Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA038900

[Submit comment/correction]

Sequence
AA038900
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038900
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAACTGGTCCTAGGTCGATTCTCGCAACACCAAAAACTTGCATCTACCT
GGTCTGATCAGACCTGATGGAGTAAGAACTAAGAACCGTCGATGTCTCTT
ATCGAACGGTGATTTCGAGGTCTTTCCCGTGGGTAGTACAGCCGAACGGG
CGGCGCAGAAGGGCACGAATACGAACGCCTCACCGGGAAACAAACCCGCC
GCATGTCTATTCGCTTCCTCCTCCCACCTCGCGGCAGCCTCCTCCTCCTT
TCCCCCCTCCGCCGCCGCCGGACGCCGACGTCGCCGCCCTTTTGGACAAC
CGCCACCGCGCTCCCATCTAGAACCTGTAGTTTCTTCGGTCTCCCCACCC
GCCCCTTCACCGTCGTCTCGACCATGGCGGAGGGGGCGCAGCAACGGGCT
GTCGAGGTTAGGGAGAGCGTGGAGCTGACGGAGAAGGAGGAGCAGATCTT
CAGGCGAATTCTCGACGTCGTCCGCCACTTCGGCCTGGGCACCCAGGTCC
GCGTCGCTGGCGGATGGGTCAGGGACAAGGTGAGCTTAACTGGAAAGCTG
TTTGAGTTTCAACTGTAGAGCTTATGGCGTGGTTTCTCATTTCCCAGAAG
AAATTAGGTGGAGTCTTCAATAGTCATGTCGTATTATTTGTTTGGGAGAG
GTCACAGATGATGAGCCCTTTAGATATTTTTTTGAGGCAATCACCCCGGG
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGATCCCCACCTGAATATTTTAC
TTCAACCTGAAAGAGTTACGCATTACATAGAGAGAGATGGTCGCGCCAGG
AGGTGGCGCCATCTTTAGATCCGTTGTTCTAAAACGGTGGGTCCATAAGG
TGAGATCTGAGAGGATGTTCCTAATTGTTTCATTACAAGGTTGGTCATGA
TGCCGGAAGACTTTTGCGTTGCGCGCTTCCCATATCTTCCGTAAAATGAT
CATGAGCATAGACGCCCAGGCTGATGCGGGCAGGTGGGGTGGGTGGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGGCATCTGGGTCGACCAGATCAGTGGGAATGGCGAA
CACGCGGGTATGATGCCAATCTTGCACCAAATGGCGGCGGCAGCAGGGCA
GTGGGAAAACAGGTGTTCCCTGTCCTCAGGAAGTAGGCCACAGCGTGCGC
AGGTGTCGGAGTCGATGATGGTCTTCCGCAGCAGAATTGATCCTTGTGTT
GAGCCTGTTGAGGTGAAGTAGCCAGGAGAATATCTTGTCCTTGTTGGGCA
CCGGCGAGGACCAGGTGACATCGGCATCTGGGTCCTGAAGCTGAGTCTGG
AGCAGCAGGTAGGCTCCACGAGAGGAGAAGCACCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCAAAGCAGGAGGCGTGAGTCTGGCTCCGCAGGCAGCGTGACACC
CTGCAACAAAGGAGACAAAGAAGCAAGCTCGGATGCAGCAGTGTTGGCTA
GTCGGTTACTCAGGCCCTCTTGGATGCCATTGTGCAGAATATCACTAACA
AACACATTAGGTTGGGTGTGGTGTGAGTAGAGTGCTGGGTAGGCAAGTTG
TAGGGGCTCAGAGAGTAGCCAACGCTCATGCCAGAACATTACTGAGGATC
CATTATGAAGGACATACTGTGTGAATGAGCCCTTTAGATTGTTCATAGTG
TTCTTATTGAGGTTTGGGATGGAAGTGTTTTATAATGATCAGTTAATGAA
ACCGTTTTCTTATCCCTTATTATTTATTTATTTATTGTGAGAAAATGAAC
TTCCGACTATAGGGTAGGTCCCACAAATTATGGTTCGATAAAATCCCTTA
ATTCCTGTTTGATGGTAGGTGCTTTTACACGTTGTCATGTACGATGATCA
TCTGGAATGGATGATTGGTTTGTGAGAAATTTTGTTGAAACTGTGTAATG
TTTTCATGTCTATGAACCACATTCTTTGATTCTAGCGTGTTCTGGGGTTC
TACAGTCGTGTGGAGAATTTAGTTCTTTGTCTGTTTGGGCTTCTTTTTAG
GGAAGATGTTTGCAGTTTGAAACTTGTGAATTCTTAGCTAGATGGGGGTA
CCCTATTCTGTTTGCATGATGGTCTTGGATGGTTGCCATCTATATATGTG
AGCAGATCTATGTTTCGACTGTATTTGGTCTGAGGAGTTCAGGTGGAACA
ATATAGCATCCACAATGCCACATGCCATATAGTCACAGAGAGTAGAGAAG
TGAAGAATTTCCTCGGCGACATGTTTGTTTTGAAGTTTTATTGGCCTGTG
CTATTTGTGTGCTGCATTGTGTGTTACAAATTTGCATGATGGTTGCTGTA
TGTGCTGATTAACTCACTGGAGATTCTGGAGGTCTAGGATCATACCATGA
ACTTTCATTTGTTTGCAAGCAAAAGGAATTCGTACTTAAATTTTCTTTGT
GGCTTGTACTTTGTGGAATATTCTTGGCAGCTATTGGGGAAAGACTCTAC
TGACATTGACATTGCACTTGATAATATGACGGGACAAAATTTCTGTGAGA
GAGTAAATGAGTACTCAGAGTTCATAGGTGAAGAGCAGAAAGGAATTGGT
GTTATCCAGTGGTATGCAACCTTCATTATTCTGTTTCTTCCATTTGCTAA
TACGATTTCAGCAGCTTTTTGTTTGTTGATGCCCCTTATCACTAACTAGG
GCTGATCTGATATTCCAAGGTTATGTGTTGTATGTGATTGTCTCTGGTGT
GACTGGCCCTCGTGAGAAATTGTTATGGTGTGGCTGTATATATATTATGT
TTCAAATATGCCCTTGACAACCATTACTGCTGTACTGATGCCGACATTTA
TACCTGGAGGCCCCAGTAAAGCATTTTCGTTTCATGAATATATAGGCTGG
ATTTATGCCTTTCGTCTGTTATATCATTTTATCTCTTGGTTGGTCAAAGT
CAAGAACAATGATCAACATTCAGAGTTATATCAATTAGCGTGCGCAACCT
GTATGCCCTTATGCGTTGTAATTTTCTCTGAGCTGAATATATAAGCATGG
GAAGAAAAAAGGTCACACATGCGAGCACATAGACAATGGCAGGGGATGCC
ACAGTTTAATGCAAGTAGAGTAATTTGTATATGTTCCTTACTGTACTATG
CTTTCTATATTGCATATGAAATCAACTAGGTTCGTTTTACCAGGGAGTTC
TGACATCTTATACTTTTTCTGCAGCAACCCCGATCAATCCAAGCATTTGG
AAACTGCAACAATGCTTATATACGGCATCTGGATTGATTTTGTAAATTTG
AGGTCTGAAAAGTATGCTGAAAACAGTCGTATTCCTACTGTGGTATGCAC
ATTCATTTAGTACTCCTTTTCACACTCTGTCGACCTTCTGAACAAAATAC
ACATTATCTGTTTGTGTATATATGGATTTTTTGGTAGTTTACTTGGCCAT
ATGTAATTCGTGTGTGGCTAATGTTTTATGTGGGCATAATACTAGAACTA
GTCAAACATGTGTTAGCTCAGTTGCAACTTATACCCTTGAATATTTTTGG
CGGATCAATATTTGCAATGTATGATAATCTGTTGCAAGTTGCAACCAGTT
TACAGCTACGCCATGATTTGCAATTTGCAGGAAATTGGTACAGCCAAAGA
AGATGCATTTCGCAGGGACCTAACAATCAATAGGTAATACCATATTATTT
CTTATTCATTAATTTATTATTCTGTAATGTTATGCTTTAATTGTGCAATG
TTGATTTTAACTTAGTACTGTACTTAGTCTTTCTAATATTCAAACTTCAA
CAGCTTATTCTATAATATCAACACTAAATCGGTGGAAGATTTAACTGGAA
GAGGTAGTTGAGTTGCTATTACAAATTTATATACATTCATGTGACCATTT
TATACATTCCCGCACTTAAGTAACCATGGTGATCCCATACTGCATGAAGG
TCTCGAAGATCTGAAAAAGGGCCTCATTGCTACTCCTTTACCTGCCAAAT
CAACTTTCCTGGATGACCCCCTCAGGGTTCTCCGCGCAATCCGGTTTGGT
ACATTCAAACATCCTGTGATTGATCTAAATTATTCTTGTAAATATTTTCT
ATCGCACTAGTACATGTACTTTTAAGATTCAGAGGTGTCCATGATGAGTT
TACTTGCCAAGTTGATAGCATCTTACACAGGAAGCATTTCTACTTGGGTC
TTAACTGAAAACCTTATAAAATATTACTATGTGTTCATCAGTAGTCAATT
TGTGGCCACTTAGTTACTTGTATAAATGACTGTCAAGAAATGGACTATTG
GCGTATAATTAAAGACCATGACGGTGACTTTCATCAGTATATTTTTCCTT
GAATATACTAATACTCATATCTGACAGCTGCTAGATTCAGCTTTACATTA
ACTGAAGATTTGAAAGAAGCTGCTTCTGATGAAAAGGTGAAGTCTGAACT
TGGTAGCAAGATCAGCAGAGAACGTATTGGGCATGAGGTTTGATTTCTAC
ACTGTCAACTGATGCTTCGTTGTTTCTTCCTGCTTTATCGTATGGATAAC
CAAACTTCACCGTTCTTAATATGTATTGAGTGAAATGCAAACCCCACGTC
ATAACAATAAAGTTTATATATTGTGCAGGTAGATAAAATGATGTCAGATC
AACACCCTGTCGATGCAATGTCTTGTATCCATGATTTGGGTTTATTTTCT
GTTGTTTTTGCTTTTCCTGAGAAACTCGACCCTCCAGTTCTTGACAAACA
TGATTGGTATGTATTTGTTCTAATATTCAGTTATGTATGTGTGATTACAT
GTAACACGGTCACACTTCTGATTTCTGGGCTTGTAGACTTTTACAAATCA
GTATGCACTAGTCTATTCACTTCCATTAGTGTATATAATTTAGTTCAGTT
TCATCTGATATTTTCTGTTAATTCAGGCTTTGTGTTTCACATATTGAAGC
GGCGTGGAATCTTGCACGTTCCATTGGCCGCTCTGTGTTCAGTGGTGGTT
CCGATTCCAAGTCACAGGTCTGGGTTTCCAGCGTATCTCCTTTTATATGA
CACACCCCAGAGTTTGTTTTGTCGCATGATATGTTGTTTTTAACTGTCTT
CTGTGCTTCGTGTTGAAATGCATATGGCCAAGAATGAACTTATGTTATGT
GACTTCTCTGGAAATAATCTTTACACAAACTTACAGTATCCTGATTCTTA
TCTGTAACATTGTATCAGATTCTTGGTAATCAATTACTTGCTTATTTATA
AAATGTTTTTTAACCTGATGGCCATGATGGTTTGGAGTACATGCTAATGC
TCTTCCATTGTTCAATTATCTCTGTATCGACTCAGTTGCAGTCTTACAGA
GGATTTGGCACAGTATTGTATTTTATTCAGAAAACTATGATACTAAGCTT
CCCACTAGTTTCATATTTTTTTTAAGATTCTTGTTGTAGATAACCCTACT
AGACATTGTGTGATAGCAACAAACACATGATTGATTATCACTGATGTTTC
TGCGATTTCCTAACATTAAGATTTGTAATGCTGTGTAGGATGAACAGCAA
AGGCTTTGCCTGTATAGTGCACTGTTTATTCCTGTTCGAAATATGGTCTA
CATGGACAAAAAATCTAAGAAGGTAAATGTCCAATTCATGCCTCCTTTAA
ACTTGTTTTAATCGTAACACTTACTGTTTAAGGAGGCAAATTCTTTATGT
TCTTTGTTTGCTAAATCATCCATTTTCTGCAACTGTGTTAGTAAACAAAT
TTGTTTGCTAAATCATCCACTTTCATCATAATCATATTTCGTTTTTCTTA
CACTGAACATACGATTGACTAACTCATGTATTATCTTTTCTAATCCAACT
ACTTAAGCAGGTTAATAATTTTTATTATAATCTGGATTGTTTATATTCTT
GAATGTTTTGCAAGTGTTTATGTGGGTACACTTGCTTGATACATGGAATT
TTTTTTCTGATTAGAGTAGTCTTAATCTAAAGCTTAATATTAGACGGCGG
GTTGTTTATGAGGTGTAAAATTGTTACATTATTATAAAGCAACTCTTCGA
GGTAAGTAAGTTTATTACCGAACTAAACAGCTTGATAATCACCACCCTCT
GTTGTTTTATGGGAAGTAGTCTTACAAGCTTGTTGCATCTTCTGCAGGTT
CCCATTGTTAGCTATATTATTCGGGACTCTCTAAAGCTGAAAGCTAGTGA
TGCTGACACGGTACACTTTCTTGAGCAGGCCTCAACTCAACAAGAATAGT
TTCTGCTCATTCCACATATTGTGTACTTCAATAGAAAATATTAACTTCTC
ATTATTTGTTCACCTTGAAAGATTGTGAACATACATGTTGCAAGTGAGAA
GTTTGCGGAATTAGTTCTCCTTGAGTCAAGTGAAAATCTGGAAACTGTCA
AAGAGAAGCTGGATGATCAATATCTCGAGATACCAACAGACTTAGTAAAG
CGTGTTTTGGCAGGTCAGTGTTGAGTATGCTTATTCTGAAATTTGAGATG
TCCTTTACATTTATCATTTCTTCATAACCCAACGTCTCTCTCTCTCTTTG
ATGGCCCTAATCTGGGCACTTGAGGTACATGATATGTTTAGATTTAACGA
GTTAGGATACTTGCTTGTTGTGCATCAGTTGGATGTATTTGTTTGTAGTA
TTCTTATTATTTTGTTCTGTTACTGGATTAAAAATTCTGACAGTTTGAGC
ATTTCAGGACTTATACTTCGTGAAATTAAAGGTTTTTGGCGTGTGGCACT
GTTTATCTCAACTCTCGTCTATCCAGAAGTTGGCAATACCAGTGGATCCC
TCAGCAAGCAGGATGAGCTACAACGAAGGAAAGAGAAATACCTTAGTGTT
GAGCGTTCAATAACTGACCTTGGTAAAGAACTTAAACCAATGACTTCATA
CCTTATTTCAGCTTCCTATTAAATACCTGTGTTAGATTTATGTTTTTGCT
TTATAGTCCTGATTTATTCCTTACTGTTTCATTTCCCCAGATCTTGATGG
TGTATGGAAAATGAAGCCGTTGCTCGATGGGAAGGCCATTATGGGGGTCA
TGGAGGTCAAGTCCGGAGGTCCCTTGATTGGAAAATGGGTACAGACTAAC
CCTTTTTATCCGCTCGTACTATTTTAGTTCATGTCGTATTCTAGTTCCTT
TGCACTCTTAACACAAGATGTGCTCTTCCCCCAGCAACAAAGGCTGGTGA
AGTGGCAGCTTGCGCATCCGGAAGGAACCGTGGAGGAGTGCAAGGAGTGG
ATGAAGCGGTCCCAGCAGCAGTCGAAACGACAGAAAGTAGAATGCAGCAC
CTGAAGATCATTGACATTTTGAGCTTAGGCAGTCCTCAAAATTCAGTTAT
AGGTCACAAACTTCCCATGACACCAGCCAGTGTGGTAGCCATCTTTAAAC
TAAGAATCAAGCACCTTAGTGAAGGTGGTTATACCACCAACCAACCAGTG
ACTAACCTTAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.