGGTTGACGCGAT TAGTTTTACACAGATCAAGCAAAAACTGAAATTAAGTTTATTTGAAAGAT TTGTCACTACCATGTATTCTACGTCCTATTTGACTTCCAGTTACATATTT GATTTAGGGTAATCTTCCTAAAAGTGAGGAACCTGCTTTGAAAGTGCTAG GAGATGTTGCATTTAAGAGAAAGGATTATACTCATGCATTGGCTCTATAC ACCAAGGTAAATTCTTTCATCATATCAGTGGTTCCAGATTAGTACAATAA TTAACTTATCATATATTGAAATTACTAATGAAGCAAATAATCATTTTGTT AACAGTGCTGCGGATCTGGGTGTTCTACTTGGAAACATAAAACTTTTGTT AGTAACAAAATTTGAGGTCCCAGTTTTTCTATTTAGAAATATTTGTACAT GTAGATGTCTGATTGTGGAGAATCTACTTTCTATCATATTGATTAATATT TACACAAGTATTTATAGGACAAGGAGTATTAGTGTTGTCATTTGCAGCCG ACTTGATCTTTTTGTGGGGTACCATTCGATGGCTCCAGGCAATTGAGGCT GACCCTAAGGATTCAACCTTGTACGCAAAGAGGAGCCTTTGCTGGCTGCG TATGGGTGAGAAAGACAAAGCTTTGGATGATGCCGATACCTGCAAAACTA TGGGTCTTGATGTATCAAATCCCTGCCCTGAGCAAGGAGCAGCTCTAATA CCGACGGAGGTATGGTTTGGAAAGTTTCTATGCCATTTTATTCTCCATAA TATGTTGTGTTACCTGGCCATGCATTAATTTTGTGTGCTTAGGACTATGG CCTAGCACCCGAAGCTCTTATATCTAGCTTGAAGTTGGATTCTAGAAGCG GCCTGATTAGTGAAGTATCTAGGTAATCTCTGCTCTTTGCTTGGAATGTT TGGTTGGATAGTTCGAGGTTGTTATTTTAATAGGTCATTATTGTCAACCA CTTGACAACAAATATAATCACTTGTACATAATCATATGTTGATTGTTGTT TCTCCCATGCGGACTGTCGATTCTGTAATGTTAAACCTTGATCTTCCTTT TTGCCCTTTGTCATTTGTTTTGGTTTTCAGATCACATGTCACCAAGCATA GAAGGAGATTATGCATTCTCTCTCTCAAAAAAGATTATGCAGATGAATTT ATTTGCTTACTCTTGATTTCTGCTAAACTATTCATTAATGTCCAGTGATT TAAATTGTTTATACATATGCTACTATTAACTTGGCATTAAAACTTGCAGG GAGGAGGATAATAAGTGAATAAAGGTTTAGTTACTGCCTGGACATGTGAA GCGTCCACTGAAGTTGTGGAGGGTTGTGTTTTGTTGGATCCTGCACGTTG TACTGTATAGCCTGTCCATATTCTTGTGAAGAAAACAACACAAGCTGGAG CTGTACGTACCTATACATAGCATAACACAGACGAGTAGCTGGAGATATAC CTAGGATAGATGATGCCTACATGTCACATATGGTACTGAGCTACGGAACT GATCCATGTACCTAGCATAGTCGCTTACTTGTCACATAGGGTACATGACT ACGAATTTGGGCAAAAATAGGTGTACCGTTGTTTACATAGTGGAATTGAG ATTGTTGGGGAGCTTAAACACGTTGAAAGTTTCATAATATTTTGTTAATA GTCGTGACTGAGATTGTTGGAAATTTAAATCTGTATATTTTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.