Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA044590

[Submit comment/correction]

Sequence
AA044590
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044590
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGCCCCGTATGCTGGCCTCTTGCTGGATCCAGCGATCTTATCGCTTCG
AACAACCAGCTCCATTCCTAGAAGCAAAAGCCACGCTCGACGGCTCCAGC
CAGCCAGCCTGCCAACGAGCTCATCCCTTTCGAACCCAACGCCGGTCCCG
CTCCGCCCCAACACGATAGCCCCCAAATTTCCCCAGGCTCCCGTTCCGAT
TCTTCGCGACGCAGACCACCAAACCCCACCACGAGACGAACCAAGACGCT
GCGACGACGTCGGCATCATTTCCCCGGAAGAAATTTCCGCGGCGACGTCG
CCATCATTTCATCACACTCCAGCGAGTCACCAGCAAGTCGTCGCCGCGCC
TCCTCGATGACCGAGAGCAGCGGTTACTGCGCGACCACTGCTGTCAGAGC
AGTTACTTACTCCACTCCCCCTCGCTAATCGCCGCTACTAATCCCCCTCT
CCGACTCCAAACCCCCCTACCGCTCTAATCCCGTCGCTGTCTCCGCGCGG
ATCGCCGATCGCCGCGATGTCGTCTTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCGTGCG
CCGAGAGCGGGAACCCTAGCCCCCACCCGGCGGCGCCGGCGGGGGTCCGG
CCGGGGGCGTGGCCGGCCAGGCGGCGCTGCCACGACGTGTTCTGGCTGGT
GGTCTTCCTCCTCCACTTGCTCCTCTTCGGCGGGGCGCTCGCGCTCTCGG
GCCTCAACCGCTTCCACATAGCCGACCGCTTCAACATCGACCCCTTCACC
AACCACACCGCCGCCCCACCCTCCGCTGGCGGCGCGCCGCAGCCCGCGCC
GCCGGGGCCAGATGTTCAGGTGTCCAAGTATAAGGCGCTACCCTCCGAGC
TGACGGAGACTTACTGGAAGTACTACGGCGCTGCGGGCGCCGTGGGGACG
GTGCTCGCGTGGGCGTGGCTGGCGGCGGCGGCCGGGAAGAGGGACGGGGG
GAGGGTGGTCATGCGGGCCGCCGTGCACAGCCTCACCGCCTACCTCGCCG
TCGTCAGCGTCCTCTGCTTCTGGGGGAAGCACTTCTTCTGGGGCGTGGCG
CTCGCCGTCGGCGCTGCGCTCCACTTCCTCTACGTCATGTCAGTGATTGA
TAGGTACAGTCAACCTCAACCGCAGTTTCGAATTGGTTTCAGGATTTTGG
CAATTTCATACACCTCATGAGCTTGGACTCTAGTGGGCGAGGATGTGACA
TCGACATTGAAAAAAGAGAAGTAAATTTCTGCACAATTGAAGAATTGTGT
CATCGCTCATAAGATTTAGCTTAGGTGATTGATACATATCTGTTCCCATG
CCCCCTTTCAAACAGTTGCGCCTTGTGCGCATACAGGTTCTATGCCTCCA
GTCCAGTGTGTGCACGCCAAGTCTGTCCAGTGCTTTCTCTGGTAACTTGC
TTACGAGTGGACGTGTTTTGAACTCGAAATTCACCTATTCAGCATGGCTT
TGTGCTCTTTTTGTTTGTATATGCACATGTTGTATAGATGAACAAAGAAA
ACTATGGTTTCTGATATCTTTAAATTGTTTTGGTGCATGTCTAGATTATT
AGCTTGCGAATAAGCAGATGGCAATGATCTCTACATGTTTGAATGATTCA
ATATCAATGGTGTTCCAATACTAATTTGATTCTAGTTATATGAAGGAATG
GCAGAAAAATCAGCAAGTGTAGAATGGCGGAAGTTGCTGCACTGCTCCTT
AAATCAGTTGCAATGCAAAAAATCAGTTGAATTGCATTTTAGCTTGTTGA
ACTATTGCTACATTGTCAGGTTTAGGCATATGCGGCGCTGATGATAGCAA
AAAATAAAATAAATCCAGTTATTGGCTCTGGTACATGCTTTGGTTGAGTT
GGTATGTCTATACTTTCTTAATGCAGCTTTGCTCAGTGGCATGCTGGAAA
ATACATTTTTAAGTTGAAATAGGACATTGGTACTTTACTAGTCGGCTTGA
ACACCTGTATAGTAACTACGCAAGTCAATAGTACCTTGCCATCTAGGCCC
TAAAAACTAGCATACAAACTATGTGGTGTTTGAAGCGAAAAACTTTCGGG
CATGGCGCAACATCCTATCGAGTTTTACCTTTCAGGGTGTAAACAATATC
AGAGTGCGATGAAGCCGCAAAGTAGGCACCGAGTGTCTAAATTTTTTGGC
CAGATTAATTTCTTTTCTGCATTAGTTTGTGTGGTTTAGCACGTTCAACA
CTATTGAATTGCTTGCACCTAACTAGTTCATTCAAAAGCTTGGGATCAAT
GTAGGCTGCAGCTATTTTTATTAATAGTGTGTTGGCCGGATCTTAAACTC
GGGACCTGTTGGCTTTGGTACCATATTAAATTGCACGCACTTAACTAGTC
ACCCAAAAGCTTAAGCTCATGGGGAAATCAACAGACACATTTTAGGTTCG
CTGTAAAAGTACTACAATTAATTGTTCGAATTTTAGTTTGAGAGCCTAGT
GTTGAGGATCTCATATCTATGGACTATGATTTCATTGTTTGTAACATCAG
AAACTGGCTATGCTCTTCAAACCAGTATCAAACTGGGTGCTGATTTCTAT
CAATAGTCAGTAACTTCCCCTTGTTTATTTTTATGTGTATTGTCTTGCAT
TACTACCCTATGTTGTATTAGTATAAACATGGAACCAAGTGATTCCTCTA
TAATTGACACTCTATAATTGACACAGTTAAGCCATTCTCTAGCAAAGGAG
GTGTTCAATTTTGTTCTCAAGCCTCGTATGTGTCTACAAAGTTTAACATG
AAAGTGGTATGATAACTTGTTTGCAATCCATGACGGTCTCCACAAGAAAG
CTGTAGCATCGAGTAGAAAAACTTGAAAACCTTGTTAAGTTTCAAAAGGG
CGGAGAATTCTAGTGCAGACTTCCAGCTAAATCATGTATGCCATACTTGG
ATCAGGATATTTCTATGTTTTTTTTCTATAATCATGTCTTGGTTTGTTGG
TAGATGTCAGTTGATCTTGGTTTAGGAACAAAATATCATACATTACTATT
TTGGATTGCTTCTATCCCAAAGTTCTGCTGGGCAATATTCTTTCCACCTG
TATTTGATAATAACATGAGGCCTCAATTAGGTCCTAAGTACTAGATCAAT
CTTAATTTCTTTCAGAATTATTGATGTGTTACATGATGTACTGTCCATTA
GCCAGTATTATTATTGCCTTATTCAGTTATGTGGTAAAATTATGAAGGAC
TTTCTTAATCTCATCTAGTCATGAGTAATATATTTGTTCAAAACTGCATA
TTTGTTTATTTGTTAGCATAACTGGGTAAATTTTTGCTAGATTTCCGTTC
ACAATGCTAGTACTGCAGAAGGCAGTAAGGATGGTATGGGAACTTCCCAA
AGTGACGAGAGTAGCATATGCATTTGTACTGGTAATGCTATGTTGGATGG
CATTATGGTCCTTTGGAGTTTCTGGTATCGTTGCTATGCACATACCTAAT
CGTGGGCAATGGTGGCTTGTTTTGGTGAGGGCAAGTTGTTGTCATTAGTC
TATGTAATGTTTTGTTATTTTTAGATATTTTATAATTATTATCCTGCAAT
TTGCAGGCGCTATCAGTCAGTTTATTTTGGACTGGAGCTGTCCTTAGTAA
TACAGTCCATGTCATAGTATCAGGGATGGTATTCCTTGTTCTCATTCATG
GTGGACAAGCTGCTGCATCGATGCCCCCCAAACCACTTCTTAAGTCTCTT
CAGTATGCTGTAACAACTTCATTTGGAAGCATTTGCTATGGATCACTCTT
TACAGCTGCCATTAGGACTCTACGCTGGGAGGTCTGTGACTTACTGGCTA
GAGTTGCCTGGTGCGAAATTTTCAGTCATTAACTTCATTTCTTTTGATAT
CGTTGCCTCTCATTTATTTATTCCTTCCCTTTATTTTTAATTCAGATTCG
AGGGATTCGTTCTAAAATTGGTAACAATGAATGTCTGCTGTGCTGTGTTG
ATTTTTTCTTTCATATTGTGGAGACGCTTGTTCGTTTCTTCAACAAATAT
GCATATGTACAGGTCAGTGGTTCTAAGATAAATTTGAAAGCGTCCCTGTT
CTCTGTGTATTGCTGCTTTGTCATGTATATTTGTGCATACTATATCAGTC
AAAGTTCCTAAGGGTACCTGCATTCTTGGTATACAAAGAGTGCAAGTTGT
GAAGCAAATAACTGATTCTTTTGAGTTGGTAGAAATTAGTATACTAAAAT
TACTTGTATCCTTGTACTACTTATTGATTTGAAGCTGCTGGTCATTATCT
AGAAAAAGGTTTCTGGCATACTGCATTACACACATGTATCACACTGCTTT
TCACTTTCAGATAGCTGTCAACGGACATAGTTTCAATCGTTCAGCTAGGG
ATGCCTGGGAGCTGTTCCAGTCAACAGGCATCGAAGCACTTATTGCTTAT
GATTGTTCCGGTGCTGTTCTTCTGATGAGCACAATATTAGGTGGGTTAAT
TACAGGAACCTGTACAGGTGTTTGGGCATACTTCACACAAAGTGATAAAG
CAATTATTGTTGGTTCAACCTCTATGCTGATGGGGATGATACTGGTAAGT
GCTTACATGTGTATAAAGTTTCGATTGAAGTACTTCAGAAATAGAAACAT
CCTGGTGCATGTGCTTTCTTCTTGCAGTAGAAACTCATAGATATTGCTAG
GAGCTGCACAGCAGAACTCTTTGACTAGTACCTTTGTTGGATATTTCCAC
TTAAATATGTTTTAATAGAGTTTTTTCAGGACTGAGCGCTGCTTTGTTTT
GCAGGTTGGGCTGACTGTTGTGGTTGTCGAAAGTGCCGTTACATCAATAT
ACATATGCTATGCTGAGGACCCCCTTTTAATTCAGAGATGGGATCCTGAA
TTTTTTGAACAAATGTCAGAGGCCCTACACCAGCGACTGCAGTACCGGAG
CTCCCGAGCCCGCCAAATACTGAACGGTCGTCTTGATCATTTGCCAAGTA
CATCGAGTATTTGAACCTGATATGTGATTTCTGTTAACCCGTTGAAAGTG
CAGCAGCCCATTTCCGGAACAAGAGGTTTTGGATCCTTCTGCCATGAAAA
TATAGATCGACGAAGCTTTCTCTGCCAGTGAAATATAGAGAATGAAGCGC
CCCAGCAATCTTGGGGCCTTCAAAAGCAACATTCCCAATCAAGCAGTAGT
GTGTTCATAGTTTCTTTTTTTAAAATTGCCGGGAGTATGTTCATAGGTGT
GTAGAATTGCAGTGCCAGCTTTTGTTTGTCGGGTGCATTGTGTGTGTGCA
GCCCTTTTAGGGGAAAACAGAGAGAGAAAATAGAACAGCAGCCCGTACAT
GTGACTTGGGTGATCGTTCATGAATGGAAATGCTTCATGCCTTGGGTTTT
TTGGCGAGCAGTTTGAGTACAAAGCTCATACTCCTATGTCAATTGAAAAC
GTCCTATCACGAAAACTGACGTTTTATACACTGGCGTGGTCTTTTGAAGG
TGTAACTTTGATCACTGATTTCTACTGTGTAAAGACCAAAGACCAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.